data_SMR-81a53e1e5ccffc8099a85d6f1bfb33dc_1 _entry.id SMR-81a53e1e5ccffc8099a85d6f1bfb33dc_1 _struct.entry_id SMR-81a53e1e5ccffc8099a85d6f1bfb33dc_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A0A1U9X974/ A0A1U9X974_HUMAN, PRRC2A - P48634/ PRC2A_HUMAN, Protein PRRC2A Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A1U9X974, P48634' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.4 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 268011.556 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PRC2A_HUMAN P48634 1 ;MSDRSGPTAKGKDGKKYSSLNLFDTYKGKSLEIQKPAVAPRHGLQSLGKVAIARRMPPPANLPSLKAENK GNDPNVSLVPKDGTGWASKQEQSDPKSSDASTAQPPESQPLPASQTPASNQPKRPPAAPENTPLVPSGVK SWAQASVTHGAHGDGGRASSLLSRFSREEFPTLQAAGDQDKAAKERESAEQSSGPGPSLRPQNSTTWRDG GGRGPDELEGPDSKLHHGHDPRGGLQPSGPPQFPPYRGMMPPFMYPPYLPFPPPYGPQGPYRYPTPDGPS RFPRVAGPRGSGPPMRLVEPVGRPSILKEDNLKEFDQLDQENDDGWAGAHEEVDYTEKLKFSDEEDGRDS DEEGAEGHRDSQSASGEERPPEADGKKGNSPNSEPPTPKTAWAETSRPPETEPGPPAPKPPLPPPHRGPA GNWGPPGDYPDRGGPPCKPPAPEDEDEAWRQRRKQSSSEISLAVERARRRREEEERRMQEERRAACAEKL KRLDEKFGAPDKRLKAEPAAPPAAPSTPAPPPAVPKELPAPPAPPPASAPTPETEPEEPAQAPPAQSTPT PGVAAAPTLVSGGGSTSSTSSGSFEASPVEPQLPSKEGPEPPEEVPPPTTPPVPKVEPKGDGIGPTRQPP SQGLGYPKYQKSLPPRFQRQQQEQLLKQQQQHQWQQHQQGSAPPTPVPPSPPQPVTLGAVPAPQAPPPPP KALYPGALGRPPPMPPMNFDPRWMMIPPYVDPRLLQGRPPLDFYPPGVHPSGLVPRERSDSGGSSSEPFD RHAPAMLRERGTPPVDPKLAWVGDVFTATPAEPRPLTSPLRQAADEDDKGMRSETPPVPPPPPYLASYPG FPENGAPGPPISRFPLEEPGPRPLPWPPGSDEVAKIQTPPPKKEPPKEETAQLTGPEAGRKPARGVGSGG QGPPPPRRESRTETRWGPRPGSSRRGIPPEEPGAPPRRAGPIKKPPPPTKVEELPPKPLEQGDETPKPPK PDPLKITKGKLGGPKETPPNGNLSPAPRLRRDYSYERVGPTSCRGRGRGEYFARGRGFRGTYGGRGRGAR SREFRSYREFRGDDGRGGGTGGPNHPPAPRGRTASETRSEGSEYEEIPKRRRQRGSETGSETHESDLAPS DKEAPTPKEGTLTQVPLAPPPPGAPPSPAPARFTARGGRVFTPRGVPSRRGRGGGRPPPQVCPGWSPPAK SLAPKKPPTGPLPPSKEPLKEKLIPGPLSPVARGGSNGGSNVGMEDGERPRRRRHGRAQQQDKPPRFRRL KQERENAARGSEGKPSLTLPASAPGPEEALTTVTVAPAPRRAAAKSPDLSNQNSDQANEEWETASESSDF TSERRGDKEAPPPVLLTPKAVGTPGGGGGGAVPGISAMSRGDLSQRAKDLSKRSFSSQRPGMERQNRRPG PGGKAGSSGSSSGGGGGGPGGRTGPGRGDKRSWPSPKNRSRPPEERPPGLPLPPPPPSSSAVFRLDQVIH SNPAGIQQALAQLSSRQGSVTAPGGHPRHKPGLPQAPQGPSPRPPTRYEPQRVNSGLSSDPHFEEPGPMV RGVGGTPRDSAGVSPFPPKRRERPPRKPELLQEESLPPPHSSGFLGSKPEGPGPQAESRDTGTEALTPHI WNRLHTATSRKSYRPSSMEPWMEPLSPFEDVAGTEMSQSDSGVDLSGDSQVSSGPCSQRSSPDGGLKGAA EGPPKRPGGSSPLNAVPCEGPPGSEPPRRPPPAPHDGDRKELPREQPLPPGPIGTERSQRTDRGTEPGPI RPSHRPGPPVQFGTSDKDSDLRLVVGDSLKAEKELTASVTEAIPVSRDWELLPSAAASAEPQSKNLDSGH CVPEPSSSGQRLYPEVFYGSAGPSSSQISGGAMDSQLHPNSGGFRPGTPSLHPYRSQPLYLPPGPAPPSA LLSGLALKGQFLDFSTMQATELGKLPAGGVLYPPPSFLYSPAFCPSPLPDTSLLQVRQDLPSPSDFYSTP LQPGGQSGFLPSGAPAQQMLLPMVDSQLPVVNFGSLPPAPPPAPPPLSLLPVGPALQPPSLAVRPPPAPA TRVLPSPARPFPASLGRAELHPVELKPFQDYQKLSSNLGGPGSSRTPPTGRSFSGLNSRLKATPSTYSGV FRTQRVDLYQQASPPDALRWIPKPWERTGPPPREGPSRRAEEPGSRGDKEPGLPPPR ; 'Protein PRRC2A' 2 1 UNP A0A1U9X974_HUMAN A0A1U9X974 1 ;MSDRSGPTAKGKDGKKYSSLNLFDTYKGKSLEIQKPAVAPRHGLQSLGKVAIARRMPPPANLPSLKAENK GNDPNVSLVPKDGTGWASKQEQSDPKSSDASTAQPPESQPLPASQTPASNQPKRPPAAPENTPLVPSGVK SWAQASVTHGAHGDGGRASSLLSRFSREEFPTLQAAGDQDKAAKERESAEQSSGPGPSLRPQNSTTWRDG GGRGPDELEGPDSKLHHGHDPRGGLQPSGPPQFPPYRGMMPPFMYPPYLPFPPPYGPQGPYRYPTPDGPS RFPRVAGPRGSGPPMRLVEPVGRPSILKEDNLKEFDQLDQENDDGWAGAHEEVDYTEKLKFSDEEDGRDS DEEGAEGHRDSQSASGEERPPEADGKKGNSPNSEPPTPKTAWAETSRPPETEPGPPAPKPPLPPPHRGPA GNWGPPGDYPDRGGPPCKPPAPEDEDEAWRQRRKQSSSEISLAVERARRRREEEERRMQEERRAACAEKL KRLDEKFGAPDKRLKAEPAAPPAAPSTPAPPPAVPKELPAPPAPPPASAPTPETEPEEPAQAPPAQSTPT PGVAAAPTLVSGGGSTSSTSSGSFEASPVEPQLPSKEGPEPPEEVPPPTTPPVPKVEPKGDGIGPTRQPP SQGLGYPKYQKSLPPRFQRQQQEQLLKQQQQHQWQQHQQGSAPPTPVPPSPPQPVTLGAVPAPQAPPPPP KALYPGALGRPPPMPPMNFDPRWMMIPPYVDPRLLQGRPPLDFYPPGVHPSGLVPRERSDSGGSSSEPFD RHAPAMLRERGTPPVDPKLAWVGDVFTATPAEPRPLTSPLRQAADEDDKGMRSETPPVPPPPPYLASYPG FPENGAPGPPISRFPLEEPGPRPLPWPPGSDEVAKIQTPPPKKEPPKEETAQLTGPEAGRKPARGVGSGG QGPPPPRRESRTETRWGPRPGSSRRGIPPEEPGAPPRRAGPIKKPPPPTKVEELPPKPLEQGDETPKPPK PDPLKITKGKLGGPKETPPNGNLSPAPRLRRDYSYERVGPTSCRGRGRGEYFARGRGFRGTYGGRGRGAR SREFRSYREFRGDDGRGGGTGGPNHPPAPRGRTASETRSEGSEYEEIPKRRRQRGSETGSETHESDLAPS DKEAPTPKEGTLTQVPLAPPPPGAPPSPAPARFTARGGRVFTPRGVPSRRGRGGGRPPPQVCPGWSPPAK SLAPKKPPTGPLPPSKEPLKEKLIPGPLSPVARGGSNGGSNVGMEDGERPRRRRHGRAQQQDKPPRFRRL KQERENAARGSEGKPSLTLPASAPGPEEALTTVTVAPAPRRAAAKSPDLSNQNSDQANEEWETASESSDF TSERRGDKEAPPPVLLTPKAVGTPGGGGGGAVPGISAMSRGDLSQRAKDLSKRSFSSQRPGMERQNRRPG PGGKAGSSGSSSGGGGGGPGGRTGPGRGDKRSWPSPKNRSRPPEERPPGLPLPPPPPSSSAVFRLDQVIH SNPAGIQQALAQLSSRQGSVTAPGGHPRHKPGLPQAPQGPSPRPPTRYEPQRVNSGLSSDPHFEEPGPMV RGVGGTPRDSAGVSPFPPKRRERPPRKPELLQEESLPPPHSSGFLGSKPEGPGPQAESRDTGTEALTPHI WNRLHTATSRKSYRPSSMEPWMEPLSPFEDVAGTEMSQSDSGVDLSGDSQVSSGPCSQRSSPDGGLKGAA EGPPKRPGGSSPLNAVPCEGPPGSEPPRRPPPAPHDGDRKELPREQPLPPGPIGTERSQRTDRGTEPGPI RPSHRPGPPVQFGTSDKDSDLRLVVGDSLKAEKELTASVTEAIPVSRDWELLPSAAASAEPQSKNLDSGH CVPEPSSSGQRLYPEVFYGSAGPSSSQISGGAMDSQLHPNSGGFRPGTPSLHPYRSQPLYLPPGPAPPSA LLSGLALKGQFLDFSTMQATELGKLPAGGVLYPPPSFLYSPAFCPSPLPDTSLLQVRQDLPSPSDFYSTP LQPGGQSGFLPSGAPAQQMLLPMVDSQLPVVNFGSLPPAPPPAPPPLSLLPVGPALQPPSLAVRPPPAPA TRVLPSPARPFPASLGRAELHPVELKPFQDYQKLSSNLGGPGSSRTPPTGRSFSGLNSRLKATPSTYSGV FRTQRVDLYQQASPPDALRWIPKPWERTGPPPREGPSRRAEEPGSRGDKEPGLPPPR ; PRRC2A # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2157 1 2157 2 2 1 2157 1 2157 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . 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A 1 2006 PRO 2006 ? ? ? A . A 1 2007 LEU 2007 ? ? ? A . A 1 2008 SER 2008 ? ? ? A . A 1 2009 LEU 2009 ? ? ? A . A 1 2010 LEU 2010 ? ? ? A . A 1 2011 PRO 2011 ? ? ? A . A 1 2012 VAL 2012 ? ? ? A . A 1 2013 GLY 2013 ? ? ? A . A 1 2014 PRO 2014 ? ? ? A . A 1 2015 ALA 2015 ? ? ? A . A 1 2016 LEU 2016 ? ? ? A . A 1 2017 GLN 2017 ? ? ? A . A 1 2018 PRO 2018 ? ? ? A . A 1 2019 PRO 2019 ? ? ? A . A 1 2020 SER 2020 ? ? ? A . A 1 2021 LEU 2021 ? ? ? A . A 1 2022 ALA 2022 ? ? ? A . A 1 2023 VAL 2023 ? ? ? A . A 1 2024 ARG 2024 ? ? ? A . A 1 2025 PRO 2025 ? ? ? A . A 1 2026 PRO 2026 ? ? ? A . A 1 2027 PRO 2027 ? ? ? A . A 1 2028 ALA 2028 ? ? ? A . A 1 2029 PRO 2029 ? ? ? A . A 1 2030 ALA 2030 ? ? ? A . A 1 2031 THR 2031 ? ? ? A . A 1 2032 ARG 2032 ? ? ? A . A 1 2033 VAL 2033 ? ? ? A . A 1 2034 LEU 2034 ? ? ? A . A 1 2035 PRO 2035 ? ? ? A . A 1 2036 SER 2036 ? ? ? A . A 1 2037 PRO 2037 ? ? ? A . A 1 2038 ALA 2038 ? ? ? A . A 1 2039 ARG 2039 ? ? ? A . A 1 2040 PRO 2040 ? ? ? A . 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Nuclear factor interleukin-3-regulated protein {PDB ID=8k89, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=8k89.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8k89, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-07-09 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-07-04 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GEFMPDEKKDAMYWEKRRKNNEAAKRSREKRRLNDLVLENKLIALGEENATLKAELLSLKLKFGLISSTA YAQEMQKLSNSTAVYFQDYQTSKSNVSS ; ;GEFMPDEKKDAMYWEKRRKNNEAAKRSREKRRLNDLVLENKLIALGEENATLKAELLSLKLKFGLISSTA YAQEMQKLSNSTAVYFQDYQTSKSNVSS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 38 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8k89 2024-11-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2157 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2157 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 110.000 25.806 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSDRSGPTAKGKDGKKYSSLNLFDTYKGKSLEIQKPAVAPRHGLQSLGKVAIARRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVSLVPKDGTGWASKQEQSDPKSSDASTAQPPESQPLPASQTPASNQPKRPPAAPENTPLVPSGVKSWAQASVTHGAHGDGGRASSLLSRFSREEFPTLQAAGDQDKAAKERESAEQSSGPGPSLRPQNSTTWRDGGGRGPDELEGPDSKLHHGHDPRGGLQPSGPPQFPPYRGMMPPFMYPPYLPFPPPYGPQGPYRYPTPDGPSRFPRVAGPRGSGPPMRLVEPVGRPSILKEDNLKEFDQLDQENDDGWAGAHEEVDYTEKLKFSDEEDGRDSDEEGAEGHRDSQSASGEERPPEADGKKGNSPNSEPPTPKTAWAETSRPPETEPGPPAPKPPLPPPHRGPAGNWGPPGDYPDRGGPPCKPPAPEDEDEAWRQRRKQSSSEISLAVERARRRREEEERRMQEERRAACAEKLKRLDEKFGAPDKRLKAEPAAPPAAPSTPAPPPAVPKELPAPPAPPPASAPTPETEPEEPAQAPPAQSTPTPGVAAAPTLVSGGGSTSSTSSGSFEASPVEPQLPSKEGPEPPEEVPPPTTPPVPKVEPKGDGIGPTRQPPSQGLGYPKYQKSLPPRFQRQQQEQLLKQQQQHQWQQHQQGSAPPTPVPPSPPQPVTLGAVPAPQAPPPPPKALYPGALGRPPPMPPMNFDPRWMMIPPYVDPRLLQGRPPLDFYPPGVHPSGLVPRERSDSGGSSSEPFDRHAPAMLRERGTPPVDPKLAWVGDVFTATPAEPRPLTSPLRQAADEDDKGMRSETPPVPPPPPYLASYPGFPENGAPGPPISRFPLEEPGPRPLPWPPGSDEVAKIQTPPPKKEPPKEETAQLTGPEAGRKPARGVGSGGQGPPPPRRESRTETRWGPRPGSSRRGIPPEEPGAPPRRAGPIKKPPPPTKVEELPPKPLEQGDETPKPPKPDPLKITKGKLGGPKETPPNGNLSPAPRLRRDYSYERVGPTSCRGRGRGEYFARGRGFRGTYGGRGRGARSREFRSYREFRGDDGRGGGTGGPNHPPAPRGRTASETRSEGSEYEEIPKRRRQRGSETGSETHESDLAPSDKEAPTPKEGTLTQVPLAPPPPGAPPSPAPARFTARGGRVFTPRGVPSRRGRGGGRPPPQVCPGWSPPAKSLAPKKPPTGPLPPSKEPLKEKLIPGPLSPVARGGSNGGSNVGMEDGERPRRRRHGRAQQQDKPPRFRRLKQERENAARGSEGKPSLTLPASAPGPEEALTTVTVAPAPRRAAAKSPDLSNQNSDQANEEWETASESSDFTSERRGDKEAPPPVLLTPKAVGTPGGGGGGAVPGISAMSRGDLSQRAKDLSKRSFSSQRPGMERQNRRPGPGGKAGSSGSSSGGGGGGPGGRTGPGRGDKRSWPSPKNRSRPPEERPPGLPLPPPPPSSSAVFRLDQVIHSNPAGIQQALAQLSSRQGSVTAPGGHPRHKPGLPQAPQGPSPRPPTRYEPQRVNSGLSSDPHFEEPGPMVRGVGGTPRDSAGVSPFPPKRRERPPRKPELLQEESLPPPHSSGFLGSKPEGPGPQAESRDTGTEALTPHIWNRLHTATSRKSYRPSSMEPWMEPLSPFEDVAGTEMSQSDSGVDLSGDSQVSSGPCSQRSSPDGGLKGAAEGPPKRPGGSSPLNAVPCEGPPGSEPPRRPPPAPHDGDRKELPREQPLPPGPIGTERSQRTDRGTEPGPIRPSHRPGPPVQFGTSDKDSDLRLVVGDSLKAEKELTASVTEAIPVSRDWELLPSAAASAEPQSKNLDSGHCVPEPSSSGQRLYPEVFYGSAGPSSSQISGGAMDSQLHPNSGGFRPGTPSLHPYRSQPLYLPPGPAPPSALLSGLALKGQFLDFSTMQATELGKLPAGGVLYPPPSFLYSPAFCPSPLPDTSLLQVRQDLPSPSDFYSTPLQPGGQSGFLPSGAPAQQMLLPMVDSQLPVVNFGSLPPAPPPAPPPLSLLPVGPALQPPSLAVRPPPAPATRVLPSPARPFPASLGRAELHPVELKPFQDYQKLSSNLGGPGSSRTPPTGRSFSGLNSRLKATPSTYSGVFRTQRVDLYQQASPPDALRWIPKPWERTGPPPREGPSRRAEEPGSRGDKEPGLPPPR 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KKDAMYWEKRRKN-----NEAAKRSREKRRLNDLVL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.101}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8k89.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 444 444 ? A 9.822 63.990 6.242 1 1 A ASP 0.480 1 ATOM 2 C CA . ASP 444 444 ? A 9.209 65.326 6.583 1 1 A ASP 0.480 1 ATOM 3 C C . ASP 444 444 ? A 9.228 65.557 8.064 1 1 A ASP 0.480 1 ATOM 4 O O . ASP 444 444 ? A 10.075 64.994 8.754 1 1 A ASP 0.480 1 ATOM 5 C CB . ASP 444 444 ? A 7.770 65.372 6.016 1 1 A ASP 0.480 1 ATOM 6 C CG . ASP 444 444 ? A 7.884 65.242 4.502 1 1 A ASP 0.480 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 444 444 ? A 9.053 65.170 4.034 1 1 A ASP 0.480 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 444 444 ? A 6.840 65.124 3.840 1 1 A ASP 0.480 1 ATOM 9 N N . GLU 445 445 ? A 8.270 66.340 8.590 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 10 C CA . GLU 445 445 ? A 8.005 66.449 10.004 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 11 C C . GLU 445 445 ? A 7.324 65.187 10.535 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 12 O O . GLU 445 445 ? A 7.477 64.823 11.696 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 13 C CB . GLU 445 445 ? A 7.168 67.713 10.270 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 14 C CG . GLU 445 445 ? A 7.927 69.026 9.946 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 15 C CD . GLU 445 445 ? A 7.113 70.287 10.249 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 16 O OE1 . GLU 445 445 ? A 5.939 70.163 10.676 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 17 O OE2 . GLU 445 445 ? A 7.689 71.386 10.049 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 18 N N . ASP 446 446 ? A 6.638 64.399 9.675 1 1 A ASP 0.580 1 ATOM 19 C CA . ASP 446 446 ? A 5.986 63.160 10.074 1 1 A ASP 0.580 1 ATOM 20 C C . ASP 446 446 ? A 6.940 62.117 10.638 1 1 A ASP 0.580 1 ATOM 21 O O . ASP 446 446 ? A 6.659 61.422 11.624 1 1 A ASP 0.580 1 ATOM 22 C CB . ASP 446 446 ? A 5.148 62.596 8.902 1 1 A ASP 0.580 1 ATOM 23 C CG . ASP 446 446 ? A 3.950 63.499 8.642 1 1 A ASP 0.580 1 ATOM 24 O OD1 . ASP 446 446 ? A 3.656 64.359 9.510 1 1 A ASP 0.580 1 ATOM 25 O OD2 . ASP 446 446 ? A 3.326 63.330 7.569 1 1 A ASP 0.580 1 ATOM 26 N N . GLU 447 447 ? A 8.149 62.053 10.056 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 27 C CA . GLU 447 447 ? A 9.213 61.193 10.520 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 28 C C . GLU 447 447 ? A 9.839 61.724 11.805 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 29 O O . GLU 447 447 ? A 10.287 60.946 12.642 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 30 C CB . GLU 447 447 ? A 10.278 60.913 9.430 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 31 C CG . GLU 447 447 ? A 9.735 60.129 8.203 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 32 C CD . GLU 447 447 ? A 9.258 58.712 8.544 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 33 O OE1 . GLU 447 447 ? A 10.023 57.922 9.167 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 34 O OE2 . GLU 447 447 ? A 8.101 58.396 8.184 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 35 N N . ALA 448 448 ? A 9.817 63.055 12.054 1 1 A ALA 0.650 1 ATOM 36 C CA . ALA 448 448 ? A 10.255 63.654 13.304 1 1 A ALA 0.650 1 ATOM 37 C C . ALA 448 448 ? A 9.395 63.191 14.478 1 1 A ALA 0.650 1 ATOM 38 O O . ALA 448 448 ? A 9.883 62.807 15.542 1 1 A ALA 0.650 1 ATOM 39 C CB . ALA 448 448 ? A 10.223 65.198 13.213 1 1 A ALA 0.650 1 ATOM 40 N N . TRP 449 449 ? A 8.063 63.152 14.284 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 41 C CA . TRP 449 449 ? A 7.135 62.612 15.262 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 42 C C . TRP 449 449 ? A 7.254 61.116 15.479 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 43 O O . TRP 449 449 ? A 7.101 60.622 16.600 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 44 C CB . TRP 449 449 ? A 5.683 63.005 14.939 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 45 C CG . TRP 449 449 ? A 5.495 64.503 14.966 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 46 C CD1 . TRP 449 449 ? A 5.276 65.361 13.927 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 47 C CD2 . TRP 449 449 ? A 5.632 65.323 16.142 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 48 N NE1 . TRP 449 449 ? A 5.302 66.663 14.366 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 49 C CE2 . TRP 449 449 ? A 5.509 66.656 15.725 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 50 C CE3 . TRP 449 449 ? A 5.854 65.003 17.480 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 51 C CZ2 . TRP 449 449 ? A 5.598 67.695 16.639 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 52 C CZ3 . TRP 449 449 ? A 5.916 66.053 18.405 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 53 C CH2 . TRP 449 449 ? A 5.790 67.381 17.992 1 1 A TRP 0.480 1 ATOM 54 N N . ARG 450 450 ? A 7.548 60.342 14.421 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 55 C CA . ARG 450 450 ? A 7.931 58.946 14.523 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 56 C C . ARG 450 450 ? A 9.206 58.721 15.328 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 57 O O . ARG 450 450 ? A 9.267 57.817 16.160 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 58 C CB . ARG 450 450 ? A 8.133 58.363 13.112 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 59 C CG . ARG 450 450 ? A 8.521 56.877 13.054 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 60 C CD . ARG 450 450 ? A 9.127 56.538 11.701 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 61 N NE . ARG 450 450 ? A 9.554 55.112 11.765 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 62 C CZ . ARG 450 450 ? A 10.166 54.537 10.725 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 63 N NH1 . ARG 450 450 ? A 10.415 55.222 9.612 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 64 N NH2 . ARG 450 450 ? A 10.514 53.253 10.808 1 1 A ARG 0.520 1 ATOM 65 N N . GLN 451 451 ? A 10.249 59.551 15.122 1 1 A GLN 0.570 1 ATOM 66 C CA . GLN 451 451 ? A 11.475 59.532 15.903 1 1 A GLN 0.570 1 ATOM 67 C C . GLN 451 451 ? A 11.234 59.831 17.362 1 1 A GLN 0.570 1 ATOM 68 O O . GLN 451 451 ? A 11.766 59.164 18.250 1 1 A GLN 0.570 1 ATOM 69 C CB . GLN 451 451 ? A 12.508 60.532 15.348 1 1 A GLN 0.570 1 ATOM 70 C CG . GLN 451 451 ? A 13.091 60.078 13.998 1 1 A GLN 0.570 1 ATOM 71 C CD . GLN 451 451 ? 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A 19.367 45.579 44.975 1 1 A MET 0.380 1 ATOM 310 O OXT . MET 478 478 ? A 15.194 44.236 47.684 1 1 A MET 0.380 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.542 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 444 ASP 1 0.480 2 1 A 445 GLU 1 0.470 3 1 A 446 ASP 1 0.580 4 1 A 447 GLU 1 0.580 5 1 A 448 ALA 1 0.650 6 1 A 449 TRP 1 0.480 7 1 A 450 ARG 1 0.520 8 1 A 451 GLN 1 0.570 9 1 A 452 ARG 1 0.490 10 1 A 453 ARG 1 0.490 11 1 A 454 LYS 1 0.530 12 1 A 455 GLN 1 0.520 13 1 A 456 SER 1 0.480 14 1 A 457 SER 1 0.460 15 1 A 458 SER 1 0.430 16 1 A 459 GLU 1 0.400 17 1 A 460 ILE 1 0.420 18 1 A 461 SER 1 0.500 19 1 A 462 LEU 1 0.490 20 1 A 463 ALA 1 0.570 21 1 A 464 VAL 1 0.580 22 1 A 465 GLU 1 0.560 23 1 A 466 ARG 1 0.570 24 1 A 467 ALA 1 0.710 25 1 A 468 ARG 1 0.590 26 1 A 469 ARG 1 0.600 27 1 A 470 ARG 1 0.610 28 1 A 471 ARG 1 0.600 29 1 A 472 GLU 1 0.670 30 1 A 473 GLU 1 0.650 31 1 A 474 GLU 1 0.630 32 1 A 475 GLU 1 0.630 33 1 A 476 ARG 1 0.570 34 1 A 477 ARG 1 0.500 35 1 A 478 MET 1 0.380 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #