data_SMR-4e2c1fb5886b4437489be8fd5e11c205_1 _entry.id SMR-4e2c1fb5886b4437489be8fd5e11c205_1 _struct.entry_id SMR-4e2c1fb5886b4437489be8fd5e11c205_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P18583 (isoform 2)/ SON_HUMAN, Protein SON Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P18583 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.4 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 271133.184 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SON_HUMAN P18583 1 ;MATNIEQIFRSFVVSKFREIQQELSSGRNEGQLNGETNTPIEGNQAGDAAASARSLPNEEIVQKIEEVLS GVLDTELRYKPDLKEGSRKSRCVSVQTDPTDEIPTKKSKKHKKHKNKKKKKKKEKEKKYKRQPEESESKT KSHDDGNIDLESDSFLKFDSEPSAVALELPTRAFGPSETNESPAVVLEPPVVSMEVSEPHILETLKPATK TAELSVVSTSVISEQSEQSVAVMPEPSMTKILDSFAAAPVPTTTLVLKSSEPVVTMSVEYQMKSVLKSVE STSPEPSKIMLVEPPVAKVLEPSETLVVSSETPTEVYPEPSTSTTMDFPESSAIEALRLPEQPVDVPSEI ADSSMTRPQELPELPKTTALELQESSVASAMELPGPPATSMPELQGPPVTPVLELPGPSATPVPELPGPL STPVPELPGPPATAVPELPGPSVTPVPQLSQELPGLPAPSMGLEPPQEVPEPPVMAQELPGLPLVTAAVE LPEQPAVTVAMELTEQPVTTTELEQPVGMTTVEHPGHPEVTTATGLLGQPEATMVLELPGQPVATTALEL PGQPSVTGVPELPGLPSATRALELSGQPVATGALELPGPLMAAGALEFSGQSGAAGALELLGQPLATGVL ELPGQPGAPELPGQPVATVALEISVQSVVTTSELSTMTVSQSLEVPSTTALESYNTQRSMMSSYERSMMS YERSMMSPMAERSMMSAYERSMMSAYERSMMSPMAERSMMSAYERSMMSAYERSMMSPMADRSMMSMGAD RSMMSSYSAADRSMMSSYSAADRSMMSSYTADRSMMSMAADSYTDSYTDTYTEAYMVPPLPPEEPPTMPP LPPEEPPMTPPLPPEEPPEGPALPTEQSALTAENTWPTEVPSSPSEESVSQPEPPVSQSEISEPSAVPTD YSVSASDPSVLVSEAAVTVPEPPPEPESSITLTPVESAVVAEEHEVVPERPVTCMVSETPAMSAEPTVLA SEPPVMSETAETFDSMRASGHVASEVSTSLLVPAVTTPVLAESILEPPAMAAPESSAMAVLESSAVTVLE SSTVTVLESSTVTVLEPSVVTVPEPPVVAEPDYVTIPVPVVSALEPSVPVLEPAVSVLQPSMIVSEPSVS VQESTVTVSEPAVTVSEQTQVIPTEVAIESTPMILESSIMSSHVMKGINLSSGDQNLAPEIGMQEIALHS GEEPHAEEHLKGDFYESEHGINIDLNINNHLIAKEMEHNTVCAAGTSPVGEIGEEKILPTSETKQRTVLD TYPGVSEADAGETLSSTGPFALEPDATGTSKGIEFTTASTLSLVNKYDVDLSLTTQDTEHDMVISTSPSG GSEADIEGPLPAKDIHLDLPSNNNLVSKDTEEPLPVKESDQTLAALLSPKESSGGEKEVPPPPKETLPDS GFSANIEDINEADLVRPLLPKDMERLTSLRAGIEGPLLASDVGRDRSAASPVVSSMPERASESSSEEKDD YEIFVKVKDTHEKSKKNKNRDKGEKEKKRDSSLRSRSKRSKSSEHKSRKRTSESRSRARKRSSKSKSHRS QTRSRSRSRRRRRSSRSRSKSRGRRSVSKEKRKRSPKHRSKSRERKRKRSSSRDNRKTVRARSRTPSRRS RSHTPSRRRRSRSVGRRRSFSISPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRR RSRSVVRRRSFSISPVRLRRSRTPLRRRFSRSPIRRKRSRSSERGRSPKRLTDLDKAQLLEIAKANAAAM CAKAGVPLPPNLKPAPPPTIEEKVAKKSGGATIEELTEKCKQIAQSKEDDDVIVNKPHVSDEEEEEPPFY HHPFKLSEPKPIFFNLNIAAAKPTPPKSQVTLTKEFPVSSGSQHRKKEADSVYGEWVPVEKNGEENKDDD NVFSSNLPSEPVDISTAMSERALAQKRLSENAFDLEAMSMLNRAQERIDAWAQLNSIPGQFTGSTGVQVL TQEQLANTGAQAWIKKDQFLRAAPVTGGMGAVLMRKMGWREGEGLGKNKEGNKEPILVDFKTDRKGLVAV GERAQKRSGNFSAAMKDLSGKHPVSALMEICNKRRWQPPEFLLVHDSGPDHRKHFLFRVLINGSAYQPSF ASPNKKHAKATAATVVLQAMGLVPKDLMANATCFRSASRR ; 'Protein SON' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2140 1 2140 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . SON_HUMAN P18583 P18583-2 1 2140 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-05-18 ADE72D9D269A914D . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MATNIEQIFRSFVVSKFREIQQELSSGRNEGQLNGETNTPIEGNQAGDAAASARSLPNEEIVQKIEEVLS GVLDTELRYKPDLKEGSRKSRCVSVQTDPTDEIPTKKSKKHKKHKNKKKKKKKEKEKKYKRQPEESESKT KSHDDGNIDLESDSFLKFDSEPSAVALELPTRAFGPSETNESPAVVLEPPVVSMEVSEPHILETLKPATK TAELSVVSTSVISEQSEQSVAVMPEPSMTKILDSFAAAPVPTTTLVLKSSEPVVTMSVEYQMKSVLKSVE STSPEPSKIMLVEPPVAKVLEPSETLVVSSETPTEVYPEPSTSTTMDFPESSAIEALRLPEQPVDVPSEI ADSSMTRPQELPELPKTTALELQESSVASAMELPGPPATSMPELQGPPVTPVLELPGPSATPVPELPGPL STPVPELPGPPATAVPELPGPSVTPVPQLSQELPGLPAPSMGLEPPQEVPEPPVMAQELPGLPLVTAAVE LPEQPAVTVAMELTEQPVTTTELEQPVGMTTVEHPGHPEVTTATGLLGQPEATMVLELPGQPVATTALEL PGQPSVTGVPELPGLPSATRALELSGQPVATGALELPGPLMAAGALEFSGQSGAAGALELLGQPLATGVL 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Ribonuclease 3 {PDB ID=6v5b, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=6v5b.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6v5b, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-07-09 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-07-04 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSGHRSPSREKKRARWEEEKDRWSDNQSSGKDKNYTSIKEKEPEETMPDKNEEEEEELLKPVWIRCTHSE NYYSSDPMDQVGDSTVVGTSRLRDLYDKFEEELGSRQEKAKAARPPWEPPKTKLDEDLESSSESECESDE DSTCSSSSDSEVFDVIAEIKRKKAHPDRLHDELWYNDPGQMNDGPLCKCSAKARRTGIRHSIYPGEEAIK PCRPMTNNAGRLFHYRITVSPPTNFLTDRPTVIEYDDHEYIFEGFSMFAHAPLTNIPLCKVIRFNIDYTI HFIEEMMPENFCVKGLELFSLFLFRDILELYDWNLKGPLFEDSPPCCPRFHFMPRFVRFLPDGGKEVLSM HQILLYLLRCSKALVPEEEIANMLQWEELEWQKYAEECKGMIVTNPGTKPSSVRIDQLDREQFNPDVITF PIIVHFGIRPAQLSYAGDPQYQKLWKSYVKLRHLLANSPKVKQTDKQKLAQREEALQKIRQKNTMRREVT VELSSQGFWKTGIRSDVCQHAMMLPVLTHHIRYHQCLMHLDKLIGYTFQDRCLLQLAMTHPSHHLNFGMN PDHARNSLSNCGIRQPKYGDRKVHHMHMRKKGINTLINIMSRLGQDDPTPSRINHNERLEFLGDAVVEFL TSVHLYYLFPSLEEGGLATYRTAIVQNQHLAMLAKKLELDRFMLYAHGPDLCRESDLRHAMANCFEALIG AVYLEGSLEEAKQLFGRLLFNDPDLREVWLNYPLHPLQLQEPNTDRQLIETSPVLQKLTEFEEAIGVIFT HVRLLARAFTLRTVGFNHLTLGHNQRMEFLGDSIMQLVATEYLFIHFPDHHEGHLTLLRSSLVNNRTQAK VAEELGMQEYAITNDKTKRPVALRTKTLADLLESFIAALYIDKDLEYVHTFMNVCFFPRLKEFILNQDWN DPKSQLQQCCLTLRTEGKEPDIPLYKTLQTVGPSHARTYTVAVYFKGERIGCGKGPSIQQAEMGAAMDAL EKYNFPQMAHQKRFIERKYRQELKEMRWEREHQERE ; ;GSGHRSPSREKKRARWEEEKDRWSDNQSSGKDKNYTSIKEKEPEETMPDKNEEEEEELLKPVWIRCTHSE NYYSSDPMDQVGDSTVVGTSRLRDLYDKFEEELGSRQEKAKAARPPWEPPKTKLDEDLESSSESECESDE DSTCSSSSDSEVFDVIAEIKRKKAHPDRLHDELWYNDPGQMNDGPLCKCSAKARRTGIRHSIYPGEEAIK PCRPMTNNAGRLFHYRITVSPPTNFLTDRPTVIEYDDHEYIFEGFSMFAHAPLTNIPLCKVIRFNIDYTI HFIEEMMPENFCVKGLELFSLFLFRDILELYDWNLKGPLFEDSPPCCPRFHFMPRFVRFLPDGGKEVLSM HQILLYLLRCSKALVPEEEIANMLQWEELEWQKYAEECKGMIVTNPGTKPSSVRIDQLDREQFNPDVITF PIIVHFGIRPAQLSYAGDPQYQKLWKSYVKLRHLLANSPKVKQTDKQKLAQREEALQKIRQKNTMRREVT VELSSQGFWKTGIRSDVCQHAMMLPVLTHHIRYHQCLMHLDKLIGYTFQDRCLLQLAMTHPSHHLNFGMN PDHARNSLSNCGIRQPKYGDRKVHHMHMRKKGINTLINIMSRLGQDDPTPSRINHNERLEFLGDAVVEFL TSVHLYYLFPSLEEGGLATYRTAIVQNQHLAMLAKKLELDRFMLYAHGPDLCRESDLRHAMANCFEALIG AVYLEGSLEEAKQLFGRLLFNDPDLREVWLNYPLHPLQLQEPNTDRQLIETSPVLQKLTEFEEAIGVIFT HVRLLARAFTLRTVGFNHLTLGHNQRMEFLGDSIMQLVATEYLFIHFPDHHEGHLTLLRSSLVNNRTQAK VAEELGMQEYAITNDKTKRPVALRTKTLADLLESFIAALYIDKDLEYVHTFMNVCFFPRLKEFILNQDWN DPKSQLQQCCLTLRTEGKEPDIPLYKTLQTVGPSHARTYTVAVYFKGERIGCGKGPSIQQAEMGAAMDAL EKYNFPQMAHQKRFIERKYRQELKEMRWEREHQERE ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 906 988 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6v5b 2024-03-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2140 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2145 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.020 19.231 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MATNIEQIFRSFVVSKFREIQQELSSGRNEGQLNGETNTPIEGNQAGDAAASARSLPNEEIVQKIEEVLSGVLDTELRYKPDLKEGSRKSRCVSVQTDPTDEIPTKKSKKHKKHKNKKKKKKKEKEKKYKRQPEESESKTKSHDDGNIDLESDSFLKFDSEPSAVALELPTRAFGPSETNESPAVVLEPPVVSMEVSEPHILETLKPATKTAELSVVSTSVISEQSEQSVAVMPEPSMTKILDSFAAAPVPTTTLVLKSSEPVVTMSVEYQMKSVLKSVESTSPEPSKIMLVEPPVAKVLEPSETLVVSSETPTEVYPEPSTSTTMDFPESSAIEALRLPEQPVDVPSEIADSSMTRPQELPELPKTTALELQESSVASAMELPGPPATSMPELQGPPVTPVLELPGPSATPVPELPGPLSTPVPELPGPPATAVPELPGPSVTPVPQLSQELPGLPAPSMGLEPPQEVPEPPVMAQELPGLPLVTAAVELPEQPAVTVAMELTEQPVTTTELEQPVGMTTVEHPGHPEVTTATGLLGQPEATMVLELPGQPVATTALELPGQPSVTGVPELPGLPSATRALELSGQPVATGALELPGPLMAAGALEFSGQSGAAGALELLGQPLATGVLELPGQPGAPELPGQPVATVALEISVQSVVTTSELSTMTVSQSLEVPSTTALESYNTQRSMMSSYERSMMSYERSMMSPMAERSMMSAYERSMMSAYERSMMSPMAERSMMSAYERSMMSAYERSMMSPMADRSMMSMGADRSMMSSYSAADRSMMSSYSAADRSMMSSYTADRSMMSMAADSYTDSYTDTYTEAYMVPPLPPEEPPTMPPLPPEEPPMTPPLPPEEPPEGPALPTEQSALTAENTWPTEVPSSPSEESVSQPEPPVSQSEISEPSAVPTDYSVSASDPSVLVSEAAVTVPEPPPEPESSITLTPVESAVVAEEHEVVPERPVTCMVSETPAMSAEPTVLASEPPVMSETAETFDSMRASGHVASEVSTSLLVPAVTTPVLAESILEPPAMAAPESSAMAVLESSAVTVLESSTVTVLESSTVTVLEPSVVTVPEPPVVAEPDYVTIPVPVVSALEPSVPVLEPAVSVLQPSMIVSEPSVSVQESTVTVSEPAVTVSEQTQVIPTEVAIESTPMILESSIMSSHVMKGINLSSGDQNLAPEIGMQEIALHSGEEPHAEEHLKGDFYESEHGINIDLNINNHLIAKEMEHNTVCAAGTSPVGEIGEEKILPTSETKQRTVLDTYPGVSEADAGETLSSTGPFALEPDATGTSKGIEFTTASTLSLVNKYDVDLSLTTQDTEHDMVISTSPSGGSEADIEGPLPAKDIHLDLPSNNNLVSKDTEEPLPVKESDQTLAALLSPKESSGGEKEVPPPPKETLPDSGFSANIEDINEADLVRPLLPKDMERLTSLRAGIEGPLLASDVGRDRSAASPVVSSMPERASESSSEEKDDYEIFVKVKDTHEKSKKNKNRDKGEKEKKRDSSLRSRSKRSKSSEHKSRKRTSESRSRARKRSSKSKSHRSQTRSRSRSRRRRRSSRSRSKSRGRRSVSKEKRKRSPKHRSKSRERKRKRSSSRDNRKTVRARSRTPSRRSRSHTPSRRRRSRSVGRRRSFSISPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRRRSRSVVRRRSFSISPVRLRRSRTPLRRRFSRSPIRRKRSRSSERGRSPKRLTDLDKAQLLEIAKANAAAMCAKAGVPLPPNLKPAPPPTIEEKVAKKSGGATIEELTEKCKQIAQSKEDDDVIVNKPHVSDEEEEEPPFYHHPFKLSEPKPIFFNLNIAAAKPTPPKSQVTLTKEFPVSSGSQHRKKEADSVYGEWVPVEKNGEENKDDDNVFSSNLPSEPVDISTAMSERALAQKRLSENAFDLEAMSMLNRAQERIDAWAQLNSIPGQFTGSTGVQVLTQEQLANTGAQAWIKKDQFLRAAPVTGGMGAVLMRKMGWREGEGLGKNKEGNKEPILVDFKTDRKGLVAVGERAQKRSGNFSAAMKDLSGKHPVSALMEICNK-----RRWQPPEFLLVHDSGPDHRKHFLFRVLINGSAYQPSFASPNKKHAKATAATVVLQAMGLVPKDLMANATCFRSASRR 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NQDWNDPKSQLQQCCLTLRTEGKEPDIPLYKTLQTVGPSHARTYTVAVYFKGERIGCG-KGPSIQQAEMGAAMDALEKYNFPQM--------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6v5b.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 2047 2047 ? A 145.495 118.371 125.835 1 1 A ASP 0.200 1 ATOM 2 C CA . ASP 2047 2047 ? A 144.518 117.862 126.846 1 1 A ASP 0.200 1 ATOM 3 C C . ASP 2047 2047 ? A 143.188 118.612 126.967 1 1 A ASP 0.200 1 ATOM 4 O O . ASP 2047 2047 ? A 142.140 118.044 126.668 1 1 A ASP 0.200 1 ATOM 5 C CB . ASP 2047 2047 ? A 145.278 117.709 128.194 1 1 A ASP 0.200 1 ATOM 6 C CG . ASP 2047 2047 ? A 146.503 116.806 128.039 1 1 A ASP 0.200 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 2047 2047 ? A 146.783 116.431 126.869 1 1 A ASP 0.200 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 2047 2047 ? A 147.179 116.564 129.052 1 1 A ASP 0.200 1 ATOM 9 N N . LEU 2048 2048 ? A 143.159 119.896 127.397 1 1 A LEU 0.200 1 ATOM 10 C CA . LEU 2048 2048 ? A 141.942 120.473 127.963 1 1 A LEU 0.200 1 ATOM 11 C C . LEU 2048 2048 ? A 141.408 121.736 127.296 1 1 A LEU 0.200 1 ATOM 12 O O . LEU 2048 2048 ? A 140.703 122.521 127.921 1 1 A LEU 0.200 1 ATOM 13 C CB . LEU 2048 2048 ? A 142.167 120.734 129.472 1 1 A LEU 0.200 1 ATOM 14 C CG . LEU 2048 2048 ? A 142.346 119.458 130.323 1 1 A LEU 0.200 1 ATOM 15 C CD1 . LEU 2048 2048 ? A 142.745 119.840 131.753 1 1 A LEU 0.200 1 ATOM 16 C CD2 . LEU 2048 2048 ? A 141.086 118.579 130.343 1 1 A LEU 0.200 1 ATOM 17 N N . SER 2049 2049 ? A 141.680 121.983 126.001 1 1 A SER 0.220 1 ATOM 18 C CA . SER 2049 2049 ? A 141.030 123.090 125.288 1 1 A SER 0.220 1 ATOM 19 C C . SER 2049 2049 ? A 139.578 122.821 124.925 1 1 A SER 0.220 1 ATOM 20 O O . SER 2049 2049 ? A 138.710 123.678 125.065 1 1 A SER 0.220 1 ATOM 21 C CB . SER 2049 2049 ? A 141.783 123.503 124.002 1 1 A SER 0.220 1 ATOM 22 O OG . SER 2049 2049 ? A 142.005 122.380 123.144 1 1 A SER 0.220 1 ATOM 23 N N . GLY 2050 2050 ? A 139.279 121.581 124.490 1 1 A GLY 0.320 1 ATOM 24 C CA . GLY 2050 2050 ? A 137.950 121.133 124.073 1 1 A GLY 0.320 1 ATOM 25 C C . GLY 2050 2050 ? A 137.013 120.840 125.214 1 1 A GLY 0.320 1 ATOM 26 O O . GLY 2050 2050 ? A 135.876 120.433 125.000 1 1 A GLY 0.320 1 ATOM 27 N N . LYS 2051 2051 ? A 137.481 121.017 126.469 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 28 C CA . LYS 2051 2051 ? A 136.704 120.767 127.670 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 29 C C . LYS 2051 2051 ? A 136.220 119.328 127.805 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 30 O O . LYS 2051 2051 ? A 135.026 119.025 127.789 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 31 C CB . LYS 2051 2051 ? A 135.556 121.774 127.877 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 32 C CG . LYS 2051 2051 ? A 136.015 123.227 128.037 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 33 C CD . LYS 2051 2051 ? A 134.813 124.161 128.244 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 34 C CE . LYS 2051 2051 ? A 135.217 125.629 128.375 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 35 N NZ . LYS 2051 2051 ? A 134.013 126.469 128.555 1 1 A LYS 0.480 1 ATOM 36 N N . HIS 2052 2052 ? A 137.193 118.410 127.973 1 1 A HIS 0.440 1 ATOM 37 C CA . HIS 2052 2052 ? A 137.003 116.976 128.150 1 1 A HIS 0.440 1 ATOM 38 C C . HIS 2052 2052 ? A 135.899 116.489 129.106 1 1 A HIS 0.440 1 ATOM 39 O O . HIS 2052 2052 ? A 135.319 115.459 128.767 1 1 A HIS 0.440 1 ATOM 40 C CB . HIS 2052 2052 ? A 138.356 116.307 128.506 1 1 A HIS 0.440 1 ATOM 41 C CG . HIS 2052 2052 ? A 138.322 114.808 128.592 1 1 A HIS 0.440 1 ATOM 42 N ND1 . HIS 2052 2052 ? A 138.470 114.201 129.818 1 1 A HIS 0.440 1 ATOM 43 C CD2 . HIS 2052 2052 ? A 138.092 113.876 127.631 1 1 A HIS 0.440 1 ATOM 44 C CE1 . HIS 2052 2052 ? A 138.317 112.914 129.592 1 1 A HIS 0.440 1 ATOM 45 N NE2 . HIS 2052 2052 ? A 138.091 112.659 128.281 1 1 A HIS 0.440 1 ATOM 46 N N . PRO 2053 2053 ? A 135.530 117.111 130.233 1 1 A PRO 0.600 1 ATOM 47 C CA . PRO 2053 2053 ? A 134.454 116.603 131.077 1 1 A PRO 0.600 1 ATOM 48 C C . PRO 2053 2053 ? A 133.056 116.559 130.482 1 1 A PRO 0.600 1 ATOM 49 O O . PRO 2053 2053 ? A 132.479 115.483 130.418 1 1 A PRO 0.600 1 ATOM 50 C CB . PRO 2053 2053 ? A 134.490 117.546 132.290 1 1 A PRO 0.600 1 ATOM 51 C CG . PRO 2053 2053 ? A 135.954 117.949 132.411 1 1 A PRO 0.600 1 ATOM 52 C CD . PRO 2053 2053 ? A 136.355 118.089 130.952 1 1 A PRO 0.600 1 ATOM 53 N N . VAL 2054 2054 ? A 132.450 117.692 130.065 1 1 A VAL 0.660 1 ATOM 54 C CA . VAL 2054 2054 ? A 131.009 117.684 129.788 1 1 A VAL 0.660 1 ATOM 55 C C . VAL 2054 2054 ? A 130.705 118.038 128.355 1 1 A VAL 0.660 1 ATOM 56 O O . VAL 2054 2054 ? A 129.928 117.353 127.690 1 1 A VAL 0.660 1 ATOM 57 C CB . VAL 2054 2054 ? A 130.233 118.653 130.687 1 1 A VAL 0.660 1 ATOM 58 C CG1 . VAL 2054 2054 ? A 128.718 118.623 130.383 1 1 A VAL 0.660 1 ATOM 59 C CG2 . VAL 2054 2054 ? A 130.443 118.276 132.162 1 1 A VAL 0.660 1 ATOM 60 N N . SER 2055 2055 ? A 131.324 119.103 127.797 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 61 C CA . SER 2055 2055 ? A 130.996 119.525 126.440 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 62 C C . SER 2055 2055 ? A 131.602 118.624 125.395 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 63 O O . SER 2055 2055 ? A 131.075 118.516 124.292 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 64 C CB . SER 2055 2055 ? A 131.261 121.018 126.125 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 65 O OG . SER 2055 2055 ? A 132.578 121.449 126.462 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 66 N N . ALA 2056 2056 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #