data_SMR-fd7bcda26876c10ffa08a3441b0a67fe_1 _entry.id SMR-fd7bcda26876c10ffa08a3441b0a67fe_1 _struct.entry_id SMR-fd7bcda26876c10ffa08a3441b0a67fe_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - E9PAV3/ NACAM_HUMAN, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries E9PAV3' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.4 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 243019.551 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NACAM_HUMAN E9PAV3 1 ;MPGEATETVPATEQELPQPQAETAVLPMSSALSVTAALGQPGPTLPPPCSPAPQQCPLSAANQASPFPSP STIASTPLEVPFPQSSSGTALPLGTAPEAPTFLPNLIGPPISPAALALASPMIAPTLKGTPSSSAPLALV ALAPHSVQKSSAFPPNLLTSPPSVAVAESGSVITLSAPIAPSEPKTNLNKVPSEVVPNPKGTPSPPCIVS TVPYHCVTPMASIQSGVASLPQTTPTTTLAIASPQVKDTTISSVLISPQNPGSLSLKGPVSPPAALSLST QSLPVVTSSQKTAGPNTPPDFPISLGSHLAPLHQSSFGSVQLLGQTGPSALSDPTVKTISVDHSSTGASY PSQRSVIPPLPSRNEVVPATVAAFPVVAPSVDKGPSTISSITCSPSGSLNVATSFSLSPTTSLILKSSPN ATYHYPLVAQMPVSSVGTTPLVVTNPCTIAAAPTTTFEVATCVSPPMSSGPISNIEPTSPAALVMAPVAP KEPSTQVATTLRIPVSPPLPDPEDLKNLPSSVLVKFPTQKDLQTVPASLEGAPFSPAQAGLTTKKDPTVL PLVQAAPKNSPSFQSTSSSPEIPLSPEATLAKKSLGEPLPIGKPASSMTSPLGVNSSASVIKTDSYAGPD SAGPLLKSSLITPTVAAFPLESADPAGVAPTTAKGTSTYTTTASPFLEGTVSLAPKNHPVKEGTLTTLPL VPTASENCPVAPSPQNTCAPLATLVLAPEIPKSVPSPSLPPAGTPPGTKKVDGISHTSALAPVASSPKEC PTEDSGASATASSKGTLTYLADSPSPLGVSVSPQTKRPPTKKGSAGPDTPIGNLSSPVSPVEASFLPENS LSFQGSKDSPATTHSPTPPSPKGAPTPSAVTPLSPKGVTLPPKETPTPSVVNLPFPKEGPATPAPKQAPA LSMTSSSPKKARATPAPKGIPASPSPKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKWAPTPPAATPPSPKGGPATP SPKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPTPPAVTPPSPKGSPAATPFPKGASTPPAATPPSPKGSPAAT PLPKGAPTTPAATLPSPKGGPATPSLKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPMPPAATPPSPKGGLATP PHKGAPTTPAATPPSPKGGLATPPPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPPPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPS PKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGPATPPP KGAPTPPAATPPSLKGGLATPPHKGAPNPAVVTPPSPKGGPATSPPKGAPTPPAATPPSPKGSPGTPPPK GAPTPPAVTPPSPKGTPTLPATTPSSKGGPTTPSSKEGPTPPAATPSHKGGPAMTPPSPKRGPAIPSPKG DPTSPAVIPLSPKKAPATPVTREGAATPSKGDLTPPAVTPVSLKKAPATSAPKGGPATPSSKGDPTLPAV TPPSPKEPPAPKQVATSSSPKKAPATPAPMGAPTLPAVIPSSPKEVPATPSSRRDPIAPTATLLSKKTPA TLAPKEALIPPAMTVPSPKKTPAIPTPKEAPATPSSKEASSPPAVTPSTYKGAPSPKELLIPPAVTSPSP KEAPTPPAVTPPSPEKGPATPAPKGTPTSPPVTPSSLKDSPTSPASVTCKMGATVPQASKGLPAKKGPTA LKEVLVAPAPESTPIITAPTRKGPQTKKSSATSPPICPDPSAKNGSKGPLSTVAPAPLLPVQKDSSKTAK GKDASHSPKGPLAPPESKASTPLTAAAFEKVLPKPESASVSAAPSPPVSLPLAPSPVPTLPPKQQFLPSS PGLVLESPSKPLAPADEDELLPLIPPEPISGGVPFQSVLVNMPTPKSAGIPVPTPSAKQPVTKNNKGSGT ESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIR KSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESE EEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM ; 'Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2078 1 2078 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . NACAM_HUMAN E9PAV3 . 1 2078 9606 'Homo sapiens (Human)' 2011-04-05 9A07C05D3F24C34B . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MPGEATETVPATEQELPQPQAETAVLPMSSALSVTAALGQPGPTLPPPCSPAPQQCPLSAANQASPFPSP STIASTPLEVPFPQSSSGTALPLGTAPEAPTFLPNLIGPPISPAALALASPMIAPTLKGTPSSSAPLALV ALAPHSVQKSSAFPPNLLTSPPSVAVAESGSVITLSAPIAPSEPKTNLNKVPSEVVPNPKGTPSPPCIVS TVPYHCVTPMASIQSGVASLPQTTPTTTLAIASPQVKDTTISSVLISPQNPGSLSLKGPVSPPAALSLST QSLPVVTSSQKTAGPNTPPDFPISLGSHLAPLHQSSFGSVQLLGQTGPSALSDPTVKTISVDHSSTGASY PSQRSVIPPLPSRNEVVPATVAAFPVVAPSVDKGPSTISSITCSPSGSLNVATSFSLSPTTSLILKSSPN ATYHYPLVAQMPVSSVGTTPLVVTNPCTIAAAPTTTFEVATCVSPPMSSGPISNIEPTSPAALVMAPVAP KEPSTQVATTLRIPVSPPLPDPEDLKNLPSSVLVKFPTQKDLQTVPASLEGAPFSPAQAGLTTKKDPTVL PLVQAAPKNSPSFQSTSSSPEIPLSPEATLAKKSLGEPLPIGKPASSMTSPLGVNSSASVIKTDSYAGPD SAGPLLKSSLITPTVAAFPLESADPAGVAPTTAKGTSTYTTTASPFLEGTVSLAPKNHPVKEGTLTTLPL VPTASENCPVAPSPQNTCAPLATLVLAPEIPKSVPSPSLPPAGTPPGTKKVDGISHTSALAPVASSPKEC PTEDSGASATASSKGTLTYLADSPSPLGVSVSPQTKRPPTKKGSAGPDTPIGNLSSPVSPVEASFLPENS LSFQGSKDSPATTHSPTPPSPKGAPTPSAVTPLSPKGVTLPPKETPTPSVVNLPFPKEGPATPAPKQAPA LSMTSSSPKKARATPAPKGIPASPSPKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKWAPTPPAATPPSPKGGPATP SPKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPTPPAVTPPSPKGSPAATPFPKGASTPPAATPPSPKGSPAAT PLPKGAPTTPAATLPSPKGGPATPSLKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPMPPAATPPSPKGGLATP PHKGAPTTPAATPPSPKGGLATPPPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPPPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPS PKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGPATPPP KGAPTPPAATPPSLKGGLATPPHKGAPNPAVVTPPSPKGGPATSPPKGAPTPPAATPPSPKGSPGTPPPK GAPTPPAVTPPSPKGTPTLPATTPSSKGGPTTPSSKEGPTPPAATPSHKGGPAMTPPSPKRGPAIPSPKG DPTSPAVIPLSPKKAPATPVTREGAATPSKGDLTPPAVTPVSLKKAPATSAPKGGPATPSSKGDPTLPAV TPPSPKEPPAPKQVATSSSPKKAPATPAPMGAPTLPAVIPSSPKEVPATPSSRRDPIAPTATLLSKKTPA TLAPKEALIPPAMTVPSPKKTPAIPTPKEAPATPSSKEASSPPAVTPSTYKGAPSPKELLIPPAVTSPSP 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KEPSTQVATTLRIPVSPPLPDPEDLKNLPSSVLVKFPTQKDLQTVPASLEGAPFSPAQAGLTTKKDPTVL PLVQAAPKNSPSFQSTSSSPEIPLSPEATLAKKSLGEPLPIGKPASSMTSPLGVNSSASVIKTDSYAGPD SAGPLLKSSLITPTVAAFPLESADPAGVAPTTAKGTSTYTTTASPFLEGTVSLAPKNHPVKEGTLTTLPL VPTASENCPVAPSPQNTCAPLATLVLAPEIPKSVPSPSLPPAGTPPGTKKVDGISHTSALAPVASSPKEC PTEDSGASATASSKGTLTYLADSPSPLGVSVSPQTKRPPTKKGSAGPDTPIGNLSSPVSPVEASFLPENS LSFQGSKDSPATTHSPTPPSPKGAPTPSAVTPLSPKGVTLPPKETPTPSVVNLPFPKEGPATPAPKQAPA LSMTSSSPKKARATPAPKGIPASPSPKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKWAPTPPAATPPSPKGGPATP SPKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPTPPAVTPPSPKGSPAATPFPKGASTPPAATPPSPKGSPAAT PLPKGAPTTPAATLPSPKGGPATPSLKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPMPPAATPPSPKGGLATP PHKGAPTTPAATPPSPKGGLATPPPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPPPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPS PKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGPATPPP KGAPTPPAATPPSLKGGLATPPHKGAPNPAVVTPPSPKGGPATSPPKGAPTPPAATPPSPKGSPGTPPPK GAPTPPAVTPPSPKGTPTLPATTPSSKGGPTTPSSKEGPTPPAATPSHKGGPAMTPPSPKRGPAIPSPKG DPTSPAVIPLSPKKAPATPVTREGAATPSKGDLTPPAVTPVSLKKAPATSAPKGGPATPSSKGDPTLPAV 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A 1 1941 LYS 1941 1941 LYS LYS A . A 1 1942 ALA 1942 1942 ALA ALA A . A 1 1943 MET 1943 1943 MET MET A . A 1 1944 SER 1944 1944 SER SER A . A 1 1945 LYS 1945 1945 LYS LYS A . A 1 1946 LEU 1946 1946 LEU LEU A . A 1 1947 GLY 1947 1947 GLY GLY A . A 1 1948 LEU 1948 1948 LEU LEU A . A 1 1949 ARG 1949 1949 ARG ARG A . A 1 1950 GLN 1950 1950 GLN GLN A . A 1 1951 VAL 1951 1951 VAL VAL A . A 1 1952 THR 1952 1952 THR THR A . A 1 1953 GLY 1953 1953 GLY GLY A . A 1 1954 VAL 1954 1954 VAL VAL A . A 1 1955 THR 1955 1955 THR THR A . A 1 1956 ARG 1956 1956 ARG ARG A . A 1 1957 VAL 1957 1957 VAL VAL A . A 1 1958 THR 1958 1958 THR THR A . A 1 1959 ILE 1959 1959 ILE ILE A . A 1 1960 ARG 1960 1960 ARG ARG A . A 1 1961 LYS 1961 1961 LYS LYS A . A 1 1962 SER 1962 1962 SER SER A . A 1 1963 LYS 1963 1963 LYS LYS A . A 1 1964 ASN 1964 1964 ASN ASN A . A 1 1965 ILE 1965 1965 ILE ILE A . A 1 1966 LEU 1966 1966 LEU LEU A . A 1 1967 PHE 1967 1967 PHE PHE A . A 1 1968 VAL 1968 1968 VAL VAL A . A 1 1969 ILE 1969 1969 ILE ILE A . A 1 1970 THR 1970 1970 THR THR A . A 1 1971 LYS 1971 1971 LYS LYS A . A 1 1972 PRO 1972 1972 PRO PRO A . A 1 1973 ASP 1973 1973 ASP ASP A . A 1 1974 VAL 1974 1974 VAL VAL A . A 1 1975 TYR 1975 1975 TYR TYR A . A 1 1976 LYS 1976 1976 LYS LYS A . A 1 1977 SER 1977 1977 SER SER A . A 1 1978 PRO 1978 1978 PRO PRO A . A 1 1979 ALA 1979 1979 ALA ALA A . A 1 1980 SER 1980 1980 SER SER A . A 1 1981 ASP 1981 1981 ASP ASP A . A 1 1982 THR 1982 1982 THR THR A . A 1 1983 TYR 1983 1983 TYR TYR A . A 1 1984 ILE 1984 1984 ILE ILE A . A 1 1985 VAL 1985 1985 VAL VAL A . A 1 1986 PHE 1986 1986 PHE PHE A . A 1 1987 GLY 1987 1987 GLY GLY A . A 1 1988 GLU 1988 1988 GLU GLU A . A 1 1989 ALA 1989 1989 ALA ALA A . A 1 1990 LYS 1990 1990 LYS LYS A . A 1 1991 ILE 1991 1991 ILE ILE A . A 1 1992 GLU 1992 1992 GLU GLU A . A 1 1993 ASP 1993 1993 ASP ASP A . A 1 1994 LEU 1994 1994 LEU LEU A . A 1 1995 SER 1995 1995 SER SER A . A 1 1996 GLN 1996 1996 GLN GLN A . 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A 1 2025 VAL 2025 2025 VAL VAL A . A 1 2026 GLN 2026 2026 GLN GLN A . A 1 2027 GLU 2027 2027 GLU GLU A . A 1 2028 GLU 2028 2028 GLU GLU A . A 1 2029 SER 2029 2029 SER SER A . A 1 2030 GLU 2030 2030 GLU GLU A . A 1 2031 GLU 2031 2031 GLU GLU A . A 1 2032 GLU 2032 2032 GLU GLU A . A 1 2033 GLU 2033 2033 GLU GLU A . A 1 2034 VAL 2034 2034 VAL VAL A . A 1 2035 ASP 2035 2035 ASP ASP A . A 1 2036 GLU 2036 2036 GLU GLU A . A 1 2037 THR 2037 2037 THR THR A . A 1 2038 GLY 2038 2038 GLY GLY A . A 1 2039 VAL 2039 2039 VAL VAL A . A 1 2040 GLU 2040 2040 GLU GLU A . A 1 2041 VAL 2041 2041 VAL VAL A . A 1 2042 LYS 2042 2042 LYS LYS A . A 1 2043 ASP 2043 2043 ASP ASP A . A 1 2044 ILE 2044 2044 ILE ILE A . A 1 2045 GLU 2045 2045 GLU GLU A . A 1 2046 LEU 2046 2046 LEU LEU A . A 1 2047 VAL 2047 2047 VAL VAL A . A 1 2048 MET 2048 2048 MET MET A . A 1 2049 SER 2049 2049 SER SER A . A 1 2050 GLN 2050 2050 GLN GLN A . A 1 2051 ALA 2051 2051 ALA ALA A . A 1 2052 ASN 2052 2052 ASN ASN A . A 1 2053 VAL 2053 2053 VAL VAL A . A 1 2054 SER 2054 2054 SER SER A . A 1 2055 ARG 2055 2055 ARG ARG A . A 1 2056 ALA 2056 2056 ALA ALA A . A 1 2057 LYS 2057 2057 LYS LYS A . A 1 2058 ALA 2058 2058 ALA ALA A . A 1 2059 VAL 2059 2059 VAL VAL A . A 1 2060 ARG 2060 2060 ARG ARG A . A 1 2061 ALA 2061 2061 ALA ALA A . A 1 2062 LEU 2062 2062 LEU LEU A . A 1 2063 LYS 2063 2063 LYS LYS A . A 1 2064 ASN 2064 2064 ASN ASN A . A 1 2065 ASN 2065 2065 ASN ASN A . A 1 2066 SER 2066 2066 SER SER A . A 1 2067 ASN 2067 2067 ASN ASN A . A 1 2068 ASP 2068 2068 ASP ASP A . A 1 2069 ILE 2069 2069 ILE ILE A . A 1 2070 VAL 2070 2070 VAL VAL A . A 1 2071 ASN 2071 2071 ASN ASN A . A 1 2072 ALA 2072 2072 ALA ALA A . A 1 2073 ILE 2073 2073 ILE ILE A . A 1 2074 MET 2074 2074 MET MET A . A 1 2075 GLU 2075 2075 GLU GLU A . A 1 2076 LEU 2076 2076 LEU LEU A . A 1 2077 THR 2077 2077 THR THR A . A 1 2078 MET 2078 2078 MET MET A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha {PDB ID=9qqb, label_asym_id=WA, auth_asym_id=Nt, SMTL ID=9qqb.45.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 9qqb, label_asym_id=WA' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-07-23 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-07-18 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A WA 49 1 Nt # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQS RSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAA EKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAI MELTM ; ;MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQS RSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAA EKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAI MELTM ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 24 215 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 9qqb 2025-07-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2078 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2078 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 6.62e-96 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MPGEATETVPATEQELPQPQAETAVLPMSSALSVTAALGQPGPTLPPPCSPAPQQCPLSAANQASPFPSPSTIASTPLEVPFPQSSSGTALPLGTAPEAPTFLPNLIGPPISPAALALASPMIAPTLKGTPSSSAPLALVALAPHSVQKSSAFPPNLLTSPPSVAVAESGSVITLSAPIAPSEPKTNLNKVPSEVVPNPKGTPSPPCIVSTVPYHCVTPMASIQSGVASLPQTTPTTTLAIASPQVKDTTISSVLISPQNPGSLSLKGPVSPPAALSLSTQSLPVVTSSQKTAGPNTPPDFPISLGSHLAPLHQSSFGSVQLLGQTGPSALSDPTVKTISVDHSSTGASYPSQRSVIPPLPSRNEVVPATVAAFPVVAPSVDKGPSTISSITCSPSGSLNVATSFSLSPTTSLILKSSPNATYHYPLVAQMPVSSVGTTPLVVTNPCTIAAAPTTTFEVATCVSPPMSSGPISNIEPTSPAALVMAPVAPKEPSTQVATTLRIPVSPPLPDPEDLKNLPSSVLVKFPTQKDLQTVPASLEGAPFSPAQAGLTTKKDPTVLPLVQAAPKNSPSFQSTSSSPEIPLSPEATLAKKSLGEPLPIGKPASSMTSPLGVNSSASVIKTDSYAGPDSAGPLLKSSLITPTVAAFPLESADPAGVAPTTAKGTSTYTTTASPFLEGTVSLAPKNHPVKEGTLTTLPLVPTASENCPVAPSPQNTCAPLATLVLAPEIPKSVPSPSLPPAGTPPGTKKVDGISHTSALAPVASSPKECPTEDSGASATASSKGTLTYLADSPSPLGVSVSPQTKRPPTKKGSAGPDTPIGNLSSPVSPVEASFLPENSLSFQGSKDSPATTHSPTPPSPKGAPTPSAVTPLSPKGVTLPPKETPTPSVVNLPFPKEGPATPAPKQAPALSMTSSSPKKARATPAPKGIPASPSPKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKWAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPTPPAVTPPSPKGSPAATPFPKGASTPPAATPPSPKGSPAATPLPKGAPTTPAATLPSPKGGPATPSLKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPMPPAATPPSPKGGLATPPHKGAPTTPAATPPSPKGGLATPPPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPPPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGPATPPPKGAPTPPAATPPSLKGGLATPPHKGAPNPAVVTPPSPKGGPATSPPKGAPTPPAATPPSPKGSPGTPPPKGAPTPPAVTPPSPKGTPTLPATTPSSKGGPTTPSSKEGPTPPAATPSHKGGPAMTPPSPKRGPAIPSPKGDPTSPAVIPLSPKKAPATPVTREGAATPSKGDLTPPAVTPVSLKKAPATSAPKGGPATPSSKGDPTLPAVTPPSPKEPPAPKQVATSSSPKKAPATPAPMGAPTLPAVIPSSPKEVPATPSSRRDPIAPTATLLSKKTPATLAPKEALIPPAMTVPSPKKTPAIPTPKEAPATPSSKEASSPPAVTPSTYKGAPSPKELLIPPAVTSPSPKEAPTPPAVTPPSPEKGPATPAPKGTPTSPPVTPSSLKDSPTSPASVTCKMGATVPQASKGLPAKKGPTALKEVLVAPAPESTPIITAPTRKGPQTKKSSATSPPICPDPSAKNGSKGPLSTVAPAPLLPVQKDSSKTAKGKDASHSPKGPLAPPESKASTPLTAAAFEKVLPKPESASVSAAPSPPVSLPLAPSPVPTLPPKQQFLPSSPGLVLESPSKPLAPADEDELLPLIPPEPISGGVPFQSVLVNMPTPKSAGIPVPTPSAKQPVTKNNKGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM 2 1 2 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# # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 9qqb.45' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #