data_SMR-7c28783a036cd315fe165a75c167d72d_4 _entry.id SMR-7c28783a036cd315fe165a75c167d72d_4 _struct.entry_id SMR-7c28783a036cd315fe165a75c167d72d_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P85001/ CE290_DANRE, Centrosomal protein of 290 kDa Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P85001' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 327841.975 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CE290_DANRE P85001 1 ;MPAAADWRLLMGMDPEDLGDEDEKICDLILMVKPRDLKADDSEKMIQLFRISQTLLRMKLDEIKCAYEVV DSAGAEQARIENELKAKVLKLESELEMAQRVMGGGDKHFLRDEIRQLESHLERKEKEVTQLEKEMGKERK SNEELALRAEEAEEKNRKLKREIKQLTRKNEQLQQDIEFYRKEAEQRESLQTKEESNEIQRRLTKANQQL YQCMEELQHAEDMAANLRSENEHLQKNLEESVKEMEKMTDEYNKMKIAVQQTDAIMDQLRKDRDHAKLQV RELTDQIQARVEEDDPVMAAVNAKVEEWKSVLSGKDLEILEYQQMIRDLREKLRTAQMDSDKSNIIALQQ AVQERDNQIKMLSEQVEQYTTEMERNAMLIEELKRPLKKDKGHSSDHQRRLEDLSAKLQVAERKVLEAQR AAQLAERDARDKDKELNDTLSRIRLYESGTDGLEAAISEIKECKNQIRVRDREIEGMIKEINQLEMKINN LLDENEDLRERLGLNPKEELDLSEFRRSKILKQRQYKAENQVLLKEIERLEEERLELKQRIRALVKDKGV TVVSNSLLDNSVEEKPVRSLRPSSGSTDDEIKRKNERLQKELSNKEKELELRRSESAQFKAKLNEMLNEN KQLEQGMKEILQAIQDTQKKTPTSTGVSIPSLERLVNALEMKYSEGKFDASLHLRTQVDQLTGRNEELRL EMKTAREEAANTLSQLTKANEKIARLESEMESMSKSTGSSIPHKTLALPEEMTPTSAEAINALNEYTVQL LQEIKNKGDSIEQLGSALEEYKRKFAVIRHQQGLLYKEHQSERESWQKERDSFAELKSKLEEQREVDAVK IKEYNHLLETLEKDPSEIRREMAETGRKIVVLRVNEKCLTRRYTTLLELEQHLRKENAKLKEDFTQMQAV VTERIGYLQRFKEMAAFKMASLQKSLDVSVPASELERANKQYTELTIKYRNLLQKDNHLVQKTTSLEHLE TENMSLRERIDSINKELEISKEKLHTLEQAFENISTTGGEIIMDKATKAVANSEIVSVSRRITTLEMKEL NERQRAEHAQKMYEHLRNSLKQVEERNFELETKFAELTKLNLEAQRIERELRDELADSVSKHISDADRKR ITELEKTEANLRIEVSKLREVSDVAKMQVSALDARQQSREKEVESLRRQVLDYQAESDEKALIAKLHQHI VALQLSETTAISRLEATNTRLQKLEAQKLRDEQKLDEQQQALWHARQEGHQRARHLRHTIQALRRQFSGA LPLAQQEKFSNTMLHLQEDRARVREDAQIAEEERRKAEGKAQELELKLKGLEELIATLKDAKGAQKVSEW HKKLEDVRLLEMRQSRELNTQREEIKYLKNCVAEQECTISGLEEELVQQNNLLEERQLIWDQREVQLERQ LDSYEKQQNEVLNTAQKFEEATGSLPDPNQPLANQLDYALGKIKEHVRTILETKTTCKILEEKLKEKEAA LWSSEQNVLSRDKVINELRLRLPAAAEREKLLADLSKQEDSESQPTLKVAHQTINNLQGRLDQKEEVLKK YQNLLGKARQEQEEIAKRHEEEVRALHQKLDVYMDTSLDRFKQTALELIKKPTITVPTSKHLVRLAEMEQ TVAEQDNSLSSLSQKLKIVTQELDQQRQVTAAQAMEHAADMARLEDKHAAQMKGLSQEAEELRAQLIQME KELHYLRTELEAQKEANVRSPSNTMKNLVERLKNQLALKEKQLKALSKALLELRAELTSQAEQQIITNAA QKEEALNVQQIVDKQTKELRACVRDLNEELQLAKDGVRAAKARENSLKEDLETLNKDLQRSQKSQNKLQS EKEALEEHLNELKKKIQRLSSGLQAQVESDGPTVDSLQKKIRKLEHELDRKSISEPADKRSTLKEDKSSK EEVVRWEEGKKWQARVDKMRNVLKEKEREVDSQAKQLATMKELYSRLEQEKVSLQKKLKGRGVTADQVVG ARTLEADKEIEELHKRNAELEQQIKVMKQQQALPRDAAMEDITIRNRYLEERLYSMESRLSKEPPSRPST SGRGSDTPSQREHEFQKENLRLSTENLELRFQLEQANKDLPRLKDQVSDLKEMCSVLKKEKAEVEKRLSH LRGSGRSGKTIPELEKTIGLMKKVVEKVQRENENLKKTSEVNVQEQLATLERDHEKLKSEYEKLKGKQEE QLNSRLESKTKGIEKIMMENERLRKEIKKEAEAAEKLRVAKASLEVANEKLKAELEETHQRLLLAQSKGA TLLGVDSKTWKSSVVTRLFENKMKGLESDIAKKNISISELKVQLKEANEKLQATQHTVIQLKEQVELLKN VPVEATTDEGLAREYQSVRLANKQLEREKAQLLRQIQRNEVQLGTNKDGPGYTELQEQIKAANNEKKKLQ DEVRKLTQELKHFDPTFFEELEDLKFNYNLEVKKNIVLEEQLKKLSDQFGVAIPDVSIN ; 'Centrosomal protein of 290 kDa' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2439 1 2439 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . CE290_DANRE P85001 . 1 2439 7955 'Danio rerio (Zebrafish) (Brachydanio rerio)' 2006-10-31 B64BB271A5C64C71 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no G ;MPAAADWRLLMGMDPEDLGDEDEKICDLILMVKPRDLKADDSEKMIQLFRISQTLLRMKLDEIKCAYEVV DSAGAEQARIENELKAKVLKLESELEMAQRVMGGGDKHFLRDEIRQLESHLERKEKEVTQLEKEMGKERK SNEELALRAEEAEEKNRKLKREIKQLTRKNEQLQQDIEFYRKEAEQRESLQTKEESNEIQRRLTKANQQL YQCMEELQHAEDMAANLRSENEHLQKNLEESVKEMEKMTDEYNKMKIAVQQTDAIMDQLRKDRDHAKLQV RELTDQIQARVEEDDPVMAAVNAKVEEWKSVLSGKDLEILEYQQMIRDLREKLRTAQMDSDKSNIIALQQ AVQERDNQIKMLSEQVEQYTTEMERNAMLIEELKRPLKKDKGHSSDHQRRLEDLSAKLQVAERKVLEAQR AAQLAERDARDKDKELNDTLSRIRLYESGTDGLEAAISEIKECKNQIRVRDREIEGMIKEINQLEMKINN LLDENEDLRERLGLNPKEELDLSEFRRSKILKQRQYKAENQVLLKEIERLEEERLELKQRIRALVKDKGV TVVSNSLLDNSVEEKPVRSLRPSSGSTDDEIKRKNERLQKELSNKEKELELRRSESAQFKAKLNEMLNEN 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A 1 2264 LYS 2264 ? ? ? G . A 1 2265 GLY 2265 ? ? ? G . A 1 2266 LEU 2266 ? ? ? G . A 1 2267 GLU 2267 ? ? ? G . A 1 2268 SER 2268 ? ? ? G . A 1 2269 ASP 2269 ? ? ? G . A 1 2270 ILE 2270 ? ? ? G . A 1 2271 ALA 2271 ? ? ? G . A 1 2272 LYS 2272 ? ? ? G . A 1 2273 LYS 2273 ? ? ? G . A 1 2274 ASN 2274 ? ? ? G . A 1 2275 ILE 2275 ? ? ? G . A 1 2276 SER 2276 ? ? ? G . A 1 2277 ILE 2277 ? ? ? G . A 1 2278 SER 2278 ? ? ? G . A 1 2279 GLU 2279 ? ? ? G . A 1 2280 LEU 2280 ? ? ? G . A 1 2281 LYS 2281 ? ? ? G . A 1 2282 VAL 2282 ? ? ? G . A 1 2283 GLN 2283 ? ? ? G . A 1 2284 LEU 2284 ? ? ? G . A 1 2285 LYS 2285 ? ? ? G . A 1 2286 GLU 2286 ? ? ? G . A 1 2287 ALA 2287 ? ? ? G . A 1 2288 ASN 2288 ? ? ? G . A 1 2289 GLU 2289 ? ? ? G . A 1 2290 LYS 2290 ? ? ? G . A 1 2291 LEU 2291 ? ? ? G . A 1 2292 GLN 2292 ? ? ? G . A 1 2293 ALA 2293 ? ? ? G . A 1 2294 THR 2294 ? ? ? G . A 1 2295 GLN 2295 ? ? ? G . A 1 2296 HIS 2296 ? ? ? G . A 1 2297 THR 2297 ? ? ? G . A 1 2298 VAL 2298 ? ? ? G . 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A 1 2369 ILE 2369 ? ? ? G . A 1 2370 LYS 2370 ? ? ? G . A 1 2371 ALA 2371 ? ? ? G . A 1 2372 ALA 2372 ? ? ? G . A 1 2373 ASN 2373 ? ? ? G . A 1 2374 ASN 2374 ? ? ? G . A 1 2375 GLU 2375 ? ? ? G . A 1 2376 LYS 2376 ? ? ? G . A 1 2377 LYS 2377 ? ? ? G . A 1 2378 LYS 2378 ? ? ? G . A 1 2379 LEU 2379 ? ? ? G . A 1 2380 GLN 2380 ? ? ? G . A 1 2381 ASP 2381 ? ? ? G . A 1 2382 GLU 2382 ? ? ? G . A 1 2383 VAL 2383 ? ? ? G . A 1 2384 ARG 2384 ? ? ? G . A 1 2385 LYS 2385 ? ? ? G . A 1 2386 LEU 2386 ? ? ? G . A 1 2387 THR 2387 ? ? ? G . A 1 2388 GLN 2388 ? ? ? G . A 1 2389 GLU 2389 ? ? ? G . A 1 2390 LEU 2390 ? ? ? G . A 1 2391 LYS 2391 ? ? ? G . A 1 2392 HIS 2392 ? ? ? G . A 1 2393 PHE 2393 ? ? ? G . A 1 2394 ASP 2394 ? ? ? G . A 1 2395 PRO 2395 ? ? ? G . A 1 2396 THR 2396 ? ? ? G . A 1 2397 PHE 2397 ? ? ? G . A 1 2398 PHE 2398 ? ? ? G . A 1 2399 GLU 2399 ? ? ? G . A 1 2400 GLU 2400 ? ? ? G . A 1 2401 LEU 2401 ? ? ? G . A 1 2402 GLU 2402 ? ? ? G . A 1 2403 ASP 2403 ? ? ? G . 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A 1 2439 ASN 2439 ? ? ? G . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Dynactin subunit 1 {PDB ID=8pqw, label_asym_id=G, auth_asym_id=G, SMTL ID=8pqw.1.G}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8pqw, label_asym_id=G' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-06-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-06-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A G 3 1 G # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MAQSKRHVYSRTPSGSRMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKND GTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLRREGTDSNAKTSKLRGPKPKKAP TARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPL PSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAR KEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKG SDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAE STIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLD MAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFA 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QVTQLKSLSDTIEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGLG QRHRLVLTQEQLHQLHDRLIS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 327 540 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8pqw 2024-04-10 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2439 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2452 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.120 18.408 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MPAAADWRLLMGMDPEDLGDEDEKICDLILMVKPRDLKADDSEKMIQLFRISQTLLRMKLDEIKCAYEVVDSAGAEQARIENELKAKVLKLESELEMAQR--VMGGGDKHFLRDEIRQLESHLERKEKEVTQLEKEMGKERKSNEELALRAEEAEEKNRKLKREIKQLTRKNEQLQQDIEFYRKEAEQRESLQTKEESNEIQRRLTKAN-------QQLYQCMEELQHAEDMAANLRSENEHLQKNLEE----SVKEMEKMTDEYNKMKIAVQQTDAIMDQLRKDRDHAKLQVRELTDQIQARVEEDDPVMAAVNAKVEEWKSVLSGKDLEILEYQQMIRDLREKLRTAQMDSDKSNIIALQQAVQERDNQIKMLSEQVEQYTTEMERNAMLIEELKRPLKKDKGHSSDHQRRLEDLSAKLQVAERKVLEAQRAAQLAERDARDKDKELNDTLSRIRLYESGTDGLEAAISEIKECKNQIRVRDREIEGMIKEINQLEMKINNLLDENEDLRERLGLNPKEELDLSEFRRSKILKQRQYKAENQVLLKEIERLEEERLELKQRIRALVKDKGVTVVSNSLLDNSVEEKPVRSLRPSSGSTDDEIKRKNERLQKELSNKEKELELRRSESAQFKAKLNEMLNENKQLEQGMKEILQAIQDTQKKTPTSTGVSIPSLERLVNALEMKYSEGKFDASLHLRTQVDQLTGRNEELRLEMKTAREEAANTLSQLTKANEKIARLESEMESMSKSTGSSIPHKTLALPEEMTPTSAEAINALNEYTVQLLQEIKNKGDSIEQLGSALEEYKRKFAVIRHQQGLLYKEHQSERESWQKERDSFAELKSKLEEQREVDAVKIKEYNHLLETLEKDPSEIRREMAETGRKIVVLRVNEKCLTRRYTTLLELEQHLRKENAKLKEDFTQMQAVVTERIGYLQRFKEMAAFKMASLQKSLDVSVPASELERANKQYTELTIKYRNLLQKDNHLVQKTTSLEHLETENMSLRERIDSINKELEISKEKLHTLEQAFENISTTGGEIIMDKATKAVANSEIVSVSRRITTLEMKELNERQRAEHAQKMYEHLRNSLKQVEERNFELETKFAELTKLNLEAQRIERELRDELADSVSKHISDADRKRITELEKTEANLRIEVSKLREVSDVAKMQVSALDARQQSREKEVESLRRQVLDYQAESDEKALIAKLHQHIVALQLSETTAISRLEATNTRLQKLEAQKLRDEQKLDEQQQALWHARQEGHQRARHLRHTIQALRRQFSGALPLAQQEKFSNTMLHLQEDRARVREDAQIAEEERRKAEGKAQELELKLKGLEELIATLKDAKGAQKVSEWHKKLEDVRLLEMRQSRELNTQREEIKYLKNCVAEQECTISGLEEELVQQNNLLEERQLIWDQREVQLERQLDSYEKQQNEVLNTAQKFEEATGSLPDPNQPLANQLDYALGKIKEHVRTILETKTTCKILEEKLKEKEAALWSSEQNVLSRDKVINELRLRLPAAAEREKLLADLSKQEDSESQPTLKVAHQTINNLQGRLDQKEEVLKKYQNLLGKARQEQEEIAKRHEEEVRALHQKLDVYMDTSLDRFKQTALELIKKPTITVPTSKHLVRLAEMEQTVAEQDNSLSSLSQKLKIVTQELDQQRQVTAAQAMEHAADMARLEDKHAAQMKGLSQEAEELRAQLIQMEKELHYLRTELEAQKEANVRSPSNTMKNLVERLKNQLALKEKQLKALSKALLELRAELTSQAEQQIITNAAQKEEALNVQQIVDKQTKELRACVRDLNEELQLAKDGVRAAKARENSLKEDLETLNKDLQRSQKSQNKLQSEKEALEEHLNELKKKIQRLSSGLQAQVESDGPTVDSLQKKIRKLEHELDRKSISEPADKRSTLKEDKSSKEEVVRWEEGKKWQARVDKMRNVLKEKEREVDSQAKQLATMKELYSRLEQEKVSLQKKLKGRGVTADQVVGARTLEADKEIEELHKRNAELEQQIKVMKQQQALPRDAAMEDITIRNRYLEERLYSMESRLSKEPPSRPSTSGRGSDTPSQREHEFQKENLRLSTENLELRFQLEQANKDLPRLKDQVSDLKEMCSVLKKEKAEVEKRLSHLRGSGRSGKTIPELEKTIGLMKKVVEKVQRENENLKKTSEVNVQEQLATLERDHEKLKSEYEKLKGKQEEQLNSRLESKTKGIEKIMMENERLRKEIKKEAEAAEKLRVAKASLEVANEKLKAELEETHQRLLLAQSKGATLLGVDSKTWKSSVVTRLFENKMKGLESDIAKKNISISELKVQLKEANEKLQATQHTVIQLKEQVELLKNVPVEATTDEGLAREYQSVRLANKQLEREKAQLLRQIQRNEVQLGTNKDGPGYTELQEQIKAANNEKKKLQDEVRKLTQELKHFDPTFFEELEDLKFNYNLEVKKNIVLEEQLKKLSDQFGVAIPDVSIN 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------ALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAAL------GAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.085}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8pqw.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 4' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 148 148 ? A 206.108 239.911 242.158 1 1 G ARG 0.240 1 ATOM 2 C CA . ARG 148 148 ? A 206.468 238.720 241.308 1 1 G ARG 0.240 1 ATOM 3 C C . ARG 148 148 ? A 207.165 237.553 242.013 1 1 G ARG 0.240 1 ATOM 4 O O . ARG 148 148 ? A 207.508 236.568 241.374 1 1 G ARG 0.240 1 ATOM 5 C CB . ARG 148 148 ? A 207.343 239.228 240.120 1 1 G ARG 0.240 1 ATOM 6 C CG . ARG 148 148 ? A 206.701 240.327 239.238 1 1 G ARG 0.240 1 ATOM 7 C CD . ARG 148 148 ? A 205.458 239.828 238.500 1 1 G ARG 0.240 1 ATOM 8 N NE . ARG 148 148 ? A 204.855 240.956 237.746 1 1 G ARG 0.240 1 ATOM 9 C CZ . ARG 148 148 ? A 203.694 240.798 237.094 1 1 G ARG 0.240 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 148 148 ? A 203.011 239.660 237.129 1 1 G ARG 0.240 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 148 148 ? A 203.214 241.815 236.382 1 1 G ARG 0.240 1 ATOM 12 N N . ALA 149 149 ? A 207.363 237.607 243.353 1 1 G ALA 0.370 1 ATOM 13 C CA . ALA 149 149 ? A 208.067 236.594 244.119 1 1 G ALA 0.370 1 ATOM 14 C C . ALA 149 149 ? A 207.307 235.259 244.209 1 1 G ALA 0.370 1 ATOM 15 O O . ALA 149 149 ? A 207.907 234.199 244.317 1 1 G ALA 0.370 1 ATOM 16 C CB . ALA 149 149 ? A 208.352 237.226 245.504 1 1 G ALA 0.370 1 ATOM 17 N N . GLU 150 150 ? A 205.961 235.293 244.094 1 1 G GLU 0.500 1 ATOM 18 C CA . GLU 150 150 ? A 205.111 234.126 244.218 1 1 G GLU 0.500 1 ATOM 19 C C . GLU 150 150 ? A 204.842 233.453 242.877 1 1 G GLU 0.500 1 ATOM 20 O O . GLU 150 150 ? A 204.746 232.236 242.793 1 1 G GLU 0.500 1 ATOM 21 C CB . GLU 150 150 ? A 203.779 234.549 244.877 1 1 G GLU 0.500 1 ATOM 22 C CG . GLU 150 150 ? A 203.997 235.107 246.308 1 1 G GLU 0.500 1 ATOM 23 C CD . GLU 150 150 ? A 202.715 235.596 246.983 1 1 G GLU 0.500 1 ATOM 24 O OE1 . GLU 150 150 ? A 202.825 236.029 248.159 1 1 G GLU 0.500 1 ATOM 25 O OE2 . GLU 150 150 ? A 201.649 235.607 246.321 1 1 G GLU 0.500 1 ATOM 26 N N . GLU 151 151 ? A 204.770 234.205 241.750 1 1 G GLU 0.550 1 ATOM 27 C CA . GLU 151 151 ? A 204.485 233.628 240.439 1 1 G GLU 0.550 1 ATOM 28 C C . GLU 151 151 ? A 205.574 232.662 239.977 1 1 G GLU 0.550 1 ATOM 29 O O . GLU 151 151 ? A 205.296 231.559 239.514 1 1 G GLU 0.550 1 ATOM 30 C CB . GLU 151 151 ? A 204.290 234.738 239.371 1 1 G GLU 0.550 1 ATOM 31 C CG . GLU 151 151 ? A 202.996 235.580 239.564 1 1 G GLU 0.550 1 ATOM 32 C CD . GLU 151 151 ? A 203.057 236.936 238.875 1 1 G GLU 0.550 1 ATOM 33 O OE1 . GLU 151 151 ? A 204.144 237.311 238.367 1 1 G GLU 0.550 1 ATOM 34 O OE2 . GLU 151 151 ? A 202.049 237.679 238.864 1 1 G GLU 0.550 1 ATOM 35 N N . ALA 152 152 ? A 206.866 233.032 240.139 1 1 G ALA 0.650 1 ATOM 36 C CA . ALA 152 152 ? A 207.986 232.133 239.915 1 1 G ALA 0.650 1 ATOM 37 C C . ALA 152 152 ? A 207.985 230.958 240.896 1 1 G ALA 0.650 1 ATOM 38 O O . ALA 152 152 ? A 208.248 229.823 240.506 1 1 G ALA 0.650 1 ATOM 39 C CB . ALA 152 152 ? A 209.334 232.891 239.936 1 1 G ALA 0.650 1 ATOM 40 N N . GLU 153 153 ? A 207.632 231.194 242.183 1 1 G GLU 0.620 1 ATOM 41 C CA . GLU 153 153 ? A 207.491 230.147 243.183 1 1 G GLU 0.620 1 ATOM 42 C C . GLU 153 153 ? A 206.432 229.100 242.810 1 1 G GLU 0.620 1 ATOM 43 O O . GLU 153 153 ? A 206.696 227.900 242.806 1 1 G GLU 0.620 1 ATOM 44 C CB . GLU 153 153 ? A 207.171 230.731 244.592 1 1 G GLU 0.620 1 ATOM 45 C CG . GLU 153 153 ? A 207.125 229.606 245.661 1 1 G GLU 0.620 1 ATOM 46 C CD . GLU 153 153 ? A 206.811 229.979 247.109 1 1 G GLU 0.620 1 ATOM 47 O OE1 . GLU 153 153 ? A 206.838 231.151 247.520 1 1 G GLU 0.620 1 ATOM 48 O OE2 . GLU 153 153 ? A 206.537 229.007 247.838 1 1 G GLU 0.620 1 ATOM 49 N N . GLU 154 154 ? A 205.218 229.513 242.413 1 1 G GLU 0.630 1 ATOM 50 C CA . GLU 154 154 ? A 204.181 228.621 241.931 1 1 G GLU 0.630 1 ATOM 51 C C . GLU 154 154 ? A 204.491 227.912 240.617 1 1 G GLU 0.630 1 ATOM 52 O O . GLU 154 154 ? A 204.129 226.748 240.439 1 1 G GLU 0.630 1 ATOM 53 C CB . GLU 154 154 ? A 202.829 229.334 241.852 1 1 G GLU 0.630 1 ATOM 54 C CG . GLU 154 154 ? A 202.280 229.723 243.242 1 1 G GLU 0.630 1 ATOM 55 C CD . GLU 154 154 ? A 200.839 230.210 243.111 1 1 G GLU 0.630 1 ATOM 56 O OE1 . GLU 154 154 ? A 200.346 230.307 241.954 1 1 G GLU 0.630 1 ATOM 57 O OE2 . GLU 154 154 ? A 200.197 230.399 244.172 1 1 G GLU 0.630 1 ATOM 58 N N . LYS 155 155 ? A 205.198 228.569 239.668 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 59 C CA . LYS 155 155 ? A 205.744 227.920 238.478 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 60 C C . LYS 155 155 ? A 206.736 226.814 238.823 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 61 O O . LYS 155 155 ? A 206.631 225.699 238.314 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 62 C CB . LYS 155 155 ? A 206.439 228.937 237.537 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 63 C CG . LYS 155 155 ? A 205.444 229.850 236.807 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 64 C CD . LYS 155 155 ? A 206.145 230.928 235.967 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 65 C CE . LYS 155 155 ? A 205.157 231.907 235.327 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 66 N NZ . LYS 155 155 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #