data_SMR-b40736893a541837f02eed3546978922_4
_entry.id SMR-b40736893a541837f02eed3546978922_4
_struct.entry_id SMR-b40736893a541837f02eed3546978922_4
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q73WX4/ KGD_MYCPA, Multifunctional 2-oxoglutarate metabolism enzyme

Estimated model accuracy of this model is 0.414, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q73WX4'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
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_citation.title
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_citation.page_last
_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
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_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 159688.841 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP KGD_MYCPA Q73WX4 1
;MSNISSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYNPEPTGDSVLAAPASTDGPSAPAPAAPQTA
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GYTVGNPDALVLWEAQFGDFVNGAQSIIDEFISSGEAKWGQLSNVVLLLPHGHEGQGPDHTSARIERFLQ
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DGIGDRGKVSRVLLTSGKLYYELVARKNKDNRDDVAIVRIEQLAPLPKRRLGETLDRYPNVREYFWVQEE
PANQGAWPRFGLELPELLPDKLTGLKRISRRAMSAPSSGSSKVHAVEQQEIIDTAFA
;
'Multifunctional 2-oxoglutarate metabolism enzyme'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1247 1 1247
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
_ma_target_ref_db_details.is_primary
1 UNP . KGD_MYCPA Q73WX4 . 1 1247 262316
'Mycolicibacterium paratuberculosis (strain ATCC BAA-968 / K-10)(Mycobacterium paratuberculosis)'
2004-07-05 D31E9876D146519A .
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no M
;MSNISSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYNPEPTGDSVLAAPASTDGPSAPAPAAPQTA
QPALPAQTAPPAQTAQPARPAPQPAAAPGNGASTRPAKPATPPPAEGDELQTLRGAAAAVVKNMSASLEV
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PANQGAWPRFGLELPELLPDKLTGLKRISRRAMSAPSSGSSKVHAVEQQEIIDTAFA
;

;MSNISSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYNPEPTGDSVLAAPASTDGPSAPAPAAPQTA
QPALPAQTAPPAQTAQPARPAPQPAAAPGNGASTRPAKPATPPPAEGDELQTLRGAAAAVVKNMSASLEV
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LEGLVRAKQDLLDHGADDQGDEKAFSVVPMMLHGDAAFAGQGVVAETLNLTHLPGYRVGGTIHIIVNNQI
GFTTAPEHSRSSEYCTDVAKMIGAPIFHVNGDDPEACAWVAKLAVDFRQKFKKDVVIDMLCYRKRGHNEG
DDPSMTNPAMYDVVDIKRGVRKSYTEALIGRGDISMKEAEDALRDYQGQLERVFNEVRELEKHGVGPSES
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AGGKLVRLSGQDTRRGTFSQRHSVIIDRNTGEEFTPLQLLATNPDGTPTGGKFLVYDSPLSEYAAVGFEY
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;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 SER .
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1 25 ASP .
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1 112 PRO .
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1 127 ALA .
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1 129 ALA .
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1 131 VAL .
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1 144 THR .
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1 147 ARG .
1 148 ALA .
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1 194 ASN .
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1 224 ASP .
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1 1208 LEU .
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1 1212 LEU .
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1 1225 ALA .
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1 1230 SER .
1 1231 SER .
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1 1233 VAL .
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1 1236 VAL .
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1 1239 GLN .
1 1240 GLU .
1 1241 ILE .
1 1242 ILE .
1 1243 ASP .
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1 1247 ALA .
#
#
loop_
_struct_asym.id
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.details
A 1 .
#
#
loop_
_pdbx_poly_seq_scheme.asym_id
_pdbx_poly_seq_scheme.entity_id
_pdbx_poly_seq_scheme.seq_id
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_pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code
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A 1 23 ARG 23 23 ARG ARG M .
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A 1 25 ASP 25 25 ASP ASP M .
A 1 26 PRO 26 26 PRO PRO M .
A 1 27 SER 27 27 SER SER M .
A 1 28 SER 28 28 SER SER M .
A 1 29 VAL 29 29 VAL VAL M .
A 1 30 ASP 30 30 ASP ASP M .
A 1 31 PRO 31 31 PRO PRO M .
A 1 32 SER 32 32 SER SER M .
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A 1 202 GLY 202 ? ? ? M .
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A 1 264 GLU 264 ? ? ? M .
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A 1 275 ASN 275 ? ? ? M .
A 1 276 PRO 276 ? ? ? M .
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A 1 278 THR 278 ? ? ? M .
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A 1 1104 ASP 1104 ? ? ? M .
A 1 1105 PHE 1105 ? ? ? M .
A 1 1106 THR 1106 ? ? ? M .
A 1 1107 GLU 1107 ? ? ? M .
A 1 1108 ILE 1108 ? ? ? M .
A 1 1109 LYS 1109 ? ? ? M .
A 1 1110 PHE 1110 ? ? ? M .
A 1 1111 ARG 1111 ? ? ? M .
A 1 1112 SER 1112 ? ? ? M .
A 1 1113 VAL 1113 ? ? ? M .
A 1 1114 LEU 1114 ? ? ? M .
A 1 1115 GLU 1115 ? ? ? M .
A 1 1116 GLU 1116 ? ? ? M .
A 1 1117 PRO 1117 ? ? ? M .
A 1 1118 THR 1118 ? ? ? M .
A 1 1119 TYR 1119 ? ? ? M .
A 1 1120 GLU 1120 ? ? ? M .
A 1 1121 ASP 1121 ? ? ? M .
A 1 1122 GLY 1122 ? ? ? M .
A 1 1123 ILE 1123 ? ? ? M .
A 1 1124 GLY 1124 ? ? ? M .
A 1 1125 ASP 1125 ? ? ? M .
A 1 1126 ARG 1126 ? ? ? M .
A 1 1127 GLY 1127 ? ? ? M .
A 1 1128 LYS 1128 ? ? ? M .
A 1 1129 VAL 1129 ? ? ? M .
A 1 1130 SER 1130 ? ? ? M .
A 1 1131 ARG 1131 ? ? ? M .
A 1 1132 VAL 1132 ? ? ? M .
A 1 1133 LEU 1133 ? ? ? M .
A 1 1134 LEU 1134 ? ? ? M .
A 1 1135 THR 1135 ? ? ? M .
A 1 1136 SER 1136 ? ? ? M .
A 1 1137 GLY 1137 ? ? ? M .
A 1 1138 LYS 1138 ? ? ? M .
A 1 1139 LEU 1139 ? ? ? M .
A 1 1140 TYR 1140 ? ? ? M .
A 1 1141 TYR 1141 ? ? ? M .
A 1 1142 GLU 1142 ? ? ? M .
A 1 1143 LEU 1143 ? ? ? M .
A 1 1144 VAL 1144 ? ? ? M .
A 1 1145 ALA 1145 ? ? ? M .
A 1 1146 ARG 1146 ? ? ? M .
A 1 1147 LYS 1147 ? ? ? M .
A 1 1148 ASN 1148 ? ? ? M .
A 1 1149 LYS 1149 ? ? ? M .
A 1 1150 ASP 1150 ? ? ? M .
A 1 1151 ASN 1151 ? ? ? M .
A 1 1152 ARG 1152 ? ? ? M .
A 1 1153 ASP 1153 ? ? ? M .
A 1 1154 ASP 1154 ? ? ? M .
A 1 1155 VAL 1155 ? ? ? M .
A 1 1156 ALA 1156 ? ? ? M .
A 1 1157 ILE 1157 ? ? ? M .
A 1 1158 VAL 1158 ? ? ? M .
A 1 1159 ARG 1159 ? ? ? M .
A 1 1160 ILE 1160 ? ? ? M .
A 1 1161 GLU 1161 ? ? ? M .
A 1 1162 GLN 1162 ? ? ? M .
A 1 1163 LEU 1163 ? ? ? M .
A 1 1164 ALA 1164 ? ? ? M .
A 1 1165 PRO 1165 ? ? ? M .
A 1 1166 LEU 1166 ? ? ? M .
A 1 1167 PRO 1167 ? ? ? M .
A 1 1168 LYS 1168 ? ? ? M .
A 1 1169 ARG 1169 ? ? ? M .
A 1 1170 ARG 1170 ? ? ? M .
A 1 1171 LEU 1171 ? ? ? M .
A 1 1172 GLY 1172 ? ? ? M .
A 1 1173 GLU 1173 ? ? ? M .
A 1 1174 THR 1174 ? ? ? M .
A 1 1175 LEU 1175 ? ? ? M .
A 1 1176 ASP 1176 ? ? ? M .
A 1 1177 ARG 1177 ? ? ? M .
A 1 1178 TYR 1178 ? ? ? M .
A 1 1179 PRO 1179 ? ? ? M .
A 1 1180 ASN 1180 ? ? ? M .
A 1 1181 VAL 1181 ? ? ? M .
A 1 1182 ARG 1182 ? ? ? M .
A 1 1183 GLU 1183 ? ? ? M .
A 1 1184 TYR 1184 ? ? ? M .
A 1 1185 PHE 1185 ? ? ? M .
A 1 1186 TRP 1186 ? ? ? M .
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A 1 1188 GLN 1188 ? ? ? M .
A 1 1189 GLU 1189 ? ? ? M .
A 1 1190 GLU 1190 ? ? ? M .
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A 1 1193 ASN 1193 ? ? ? M .
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A 1 1207 LEU 1207 ? ? ? M .
A 1 1208 LEU 1208 ? ? ? M .
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A 1 1212 LEU 1212 ? ? ? M .
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A 1 1214 GLY 1214 ? ? ? M .
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A 1 1220 ARG 1220 ? ? ? M .
A 1 1221 ARG 1221 ? ? ? M .
A 1 1222 ALA 1222 ? ? ? M .
A 1 1223 MET 1223 ? ? ? M .
A 1 1224 SER 1224 ? ? ? M .
A 1 1225 ALA 1225 ? ? ? M .
A 1 1226 PRO 1226 ? ? ? M .
A 1 1227 SER 1227 ? ? ? M .
A 1 1228 SER 1228 ? ? ? M .
A 1 1229 GLY 1229 ? ? ? M .
A 1 1230 SER 1230 ? ? ? M .
A 1 1231 SER 1231 ? ? ? M .
A 1 1232 LYS 1232 ? ? ? M .
A 1 1233 VAL 1233 ? ? ? M .
A 1 1234 HIS 1234 ? ? ? M .
A 1 1235 ALA 1235 ? ? ? M .
A 1 1236 VAL 1236 ? ? ? M .
A 1 1237 GLU 1237 ? ? ? M .
A 1 1238 GLN 1238 ? ? ? M .
A 1 1239 GLN 1239 ? ? ? M .
A 1 1240 GLU 1240 ? ? ? M .
A 1 1241 ILE 1241 ? ? ? M .
A 1 1242 ILE 1242 ? ? ? M .
A 1 1243 ASP 1243 ? ? ? M .
A 1 1244 THR 1244 ? ? ? M .
A 1 1245 ALA 1245 ? ? ? M .
A 1 1246 PHE 1246 ? ? ? M .
A 1 1247 ALA 1247 ? ? ? M .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'Multifunctional 2-oxoglutarate metabolism enzyme {PDB ID=8p5r, label_asym_id=M, auth_asym_id=N, SMTL ID=8p5r.1.M}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 8p5r, label_asym_id=M'
'target-template alignment' .
4 'model 4' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-06-25
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-06-20
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A M 1 1 N
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMASVSSSPSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYSPEPTTD
SASNGRTTTAAPVTPPTPAPAPAPEPKAAPKPAAKTEAKPAKPAKSATPAKGDESQILRGAAAAVVKNMN
ASLEVPTATSVRAIPAKLMIDNRVVINNHLKRTRGGKISFTHLLGYAIVQAVKKFPNMNRHFAVVDGKPT
AITPAHTNLGLAIDLQGKDGNRSLVVAAIKRCETMRFGQFIAAYEDIVRRARDGKLTAEDFSGVTISLTN
PGTLGTVHSVPRLMQGQGAIIGAGAMEYPAEFQGASEERIADLGIGKLITLTSTYDHRIIQGAESGDFLR
TIHQLLLDDDFFDEIFRELGIPYEPVRWRTDNPDSIEDKNARVIELIAAYRNRGHLMADIDPLRLDNTRF
RSHPDLDVNSHGLTLWDLDREFKVDGFAGVQRKKLRDILSVLRDAYCRHVGVEYTHILEPEQQRWIQERV
ETKHDKPTVAEQKYILSKLNAAEAFETFLQTKYVGQKRFSLEGAETVIPMMDAVIDQCAEHGLDEVVIAM
PHRGRLNVLANIVGKPYSQIFSEFEGNLNPSQAHGSGDVKYHLGATGTYIQMFGDNDIEVSLTANPSHLE
AVDPVLEGLVRAKQDLLDTGEEGSDNRFSVVPLMLHGDAAFAGQGVVAETLNLALLRGYRTGGTIHIVVN
NQIGFTTAPTDSRSSEYCTDVAKMIGAPIFHVNGDDPEACAWVARLAVDFRQAFKKDVVIDMLCYRRRGH
NEGDDPSMTQPYMYDVIDTKRGSRKAYTEALIGRGDISMKEAEDALRDYQGQLERVFNEVRELEKHEIEP
SESVEADQQIPSKLATAVDKAMLQRIGDAHLALPEGFTVHPRVRPVLEKRREMAYEGRIDWAFAELLALG
SLIAEGKLVRLSGQDTQRGTFTQRHAVIVDRKTGEEFTPLQLLATNPDGTPTGGKFLVYNSALSEFAAVG
FEYGYSVGNPDAMVLWEAQFGDFVNGAQSIIDEFISSGEAKWGQLSDVVLLLPHGHEGQGPDHTSGRIER
FLQLWAEGSMTIAMPSTPANYFHLLRRHGKDGIQRPLIVFTPKSMLRNKAAVSDIRDFTESKFRSVLEEP
MYTDGEGDRNKVTRLLLTSGKIYYELAARKAKENREDVAIVRIEQLAPLPRRRLAETLDRYPNVKEKFWV
QEEPANQGAWPSFGLTLPEILPDHFTGLKRISRRAMSAPSSGSSKVHAVEQQEILDTAFG
;

;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMASVSSSPSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYSPEPTTD
SASNGRTTTAAPVTPPTPAPAPAPEPKAAPKPAAKTEAKPAKPAKSATPAKGDESQILRGAAAAVVKNMN
ASLEVPTATSVRAIPAKLMIDNRVVINNHLKRTRGGKISFTHLLGYAIVQAVKKFPNMNRHFAVVDGKPT
AITPAHTNLGLAIDLQGKDGNRSLVVAAIKRCETMRFGQFIAAYEDIVRRARDGKLTAEDFSGVTISLTN
PGTLGTVHSVPRLMQGQGAIIGAGAMEYPAEFQGASEERIADLGIGKLITLTSTYDHRIIQGAESGDFLR
TIHQLLLDDDFFDEIFRELGIPYEPVRWRTDNPDSIEDKNARVIELIAAYRNRGHLMADIDPLRLDNTRF
RSHPDLDVNSHGLTLWDLDREFKVDGFAGVQRKKLRDILSVLRDAYCRHVGVEYTHILEPEQQRWIQERV
ETKHDKPTVAEQKYILSKLNAAEAFETFLQTKYVGQKRFSLEGAETVIPMMDAVIDQCAEHGLDEVVIAM
PHRGRLNVLANIVGKPYSQIFSEFEGNLNPSQAHGSGDVKYHLGATGTYIQMFGDNDIEVSLTANPSHLE
AVDPVLEGLVRAKQDLLDTGEEGSDNRFSVVPLMLHGDAAFAGQGVVAETLNLALLRGYRTGGTIHIVVN
NQIGFTTAPTDSRSSEYCTDVAKMIGAPIFHVNGDDPEACAWVARLAVDFRQAFKKDVVIDMLCYRRRGH
NEGDDPSMTQPYMYDVIDTKRGSRKAYTEALIGRGDISMKEAEDALRDYQGQLERVFNEVRELEKHEIEP
SESVEADQQIPSKLATAVDKAMLQRIGDAHLALPEGFTVHPRVRPVLEKRREMAYEGRIDWAFAELLALG
SLIAEGKLVRLSGQDTQRGTFTQRHAVIVDRKTGEEFTPLQLLATNPDGTPTGGKFLVYNSALSEFAAVG
FEYGYSVGNPDAMVLWEAQFGDFVNGAQSIIDEFISSGEAKWGQLSDVVLLLPHGHEGQGPDHTSGRIER
FLQLWAEGSMTIAMPSTPANYFHLLRRHGKDGIQRPLIVFTPKSMLRNKAAVSDIRDFTESKFRSVLEEP
MYTDGEGDRNKVTRLLLTSGKIYYELAARKAKENREDVAIVRIEQLAPLPRRRLAETLDRYPNVKEKFWV
QEEPANQGAWPSFGLTLPEILPDHFTGLKRISRRAMSAPSSGSSKVHAVEQQEILDTAFG
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 26 1250
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 8p5r 2023-08-23
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1247
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1247 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2e-235 85.061
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MSNISSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYNPEPTGDSVLAAPASTDGPSAPAPAAPQTAQPALPAQTAPPAQTAQPARPAPQPAAAPGNGASTRPAKPATPPPAEGDELQTLRGAAAAVVKNMSASLEVPTATSVRAIPAKLLIDNRIVINNQLKRTRGGKISFTHLLGYALVQAIKKFPNMNRHYAEIDGKPTAITPAHTNLGLAIDLQGKDGKRSLVVAGIKNCETMRFAQFVTAYEDIVRRARDGKLTAEDFAGVTISLTNPGTIGTVHSVPRLMNGQGAIIGVGAMEYPAEFQGASEERIAELGIGKLITLTSTYDHRIIQGAESGDFLRTIHEMLLSDGFWDDIFRELSIPYLPIRWSTDNPDSIVDKNARVMELIAAYRNRGHLMADIDPLRLDGSRFRSHPDLEILNHGLTLWDLDRVFKVNGFAGAEYKKLRDILGLLRDAYCRHIGVEYTHILDPEQQEWLQQRVETKHVKPTVAEQKFILSKLNAAEAFETFLQTKYVGQKRFSLEGAESVIPMMDAAIDQCAEHGLDEVVIGMPHRGRLNVLANIVGKPYSQIFSEFEGNLNPAQAHGSGDVKYHLGATGVYLQMFGDNDIQVSLTANPSHLEAVDPVLEGLVRAKQDLLDHGADDQGDEKAFSVVPMMLHGDAAFAGQGVVAETLNLTHLPGYRVGGTIHIIVNNQIGFTTAPEHSRSSEYCTDVAKMIGAPIFHVNGDDPEACAWVAKLAVDFRQKFKKDVVIDMLCYRKRGHNEGDDPSMTNPAMYDVVDIKRGVRKSYTEALIGRGDISMKEAEDALRDYQGQLERVFNEVRELEKHGVGPSESVEADQMLPAGLATAVDKALLARIGDAFLALPEGFTAHPRVQPVLEKRREMAYEGKIDWAFAELLALGSLVAGGKLVRLSGQDTRRGTFSQRHSVIIDRNTGEEFTPLQLLATNPDGTPTGGKFLVYDSPLSEYAAVGFEYGYTVGNPDALVLWEAQFGDFVNGAQSIIDEFISSGEAKWGQLSNVVLLLPHGHEGQGPDHTSARIERFLQLWAEGSMTIAMPSTPSNYFHLLRRHALDGIKRPLIVFTPKSMLRNKAAVSDIKDFTEIKFRSVLEEPTYEDGIGDRGKVSRVLLTSGKLYYELVARKNKDNRDDVAIVRIEQLAPLPKRRLGETLDRYPNVREYFWVQEEPANQGAWPRFGLELPELLPDKLTGLKRISRRAMSAPSSGSSKVHAVEQQEIIDTAFA
2 1 2
--SSPSPFGQNEWLVEEMYRKFRDDPSSVDPSWHEFLVDYSPEPTTDSASNGRTTTAAPVTPP--TPA---PAPA---PEPKAA---PKPAAKTEAK-------PAKPAKSATPAKGDESQILRGAAAAVVKNMNASLEVPTATSVRAIPAKLMIDNRVVINNHLKRTRGGKISFTHLLGYAIVQAVKKFPNMNRHFAVVDGKPTAITPAHTNLGLAIDLQGKDGNRSLVVAAIKRCETMRFGQFIAAYEDIVRRARDGKLTAEDFSGVTISLTNPGTLGTVHSVPRLMQGQGAIIGAGAMEYPAEFQGASEERIADLGIGKLITLTSTYDHRIIQGAESGDFLRTIHQLLLDDDFFDEIFRELGIPYEPVRWRTDNPDSIEDKNARVIELIAAYRNRGHLMADIDPLRLDNTRFRSHPDLDVNSHGLTLWDLDREFKVDGFAGVQRKKLRDILSVLRDAYCRHVGVEYTHILEPEQQRWIQERVETKHDKPTVAEQKYILSKLNAAEAFETFLQTKYVGQKRFSLEGAETVIPMMDAVIDQCAEHGLDEVVIAMPHRGRLNVLANIVGKPYSQIFSEFEGNLNPSQAHGSGDVKYHLGATGTYIQMFGDNDIEVSLTANPSHLEAVDPVLEGLVRAKQDLLDTGEE--GSDNRFSVVPLMLHGDAAFAGQGVVAETLNLALLRGYRTGGTIHIVVNNQIGFTTAPTDSRSSEYCTDVAKMIGAPIFHVNGDDPEACAWVARLAVDFRQAFKKDVVIDMLCYRRRGHNEGDDPSMTQPYMYDVIDTKRGSRKAYTEALIGRGDISMKEAEDALRDYQGQLERVFNEVRELEKHEIEPSESVEADQQIPSKLATAVDKAMLQRIGDAHLALPEGFTVHPRVRPVLEKRREMAYEGRIDWAFAELLALGSLIAEGKLVRLSGQDTQRGTFTQRHAVIVDRKTGEEFTPLQLLATNPDGTPTGGKFLVYNSALSEFAAVGFEYGYSVGNPDAMVLWEAQFGDFVNGAQSIIDEFISSGEAKWGQLSDVVLLLPHGHEGQGPDHTSGRIERFLQLWAEGSMTIAMPSTPANYFHLLRRHGKDGIQRPLIVFTPKSMLRNKAAVSDIRDFTESKFRSVLEEPMYTDGEGDRNKVTRLLLTSGKIYYELAARKAKENREDVAIVRIEQLAPLPRRRLAETLDRYPNVKEKFWVQEEPANQGAWPSFGLTLPEILPDHFTGLKRISRRAMSAPSSGSSKVHAVEQQEILDTAFG
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.248}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8p5r.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 'model 4' 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_ma_model_group.id
_ma_model_group.name
_ma_model_group.details
1 . .
#
#
loop_
_ma_model_group_link.group_id
_ma_model_group_link.model_id
1 1
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
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ATOM 3 C C . GLU 12 12 ? A 147.283 -124.552 -1.280 1 1 M GLU 0.480 1
ATOM 4 O O . GLU 12 12 ? A 147.686 -124.072 -0.232 1 1 M GLU 0.480 1
ATOM 5 C CB . GLU 12 12 ? A 146.571 -123.838 -3.614 1 1 M GLU 0.480 1
ATOM 6 C CG . GLU 12 12 ? A 145.287 -123.096 -3.164 1 1 M GLU 0.480 1
ATOM 7 C CD . GLU 12 12 ? A 144.097 -123.680 -3.923 1 1 M GLU 0.480 1
ATOM 8 O OE1 . GLU 12 12 ? A 142.950 -123.435 -3.490 1 1 M GLU 0.480 1
ATOM 9 O OE2 . GLU 12 12 ? A 144.354 -124.434 -4.898 1 1 M GLU 0.480 1
ATOM 10 N N . TRP 13 13 ? A 146.550 -125.692 -1.283 1 1 M TRP 0.540 1
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ATOM 147 O OG . SER 27 27 ? A 151.977 -143.622 8.696 1 1 M SER 0.890 1
ATOM 148 N N . SER 28 28 ? A 151.324 -141.382 6.629 1 1 M SER 0.910 1
ATOM 149 C CA . SER 28 28 ? A 150.090 -140.827 6.044 1 1 M SER 0.910 1
ATOM 150 C C . SER 28 28 ? A 150.263 -140.137 4.709 1 1 M SER 0.910 1
ATOM 151 O O . SER 28 28 ? A 149.385 -140.162 3.844 1 1 M SER 0.910 1
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ATOM 161 N N . ASP 30 30 ? A 152.154 -139.705 1.060 1 1 M ASP 0.870 1
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ATOM 169 N N . PRO 31 31 ? A 154.933 -141.759 -0.146 1 1 M PRO 0.850 1
ATOM 170 C CA . PRO 31 31 ? A 156.388 -141.803 -0.001 1 1 M PRO 0.850 1
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ATOM 174 C CG . PRO 31 31 ? A 155.461 -144.033 0.280 1 1 M PRO 0.850 1
ATOM 175 C CD . PRO 31 31 ? A 154.359 -143.098 -0.234 1 1 M PRO 0.850 1
ATOM 176 N N . SER 32 32 ? A 156.563 -140.519 -2.145 1 1 M SER 0.830 1
ATOM 177 C CA . SER 32 32 ? A 157.174 -139.656 -3.153 1 1 M SER 0.830 1
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ATOM 180 C CB . SER 32 32 ? A 156.432 -139.772 -4.511 1 1 M SER 0.830 1
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ATOM 182 N N . TRP 33 33 ? A 156.409 -137.805 -1.694 1 1 M TRP 0.750 1
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ATOM 194 C CZ3 . TRP 33 33 ? A 150.502 -136.248 -2.454 1 1 M TRP 0.750 1
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ATOM 206 N N . GLU 35 35 ? A 160.673 -136.396 -0.511 1 1 M GLU 0.730 1
ATOM 207 C CA . GLU 35 35 ? A 161.704 -135.644 -1.202 1 1 M GLU 0.730 1
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ATOM 210 C CB . GLU 35 35 ? A 162.410 -136.554 -2.241 1 1 M GLU 0.730 1
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ATOM 213 O OE1 . GLU 35 35 ? A 160.708 -138.781 -2.044 1 1 M GLU 0.730 1
ATOM 214 O OE2 . GLU 35 35 ? A 162.224 -140.098 -1.078 1 1 M GLU 0.730 1
ATOM 215 N N . PHE 36 36 ? A 160.193 -133.732 -1.190 1 1 M PHE 0.700 1
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ATOM 228 C C . LEU 37 37 ? A 159.373 -131.304 2.856 1 1 M LEU 0.770 1
ATOM 229 O O . LEU 37 37 ? A 159.195 -130.440 3.711 1 1 M LEU 0.770 1
ATOM 230 C CB . LEU 37 37 ? A 157.248 -132.434 2.519 1 1 M LEU 0.770 1
ATOM 231 C CG . LEU 37 37 ? A 155.865 -132.418 1.852 1 1 M LEU 0.770 1
ATOM 232 C CD1 . LEU 37 37 ? A 155.073 -133.593 2.447 1 1 M LEU 0.770 1
ATOM 233 C CD2 . LEU 37 37 ? A 155.178 -131.045 2.052 1 1 M LEU 0.770 1
ATOM 234 N N . VAL 38 38 ? A 160.524 -132.003 2.795 1 1 M VAL 0.740 1
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ATOM 241 N N . ASP 39 39 ? A 162.099 -129.957 1.867 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 242 C CA . ASP 39 39 ? A 162.747 -128.776 1.357 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 243 C C . ASP 39 39 ? A 161.923 -127.494 1.599 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 244 O O . ASP 39 39 ? A 162.145 -126.459 0.970 1 1 M ASP 0.670 1
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ATOM 246 C CG . ASP 39 39 ? A 163.428 -130.431 -0.442 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 247 O OD1 . ASP 39 39 ? A 164.348 -130.976 0.223 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 248 O OD2 . ASP 39 39 ? A 162.724 -131.032 -1.294 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 249 N N . TYR 40 40 ? A 160.941 -127.536 2.534 1 1 M TYR 0.530 1
ATOM 250 C CA . TYR 40 40 ? A 160.040 -126.437 2.839 1 1 M TYR 0.530 1
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ATOM 256 C CD2 . TYR 40 40 ? A 156.449 -127.246 1.645 1 1 M TYR 0.530 1
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ATOM 261 N N . ASN 41 41 ? A 160.877 -126.454 5.184 1 1 M ASN 0.500 1
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ATOM 265 C CB . ASN 41 41 ? A 159.828 -125.553 7.225 1 1 M ASN 0.500 1
ATOM 266 C CG . ASN 41 41 ? A 160.059 -124.871 8.553 1 1 M ASN 0.500 1
ATOM 267 O OD1 . ASN 41 41 ? A 160.324 -123.663 8.659 1 1 M ASN 0.500 1
ATOM 268 N ND2 . ASN 41 41 ? A 159.947 -125.608 9.671 1 1 M ASN 0.500 1
ATOM 269 O OXT . ASN 41 41 ? A 162.405 -126.733 8.344 1 1 M ASN 0.500 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.775
2 1 3 0.414
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 12 GLU 1 0.480
2 1 A 13 TRP 1 0.540
3 1 A 14 LEU 1 0.710
4 1 A 15 VAL 1 0.690
5 1 A 16 GLU 1 0.750
6 1 A 17 GLU 1 0.830
7 1 A 18 MET 1 0.850
8 1 A 19 TYR 1 0.840
9 1 A 20 ARG 1 0.860
10 1 A 21 LYS 1 0.910
11 1 A 22 PHE 1 0.860
12 1 A 23 ARG 1 0.840
13 1 A 24 ASP 1 0.880
14 1 A 25 ASP 1 0.880
15 1 A 26 PRO 1 0.890
16 1 A 27 SER 1 0.890
17 1 A 28 SER 1 0.910
18 1 A 29 VAL 1 0.910
19 1 A 30 ASP 1 0.870
20 1 A 31 PRO 1 0.850
21 1 A 32 SER 1 0.830
22 1 A 33 TRP 1 0.750
23 1 A 34 HIS 1 0.790
24 1 A 35 GLU 1 0.730
25 1 A 36 PHE 1 0.700
26 1 A 37 LEU 1 0.770
27 1 A 38 VAL 1 0.740
28 1 A 39 ASP 1 0.670
29 1 A 40 TYR 1 0.530
30 1 A 41 ASN 1 0.500
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
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;
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2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
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