data_SMR-32f52cab53ffd79396fe4b72ac6e24df_2
_entry.id SMR-32f52cab53ffd79396fe4b72ac6e24df_2
_struct.entry_id SMR-32f52cab53ffd79396fe4b72ac6e24df_2
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q05854/ YL278_YEAST, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLR278C

Estimated model accuracy of this model is 0.029, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q05854'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
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_citation.title
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_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
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_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 175587.370 1 .
#
#
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_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP YL278_YEAST Q05854 1
;MGRPRKNVSQEKIQQLKRELELAGNRTDVLLQDKKGRSRSCLLCRRRKQRCDHKLPSCTACLKAGIKCVQ
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WTINDDYGFLT
;
'Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLR278C'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1341 1 1341
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
_ma_target_ref_db_details.is_primary
1 UNP . YL278_YEAST Q05854 . 1 1341 559292
"Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast)"
1997-11-01 94201F3964500EEF .
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no A
;MGRPRKNVSQEKIQQLKRELELAGNRTDVLLQDKKGRSRSCLLCRRRKQRCDHKLPSCTACLKAGIKCVQ
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;

;MGRPRKNVSQEKIQQLKRELELAGNRTDVLLQDKKGRSRSCLLCRRRKQRCDHKLPSCTACLKAGIKCVQ
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;

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#
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_entity_poly_seq.entity_id
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1 46 ARG .
1 47 ARG .
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1 1211 SER .
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1 1301 ASN .
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1 1304 PRO .
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1 1307 THR .
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1 1310 ASP .
1 1311 ILE .
1 1312 ARG .
1 1313 LYS .
1 1314 LYS .
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1 1316 SER .
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1 1318 TRP .
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1 1322 MET .
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1 1335 ASP .
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#
#
loop_
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_struct_asym.entity_id
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A 1 .
#
#
loop_
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A 1 217 SER 217 ? ? ? A .
A 1 218 SER 218 ? ? ? A .
A 1 219 ASN 219 ? ? ? A .
A 1 220 MET 220 ? ? ? A .
A 1 221 VAL 221 ? ? ? A .
A 1 222 ILE 222 ? ? ? A .
A 1 223 LEU 223 ? ? ? A .
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A 1 1339 PHE 1339 ? ? ? A .
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#
#
loop_
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_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1 'CD2-LAC9 {PDB ID=1cld, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1cld.1.A}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 1cld, label_asym_id=A'
'target-template alignment' .
4 'model 2' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
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10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-06-25
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-06-20
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
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1.000000 0 0 0
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_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A
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_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1 MKKSSEVMHQACDACRKKKWKCSKTVPTCTNCLKYNLDCVYSPQVVRTPLTRAHLTEMENR
MKKSSEVMHQACDACRKKKWKCSKTVPTCTNCLKYNLDCVYSPQVVRTPLTRAHLTEMENR
#
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1 1 8 43
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#
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_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 1cld 2024-05-22
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#
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1 1 A 1 1341
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#
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_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1341 'target-template pairwise alignment' local
#
#
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_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
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_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.300 36.111
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
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_ma_alignment.ordinal_id
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1 1 1
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2 1 2
------------------------------------MHQACDACRKKKWKCSKTVPTCTNCLKYNLDCVYSP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
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_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1cld.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 'model 2' 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_ma_model_group.id
_ma_model_group.name
_ma_model_group.details
1 . .
#
#
loop_
_ma_model_group_link.group_id
_ma_model_group_link.model_id
1 1
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
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ATOM 3 C C . ARG 39 39 ? A 7.796 -2.857 3.003 1 1 A ARG 0.400 1
ATOM 4 O O . ARG 39 39 ? A 6.928 -3.548 3.514 1 1 A ARG 0.400 1
ATOM 5 C CB . ARG 39 39 ? A 9.760 -3.552 1.635 1 1 A ARG 0.400 1
ATOM 6 C CG . ARG 39 39 ? A 11.272 -3.855 1.561 1 1 A ARG 0.400 1
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ATOM 10 N NH1 . ARG 39 39 ? A 11.809 -5.034 -2.609 1 1 A ARG 0.400 1
ATOM 11 N NH2 . ARG 39 39 ? A 10.688 -6.940 -2.053 1 1 A ARG 0.400 1
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ATOM 14 C C . SER 40 40 ? A 5.590 -1.905 0.925 1 1 A SER 0.550 1
ATOM 15 O O . SER 40 40 ? A 6.303 -2.512 0.138 1 1 A SER 0.550 1
ATOM 16 C CB . SER 40 40 ? A 6.171 0.319 2.126 1 1 A SER 0.550 1
ATOM 17 O OG . SER 40 40 ? A 6.874 0.855 1.005 1 1 A SER 0.550 1
ATOM 18 N N . CYS 41 41 ? A 4.244 -1.858 0.759 1 1 A CYS 0.590 1
ATOM 19 C CA . CYS 41 41 ? A 3.560 -2.383 -0.417 1 1 A CYS 0.590 1
ATOM 20 C C . CYS 41 41 ? A 3.828 -1.454 -1.596 1 1 A CYS 0.590 1
ATOM 21 O O . CYS 41 41 ? A 4.356 -0.380 -1.399 1 1 A CYS 0.590 1
ATOM 22 C CB . CYS 41 41 ? A 2.032 -2.553 -0.155 1 1 A CYS 0.590 1
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ATOM 47 C CA . ARG 45 45 ? A 6.382 2.555 -1.938 1 1 A ARG 0.510 1
ATOM 48 C C . ARG 45 45 ? A 6.451 3.781 -2.819 1 1 A ARG 0.510 1
ATOM 49 O O . ARG 45 45 ? A 7.453 4.495 -2.813 1 1 A ARG 0.510 1
ATOM 50 C CB . ARG 45 45 ? A 6.691 1.296 -2.764 1 1 A ARG 0.510 1
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ATOM 66 N NH1 . ARG 46 46 ? A 1.543 2.929 -9.496 1 1 A ARG 0.500 1
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ATOM 113 S SG . CYS 51 51 ? A 1.072 -2.215 3.279 1 1 A CYS 0.570 1
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ATOM 118 C CB . ASP 52 52 ? A 0.017 -3.372 7.919 1 1 A ASP 0.530 1
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ATOM 132 N N . LYS 54 54 ? A -0.423 -6.551 4.315 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 133 C CA . LYS 54 54 ? A -1.608 -7.374 4.430 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 134 C C . LYS 54 54 ? A -2.362 -7.297 3.131 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 135 O O . LYS 54 54 ? A -2.349 -6.271 2.464 1 1 A LYS 0.500 1
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ATOM 138 C CD . LYS 54 54 ? A -2.783 -6.516 8.074 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 139 C CE . LYS 54 54 ? A -2.102 -6.573 9.443 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 140 N NZ . LYS 54 54 ? A -3.040 -6.104 10.483 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 141 N N . LEU 55 55 ? A -3.001 -8.433 2.767 1 1 A LEU 0.460 1
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ATOM 145 C CB . LEU 55 55 ? A -3.269 -9.919 0.817 1 1 A LEU 0.460 1
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ATOM 147 C CD1 . LEU 55 55 ? A -1.509 -11.160 -0.430 1 1 A LEU 0.460 1
ATOM 148 C CD2 . LEU 55 55 ? A -1.508 -8.649 -0.524 1 1 A LEU 0.460 1
ATOM 149 N N . PRO 56 56 ? A -6.048 -8.411 0.664 1 1 A PRO 0.480 1
ATOM 150 C CA . PRO 56 56 ? A -5.690 -8.079 -0.716 1 1 A PRO 0.480 1
ATOM 151 C C . PRO 56 56 ? A -5.108 -6.708 -0.824 1 1 A PRO 0.480 1
ATOM 152 O O . PRO 56 56 ? A -4.035 -6.539 -1.389 1 1 A PRO 0.480 1
ATOM 153 C CB . PRO 56 56 ? A -6.990 -8.210 -1.529 1 1 A PRO 0.480 1
ATOM 154 C CG . PRO 56 56 ? A -8.137 -8.399 -0.518 1 1 A PRO 0.480 1
ATOM 155 C CD . PRO 56 56 ? A -7.486 -8.510 0.867 1 1 A PRO 0.480 1
ATOM 156 N N . SER 57 57 ? A -5.779 -5.725 -0.227 1 1 A SER 0.550 1
ATOM 157 C CA . SER 57 57 ? A -5.338 -4.369 -0.283 1 1 A SER 0.550 1
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ATOM 161 O OG . SER 57 57 ? A -6.671 -3.687 -2.168 1 1 A SER 0.550 1
ATOM 162 N N . CYS 58 58 ? A -3.796 -3.385 1.264 1 1 A CYS 0.600 1
ATOM 163 C CA . CYS 58 58 ? A -3.403 -2.773 2.506 1 1 A CYS 0.600 1
ATOM 164 C C . CYS 58 58 ? A -4.413 -1.752 3.016 1 1 A CYS 0.600 1
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ATOM 166 C CB . CYS 58 58 ? A -2.013 -2.102 2.393 1 1 A CYS 0.600 1
ATOM 167 S SG . CYS 58 58 ? A -1.857 -0.603 1.389 1 1 A CYS 0.600 1
ATOM 168 N N . THR 59 59 ? A -4.348 -1.420 4.324 1 1 A THR 0.590 1
ATOM 169 C CA . THR 59 59 ? A -5.175 -0.392 4.948 1 1 A THR 0.590 1
ATOM 170 C C . THR 59 59 ? A -5.063 0.982 4.335 1 1 A THR 0.590 1
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ATOM 173 O OG1 . THR 59 59 ? A -3.601 -0.716 6.731 1 1 A THR 0.590 1
ATOM 174 C CG2 . THR 59 59 ? A -5.940 -1.127 7.187 1 1 A THR 0.590 1
ATOM 175 N N . ALA 60 60 ? A -3.893 1.350 3.781 1 1 A ALA 0.620 1
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ATOM 178 O O . ALA 60 60 ? A -5.005 3.481 1.184 1 1 A ALA 0.620 1
ATOM 179 C CB . ALA 60 60 ? A -2.183 2.782 2.820 1 1 A ALA 0.620 1
ATOM 180 N N . CYS 61 61 ? A -4.382 1.326 0.948 1 1 A CYS 0.610 1
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ATOM 186 N N . LEU 62 62 ? A -7.057 0.378 0.663 1 1 A LEU 0.530 1
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ATOM 194 N N . LYS 63 63 ? A -8.228 2.597 1.808 1 1 A LYS 0.540 1
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ATOM 214 C C . ILE 66 66 ? A -5.680 0.800 -5.481 1 1 A ILE 0.550 1
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ATOM 216 C CB . ILE 66 66 ? A -4.906 3.152 -4.939 1 1 A ILE 0.550 1
ATOM 217 C CG1 . ILE 66 66 ? A -3.755 3.405 -5.962 1 1 A ILE 0.550 1
ATOM 218 C CG2 . ILE 66 66 ? A -4.273 2.534 -3.709 1 1 A ILE 0.550 1
ATOM 219 C CD1 . ILE 66 66 ? A -2.651 4.387 -5.491 1 1 A ILE 0.550 1
ATOM 220 N N . LYS 67 67 ? A -4.948 0.550 -6.580 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 221 C CA . LYS 67 67 ? A -4.402 -0.737 -6.911 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 222 C C . LYS 67 67 ? A -3.254 -1.160 -5.978 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 223 O O . LYS 67 67 ? A -2.110 -0.768 -6.162 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 224 C CB . LYS 67 67 ? A -3.934 -0.683 -8.388 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 225 C CG . LYS 67 67 ? A -3.635 -2.077 -8.944 1 1 A LYS 0.580 1
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ATOM 227 C CE . LYS 67 67 ? A -2.855 -3.443 -10.950 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 228 N NZ . LYS 67 67 ? A -2.458 -3.360 -12.373 1 1 A LYS 0.580 1
ATOM 229 N N . CYS 68 68 ? A -3.556 -2.001 -4.948 1 1 A CYS 0.610 1
ATOM 230 C CA . CYS 68 68 ? A -2.540 -2.645 -4.116 1 1 A CYS 0.610 1
ATOM 231 C C . CYS 68 68 ? A -1.858 -3.769 -4.833 1 1 A CYS 0.610 1
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ATOM 234 S SG . CYS 68 68 ? A -1.788 -3.562 -1.507 1 1 A CYS 0.610 1
ATOM 235 N N . VAL 69 69 ? A -0.531 -3.654 -4.986 1 1 A VAL 0.590 1
ATOM 236 C CA . VAL 69 69 ? A 0.245 -4.716 -5.581 1 1 A VAL 0.590 1
ATOM 237 C C . VAL 69 69 ? A 1.485 -4.906 -4.717 1 1 A VAL 0.590 1
ATOM 238 O O . VAL 69 69 ? A 1.855 -4.079 -3.893 1 1 A VAL 0.590 1
ATOM 239 C CB . VAL 69 69 ? A 0.610 -4.376 -7.033 1 1 A VAL 0.590 1
ATOM 240 C CG1 . VAL 69 69 ? A 1.199 -5.558 -7.832 1 1 A VAL 0.590 1
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ATOM 242 N N . GLN 70 70 ? A 2.131 -6.073 -4.895 1 1 A GLN 0.540 1
ATOM 243 C CA . GLN 70 70 ? A 3.347 -6.459 -4.227 1 1 A GLN 0.540 1
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ATOM 245 O O . GLN 70 70 ? A 4.047 -7.734 -6.119 1 1 A GLN 0.540 1
ATOM 246 C CB . GLN 70 70 ? A 3.086 -7.535 -3.173 1 1 A GLN 0.540 1
ATOM 247 C CG . GLN 70 70 ? A 2.105 -7.030 -2.101 1 1 A GLN 0.540 1
ATOM 248 C CD . GLN 70 70 ? A 1.978 -8.122 -1.062 1 1 A GLN 0.540 1
ATOM 249 O OE1 . GLN 70 70 ? A 1.913 -9.314 -1.400 1 1 A GLN 0.540 1
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ATOM 251 N N . PRO 71 71 ? A 5.610 -6.470 -5.062 1 1 A PRO 0.500 1
ATOM 252 C CA . PRO 71 71 ? A 6.784 -7.110 -5.639 1 1 A PRO 0.500 1
ATOM 253 C C . PRO 71 71 ? A 7.991 -7.208 -4.696 1 1 A PRO 0.500 1
ATOM 254 O O . PRO 71 71 ? A 7.937 -6.820 -3.493 1 1 A PRO 0.500 1
ATOM 255 C CB . PRO 71 71 ? A 7.121 -6.113 -6.754 1 1 A PRO 0.500 1
ATOM 256 C CG . PRO 71 71 ? A 6.812 -4.726 -6.142 1 1 A PRO 0.500 1
ATOM 257 C CD . PRO 71 71 ? A 5.830 -5.021 -4.987 1 1 A PRO 0.500 1
ATOM 258 O OXT . PRO 71 71 ? A 9.073 -7.649 -5.181 1 1 A PRO 0.500 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.540
2 1 3 0.029
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 39 ARG 1 0.400
2 1 A 40 SER 1 0.550
3 1 A 41 CYS 1 0.590
4 1 A 42 LEU 1 0.560
5 1 A 43 LEU 1 0.570
6 1 A 44 CYS 1 0.580
7 1 A 45 ARG 1 0.510
8 1 A 46 ARG 1 0.500
9 1 A 47 ARG 1 0.490
10 1 A 48 LYS 1 0.510
11 1 A 49 GLN 1 0.500
12 1 A 50 ARG 1 0.480
13 1 A 51 CYS 1 0.570
14 1 A 52 ASP 1 0.530
15 1 A 53 HIS 1 0.500
16 1 A 54 LYS 1 0.500
17 1 A 55 LEU 1 0.460
18 1 A 56 PRO 1 0.480
19 1 A 57 SER 1 0.550
20 1 A 58 CYS 1 0.600
21 1 A 59 THR 1 0.590
22 1 A 60 ALA 1 0.620
23 1 A 61 CYS 1 0.610
24 1 A 62 LEU 1 0.530
25 1 A 63 LYS 1 0.540
26 1 A 64 ALA 1 0.570
27 1 A 65 GLY 1 0.560
28 1 A 66 ILE 1 0.550
29 1 A 67 LYS 1 0.580
30 1 A 68 CYS 1 0.610
31 1 A 69 VAL 1 0.590
32 1 A 70 GLN 1 0.540
33 1 A 71 PRO 1 0.500
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
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Attribution-ShareAlike 4.0 International License
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transform and build upon the model for any purpose, even
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2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
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https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
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