data_SMR-d6cb992f315790d5d07e3d09ced775ea_2 _entry.id SMR-d6cb992f315790d5d07e3d09ced775ea_2 _struct.entry_id SMR-d6cb992f315790d5d07e3d09ced775ea_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P89452/ DNBI_HHV2H, Major DNA-binding protein Estimated model accuracy of this model is 0.014, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P89452' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 150091.578 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DNBI_HHV2H P89452 1 ;MDTKPKTTTTVKVPPGPMGYVYGRACPAEGLELLSLLSARSGDADVAVAPLIVGLTVESGFEANVAAVVG SRTTGLGGTAVSLKLMPSHYSPSVYVFHGGRHLAPSTQAPNLTRLCERARPHFGFADYAPRPCDLKHETT GDALCERLGLDPDRALLYLVITEGFREAVCISNTFLHLGGMDKVTIGDAEVHRIPVYPLQMFMPDFSRVI ADPFNCNHRSIGENFNYPLPFFNRPLARLLFEAVVGPAAVALRARNVDAVARAAAHLAFDENHEGAALPA DITFTAFEASQGKPQRGARDAGNKGPAGGFEQRLASVMAGDAALALESIVSMAVFDEPPPDITTWPLLEG QETPAARAGAVGAYLARAAGLVGAMVFSTNSALHLTEVDDAGPADPKDHSKPSFYRFFLVPGTHVAANPQ LDREGHVVPGYEGRPTAPLVGGTQEFAGEHLAMLCGFSPALLAKMLFYLERCDGGVIVGRQEMDVFRYVA DSGQTDVPCNLCTFETRHACAHTTLMRLRARHPKFASAARGAIGVFGTMNSAYSDCDVLGNYAAFSALKR ADGSENTRTIMQETYRAATERVMAELEALQYVDQAVPTALGRLETIIGNREALHTVVNNIKQLVDREVEQ LMRNLIEGRNFKFRDGLAEANHAMSLSLDPYTCGPCPLLQLLARRSNLAVYQDLALSQCHGVFAGQSVEG RNFRNQFQPVLRRRVMDLFNNGFLSAKTLTVALSEGAAICAPSLTAGQTAPAESSFEGDVARVTLGFPKE LRVKSRVLFAGASANASEAAKARVASLQSAYQKPDKRVDILLGPLGFLLKQFHAVIFPNGKPPGSNQPNP QWFWTALQRNQLPARLLSREDIETIAFIKRFSLDYGAINFINLAPNNVSELAMYYMANQILRYCDHSTYF INTLTAVIAGSRRPPSVQAAAAWAPQGGAGLEAGARALMDSLDAHPGAWTSMFASCNLLRPVMAARPMVV LGLSISKYYGMAGNDRVFQAGNWASLLGGKNACPLLIFDRTRKFVLACPRAGFVCAASSLGGGAHEHSLC EQLRGIIAEGGAAVASSVFVATVKSLGPRTQQLQIEDWLALLEDEYLSEEMMEFTTRALERGHGEWSTDA ALEVAHEAEALVSQLGAAGEVFNFGDFGDEDDHAASFGGLAAAAGAAGVARKRAFHGDDPFGEGPPEKKD LTLDML ; 'Major DNA-binding protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1196 1 1196 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . DNBI_HHV2H P89452 . 1 1196 10315 'Human herpesvirus 2 (strain HG52) (HHV-2) (Human herpes simplex virus 2)' 1997-05-01 A19CA843280DD7F5 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MDTKPKTTTTVKVPPGPMGYVYGRACPAEGLELLSLLSARSGDADVAVAPLIVGLTVESGFEANVAAVVG SRTTGLGGTAVSLKLMPSHYSPSVYVFHGGRHLAPSTQAPNLTRLCERARPHFGFADYAPRPCDLKHETT GDALCERLGLDPDRALLYLVITEGFREAVCISNTFLHLGGMDKVTIGDAEVHRIPVYPLQMFMPDFSRVI ADPFNCNHRSIGENFNYPLPFFNRPLARLLFEAVVGPAAVALRARNVDAVARAAAHLAFDENHEGAALPA DITFTAFEASQGKPQRGARDAGNKGPAGGFEQRLASVMAGDAALALESIVSMAVFDEPPPDITTWPLLEG QETPAARAGAVGAYLARAAGLVGAMVFSTNSALHLTEVDDAGPADPKDHSKPSFYRFFLVPGTHVAANPQ LDREGHVVPGYEGRPTAPLVGGTQEFAGEHLAMLCGFSPALLAKMLFYLERCDGGVIVGRQEMDVFRYVA DSGQTDVPCNLCTFETRHACAHTTLMRLRARHPKFASAARGAIGVFGTMNSAYSDCDVLGNYAAFSALKR 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DITFTAFEASQGKPQRGARDAGNKGPAGGFEQRLASVMAGDAALALESIVSMAVFDEPPPDITTWPLLEG QETPAARAGAVGAYLARAAGLVGAMVFSTNSALHLTEVDDAGPADPKDHSKPSFYRFFLVPGTHVAANPQ LDREGHVVPGYEGRPTAPLVGGTQEFAGEHLAMLCGFSPALLAKMLFYLERCDGGVIVGRQEMDVFRYVA DSGQTDVPCNLCTFETRHACAHTTLMRLRARHPKFASAARGAIGVFGTMNSAYSDCDVLGNYAAFSALKR ADGSENTRTIMQETYRAATERVMAELEALQYVDQAVPTALGRLETIIGNREALHTVVNNIKQLVDREVEQ LMRNLIEGRNFKFRDGLAEANHAMSLSLDPYTCGPCPLLQLLARRSNLAVYQDLALSQCHGVFAGQSVEG RNFRNQFQPVLRRRVMDLFNNGFLSAKTLTVALSEGAAICAPSLTAGQTAPAESSFEGDVARVTLGFPKE LRVKSRVLFAGASANASEAAKARVASLQSAYQKPDKRVDILLGPLGFLLKQFHAVIFPNGKPPGSNQPNP QWFWTALQRNQLPARLLSREDIETIAFIKRFSLDYGAINFINLAPNNVSELAMYYMANQILRYCDHSTYF INTLTAVIAGSRRPPSVQAAAAWAPQGGAGLEAGARALMDSLDAHPGAWTSMFASCNLLRPVMAARPMVV LGLSISKYYGMAGNDRVFQAGNWASLLGGKNACPLLIFDRTRKFVLACPRAGFVCAASSLGGGAHEHSLC EQLRGIIAEGGAAVASSVFVATVKSLGPRTQQLQIEDWLALLEDEYLSEEMMEFTTRALERGHGEWSTDA ALEVAHEAEALVSQLGAAGEVFNFGDFGDEDDHAASFGGLAAAAGAAGVARKRAFHGDDPFGEGPPEKKD LTLDML ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASP . 1 3 THR . 1 4 LYS . 1 5 PRO . 1 6 LYS . 1 7 THR . 1 8 THR . 1 9 THR . 1 10 THR . 1 11 VAL . 1 12 LYS . 1 13 VAL . 1 14 PRO . 1 15 PRO . 1 16 GLY . 1 17 PRO . 1 18 MET . 1 19 GLY . 1 20 TYR . 1 21 VAL . 1 22 TYR . 1 23 GLY . 1 24 ARG . 1 25 ALA . 1 26 CYS . 1 27 PRO . 1 28 ALA . 1 29 GLU . 1 30 GLY . 1 31 LEU . 1 32 GLU . 1 33 LEU . 1 34 LEU . 1 35 SER . 1 36 LEU . 1 37 LEU . 1 38 SER . 1 39 ALA . 1 40 ARG . 1 41 SER . 1 42 GLY . 1 43 ASP . 1 44 ALA . 1 45 ASP . 1 46 VAL . 1 47 ALA . 1 48 VAL . 1 49 ALA . 1 50 PRO . 1 51 LEU . 1 52 ILE . 1 53 VAL . 1 54 GLY . 1 55 LEU . 1 56 THR . 1 57 VAL . 1 58 GLU . 1 59 SER . 1 60 GLY . 1 61 PHE . 1 62 GLU . 1 63 ALA . 1 64 ASN . 1 65 VAL . 1 66 ALA . 1 67 ALA . 1 68 VAL . 1 69 VAL . 1 70 GLY . 1 71 SER . 1 72 ARG . 1 73 THR . 1 74 THR . 1 75 GLY . 1 76 LEU . 1 77 GLY . 1 78 GLY . 1 79 THR . 1 80 ALA . 1 81 VAL . 1 82 SER . 1 83 LEU . 1 84 LYS . 1 85 LEU . 1 86 MET . 1 87 PRO . 1 88 SER . 1 89 HIS . 1 90 TYR . 1 91 SER . 1 92 PRO . 1 93 SER . 1 94 VAL . 1 95 TYR . 1 96 VAL . 1 97 PHE . 1 98 HIS . 1 99 GLY . 1 100 GLY . 1 101 ARG . 1 102 HIS . 1 103 LEU . 1 104 ALA . 1 105 PRO . 1 106 SER . 1 107 THR . 1 108 GLN . 1 109 ALA . 1 110 PRO . 1 111 ASN . 1 112 LEU . 1 113 THR . 1 114 ARG . 1 115 LEU . 1 116 CYS . 1 117 GLU . 1 118 ARG . 1 119 ALA . 1 120 ARG . 1 121 PRO . 1 122 HIS . 1 123 PHE . 1 124 GLY . 1 125 PHE . 1 126 ALA . 1 127 ASP . 1 128 TYR . 1 129 ALA . 1 130 PRO . 1 131 ARG . 1 132 PRO . 1 133 CYS . 1 134 ASP . 1 135 LEU . 1 136 LYS . 1 137 HIS . 1 138 GLU . 1 139 THR . 1 140 THR . 1 141 GLY . 1 142 ASP . 1 143 ALA . 1 144 LEU . 1 145 CYS . 1 146 GLU . 1 147 ARG . 1 148 LEU . 1 149 GLY . 1 150 LEU . 1 151 ASP . 1 152 PRO . 1 153 ASP . 1 154 ARG . 1 155 ALA . 1 156 LEU . 1 157 LEU . 1 158 TYR . 1 159 LEU . 1 160 VAL . 1 161 ILE . 1 162 THR . 1 163 GLU . 1 164 GLY . 1 165 PHE . 1 166 ARG . 1 167 GLU . 1 168 ALA . 1 169 VAL . 1 170 CYS . 1 171 ILE . 1 172 SER 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B . A 1 1021 THR 1021 ? ? ? B . A 1 1022 ARG 1022 ? ? ? B . A 1 1023 LYS 1023 ? ? ? B . A 1 1024 PHE 1024 ? ? ? B . A 1 1025 VAL 1025 ? ? ? B . A 1 1026 LEU 1026 ? ? ? B . A 1 1027 ALA 1027 ? ? ? B . A 1 1028 CYS 1028 ? ? ? B . A 1 1029 PRO 1029 ? ? ? B . A 1 1030 ARG 1030 ? ? ? B . A 1 1031 ALA 1031 ? ? ? B . A 1 1032 GLY 1032 ? ? ? B . A 1 1033 PHE 1033 ? ? ? B . A 1 1034 VAL 1034 ? ? ? B . A 1 1035 CYS 1035 ? ? ? B . A 1 1036 ALA 1036 ? ? ? B . A 1 1037 ALA 1037 ? ? ? B . A 1 1038 SER 1038 ? ? ? B . A 1 1039 SER 1039 ? ? ? B . A 1 1040 LEU 1040 ? ? ? B . A 1 1041 GLY 1041 ? ? ? B . A 1 1042 GLY 1042 ? ? ? B . A 1 1043 GLY 1043 ? ? ? B . A 1 1044 ALA 1044 ? ? ? B . A 1 1045 HIS 1045 ? ? ? B . A 1 1046 GLU 1046 ? ? ? B . A 1 1047 HIS 1047 ? ? ? B . A 1 1048 SER 1048 ? ? ? B . A 1 1049 LEU 1049 ? ? ? B . A 1 1050 CYS 1050 ? ? ? B . A 1 1051 GLU 1051 ? ? ? B . A 1 1052 GLN 1052 ? ? ? B . A 1 1053 LEU 1053 ? ? ? B . A 1 1054 ARG 1054 ? ? ? B . A 1 1055 GLY 1055 ? ? ? B . A 1 1056 ILE 1056 ? ? ? B . A 1 1057 ILE 1057 ? ? ? B . A 1 1058 ALA 1058 ? ? ? B . A 1 1059 GLU 1059 ? ? ? B . A 1 1060 GLY 1060 ? ? ? B . A 1 1061 GLY 1061 ? ? ? B . A 1 1062 ALA 1062 ? ? ? B . A 1 1063 ALA 1063 ? ? ? B . A 1 1064 VAL 1064 ? ? ? B . A 1 1065 ALA 1065 ? ? ? B . A 1 1066 SER 1066 ? ? ? B . A 1 1067 SER 1067 ? ? ? B . A 1 1068 VAL 1068 ? ? ? B . A 1 1069 PHE 1069 ? ? ? B . A 1 1070 VAL 1070 ? ? ? B . A 1 1071 ALA 1071 ? ? ? B . A 1 1072 THR 1072 ? ? ? B . A 1 1073 VAL 1073 ? ? ? B . A 1 1074 LYS 1074 ? ? ? B . A 1 1075 SER 1075 ? ? ? B . A 1 1076 LEU 1076 ? ? ? B . A 1 1077 GLY 1077 ? ? ? B . A 1 1078 PRO 1078 ? ? ? B . A 1 1079 ARG 1079 ? ? ? B . A 1 1080 THR 1080 ? ? ? B . A 1 1081 GLN 1081 ? ? ? B . A 1 1082 GLN 1082 ? ? ? B . A 1 1083 LEU 1083 ? ? ? B . A 1 1084 GLN 1084 ? ? ? B . A 1 1085 ILE 1085 ? ? ? B . A 1 1086 GLU 1086 ? ? ? B . A 1 1087 ASP 1087 ? ? ? B . A 1 1088 TRP 1088 ? ? ? B . A 1 1089 LEU 1089 ? ? ? B . A 1 1090 ALA 1090 ? ? ? B . A 1 1091 LEU 1091 ? ? ? B . A 1 1092 LEU 1092 ? ? ? B . A 1 1093 GLU 1093 ? ? ? B . A 1 1094 ASP 1094 ? ? ? B . A 1 1095 GLU 1095 ? ? ? B . A 1 1096 TYR 1096 ? ? ? B . A 1 1097 LEU 1097 ? ? ? B . A 1 1098 SER 1098 ? ? ? B . A 1 1099 GLU 1099 ? ? ? B . A 1 1100 GLU 1100 ? ? ? B . A 1 1101 MET 1101 ? ? ? B . A 1 1102 MET 1102 ? ? ? B . A 1 1103 GLU 1103 ? ? ? B . A 1 1104 PHE 1104 ? ? ? B . A 1 1105 THR 1105 ? ? ? B . A 1 1106 THR 1106 ? ? ? B . A 1 1107 ARG 1107 ? ? ? B . A 1 1108 ALA 1108 ? ? ? B . A 1 1109 LEU 1109 ? ? ? B . A 1 1110 GLU 1110 ? ? ? B . A 1 1111 ARG 1111 ? ? ? B . A 1 1112 GLY 1112 ? ? ? B . A 1 1113 HIS 1113 ? ? ? B . A 1 1114 GLY 1114 ? ? ? B . A 1 1115 GLU 1115 ? ? ? B . A 1 1116 TRP 1116 ? ? ? B . A 1 1117 SER 1117 ? ? ? B . A 1 1118 THR 1118 ? ? ? B . A 1 1119 ASP 1119 ? ? ? B . A 1 1120 ALA 1120 ? ? ? B . A 1 1121 ALA 1121 ? ? ? B . A 1 1122 LEU 1122 ? ? ? B . A 1 1123 GLU 1123 ? ? ? B . A 1 1124 VAL 1124 ? ? ? B . A 1 1125 ALA 1125 ? ? ? B . A 1 1126 HIS 1126 ? ? ? B . A 1 1127 GLU 1127 ? ? ? B . A 1 1128 ALA 1128 ? ? ? B . A 1 1129 GLU 1129 ? ? ? B . A 1 1130 ALA 1130 ? ? ? B . A 1 1131 LEU 1131 ? ? ? B . A 1 1132 VAL 1132 ? ? ? B . A 1 1133 SER 1133 ? ? ? B . A 1 1134 GLN 1134 ? ? ? B . A 1 1135 LEU 1135 ? ? ? B . A 1 1136 GLY 1136 ? ? ? B . A 1 1137 ALA 1137 ? ? ? B . A 1 1138 ALA 1138 ? ? ? B . A 1 1139 GLY 1139 ? ? ? B . A 1 1140 GLU 1140 ? ? ? B . A 1 1141 VAL 1141 ? ? ? B . A 1 1142 PHE 1142 ? ? ? B . A 1 1143 ASN 1143 ? ? ? B . A 1 1144 PHE 1144 ? ? ? B . A 1 1145 GLY 1145 ? ? ? B . A 1 1146 ASP 1146 ? ? ? B . A 1 1147 PHE 1147 ? ? ? B . A 1 1148 GLY 1148 ? ? ? B . A 1 1149 ASP 1149 ? ? ? B . A 1 1150 GLU 1150 ? ? ? B . A 1 1151 ASP 1151 ? ? ? B . A 1 1152 ASP 1152 ? ? ? B . A 1 1153 HIS 1153 ? ? ? B . A 1 1154 ALA 1154 ? ? ? B . A 1 1155 ALA 1155 ? ? ? B . A 1 1156 SER 1156 ? ? ? B . A 1 1157 PHE 1157 ? ? ? B . A 1 1158 GLY 1158 ? ? ? B . A 1 1159 GLY 1159 ? ? ? B . A 1 1160 LEU 1160 ? ? ? B . A 1 1161 ALA 1161 ? ? ? B . A 1 1162 ALA 1162 ? ? ? B . A 1 1163 ALA 1163 ? ? ? B . A 1 1164 ALA 1164 ? ? ? B . A 1 1165 GLY 1165 ? ? ? B . A 1 1166 ALA 1166 ? ? ? B . A 1 1167 ALA 1167 ? ? ? B . A 1 1168 GLY 1168 ? ? ? B . A 1 1169 VAL 1169 ? ? ? B . A 1 1170 ALA 1170 ? ? ? B . A 1 1171 ARG 1171 ? ? ? B . A 1 1172 LYS 1172 ? ? ? B . A 1 1173 ARG 1173 ? ? ? B . A 1 1174 ALA 1174 ? ? ? B . A 1 1175 PHE 1175 ? ? ? B . A 1 1176 HIS 1176 ? ? ? B . A 1 1177 GLY 1177 ? ? ? B . A 1 1178 ASP 1178 ? ? ? B . A 1 1179 ASP 1179 ? ? ? B . A 1 1180 PRO 1180 ? ? ? B . A 1 1181 PHE 1181 ? ? ? B . A 1 1182 GLY 1182 ? ? ? B . A 1 1183 GLU 1183 ? ? ? B . A 1 1184 GLY 1184 ? ? ? B . A 1 1185 PRO 1185 ? ? ? B . A 1 1186 PRO 1186 ? ? ? B . A 1 1187 GLU 1187 ? ? ? B . A 1 1188 LYS 1188 ? ? ? B . A 1 1189 LYS 1189 ? ? ? B . A 1 1190 ASP 1190 ? ? ? B . A 1 1191 LEU 1191 ? ? ? B . A 1 1192 THR 1192 ? ? ? B . A 1 1193 LEU 1193 ? ? ? B . A 1 1194 ASP 1194 ? ? ? B . A 1 1195 MET 1195 ? ? ? B . A 1 1196 LEU 1196 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'MarR family protein Rv0880 {PDB ID=4yif, label_asym_id=F, auth_asym_id=F, SMTL ID=4yif.3.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 4yif, label_asym_id=F' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-06-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-06-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A F 1 1 F # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMVLDSDARLASDLSLAVMRLSRQLRFRNPSSPVSLSQLSALTTLANEGAM TPGALAIRERVRPPSMTRVIASLADMGFVDRAPHPIDGRQVLVSVSESGAELVKAARRARQEWLAERLAT LNRSERDILRSAADLMLALVDESP ; ;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMVLDSDARLASDLSLAVMRLSRQLRFRNPSSPVSLSQLSALTTLANEGAM TPGALAIRERVRPPSMTRVIASLADMGFVDRAPHPIDGRQVLVSVSESGAELVKAARRARQEWLAERLAT LNRSERDILRSAADLMLALVDESP ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 83 143 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4yif 2023-11-08 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1196 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1196 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 71.000 18.033 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDTKPKTTTTVKVPPGPMGYVYGRACPAEGLELLSLLSARSGDADVAVAPLIVGLTVESGFEANVAAVVGSRTTGLGGTAVSLKLMPSHYSPSVYVFHGGRHLAPSTQAPNLTRLCERARPHFGFADYAPRPCDLKHETTGDALCERLGLDPDRALLYLVITEGFREAVCISNTFLHLGGMDKVTIGDAEVHRIPVYPLQMFMPDFSRVIADPFNCNHRSIGENFNYPLPFFNRPLARLLFEAVVGPAAVALRARNVDAVARAAAHLAFDENHEGAALPADITFTAFEASQGKPQRGARDAGNKGPAGGFEQRLASVMAGDAALALESIVSMAVFDEPPPDITTWPLLEGQETPAARAGAVGAYLARAAGLVGAMVFSTNSALHLTEVDDAGPADPKDHSKPSFYRFFLVPGTHVAANPQLDREGHVVPGYEGRPTAPLVGGTQEFAGEHLAMLCGFSPALLAKMLFYLERCDGGVIVGRQEMDVFRYVADSGQTDVPCNLCTFETRHACAHTTLMRLRARHPKFASAARGAIGVFGTMNSAYSDCDVLGNYAAFSALKRADGSENTRTIMQETYRAATERVMAELEALQYVDQAVPTALGRLETIIGNREALHTVVNNIKQLVDREVEQLMRNLIEGRNFKFRDGLAEANHAMSLSLDPYTCGPCPLLQLLARRSNLAVYQDLALSQCHGVFAGQSVEGRNFRNQFQPVLRRRVMDLFNNGFLSAKTLTVALSEGAAICAPSLTAGQTAPAESSFEGDVARVTLGFPKELRVKSRVLFAGASANASEAAKARVASLQSAYQKPDKRVDILLGPLGFLLKQFHAVIFPNGKPPGSNQPNPQWFWTALQRNQLPARLLSREDIETIAFIKRFSLDYGAINFINLAPNNVSELAMYYMANQILRYCDHSTYFINTLTAVIAGSRRPPSVQAAAAWAPQGGAGLEAGARALMDSLDAHPGAWTSMFASCNLLRPVMAARPMVVLGLSISKYYGMAGNDRVFQAGNWASLLGGKNACPLLIFDRTRKFVLACPRAGFVCAASSLGGGAHEHSLCEQLRGIIAEGGAAVASSVFVATVKSLGPRTQQLQIEDWLALLEDEYLSEEMMEFTTRALERGHGEWSTDAALEVAHEAEALVSQLGAAGEVFNFGDFGDEDDHAASFGGLAAAAGAAGVARKRAFHGDDPFGEGPPEKKDLTLDML 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PPSMTRVIASLADMGFVDRAPHPIDG-RQVLVSVSESGAELVKAARRARQEWLAERLATLNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4yif.3, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 2' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 16.128 -10.838 61.602 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 16 C CB . ALA 577 577 ? A 18.455 -8.529 61.302 1 1 B ALA 0.670 1 ATOM 17 N N . ALA 578 578 ? A 16.102 -9.358 63.282 1 1 B ALA 0.590 1 ATOM 18 C CA . ALA 578 578 ? A 15.393 -10.205 64.222 1 1 B ALA 0.590 1 ATOM 19 C C . ALA 578 578 ? A 13.947 -10.499 63.824 1 1 B ALA 0.590 1 ATOM 20 O O . ALA 578 578 ? A 13.502 -11.641 63.880 1 1 B ALA 0.590 1 ATOM 21 C CB . ALA 578 578 ? A 15.454 -9.572 65.630 1 1 B ALA 0.590 1 ATOM 22 N N . THR 579 579 ? A 13.198 -9.471 63.366 1 1 B THR 0.620 1 ATOM 23 C CA . THR 579 579 ? A 11.815 -9.573 62.908 1 1 B THR 0.620 1 ATOM 24 C C . THR 579 579 ? A 11.668 -10.434 61.669 1 1 B THR 0.620 1 ATOM 25 O O . THR 579 579 ? A 10.712 -11.193 61.550 1 1 B THR 0.620 1 ATOM 26 C CB . THR 579 579 ? A 11.069 -8.239 62.725 1 1 B THR 0.620 1 ATOM 27 O OG1 . THR 579 579 ? A 11.625 -7.354 61.768 1 1 B THR 0.620 1 ATOM 28 C CG2 . THR 579 579 ? A 11.057 -7.445 64.035 1 1 B THR 0.620 1 ATOM 29 N N . GLU 580 580 ? 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A 16.234 -14.486 61.787 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 44 C CD . ARG 581 581 ? A 17.469 -14.836 62.624 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 45 N NE . ARG 581 581 ? A 17.494 -13.933 63.821 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 46 C CZ . ARG 581 581 ? A 18.223 -12.815 63.944 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 47 N NH1 . ARG 581 581 ? A 18.959 -12.338 62.947 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 48 N NH2 . ARG 581 581 ? A 18.203 -12.150 65.100 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 49 N N . VAL 582 582 ? A 11.706 -13.921 63.012 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 50 C CA . VAL 582 582 ? A 10.405 -14.192 63.635 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 51 C C . VAL 582 582 ? A 9.356 -14.543 62.588 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 52 O O . VAL 582 582 ? A 8.617 -15.523 62.693 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 53 C CB . VAL 582 582 ? A 9.884 -12.980 64.428 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 54 C CG1 . VAL 582 582 ? A 8.440 -13.192 64.938 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 55 C CG2 . VAL 582 582 ? A 10.797 -12.682 65.631 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 56 N N . MET 583 583 ? A 9.307 -13.757 61.497 1 1 B MET 0.670 1 ATOM 57 C CA . MET 583 583 ? 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A 3.686 -9.561 54.087 1 1 B ILE 0.360 1 ATOM 240 C CA . ILE 607 607 ? A 3.332 -10.679 54.933 1 1 B ILE 0.360 1 ATOM 241 C C . ILE 607 607 ? A 2.015 -10.358 55.576 1 1 B ILE 0.360 1 ATOM 242 O O . ILE 607 607 ? A 1.789 -9.248 56.055 1 1 B ILE 0.360 1 ATOM 243 C CB . ILE 607 607 ? A 4.380 -10.953 56.001 1 1 B ILE 0.360 1 ATOM 244 C CG1 . ILE 607 607 ? A 5.634 -11.437 55.264 1 1 B ILE 0.360 1 ATOM 245 C CG2 . ILE 607 607 ? A 3.921 -12.075 56.944 1 1 B ILE 0.360 1 ATOM 246 C CD1 . ILE 607 607 ? A 6.859 -11.665 56.141 1 1 B ILE 0.360 1 ATOM 247 N N . GLY 608 608 ? A 1.093 -11.331 55.578 1 1 B GLY 0.420 1 ATOM 248 C CA . GLY 608 608 ? A -0.165 -11.187 56.275 1 1 B GLY 0.420 1 ATOM 249 C C . GLY 608 608 ? A -0.431 -12.465 56.985 1 1 B GLY 0.420 1 ATOM 250 O O . GLY 608 608 ? A 0.220 -13.488 56.770 1 1 B GLY 0.420 1 ATOM 251 N N . ASN 609 609 ? A -1.404 -12.434 57.897 1 1 B ASN 0.500 1 ATOM 252 C CA . ASN 609 609 ? A -1.809 -13.637 58.573 1 1 B ASN 0.500 1 ATOM 253 C C . ASN 609 609 ? A -2.557 -14.689 57.755 1 1 B ASN 0.500 1 ATOM 254 O O . ASN 609 609 ? A -3.485 -14.369 57.005 1 1 B ASN 0.500 1 ATOM 255 C CB . ASN 609 609 ? A -2.510 -13.317 59.908 1 1 B ASN 0.500 1 ATOM 256 C CG . ASN 609 609 ? A -3.834 -12.578 59.756 1 1 B ASN 0.500 1 ATOM 257 O OD1 . ASN 609 609 ? A -3.891 -11.421 59.336 1 1 B ASN 0.500 1 ATOM 258 N ND2 . ASN 609 609 ? A -4.916 -13.263 60.192 1 1 B ASN 0.500 1 ATOM 259 N N . ARG 610 610 ? A -2.205 -15.986 57.937 1 1 B ARG 0.590 1 ATOM 260 C CA . ARG 610 610 ? A -2.985 -17.117 57.456 1 1 B ARG 0.590 1 ATOM 261 C C . ARG 610 610 ? A -4.191 -17.328 58.372 1 1 B ARG 0.590 1 ATOM 262 O O . ARG 610 610 ? A -4.275 -16.770 59.473 1 1 B ARG 0.590 1 ATOM 263 C CB . ARG 610 610 ? A -2.124 -18.419 57.339 1 1 B ARG 0.590 1 ATOM 264 C CG . ARG 610 610 ? A -2.699 -19.631 56.566 1 1 B ARG 0.590 1 ATOM 265 C CD . ARG 610 610 ? A -3.026 -19.315 55.100 1 1 B ARG 0.590 1 ATOM 266 N NE . ARG 610 610 ? A -3.676 -20.490 54.444 1 1 B ARG 0.590 1 ATOM 267 C CZ . ARG 610 610 ? A -4.964 -20.553 54.083 1 1 B ARG 0.590 1 ATOM 268 N NH1 . ARG 610 610 ? A -5.800 -19.564 54.342 1 1 B ARG 0.590 1 ATOM 269 N NH2 . ARG 610 610 ? A -5.471 -21.662 53.557 1 1 B ARG 0.590 1 ATOM 270 N N . GLU 611 611 ? A -5.163 -18.170 57.964 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 271 C CA . GLU 611 611 ? A -6.294 -18.590 58.780 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 272 C C . GLU 611 611 ? A -5.845 -19.271 60.069 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 273 O O . GLU 611 611 ? A -6.300 -18.941 61.157 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 274 C CB . GLU 611 611 ? A -7.217 -19.541 57.981 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 275 C CG . GLU 611 611 ? A -7.942 -18.856 56.794 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 276 C CD . GLU 611 611 ? A -8.628 -19.866 55.859 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 277 O OE1 . GLU 611 611 ? A -7.896 -20.692 55.239 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 278 O OE2 . GLU 611 611 ? A -9.862 -19.814 55.725 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 279 N N . ALA 612 612 ? A -4.853 -20.183 59.984 1 1 B ALA 0.520 1 ATOM 280 C CA . ALA 612 612 ? A -4.283 -20.838 61.146 1 1 B ALA 0.520 1 ATOM 281 C C . ALA 612 612 ? A -3.636 -19.874 62.150 1 1 B ALA 0.520 1 ATOM 282 O O . ALA 612 612 ? A -3.776 -20.029 63.361 1 1 B ALA 0.520 1 ATOM 283 C CB . ALA 612 612 ? A -3.300 -21.951 60.726 1 1 B ALA 0.520 1 ATOM 284 N N . LEU 613 613 ? A -2.935 -18.820 61.688 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 285 C CA . LEU 613 613 ? A -2.419 -17.774 62.559 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 286 C C . LEU 613 613 ? A -3.484 -16.911 63.184 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 287 O O . LEU 613 613 ? A -3.422 -16.589 64.368 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 288 C CB . LEU 613 613 ? A -1.534 -16.828 61.767 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 289 C CG . LEU 613 613 ? A -0.904 -15.637 62.498 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 290 C CD1 . LEU 613 613 ? A 0.063 -15.912 63.673 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 291 C CD2 . LEU 613 613 ? A -0.033 -15.012 61.420 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 292 N N . HIS 614 614 ? A -4.524 -16.545 62.404 1 1 B HIS 0.610 1 ATOM 293 C CA . HIS 614 614 ? A -5.685 -15.833 62.913 1 1 B HIS 0.610 1 ATOM 294 C C . HIS 614 614 ? A -6.339 -16.594 64.051 1 1 B HIS 0.610 1 ATOM 295 O O . HIS 614 614 ? A -6.708 -16.040 65.087 1 1 B HIS 0.610 1 ATOM 296 C CB . HIS 614 614 ? A -6.744 -15.690 61.810 1 1 B HIS 0.610 1 ATOM 297 C CG . HIS 614 614 ? A -7.890 -14.851 62.211 1 1 B HIS 0.610 1 ATOM 298 N ND1 . HIS 614 614 ? A -7.668 -13.528 62.505 1 1 B HIS 0.610 1 ATOM 299 C CD2 . HIS 614 614 ? A -9.190 -15.180 62.401 1 1 B HIS 0.610 1 ATOM 300 C CE1 . HIS 614 614 ? A -8.840 -13.065 62.874 1 1 B HIS 0.610 1 ATOM 301 N NE2 . HIS 614 614 ? A -9.800 -14.021 62.822 1 1 B HIS 0.610 1 ATOM 302 N N . THR 615 615 ? A -6.423 -17.927 63.881 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 303 C CA . THR 615 615 ? A -6.875 -18.863 64.902 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 304 C C . THR 615 615 ? A -6.037 -18.796 66.170 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 305 O O . THR 615 615 ? A -6.583 -18.680 67.264 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 306 C CB . THR 615 615 ? A -6.937 -20.299 64.388 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 307 O OG1 . THR 615 615 ? A -7.848 -20.382 63.303 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 308 C CG2 . THR 615 615 ? A -7.450 -21.279 65.448 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 309 N N . VAL 616 616 ? A -4.683 -18.782 66.074 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 310 C CA . VAL 616 616 ? A -3.803 -18.610 67.231 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 311 C C . VAL 616 616 ? A -4.045 -17.284 67.936 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 312 O O . VAL 616 616 ? A -4.226 -17.245 69.155 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 313 C CB . VAL 616 616 ? A -2.319 -18.717 66.862 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 314 C CG1 . VAL 616 616 ? A -1.393 -18.364 68.049 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 315 C CG2 . VAL 616 616 ? A -2.010 -20.147 66.384 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 316 N N . VAL 617 617 ? A -4.123 -16.172 67.171 1 1 B VAL 0.780 1 ATOM 317 C CA . VAL 617 617 ? A -4.321 -14.827 67.699 1 1 B VAL 0.780 1 ATOM 318 C C . VAL 617 617 ? A -5.620 -14.703 68.461 1 1 B VAL 0.780 1 ATOM 319 O O . VAL 617 617 ? A -5.650 -14.232 69.599 1 1 B VAL 0.780 1 ATOM 320 C CB . VAL 617 617 ? A -4.292 -13.782 66.585 1 1 B VAL 0.780 1 ATOM 321 C CG1 . VAL 617 617 ? A -4.724 -12.381 67.075 1 1 B VAL 0.780 1 ATOM 322 C CG2 . VAL 617 617 ? A -2.860 -13.718 66.027 1 1 B VAL 0.780 1 ATOM 323 N N . ASN 618 618 ? A -6.734 -15.190 67.878 1 1 B ASN 0.790 1 ATOM 324 C CA . ASN 618 618 ? A -8.003 -15.199 68.579 1 1 B ASN 0.790 1 ATOM 325 C C . ASN 618 618 ? A -8.016 -16.100 69.793 1 1 B ASN 0.790 1 ATOM 326 O O . ASN 618 618 ? A -8.567 -15.722 70.819 1 1 B ASN 0.790 1 ATOM 327 C CB . ASN 618 618 ? A -9.210 -15.532 67.688 1 1 B ASN 0.790 1 ATOM 328 C CG . ASN 618 618 ? A -9.505 -14.334 66.801 1 1 B ASN 0.790 1 ATOM 329 O OD1 . ASN 618 618 ? A -9.156 -13.183 67.064 1 1 B ASN 0.790 1 ATOM 330 N ND2 . ASN 618 618 ? A -10.243 -14.609 65.706 1 1 B ASN 0.790 1 ATOM 331 N N . ASN 619 619 ? A -7.400 -17.294 69.746 1 1 B ASN 0.750 1 ATOM 332 C CA . ASN 619 619 ? A -7.313 -18.165 70.907 1 1 B ASN 0.750 1 ATOM 333 C C . ASN 619 619 ? A -6.595 -17.529 72.092 1 1 B ASN 0.750 1 ATOM 334 O O . ASN 619 619 ? A -7.051 -17.631 73.232 1 1 B ASN 0.750 1 ATOM 335 C CB . ASN 619 619 ? A -6.574 -19.476 70.574 1 1 B ASN 0.750 1 ATOM 336 C CG . ASN 619 619 ? A -7.435 -20.363 69.687 1 1 B ASN 0.750 1 ATOM 337 O OD1 . ASN 619 619 ? A -8.653 -20.222 69.584 1 1 B ASN 0.750 1 ATOM 338 N ND2 . ASN 619 619 ? A -6.780 -21.356 69.040 1 1 B ASN 0.750 1 ATOM 339 N N . ILE 620 620 ? A -5.470 -16.828 71.829 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 340 C CA . ILE 620 620 ? A -4.755 -16.024 72.816 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 341 C C . ILE 620 620 ? A -5.606 -14.875 73.326 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 342 O O . ILE 620 620 ? A -5.745 -14.680 74.533 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 343 C CB . ILE 620 620 ? A -3.432 -15.501 72.253 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 344 C CG1 . ILE 620 620 ? A -2.471 -16.683 71.986 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 345 C CG2 . ILE 620 620 ? A -2.777 -14.468 73.204 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 346 C CD1 . ILE 620 620 ? A -1.238 -16.297 71.163 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 347 N N . LYS 621 621 ? A -6.262 -14.115 72.427 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 348 C CA . LYS 621 621 ? A -7.133 -13.022 72.815 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 349 C C . LYS 621 621 ? A -8.314 -13.469 73.667 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 350 O O . LYS 621 621 ? A -8.615 -12.886 74.704 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 351 C CB . LYS 621 621 ? A -7.632 -12.273 71.560 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 352 C CG . LYS 621 621 ? A -8.495 -11.056 71.907 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 353 C CD . LYS 621 621 ? A -8.902 -10.234 70.682 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 354 C CE . LYS 621 621 ? A -9.709 -8.992 71.069 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 355 N NZ . LYS 621 621 ? A -10.974 -9.373 71.748 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 356 N N . GLN 622 622 ? A -8.966 -14.578 73.285 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 357 C CA . GLN 622 622 ? A -10.043 -15.187 74.032 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 358 C C . GLN 622 622 ? A -9.629 -15.639 75.418 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 359 O O . GLN 622 622 ? A -10.392 -15.515 76.374 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 360 C CB . GLN 622 622 ? A -10.586 -16.412 73.279 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 361 C CG . GLN 622 622 ? A -11.418 -16.078 72.027 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 362 C CD . GLN 622 622 ? A -11.792 -17.385 71.336 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 363 O OE1 . GLN 622 622 ? A -12.052 -18.385 72.013 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 364 N NE2 . GLN 622 622 ? A -11.828 -17.374 69.984 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 365 N N . LEU 623 623 ? A -8.409 -16.191 75.569 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 366 C CA . LEU 623 623 ? A -7.863 -16.523 76.870 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 367 C C . LEU 623 623 ? A -7.705 -15.299 77.766 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 368 O O . LEU 623 623 ? A -8.192 -15.303 78.895 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 369 C CB . LEU 623 623 ? A -6.515 -17.261 76.710 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 370 C CG . LEU 623 623 ? A -5.860 -17.725 78.025 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 371 C CD1 . LEU 623 623 ? A -6.750 -18.680 78.837 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 372 C CD2 . LEU 623 623 ? A -4.489 -18.355 77.744 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 373 N N . VAL 624 624 ? A -7.122 -14.198 77.229 1 1 B VAL 0.750 1 ATOM 374 C CA . VAL 624 624 ? A -6.962 -12.930 77.939 1 1 B VAL 0.750 1 ATOM 375 C C . 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A -19.560 0.744 87.451 1 1 B GLU 0.290 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.505 2 1 3 0.014 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 576 ARG 1 0.660 2 1 A 577 ALA 1 0.670 3 1 A 578 ALA 1 0.590 4 1 A 579 THR 1 0.620 5 1 A 580 GLU 1 0.600 6 1 A 581 ARG 1 0.580 7 1 A 582 VAL 1 0.690 8 1 A 583 MET 1 0.670 9 1 A 584 ALA 1 0.710 10 1 A 585 GLU 1 0.610 11 1 A 586 LEU 1 0.480 12 1 A 587 GLU 1 0.530 13 1 A 588 ALA 1 0.640 14 1 A 589 LEU 1 0.370 15 1 A 590 GLN 1 0.420 16 1 A 591 TYR 1 0.310 17 1 A 592 VAL 1 0.460 18 1 A 593 ASP 1 0.430 19 1 A 594 GLN 1 0.300 20 1 A 595 ALA 1 0.290 21 1 A 596 VAL 1 0.210 22 1 A 597 PRO 1 0.200 23 1 A 598 THR 1 0.220 24 1 A 599 ALA 1 0.240 25 1 A 600 LEU 1 0.300 26 1 A 601 GLY 1 0.270 27 1 A 602 ARG 1 0.190 28 1 A 603 LEU 1 0.190 29 1 A 604 GLU 1 0.220 30 1 A 605 THR 1 0.270 31 1 A 606 ILE 1 0.260 32 1 A 607 ILE 1 0.360 33 1 A 608 GLY 1 0.420 34 1 A 609 ASN 1 0.500 35 1 A 610 ARG 1 0.590 36 1 A 611 GLU 1 0.610 37 1 A 612 ALA 1 0.520 38 1 A 613 LEU 1 0.470 39 1 A 614 HIS 1 0.610 40 1 A 615 THR 1 0.650 41 1 A 616 VAL 1 0.660 42 1 A 617 VAL 1 0.780 43 1 A 618 ASN 1 0.790 44 1 A 619 ASN 1 0.750 45 1 A 620 ILE 1 0.680 46 1 A 621 LYS 1 0.740 47 1 A 622 GLN 1 0.760 48 1 A 623 LEU 1 0.770 49 1 A 624 VAL 1 0.750 50 1 A 625 ASP 1 0.790 51 1 A 626 ARG 1 0.700 52 1 A 627 GLU 1 0.660 53 1 A 628 VAL 1 0.730 54 1 A 629 GLU 1 0.710 55 1 A 630 GLN 1 0.560 56 1 A 631 LEU 1 0.470 57 1 A 632 MET 1 0.510 58 1 A 633 ARG 1 0.440 59 1 A 634 ASN 1 0.250 60 1 A 635 LEU 1 0.300 61 1 A 636 ILE 1 0.280 62 1 A 637 GLU 1 0.290 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #