data_SMR-c3804ac9322810fbd9d7c580d9311931_2 _entry.id SMR-c3804ac9322810fbd9d7c580d9311931_2 _struct.entry_id SMR-c3804ac9322810fbd9d7c580d9311931_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A1JII0/ RPOB_YERE8, DNA-directed RNA polymerase subunit beta Estimated model accuracy of this model is 0.046, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A1JII0' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 174805.120 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RPOB_YERE8 A1JII0 1 ;MVYSYTEKKRIRKDFGKRPQVLDIPYLLSIQLDSFQKFIEQDPEGQYGLEAAFRSVFPIQSYSGNSELQY VSYRLGEPVFDVKECQIRGVTYSAPLRVKLRLVIYEREAPEGTVKDIKEQEVYMGEIPLMTENGTFVING TERVIVSQLHRSPGVFFDSDKGKTHSSGKVLYNARIIPYRGSWLDFEFDPKDNLFVRIDRRRKLPATIIL RALNFTTAQILDLFFEKVVFEIRDNKLQMELVPERLRGETASFDIEANGKVYVEKARRITARHIRQLEKD GIDRIEVPVEYIAGKVVAKDYIDENTGELICAANMELSLDLLAKLSQAGHKQIETLFTNDLDHSAYISET LRVDPTSDRLSALVEIYRMMRPGEPPTREAAENLFENLFFSEDRYDLSAVGRMKFNRSLLRDEIEGSGIL SKEDITEVMKKLIDIRNGKGEVDDIDHLGNRRIRSVGEMAENQFRVGLVRVERAVKERLSLGDLDTLMPQ DMINAKPISAAVKEFFGSSQLSQFMDQNNPLSEITHKRRISALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRVCP IETPEGPNIGLINSLSVYAQTNEYGFLETPYRRVRDGVVTDEINYLSAIEEGNFVIAQANSNLDEDGRFI EDLVTCRSKGESSLFSRDQVDYMDVSTQQVVSVGASLIPFLEHDDANRALMGANMQRQAVPTLRADKPLV GTGMERAVAVDSGVTSVAKRGGTVQYVDASRIVIKVNEDEMYPGEAGIDIYNLTKYTRSNQNTCINQMPC VNLGEPIERGDVLADGPSTDLGELALGQNMRVAFMPWNGYNFEDSILVSERVVQEDRFTTIHIQELACVS RDTKLGPEEITADIPNVGEAALSKLDESGIVYIGAEVTGGDILVGKVTPKGETQLTPEEKLLRAIFGEKA SDVKDSSLRVPNGVSGTVIDVQVFTRDGVEKDKRALEIEEMQLKQAKKDLTEELQILEAGLFARIHAVLV SGGIEADKLSKLPRDRWLELGLTDEDKQNQLEQLAEQYDEMKSEFEKKMDAKRRKITQGDDLAPGVLKIV KVYLAVKRQIQPGDKMAGRHGNKGVISKINPIEDMPYDENGTPVDIVLNPLGVPSRMNIGQILETHLGMA AKGIGEKINAMLKKQEEVAKLREFIQKAYDLGDSVCQKVDLSTFTDDEVLRLAENLKKGMPIATPVFDGA TEKEIKELLQLGGLPTSGQITLFDGRTGEQFERQVTVGYMYMLKLNHLVDDKMHARSTGSYSLVTQQPLG GKAQFGGQRFGEMEVWALEAYGAAYTLQEMLTVKSDDVNGRTKMYKNIVDGDHRMEPGMPESFNVLLKEI RSLGINIELEEE ; 'DNA-directed RNA polymerase subunit beta' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1342 1 1342 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . RPOB_YERE8 A1JII0 . 1 1342 393305 'Yersinia enterocolitica serotype O:8 / biotype 1B (strain NCTC 13174 /8081)' 2007-02-06 8E545D186DABC319 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MVYSYTEKKRIRKDFGKRPQVLDIPYLLSIQLDSFQKFIEQDPEGQYGLEAAFRSVFPIQSYSGNSELQY VSYRLGEPVFDVKECQIRGVTYSAPLRVKLRLVIYEREAPEGTVKDIKEQEVYMGEIPLMTENGTFVING TERVIVSQLHRSPGVFFDSDKGKTHSSGKVLYNARIIPYRGSWLDFEFDPKDNLFVRIDRRRKLPATIIL RALNFTTAQILDLFFEKVVFEIRDNKLQMELVPERLRGETASFDIEANGKVYVEKARRITARHIRQLEKD GIDRIEVPVEYIAGKVVAKDYIDENTGELICAANMELSLDLLAKLSQAGHKQIETLFTNDLDHSAYISET LRVDPTSDRLSALVEIYRMMRPGEPPTREAAENLFENLFFSEDRYDLSAVGRMKFNRSLLRDEIEGSGIL SKEDITEVMKKLIDIRNGKGEVDDIDHLGNRRIRSVGEMAENQFRVGLVRVERAVKERLSLGDLDTLMPQ DMINAKPISAAVKEFFGSSQLSQFMDQNNPLSEITHKRRISALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRVCP 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TERVIVSQLHRSPGVFFDSDKGKTHSSGKVLYNARIIPYRGSWLDFEFDPKDNLFVRIDRRRKLPATIIL RALNFTTAQILDLFFEKVVFEIRDNKLQMELVPERLRGETASFDIEANGKVYVEKARRITARHIRQLEKD GIDRIEVPVEYIAGKVVAKDYIDENTGELICAANMELSLDLLAKLSQAGHKQIETLFTNDLDHSAYISET LRVDPTSDRLSALVEIYRMMRPGEPPTREAAENLFENLFFSEDRYDLSAVGRMKFNRSLLRDEIEGSGIL SKEDITEVMKKLIDIRNGKGEVDDIDHLGNRRIRSVGEMAENQFRVGLVRVERAVKERLSLGDLDTLMPQ DMINAKPISAAVKEFFGSSQLSQFMDQNNPLSEITHKRRISALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRVCP IETPEGPNIGLINSLSVYAQTNEYGFLETPYRRVRDGVVTDEINYLSAIEEGNFVIAQANSNLDEDGRFI EDLVTCRSKGESSLFSRDQVDYMDVSTQQVVSVGASLIPFLEHDDANRALMGANMQRQAVPTLRADKPLV GTGMERAVAVDSGVTSVAKRGGTVQYVDASRIVIKVNEDEMYPGEAGIDIYNLTKYTRSNQNTCINQMPC VNLGEPIERGDVLADGPSTDLGELALGQNMRVAFMPWNGYNFEDSILVSERVVQEDRFTTIHIQELACVS RDTKLGPEEITADIPNVGEAALSKLDESGIVYIGAEVTGGDILVGKVTPKGETQLTPEEKLLRAIFGEKA SDVKDSSLRVPNGVSGTVIDVQVFTRDGVEKDKRALEIEEMQLKQAKKDLTEELQILEAGLFARIHAVLV SGGIEADKLSKLPRDRWLELGLTDEDKQNQLEQLAEQYDEMKSEFEKKMDAKRRKITQGDDLAPGVLKIV KVYLAVKRQIQPGDKMAGRHGNKGVISKINPIEDMPYDENGTPVDIVLNPLGVPSRMNIGQILETHLGMA 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TYR . 1 63 SER . 1 64 GLY . 1 65 ASN . 1 66 SER . 1 67 GLU . 1 68 LEU . 1 69 GLN . 1 70 TYR . 1 71 VAL . 1 72 SER . 1 73 TYR . 1 74 ARG . 1 75 LEU . 1 76 GLY . 1 77 GLU . 1 78 PRO . 1 79 VAL . 1 80 PHE . 1 81 ASP . 1 82 VAL . 1 83 LYS . 1 84 GLU . 1 85 CYS . 1 86 GLN . 1 87 ILE . 1 88 ARG . 1 89 GLY . 1 90 VAL . 1 91 THR . 1 92 TYR . 1 93 SER . 1 94 ALA . 1 95 PRO . 1 96 LEU . 1 97 ARG . 1 98 VAL . 1 99 LYS . 1 100 LEU . 1 101 ARG . 1 102 LEU . 1 103 VAL . 1 104 ILE . 1 105 TYR . 1 106 GLU . 1 107 ARG . 1 108 GLU . 1 109 ALA . 1 110 PRO . 1 111 GLU . 1 112 GLY . 1 113 THR . 1 114 VAL . 1 115 LYS . 1 116 ASP . 1 117 ILE . 1 118 LYS . 1 119 GLU . 1 120 GLN . 1 121 GLU . 1 122 VAL . 1 123 TYR . 1 124 MET . 1 125 GLY . 1 126 GLU . 1 127 ILE . 1 128 PRO . 1 129 LEU . 1 130 MET . 1 131 THR . 1 132 GLU . 1 133 ASN . 1 134 GLY . 1 135 THR . 1 136 PHE . 1 137 VAL . 1 138 ILE . 1 139 ASN . 1 140 GLY . 1 141 THR . 1 142 GLU . 1 143 ARG . 1 144 VAL . 1 145 ILE . 1 146 VAL . 1 147 SER . 1 148 GLN . 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A 1 1292 THR 1292 ? ? ? B . A 1 1293 VAL 1293 ? ? ? B . A 1 1294 LYS 1294 ? ? ? B . A 1 1295 SER 1295 ? ? ? B . A 1 1296 ASP 1296 ? ? ? B . A 1 1297 ASP 1297 ? ? ? B . A 1 1298 VAL 1298 ? ? ? B . A 1 1299 ASN 1299 ? ? ? B . A 1 1300 GLY 1300 ? ? ? B . A 1 1301 ARG 1301 ? ? ? B . A 1 1302 THR 1302 ? ? ? B . A 1 1303 LYS 1303 ? ? ? B . A 1 1304 MET 1304 ? ? ? B . A 1 1305 TYR 1305 ? ? ? B . A 1 1306 LYS 1306 ? ? ? B . A 1 1307 ASN 1307 ? ? ? B . A 1 1308 ILE 1308 ? ? ? B . A 1 1309 VAL 1309 ? ? ? B . A 1 1310 ASP 1310 ? ? ? B . A 1 1311 GLY 1311 ? ? ? B . A 1 1312 ASP 1312 ? ? ? B . A 1 1313 HIS 1313 ? ? ? B . A 1 1314 ARG 1314 ? ? ? B . A 1 1315 MET 1315 ? ? ? B . A 1 1316 GLU 1316 ? ? ? B . A 1 1317 PRO 1317 ? ? ? B . A 1 1318 GLY 1318 ? ? ? B . A 1 1319 MET 1319 ? ? ? B . A 1 1320 PRO 1320 ? ? ? B . A 1 1321 GLU 1321 ? ? ? B . A 1 1322 SER 1322 ? ? ? B . A 1 1323 PHE 1323 ? ? ? B . A 1 1324 ASN 1324 ? ? ? B . A 1 1325 VAL 1325 ? ? ? B . A 1 1326 LEU 1326 ? ? ? B . A 1 1327 LEU 1327 ? ? ? B . A 1 1328 LYS 1328 ? ? ? B . A 1 1329 GLU 1329 ? ? ? B . A 1 1330 ILE 1330 ? ? ? B . A 1 1331 ARG 1331 ? ? ? B . A 1 1332 SER 1332 ? ? ? B . A 1 1333 LEU 1333 ? ? ? B . A 1 1334 GLY 1334 ? ? ? B . A 1 1335 ILE 1335 ? ? ? B . A 1 1336 ASN 1336 ? ? ? B . A 1 1337 ILE 1337 ? ? ? B . A 1 1338 GLU 1338 ? ? ? B . A 1 1339 LEU 1339 ? ? ? B . A 1 1340 GLU 1340 ? ? ? B . A 1 1341 GLU 1341 ? ? ? B . A 1 1342 GLU 1342 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'DNA-directed RNA polymerase subunit beta {PDB ID=3e7h, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=3e7h.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 3e7h, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-07-02 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-06-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;AVNFEVKDQTLMMELVPERLRGETATFDIEADGKVYVEKGRRVTARHIRQLEKDGVNFIEVPVEYIVGKV SAKDYVNEATGELIITANQEISLEALANLSQAG ; ;AVNFEVKDQTLMMELVPERLRGETATFDIEADGKVYVEKGRRVTARHIRQLEKDGVNFIEVPVEYIVGKV SAKDYVNEATGELIITANQEISLEALANLSQAG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 2 103 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3e7h 2024-02-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1342 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1342 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 2.59e-45 75.490 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MVYSYTEKKRIRKDFGKRPQVLDIPYLLSIQLDSFQKFIEQDPEGQYGLEAAFRSVFPIQSYSGNSELQYVSYRLGEPVFDVKECQIRGVTYSAPLRVKLRLVIYEREAPEGTVKDIKEQEVYMGEIPLMTENGTFVINGTERVIVSQLHRSPGVFFDSDKGKTHSSGKVLYNARIIPYRGSWLDFEFDPKDNLFVRIDRRRKLPATIILRALNFTTAQILDLFFEKVVFEIRDNKLQMELVPERLRGETASFDIEANGKVYVEKARRITARHIRQLEKDGIDRIEVPVEYIAGKVVAKDYIDENTGELICAANMELSLDLLAKLSQAGHKQIETLFTNDLDHSAYISETLRVDPTSDRLSALVEIYRMMRPGEPPTREAAENLFENLFFSEDRYDLSAVGRMKFNRSLLRDEIEGSGILSKEDITEVMKKLIDIRNGKGEVDDIDHLGNRRIRSVGEMAENQFRVGLVRVERAVKERLSLGDLDTLMPQDMINAKPISAAVKEFFGSSQLSQFMDQNNPLSEITHKRRISALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRVCPIETPEGPNIGLINSLSVYAQTNEYGFLETPYRRVRDGVVTDEINYLSAIEEGNFVIAQANSNLDEDGRFIEDLVTCRSKGESSLFSRDQVDYMDVSTQQVVSVGASLIPFLEHDDANRALMGANMQRQAVPTLRADKPLVGTGMERAVAVDSGVTSVAKRGGTVQYVDASRIVIKVNEDEMYPGEAGIDIYNLTKYTRSNQNTCINQMPCVNLGEPIERGDVLADGPSTDLGELALGQNMRVAFMPWNGYNFEDSILVSERVVQEDRFTTIHIQELACVSRDTKLGPEEITADIPNVGEAALSKLDESGIVYIGAEVTGGDILVGKVTPKGETQLTPEEKLLRAIFGEKASDVKDSSLRVPNGVSGTVIDVQVFTRDGVEKDKRALEIEEMQLKQAKKDLTEELQILEAGLFARIHAVLVSGGIEADKLSKLPRDRWLELGLTDEDKQNQLEQLAEQYDEMKSEFEKKMDAKRRKITQGDDLAPGVLKIVKVYLAVKRQIQPGDKMAGRHGNKGVISKINPIEDMPYDENGTPVDIVLNPLGVPSRMNIGQILETHLGMAAKGIGEKINAMLKKQEEVAKLREFIQKAYDLGDSVCQKVDLSTFTDDEVLRLAENLKKGMPIATPVFDGATEKEIKELLQLGGLPTSGQITLFDGRTGEQFERQVTVGYMYMLKLNHLVDDKMHARSTGSYSLVTQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWALEAYGAAYTLQEMLTVKSDDVNGRTKMYKNIVDGDHRMEPGMPESFNVLLKEIRSLGINIELEEE 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VNFEVKDQTLMMELVPERLRGETATFDIEADGKVYVEKGRRVTARHIRQLEKDGVNFIEVPVEYIVGKVSAKDYVNEATGELIITANQEISLEALANLSQAG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.151}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3e7h.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 2' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . VAL 228 228 ? A 21.825 36.049 58.465 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 2 C CA . VAL 228 228 ? A 23.333 36.034 58.443 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 3 C C . VAL 228 228 ? A 23.831 36.621 57.153 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 4 O O . VAL 228 228 ? A 23.366 36.211 56.092 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 5 C CB . VAL 228 228 ? A 23.864 34.614 58.608 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 6 C CG1 . VAL 228 228 ? A 25.402 34.582 58.689 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 7 C CG2 . VAL 228 228 ? A 23.366 34.079 59.949 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 8 N N . VAL 229 229 ? A 24.750 37.596 57.198 1 1 B VAL 0.070 1 ATOM 9 C CA . VAL 229 229 ? A 25.388 38.104 56.001 1 1 B VAL 0.070 1 ATOM 10 C C . VAL 229 229 ? A 26.788 37.548 56.098 1 1 B VAL 0.070 1 ATOM 11 O O . VAL 229 229 ? A 27.308 37.307 57.190 1 1 B VAL 0.070 1 ATOM 12 C CB . VAL 229 229 ? A 25.314 39.629 55.845 1 1 B VAL 0.070 1 ATOM 13 C CG1 . VAL 229 229 ? A 26.098 40.152 54.620 1 1 B VAL 0.070 1 ATOM 14 C CG2 . VAL 229 229 ? A 23.831 40.051 55.743 1 1 B VAL 0.070 1 ATOM 15 N N . PHE 230 230 ? A 27.395 37.220 54.955 1 1 B PHE 0.270 1 ATOM 16 C CA . PHE 230 230 ? A 28.758 36.765 54.893 1 1 B PHE 0.270 1 ATOM 17 C C . PHE 230 230 ? A 29.477 37.721 53.947 1 1 B PHE 0.270 1 ATOM 18 O O . PHE 230 230 ? A 29.405 37.584 52.724 1 1 B PHE 0.270 1 ATOM 19 C CB . PHE 230 230 ? A 28.726 35.299 54.402 1 1 B PHE 0.270 1 ATOM 20 C CG . PHE 230 230 ? A 29.941 34.542 54.824 1 1 B PHE 0.270 1 ATOM 21 C CD1 . PHE 230 230 ? A 29.945 33.862 56.052 1 1 B PHE 0.270 1 ATOM 22 C CD2 . PHE 230 230 ? A 31.065 34.461 53.992 1 1 B PHE 0.270 1 ATOM 23 C CE1 . PHE 230 230 ? A 31.044 33.084 56.428 1 1 B PHE 0.270 1 ATOM 24 C CE2 . PHE 230 230 ? A 32.159 33.670 54.363 1 1 B PHE 0.270 1 ATOM 25 C CZ . PHE 230 230 ? A 32.149 32.979 55.579 1 1 B PHE 0.270 1 ATOM 26 N N . GLU 231 231 ? A 30.180 38.737 54.488 1 1 B GLU 0.310 1 ATOM 27 C CA . GLU 231 231 ? A 30.807 39.784 53.701 1 1 B GLU 0.310 1 ATOM 28 C C . GLU 231 231 ? A 32.240 39.370 53.401 1 1 B GLU 0.310 1 ATOM 29 O O . GLU 231 231 ? A 33.087 39.311 54.287 1 1 B GLU 0.310 1 ATOM 30 C CB . GLU 231 231 ? A 30.780 41.149 54.446 1 1 B GLU 0.310 1 ATOM 31 C CG . GLU 231 231 ? A 31.449 42.321 53.675 1 1 B GLU 0.310 1 ATOM 32 C CD . GLU 231 231 ? A 31.745 43.567 54.529 1 1 B GLU 0.310 1 ATOM 33 O OE1 . GLU 231 231 ? A 32.561 43.445 55.487 1 1 B GLU 0.310 1 ATOM 34 O OE2 . GLU 231 231 ? A 31.227 44.654 54.168 1 1 B GLU 0.310 1 ATOM 35 N N . ILE 232 232 ? A 32.547 39.030 52.132 1 1 B ILE 0.280 1 ATOM 36 C CA . ILE 232 232 ? A 33.855 38.546 51.709 1 1 B ILE 0.280 1 ATOM 37 C C . ILE 232 232 ? A 34.836 39.692 51.537 1 1 B ILE 0.280 1 ATOM 38 O O . ILE 232 232 ? A 34.605 40.631 50.781 1 1 B ILE 0.280 1 ATOM 39 C CB . ILE 232 232 ? A 33.776 37.711 50.431 1 1 B ILE 0.280 1 ATOM 40 C CG1 . ILE 232 232 ? A 32.772 36.552 50.654 1 1 B ILE 0.280 1 ATOM 41 C CG2 . ILE 232 232 ? A 35.190 37.215 50.030 1 1 B ILE 0.280 1 ATOM 42 C CD1 . ILE 232 232 ? A 32.512 35.684 49.419 1 1 B ILE 0.280 1 ATOM 43 N N . ARG 233 233 ? 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A 7.260 32.296 66.430 1 1 B GLN 0.480 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.573 2 1 3 0.046 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 228 VAL 1 0.150 2 1 A 229 VAL 1 0.070 3 1 A 230 PHE 1 0.270 4 1 A 231 GLU 1 0.310 5 1 A 232 ILE 1 0.280 6 1 A 233 ARG 1 0.230 7 1 A 234 ASP 1 0.300 8 1 A 235 ASN 1 0.390 9 1 A 236 LYS 1 0.410 10 1 A 237 LEU 1 0.430 11 1 A 238 GLN 1 0.550 12 1 A 239 MET 1 0.610 13 1 A 240 GLU 1 0.690 14 1 A 241 LEU 1 0.740 15 1 A 242 VAL 1 0.690 16 1 A 243 PRO 1 0.690 17 1 A 244 GLU 1 0.630 18 1 A 245 ARG 1 0.600 19 1 A 246 LEU 1 0.680 20 1 A 247 ARG 1 0.590 21 1 A 248 GLY 1 0.740 22 1 A 249 GLU 1 0.680 23 1 A 250 THR 1 0.660 24 1 A 251 ALA 1 0.630 25 1 A 252 SER 1 0.560 26 1 A 253 PHE 1 0.600 27 1 A 254 ASP 1 0.590 28 1 A 255 ILE 1 0.620 29 1 A 256 GLU 1 0.630 30 1 A 257 ALA 1 0.680 31 1 A 258 ASN 1 0.600 32 1 A 259 GLY 1 0.680 33 1 A 260 LYS 1 0.660 34 1 A 261 VAL 1 0.700 35 1 A 262 TYR 1 0.640 36 1 A 263 VAL 1 0.700 37 1 A 264 GLU 1 0.610 38 1 A 265 LYS 1 0.570 39 1 A 266 ALA 1 0.640 40 1 A 267 ARG 1 0.540 41 1 A 268 ARG 1 0.610 42 1 A 269 ILE 1 0.710 43 1 A 270 THR 1 0.760 44 1 A 271 ALA 1 0.830 45 1 A 272 ARG 1 0.720 46 1 A 273 HIS 1 0.710 47 1 A 274 ILE 1 0.740 48 1 A 275 ARG 1 0.700 49 1 A 276 GLN 1 0.710 50 1 A 277 LEU 1 0.730 51 1 A 278 GLU 1 0.670 52 1 A 279 LYS 1 0.720 53 1 A 280 ASP 1 0.800 54 1 A 281 GLY 1 0.780 55 1 A 282 ILE 1 0.740 56 1 A 283 ASP 1 0.720 57 1 A 284 ARG 1 0.660 58 1 A 285 ILE 1 0.690 59 1 A 286 GLU 1 0.650 60 1 A 287 VAL 1 0.700 61 1 A 288 PRO 1 0.630 62 1 A 289 VAL 1 0.570 63 1 A 290 GLU 1 0.520 64 1 A 291 TYR 1 0.470 65 1 A 292 ILE 1 0.480 66 1 A 293 ALA 1 0.560 67 1 A 294 GLY 1 0.460 68 1 A 295 LYS 1 0.400 69 1 A 296 VAL 1 0.480 70 1 A 297 VAL 1 0.470 71 1 A 298 ALA 1 0.520 72 1 A 299 LYS 1 0.600 73 1 A 300 ASP 1 0.660 74 1 A 301 TYR 1 0.740 75 1 A 302 ILE 1 0.690 76 1 A 303 ASP 1 0.600 77 1 A 304 GLU 1 0.530 78 1 A 305 ASN 1 0.590 79 1 A 306 THR 1 0.640 80 1 A 307 GLY 1 0.660 81 1 A 308 GLU 1 0.580 82 1 A 309 LEU 1 0.500 83 1 A 310 ILE 1 0.460 84 1 A 311 CYS 1 0.360 85 1 A 312 ALA 1 0.400 86 1 A 313 ALA 1 0.330 87 1 A 314 ASN 1 0.370 88 1 A 315 MET 1 0.320 89 1 A 316 GLU 1 0.350 90 1 A 317 LEU 1 0.360 91 1 A 318 SER 1 0.550 92 1 A 319 LEU 1 0.660 93 1 A 320 ASP 1 0.620 94 1 A 321 LEU 1 0.510 95 1 A 322 LEU 1 0.490 96 1 A 323 ALA 1 0.660 97 1 A 324 LYS 1 0.570 98 1 A 325 LEU 1 0.570 99 1 A 326 SER 1 0.480 100 1 A 327 GLN 1 0.480 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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