data_SMR-40c431e15c5031eff4ae32cfafa47b41_2 _entry.id SMR-40c431e15c5031eff4ae32cfafa47b41_2 _struct.entry_id SMR-40c431e15c5031eff4ae32cfafa47b41_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - O95803/ NDST3_HUMAN, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3 Estimated model accuracy of this model is 0.011, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O95803' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.4 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 116742.428 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NDST3_HUMAN O95803 1 ;MSFIMKLHRHFQRTVILLATFCMVSIIISAYYLYSGYKQENELSETASEVDCGDLQHLPYQLMEVKAMKL FDASRTDPTVLVFVESQYSSLGQDIIMILESSRFQYHIEIAPGKGDLPVLIDKMKGKYILIIYENILKYI NMDSWNRSLLDKYCVEYGVGVIGFHKTSEKSVQSFQLKGFPFSIYGNLAVKDCCINPHSPLIRVTKSSKL EKGSLPGTDWTVFQINHSAYQPVIFAKVKTPENLSPSISKGAFYATIIHDLGLHDGIQRVLFGNNLNFWL HKLIFIDAISFLSGKRLTLSLDRYILVDIDDIFVGKEGTRMNTNDVKALLDTQNLLRAQITNFTFNLGFS GKFYHTGTEEEDEGDDCLLGSVDEFWWFPHMWSHMQPHLFHNESSLVEQMILNKKFALEHGIPTDMGYAV APHHSGVYPVHVQLYEAWKKVWNIKITSTEEYPHLKPARYRRGFIHKNIMVLPRQTCGLFTHTIFYKEYP GGPKELDKSIQGGELFFTVVLNPISIFMTHLSNYGNDRLGLYTFVNLANFVKSWTNLRLQTLPPVQLAHK YFELFPDQKDPLWQNPCDDKRHRDIWSKEKTCDRLPKFLVIGPQKTGTTALYLFLVMHPSILSNSPSPKT FEEVQFFNRNNYHRGIDWYMDFFPVPSNVTTDFLFEKSANYFHSEEAPKRAASLVPKAKIITILIDPSDR AYSWYQHQRSHEDPAALKFSFYEVISAGPRAPSELRALQKRCLVPGWYASHIERWLVYFPPFQLLIIDGQ QLRTDPATVMDEVQKFLGVLPHYNYSEALTFDSHKGFWCQLLEEGKTKCLGKSKGRKYPPMDSDSRTFLS SYYRDHNVELSKLLHKLGQPLPSWLRQELQKVR ; 'Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 873 1 873 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . NDST3_HUMAN O95803 . 1 873 9606 'Homo sapiens (Human)' 1999-05-01 4DDE39257CAC0D36 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MSFIMKLHRHFQRTVILLATFCMVSIIISAYYLYSGYKQENELSETASEVDCGDLQHLPYQLMEVKAMKL FDASRTDPTVLVFVESQYSSLGQDIIMILESSRFQYHIEIAPGKGDLPVLIDKMKGKYILIIYENILKYI NMDSWNRSLLDKYCVEYGVGVIGFHKTSEKSVQSFQLKGFPFSIYGNLAVKDCCINPHSPLIRVTKSSKL EKGSLPGTDWTVFQINHSAYQPVIFAKVKTPENLSPSISKGAFYATIIHDLGLHDGIQRVLFGNNLNFWL HKLIFIDAISFLSGKRLTLSLDRYILVDIDDIFVGKEGTRMNTNDVKALLDTQNLLRAQITNFTFNLGFS GKFYHTGTEEEDEGDDCLLGSVDEFWWFPHMWSHMQPHLFHNESSLVEQMILNKKFALEHGIPTDMGYAV APHHSGVYPVHVQLYEAWKKVWNIKITSTEEYPHLKPARYRRGFIHKNIMVLPRQTCGLFTHTIFYKEYP GGPKELDKSIQGGELFFTVVLNPISIFMTHLSNYGNDRLGLYTFVNLANFVKSWTNLRLQTLPPVQLAHK YFELFPDQKDPLWQNPCDDKRHRDIWSKEKTCDRLPKFLVIGPQKTGTTALYLFLVMHPSILSNSPSPKT 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AYSWYQHQRSHEDPAALKFSFYEVISAGPRAPSELRALQKRCLVPGWYASHIERWLVYFPPFQLLIIDGQ QLRTDPATVMDEVQKFLGVLPHYNYSEALTFDSHKGFWCQLLEEGKTKCLGKSKGRKYPPMDSDSRTFLS SYYRDHNVELSKLLHKLGQPLPSWLRQELQKVR ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 SER . 1 3 PHE . 1 4 ILE . 1 5 MET . 1 6 LYS . 1 7 LEU . 1 8 HIS . 1 9 ARG . 1 10 HIS . 1 11 PHE . 1 12 GLN . 1 13 ARG . 1 14 THR . 1 15 VAL . 1 16 ILE . 1 17 LEU . 1 18 LEU . 1 19 ALA . 1 20 THR . 1 21 PHE . 1 22 CYS . 1 23 MET . 1 24 VAL . 1 25 SER . 1 26 ILE . 1 27 ILE . 1 28 ILE . 1 29 SER . 1 30 ALA . 1 31 TYR . 1 32 TYR . 1 33 LEU . 1 34 TYR . 1 35 SER . 1 36 GLY . 1 37 TYR . 1 38 LYS . 1 39 GLN . 1 40 GLU . 1 41 ASN . 1 42 GLU . 1 43 LEU . 1 44 SER . 1 45 GLU . 1 46 THR . 1 47 ALA . 1 48 SER . 1 49 GLU . 1 50 VAL . 1 51 ASP . 1 52 CYS . 1 53 GLY . 1 54 ASP . 1 55 LEU . 1 56 GLN . 1 57 HIS . 1 58 LEU . 1 59 PRO . 1 60 TYR . 1 61 GLN . 1 62 LEU . 1 63 MET . 1 64 GLU . 1 65 VAL . 1 66 LYS . 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B 1 782 GLU 782 ? ? ? B . B 1 783 VAL 783 ? ? ? B . B 1 784 GLN 784 ? ? ? B . B 1 785 LYS 785 ? ? ? B . B 1 786 PHE 786 ? ? ? B . B 1 787 LEU 787 ? ? ? B . B 1 788 GLY 788 ? ? ? B . B 1 789 VAL 789 ? ? ? B . B 1 790 LEU 790 ? ? ? B . B 1 791 PRO 791 ? ? ? B . B 1 792 HIS 792 ? ? ? B . B 1 793 TYR 793 ? ? ? B . B 1 794 ASN 794 ? ? ? B . B 1 795 TYR 795 ? ? ? B . B 1 796 SER 796 ? ? ? B . B 1 797 GLU 797 ? ? ? B . B 1 798 ALA 798 ? ? ? B . B 1 799 LEU 799 ? ? ? B . B 1 800 THR 800 ? ? ? B . B 1 801 PHE 801 ? ? ? B . B 1 802 ASP 802 ? ? ? B . B 1 803 SER 803 ? ? ? B . B 1 804 HIS 804 ? ? ? B . B 1 805 LYS 805 ? ? ? B . B 1 806 GLY 806 ? ? ? B . B 1 807 PHE 807 ? ? ? B . B 1 808 TRP 808 ? ? ? B . B 1 809 CYS 809 ? ? ? B . B 1 810 GLN 810 ? ? ? B . B 1 811 LEU 811 ? ? ? B . B 1 812 LEU 812 ? ? ? B . B 1 813 GLU 813 ? ? ? B . B 1 814 GLU 814 ? ? ? B . B 1 815 GLY 815 ? ? ? B . B 1 816 LYS 816 ? ? ? B . B 1 817 THR 817 ? ? ? B . B 1 818 LYS 818 ? ? ? B . B 1 819 CYS 819 ? ? ? B . B 1 820 LEU 820 ? ? ? B . B 1 821 GLY 821 ? ? ? B . B 1 822 LYS 822 ? ? ? B . B 1 823 SER 823 ? ? ? B . B 1 824 LYS 824 ? ? ? B . B 1 825 GLY 825 ? ? ? B . B 1 826 ARG 826 ? ? ? B . B 1 827 LYS 827 ? ? ? B . B 1 828 TYR 828 ? ? ? B . B 1 829 PRO 829 ? ? ? B . B 1 830 PRO 830 ? ? ? B . B 1 831 MET 831 ? ? ? B . B 1 832 ASP 832 ? ? ? B . B 1 833 SER 833 ? ? ? B . B 1 834 ASP 834 ? ? ? B . B 1 835 SER 835 ? ? ? B . B 1 836 ARG 836 ? ? ? B . B 1 837 THR 837 ? ? ? B . B 1 838 PHE 838 ? ? ? B . B 1 839 LEU 839 ? ? ? B . B 1 840 SER 840 ? ? ? B . B 1 841 SER 841 ? ? ? B . B 1 842 TYR 842 ? ? ? B . B 1 843 TYR 843 ? ? ? B . B 1 844 ARG 844 ? ? ? B . B 1 845 ASP 845 ? ? ? B . B 1 846 HIS 846 ? ? ? B . B 1 847 ASN 847 ? ? ? B . B 1 848 VAL 848 ? ? ? B . B 1 849 GLU 849 ? ? ? B . B 1 850 LEU 850 ? ? ? B . B 1 851 SER 851 ? ? ? B . B 1 852 LYS 852 ? ? ? B . B 1 853 LEU 853 ? ? ? B . B 1 854 LEU 854 ? ? ? B . B 1 855 HIS 855 ? ? ? B . B 1 856 LYS 856 ? ? ? B . B 1 857 LEU 857 ? ? ? B . B 1 858 GLY 858 ? ? ? B . B 1 859 GLN 859 ? ? ? B . B 1 860 PRO 860 ? ? ? B . B 1 861 LEU 861 ? ? ? B . B 1 862 PRO 862 ? ? ? B . B 1 863 SER 863 ? ? ? B . B 1 864 TRP 864 ? ? ? B . B 1 865 LEU 865 ? ? ? B . B 1 866 ARG 866 ? ? ? B . B 1 867 GLN 867 ? ? ? B . B 1 868 GLU 868 ? ? ? B . B 1 869 LEU 869 ? ? ? B . B 1 870 GLN 870 ? ? ? B . B 1 871 LYS 871 ? ? ? B . B 1 872 VAL 872 ? ? ? B . B 1 873 ARG 873 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'TRANSCRIPTIONAL COACTIVATOR PC4 {PDB ID=1pcf, label_asym_id=E, auth_asym_id=E, SMTL ID=1pcf.3.A}' 'template structure' . 2 'TRANSCRIPTIONAL COACTIVATOR PC4 {PDB ID=1pcf, label_asym_id=F, auth_asym_id=F, SMTL ID=1pcf.3.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 1pcf, label_asym_id=E' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 1pcf, label_asym_id=F' 'target-template alignment' . 6 'model 2' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-07-09 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-07-04 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A E 1 1 E 2 2 'reference database' polymer 1 2 B F 1 1 F # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 AMFQIGKMRYVSVRDFKGKVLIDIREYWMDPEGEMKPGRKGISLNPEQWSQLKEQISDIDDAVRKL AMFQIGKMRYVSVRDFKGKVLIDIREYWMDPEGEMKPGRKGISLNPEQWSQLKEQISDIDDAVRKL 2 AMFQIGKMRYVSVRDFKGKVLIDIREYWMDPEGEMKPGRKGISLNPEQWSQLKEQISDIDDAVRKL AMFQIGKMRYVSVRDFKGKVLIDIREYWMDPEGEMKPGRKGISLNPEQWSQLKEQISDIDDAVRKL # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 18 64 2 2 18 64 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1pcf 2024-02-14 2 PDB . 1pcf 2024-02-14 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 873 2 2 B 1 873 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 873 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 873 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 35.000 10.638 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 35.000 10.638 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSFIMKLHRHFQRTVILLATFCMVSIIISAYYLYSGYKQENELSETASEVDCGDLQHLPYQLMEVKAMKLFDASRTDPTVLVFVESQYSSLGQDIIMILESSRFQYHIEIAPGKGDLPVLIDKMKGKYILIIYENILKYINMDSWNRSLLDKYCVEYGVGVIGFHKTSEKSVQSFQLKGFPFSIYGNLAVKDCCINPHSPLIRVTKSSKLEKGSLPGTDWTVFQINHSAYQPVIFAKVKTPENLSPSISKGAFYATIIHDLGLHDGIQRVLFGNNLNFWLHKLIFIDAISFLSGKRLTLSLDRYILVDIDDIFVGKEGTRMNTNDVKALLDTQNLLRAQITNFTFNLGFSGKFYHTGTEEEDEGDDCLLGSVDEFWWFPHMWSHMQPHLFHNESSLVEQMILNKKFALEHGIPTDMGYAVAPHHSGVYPVHVQLYEAWKKVWNIKITSTEEYPHLKPARYRRGFIHKNIMVLPRQTCGLFTHTIFYKEYPGGPKELDKSIQGGELFFTVVLNPISIFMTHLSNYGNDRLGLYTFVNLANFVKSWTNLRLQTLPPVQLAHKYFELFPDQKDPLWQNPCDDKRHRDIWSKEKTCDRLPKFLVIGPQKTGTTALYLFLVMHPSILSNSPSPKTFEEVQFFNRNNYHRGIDWYMDFFPVPSNVTTDFLFEKSANYFHSEEAPKRAASLVPKAKIITILIDPSDRAYSWYQHQRSHEDPAALKFSFYEVISAGPRAPSELRALQKRCLVPGWYASHIERWLVYFPPFQLLIIDGQQLRTDPATVMDEVQKFLGVLPHYNYSEALTFDSHKGFWCQLLEEGKTKCLGKSKGRKYPPMDSDSRTFLSSYYRDHNVELSKLLHKLGQPLPSWLRQELQKVR 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GKVLIDIREYWMDPEGEMKPGRKGISLNPEQWSQLKEQISDIDDAVR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MSFIMKLHRHFQRTVILLATFCMVSIIISAYYLYSGYKQENELSETASEVDCGDLQHLPYQLMEVKAMKLFDASRTDPTVLVFVESQYSSLGQDIIMILESSRFQYHIEIAPGKGDLPVLIDKMKGKYILIIYENILKYINMDSWNRSLLDKYCVEYGVGVIGFHKTSEKSVQSFQLKGFPFSIYGNLAVKDCCINPHSPLIRVTKSSKLEKGSLPGTDWTVFQINHSAYQPVIFAKVKTPENLSPSISKGAFYATIIHDLGLHDGIQRVLFGNNLNFWLHKLIFIDAISFLSGKRLTLSLDRYILVDIDDIFVGKEGTRMNTNDVKALLDTQNLLRAQITNFTFNLGFSGKFYHTGTEEEDEGDDCLLGSVDEFWWFPHMWSHMQPHLFHNESSLVEQMILNKKFALEHGIPTDMGYAVAPHHSGVYPVHVQLYEAWKKVWNIKITSTEEYPHLKPARYRRGFIHKNIMVLPRQTCGLFTHTIFYKEYPGGPKELDKSIQGGELFFTVVLNPISIFMTHLSNYGNDRLGLYTFVNLANFVKSWTNLRLQTLPPVQLAHKYFELFPDQKDPLWQNPCDDKRHRDIWSKEKTCDRLPKFLVIGPQKTGTTALYLFLVMHPSILSNSPSPKTFEEVQFFNRNNYHRGIDWYMDFFPVPSNVTTDFLFEKSANYFHSEEAPKRAASLVPKAKIITILIDPSDRAYSWYQHQRSHEDPAALKFSFYEVISAGPRAPSELRALQKRCLVPGWYASHIERWLVYFPPFQLLIIDGQQLRTDPATVMDEVQKFLGVLPHYNYSEALTFDSHKGFWCQLLEEGKTKCLGKSKGRKYPPMDSDSRTFLSSYYRDHNVELSKLLHKLGQPLPSWLRQELQKVR 4 2 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GKVLIDIREYWMDPEGEMKPGRKGISLNPEQWSQLKEQISDIDDAVR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.025}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1pcf.3, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 2' 6 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 74.224 11.356 88.227 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 16 C CD . ARG 296 296 ? A 73.125 10.417 88.715 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 17 N NE . ARG 296 296 ? A 73.409 9.057 88.160 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 18 C CZ . ARG 296 296 ? A 72.613 8.001 88.372 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 19 N NH1 . ARG 296 296 ? A 71.511 8.112 89.109 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 20 N NH2 . ARG 296 296 ? A 72.909 6.818 87.842 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 21 N N . LEU 297 297 ? A 73.987 15.950 87.815 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 22 C CA . LEU 297 297 ? A 73.469 17.261 88.107 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 23 C C . LEU 297 297 ? A 72.069 17.160 88.641 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 24 O O . LEU 297 297 ? A 71.218 16.444 88.120 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 25 C CB . LEU 297 297 ? A 73.412 18.141 86.846 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 26 C CG . LEU 297 297 ? A 74.773 18.342 86.158 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 27 C CD1 . LEU 297 297 ? A 74.557 19.146 84.872 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 28 C CD2 . LEU 297 297 ? A 75.786 19.060 87.067 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 29 N N . THR 298 298 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.575 2 1 3 0.011 3 1 4 0.025 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 295 LYS 1 0.460 2 1 A 296 ARG 1 0.540 3 1 A 297 LEU 1 0.600 4 1 A 298 THR 1 0.590 5 1 A 299 LEU 1 0.540 6 1 A 300 SER 1 0.550 7 1 A 301 LEU 1 0.540 8 1 A 302 ASP 1 0.580 9 1 A 303 ARG 1 0.480 10 1 A 304 TYR 1 0.580 11 1 A 305 ILE 1 0.650 12 1 A 306 LEU 1 0.590 13 1 A 307 VAL 1 0.420 14 1 A 308 ASP 1 0.470 15 1 A 309 ILE 1 0.410 16 1 A 310 ASP 1 0.330 17 1 A 311 ASP 1 0.350 18 1 A 312 ILE 1 0.440 19 1 A 313 PHE 1 0.570 20 1 A 314 VAL 1 0.550 21 1 A 315 GLY 1 0.550 22 1 A 316 LYS 1 0.500 23 1 A 317 GLU 1 0.490 24 1 A 318 GLY 1 0.600 25 1 A 319 THR 1 0.570 26 1 A 320 ARG 1 0.550 27 1 A 321 MET 1 0.630 28 1 A 322 ASN 1 0.690 29 1 A 323 THR 1 0.750 30 1 A 324 ASN 1 0.760 31 1 A 325 ASP 1 0.730 32 1 A 326 VAL 1 0.680 33 1 A 327 LYS 1 0.700 34 1 A 328 ALA 1 0.810 35 1 A 329 LEU 1 0.680 36 1 A 330 LEU 1 0.680 37 1 A 331 ASP 1 0.590 38 1 A 332 THR 1 0.690 39 1 A 333 GLN 1 0.610 40 1 A 334 ASN 1 0.510 41 1 A 335 LEU 1 0.600 42 1 A 336 LEU 1 0.670 43 1 A 337 ARG 1 0.570 44 1 A 338 ALA 1 0.630 45 1 A 339 GLN 1 0.580 46 1 A 340 ILE 1 0.600 47 1 A 341 THR 1 0.460 48 1 B 295 LYS 1 0.500 49 1 B 296 ARG 1 0.510 50 1 B 297 LEU 1 0.600 51 1 B 298 THR 1 0.570 52 1 B 299 LEU 1 0.530 53 1 B 300 SER 1 0.550 54 1 B 301 LEU 1 0.540 55 1 B 302 ASP 1 0.570 56 1 B 303 ARG 1 0.480 57 1 B 304 TYR 1 0.580 58 1 B 305 ILE 1 0.630 59 1 B 306 LEU 1 0.570 60 1 B 307 VAL 1 0.440 61 1 B 308 ASP 1 0.470 62 1 B 309 ILE 1 0.420 63 1 B 310 ASP 1 0.340 64 1 B 311 ASP 1 0.370 65 1 B 312 ILE 1 0.440 66 1 B 313 PHE 1 0.560 67 1 B 314 VAL 1 0.530 68 1 B 315 GLY 1 0.560 69 1 B 316 LYS 1 0.500 70 1 B 317 GLU 1 0.480 71 1 B 318 GLY 1 0.580 72 1 B 319 THR 1 0.580 73 1 B 320 ARG 1 0.540 74 1 B 321 MET 1 0.630 75 1 B 322 ASN 1 0.680 76 1 B 323 THR 1 0.740 77 1 B 324 ASN 1 0.760 78 1 B 325 ASP 1 0.710 79 1 B 326 VAL 1 0.680 80 1 B 327 LYS 1 0.690 81 1 B 328 ALA 1 0.800 82 1 B 329 LEU 1 0.680 83 1 B 330 LEU 1 0.680 84 1 B 331 ASP 1 0.590 85 1 B 332 THR 1 0.700 86 1 B 333 GLN 1 0.600 87 1 B 334 ASN 1 0.510 88 1 B 335 LEU 1 0.610 89 1 B 336 LEU 1 0.660 90 1 B 337 ARG 1 0.570 91 1 B 338 ALA 1 0.620 92 1 B 339 GLN 1 0.560 93 1 B 340 ILE 1 0.600 94 1 B 341 THR 1 0.460 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #