data_SMR-4b597cfd2158446dae2c0eeadecf92f7_1 _entry.id SMR-4b597cfd2158446dae2c0eeadecf92f7_1 _struct.entry_id SMR-4b597cfd2158446dae2c0eeadecf92f7_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q6P4Z2/ CO2A1_XENTR, Collagen alpha-1(II) chain Estimated model accuracy of this model is 0.041, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q6P4Z2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 169704.671 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CO2A1_XENTR Q6P4Z2 1 ;MFSFVDSRTLVLFAATQVILLAVVRCQDEEDVLATGSCVQHGQRYSDKDVWKPEPCQICVCDTGNVLCDE IICEDPKDCPNAEIPFGECCPICPTEQSSTSSGQGVLKGQKGEPGDIKDVVGPKGPPGPQGPSGEQGPRG DRGDKGEKGAPGPRGRDGEPGTPGNPGPVGPPGPPGPPGLGGNFAAQMTGGFDEKAGGAQMGVMQGPMGP MGPRGPPGPTGAPGPQGFQGNPGEPGEPGAGGPMGPRGPPGPAGKPGDDGEAGKPGKSGERGPPGPQGAR GFPGTPGLPGVKGHRGYPGLDGSKGEAGAAGAKGEGGATGEAGSPGPMGPRGLPGERGRPGASGAAGARG NDGLPGPAGPPGPVGPAGAPGFPGAPGSKGEAGPTGARGPEGAQGPRGESGTPGSPGPAGASGNPGTDGI PGAKGSSGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPLGPKGQTGDPGVAGFKGEHGPKGEIGSAGPQGAPGPA GEEGKRGARGEPGAAGPLGPPGERGAPGNRGFPGQDGLAGPKGAPGERGVPGLGGPKGANGDPGRPGEPG LPGARGLTGRPGDAGPQGKVGPSGASGEDGRPGPPGPQGARGQPGVMGFPGPKGANGEPGKAGEKGLLGA PGLRGLPGKDGETGAQGPNGPAGPAGERGEQGPPGPSGFQGLPGPPGSPGEGGKPGDQGVPGEAGAPGLV GPRGERGFPGERGSSGPQGLQGPRGLPGTPGTDGPKGATGPSGPNGAQGPPGLQGMPGERGAAGISGPKG DRGDTGEKGPEGAPGKDGSRGLTGPIGPPGPSGPNGEKGESGPSGPAGIVGARGAPGDRGETGPPGPAGF AGPPGADGQAGLKGDQGESGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVNGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV GPPGPNGNPGPSGAPGSAGKEGPKGARGDAGPTGRAGDPGLQGPAGVPGEKGESGEDGPSGPDGPPGPQG LSGQRGIVGLPGQRGERGFPGLPGPSGEPGKQGGPGSAGDRGPPGPVGPPGLTGPAGEPGREGNAGSDGP PGRDGATGIKGDRGETGPLGAPGAPGAPGAPGPVGPTGKQGDRGESGPQGPLGPSGPAGARGLPGPQGPR GDKGEAGEAGERGQKGHRGFTGLQGLPGPPGTAGDQGASGPAGPGGPRGPPGPVGPSGKDGSNGLPGPIG PPGPRGRGGETGPAGPPGQPGPPGPPGPPGPGIDMSAFAGLSQPEKGPDPMRYMRADQASSSVPQRDVDV EATLKSLNNQIESIRSPDGTKKNPARTCRDLKLCHPEWKSGDYWIDPNQGCTVDAIKVFCNMETGETCVY PNPSKIPKKNWWSAKGKEKKHIWFGETINGGFQFSYGDDSSAPNTANIQMTFLRLLSTDATQNITYHCKN SIAFMDEASGNLKKAVLLQGSNDVEIRAEGNSRFTYNALEDGCKKHTGKWSKTVIEYRTQKTSRLPIVDI APMDIGGADQEFGVDIGPVCFL ; 'Collagen alpha-1(II) chain' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1492 1 1492 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . CO2A1_XENTR Q6P4Z2 . 1 1492 8364 'Xenopus tropicalis (Western clawed frog) (Silurana tropicalis)' 2004-07-05 DB7AF42B94210EB7 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MFSFVDSRTLVLFAATQVILLAVVRCQDEEDVLATGSCVQHGQRYSDKDVWKPEPCQICVCDTGNVLCDE IICEDPKDCPNAEIPFGECCPICPTEQSSTSSGQGVLKGQKGEPGDIKDVVGPKGPPGPQGPSGEQGPRG DRGDKGEKGAPGPRGRDGEPGTPGNPGPVGPPGPPGPPGLGGNFAAQMTGGFDEKAGGAQMGVMQGPMGP MGPRGPPGPTGAPGPQGFQGNPGEPGEPGAGGPMGPRGPPGPAGKPGDDGEAGKPGKSGERGPPGPQGAR GFPGTPGLPGVKGHRGYPGLDGSKGEAGAAGAKGEGGATGEAGSPGPMGPRGLPGERGRPGASGAAGARG NDGLPGPAGPPGPVGPAGAPGFPGAPGSKGEAGPTGARGPEGAQGPRGESGTPGSPGPAGASGNPGTDGI PGAKGSSGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPLGPKGQTGDPGVAGFKGEHGPKGEIGSAGPQGAPGPA GEEGKRGARGEPGAAGPLGPPGERGAPGNRGFPGQDGLAGPKGAPGERGVPGLGGPKGANGDPGRPGEPG 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;MFSFVDSRTLVLFAATQVILLAVVRCQDEEDVLATGSCVQHGQRYSDKDVWKPEPCQICVCDTGNVLCDE IICEDPKDCPNAEIPFGECCPICPTEQSSTSSGQGVLKGQKGEPGDIKDVVGPKGPPGPQGPSGEQGPRG DRGDKGEKGAPGPRGRDGEPGTPGNPGPVGPPGPPGPPGLGGNFAAQMTGGFDEKAGGAQMGVMQGPMGP MGPRGPPGPTGAPGPQGFQGNPGEPGEPGAGGPMGPRGPPGPAGKPGDDGEAGKPGKSGERGPPGPQGAR GFPGTPGLPGVKGHRGYPGLDGSKGEAGAAGAKGEGGATGEAGSPGPMGPRGLPGERGRPGASGAAGARG NDGLPGPAGPPGPVGPAGAPGFPGAPGSKGEAGPTGARGPEGAQGPRGESGTPGSPGPAGASGNPGTDGI PGAKGSSGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPLGPKGQTGDPGVAGFKGEHGPKGEIGSAGPQGAPGPA GEEGKRGARGEPGAAGPLGPPGERGAPGNRGFPGQDGLAGPKGAPGERGVPGLGGPKGANGDPGRPGEPG LPGARGLTGRPGDAGPQGKVGPSGASGEDGRPGPPGPQGARGQPGVMGFPGPKGANGEPGKAGEKGLLGA PGLRGLPGKDGETGAQGPNGPAGPAGERGEQGPPGPSGFQGLPGPPGSPGEGGKPGDQGVPGEAGAPGLV GPRGERGFPGERGSSGPQGLQGPRGLPGTPGTDGPKGATGPSGPNGAQGPPGLQGMPGERGAAGISGPKG DRGDTGEKGPEGAPGKDGSRGLTGPIGPPGPSGPNGEKGESGPSGPAGIVGARGAPGDRGETGPPGPAGF AGPPGADGQAGLKGDQGESGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVNGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV GPPGPNGNPGPSGAPGSAGKEGPKGARGDAGPTGRAGDPGLQGPAGVPGEKGESGEDGPSGPDGPPGPQG 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THR . 1 36 GLY . 1 37 SER . 1 38 CYS . 1 39 VAL . 1 40 GLN . 1 41 HIS . 1 42 GLY . 1 43 GLN . 1 44 ARG . 1 45 TYR . 1 46 SER . 1 47 ASP . 1 48 LYS . 1 49 ASP . 1 50 VAL . 1 51 TRP . 1 52 LYS . 1 53 PRO . 1 54 GLU . 1 55 PRO . 1 56 CYS . 1 57 GLN . 1 58 ILE . 1 59 CYS . 1 60 VAL . 1 61 CYS . 1 62 ASP . 1 63 THR . 1 64 GLY . 1 65 ASN . 1 66 VAL . 1 67 LEU . 1 68 CYS . 1 69 ASP . 1 70 GLU . 1 71 ILE . 1 72 ILE . 1 73 CYS . 1 74 GLU . 1 75 ASP . 1 76 PRO . 1 77 LYS . 1 78 ASP . 1 79 CYS . 1 80 PRO . 1 81 ASN . 1 82 ALA . 1 83 GLU . 1 84 ILE . 1 85 PRO . 1 86 PHE . 1 87 GLY . 1 88 GLU . 1 89 CYS . 1 90 CYS . 1 91 PRO . 1 92 ILE . 1 93 CYS . 1 94 PRO . 1 95 THR . 1 96 GLU . 1 97 GLN . 1 98 SER . 1 99 SER . 1 100 THR . 1 101 SER . 1 102 SER . 1 103 GLY . 1 104 GLN . 1 105 GLY . 1 106 VAL . 1 107 LEU . 1 108 LYS . 1 109 GLY . 1 110 GLN . 1 111 LYS . 1 112 GLY . 1 113 GLU . 1 114 PRO . 1 115 GLY . 1 116 ASP . 1 117 ILE . 1 118 LYS . 1 119 ASP . 1 120 VAL . 1 121 VAL . 1 122 GLY . 1 123 PRO . 1 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# loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # 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# loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 4.59e-29 75.758 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MFSFVDSRTLVLFAATQVILLAVVRCQDEEDVLATGSCVQHGQRYSDKDVWKPEPCQICVCDTGNVLCDEIICEDPKDCPNAEIPFGECCPICPTEQSSTSSGQGVLKGQKGEPGDIKDVVGPKGPPGPQGPSGEQGPRGDRGDKGEKGAPGPRGRDGEPGTPGNPGPVGPPGPPGPPGLGGNFAAQMTGGFDEKAGGAQMGVMQGPMGPMGPRGPPGPTGAPGPQGFQGNPGEPGEPGAGGPMGPRGPPGPAGKPGDDGEAGKPGKSGERGPPGPQGARGFPGTPGLPGVKGHRGYPGLDGSKGEAGAAGAKGEGGATGEAGSPGPMGPRGLPGERGRPGASGAAGARGNDGLPGPAGPPGPVGPAGAPGFPGAPGSKGEAGPTGARGPEGAQGPRGESGTPGSPGPAGASGNPGTDGIPGAKGSSGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPLGPKGQTGDPGVAGFKGEHGPKGEIGSAGPQGAPGPAGEEGKRGARGEPGAAGPLGPPGERGAPGNRGFPGQDGLAGPKGAPGERGVPGLGGPKGANGDPGRPGEPGLPGARGLTGRPGDAGPQGKVGPSGASGEDGRPGPPGPQGARGQPGVMGFPGPKGANGEPGKAGEKGLLGAPGLRGLPGKDGETGAQGPNGPAGPAGERGEQGPPGPSGFQGLPGPPGSPGEGGKPGDQGVPGEAGAPGLVGPRGERGFPGERGSSGPQGLQGPRGLPGTPGTDGPKGATGPSGPNGAQGPPGLQGMPGERGAAGISGPKGDRGDTGEKGPEGAPGKDGSRGLTGPIGPPGPSGPNGEKGESGPSGPAGIVGARGAPGDRGETGPPGPAGFAGPPGADGQAGLKGDQGESGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVNGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGPNGNPGPSGAPGSAGKEGPKGARGDAGPTGRAGDPGLQGPAGVPGEKGESGEDGPSGPDGPPGPQGLSGQRGIVGLPGQRGERGFPGLPGPSGEPGKQGGPGSAGDRGPPGPVGPPGLTGPAGEPGREGNAGSDGPPGRDGATGIKGDRGETGPLGAPGAPGAPGAPGPVGPTGKQGDRGESGPQGPLGPSGPAGARGLPGPQGPRGDKGEAGEAGERGQKGHRGFTGLQGLPGPPGTAGDQGASGPAGPGGPRGPPGPVGPSGKDGSNGLPGPIGPPGPRGRGGETGPAGPPGQPGPPGPPGPPGPGIDMSAFAGLSQPEKGPDPMRYMRADQASSSVPQRDVDVEATLKSLNNQIESIRSPDGTKKNPARTCRDLKLCHPEWKSGDYWIDPNQGCTVDAIKVFCNMETGETCVYPNPSKIPKKNWWSAKGKEKKHIWFGETINGGFQFSYGDDSSAPNTANIQMTFLRLLSTDATQNITYHCKNSIAFMDEASGNLKKAVLLQGSNDVEIRAEGNSRFTYNALEDGCKKHTGKWSKTVIEYRTQKTSRLPIVDIAPMDIGGADQEFGVDIGPVCFL 2 1 2 -----------------------------------GSCVQDGQRYNDKDVWKPEPCRICVCDTGTVLCDDIICEDVKDCLSPEIPFGECCPICPADLAAAA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1u5m.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 36 36 ? A -0.391 20.382 -3.365 1 1 A GLY 0.640 1 ATOM 2 C CA . GLY 36 36 ? A -0.360 19.111 -4.199 1 1 A GLY 0.640 1 ATOM 3 C C . GLY 36 36 ? A 0.899 18.313 -4.027 1 1 A GLY 0.640 1 ATOM 4 O O . GLY 36 36 ? A 0.824 17.120 -3.797 1 1 A GLY 0.640 1 ATOM 5 N N . SER 37 37 ? A 2.088 18.959 -4.091 1 1 A SER 0.640 1 ATOM 6 C CA . SER 37 37 ? A 3.373 18.364 -3.750 1 1 A SER 0.640 1 ATOM 7 C C . SER 37 37 ? A 3.424 17.702 -2.387 1 1 A SER 0.640 1 ATOM 8 O O . SER 37 37 ? A 2.904 18.211 -1.392 1 1 A SER 0.640 1 ATOM 9 C CB . SER 37 37 ? A 4.516 19.429 -3.799 1 1 A SER 0.640 1 ATOM 10 O OG . SER 37 37 ? A 4.174 20.608 -3.059 1 1 A SER 0.640 1 ATOM 11 N N . CYS 38 38 ? A 4.074 16.533 -2.329 1 1 A CYS 0.710 1 ATOM 12 C CA . CYS 38 38 ? A 4.161 15.734 -1.133 1 1 A CYS 0.710 1 ATOM 13 C C . CYS 38 38 ? A 5.594 15.721 -0.719 1 1 A CYS 0.710 1 ATOM 14 O O . CYS 38 38 ? A 6.486 15.551 -1.552 1 1 A CYS 0.710 1 ATOM 15 C CB . CYS 38 38 ? A 3.710 14.276 -1.374 1 1 A CYS 0.710 1 ATOM 16 S SG . CYS 38 38 ? A 1.906 14.122 -1.296 1 1 A CYS 0.710 1 ATOM 17 N N . VAL 39 39 ? A 5.836 15.924 0.587 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 18 C CA . VAL 39 39 ? A 7.156 15.950 1.171 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 19 C C . VAL 39 39 ? A 7.415 14.588 1.759 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 20 O O . VAL 39 39 ? A 6.817 14.195 2.760 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 21 C CB . VAL 39 39 ? A 7.280 17.023 2.255 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 22 C CG1 . VAL 39 39 ? A 8.628 16.931 3.013 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 23 C CG2 . VAL 39 39 ? A 7.156 18.392 1.556 1 1 A VAL 0.680 1 ATOM 24 N N . GLN 40 40 ? A 8.319 13.813 1.147 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 25 C CA . GLN 40 40 ? A 8.681 12.516 1.659 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 26 C C . GLN 40 40 ? A 10.149 12.541 1.960 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 27 O O . GLN 40 40 ? A 10.949 12.707 1.054 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 28 C CB . GLN 40 40 ? A 8.351 11.443 0.611 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 29 C CG . GLN 40 40 ? A 7.426 10.368 1.205 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 30 C CD . GLN 40 40 ? A 8.113 9.507 2.262 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 31 O OE1 . GLN 40 40 ? A 9.304 9.241 2.208 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 32 N NE2 . GLN 40 40 ? A 7.352 9.014 3.265 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 33 N N . HIS 41 41 ? A 10.544 12.508 3.251 1 1 A HIS 0.570 1 ATOM 34 C CA . HIS 41 41 ? A 11.945 12.555 3.677 1 1 A HIS 0.570 1 ATOM 35 C C . HIS 41 41 ? A 12.661 13.863 3.332 1 1 A HIS 0.570 1 ATOM 36 O O . HIS 41 41 ? A 13.864 13.995 3.517 1 1 A HIS 0.570 1 ATOM 37 C CB . HIS 41 41 ? A 12.782 11.318 3.225 1 1 A HIS 0.570 1 ATOM 38 C CG . HIS 41 41 ? A 12.301 10.026 3.812 1 1 A HIS 0.570 1 ATOM 39 N ND1 . HIS 41 41 ? A 12.349 8.895 3.025 1 1 A HIS 0.570 1 ATOM 40 C CD2 . HIS 41 41 ? A 11.789 9.725 5.032 1 1 A HIS 0.570 1 ATOM 41 C CE1 . HIS 41 41 ? A 11.847 7.937 3.764 1 1 A HIS 0.570 1 ATOM 42 N NE2 . HIS 41 41 ? A 11.495 8.376 5.001 1 1 A HIS 0.570 1 ATOM 43 N N . GLY 42 42 ? A 11.900 14.885 2.869 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 44 C CA . GLY 42 42 ? A 12.437 16.117 2.301 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 45 C C . GLY 42 42 ? A 12.479 16.125 0.795 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 46 O O . GLY 42 42 ? A 13.097 17.000 0.198 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 47 N N . GLN 43 43 ? A 11.808 15.182 0.113 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 48 C CA . GLN 43 43 ? A 11.781 15.132 -1.328 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 49 C C . GLN 43 43 ? A 10.407 15.514 -1.806 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 50 O O . GLN 43 43 ? A 9.395 15.013 -1.319 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 51 C CB . GLN 43 43 ? A 12.139 13.716 -1.816 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 52 C CG . GLN 43 43 ? A 13.655 13.443 -1.737 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 53 C CD . GLN 43 43 ? A 13.949 11.956 -1.907 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 54 O OE1 . GLN 43 43 ? A 13.494 11.105 -1.148 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 55 N NE2 . GLN 43 43 ? A 14.713 11.583 -2.957 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 56 N N . ARG 44 44 ? A 10.363 16.455 -2.767 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 57 C CA . ARG 44 44 ? A 9.154 16.935 -3.388 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 58 C C . ARG 44 44 ? A 8.803 16.071 -4.565 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 59 O O . ARG 44 44 ? A 9.496 16.073 -5.581 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 60 C CB . ARG 44 44 ? A 9.329 18.383 -3.893 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 61 C CG . ARG 44 44 ? A 9.339 19.399 -2.741 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 62 C CD . ARG 44 44 ? A 10.676 20.132 -2.579 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 63 N NE . ARG 44 44 ? A 10.446 21.331 -1.699 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 64 C CZ . ARG 44 44 ? A 9.821 22.451 -2.092 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 65 N NH1 . ARG 44 44 ? A 9.307 22.579 -3.309 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 66 N NH2 . ARG 44 44 ? A 9.707 23.473 -1.247 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 67 N N . TYR 45 45 ? A 7.692 15.342 -4.429 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 68 C CA . TYR 45 45 ? A 7.178 14.433 -5.424 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 69 C C . TYR 45 45 ? A 5.829 14.938 -5.888 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 70 O O . TYR 45 45 ? A 5.155 15.687 -5.167 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 71 C CB . TYR 45 45 ? A 7.019 13.012 -4.830 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 72 C CG . TYR 45 45 ? A 8.362 12.364 -4.688 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 73 C CD1 . TYR 45 45 ? A 9.026 11.855 -5.816 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 74 C CD2 . TYR 45 45 ? A 8.946 12.205 -3.423 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 75 C CE1 . 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #