data_SMR-a466258d490707ed5f2744bd5ff12b2f_1 _entry.id SMR-a466258d490707ed5f2744bd5ff12b2f_1 _struct.entry_id SMR-a466258d490707ed5f2744bd5ff12b2f_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - A0A096LP49/ CC187_HUMAN, Coiled-coil domain-containing protein 187 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A096LP49' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 134156.955 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CC187_HUMAN A0A096LP49 1 ;MPTLVVGTPPTCLGDTPQPCHKNSQRQGPFSHGAPGRAADWKAVAKPRLCAPAAEDDVAALRWPGPSQQP DPPWAAPHVVGSDDLKEPGPWGKACSLPMWSTGPEARDGDSSVSSGRLSCSSGGHDVCVSWKERPPQVLG PQQRPRKSDARLEQLRDKIRAQAWQQGSCASLGTSAPSSASRLHKASTLMLRRKGQEAKNPPPAPECSGF SILSAAERRVEAKASHGQGRELSRVSQHQVPVLREKPKRVKSSSCKREKTPKLPSPRRAAKDKHKDEDSE LVGVYAWRKGQALVRSLLGPPPVLRRHHSKDPSRDPALTVDLGDSEKVIAAKCSPVCAQLPDATSAYSDQ QVSGNTPSLASFDQPATIQTAMAILQDLRQQIQAGLELAQARKGGQELGPSKRRLQDVAGRGCCRDPNAQ SSFSKSPWAMTERKHSSLERARSVHTWEPWSSSTARESCPQRAWGAQGQDRSFQRPESPHERLGHFSQRP WSALAGQACSPQRAWGAQRQGPSSQRPGSPPEKRSPFPQQPWSAVATQPCPRRAWTACETWEDPGPRLRN PLERPSPPAQRPWSSSGVQRAGPQGKGRGIGSPVSAAKHALPRPTGSFPQNPLGKEKDTLRPCPRSRGLL GPSHSSESLREFMRQKAQARRRQALEEKASALRTRELRSRRLQEVYRQQREAVLGRAVPVVSRTTPGIVT FVPSSAQSGGLEASGSLESPVLEWSKVTSGMVLGGQEAPGSFCLCLNRAWNHAETLDPPGMGGPQDGRDA PVLLSASPSLGSLELQDLTTRYLPRGMCIYLDPKEAEHLGTSSSLHLRHKQAQLQALETTAKVLKQRVDS LTAKLQGAEALDTVRDPAVGLLRSCPHSLPAAPTLATPTLATPACPGALGPNWGRGAPGEWVSMQPQPLL PPTYFLDGETLSWGPSWEQQQSVSPRAHCESKPRGFPEEGHVDVKPDKRLQRGVAPFQALSPSAGSSYAG PATLHPIWGSLGLEETPSVGGADSVAPCTPRSCGKGDPADRPWAGWSGGRGIHREHLPLPSTRAWPYGVE KSFSTWRASTPRY ; 'Coiled-coil domain-containing protein 187' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1063 1 1063 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . CC187_HUMAN A0A096LP49 . 1 1063 9606 'Homo sapiens (Human)' 2014-11-26 0E9464F37B352991 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MPTLVVGTPPTCLGDTPQPCHKNSQRQGPFSHGAPGRAADWKAVAKPRLCAPAAEDDVAALRWPGPSQQP DPPWAAPHVVGSDDLKEPGPWGKACSLPMWSTGPEARDGDSSVSSGRLSCSSGGHDVCVSWKERPPQVLG PQQRPRKSDARLEQLRDKIRAQAWQQGSCASLGTSAPSSASRLHKASTLMLRRKGQEAKNPPPAPECSGF SILSAAERRVEAKASHGQGRELSRVSQHQVPVLREKPKRVKSSSCKREKTPKLPSPRRAAKDKHKDEDSE LVGVYAWRKGQALVRSLLGPPPVLRRHHSKDPSRDPALTVDLGDSEKVIAAKCSPVCAQLPDATSAYSDQ QVSGNTPSLASFDQPATIQTAMAILQDLRQQIQAGLELAQARKGGQELGPSKRRLQDVAGRGCCRDPNAQ SSFSKSPWAMTERKHSSLERARSVHTWEPWSSSTARESCPQRAWGAQGQDRSFQRPESPHERLGHFSQRP WSALAGQACSPQRAWGAQRQGPSSQRPGSPPEKRSPFPQQPWSAVATQPCPRRAWTACETWEDPGPRLRN PLERPSPPAQRPWSSSGVQRAGPQGKGRGIGSPVSAAKHALPRPTGSFPQNPLGKEKDTLRPCPRSRGLL 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B 1 900 GLU 900 ? ? ? B . B 1 901 TRP 901 ? ? ? B . B 1 902 VAL 902 ? ? ? B . B 1 903 SER 903 ? ? ? B . B 1 904 MET 904 ? ? ? B . B 1 905 GLN 905 ? ? ? B . B 1 906 PRO 906 ? ? ? B . B 1 907 GLN 907 ? ? ? B . B 1 908 PRO 908 ? ? ? B . B 1 909 LEU 909 ? ? ? B . B 1 910 LEU 910 ? ? ? B . B 1 911 PRO 911 ? ? ? B . B 1 912 PRO 912 ? ? ? B . B 1 913 THR 913 ? ? ? B . B 1 914 TYR 914 ? ? ? B . B 1 915 PHE 915 ? ? ? B . B 1 916 LEU 916 ? ? ? B . B 1 917 ASP 917 ? ? ? B . B 1 918 GLY 918 ? ? ? B . B 1 919 GLU 919 ? ? ? B . B 1 920 THR 920 ? ? ? B . B 1 921 LEU 921 ? ? ? B . B 1 922 SER 922 ? ? ? B . B 1 923 TRP 923 ? ? ? B . B 1 924 GLY 924 ? ? ? B . B 1 925 PRO 925 ? ? ? B . B 1 926 SER 926 ? ? ? B . B 1 927 TRP 927 ? ? ? B . B 1 928 GLU 928 ? ? ? B . B 1 929 GLN 929 ? ? ? B . B 1 930 GLN 930 ? ? ? B . B 1 931 GLN 931 ? ? ? B . B 1 932 SER 932 ? ? ? B . B 1 933 VAL 933 ? ? ? B . B 1 934 SER 934 ? ? ? B . B 1 935 PRO 935 ? ? ? B . B 1 936 ARG 936 ? ? ? B . B 1 937 ALA 937 ? ? ? B . 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B 1 976 SER 976 ? ? ? B . B 1 977 SER 977 ? ? ? B . B 1 978 TYR 978 ? ? ? B . B 1 979 ALA 979 ? ? ? B . B 1 980 GLY 980 ? ? ? B . B 1 981 PRO 981 ? ? ? B . B 1 982 ALA 982 ? ? ? B . B 1 983 THR 983 ? ? ? B . B 1 984 LEU 984 ? ? ? B . B 1 985 HIS 985 ? ? ? B . B 1 986 PRO 986 ? ? ? B . B 1 987 ILE 987 ? ? ? B . B 1 988 TRP 988 ? ? ? B . B 1 989 GLY 989 ? ? ? B . B 1 990 SER 990 ? ? ? B . B 1 991 LEU 991 ? ? ? B . B 1 992 GLY 992 ? ? ? B . B 1 993 LEU 993 ? ? ? B . B 1 994 GLU 994 ? ? ? B . B 1 995 GLU 995 ? ? ? B . B 1 996 THR 996 ? ? ? B . B 1 997 PRO 997 ? ? ? B . B 1 998 SER 998 ? ? ? B . B 1 999 VAL 999 ? ? ? B . B 1 1000 GLY 1000 ? ? ? B . B 1 1001 GLY 1001 ? ? ? B . B 1 1002 ALA 1002 ? ? ? B . B 1 1003 ASP 1003 ? ? ? B . B 1 1004 SER 1004 ? ? ? B . B 1 1005 VAL 1005 ? ? ? B . B 1 1006 ALA 1006 ? ? ? B . B 1 1007 PRO 1007 ? ? ? B . B 1 1008 CYS 1008 ? ? ? B . B 1 1009 THR 1009 ? ? ? B . B 1 1010 PRO 1010 ? ? ? B . B 1 1011 ARG 1011 ? ? ? B . B 1 1012 SER 1012 ? ? ? B . B 1 1013 CYS 1013 ? ? ? B . B 1 1014 GLY 1014 ? ? ? B . B 1 1015 LYS 1015 ? ? ? B . B 1 1016 GLY 1016 ? ? ? B . B 1 1017 ASP 1017 ? ? ? B . B 1 1018 PRO 1018 ? ? ? B . B 1 1019 ALA 1019 ? ? ? B . B 1 1020 ASP 1020 ? ? ? B . B 1 1021 ARG 1021 ? ? ? B . B 1 1022 PRO 1022 ? ? ? B . B 1 1023 TRP 1023 ? ? ? B . B 1 1024 ALA 1024 ? ? ? B . B 1 1025 GLY 1025 ? ? ? B . B 1 1026 TRP 1026 ? ? ? B . B 1 1027 SER 1027 ? ? ? B . B 1 1028 GLY 1028 ? ? ? B . B 1 1029 GLY 1029 ? ? ? B . B 1 1030 ARG 1030 ? ? ? B . B 1 1031 GLY 1031 ? ? ? B . B 1 1032 ILE 1032 ? ? ? B . B 1 1033 HIS 1033 ? ? ? B . B 1 1034 ARG 1034 ? ? ? B . B 1 1035 GLU 1035 ? ? ? B . B 1 1036 HIS 1036 ? ? ? B . B 1 1037 LEU 1037 ? ? ? B . B 1 1038 PRO 1038 ? ? ? B . B 1 1039 LEU 1039 ? ? ? B . B 1 1040 PRO 1040 ? ? ? B . B 1 1041 SER 1041 ? ? ? B . B 1 1042 THR 1042 ? ? ? B . B 1 1043 ARG 1043 ? ? ? B . B 1 1044 ALA 1044 ? ? ? B . B 1 1045 TRP 1045 ? ? ? B . B 1 1046 PRO 1046 ? ? ? B . B 1 1047 TYR 1047 ? ? ? B . B 1 1048 GLY 1048 ? ? ? B . B 1 1049 VAL 1049 ? ? ? B . B 1 1050 GLU 1050 ? ? ? B . B 1 1051 LYS 1051 ? ? ? B . B 1 1052 SER 1052 ? ? ? B . B 1 1053 PHE 1053 ? ? ? B . B 1 1054 SER 1054 ? ? ? B . B 1 1055 THR 1055 ? ? ? B . B 1 1056 TRP 1056 ? ? ? B . B 1 1057 ARG 1057 ? ? ? B . B 1 1058 ALA 1058 ? ? ? B . B 1 1059 SER 1059 ? ? ? B . B 1 1060 THR 1060 ? ? ? B . B 1 1061 PRO 1061 ? ? ? B . B 1 1062 ARG 1062 ? ? ? B . B 1 1063 TYR 1063 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Transcription factor HY5 {PDB ID=2oqq, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2oqq.1.A}' 'template structure' . 2 'Transcription factor HY5 {PDB ID=2oqq, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=2oqq.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 2oqq, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 2oqq, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-06-25 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-06-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GSAYLSELENRVKDLENKNSELEERLSTLQNENQMLRHILKN GSAYLSELENRVKDLENKNSELEERLSTLQNENQMLRHILKN 2 GSAYLSELENRVKDLENKNSELEERLSTLQNENQMLRHILKN GSAYLSELENRVKDLENKNSELEERLSTLQNENQMLRHILKN # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 3 30 2 2 3 30 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2oqq 2023-12-27 2 PDB . 2oqq 2023-12-27 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1063 2 2 B 1 1063 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 1063 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 1063 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 27.000 28.571 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 27.000 28.571 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MPTLVVGTPPTCLGDTPQPCHKNSQRQGPFSHGAPGRAADWKAVAKPRLCAPAAEDDVAALRWPGPSQQPDPPWAAPHVVGSDDLKEPGPWGKACSLPMWSTGPEARDGDSSVSSGRLSCSSGGHDVCVSWKERPPQVLGPQQRPRKSDARLEQLRDKIRAQAWQQGSCASLGTSAPSSASRLHKASTLMLRRKGQEAKNPPPAPECSGFSILSAAERRVEAKASHGQGRELSRVSQHQVPVLREKPKRVKSSSCKREKTPKLPSPRRAAKDKHKDEDSELVGVYAWRKGQALVRSLLGPPPVLRRHHSKDPSRDPALTVDLGDSEKVIAAKCSPVCAQLPDATSAYSDQQVSGNTPSLASFDQPATIQTAMAILQDLRQQIQAGLELAQARKGGQELGPSKRRLQDVAGRGCCRDPNAQSSFSKSPWAMTERKHSSLERARSVHTWEPWSSSTARESCPQRAWGAQGQDRSFQRPESPHERLGHFSQRPWSALAGQACSPQRAWGAQRQGPSSQRPGSPPEKRSPFPQQPWSAVATQPCPRRAWTACETWEDPGPRLRNPLERPSPPAQRPWSSSGVQRAGPQGKGRGIGSPVSAAKHALPRPTGSFPQNPLGKEKDTLRPCPRSRGLLGPSHSSESLREFMRQKAQARRRQALEEKASALRTRELRSRRLQEVYRQQREAVLGRAVPVVSRTTPGIVTFVPSSAQSGGLEASGSLESPVLEWSKVTSGMVLGGQEAPGSFCLCLNRAWNHAETLDPPGMGGPQDGRDAPVLLSASPSLGSLELQDLTTRYLPRGMCIYLDPKEAEHLGTSSSLHLRHKQAQLQALETTAKVLKQRVDSLTAKLQGAEALDTVRDPAVGLLRSCPHSLPAAPTLATPTLATPACPGALGPNWGRGAPGEWVSMQPQPLLPPTYFLDGETLSWGPSWEQQQSVSPRAHCESKPRGFPEEGHVDVKPDKRLQRGVAPFQALSPSAGSSYAGPATLHPIWGSLGLEETPSVGGADSVAPCTPRSCGKGDPADRPWAGWSGGRGIHREHLPLPSTRAWPYGVEKSFSTWRASTPRY 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AYLSELENRVKDLENKNSELEERLSTLQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MPTLVVGTPPTCLGDTPQPCHKNSQRQGPFSHGAPGRAADWKAVAKPRLCAPAAEDDVAALRWPGPSQQPDPPWAAPHVVGSDDLKEPGPWGKACSLPMWSTGPEARDGDSSVSSGRLSCSSGGHDVCVSWKERPPQVLGPQQRPRKSDARLEQLRDKIRAQAWQQGSCASLGTSAPSSASRLHKASTLMLRRKGQEAKNPPPAPECSGFSILSAAERRVEAKASHGQGRELSRVSQHQVPVLREKPKRVKSSSCKREKTPKLPSPRRAAKDKHKDEDSELVGVYAWRKGQALVRSLLGPPPVLRRHHSKDPSRDPALTVDLGDSEKVIAAKCSPVCAQLPDATSAYSDQQVSGNTPSLASFDQPATIQTAMAILQDLRQQIQAGLELAQARKGGQELGPSKRRLQDVAGRGCCRDPNAQSSFSKSPWAMTERKHSSLERARSVHTWEPWSSSTARESCPQRAWGAQGQDRSFQRPESPHERLGHFSQRPWSALAGQACSPQRAWGAQRQGPSSQRPGSPPEKRSPFPQQPWSAVATQPCPRRAWTACETWEDPGPRLRNPLERPSPPAQRPWSSSGVQRAGPQGKGRGIGSPVSAAKHALPRPTGSFPQNPLGKEKDTLRPCPRSRGLLGPSHSSESLREFMRQKAQARRRQALEEKASALRTRELRSRRLQEVYRQQREAVLGRAVPVVSRTTPGIVTFVPSSAQSGGLEASGSLESPVLEWSKVTSGMVLGGQEAPGSFCLCLNRAWNHAETLDPPGMGGPQDGRDAPVLLSASPSLGSLELQDLTTRYLPRGMCIYLDPKEAEHLGTSSSLHLRHKQAQLQALETTAKVLKQRVDSLTAKLQGAEALDTVRDPAVGLLRSCPHSLPAAPTLATPTLATPACPGALGPNWGRGAPGEWVSMQPQPLLPPTYFLDGETLSWGPSWEQQQSVSPRAHCESKPRGFPEEGHVDVKPDKRLQRGVAPFQALSPSAGSSYAGPATLHPIWGSLGLEETPSVGGADSVAPCTPRSCGKGDPADRPWAGWSGGRGIHREHLPLPSTRAWPYGVEKSFSTWRASTPRY 4 2 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AYLSELENRVKDLENKNSELEERLSTLQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.184}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2oqq.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 6 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 18.937 24.521 4.453 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 44 C CD2 . LEU 827 827 ? A 18.111 25.359 6.750 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 45 N N . GLU 828 828 ? A 21.348 21.206 8.222 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 46 C CA . GLU 828 828 ? A 21.939 19.968 8.729 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 47 C C . GLU 828 828 ? A 22.045 19.991 10.221 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 48 O O . GLU 828 828 ? A 21.725 19.028 10.912 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 49 C CB . GLU 828 828 ? A 23.368 19.678 8.185 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 50 C CG . GLU 828 828 ? A 23.437 20.143 6.726 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 51 C CD . GLU 828 828 ? A 24.475 19.535 5.796 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 52 O OE1 . GLU 828 828 ? A 25.651 19.396 6.208 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 53 O OE2 . GLU 828 828 ? A 24.077 19.244 4.636 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 54 N N . THR 829 829 ? A 22.470 21.153 10.755 1 1 A THR 0.720 1 ATOM 55 C CA . THR 829 829 ? A 22.552 21.414 12.187 1 1 A THR 0.720 1 ATOM 56 C C . THR 829 829 ? A 21.194 21.345 12.828 1 1 A THR 0.720 1 ATOM 57 O O . THR 829 829 ? 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B 19.282 19.188 4.645 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 254 C CD1 . LEU 827 827 ? B 19.475 17.955 5.560 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 255 C CD2 . LEU 827 827 ? B 20.609 19.712 4.100 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 256 N N . GLU 828 828 ? B 15.646 20.060 4.051 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 257 C CA . GLU 828 828 ? B 14.671 20.775 4.852 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 258 C C . GLU 828 828 ? B 13.274 20.312 4.601 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 259 O O . GLU 828 828 ? B 12.346 20.681 5.312 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 260 C CB . GLU 828 828 ? B 14.756 22.296 4.692 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 261 C CG . GLU 828 828 ? B 15.922 22.853 5.527 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 262 C CD . GLU 828 828 ? B 15.922 22.478 7.012 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 263 O OE1 . GLU 828 828 ? B 16.557 21.448 7.351 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 264 O OE2 . GLU 828 828 ? B 15.342 23.214 7.847 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 265 N N . THR 829 829 ? B 13.073 19.385 3.656 1 1 B THR 0.700 1 ATOM 266 C CA . THR 829 829 ? B 11.901 18.508 3.676 1 1 B THR 0.700 1 ATOM 267 C C . THR 829 829 ? 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B 11.831 19.635 9.239 1 1 B ALA 0.750 1 ATOM 282 O O . ALA 831 831 ? B 11.350 19.728 10.363 1 1 B ALA 0.750 1 ATOM 283 C CB . ALA 831 831 ? B 14.137 20.500 9.214 1 1 B ALA 0.750 1 ATOM 284 N N . LYS 832 832 ? B 11.066 19.858 8.145 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 285 C CA . LYS 832 832 ? B 9.618 20.033 8.241 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 286 C C . LYS 832 832 ? B 8.956 18.811 8.834 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 287 O O . LYS 832 832 ? B 8.155 18.931 9.762 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 288 C CB . LYS 832 832 ? B 8.964 20.372 6.871 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 289 C CG . LYS 832 832 ? B 9.462 21.710 6.311 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 290 C CD . LYS 832 832 ? B 8.739 22.167 5.035 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 291 C CE . LYS 832 832 ? B 9.356 23.452 4.466 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 292 N NZ . LYS 832 832 ? B 8.591 23.914 3.288 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 293 N N . VAL 833 833 ? B 9.358 17.610 8.390 1 1 B VAL 0.740 1 ATOM 294 C CA . VAL 833 833 ? B 8.966 16.348 8.983 1 1 B VAL 0.740 1 ATOM 295 C C . VAL 833 833 ? B 9.416 16.217 10.436 1 1 B VAL 0.740 1 ATOM 296 O O . VAL 833 833 ? B 8.617 15.894 11.311 1 1 B VAL 0.740 1 ATOM 297 C CB . VAL 833 833 ? B 9.547 15.210 8.153 1 1 B VAL 0.740 1 ATOM 298 C CG1 . VAL 833 833 ? B 9.227 13.839 8.773 1 1 B VAL 0.740 1 ATOM 299 C CG2 . VAL 833 833 ? B 8.954 15.292 6.733 1 1 B VAL 0.740 1 ATOM 300 N N . LEU 834 834 ? B 10.697 16.501 10.765 1 1 B LEU 0.690 1 ATOM 301 C CA . LEU 834 834 ? B 11.212 16.398 12.119 1 1 B LEU 0.690 1 ATOM 302 C C . LEU 834 834 ? B 10.499 17.305 13.098 1 1 B LEU 0.690 1 ATOM 303 O O . LEU 834 834 ? B 10.103 16.849 14.166 1 1 B LEU 0.690 1 ATOM 304 C CB . LEU 834 834 ? B 12.731 16.683 12.183 1 1 B LEU 0.690 1 ATOM 305 C CG . LEU 834 834 ? B 13.618 15.524 11.679 1 1 B LEU 0.690 1 ATOM 306 C CD1 . LEU 834 834 ? B 15.039 16.024 11.351 1 1 B LEU 0.690 1 ATOM 307 C CD2 . LEU 834 834 ? B 13.683 14.385 12.719 1 1 B LEU 0.690 1 ATOM 308 N N . LYS 835 835 ? B 10.254 18.581 12.743 1 1 B LYS 0.700 1 ATOM 309 C CA . LYS 835 835 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.626 2 1 3 0 3 1 4 0.184 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 822 ALA 1 0.250 2 1 A 823 GLN 1 0.340 3 1 A 824 LEU 1 0.510 4 1 A 825 GLN 1 0.560 5 1 A 826 ALA 1 0.680 6 1 A 827 LEU 1 0.660 7 1 A 828 GLU 1 0.690 8 1 A 829 THR 1 0.720 9 1 A 830 THR 1 0.720 10 1 A 831 ALA 1 0.760 11 1 A 832 LYS 1 0.730 12 1 A 833 VAL 1 0.760 13 1 A 834 LEU 1 0.700 14 1 A 835 LYS 1 0.720 15 1 A 836 GLN 1 0.730 16 1 A 837 ARG 1 0.660 17 1 A 838 VAL 1 0.730 18 1 A 839 ASP 1 0.700 19 1 A 840 SER 1 0.720 20 1 A 841 LEU 1 0.660 21 1 A 842 THR 1 0.670 22 1 A 843 ALA 1 0.700 23 1 A 844 LYS 1 0.630 24 1 A 845 LEU 1 0.630 25 1 A 846 GLN 1 0.580 26 1 A 847 GLY 1 0.580 27 1 A 848 ALA 1 0.480 28 1 A 849 GLU 1 0.390 29 1 B 822 ALA 1 0.260 30 1 B 823 GLN 1 0.350 31 1 B 824 LEU 1 0.510 32 1 B 825 GLN 1 0.540 33 1 B 826 ALA 1 0.650 34 1 B 827 LEU 1 0.630 35 1 B 828 GLU 1 0.670 36 1 B 829 THR 1 0.700 37 1 B 830 THR 1 0.710 38 1 B 831 ALA 1 0.750 39 1 B 832 LYS 1 0.710 40 1 B 833 VAL 1 0.740 41 1 B 834 LEU 1 0.690 42 1 B 835 LYS 1 0.700 43 1 B 836 GLN 1 0.710 44 1 B 837 ARG 1 0.650 45 1 B 838 VAL 1 0.730 46 1 B 839 ASP 1 0.690 47 1 B 840 SER 1 0.710 48 1 B 841 LEU 1 0.660 49 1 B 842 THR 1 0.670 50 1 B 843 ALA 1 0.700 51 1 B 844 LYS 1 0.620 52 1 B 845 LEU 1 0.640 53 1 B 846 GLN 1 0.580 54 1 B 847 GLY 1 0.580 55 1 B 848 ALA 1 0.480 56 1 B 849 GLU 1 0.390 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #