data_SMR-396c1b1eadb54d137f2f2b511756277a_1 _entry.id SMR-396c1b1eadb54d137f2f2b511756277a_1 _struct.entry_id SMR-396c1b1eadb54d137f2f2b511756277a_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - P0C6T8/ R1A_CVBEN, Replicase polyprotein 1a Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P0C6T8' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance 010 non-polymer phenylmethanol 'C7 H8 O' 108.140 'CCD Core' 02J 'peptide linking' '5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxylic acid' 'C5 H5 N O3' 127.099 'CCD Core' ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PJE 'peptide linking' '(E,4S)-4-azanyl-5-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pent-2-enoic acid' 'C9 H14 N2 O3' 198.222 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 570094.422 2 . 2 polymer man 02J-ALA-VAL-LEU-PJE-010 770.878 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP R1A_CVBEN P0C6T8 1 ;MSKINKYGLELHWAPEFPWMFEDAEEKLDNPSSSEVDIVCSTTAQKLETGGICPENHVMVDCRRLLKQEC CVQSSLIREIVMNTRPYDLEVLLQDALQSREAVLVTPPLGMSLEACYVRGCNPNGWTMGLFRRRSVCNTG RCAVNKHVAYQLYMIDPAGVCFGAGQFVGWVIPLAFMPVQSRKFIVPWVMYLRKCGEKGAYNKDHKRGGF EHVYNFKVEDAYDLVHDEPKGKFSKKAYALIRGYRGVKPLLYVDQYGCDYTGGLADGLEAYADKTLQEMK ALFPIWSQELPFDVTVAWHVVRDPRYVMRLQSASTIRSVAYVANPTEDLCDGSVVIKEPVHVYADDSIIL RQHNLVDIMSCFYMEADAVVNAFYGVDLKDCGFVMQFGYIDCEQDLCDFKGWVPGNMIDGFACTTCGHVY ETGDLLAQSSGVLPVNPVLHTKSAAGYGGFGCKDSFTLYGQTVVYFGGCVYWSPARNIWIPILKSSVKSY DGLVYTGVVGCKAIVKETNLICKALYLDYVQHKCGNLHQRELLGVSDVWHKQLLLNRGVYKPLLENIDYF NMRRAKFSLETFTVCADGFMPFLLDDLVPRAYYLAVSGQAFCDYADKICHAVVSKSKELLDVSLDSLSAA IHYLNSKIVDLAQHFSDFGTSFVSKIVHFFKTFTTSTALAFAWVLFHVLHGAYIVVESDIYFVKNIPRYA SAVAQAFRSVAKVVLDSLRVTFIDGLSCFKIGRRRICLSGSKIYEVERGLLHSSQLPLDVYDLTMPSQVQ KAKQKPIYLKGSGSDFSLADSVVEVVTTSLTPCGYSEPPKVADKICIVDNVYMAKAGDKYYPVVVDGHVG LLDQAWRVPCAGRRVTFKEQPTVNEIASTPKTIKVFYELDKDFNTILNTACGVFEVDDTVDMEEFYAVVI DAIEEKLSPCKELEGVGAKVSAFLQKLEDNSLFLFDEAGEEVLASKLYCAFTAPEDDDFLEESGVEEDDV EGEETDLTVTSAGEPCVASEQEESSEILEDTLDDGPCVETSDSQVEEDVEMSDFADLESVIQDYENVCFE FYTTEPEFVKVLDLYVPKATRNNCWLRSVLAVMQKLPCQFKDKNLQDLWVLYKQQYSQLFVDTLVNKIPA NIVVPQGGYVADFAYWFLTLCDWQCVAYWKCIKCDLALKLKGLDAMFFYGDVVSHVCKCGESMVLIDVDV PFTAHFALKDKLFCAFITKRSVYKAACVVDVNDSHSMAVVDGKQIDDHRVTSITSDKFDFIIGHGMSFSM TTFEIAQLYGSCITPNVCFVKGDIIKVSKRVKAEVVVNPANGHMAHGGGVAKAIAVAAGQQFVKETTDMV KSKGVCATGDCYVSTGGKLCKTVLNVVGPDARTQGKQSYALLERVYKHLNKYDCVVTTLISAGIFSVPSD VSLTYLLGTAEKQVVLVSNNQEDFDLISKCQITAVEGTKKLAERLSFNVGRSIVYETDANKLILSNDVAF VSTFNVLQDVLSLRHDIALDDDARTFVQSNVDVVPEGWRVVNKFYQINGVRTVKYFECPGGIDICSQDKV FGYVQQGSFNKATVAQIKALFLDKVDILLTVDGVNFTNRFVPVGESFGKSLGNVFCDGVNVTKHKCDINY KGKVFFQFDNLSSEDLKAVRSSFNFDQKELLAYYNMLVNCSKWQVVFNGKYFTFKQANNNCFVNVSCLML QSLNLKFKIVQWQEAWLEFRSGRPARFVSLVLAKGGFKFGDPADSRDFLRVVFSQVDLTGAICDFEIACK CGVKQEQRTGVDAVMHFGTLSREDLEIGYTVDCSCGKKLIHCVRFDVPFLICSNTPASVKLPKGVGSANI FKGDKVGHYVHVKCEQSYQLYDASNVKKVTDVTGNLSDCLYLKNLKQTFKSVLTTYYLDDVKKIEYNPDL SQYYCDGGKYYTQRIIKAQFKTFEKVDGVYTNFKLIGHTICDILNAKLGFDSSKEFVEYKVTEWPTATGD VVLATDDLYVKRYERGCITFGKPVIWLSHEQASLNSLTYFNRPLLVDENKFDVLKVDDVDDGGDISESDA KESKEINIIKLSGVKKPFKVEDSVIVNDDTSEIKYVKSLSIVDVYDMWLTGCRYVVRTANALSMAVNVPT IRKFIKFGMTLVSIPIDLLNLREIKPVFNVVKAVRNKISACFNFIKWLFVLLFGWIKISADNKVIYTTEV ASKLTCKLVALAFKNAFLTFKWSVVARGACIIATIFLLWFNFIYANVIFSDFYLPKIGFLPTFVGKIAQW IKSTFSLVTICDLYSIQDVGFKNQYCNGSIACQFCLAGFDMLDNYKAIDVVQYEADRRAFVDYTGVLKIV IELIVSYALYTAWFYPLFALISIQILTTWLPELFMLSTLHWSVRLLVSLANMLPAHVFMRFYIIIASFIK LFILFRHVAYGCSKPGCLFCYKRNRSLRVKCSTIVGGMIRYYDVMANGGTGFCSKHQWNCIDCDSYKPGN TFITVEAALDLSKELKRPIQPTDVAYHTVTDVKQVGCYMRLFYERDGQRTYDDVNASLFVDYSNLLHSKV KGVPNMHVVVVENDADKANFLNAAVFYAQSLFRPILMVDKNLITTANTGTSVTETMFDVYVDTFLSMFDV DKKSLNALIATAHSSIKQGTQICKVLDTFLSCARKSCSIDSDVDTKCLADSVMSAVSAGLELTDESCNNL VPTYLKGDNIVAADLGVLIQNSAKHVQGNVAKIAGVSCIWSVDAFNQLSSDFQHKLKKACCKTGLKLKLT YNKQMANVSVLTTPFSLKGGAVFSYFVYVCFLLSLVCFIGLWCLMPTYTVHKSDFQLPVYASYKVLDNGV IRDVSVEDVCFANKFEQFDQWYESTFGLSYYSNSMACPIVVAVVDQDLGSTVFNVPTKVLRYGYHVLHFI THALSADGVQCYTPHSQISYSNFYASGCVLSSACTMFAMADGSPQPYCYTEGLMQNASLYSSLVPHVRYN LANAKGFIRFPEVLREGLVRIVRTRSMSYCRVGLCEEADEGICFNFNGSWVLNNDYYRSLPGTFCGRDVF DLIYQLFKGLAQPVDFLALTASSIAGAILAVIVVLVFYYLIKLKRAFGDYTSIVFVNVIVWCVNFMMLFV FQVYPTLSCVYAICYFYATLYFPSEISVIMHLQWLVMYGTIMPLWFCLLYISVVVSNHAFWVFAYCRRLG TSVRSDGTFEEMALTTFMITKDSYCKLKNSLSDVAFNRYLSLYNKYRYYSGKMDTAAYREAACSQLAKAM DTFTNNNGSDVLYQPPTASVSTSFLQSGIVKMVNPTSKVEPCIVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVIC SASDMTNPDYTNLLCRVTSSDFTVLFDRLSLTVMSYQMQGCMLVLTVTLQNSRTPKYTFGVVKPGETFTV LAAYNGKPQGAFHVTMRSSYTIKGSFLCGSCGSVGYVLMGDCVKFVYMHQLELSTGCHTGTDFNGDFYGP YKDAQVVQLPVQDYIQSVNFVAWLYAAILNNCNWFVQSDKCSVEDFNVWALSNGFSQVKSDLVIDALASM TGVSLETLLAAIKRLKNGFQGRQIMGSCSFEDELTPSDVYQQLAGIKLQSKRTRLVKGIVCWIMASTFLF SCIITAFVKWTMFMYVTTNMLSITFCALCVISLAMLLVKHKHLYLTMYIIPVLFTLLYNNYLVVYKQTFR GYVYAWLSYYVPSVEYTYTDEVIYGMLLLIGMVFVTLRSINHDLFSFIMFVGRVISVVSLWYMGSNLEEE ILLMLASLFGTYTWTTALSMAAAKVIAKWVAVNVLYFTDIPQIKIVLVCYLFIGYIISCYWGLFSLMNSL FRMPLGVYNYKISVQELRYMNANGLRPPKNSFEALMLNFKLLGIGGVPIIEVSQFQSKLTDVKCANVVLL NCLQHLHVASNSKLWQYCSTLHNEILATSDLGVAFEKLAQLLIVLFANPAAVDSKCLTSIEEVCDDYAKD NTVLQALQSEFVNMASFVEYEVAKKNLDEARSSGSANQQQLKQLEKACNIAKSAYERDRAVARKLERMAD LALTNMYKEARINDKKSKVVSALQTMLFSMVRKLDNQALNSILDNAVKGCVPLNAIPSLAANTLTIIVPD KSVYDQVVDNVYVTYAGNVWQIQTIQDSDGTNKQLNEISDDCNWPLVIIANRHNEVSATVLQNNELMPAK LKTQVVNSGPDQTCNTPTQCYYNNSNNGKIVYAILSDVDGLKYTKILKDDGNFVVLELDPPCKFTVQDVK GLKIKYLYFVKGCNTLARGWVVGTISSTVRLQAGTATEYASNSSILSLCAFSVDPKKTYLDFIQQGGTPI ANCVKMLCDHAGTGMAITVKPDATTNQDSYGGASVCIYCRARVEHPDVDGLCKLRGKFVQVPVGIKDPVS YVLTHDVCQVCGFWRDGSCSCVSTDTTVQSKDTNFLNGFGVRV ; 'Replicase polyprotein 1a' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 4383 1 4383 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . R1A_CVBEN P0C6T8 . 1 4383 233262 'Bovine coronavirus (strain 98TXSF-110-ENT) (BCoV-ENT) (BCV)' 2008-06-10 0783826E2325932B . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MSKINKYGLELHWAPEFPWMFEDAEEKLDNPSSSEVDIVCSTTAQKLETGGICPENHVMVDCRRLLKQEC CVQSSLIREIVMNTRPYDLEVLLQDALQSREAVLVTPPLGMSLEACYVRGCNPNGWTMGLFRRRSVCNTG RCAVNKHVAYQLYMIDPAGVCFGAGQFVGWVIPLAFMPVQSRKFIVPWVMYLRKCGEKGAYNKDHKRGGF EHVYNFKVEDAYDLVHDEPKGKFSKKAYALIRGYRGVKPLLYVDQYGCDYTGGLADGLEAYADKTLQEMK ALFPIWSQELPFDVTVAWHVVRDPRYVMRLQSASTIRSVAYVANPTEDLCDGSVVIKEPVHVYADDSIIL RQHNLVDIMSCFYMEADAVVNAFYGVDLKDCGFVMQFGYIDCEQDLCDFKGWVPGNMIDGFACTTCGHVY ETGDLLAQSSGVLPVNPVLHTKSAAGYGGFGCKDSFTLYGQTVVYFGGCVYWSPARNIWIPILKSSVKSY DGLVYTGVVGCKAIVKETNLICKALYLDYVQHKCGNLHQRELLGVSDVWHKQLLLNRGVYKPLLENIDYF 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B 1 4310 ARG 4310 ? ? ? B . B 1 4311 ALA 4311 ? ? ? B . B 1 4312 ARG 4312 ? ? ? B . B 1 4313 VAL 4313 ? ? ? B . B 1 4314 GLU 4314 ? ? ? B . B 1 4315 HIS 4315 ? ? ? B . B 1 4316 PRO 4316 ? ? ? B . B 1 4317 ASP 4317 ? ? ? B . B 1 4318 VAL 4318 ? ? ? B . B 1 4319 ASP 4319 ? ? ? B . B 1 4320 GLY 4320 ? ? ? B . B 1 4321 LEU 4321 ? ? ? B . B 1 4322 CYS 4322 ? ? ? B . B 1 4323 LYS 4323 ? ? ? B . B 1 4324 LEU 4324 ? ? ? B . B 1 4325 ARG 4325 ? ? ? B . B 1 4326 GLY 4326 ? ? ? B . B 1 4327 LYS 4327 ? ? ? B . B 1 4328 PHE 4328 ? ? ? B . B 1 4329 VAL 4329 ? ? ? B . B 1 4330 GLN 4330 ? ? ? B . B 1 4331 VAL 4331 ? ? ? B . B 1 4332 PRO 4332 ? ? ? B . B 1 4333 VAL 4333 ? ? ? B . B 1 4334 GLY 4334 ? ? ? B . B 1 4335 ILE 4335 ? ? ? B . B 1 4336 LYS 4336 ? ? ? B . B 1 4337 ASP 4337 ? ? ? B . B 1 4338 PRO 4338 ? ? ? B . B 1 4339 VAL 4339 ? ? ? B . B 1 4340 SER 4340 ? ? ? B . B 1 4341 TYR 4341 ? ? ? B . B 1 4342 VAL 4342 ? ? ? B . B 1 4343 LEU 4343 ? ? ? B . B 1 4344 THR 4344 ? ? ? B . B 1 4345 HIS 4345 ? ? ? B . B 1 4346 ASP 4346 ? ? ? B . B 1 4347 VAL 4347 ? ? ? B . B 1 4348 CYS 4348 ? ? ? B . B 1 4349 GLN 4349 ? ? ? B . B 1 4350 VAL 4350 ? ? ? B . B 1 4351 CYS 4351 ? ? ? B . B 1 4352 GLY 4352 ? ? ? B . B 1 4353 PHE 4353 ? ? ? B . B 1 4354 TRP 4354 ? ? ? B . B 1 4355 ARG 4355 ? ? ? B . B 1 4356 ASP 4356 ? ? ? B . B 1 4357 GLY 4357 ? ? ? B . B 1 4358 SER 4358 ? ? ? B . B 1 4359 CYS 4359 ? ? ? B . B 1 4360 SER 4360 ? ? ? B . B 1 4361 CYS 4361 ? ? ? B . B 1 4362 VAL 4362 ? ? ? B . B 1 4363 SER 4363 ? ? ? B . B 1 4364 THR 4364 ? ? ? B . B 1 4365 ASP 4365 ? ? ? B . B 1 4366 THR 4366 ? ? ? B . B 1 4367 THR 4367 ? ? ? B . B 1 4368 VAL 4368 ? ? ? B . B 1 4369 GLN 4369 ? ? ? B . B 1 4370 SER 4370 ? ? ? B . B 1 4371 LYS 4371 ? ? ? B . B 1 4372 ASP 4372 ? ? ? B . B 1 4373 THR 4373 ? ? ? B . B 1 4374 ASN 4374 ? ? ? B . B 1 4375 PHE 4375 ? ? ? B . B 1 4376 LEU 4376 ? ? ? B . B 1 4377 ASN 4377 ? ? ? B . B 1 4378 GLY 4378 ? ? ? B . B 1 4379 PHE 4379 ? ? ? B . B 1 4380 GLY 4380 ? ? ? B . B 1 4381 VAL 4381 ? ? ? B . B 1 4382 ARG 4382 ? ? ? B . B 1 4383 VAL 4383 ? ? ? B . C 2 1 02J 1 1 02J 02J '_' A C 2 2 ALA 1 1 ALA ALA '_' B C 2 3 VAL 1 1 VAL VAL '_' C C 2 4 LEU 1 1 LEU LEU '_' D C 2 5 PJE 1 1 PJE PJE '_' E C 2 6 010 1 1 010 010 '_' F D 2 1 02J 2 2 02J 02J '_' A D 2 2 ALA 2 2 ALA ALA '_' B D 2 3 VAL 2 2 VAL VAL '_' C D 2 4 LEU 2 2 LEU LEU '_' D D 2 5 PJE 2 2 PJE PJE '_' E D 2 6 010 2 2 010 010 '_' F # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Replicative polyprotein 1ab {PDB ID=6jij, label_asym_id=A, auth_asym_id=B, SMTL ID=6jij.1.A}' 'template structure' . 2 'Replicative polyprotein 1ab {PDB ID=6jij, label_asym_id=C, auth_asym_id=A, SMTL ID=6jij.1.B}' 'template structure' . 3 '02J-ALA-VAL-LEU-PJE-010 {PDB ID=6jij, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=6jij.1._.1}' 'template structure' . 4 '02J-ALA-VAL-LEU-PJE-010 {PDB ID=6jij, label_asym_id=F, auth_asym_id=F, SMTL ID=6jij.1._.2}' 'template structure' . 5 . target . 6 02J-ALA-VAL-LEU-PJE-010 target . 7 'Target-template alignment by BLAST to 6jij, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 8 'Target-template alignment by BLAST to 6jij, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 9 'model 1' 'model coordinates' . 10 SMTL 'reference database' . 11 PDB 'reference database' . 12 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 5 2 1 10 3 1 11 4 2 12 5 3 5 6 3 6 7 3 1 8 3 2 9 3 3 10 3 4 11 3 7 12 3 8 13 4 1 14 4 2 15 4 3 16 4 4 17 4 7 18 4 8 19 4 6 20 5 9 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 10 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-06-25 11 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-06-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 5 'reference database' 2 6 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . C 2 . D 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 B 2 2 'reference database' polymer 1 2 B C 1 1 A 3 3 'reference database' polymer 1 3 . D 2 1 D 4 4 'reference database' polymer 1 4 . F 2 1 F # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SGIVKMVSPTSKVEPCIVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVICSDMTDPDYPNLLCRVTSSDFCVMSGR MSLTVMSYQMQGCQLVLTVTLQNPNTPKYSFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAFHVTLRSSHTIKGSFLC GSCGSVGYVLTGDSVRFVYMHQLELSTGCHTGTDFSGNFYGPYRDAQVVQLPVQDYTQTVNVVAWLYAAI FNRCNWFVQSDSCSLEEFNVWAMTNGFSSIKADLVLDALASMTGVTVEQVLAAIKRLHSGFQGKQILGSC VFEDELTPSDVYQQLAGVKLQ ; ;SGIVKMVSPTSKVEPCIVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVICSDMTDPDYPNLLCRVTSSDFCVMSGR MSLTVMSYQMQGCQLVLTVTLQNPNTPKYSFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAFHVTLRSSHTIKGSFLC GSCGSVGYVLTGDSVRFVYMHQLELSTGCHTGTDFSGNFYGPYRDAQVVQLPVQDYTQTVNVVAWLYAAI FNRCNWFVQSDSCSLEEFNVWAMTNGFSSIKADLVLDALASMTGVTVEQVLAAIKRLHSGFQGKQILGSC VFEDELTPSDVYQQLAGVKLQ ; 2 ;SGIVKMVSPTSKVEPCIVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVICSDMTDPDYPNLLCRVTSSDFCVMSGR MSLTVMSYQMQGCQLVLTVTLQNPNTPKYSFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAFHVTLRSSHTIKGSFLC GSCGSVGYVLTGDSVRFVYMHQLELSTGCHTGTDFSGNFYGPYRDAQVVQLPVQDYTQTVNVVAWLYAAI FNRCNWFVQSDSCSLEEFNVWAMTNGFSSIKADLVLDALASMTGVTVEQVLAAIKRLHSGFQGKQILGSC VFEDELTPSDVYQQLAGVKLQ ; ;SGIVKMVSPTSKVEPCIVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVICSDMTDPDYPNLLCRVTSSDFCVMSGR MSLTVMSYQMQGCQLVLTVTLQNPNTPKYSFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAFHVTLRSSHTIKGSFLC GSCGSVGYVLTGDSVRFVYMHQLELSTGCHTGTDFSGNFYGPYRDAQVVQLPVQDYTQTVNVVAWLYAAI FNRCNWFVQSDSCSLEEFNVWAMTNGFSSIKADLVLDALASMTGVTVEQVLAAIKRLHSGFQGKQILGSC VFEDELTPSDVYQQLAGVKLQ ; 3 ?AVL?(010) ?AVL?X 4 ?AVL?(010) ?AVL?X # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 301 2 2 1 301 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6jij 2024-10-23 2 PDB . 6jij 2024-10-23 3 PDB . 6jij 2024-10-23 4 PDB . 6jij 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 4383 2 2 B 1 4383 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 7 1 4383 'target-template pairwise alignment' local 2 8 1 4383 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 2.93e-177 85.050 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'BLAST e-value' . 2.93e-177 85.050 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 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2 1 2 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4 2 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SGIVKMVSPTSKVEPCIVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVICS--DMTDPDYPNLLCRVTSSDFCVMSGRMSLTVMSYQMQGCQLVLTVTLQNPNTPKYSFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAFHVTLRSSHTIKGSFLCGSCGSVGYVLTGDSVRFVYMHQLELSTGCHTGTDFSGNFYGPYRDAQVVQLPVQDYTQTVNVVAWLYAAIFNRCNWFVQSDSCSLEEFNVWAMTNGFSSIKADLVLDALASMTGVTVEQVLAAIKRLHSGFQGKQILGSCVFEDELTPSDVYQQLAGVKLQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.501}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6jij.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 9 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 10.614 32.773 10.771 1 1 A ILE 0.780 1 ATOM 16 C CG1 . ILE 3249 3249 ? A 9.714 33.191 9.587 1 1 A ILE 0.780 1 ATOM 17 C CG2 . ILE 3249 3249 ? A 12.031 32.381 10.284 1 1 A ILE 0.780 1 ATOM 18 C CD1 . ILE 3249 3249 ? A 9.494 32.104 8.525 1 1 A ILE 0.780 1 ATOM 19 N N . VAL 3250 3250 ? A 11.292 29.786 12.233 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 20 C CA . VAL 3250 3250 ? A 12.231 29.040 13.043 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 21 C C . VAL 3250 3250 ? A 13.159 28.311 12.100 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 22 O O . VAL 3250 3250 ? A 12.893 28.157 10.909 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 23 C CB . VAL 3250 3250 ? A 11.576 28.027 13.993 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 24 C CG1 . VAL 3250 3250 ? A 10.716 28.747 15.049 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 25 C CG2 . VAL 3250 3250 ? A 10.725 27.017 13.205 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 26 N N . LYS 3251 3251 ? A 14.297 27.808 12.609 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 27 C CA . LYS 3251 3251 ? A 15.067 26.824 11.880 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 28 C C . LYS 3251 3251 ? A 14.403 25.474 12.066 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 29 O O . 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A 28.901 17.051 9.255 1 1 A TYR 0.870 1 ATOM 1230 C CZ . TYR 3407 3407 ? A 29.969 17.890 8.916 1 1 A TYR 0.870 1 ATOM 1231 O OH . TYR 3407 3407 ? A 30.815 18.438 9.905 1 1 A TYR 0.870 1 ATOM 1232 N N . MET 3408 3408 ? A 29.371 13.647 6.364 1 1 A MET 0.880 1 ATOM 1233 C CA . MET 3408 3408 ? A 29.795 12.803 7.450 1 1 A MET 0.880 1 ATOM 1234 C C . MET 3408 3408 ? A 30.717 13.602 8.355 1 1 A MET 0.880 1 ATOM 1235 O O . MET 3408 3408 ? A 31.789 14.040 7.945 1 1 A MET 0.880 1 ATOM 1236 C CB . MET 3408 3408 ? A 30.561 11.613 6.843 1 1 A MET 0.880 1 ATOM 1237 C CG . MET 3408 3408 ? A 31.210 10.656 7.853 1 1 A MET 0.880 1 ATOM 1238 S SD . MET 3408 3408 ? A 32.118 9.303 7.057 1 1 A MET 0.880 1 ATOM 1239 C CE . MET 3408 3408 ? A 30.638 8.462 6.437 1 1 A MET 0.880 1 ATOM 1240 N N . HIS 3409 3409 ? A 30.328 13.829 9.628 1 1 A HIS 0.880 1 ATOM 1241 C CA . HIS 3409 3409 ? A 31.154 14.563 10.578 1 1 A HIS 0.880 1 ATOM 1242 C C . HIS 3409 3409 ? A 32.494 13.905 10.903 1 1 A HIS 0.880 1 ATOM 1243 O O . HIS 3409 3409 ? A 32.557 12.704 11.169 1 1 A HIS 0.880 1 ATOM 1244 C CB . HIS 3409 3409 ? A 30.389 14.822 11.895 1 1 A HIS 0.880 1 ATOM 1245 C CG . HIS 3409 3409 ? A 31.138 15.715 12.828 1 1 A HIS 0.880 1 ATOM 1246 N ND1 . HIS 3409 3409 ? A 31.606 16.934 12.368 1 1 A HIS 0.880 1 ATOM 1247 C CD2 . HIS 3409 3409 ? A 31.585 15.472 14.084 1 1 A HIS 0.880 1 ATOM 1248 C CE1 . HIS 3409 3409 ? A 32.332 17.407 13.368 1 1 A HIS 0.880 1 ATOM 1249 N NE2 . HIS 3409 3409 ? A 32.351 16.562 14.427 1 1 A HIS 0.880 1 ATOM 1250 N N . GLN 3410 3410 ? A 33.591 14.696 10.909 1 1 A GLN 0.800 1 ATOM 1251 C CA . GLN 3410 3410 ? A 34.927 14.185 11.182 1 1 A GLN 0.800 1 ATOM 1252 C C . GLN 3410 3410 ? A 35.778 15.100 12.046 1 1 A GLN 0.800 1 ATOM 1253 O O . GLN 3410 3410 ? A 36.696 14.629 12.713 1 1 A GLN 0.800 1 ATOM 1254 C CB . GLN 3410 3410 ? A 35.736 13.998 9.868 1 1 A GLN 0.800 1 ATOM 1255 C CG . GLN 3410 3410 ? A 35.170 12.903 8.932 1 1 A GLN 0.800 1 ATOM 1256 C CD . GLN 3410 3410 ? A 36.263 12.029 8.311 1 1 A GLN 0.800 1 ATOM 1257 O OE1 . GLN 3410 3410 ? A 37.403 11.962 8.767 1 1 A GLN 0.800 1 ATOM 1258 N NE2 . GLN 3410 3410 ? A 35.891 11.278 7.253 1 1 A GLN 0.800 1 ATOM 1259 N N . LEU 3411 3411 ? A 35.541 16.428 12.044 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 1260 C CA . LEU 3411 3411 ? A 36.563 17.339 12.521 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 1261 C C . LEU 3411 3411 ? A 35.959 18.586 13.168 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 1262 O O . LEU 3411 3411 ? A 34.978 19.150 12.680 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 1263 C CB . LEU 3411 3411 ? A 37.459 17.686 11.297 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 1264 C CG . LEU 3411 3411 ? A 38.954 17.941 11.557 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 1265 C CD1 . LEU 3411 3411 ? A 39.702 18.055 10.226 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 1266 C CD2 . LEU 3411 3411 ? A 39.261 19.171 12.401 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 1267 N N . GLU 3412 3412 ? A 36.547 19.054 14.293 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 1268 C CA . GLU 3412 3412 ? A 36.280 20.357 14.884 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 1269 C C . GLU 3412 3412 ? A 37.527 21.204 14.652 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 1270 O O . GLU 3412 3412 ? A 38.599 20.904 15.170 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 1271 C CB . GLU 3412 3412 ? A 35.938 20.290 16.405 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 1272 C CG . GLU 3412 3412 ? A 35.508 21.675 16.955 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 1273 C CD . GLU 3412 3412 ? A 34.650 21.714 18.207 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 1274 O OE1 . GLU 3412 3412 ? A 34.768 22.746 18.930 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 1275 O OE2 . GLU 3412 3412 ? A 33.794 20.821 18.425 1 1 A GLU 0.750 1 ATOM 1276 N N . LEU 3413 3413 ? A 37.446 22.249 13.800 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 1277 C CA . LEU 3413 3413 ? A 38.587 23.096 13.466 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 1278 C C . LEU 3413 3413 ? A 38.960 24.042 14.590 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 1279 O O . LEU 3413 3413 ? A 40.122 24.344 14.852 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 1280 C CB . LEU 3413 3413 ? A 38.300 23.990 12.233 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 1281 C CG . LEU 3413 3413 ? A 38.016 23.246 10.917 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 1282 C CD1 . LEU 3413 3413 ? 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PHE 3316 3316 ? B -2.533 5.489 6.064 1 1 B PHE 0.780 1 ATOM 2839 C CB . PHE 3316 3316 ? B -2.766 5.630 8.993 1 1 B PHE 0.780 1 ATOM 2840 C CG . PHE 3316 3316 ? B -1.299 5.336 9.219 1 1 B PHE 0.780 1 ATOM 2841 C CD1 . PHE 3316 3316 ? B -0.410 6.325 9.675 1 1 B PHE 0.780 1 ATOM 2842 C CD2 . PHE 3316 3316 ? B -0.799 4.050 8.952 1 1 B PHE 0.780 1 ATOM 2843 C CE1 . PHE 3316 3316 ? B 0.936 6.019 9.901 1 1 B PHE 0.780 1 ATOM 2844 C CE2 . PHE 3316 3316 ? B 0.533 3.725 9.234 1 1 B PHE 0.780 1 ATOM 2845 C CZ . PHE 3316 3316 ? B 1.400 4.711 9.715 1 1 B PHE 0.780 1 ATOM 2846 N N . ASP 3317 3317 ? B -1.494 7.463 6.202 1 1 B ASP 0.730 1 ATOM 2847 C CA . ASP 3317 3317 ? B -0.953 7.446 4.865 1 1 B ASP 0.730 1 ATOM 2848 C C . ASP 3317 3317 ? B -1.988 7.376 3.741 1 1 B ASP 0.730 1 ATOM 2849 O O . ASP 3317 3317 ? B -2.558 8.386 3.325 1 1 B ASP 0.730 1 ATOM 2850 C CB . ASP 3317 3317 ? B 0.182 6.391 4.716 1 1 B ASP 0.730 1 ATOM 2851 C CG . ASP 3317 3317 ? 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B -9.117 5.347 3.680 1 1 B SER 0.760 1 ATOM 2879 N N . LEU 3321 3321 ? B -8.891 4.521 8.159 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 2880 C CA . LEU 3321 3321 ? B -9.343 3.943 9.404 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 2881 C C . LEU 3321 3321 ? B -10.784 4.354 9.602 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 2882 O O . LEU 3321 3321 ? B -11.206 5.427 9.174 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 2883 C CB . LEU 3321 3321 ? B -8.524 4.411 10.636 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 2884 C CG . LEU 3321 3321 ? B -6.990 4.375 10.483 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 2885 C CD1 . LEU 3321 3321 ? B -6.333 4.875 11.776 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 2886 C CD2 . LEU 3321 3321 ? B -6.444 2.987 10.120 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 2887 N N . THR 3322 3322 ? B -11.584 3.507 10.267 1 1 B THR 0.740 1 ATOM 2888 C CA . THR 3322 3322 ? B -13.014 3.749 10.412 1 1 B THR 0.740 1 ATOM 2889 C C . THR 3322 3322 ? B -13.262 4.025 11.870 1 1 B THR 0.740 1 ATOM 2890 O O . THR 3322 3322 ? B -12.692 3.365 12.737 1 1 B THR 0.740 1 ATOM 2891 C CB . THR 3322 3322 ? 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B 18.982 23.725 41.033 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 4202 C CA . ASP 3491 3491 ? B 18.901 22.730 39.989 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 4203 C C . ASP 3491 3491 ? B 20.213 21.951 40.008 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 4204 O O . ASP 3491 3491 ? B 21.300 22.521 39.938 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 4205 C CB . ASP 3491 3491 ? B 18.684 23.416 38.611 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 4206 C CG . ASP 3491 3491 ? B 18.379 22.441 37.485 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 4207 O OD1 . ASP 3491 3491 ? B 19.135 21.444 37.348 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 4208 O OD2 . ASP 3491 3491 ? B 17.416 22.700 36.724 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 4209 N N . LEU 3492 3492 ? B 20.135 20.608 40.058 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 4210 C CA . LEU 3492 3492 ? B 21.277 19.716 40.082 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 4211 C C . LEU 3492 3492 ? B 22.127 19.791 38.822 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 4212 O O . LEU 3492 3492 ? B 23.341 19.592 38.852 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 4213 C CB . LEU 3492 3492 ? B 20.833 18.237 40.258 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 4214 C CG . LEU 3492 3492 ? B 20.141 17.866 41.592 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 4215 C CD1 . LEU 3492 3492 ? B 20.808 18.525 42.808 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 4216 C CD2 . LEU 3492 3492 ? B 18.623 18.105 41.592 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 4217 N N . VAL 3493 3493 ? B 21.511 20.071 37.659 1 1 B VAL 0.770 1 ATOM 4218 C CA . VAL 3493 3493 ? B 22.222 20.235 36.408 1 1 B VAL 0.770 1 ATOM 4219 C C . VAL 3493 3493 ? B 23.030 21.516 36.429 1 1 B VAL 0.770 1 ATOM 4220 O O . VAL 3493 3493 ? B 24.181 21.554 36.002 1 1 B VAL 0.770 1 ATOM 4221 C CB . VAL 3493 3493 ? B 21.288 20.210 35.210 1 1 B VAL 0.770 1 ATOM 4222 C CG1 . VAL 3493 3493 ? B 22.107 20.350 33.921 1 1 B VAL 0.770 1 ATOM 4223 C CG2 . VAL 3493 3493 ? B 20.519 18.877 35.181 1 1 B VAL 0.770 1 ATOM 4224 N N . ILE 3494 3494 ? B 22.459 22.601 36.989 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 4225 C CA . ILE 3494 3494 ? B 23.162 23.856 37.210 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 4226 C C . ILE 3494 3494 ? B 24.350 23.684 38.146 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 4227 O O . ILE 3494 3494 ? B 25.450 24.122 37.819 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 4228 C CB . ILE 3494 3494 ? B 22.216 24.955 37.691 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 4229 C CG1 . ILE 3494 3494 ? B 21.282 25.347 36.520 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 4230 C CG2 . ILE 3494 3494 ? B 23.004 26.179 38.192 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 4231 C CD1 . ILE 3494 3494 ? B 20.242 26.423 36.859 1 1 B ILE 0.770 1 ATOM 4232 N N . ASP 3495 3495 ? B 24.191 22.979 39.280 1 1 B ASP 0.750 1 ATOM 4233 C CA . ASP 3495 3495 ? B 25.275 22.629 40.184 1 1 B ASP 0.750 1 ATOM 4234 C C . ASP 3495 3495 ? B 26.367 21.776 39.526 1 1 B ASP 0.750 1 ATOM 4235 O O . ASP 3495 3495 ? B 27.565 22.002 39.715 1 1 B ASP 0.750 1 ATOM 4236 C CB . ASP 3495 3495 ? B 24.718 21.880 41.419 1 1 B ASP 0.750 1 ATOM 4237 C CG . ASP 3495 3495 ? B 23.764 22.743 42.231 1 1 B ASP 0.750 1 ATOM 4238 O OD1 . ASP 3495 3495 ? B 23.771 23.987 42.055 1 1 B ASP 0.750 1 ATOM 4239 O OD2 . ASP 3495 3495 ? B 23.040 22.140 43.063 1 1 B ASP 0.750 1 ATOM 4240 N N . ALA 3496 3496 ? 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B 28.133 24.273 37.197 1 1 B ALA 0.800 1 ATOM 4254 C CA . ALA 3498 3498 ? B 28.906 25.102 38.108 1 1 B ALA 0.800 1 ATOM 4255 C C . ALA 3498 3498 ? B 30.202 24.453 38.592 1 1 B ALA 0.800 1 ATOM 4256 O O . ALA 3498 3498 ? B 31.274 25.052 38.554 1 1 B ALA 0.800 1 ATOM 4257 C CB . ALA 3498 3498 ? B 28.028 25.455 39.331 1 1 B ALA 0.800 1 ATOM 4258 N N . SER 3499 3499 ? B 30.155 23.171 39.008 1 1 B SER 0.750 1 ATOM 4259 C CA . SER 3499 3499 ? B 31.348 22.409 39.376 1 1 B SER 0.750 1 ATOM 4260 C C . SER 3499 3499 ? B 32.331 22.200 38.223 1 1 B SER 0.750 1 ATOM 4261 O O . SER 3499 3499 ? B 33.524 22.460 38.352 1 1 B SER 0.750 1 ATOM 4262 C CB . SER 3499 3499 ? B 30.954 21.025 39.968 1 1 B SER 0.750 1 ATOM 4263 O OG . SER 3499 3499 ? B 32.074 20.336 40.529 1 1 B SER 0.750 1 ATOM 4264 N N . MET 3500 3500 ? B 31.841 21.786 37.033 1 1 B MET 0.720 1 ATOM 4265 C CA . MET 3500 3500 ? B 32.655 21.530 35.848 1 1 B MET 0.720 1 ATOM 4266 C C . MET 3500 3500 ? B 33.376 22.763 35.303 1 1 B MET 0.720 1 ATOM 4267 O O . MET 3500 3500 ? B 34.502 22.685 34.822 1 1 B MET 0.720 1 ATOM 4268 C CB . MET 3500 3500 ? B 31.783 20.912 34.721 1 1 B MET 0.720 1 ATOM 4269 C CG . MET 3500 3500 ? B 31.217 19.514 35.057 1 1 B MET 0.720 1 ATOM 4270 S SD . MET 3500 3500 ? B 29.701 19.069 34.143 1 1 B MET 0.720 1 ATOM 4271 C CE . MET 3500 3500 ? B 30.423 18.955 32.483 1 1 B MET 0.720 1 ATOM 4272 N N . THR 3501 3501 ? B 32.715 23.933 35.345 1 1 B THR 0.780 1 ATOM 4273 C CA . THR 3501 3501 ? B 33.276 25.208 34.899 1 1 B THR 0.780 1 ATOM 4274 C C . THR 3501 3501 ? B 34.129 25.949 35.938 1 1 B THR 0.780 1 ATOM 4275 O O . THR 3501 3501 ? B 34.993 26.754 35.593 1 1 B THR 0.780 1 ATOM 4276 C CB . THR 3501 3501 ? B 32.130 26.089 34.424 1 1 B THR 0.780 1 ATOM 4277 O OG1 . THR 3501 3501 ? B 32.556 27.224 33.701 1 1 B THR 0.780 1 ATOM 4278 C CG2 . THR 3501 3501 ? B 31.302 26.613 35.586 1 1 B THR 0.780 1 ATOM 4279 N N . GLY 3502 3502 ? 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B 28.003 30.051 40.200 1 1 B SER 0.780 1 ATOM 4293 O O . SER 3504 3504 ? B 28.071 30.958 39.370 1 1 B SER 0.780 1 ATOM 4294 C CB . SER 3504 3504 ? B 29.198 29.917 42.401 1 1 B SER 0.780 1 ATOM 4295 O OG . SER 3504 3504 ? B 29.311 31.320 42.639 1 1 B SER 0.780 1 ATOM 4296 N N . LEU 3505 3505 ? B 26.811 29.514 40.559 1 1 B LEU 0.790 1 ATOM 4297 C CA . LEU 3505 3505 ? B 25.524 29.974 40.058 1 1 B LEU 0.790 1 ATOM 4298 C C . LEU 3505 3505 ? B 25.280 31.432 40.385 1 1 B LEU 0.790 1 ATOM 4299 O O . LEU 3505 3505 ? B 24.895 32.231 39.534 1 1 B LEU 0.790 1 ATOM 4300 C CB . LEU 3505 3505 ? B 24.379 29.103 40.641 1 1 B LEU 0.790 1 ATOM 4301 C CG . LEU 3505 3505 ? B 22.951 29.624 40.357 1 1 B LEU 0.790 1 ATOM 4302 C CD1 . LEU 3505 3505 ? B 22.722 29.863 38.865 1 1 B LEU 0.790 1 ATOM 4303 C CD2 . LEU 3505 3505 ? B 21.879 28.678 40.914 1 1 B LEU 0.790 1 ATOM 4304 N N . GLU 3506 3506 ? B 25.594 31.833 41.617 1 1 B GLU 0.750 1 ATOM 4305 C CA . GLU 3506 3506 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #