data_SMR-d50adf0f545ccf6d44813af7fd7cdefe_19 _entry.id SMR-d50adf0f545ccf6d44813af7fd7cdefe_19 _struct.entry_id SMR-d50adf0f545ccf6d44813af7fd7cdefe_19 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q86UP2/ KTN1_HUMAN, Kinectin Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q86UP2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.4 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 180950.904 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP KTN1_HUMAN Q86UP2 1 ;MEFYESAYFIVLIPSIVITVIFLFFWLFMKETLYDEVLAKQKREQKLIPTKTDKKKAEKKKNKKKEIQNG NLHESDSESVPRDFKLSDALAVEDDQVAPVPLNVVETSSSVRERKKKEKKQKPVLEEQVIKESDASKIPG KKVEPVPVTKQPTPPSEAAASKKKPGQKKSKNGSDDQDKKVETLMVPSKRQEALPLHQETKQESGSGKKK ASSKKQKTENVFVDEPLIHATTYIPLMDNADSSPVVDKREVIDLLKPDQVEGIQKSGTKKLKTETDKENA EVKFKDFLLSLKTMMFSEDEALCVVDLLKEKSGVIQDALKKSSKGELTTLIHQLQEKDKLLAAVKEDAAA TKDRCKQLTQEMMTEKERSNVVITRMKDRIGTLEKEHNVFQNKIHVSYQETQQMQMKFQQVREQMEAEIA HLKQENGILRDAVSNTTNQLESKQSAELNKLRQDYARLVNELTEKTGKLQQEEVQKKNAEQAATQLKVQL QEAERRWEEVQSYIRKRTAEHEAAQQDLQSKFVAKENEVQSLHSKLTDTLVSKQQLEQRLMQLMESEQKR VNKEESLQMQVQDILEQNEALKAQIQQFHSQIAAQTSASVLAEELHKVIAEKDKQIKQTEDSLASERDRL TSKEEELKDIQNMNFLLKAEVQKLQALANEQAAAAHELEKMQQSVYVKDDKIRLLEEQLQHEISNKMEEF KILNDQNKALKSEVQKLQTLVSEQPNKDVVEQMEKCIQEKDEKLKTVEELLETGLIQVATKEEELNAIRT ENSSLTKEVQDLKAKQNDQVSFASLVEELKKVIHEKDGKIKSVEELLEAELLKVANKEKTVQDLKQEIKA LKEEIGNVQLEKAQQLSITSKVQELQNLLKGKEEQMNTMKAVLEEKEKDLANTGKWLQDLQEENESLKAH VQEVAQHNLKEASSASQFEELEIVLKEKENELKRLEAMLKERESDLSSKTQLLQDVQDENKLFKSQIEQL KQQNYQQASSFPPHEELLKVISEREKEISGLWNELDSLKDAVEHQRKKNNDLREKNWEAMEALASTEKML QDKVNKTSKERQQQVEAVELEAKEVLKKLFPKVSVPSNLSYGEWLHGFEKKAKECMAGTSGSEEVKVLEH KLKEADEMHTLLQLECEKYKSVLAETEGILQKLQRSVEQEENKWKVKVDESHKTIKQMQSSFTSSEQELE RLRSENKDIENLRREREHLEMELEKAEMERSTYVTEVRELKDLLTELQKKLDDSYSEAVRQNEELNLLKA QLNETLTKLRTEQNERQKVAGDLHKAQQSLELIQSKIVKAAGDTTVIENSDVSPETESSEKETMSVSLNQ TVTQLQQLLQAVNQQLTKEKEHYQVLE ; Kinectin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1357 1 1357 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . KTN1_HUMAN Q86UP2 . 1 1357 9606 'Homo sapiens (Human)' 2003-06-01 971FCDF8AA8FC88E . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no G ;MEFYESAYFIVLIPSIVITVIFLFFWLFMKETLYDEVLAKQKREQKLIPTKTDKKKAEKKKNKKKEIQNG NLHESDSESVPRDFKLSDALAVEDDQVAPVPLNVVETSSSVRERKKKEKKQKPVLEEQVIKESDASKIPG KKVEPVPVTKQPTPPSEAAASKKKPGQKKSKNGSDDQDKKVETLMVPSKRQEALPLHQETKQESGSGKKK ASSKKQKTENVFVDEPLIHATTYIPLMDNADSSPVVDKREVIDLLKPDQVEGIQKSGTKKLKTETDKENA EVKFKDFLLSLKTMMFSEDEALCVVDLLKEKSGVIQDALKKSSKGELTTLIHQLQEKDKLLAAVKEDAAA TKDRCKQLTQEMMTEKERSNVVITRMKDRIGTLEKEHNVFQNKIHVSYQETQQMQMKFQQVREQMEAEIA HLKQENGILRDAVSNTTNQLESKQSAELNKLRQDYARLVNELTEKTGKLQQEEVQKKNAEQAATQLKVQL QEAERRWEEVQSYIRKRTAEHEAAQQDLQSKFVAKENEVQSLHSKLTDTLVSKQQLEQRLMQLMESEQKR VNKEESLQMQVQDILEQNEALKAQIQQFHSQIAAQTSASVLAEELHKVIAEKDKQIKQTEDSLASERDRL 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ILE . 1 68 GLN . 1 69 ASN . 1 70 GLY . 1 71 ASN . 1 72 LEU . 1 73 HIS . 1 74 GLU . 1 75 SER . 1 76 ASP . 1 77 SER . 1 78 GLU . 1 79 SER . 1 80 VAL . 1 81 PRO . 1 82 ARG . 1 83 ASP . 1 84 PHE . 1 85 LYS . 1 86 LEU . 1 87 SER . 1 88 ASP . 1 89 ALA . 1 90 LEU . 1 91 ALA . 1 92 VAL . 1 93 GLU . 1 94 ASP . 1 95 ASP . 1 96 GLN . 1 97 VAL . 1 98 ALA . 1 99 PRO . 1 100 VAL . 1 101 PRO . 1 102 LEU . 1 103 ASN . 1 104 VAL . 1 105 VAL . 1 106 GLU . 1 107 THR . 1 108 SER . 1 109 SER . 1 110 SER . 1 111 VAL . 1 112 ARG . 1 113 GLU . 1 114 ARG . 1 115 LYS . 1 116 LYS . 1 117 LYS . 1 118 GLU . 1 119 LYS . 1 120 LYS . 1 121 GLN . 1 122 LYS . 1 123 PRO . 1 124 VAL . 1 125 LEU . 1 126 GLU . 1 127 GLU . 1 128 GLN . 1 129 VAL . 1 130 ILE . 1 131 LYS . 1 132 GLU . 1 133 SER . 1 134 ASP . 1 135 ALA . 1 136 SER . 1 137 LYS . 1 138 ILE . 1 139 PRO . 1 140 GLY . 1 141 LYS . 1 142 LYS . 1 143 VAL . 1 144 GLU . 1 145 PRO . 1 146 VAL . 1 147 PRO . 1 148 VAL . 1 149 THR . 1 150 LYS . 1 151 GLN . 1 152 PRO . 1 153 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A 1 1271 THR 1271 ? ? ? G . A 1 1272 GLU 1272 ? ? ? G . A 1 1273 GLN 1273 ? ? ? G . A 1 1274 ASN 1274 ? ? ? G . A 1 1275 GLU 1275 ? ? ? G . A 1 1276 ARG 1276 ? ? ? G . A 1 1277 GLN 1277 ? ? ? G . A 1 1278 LYS 1278 ? ? ? G . A 1 1279 VAL 1279 ? ? ? G . A 1 1280 ALA 1280 ? ? ? G . A 1 1281 GLY 1281 ? ? ? G . A 1 1282 ASP 1282 ? ? ? G . A 1 1283 LEU 1283 ? ? ? G . A 1 1284 HIS 1284 ? ? ? G . A 1 1285 LYS 1285 ? ? ? G . A 1 1286 ALA 1286 ? ? ? G . A 1 1287 GLN 1287 ? ? ? G . A 1 1288 GLN 1288 ? ? ? G . A 1 1289 SER 1289 ? ? ? G . A 1 1290 LEU 1290 ? ? ? G . A 1 1291 GLU 1291 ? ? ? G . A 1 1292 LEU 1292 ? ? ? G . A 1 1293 ILE 1293 ? ? ? G . A 1 1294 GLN 1294 ? ? ? G . A 1 1295 SER 1295 ? ? ? G . A 1 1296 LYS 1296 ? ? ? G . A 1 1297 ILE 1297 ? ? ? G . A 1 1298 VAL 1298 ? ? ? G . A 1 1299 LYS 1299 ? ? ? G . A 1 1300 ALA 1300 ? ? ? G . A 1 1301 ALA 1301 ? ? ? G . A 1 1302 GLY 1302 ? ? ? G . A 1 1303 ASP 1303 ? ? ? G . A 1 1304 THR 1304 ? ? ? G . A 1 1305 THR 1305 ? ? ? G . A 1 1306 VAL 1306 ? ? ? G . A 1 1307 ILE 1307 ? ? ? G . A 1 1308 GLU 1308 ? ? ? G . A 1 1309 ASN 1309 ? ? ? G . A 1 1310 SER 1310 ? ? ? G . A 1 1311 ASP 1311 ? ? ? G . A 1 1312 VAL 1312 ? ? ? G . A 1 1313 SER 1313 ? ? ? G . A 1 1314 PRO 1314 ? ? ? G . A 1 1315 GLU 1315 ? ? ? G . A 1 1316 THR 1316 ? ? ? G . A 1 1317 GLU 1317 ? ? ? G . A 1 1318 SER 1318 ? ? ? G . A 1 1319 SER 1319 ? ? ? G . A 1 1320 GLU 1320 ? ? ? G . A 1 1321 LYS 1321 ? ? ? G . A 1 1322 GLU 1322 ? ? ? G . A 1 1323 THR 1323 ? ? ? G . A 1 1324 MET 1324 ? ? ? G . A 1 1325 SER 1325 ? ? ? G . A 1 1326 VAL 1326 ? ? ? G . A 1 1327 SER 1327 ? ? ? G . A 1 1328 LEU 1328 ? ? ? G . A 1 1329 ASN 1329 ? ? ? G . A 1 1330 GLN 1330 ? ? ? G . A 1 1331 THR 1331 ? ? ? G . A 1 1332 VAL 1332 ? ? ? G . A 1 1333 THR 1333 ? ? ? G . A 1 1334 GLN 1334 ? ? ? G . A 1 1335 LEU 1335 ? ? ? G . A 1 1336 GLN 1336 ? ? ? G . A 1 1337 GLN 1337 ? ? ? G . A 1 1338 LEU 1338 ? ? ? G . A 1 1339 LEU 1339 ? ? ? G . A 1 1340 GLN 1340 ? ? ? G . A 1 1341 ALA 1341 ? ? ? G . A 1 1342 VAL 1342 ? ? ? G . A 1 1343 ASN 1343 ? ? ? G . A 1 1344 GLN 1344 ? ? ? G . A 1 1345 GLN 1345 ? ? ? G . A 1 1346 LEU 1346 ? ? ? G . A 1 1347 THR 1347 ? ? ? G . A 1 1348 LYS 1348 ? ? ? G . A 1 1349 GLU 1349 ? ? ? G . A 1 1350 LYS 1350 ? ? ? G . A 1 1351 GLU 1351 ? ? ? G . A 1 1352 HIS 1352 ? ? ? G . A 1 1353 TYR 1353 ? ? ? G . A 1 1354 GLN 1354 ? ? ? G . A 1 1355 VAL 1355 ? ? ? G . A 1 1356 LEU 1356 ? ? ? G . A 1 1357 GLU 1357 ? ? ? G . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Capsular biosynthesis protein {PDB ID=8tun, label_asym_id=G, auth_asym_id=G, SMTL ID=8tun.1.G}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8tun, label_asym_id=G' 'target-template alignment' . 4 'model 19' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-07-16 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-07-11 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A G 3 1 G # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MGKIHMKLVSRLTAKRLQWALVYLPMLVATVYFLVFSADRYVSESVITVRQTSSNAPTGGMSGAALLLAG LTPASREDTCYLQTYIHSMGLLQKLDQQLKLREHFGTPLRDPLFRLWGGTSQEWFLEYYRSRVEVLMDDI CGLLTVRVQGFEPEFAQALNRAILEESERFVNELSHRMAREQGQFAEAELERATARLQEAKRQLIAFQAK HKLLDPLAQAQATGTLTAELQAALTRQEAELRNALTYLNEDSYQVKALRSQINALRQQIDEERLRATAGK NGDRINAVAAEFHDLQLQVGFAEDAYKLALAAVESARIEATRKLKSLVVVEPPVLPEIAEYPRRWYNLAT LLVVCCLIYGVVSLVVATIRDHQDGSGSGSHHHHHHHHHH ; ;MGKIHMKLVSRLTAKRLQWALVYLPMLVATVYFLVFSADRYVSESVITVRQTSSNAPTGGMSGAALLLAG LTPASREDTCYLQTYIHSMGLLQKLDQQLKLREHFGTPLRDPLFRLWGGTSQEWFLEYYRSRVEVLMDDI CGLLTVRVQGFEPEFAQALNRAILEESERFVNELSHRMAREQGQFAEAELERATARLQEAKRQLIAFQAK HKLLDPLAQAQATGTLTAELQAALTRQEAELRNALTYLNEDSYQVKALRSQINALRQQIDEERLRATAGK NGDRINAVAAEFHDLQLQVGFAEDAYKLALAAVESARIEATRKLKSLVVVEPPVLPEIAEYPRRWYNLAT LLVVCCLIYGVVSLVVATIRDHQDGSGSGSHHHHHHHHHH ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 147 274 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8tun 2024-10-30 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1357 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1358 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 29.000 13.386 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEFYESAYFIVLIPSIVITVIFLFFWLFMKETLYDEVLAKQKREQKLIPTKTDKKKAEKKKNKKKEIQNGNLHESDSESVPRDFKLSDALAVEDDQVAPVPLNVVETSSSVRERKKKEKKQKPVLEEQVIKESDASKIPGKKVEPVPVTKQPTPPSEAAASKKKPGQKKSKNGSDDQDKKVETLMVPSKRQEALPLHQETKQESGSGKKKASSKKQKTENVFVDEPLIHATTYIPLMDNADSSPVVDKREVIDLLKPDQVEGIQKSGTKKLKTETDKENAEVKFKDFLLSLKTMMFSEDEALCVVDLLKEKSGVIQDALKKSSKGE-LTTLIHQLQEKDKLLAAVKEDAAATKDRCKQLTQEMMTEKERSNVVITRMKDRIGTLEKEHNVFQNKIHVSYQETQQMQMKFQQVREQMEAEIAHLKQENGILRDAVSNTTNQLESKQSAELNKLRQDYARLVNELTEKTGKLQQEEVQKKNAEQAATQLKVQLQEAERRWEEVQSYIRKRTAEHEAAQQDLQSKFVAKENEVQSLHSKLTDTLVSKQQLEQRLMQLMESEQKRVNKEESLQMQVQDILEQNEALKAQIQQFHSQIAAQTSASVLAEELHKVIAEKDKQIKQTEDSLASERDRLTSKEEELKDIQNMNFLLKAEVQKLQALANEQAAAAHELEKMQQSVYVKDDKIRLLEEQLQHEISNKMEEFKILNDQNKALKSEVQKLQTLVSEQPNKDVVEQMEKCIQEKDEKLKTVEELLETGLIQVATKEEELNAIRTENSSLTKEVQDLKAKQNDQVSFASLVEELKKVIHEKDGKIKSVEELLEAELLKVANKEKTVQDLKQEIKALKEEIGNVQLEKAQQLSITSKVQELQNLLKGKEEQMNTMKAVLEEKEKDLANTGKWLQDLQEENESLKAHVQEVAQHNLKEASSASQFEELEIVLKEKENELKRLEAMLKERESDLSSKTQLLQDVQDENKLFKSQIEQLKQQNYQQASSFPPHEELLKVISEREKEISGLWNELDSLKDAVEHQRKKNNDLREKNWEAMEALASTEKMLQDKVNKTSKERQQQVEAVELEAKEVLKKLFPKVSVPSNLSYGEWLHGFEKKAKECMAGTSGSEEVKVLEHKLKEADEMHTLLQLECEKYKSVLAETEGILQKLQRSVEQEENKWKVKVDESHKTIKQMQSSFTSSEQELERLRSENKDIENLRREREHLEMELEKAEMERSTYVTEVRELKDLLTELQKKLDDSYSEAVRQNEELNLLKAQLNETLTKLRTEQNERQKVAGDLHKAQQSLELIQSKIVKAAGDTTVIENSDVSPETESSEKETMSVSLNQTVTQLQQLLQAVNQQLTKEKEHYQVLE 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RVQGFEPEFAQALNRAILEESERFVNELSHRMAREQGQFAEAELERATARLQEAKRQLIAFQAKHKLLDPL--AQAQATGTLTAELQAALTRQEAELRNALTYLNEDSYQVKALRSQINALRQQIDEERL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8tun.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 19' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 217.818 226.623 167.396 1 1 G THR 0.680 1 ATOM 15 O OG1 . THR 293 293 ? A 217.598 225.461 166.613 1 1 G THR 0.680 1 ATOM 16 C CG2 . THR 293 293 ? A 219.340 226.823 167.451 1 1 G THR 0.680 1 ATOM 17 N N . MET 294 294 ? A 218.459 227.775 170.309 1 1 G MET 0.430 1 ATOM 18 C CA . MET 294 294 ? A 218.747 228.862 171.209 1 1 G MET 0.430 1 ATOM 19 C C . MET 294 294 ? A 219.979 229.572 170.723 1 1 G MET 0.430 1 ATOM 20 O O . MET 294 294 ? A 220.865 228.949 170.137 1 1 G MET 0.430 1 ATOM 21 C CB . MET 294 294 ? A 219.068 228.317 172.622 1 1 G MET 0.430 1 ATOM 22 C CG . MET 294 294 ? A 217.884 227.570 173.265 1 1 G MET 0.430 1 ATOM 23 S SD . MET 294 294 ? A 216.397 228.599 173.495 1 1 G MET 0.430 1 ATOM 24 C CE . MET 294 294 ? A 217.085 229.640 174.817 1 1 G MET 0.430 1 ATOM 25 N N . MET 295 295 ? A 220.062 230.893 170.952 1 1 G MET 0.400 1 ATOM 26 C CA . MET 295 295 ? A 221.237 231.661 170.639 1 1 G MET 0.400 1 ATOM 27 C C . MET 295 295 ? A 221.186 232.941 171.443 1 1 G MET 0.400 1 ATOM 28 O O . MET 295 295 ? A 220.125 233.303 171.952 1 1 G MET 0.400 1 ATOM 29 C CB . MET 295 295 ? A 221.269 232.005 169.134 1 1 G MET 0.400 1 ATOM 30 C CG . MET 295 295 ? A 222.595 232.530 168.563 1 1 G MET 0.400 1 ATOM 31 S SD . MET 295 295 ? A 224.106 231.678 169.085 1 1 G MET 0.400 1 ATOM 32 C CE . MET 295 295 ? A 223.710 230.230 168.073 1 1 G MET 0.400 1 ATOM 33 N N . PHE 296 296 ? A 222.325 233.648 171.579 1 1 G PHE 0.440 1 ATOM 34 C CA . PHE 296 296 ? A 222.466 234.902 172.301 1 1 G PHE 0.440 1 ATOM 35 C C . PHE 296 296 ? A 222.041 236.122 171.483 1 1 G PHE 0.440 1 ATOM 36 O O . PHE 296 296 ? A 221.806 237.193 172.022 1 1 G PHE 0.440 1 ATOM 37 C CB . PHE 296 296 ? A 223.939 235.080 172.754 1 1 G PHE 0.440 1 ATOM 38 C CG . PHE 296 296 ? A 224.339 233.938 173.654 1 1 G PHE 0.440 1 ATOM 39 C CD1 . PHE 296 296 ? A 223.828 233.863 174.960 1 1 G PHE 0.440 1 ATOM 40 C CD2 . PHE 296 296 ? A 225.212 232.930 173.212 1 1 G PHE 0.440 1 ATOM 41 C CE1 . PHE 296 296 ? A 224.201 232.820 175.818 1 1 G PHE 0.440 1 ATOM 42 C CE2 . PHE 296 296 ? A 225.586 231.883 174.066 1 1 G PHE 0.440 1 ATOM 43 C CZ . PHE 296 296 ? A 225.087 231.833 175.373 1 1 G PHE 0.440 1 ATOM 44 N N . SER 297 297 ? A 221.898 235.963 170.150 1 1 G SER 0.640 1 ATOM 45 C CA . SER 297 297 ? A 221.319 236.961 169.269 1 1 G SER 0.640 1 ATOM 46 C C . SER 297 297 ? A 220.184 236.301 168.515 1 1 G SER 0.640 1 ATOM 47 O O . SER 297 297 ? A 220.302 235.165 168.048 1 1 G SER 0.640 1 ATOM 48 C CB . SER 297 297 ? A 222.350 237.557 168.270 1 1 G SER 0.640 1 ATOM 49 O OG . SER 297 297 ? A 221.761 238.536 167.407 1 1 G SER 0.640 1 ATOM 50 N N . GLU 298 298 ? A 219.033 236.996 168.405 1 1 G GLU 0.580 1 ATOM 51 C CA . GLU 298 298 ? A 217.819 236.536 167.752 1 1 G GLU 0.580 1 ATOM 52 C C . GLU 298 298 ? A 218.007 236.220 166.270 1 1 G GLU 0.580 1 ATOM 53 O O . GLU 298 298 ? 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A 219.319 223.722 163.888 1 1 G LEU 0.700 1 ATOM 132 C CD2 . LEU 308 308 ? A 220.985 222.413 162.493 1 1 G LEU 0.700 1 ATOM 133 N N . LYS 309 309 ? A 217.226 223.637 158.747 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 134 C CA . LYS 309 309 ? A 216.177 223.238 157.823 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 135 C C . LYS 309 309 ? A 216.648 222.985 156.405 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 136 O O . LYS 309 309 ? A 216.270 221.991 155.795 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 137 C CB . LYS 309 309 ? A 215.078 224.319 157.729 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 138 C CG . LYS 309 309 ? A 214.252 224.448 159.010 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 139 C CD . LYS 309 309 ? A 213.208 225.564 158.889 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 140 C CE . LYS 309 309 ? A 212.378 225.724 160.161 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 141 N NZ . LYS 309 309 ? A 211.473 226.882 160.016 1 1 G LYS 0.690 1 ATOM 142 N N . GLU 310 310 ? A 217.491 223.871 155.828 1 1 G GLU 0.660 1 ATOM 143 C CA . GLU 310 310 ? A 218.015 223.633 154.497 1 1 G GLU 0.660 1 ATOM 144 C C . GLU 310 310 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #