data_SMR-98992b9b92fb0b8ff37800ef1aaa9eed_8
_entry.id SMR-98992b9b92fb0b8ff37800ef1aaa9eed_8
_struct.entry_id SMR-98992b9b92fb0b8ff37800ef1aaa9eed_8
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q86UK5 (isoform 2)/ LBN_HUMAN, Limbin

Estimated model accuracy of this model is 0.006, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q86UK5 (isoform 2)'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
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_citation.title
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_citation.page_last
_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.4
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 163778.470 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP LBN_HUMAN Q86UK5 1
;MDPSGSRGRPTWVLAGGLLAVALALGGRGCLGASSRPRWRPLGAQPPRDPQVAPRSGPGLRIPPGRSGAG
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WWQALDGKLRGDLISRGLEKMLWARKRKQRSGNQESFWQYLVGTPEIGLIEWMSEK
;
Limbin
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1246 1 1246
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
_ma_target_ref_db_details.is_primary
1 UNP . LBN_HUMAN Q86UK5 Q86UK5-2 1 1246 9606 'Homo sapiens (Human)' 2003-06-01
02C628E8B2E15ED4 .
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no M
;MDPSGSRGRPTWVLAGGLLAVALALGGRGCLGASSRPRWRPLGAQPPRDPQVAPRSGPGLRIPPGRSGAG
PESSTQDLPCMIWPKVECCHFKTAVEAPLGMKLDKKMEVFIPLSTSAASSGPWAHSLFAFIPSWPKKNLF
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;

;MDPSGSRGRPTWVLAGGLLAVALALGGRGCLGASSRPRWRPLGAQPPRDPQVAPRSGPGLRIPPGRSGAG
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;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
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_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 ASP .
1 3 PRO .
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1 6 SER .
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1 38 ARG .
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1 47 PRO .
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1 137 LYS .
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1 142 ARG .
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1 156 ARG .
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1 1014 LEU .
1 1015 GLU .
1 1016 SER .
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1 1020 GLU .
1 1021 LEU .
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1 1153 PRO .
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1 1171 ALA .
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1 1197 GLY .
1 1198 LYS .
1 1199 LEU .
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1 1201 GLY .
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1 1207 GLY .
1 1208 LEU .
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1 1210 LYS .
1 1211 MET .
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1 1215 ARG .
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1 1230 TYR .
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#
#
loop_
_struct_asym.id
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.details
A 1 .
#
#
loop_
_pdbx_poly_seq_scheme.asym_id
_pdbx_poly_seq_scheme.entity_id
_pdbx_poly_seq_scheme.seq_id
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_pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code
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A 1 273 ASN 273 ? ? ? M .
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A 1 279 VAL 279 ? ? ? M .
A 1 280 LEU 280 ? ? ? M .
A 1 281 PHE 281 ? ? ? M .
A 1 282 SER 282 ? ? ? M .
A 1 283 ILE 283 ? ? ? M .
A 1 284 THR 284 ? ? ? M .
A 1 285 ALA 285 ? ? ? M .
A 1 286 GLU 286 ? ? ? M .
A 1 287 GLU 287 ? ? ? M .
A 1 288 ASN 288 ? ? ? M .
A 1 289 VAL 289 ? ? ? M .
A 1 290 THR 290 ? ? ? M .
A 1 291 VAL 291 ? ? ? M .
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A 1 295 HIS 295 ? ? ? M .
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A 1 697 PHE 697 ? ? ? M .
A 1 698 ARG 698 ? ? ? M .
A 1 699 THR 699 ? ? ? M .
A 1 700 VAL 700 ? ? ? M .
A 1 701 GLU 701 ? ? ? M .
A 1 702 ASP 702 ? ? ? M .
A 1 703 ALA 703 ? ? ? M .
A 1 704 GLY 704 ? ? ? M .
A 1 705 GLN 705 ? ? ? M .
A 1 706 TYR 706 ? ? ? M .
A 1 707 LEU 707 ? ? ? M .
A 1 708 HIS 708 ? ? ? M .
A 1 709 GLN 709 ? ? ? M .
A 1 710 LYS 710 ? ? ? M .
A 1 711 ARG 711 ? ? ? M .
A 1 712 SER 712 ? ? ? M .
A 1 713 LEU 713 ? ? ? M .
A 1 714 MET 714 ? ? ? M .
A 1 715 GLU 715 ? ? ? M .
A 1 716 GLU 716 ? ? ? M .
A 1 717 HIS 717 ? ? ? M .
A 1 718 GLY 718 ? ? ? M .
A 1 719 ALA 719 ? ? ? M .
A 1 720 THR 720 ? ? ? M .
A 1 721 LEU 721 ? ? ? M .
A 1 722 GLU 722 ? ? ? M .
A 1 723 GLU 723 ? ? ? M .
A 1 724 LEU 724 ? ? ? M .
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A 1 730 GLN 730 ? ? ? M .
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A 1 735 ASP 735 ? ? ? M .
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A 1 750 GLU 750 ? ? ? M .
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A 1 753 ARG 753 ? ? ? M .
A 1 754 LEU 754 ? ? ? M .
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A 1 762 GLU 762 ? ? ? M .
A 1 763 LEU 763 ? ? ? M .
A 1 764 LEU 764 ? ? ? M .
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A 1 767 GLY 767 ? ? ? M .
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A 1 773 LEU 773 ? ? ? M .
A 1 774 GLN 774 ? ? ? M .
A 1 775 GLN 775 ? ? ? M .
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A 1 777 LEU 777 ? ? ? M .
A 1 778 GLU 778 ? ? ? M .
A 1 779 GLU 779 ? ? ? M .
A 1 780 HIS 780 ? ? ? M .
A 1 781 GLY 781 ? ? ? M .
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A 1 793 GLY 793 ? ? ? M .
A 1 794 GLU 794 ? ? ? M .
A 1 795 GLU 795 ? ? ? M .
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A 1 798 ARG 798 ? ? ? M .
A 1 799 ASP 799 ? ? ? M .
A 1 800 GLN 800 ? ? ? M .
A 1 801 GLU 801 ? ? ? M .
A 1 802 GLY 802 ? ? ? M .
A 1 803 VAL 803 ? ? ? M .
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A 1 805 SER 805 ? ? ? M .
A 1 806 VAL 806 ? ? ? M .
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A 1 808 GLN 808 ? ? ? M .
A 1 809 ARG 809 ? ? ? M .
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A 1 832 ILE 832 ? ? ? M .
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A 1 835 LYS 835 ? ? ? M .
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A 1 840 VAL 840 ? ? ? M .
A 1 841 PHE 841 841 PHE PHE M .
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A 1 846 GLU 846 846 GLU GLU M .
A 1 847 GLU 847 847 GLU GLU M .
A 1 848 LEU 848 848 LEU LEU M .
A 1 849 LEU 849 849 LEU LEU M .
A 1 850 ARG 850 850 ARG ARG M .
A 1 851 MET 851 851 MET MET M .
A 1 852 ARG 852 852 ARG ARG M .
A 1 853 GLN 853 853 GLN GLN M .
A 1 854 GLU 854 854 GLU GLU M .
A 1 855 VAL 855 855 VAL VAL M .
A 1 856 HIS 856 856 HIS HIS M .
A 1 857 GLY 857 857 GLY GLY M .
A 1 858 CYS 858 858 CYS CYS M .
A 1 859 PHE 859 859 PHE PHE M .
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A 1 861 GLN 861 861 GLN GLN M .
A 1 862 MET 862 862 MET MET M .
A 1 863 ASP 863 863 ASP ASP M .
A 1 864 ARG 864 864 ARG ARG M .
A 1 865 SER 865 865 SER SER M .
A 1 866 LEU 866 866 LEU LEU M .
A 1 867 ALA 867 867 ALA ALA M .
A 1 868 LEU 868 868 LEU LEU M .
A 1 869 PRO 869 869 PRO PRO M .
A 1 870 LYS 870 870 LYS LYS M .
A 1 871 ILE 871 871 ILE ILE M .
A 1 872 ARG 872 872 ARG ARG M .
A 1 873 ALA 873 873 ALA ALA M .
A 1 874 ARG 874 874 ARG ARG M .
A 1 875 VAL 875 875 VAL VAL M .
A 1 876 LEU 876 876 LEU LEU M .
A 1 877 LEU 877 877 LEU LEU M .
A 1 878 GLN 878 878 GLN GLN M .
A 1 879 GLN 879 879 GLN GLN M .
A 1 880 PHE 880 880 PHE PHE M .
A 1 881 GLN 881 881 GLN GLN M .
A 1 882 THR 882 ? ? ? M .
A 1 883 ALA 883 ? ? ? M .
A 1 884 TRP 884 ? ? ? M .
A 1 885 ARG 885 ? ? ? M .
A 1 886 GLU 886 ? ? ? M .
A 1 887 ALA 887 ? ? ? M .
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A 1 890 VAL 890 ? ? ? M .
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A 1 896 VAL 896 ? ? ? M .
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A 1 900 GLU 900 ? ? ? M .
A 1 901 LEU 901 ? ? ? M .
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A 1 903 GLN 903 ? ? ? M .
A 1 904 GLN 904 ? ? ? M .
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A 1 906 LYS 906 ? ? ? M .
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A 1 910 SER 910 ? ? ? M .
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A 1 923 LYS 923 ? ? ? M .
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A 1 931 LEU 931 ? ? ? M .
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A 1 933 GLU 933 ? ? ? M .
A 1 934 GLU 934 ? ? ? M .
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A 1 944 VAL 944 ? ? ? M .
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A 1 946 GLY 946 ? ? ? M .
A 1 947 GLU 947 ? ? ? M .
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A 1 949 LEU 949 ? ? ? M .
A 1 950 ARG 950 ? ? ? M .
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A 1 953 VAL 953 ? ? ? M .
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A 1 1027 LYS 1027 ? ? ? M .
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A 1 1039 GLN 1039 ? ? ? M .
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A 1 1041 GLN 1041 ? ? ? M .
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A 1 1066 SER 1066 ? ? ? M .
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A 1 1093 ARG 1093 ? ? ? M .
A 1 1094 GLU 1094 ? ? ? M .
A 1 1095 GLU 1095 ? ? ? M .
A 1 1096 GLN 1096 ? ? ? M .
A 1 1097 GLN 1097 ? ? ? M .
A 1 1098 ASN 1098 ? ? ? M .
A 1 1099 SER 1099 ? ? ? M .
A 1 1100 VAL 1100 ? ? ? M .
A 1 1101 VAL 1101 ? ? ? M .
A 1 1102 LEU 1102 ? ? ? M .
A 1 1103 GLU 1103 ? ? ? M .
A 1 1104 ASP 1104 ? ? ? M .
A 1 1105 LEU 1105 ? ? ? M .
A 1 1106 LEU 1106 ? ? ? M .
A 1 1107 GLU 1107 ? ? ? M .
A 1 1108 ASN 1108 ? ? ? M .
A 1 1109 MET 1109 ? ? ? M .
A 1 1110 GLU 1110 ? ? ? M .
A 1 1111 ALA 1111 ? ? ? M .
A 1 1112 ASP 1112 ? ? ? M .
A 1 1113 THR 1113 ? ? ? M .
A 1 1114 PHE 1114 ? ? ? M .
A 1 1115 ALA 1115 ? ? ? M .
A 1 1116 THR 1116 ? ? ? M .
A 1 1117 LEU 1117 ? ? ? M .
A 1 1118 CYS 1118 ? ? ? M .
A 1 1119 SER 1119 ? ? ? M .
A 1 1120 GLN 1120 ? ? ? M .
A 1 1121 GLU 1121 ? ? ? M .
A 1 1122 LEU 1122 ? ? ? M .
A 1 1123 ARG 1123 ? ? ? M .
A 1 1124 LEU 1124 ? ? ? M .
A 1 1125 ALA 1125 ? ? ? M .
A 1 1126 SER 1126 ? ? ? M .
A 1 1127 TYR 1127 ? ? ? M .
A 1 1128 LEU 1128 ? ? ? M .
A 1 1129 ALA 1129 ? ? ? M .
A 1 1130 ARG 1130 ? ? ? M .
A 1 1131 MET 1131 ? ? ? M .
A 1 1132 ALA 1132 ? ? ? M .
A 1 1133 MET 1133 ? ? ? M .
A 1 1134 VAL 1134 ? ? ? M .
A 1 1135 PRO 1135 ? ? ? M .
A 1 1136 GLY 1136 ? ? ? M .
A 1 1137 ALA 1137 ? ? ? M .
A 1 1138 THR 1138 ? ? ? M .
A 1 1139 LEU 1139 ? ? ? M .
A 1 1140 ARG 1140 ? ? ? M .
A 1 1141 ARG 1141 ? ? ? M .
A 1 1142 LEU 1142 ? ? ? M .
A 1 1143 LEU 1143 ? ? ? M .
A 1 1144 SER 1144 ? ? ? M .
A 1 1145 VAL 1145 ? ? ? M .
A 1 1146 VAL 1146 ? ? ? M .
A 1 1147 LEU 1147 ? ? ? M .
A 1 1148 PRO 1148 ? ? ? M .
A 1 1149 THR 1149 ? ? ? M .
A 1 1150 ALA 1150 ? ? ? M .
A 1 1151 SER 1151 ? ? ? M .
A 1 1152 GLN 1152 ? ? ? M .
A 1 1153 PRO 1153 ? ? ? M .
A 1 1154 GLN 1154 ? ? ? M .
A 1 1155 LEU 1155 ? ? ? M .
A 1 1156 LEU 1156 ? ? ? M .
A 1 1157 ALA 1157 ? ? ? M .
A 1 1158 LEU 1158 ? ? ? M .
A 1 1159 LEU 1159 ? ? ? M .
A 1 1160 ASP 1160 ? ? ? M .
A 1 1161 SER 1161 ? ? ? M .
A 1 1162 ALA 1162 ? ? ? M .
A 1 1163 THR 1163 ? ? ? M .
A 1 1164 GLU 1164 ? ? ? M .
A 1 1165 ARG 1165 ? ? ? M .
A 1 1166 HIS 1166 ? ? ? M .
A 1 1167 VAL 1167 ? ? ? M .
A 1 1168 ASP 1168 ? ? ? M .
A 1 1169 HIS 1169 ? ? ? M .
A 1 1170 ALA 1170 ? ? ? M .
A 1 1171 ALA 1171 ? ? ? M .
A 1 1172 GLU 1172 ? ? ? M .
A 1 1173 SER 1173 ? ? ? M .
A 1 1174 ASP 1174 ? ? ? M .
A 1 1175 GLY 1175 ? ? ? M .
A 1 1176 GLY 1176 ? ? ? M .
A 1 1177 ALA 1177 ? ? ? M .
A 1 1178 GLU 1178 ? ? ? M .
A 1 1179 GLN 1179 ? ? ? M .
A 1 1180 ALA 1180 ? ? ? M .
A 1 1181 ASP 1181 ? ? ? M .
A 1 1182 VAL 1182 ? ? ? M .
A 1 1183 GLY 1183 ? ? ? M .
A 1 1184 ARG 1184 ? ? ? M .
A 1 1185 ARG 1185 ? ? ? M .
A 1 1186 ARG 1186 ? ? ? M .
A 1 1187 LYS 1187 ? ? ? M .
A 1 1188 HIS 1188 ? ? ? M .
A 1 1189 GLN 1189 ? ? ? M .
A 1 1190 SER 1190 ? ? ? M .
A 1 1191 TRP 1191 ? ? ? M .
A 1 1192 TRP 1192 ? ? ? M .
A 1 1193 GLN 1193 ? ? ? M .
A 1 1194 ALA 1194 ? ? ? M .
A 1 1195 LEU 1195 ? ? ? M .
A 1 1196 ASP 1196 ? ? ? M .
A 1 1197 GLY 1197 ? ? ? M .
A 1 1198 LYS 1198 ? ? ? M .
A 1 1199 LEU 1199 ? ? ? M .
A 1 1200 ARG 1200 ? ? ? M .
A 1 1201 GLY 1201 ? ? ? M .
A 1 1202 ASP 1202 ? ? ? M .
A 1 1203 LEU 1203 ? ? ? M .
A 1 1204 ILE 1204 ? ? ? M .
A 1 1205 SER 1205 ? ? ? M .
A 1 1206 ARG 1206 ? ? ? M .
A 1 1207 GLY 1207 ? ? ? M .
A 1 1208 LEU 1208 ? ? ? M .
A 1 1209 GLU 1209 ? ? ? M .
A 1 1210 LYS 1210 ? ? ? M .
A 1 1211 MET 1211 ? ? ? M .
A 1 1212 LEU 1212 ? ? ? M .
A 1 1213 TRP 1213 ? ? ? M .
A 1 1214 ALA 1214 ? ? ? M .
A 1 1215 ARG 1215 ? ? ? M .
A 1 1216 LYS 1216 ? ? ? M .
A 1 1217 ARG 1217 ? ? ? M .
A 1 1218 LYS 1218 ? ? ? M .
A 1 1219 GLN 1219 ? ? ? M .
A 1 1220 ARG 1220 ? ? ? M .
A 1 1221 SER 1221 ? ? ? M .
A 1 1222 GLY 1222 ? ? ? M .
A 1 1223 ASN 1223 ? ? ? M .
A 1 1224 GLN 1224 ? ? ? M .
A 1 1225 GLU 1225 ? ? ? M .
A 1 1226 SER 1226 ? ? ? M .
A 1 1227 PHE 1227 ? ? ? M .
A 1 1228 TRP 1228 ? ? ? M .
A 1 1229 GLN 1229 ? ? ? M .
A 1 1230 TYR 1230 ? ? ? M .
A 1 1231 LEU 1231 ? ? ? M .
A 1 1232 VAL 1232 ? ? ? M .
A 1 1233 GLY 1233 ? ? ? M .
A 1 1234 THR 1234 ? ? ? M .
A 1 1235 PRO 1235 ? ? ? M .
A 1 1236 GLU 1236 ? ? ? M .
A 1 1237 ILE 1237 ? ? ? M .
A 1 1238 GLY 1238 ? ? ? M .
A 1 1239 LEU 1239 ? ? ? M .
A 1 1240 ILE 1240 ? ? ? M .
A 1 1241 GLU 1241 ? ? ? M .
A 1 1242 TRP 1242 ? ? ? M .
A 1 1243 MET 1243 ? ? ? M .
A 1 1244 SER 1244 ? ? ? M .
A 1 1245 GLU 1245 ? ? ? M .
A 1 1246 LYS 1246 ? ? ? M .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP58 {PDB ID=5ijn, label_asym_id=M, auth_asym_id=M, SMTL ID=5ijn.1.M}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 5ijn, label_asym_id=M'
'target-template alignment' .
4 'model 8' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-07-09
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-07-04
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A M 5 1 M
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;MSTGFSFGSGTLGSTTVAAGGTSTGGVFSFGTGASSNPSVGLNFGNLGSTSTPATTSAPSSGFGTGLFGS
KPATGFTLGGTNTGIATTITTGLTLGTPATTSAATTGFSLGFNKPAASATPFALPITSTSASGLTLSSAL
TSTPAASTGFTLNNLGGTTATTTTASTGLSLGGALAGLGGSLFQSTNTGTSGLGQNALGLTLGTTAATST
AGNEGLGGIDFSSSSDKKSDKTGTRPEDSKALKDENLPPVICQDVENLQKFVKEQKQVQEEISRMSSKAM
LKVQEDIKALKQLLSLAANGIQRNTLNIDKLKIETAQELKNAEIALRTQKTPPGLQHEYAAPADYFRILV
QQFEVQLQQYRQQIEELENHLATQANNSHITPQDLSMAMQKIYQTFVALAAQLQSIHENVKVLKEQYLGY
RKMFLGDAVDVFETRRAEAKKWQNTPRVTTGPTPFSTMPNAAAVAMAATLTQQQQPATGPQPSLGVSFGT
PFGSGIGTGLQSSGLGSSNLGGFGTSSGFGCSTTGASTFGFGTTNKPSGSLSAGFGSSSTSGFNFSNPGI
TASAGLTFGVSNPASAGFGTGGQLLQLKKPPAGNKRGKR
;

;MSTGFSFGSGTLGSTTVAAGGTSTGGVFSFGTGASSNPSVGLNFGNLGSTSTPATTSAPSSGFGTGLFGS
KPATGFTLGGTNTGIATTITTGLTLGTPATTSAATTGFSLGFNKPAASATPFALPITSTSASGLTLSSAL
TSTPAASTGFTLNNLGGTTATTTTASTGLSLGGALAGLGGSLFQSTNTGTSGLGQNALGLTLGTTAATST
AGNEGLGGIDFSSSSDKKSDKTGTRPEDSKALKDENLPPVICQDVENLQKFVKEQKQVQEEISRMSSKAM
LKVQEDIKALKQLLSLAANGIQRNTLNIDKLKIETAQELKNAEIALRTQKTPPGLQHEYAAPADYFRILV
QQFEVQLQQYRQQIEELENHLATQANNSHITPQDLSMAMQKIYQTFVALAAQLQSIHENVKVLKEQYLGY
RKMFLGDAVDVFETRRAEAKKWQNTPRVTTGPTPFSTMPNAAAVAMAATLTQQQQPATGPQPSLGVSFGT
PFGSGIGTGLQSSGLGSSNLGGFGTSSGFGCSTTGASTFGFGTTNKPSGSLSAGFGSSSTSGFNFSNPGI
TASAGLTFGVSNPASAGFGTGGQLLQLKKPPAGNKRGKR
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 378 424
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 5ijn 2024-05-08
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1246
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1246 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 13.000 14.894
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MDPSGSRGRPTWVLAGGLLAVALALGGRGCLGASSRPRWRPLGAQPPRDPQVAPRSGPGLRIPPGRSGAGPESSTQDLPCMIWPKVECCHFKTAVEAPLGMKLDKKMEVFIPLSTSAASSGPWAHSLFAFIPSWPKKNLFKRESPITHRLYGDISREVQGTSENGVIFQKCALVSGSSEAQTARIWLLVNNTKTTSSANLSELLLLDSIAGLTIWDSVGNRTSEGFQAFSKKFLQVGDAFAVSYAATLQAGDLGNGESLKLPAQLTFQSSSRNRTQLKVLFSITAEENVTVLPHHGLHAAGFFIAFLLSLVLTWAALFLMVRYQCLKGNMLTRHRVWQYESKLEPLPFTSADGVNEDLSLNDQMIDILSSEDPGSMLQALEELEIATLNRADADLEACRTQISKDIIALLLKNLTSSGHLSPQVERKMSAVFKKQFLLLENEIQEEYDRKMVALTAECDLETRKKMENQYQREMMAMEEAEELLKRAGERSAVECSNLLRTLHGLEQEHLRKSLALQQEEDFAKAHRQLAVFQRNELHSIFFTQIKSAIFKGELKPEAAKMLLQNYSKIQENVEELMDFFQASKRYHLSKRFGHREYLVQNLQSSETRVQGLLSTAAAQLTHLIQKHERAGYLDEDQMEMLLERAQTEVFSIKQKLDNDLKQEKKKLHQKLITKRRRELLQKHREQRREQASVGEAFRTVEDAGQYLHQKRSLMEEHGATLEELQERLDQAALDDLRTLTLSLFEKATDELRRLQNSAMTQELLKRGVPWLFLQQILEEHGKEMAARAEQLEGEERDRDQEGVQSVRQRLKDDAPEAVTEEQAELRRWEHLIFMKLCSSVFSLSEEELLRMRQEVHGCFAQMDRSLALPKIRARVLLQQFQTAWREAEFVKLDQAVAAPELQQQSKVRKSRSKSKSKGELLKKCIEDKIHLCEEQASEDLVEKVRGELLRERVQRMEAQEGGFAQSLVALQFQKASRVTETLSAYTALLSIQDLLLEELSASEMLTKSACTQILESHSRELQELERKLEDQLVQQEAAQQQQALASWQQWVADGPGILNEPGEVDSERQVSTVLHQALSKSQTLLEQHQQCLREEQQNSVVLEDLLENMEADTFATLCSQELRLASYLARMAMVPGATLRRLLSVVLPTASQPQLLALLDSATERHVDHAAESDGGAEQADVGRRRKHQSWWQALDGKLRGDLISRGLEKMLWARKRKQRSGNQESFWQYLVGTPEIGLIEWMSEK
2 1 2
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SHITPQDLSMAMQKIYQTFVALAAQLQSIHENVKVLKEQYLGYRKMF-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5ijn.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 'model 8' 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_ma_model_group.id
_ma_model_group.name
_ma_model_group.details
1 . .
#
#
loop_
_ma_model_group_link.group_id
_ma_model_group_link.model_id
1 1
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . PHE 841 841 ? A 992.030 733.946 772.895 1 1 M PHE 0.140 1
ATOM 2 C CA . PHE 841 841 ? A 991.893 734.840 774.115 1 1 M PHE 0.140 1
ATOM 3 C C . PHE 841 841 ? A 992.252 736.391 773.764 1 1 M PHE 0.140 1
ATOM 4 O O . PHE 841 841 ? A 993.402 736.710 773.965 1 1 M PHE 0.140 1
ATOM 5 C CB . PHE 841 841 ? A 992.885 734.260 775.231 1 1 M PHE 0.140 1
ATOM 6 C CG . PHE 841 841 ? A 992.675 732.833 775.724 1 1 M PHE 0.140 1
ATOM 7 C CD1 . PHE 841 841 ? A 991.796 732.583 776.794 1 1 M PHE 0.140 1
ATOM 8 C CD2 . PHE 841 841 ? A 993.465 731.767 775.242 1 1 M PHE 0.140 1
ATOM 9 C CE1 . PHE 841 841 ? A 991.726 731.316 777.390 1 1 M PHE 0.140 1
ATOM 10 C CE2 . PHE 841 841 ? A 993.394 730.495 775.831 1 1 M PHE 0.140 1
ATOM 11 C CZ . PHE 841 841 ? A 992.536 730.275 776.917 1 1 M PHE 0.140 1
ATOM 12 N N . SER 842 842 ? A 991.333 737.354 773.222 1 1 M SER 0.280 1
ATOM 13 C CA . SER 842 842 ? A 991.518 738.907 772.901 1 1 M SER 0.280 1
ATOM 14 C C . SER 842 842 ? A 990.356 739.857 772.077 1 1 M SER 0.280 1
ATOM 15 O O . SER 842 842 ? A 989.343 739.255 771.782 1 1 M SER 0.280 1
ATOM 16 C CB . SER 842 842 ? A 992.884 739.273 772.249 1 1 M SER 0.280 1
ATOM 17 O OG . SER 842 842 ? A 993.058 738.544 771.039 1 1 M SER 0.280 1
ATOM 18 N N . LEU 843 843 ? A 990.416 741.301 771.723 1 1 M LEU 0.270 1
ATOM 19 C CA . LEU 843 843 ? A 989.435 742.451 771.224 1 1 M LEU 0.270 1
ATOM 20 C C . LEU 843 843 ? A 988.922 742.566 769.712 1 1 M LEU 0.270 1
ATOM 21 O O . LEU 843 843 ? A 989.612 742.056 768.848 1 1 M LEU 0.270 1
ATOM 22 C CB . LEU 843 843 ? A 990.085 743.920 771.307 1 1 M LEU 0.270 1
ATOM 23 C CG . LEU 843 843 ? A 990.209 744.669 772.660 1 1 M LEU 0.270 1
ATOM 24 C CD1 . LEU 843 843 ? A 991.036 745.926 772.347 1 1 M LEU 0.270 1
ATOM 25 C CD2 . LEU 843 843 ? A 988.900 745.170 773.298 1 1 M LEU 0.270 1
ATOM 26 N N . SER 844 844 ? A 987.812 743.369 769.341 1 1 M SER 0.440 1
ATOM 27 C CA . SER 844 844 ? A 987.488 743.841 767.942 1 1 M SER 0.440 1
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ATOM 30 C CB . SER 844 844 ? A 987.513 742.698 766.870 1 1 M SER 0.440 1
ATOM 31 O OG . SER 844 844 ? A 987.469 743.148 765.519 1 1 M SER 0.440 1
ATOM 32 N N . GLU 845 845 ? A 986.049 745.672 766.919 1 1 M GLU 0.530 1
ATOM 33 C CA . GLU 845 845 ? A 984.832 746.045 766.136 1 1 M GLU 0.530 1
ATOM 34 C C . GLU 845 845 ? A 985.053 746.069 764.601 1 1 M GLU 0.530 1
ATOM 35 O O . GLU 845 845 ? A 984.204 745.588 763.846 1 1 M GLU 0.530 1
ATOM 36 C CB . GLU 845 845 ? A 984.153 747.442 766.425 1 1 M GLU 0.530 1
ATOM 37 C CG . GLU 845 845 ? A 983.167 747.578 767.626 1 1 M GLU 0.530 1
ATOM 38 C CD . GLU 845 845 ? A 982.691 749.027 767.844 1 1 M GLU 0.530 1
ATOM 39 O OE1 . GLU 845 845 ? A 983.048 749.912 767.026 1 1 M GLU 0.530 1
ATOM 40 O OE2 . GLU 845 845 ? A 981.951 749.245 768.838 1 1 M GLU 0.530 1
ATOM 41 N N . GLU 846 846 ? A 986.197 746.589 764.063 1 1 M GLU 0.590 1
ATOM 42 C CA . GLU 846 846 ? A 986.510 746.789 762.635 1 1 M GLU 0.590 1
ATOM 43 C C . GLU 846 846 ? A 986.353 745.530 761.812 1 1 M GLU 0.590 1
ATOM 44 O O . GLU 846 846 ? A 986.022 745.551 760.628 1 1 M GLU 0.590 1
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ATOM 47 C CD . GLU 846 846 ? A 989.985 748.614 763.123 1 1 M GLU 0.590 1
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ATOM 49 O OE2 . GLU 846 846 ? A 990.474 749.727 763.419 1 1 M GLU 0.590 1
ATOM 50 N N . GLU 847 847 ? A 986.599 744.373 762.439 1 1 M GLU 0.620 1
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ATOM 53 O O . GLU 847 847 ? A 985.070 742.091 760.209 1 1 M GLU 0.620 1
ATOM 54 C CB . GLU 847 847 ? A 986.938 742.011 762.779 1 1 M GLU 0.620 1
ATOM 55 C CG . GLU 847 847 ? A 987.066 740.587 762.208 1 1 M GLU 0.620 1
ATOM 56 C CD . GLU 847 847 ? A 987.488 739.640 763.319 1 1 M GLU 0.620 1
ATOM 57 O OE1 . GLU 847 847 ? A 987.703 740.149 764.454 1 1 M GLU 0.620 1
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ATOM 59 N N . LEU 848 848 ? A 984.062 743.242 761.849 1 1 M LEU 0.660 1
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ATOM 73 C CD1 . LEU 849 849 ? A 983.695 749.269 759.319 1 1 M LEU 0.650 1
ATOM 74 C CD2 . LEU 849 849 ? A 981.593 748.018 758.686 1 1 M LEU 0.650 1
ATOM 75 N N . ARG 850 850 ? A 985.456 744.233 757.901 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 76 C CA . ARG 850 850 ? A 986.372 743.422 757.109 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 77 C C . ARG 850 850 ? A 985.730 742.133 756.620 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 78 O O . ARG 850 850 ? A 985.743 741.856 755.435 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 79 C CB . ARG 850 850 ? A 987.656 743.048 757.899 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 80 C CG . ARG 850 850 ? A 988.553 744.254 758.243 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 81 C CD . ARG 850 850 ? A 989.945 743.885 758.791 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 82 N NE . ARG 850 850 ? A 989.848 743.584 760.262 1 1 M ARG 0.630 1
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ATOM 84 N NH1 . ARG 850 850 ? A 990.551 745.704 760.962 1 1 M ARG 0.630 1
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ATOM 97 O O . ARG 852 852 ? A 981.101 741.718 753.150 1 1 M ARG 0.620 1
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ATOM 100 C CD . ARG 852 852 ? A 978.513 743.413 757.913 1 1 M ARG 0.620 1
ATOM 101 N NE . ARG 852 852 ? A 977.828 742.824 759.110 1 1 M ARG 0.620 1
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ATOM 111 C CD . GLN 853 853 ? A 982.689 746.461 752.512 1 1 M GLN 0.650 1
ATOM 112 O OE1 . GLN 853 853 ? A 982.811 746.753 751.320 1 1 M GLN 0.650 1
ATOM 113 N NE2 . GLN 853 853 ? A 981.544 746.722 753.181 1 1 M GLN 0.650 1
ATOM 114 N N . GLU 854 854 ? A 984.559 741.255 752.772 1 1 M GLU 0.630 1
ATOM 115 C CA . GLU 854 854 ? A 984.919 739.936 752.264 1 1 M GLU 0.630 1
ATOM 116 C C . GLU 854 854 ? A 983.729 739.075 751.834 1 1 M GLU 0.630 1
ATOM 117 O O . GLU 854 854 ? A 983.761 738.489 750.755 1 1 M GLU 0.630 1
ATOM 118 C CB . GLU 854 854 ? A 985.760 739.112 753.274 1 1 M GLU 0.630 1
ATOM 119 C CG . GLU 854 854 ? A 987.185 739.666 753.538 1 1 M GLU 0.630 1
ATOM 120 C CD . GLU 854 854 ? A 987.950 738.907 754.625 1 1 M GLU 0.630 1
ATOM 121 O OE1 . GLU 854 854 ? A 987.427 737.890 755.147 1 1 M GLU 0.630 1
ATOM 122 O OE2 . GLU 854 854 ? A 989.078 739.367 754.943 1 1 M GLU 0.630 1
ATOM 123 N N . VAL 855 855 ? A 982.612 738.996 752.591 1 1 M VAL 0.680 1
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ATOM 126 O O . VAL 855 855 ? A 980.337 738.133 750.050 1 1 M VAL 0.680 1
ATOM 127 C CB . VAL 855 855 ? A 980.341 738.237 753.286 1 1 M VAL 0.680 1
ATOM 128 C CG1 . VAL 855 855 ? A 979.030 737.583 752.796 1 1 M VAL 0.680 1
ATOM 129 C CG2 . VAL 855 855 ? A 980.854 737.415 754.484 1 1 M VAL 0.680 1
ATOM 130 N N . HIS 856 856 ? A 980.778 740.204 750.779 1 1 M HIS 0.680 1
ATOM 131 C CA . HIS 856 856 ? A 980.342 740.863 749.566 1 1 M HIS 0.680 1
ATOM 132 C C . HIS 856 856 ? A 981.199 740.456 748.370 1 1 M HIS 0.680 1
ATOM 133 O O . HIS 856 856 ? A 980.689 740.237 747.262 1 1 M HIS 0.680 1
ATOM 134 C CB . HIS 856 856 ? A 980.360 742.397 749.775 1 1 M HIS 0.680 1
ATOM 135 C CG . HIS 856 856 ? A 979.501 742.850 750.926 1 1 M HIS 0.680 1
ATOM 136 N ND1 . HIS 856 856 ? A 979.770 744.059 751.537 1 1 M HIS 0.680 1
ATOM 137 C CD2 . HIS 856 856 ? A 978.428 742.255 751.520 1 1 M HIS 0.680 1
ATOM 138 C CE1 . HIS 856 856 ? A 978.873 744.173 752.493 1 1 M HIS 0.680 1
ATOM 139 N NE2 . HIS 856 856 ? A 978.035 743.111 752.527 1 1 M HIS 0.680 1
ATOM 140 N N . GLY 857 857 ? A 982.518 740.258 748.558 1 1 M GLY 0.750 1
ATOM 141 C CA . GLY 857 857 ? A 983.376 739.691 747.522 1 1 M GLY 0.750 1
ATOM 142 C C . GLY 857 857 ? A 983.212 738.211 747.268 1 1 M GLY 0.750 1
ATOM 143 O O . GLY 857 857 ? A 983.217 737.764 746.128 1 1 M GLY 0.750 1
ATOM 144 N N . CYS 858 858 ? A 983.063 737.395 748.331 1 1 M CYS 0.740 1
ATOM 145 C CA . CYS 858 858 ? A 982.860 735.956 748.219 1 1 M CYS 0.740 1
ATOM 146 C C . CYS 858 858 ? A 981.584 735.612 747.507 1 1 M CYS 0.740 1
ATOM 147 O O . CYS 858 858 ? A 981.575 734.734 746.646 1 1 M CYS 0.740 1
ATOM 148 C CB . CYS 858 858 ? A 982.809 735.255 749.598 1 1 M CYS 0.740 1
ATOM 149 S SG . CYS 858 858 ? A 984.439 735.293 750.415 1 1 M CYS 0.740 1
ATOM 150 N N . PHE 859 859 ? A 980.483 736.328 747.807 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 151 C CA . PHE 859 859 ? A 979.204 736.148 747.150 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 152 C C . PHE 859 859 ? A 979.329 736.455 745.671 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 153 O O . PHE 859 859 ? A 978.869 735.695 744.831 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 154 C CB . PHE 859 859 ? A 978.142 737.070 747.814 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 155 C CG . PHE 859 859 ? A 976.725 736.682 747.475 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 156 C CD1 . PHE 859 859 ? A 976.035 737.324 746.436 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 157 C CD2 . PHE 859 859 ? A 976.059 735.688 748.214 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 158 C CE1 . PHE 859 859 ? A 974.724 736.952 746.111 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 159 C CE2 . PHE 859 859 ? A 974.748 735.309 747.887 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 160 C CZ . PHE 859 859 ? A 974.088 735.930 746.819 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 161 N N . ALA 860 860 ? A 980.047 737.524 745.299 1 1 M ALA 0.750 1
ATOM 162 C CA . ALA 860 860 ? A 980.300 737.851 743.912 1 1 M ALA 0.750 1
ATOM 163 C C . ALA 860 860 ? A 981.060 736.783 743.088 1 1 M ALA 0.750 1
ATOM 164 O O . ALA 860 860 ? A 980.724 736.496 741.939 1 1 M ALA 0.750 1
ATOM 165 C CB . ALA 860 860 ? A 981.076 739.175 743.872 1 1 M ALA 0.750 1
ATOM 166 N N . GLN 861 861 ? A 982.109 736.136 743.659 1 1 M GLN 0.680 1
ATOM 167 C CA . GLN 861 861 ? A 982.759 734.979 743.044 1 1 M GLN 0.680 1
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ATOM 169 O O . GLN 861 861 ? A 981.783 733.083 741.957 1 1 M GLN 0.680 1
ATOM 170 C CB . GLN 861 861 ? A 984.010 734.478 743.813 1 1 M GLN 0.680 1
ATOM 171 C CG . GLN 861 861 ? A 985.214 735.446 743.831 1 1 M GLN 0.680 1
ATOM 172 C CD . GLN 861 861 ? A 986.382 734.767 744.549 1 1 M GLN 0.680 1
ATOM 173 O OE1 . GLN 861 861 ? A 986.211 733.798 745.293 1 1 M GLN 0.680 1
ATOM 174 N NE2 . GLN 861 861 ? A 987.624 735.236 744.311 1 1 M GLN 0.680 1
ATOM 175 N N . MET 862 862 ? A 981.022 733.556 744.025 1 1 M MET 0.660 1
ATOM 176 C CA . MET 862 862 ? A 980.002 732.530 744.022 1 1 M MET 0.660 1
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ATOM 178 O O . MET 862 862 ? A 978.623 731.859 742.234 1 1 M MET 0.660 1
ATOM 179 C CB . MET 862 862 ? A 979.353 732.299 745.406 1 1 M MET 0.660 1
ATOM 180 C CG . MET 862 862 ? A 980.340 731.743 746.456 1 1 M MET 0.660 1
ATOM 181 S SD . MET 862 862 ? A 979.690 731.744 748.155 1 1 M MET 0.660 1
ATOM 182 C CE . MET 862 862 ? A 978.470 730.425 747.898 1 1 M MET 0.660 1
ATOM 183 N N . ASP 863 863 ? A 978.432 734.011 742.797 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 184 C CA . ASP 863 863 ? A 977.568 734.400 741.701 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 185 C C . ASP 863 863 ? A 978.221 734.233 740.339 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 186 O O . ASP 863 863 ? A 977.587 733.699 739.419 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 187 C CB . ASP 863 863 ? A 977.131 735.870 741.864 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 188 C CG . ASP 863 863 ? A 976.123 736.051 742.982 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 189 O OD1 . ASP 863 863 ? A 975.560 735.043 743.477 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 190 O OD2 . ASP 863 863 ? A 975.874 737.244 743.294 1 1 M ASP 0.670 1
ATOM 191 N N . ARG 864 864 ? A 979.508 734.583 740.125 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 192 C CA . ARG 864 864 ? A 980.157 734.171 738.884 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 193 C C . ARG 864 864 ? A 980.195 732.659 738.677 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 194 O O . ARG 864 864 ? A 979.893 732.157 737.593 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 195 C CB . ARG 864 864 ? A 981.621 734.642 738.789 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 196 C CG . ARG 864 864 ? A 982.302 734.231 737.456 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 197 C CD . ARG 864 864 ? A 983.720 733.653 737.553 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 198 N NE . ARG 864 864 ? A 983.700 732.393 738.370 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 199 C CZ . ARG 864 864 ? A 984.801 731.771 738.812 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 200 N NH1 . ARG 864 864 ? A 986.031 732.205 738.553 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 201 N NH2 . ARG 864 864 ? A 984.664 730.669 739.538 1 1 M ARG 0.630 1
ATOM 202 N N . SER 865 865 ? A 980.531 731.872 739.709 1 1 M SER 0.690 1
ATOM 203 C CA . SER 865 865 ? A 980.449 730.444 739.688 1 1 M SER 0.690 1
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ATOM 206 C CB . SER 865 865 ? A 981.008 729.752 740.927 1 1 M SER 0.690 1
ATOM 207 O OG . SER 865 865 ? A 982.422 729.916 740.943 1 1 M SER 0.690 1
ATOM 208 N N . LEU 866 866 ? A 977.955 730.472 740.065 1 1 M LEU 0.690 1
ATOM 209 C CA . LEU 866 866 ? A 976.597 730.046 739.768 1 1 M LEU 0.690 1
ATOM 210 C C . LEU 866 866 ? A 976.076 730.418 738.398 1 1 M LEU 0.690 1
ATOM 211 O O . LEU 866 866 ? A 975.471 729.612 737.715 1 1 M LEU 0.690 1
ATOM 212 C CB . LEU 866 866 ? A 975.614 730.591 740.834 1 1 M LEU 0.690 1
ATOM 213 C CG . LEU 866 866 ? A 975.825 729.994 742.246 1 1 M LEU 0.690 1
ATOM 214 C CD1 . LEU 866 866 ? A 975.018 730.776 743.298 1 1 M LEU 0.690 1
ATOM 215 C CD2 . LEU 866 866 ? A 975.474 728.495 742.281 1 1 M LEU 0.690 1
ATOM 216 N N . ALA 867 867 ? A 976.344 731.657 737.915 1 1 M ALA 0.760 1
ATOM 217 C CA . ALA 867 867 ? A 975.988 731.981 736.545 1 1 M ALA 0.760 1
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ATOM 220 C CB . ALA 867 867 ? A 976.254 733.465 736.249 1 1 M ALA 0.760 1
ATOM 221 N N . LEU 868 868 ? A 977.971 730.733 735.957 1 1 M LEU 0.700 1
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ATOM 225 C CB . LEU 868 868 ? A 979.841 730.549 734.573 1 1 M LEU 0.700 1
ATOM 226 C CG . LEU 868 868 ? A 981.152 729.926 734.089 1 1 M LEU 0.700 1
ATOM 227 C CD1 . LEU 868 868 ? A 981.013 729.433 732.651 1 1 M LEU 0.700 1
ATOM 228 C CD2 . LEU 868 868 ? A 982.261 730.985 734.103 1 1 M LEU 0.700 1
ATOM 229 N N . PRO 869 869 ? A 977.707 727.431 735.679 1 1 M PRO 0.750 1
ATOM 230 C CA . PRO 869 869 ? A 976.934 726.272 735.325 1 1 M PRO 0.750 1
ATOM 231 C C . PRO 869 869 ? A 975.636 726.663 734.736 1 1 M PRO 0.750 1
ATOM 232 O O . PRO 869 869 ? A 975.182 725.918 733.875 1 1 M PRO 0.750 1
ATOM 233 C CB . PRO 869 869 ? A 976.645 725.461 736.618 1 1 M PRO 0.750 1
ATOM 234 C CG . PRO 869 869 ? A 977.203 726.271 737.768 1 1 M PRO 0.750 1
ATOM 235 C CD . PRO 869 869 ? A 977.879 727.431 737.071 1 1 M PRO 0.750 1
ATOM 236 N N . LYS 870 870 ? A 974.960 727.744 735.158 1 1 M LYS 0.760 1
ATOM 237 C CA . LYS 870 870 ? A 973.676 728.085 734.603 1 1 M LYS 0.760 1
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ATOM 240 C CB . LYS 870 870 ? A 973.019 729.226 735.410 1 1 M LYS 0.760 1
ATOM 241 C CG . LYS 870 870 ? A 971.525 729.404 735.106 1 1 M LYS 0.760 1
ATOM 242 C CD . LYS 870 870 ? A 970.858 730.467 735.992 1 1 M LYS 0.760 1
ATOM 243 C CE . LYS 870 870 ? A 969.330 730.371 735.935 1 1 M LYS 0.760 1
ATOM 244 N NZ . LYS 870 870 ? A 968.714 731.477 736.702 1 1 M LYS 0.760 1
ATOM 245 N N . ILE 871 871 ? A 974.784 729.186 732.728 1 1 M ILE 0.760 1
ATOM 246 C CA . ILE 871 871 ? A 975.087 729.381 731.331 1 1 M ILE 0.760 1
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ATOM 248 O O . ILE 871 871 ? A 975.067 727.741 729.602 1 1 M ILE 0.760 1
ATOM 249 C CB . ILE 871 871 ? A 976.109 730.494 731.152 1 1 M ILE 0.760 1
ATOM 250 C CG1 . ILE 871 871 ? A 975.562 731.849 731.679 1 1 M ILE 0.760 1
ATOM 251 C CG2 . ILE 871 871 ? A 976.510 730.617 729.663 1 1 M ILE 0.760 1
ATOM 252 C CD1 . ILE 871 871 ? A 976.667 732.893 731.903 1 1 M ILE 0.760 1
ATOM 253 N N . ARG 872 872 ? A 976.469 727.298 731.298 1 1 M ARG 0.610 1
ATOM 254 C CA . ARG 872 872 ? A 976.936 726.013 730.758 1 1 M ARG 0.610 1
ATOM 255 C C . ARG 872 872 ? A 975.800 725.029 730.519 1 1 M ARG 0.610 1
ATOM 256 O O . ARG 872 872 ? A 975.705 724.414 729.462 1 1 M ARG 0.610 1
ATOM 257 C CB . ARG 872 872 ? A 977.986 725.305 731.676 1 1 M ARG 0.610 1
ATOM 258 C CG . ARG 872 872 ? A 979.352 726.019 731.809 1 1 M ARG 0.610 1
ATOM 259 C CD . ARG 872 872 ? A 980.188 725.492 732.998 1 1 M ARG 0.610 1
ATOM 260 N NE . ARG 872 872 ? A 981.461 726.280 733.104 1 1 M ARG 0.610 1
ATOM 261 C CZ . ARG 872 872 ? A 982.359 726.150 734.094 1 1 M ARG 0.610 1
ATOM 262 N NH1 . ARG 872 872 ? A 982.219 725.243 735.055 1 1 M ARG 0.610 1
ATOM 263 N NH2 . ARG 872 872 ? A 983.424 726.950 734.124 1 1 M ARG 0.610 1
ATOM 264 N N . ALA 873 873 ? A 974.864 724.892 731.470 1 1 M ALA 0.700 1
ATOM 265 C CA . ALA 873 873 ? A 973.699 724.073 731.319 1 1 M ALA 0.700 1
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ATOM 267 O O . ALA 873 873 ? A 972.383 723.822 729.348 1 1 M ALA 0.700 1
ATOM 268 C CB . ALA 873 873 ? A 972.949 724.054 732.658 1 1 M ALA 0.700 1
ATOM 269 N N . ARG 874 874 ? A 972.594 725.916 730.125 1 1 M ARG 0.620 1
ATOM 270 C CA . ARG 874 874 ? A 971.842 726.495 729.026 1 1 M ARG 0.620 1
ATOM 271 C C . ARG 874 874 ? A 972.442 726.193 727.663 1 1 M ARG 0.620 1
ATOM 272 O O . ARG 874 874 ? A 971.701 725.898 726.737 1 1 M ARG 0.620 1
ATOM 273 C CB . ARG 874 874 ? A 971.731 728.036 729.097 1 1 M ARG 0.620 1
ATOM 274 C CG . ARG 874 874 ? A 970.807 728.600 730.192 1 1 M ARG 0.620 1
ATOM 275 C CD . ARG 874 874 ? A 971.001 730.121 730.297 1 1 M ARG 0.620 1
ATOM 276 N NE . ARG 874 874 ? A 970.253 730.654 731.480 1 1 M ARG 0.620 1
ATOM 277 C CZ . ARG 874 874 ? A 970.220 731.956 731.802 1 1 M ARG 0.620 1
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ATOM 280 N N . VAL 875 875 ? A 973.784 726.224 727.504 1 1 M VAL 0.680 1
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ATOM 283 O O . VAL 875 875 ? A 973.760 724.113 724.714 1 1 M VAL 0.680 1
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ATOM 285 C CG1 . VAL 875 875 ? A 976.552 725.677 724.874 1 1 M VAL 0.680 1
ATOM 286 C CG2 . VAL 875 875 ? A 976.261 727.535 726.508 1 1 M VAL 0.680 1
ATOM 287 N N . LEU 876 876 ? A 974.190 723.421 726.799 1 1 M LEU 0.630 1
ATOM 288 C CA . LEU 876 876 ? A 973.777 722.037 726.584 1 1 M LEU 0.630 1
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ATOM 312 N N . GLN 879 879 ? A 972.019 722.994 722.644 1 1 M GLN 0.580 1
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ATOM 318 C CD . GLN 879 879 ? A 976.331 721.849 722.859 1 1 M GLN 0.580 1
ATOM 319 O OE1 . GLN 879 879 ? A 976.271 720.955 723.708 1 1 M GLN 0.580 1
ATOM 320 N NE2 . GLN 879 879 ? A 977.527 722.320 722.451 1 1 M GLN 0.580 1
ATOM 321 N N . PHE 880 880 ? A 970.741 720.490 722.513 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 322 C CA . PHE 880 880 ? A 969.802 719.392 722.404 1 1 M PHE 0.670 1
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ATOM 329 C CE1 . PHE 880 880 ? A 965.955 717.134 723.487 1 1 M PHE 0.670 1
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ATOM 331 C CZ . PHE 880 880 ? A 966.433 715.818 723.543 1 1 M PHE 0.670 1
ATOM 332 N N . GLN 881 881 ? A 968.255 720.817 721.109 1 1 M GLN 0.620 1
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ATOM 336 C CB . GLN 881 881 ? A 966.155 722.076 720.771 1 1 M GLN 0.620 1
ATOM 337 C CG . GLN 881 881 ? A 965.333 721.503 721.947 1 1 M GLN 0.620 1
ATOM 338 C CD . GLN 881 881 ? A 964.267 722.487 722.425 1 1 M GLN 0.620 1
ATOM 339 O OE1 . GLN 881 881 ? A 964.477 723.685 722.639 1 1 M GLN 0.620 1
ATOM 340 N NE2 . GLN 881 881 ? A 963.041 721.965 722.647 1 1 M GLN 0.620 1
ATOM 341 O OXT . GLN 881 881 ? A 966.802 721.786 717.913 1 1 M GLN 0.620 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.626
2 1 3 0.006
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 841 PHE 1 0.140
2 1 A 842 SER 1 0.280
3 1 A 843 LEU 1 0.270
4 1 A 844 SER 1 0.440
5 1 A 845 GLU 1 0.530
6 1 A 846 GLU 1 0.590
7 1 A 847 GLU 1 0.620
8 1 A 848 LEU 1 0.660
9 1 A 849 LEU 1 0.650
10 1 A 850 ARG 1 0.630
11 1 A 851 MET 1 0.640
12 1 A 852 ARG 1 0.620
13 1 A 853 GLN 1 0.650
14 1 A 854 GLU 1 0.630
15 1 A 855 VAL 1 0.680
16 1 A 856 HIS 1 0.680
17 1 A 857 GLY 1 0.750
18 1 A 858 CYS 1 0.740
19 1 A 859 PHE 1 0.670
20 1 A 860 ALA 1 0.750
21 1 A 861 GLN 1 0.680
22 1 A 862 MET 1 0.660
23 1 A 863 ASP 1 0.670
24 1 A 864 ARG 1 0.630
25 1 A 865 SER 1 0.690
26 1 A 866 LEU 1 0.690
27 1 A 867 ALA 1 0.760
28 1 A 868 LEU 1 0.700
29 1 A 869 PRO 1 0.750
30 1 A 870 LYS 1 0.760
31 1 A 871 ILE 1 0.760
32 1 A 872 ARG 1 0.610
33 1 A 873 ALA 1 0.700
34 1 A 874 ARG 1 0.620
35 1 A 875 VAL 1 0.680
36 1 A 876 LEU 1 0.630
37 1 A 877 LEU 1 0.600
38 1 A 878 GLN 1 0.590
39 1 A 879 GLN 1 0.580
40 1 A 880 PHE 1 0.670
41 1 A 881 GLN 1 0.620
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
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you must distribute your contributions under the same license as the
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No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
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CC BY-SA 4.0 license at this link:
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;
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2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
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