data_SMR-ffbc52a240d6c8b6fd57152fc78b2807_5 _entry.id SMR-ffbc52a240d6c8b6fd57152fc78b2807_5 _struct.entry_id SMR-ffbc52a240d6c8b6fd57152fc78b2807_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - D4A8G9/ ZFY26_RAT, Zinc finger FYVE domain-containing protein 26 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries D4A8G9' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.4 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 330330.777 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ZFY26_RAT D4A8G9 1 ;MSYPFGKEETTTEKQLFEFFCECLRRGDWELAQACVPQLQRGQGEIPQKVEDILQALVQCPILLRCGPDI NPQRLAWLWLLVLEKWLPPEKKLLSTVFRRKLEFLFLSEDLQGGIPETILKELFETLAQGPAGCTSDRSQ RWESGAPQLSPEAVSMLWNLLKQAPGPAQALLELLLEERHSASLCHSSLQKSLLDLIRKALQTLRDPASQ PAGVTDAVCGALQALCCTAELPEGEWHVLCEELLETCRTEGSPLKEERLLGCLLHKAGRSLLSLYGHTYA EKVAERPPKASLSGKDHPDPERAMLALFSTPDPAHAWKMAFFYCLSNNKHFLEQILVTALTLLKEEDFPS LGYLLDREFRPLSHLLVLLGWTHCQSLESAKRLLQTLYRNQDQGHDELLRDACEGLWAHLEVLEWCVQQS SSLIPKRELLCHLHGGDSHSVLYSLHHLTNLPALREEEVLKLLQKVPTKDLQGEHDTHDASVPEHLSQCQ SLTLYQGFCAMKYAVYALCVNSHQHSQCPDCRDSASSEELALVEPGRDSLPSPGASHLFPTYLARCRQYL QRIPDSLCLEILENIFSLLLITSADLHPEPHLPEDYAEDDDIEGKGPWGLWSPSESPQHIAATERRSERA SMGPRDLAPTGPGCPKGEPKDNSPGPHTHSFLDLKHFTSSLSGFLADEFAIGAFLSLIQEQLNELSSHRT PEETELLEDQSCWAARDGLQGRLHRFSKVLSEAQWRYKVVTSNQSSEEQPSRRYRPTAKRHSSLRRGRRT RRTRADGRERGSNPSLEGTSSELSTSTSEGSLSAVSGQVEADNRFQPQPQSSIIPMMFSPPESLLASCIL RGNFAEAHQVVLMFNLKSSPSAGELMFVERYQEVIQELARVEHKIENQNSDGGNNTVRRTGSGRSTLQAI GSAAAAGMVFYSISDVTDKLLSPSEDPIPTLQEDFWINAALTETNTPLRGVLEDLSPPAMAAFDLACCQC QLWKTCKQLLETAERRLSSSLEGRGRRLDQVVLNPDGMRGFPFVLQQISKILSYPLTVTGLTKSETLEER GGGAPRCSISELLQMCWPSLTEDCIASHTSLSQQLDQALQSLREALTLSEPKSTPLTCLVEQAAQKAPEA EAHPVHIQSQLLQKTLGKQTLAGPRQTDYVGAFFSYCSSLAKVLLRSLSSDPDNVEVKVGNPFVLLQQSS SQLVSHLLLERQVPPDRLAALLAQEHLNLSVPQVIVSCCCEPLTLCLSRQSQQASSLTAHLGMLAQGHAS HLLDGLPLSVLGSPRPSENPSAERKSDSSPKDSLPAFTASALAFLKSRSKILAMVACLRASRGTKVSRPS LSWKELRGRREAPLTAEKVAQECEHLLEQFPVFEAALLANWEPLQQASESRPSLAASLCGQARLSTVLLG LHSTLAQDVVTEAFEEALVARDWPRALQLIDVYGQDSDDLSSVRDSVLTCATVCDKEGWQYLFPVKDASL RSQLALRFVDKWPLESCLEILAYCVSDMAVPEELKSELQRKLTELRVYQKILGLQDPPVWCDWQTLRSCC AEDPSTVMDMMLGSQEYELCEEWGCLYPIPREHLVSLHHKHLLYLLERREYEKALQLLQRIPDPTMCLEV TERSLDQHPSLATSHFLANYLTSHFYGELTTDRHHEIQALYMGSKVLLTLPEQHRASYAHLSSSPLLMLE QLLMNMKVDWATTAVQTLQQLLAGQDIGFTLDEVDSLLSRYAGKALDLPYPLREKRSDSMIHLQEPVHQA SDPETLSRSSSAEFSAAAAAPAPAAPGSALVCSPSPKERAFPQTQPPLEFVPPETPPARDQWVPDETESM CMVCCREHFTMFNRRHHCRRCGRLVCGSCSTKKMVVEGCRENPTRVCDQCYSYYNKDAPEESPCQSEVPD SAKNESPSYSAVVRIPKATEVEWILSLNEEENELVRSEFYYEQAPSASLCIAILNLHRDSIACGHQLIEH CCRLSRGLTNPEVDAGLLIDIMKQLLFSAKMMFVKAGQSQDLALCDSYISKVDVLHILVAAAYRHMPSLD QILQPASVTRLRNQLLEAEYYQLGVEVSTKTGLDSTGAWHAWGMACLKAGNLTAAREKFSRCLKPPLDLN QLSHGSRLVQDVVEYLESTVRPLVSLQDDDYFATLRELEATLRTQSLFLEAIPDGKIMNNTYYQECLFYL HNYSTNLAIISFYMRHNCLREALLHLLNKESPAEVFIEGIFQPSYKSGKLHTLENLLESIDPTLESWGAY LIAACQHLQKKNYYHILYELQQFMKDQVRAAMTCIRFFSHKAKSYTELGEKLSWLLKAKDHLKIYLQENS RSSGRKKTTFFRKKMAAADVSRHMNTLQLQMEVTRFLHRCESARTSQITTLPLPTLFGNNHMKMEVACQV MLGGKNVEDGFGIAFRVLQDFQLDAAVTYCRAARQLVEKEKYGEIRQLLKCVSESGMAAKSDGDTILLNC LEAFKRIPPQELEGLIQAIHSDDNKVRAYLTCCKLRSAYLIAVKQEHTQAAALVQQVQQAAKSSGDSVVQ DICAQWLLTSHSRGAHGSGSRK ; 'Zinc finger FYVE domain-containing protein 26' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2542 1 2542 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . ZFY26_RAT D4A8G9 . 1 2542 10116 'Rattus norvegicus (Rat)' 2010-04-20 3128C41C447CBD11 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MSYPFGKEETTTEKQLFEFFCECLRRGDWELAQACVPQLQRGQGEIPQKVEDILQALVQCPILLRCGPDI NPQRLAWLWLLVLEKWLPPEKKLLSTVFRRKLEFLFLSEDLQGGIPETILKELFETLAQGPAGCTSDRSQ RWESGAPQLSPEAVSMLWNLLKQAPGPAQALLELLLEERHSASLCHSSLQKSLLDLIRKALQTLRDPASQ PAGVTDAVCGALQALCCTAELPEGEWHVLCEELLETCRTEGSPLKEERLLGCLLHKAGRSLLSLYGHTYA EKVAERPPKASLSGKDHPDPERAMLALFSTPDPAHAWKMAFFYCLSNNKHFLEQILVTALTLLKEEDFPS LGYLLDREFRPLSHLLVLLGWTHCQSLESAKRLLQTLYRNQDQGHDELLRDACEGLWAHLEVLEWCVQQS SSLIPKRELLCHLHGGDSHSVLYSLHHLTNLPALREEEVLKLLQKVPTKDLQGEHDTHDASVPEHLSQCQ SLTLYQGFCAMKYAVYALCVNSHQHSQCPDCRDSASSEELALVEPGRDSLPSPGASHLFPTYLARCRQYL QRIPDSLCLEILENIFSLLLITSADLHPEPHLPEDYAEDDDIEGKGPWGLWSPSESPQHIAATERRSERA 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;MSYPFGKEETTTEKQLFEFFCECLRRGDWELAQACVPQLQRGQGEIPQKVEDILQALVQCPILLRCGPDI NPQRLAWLWLLVLEKWLPPEKKLLSTVFRRKLEFLFLSEDLQGGIPETILKELFETLAQGPAGCTSDRSQ RWESGAPQLSPEAVSMLWNLLKQAPGPAQALLELLLEERHSASLCHSSLQKSLLDLIRKALQTLRDPASQ PAGVTDAVCGALQALCCTAELPEGEWHVLCEELLETCRTEGSPLKEERLLGCLLHKAGRSLLSLYGHTYA EKVAERPPKASLSGKDHPDPERAMLALFSTPDPAHAWKMAFFYCLSNNKHFLEQILVTALTLLKEEDFPS LGYLLDREFRPLSHLLVLLGWTHCQSLESAKRLLQTLYRNQDQGHDELLRDACEGLWAHLEVLEWCVQQS SSLIPKRELLCHLHGGDSHSVLYSLHHLTNLPALREEEVLKLLQKVPTKDLQGEHDTHDASVPEHLSQCQ SLTLYQGFCAMKYAVYALCVNSHQHSQCPDCRDSASSEELALVEPGRDSLPSPGASHLFPTYLARCRQYL QRIPDSLCLEILENIFSLLLITSADLHPEPHLPEDYAEDDDIEGKGPWGLWSPSESPQHIAATERRSERA SMGPRDLAPTGPGCPKGEPKDNSPGPHTHSFLDLKHFTSSLSGFLADEFAIGAFLSLIQEQLNELSSHRT PEETELLEDQSCWAARDGLQGRLHRFSKVLSEAQWRYKVVTSNQSSEEQPSRRYRPTAKRHSSLRRGRRT RRTRADGRERGSNPSLEGTSSELSTSTSEGSLSAVSGQVEADNRFQPQPQSSIIPMMFSPPESLLASCIL RGNFAEAHQVVLMFNLKSSPSAGELMFVERYQEVIQELARVEHKIENQNSDGGNNTVRRTGSGRSTLQAI GSAAAAGMVFYSISDVTDKLLSPSEDPIPTLQEDFWINAALTETNTPLRGVLEDLSPPAMAAFDLACCQC 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_ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;ALQFVQDPHIRFDLALEYGNLDAALDEAKKLNDSITWERLIQEALAQGNASLAEMIYQTQHSFDKLSFLY LVTGDVNKLSKMQNIAQTREDFGSMLLNTFYNNSTKERSSIFAEGGSLPLAYAVAKANGDEAAASAFLEQ AEVDEQDVTLPDQMDASNFVQRPVISKPLEKWPLKEA ; ;ALQFVQDPHIRFDLALEYGNLDAALDEAKKLNDSITWERLIQEALAQGNASLAEMIYQTQHSFDKLSFLY LVTGDVNKLSKMQNIAQTREDFGSMLLNTFYNNSTKERSSIFAEGGSLPLAYAVAKANGDEAAASAFLEQ AEVDEQDVTLPDQMDASNFVQRPVISKPLEKWPLKEA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 20 141 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3mkq 2024-02-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2542 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2548 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 34.000 10.345 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSYPFGKEETTTEKQLFEFFCECLRRGDWELAQACVPQLQRGQGEIPQKVEDILQALVQCPILLRCGPDINPQRLAWLWLLVLEKWLPPEKKLLSTVFRRKLEFLFLSEDLQGGIPETILKELFETLAQGPAGCTSDRSQRWESGAPQLSPEAVSMLWNLLKQAPGPAQALLELLLEERHSASLCHSSLQKSLLDLIRKALQTLRDPASQPAGVTDAVCGALQALCCTAELPEGEWHVLCEELLETCRTEGSPLKEERLLGCLLHKAGRSLLSLYGHTYAEKVAERPPKASLSGKDHPDPERAMLALFSTPDPAHAWKMAFFYCLSNNKHFLEQILVTALTLLKEEDFPSLGYLLDREFRPLSHLLVLLGWTHCQSLESAKRLLQTLYRNQDQGHDELLRDACEGLWAHLEVLEWCVQQSSSLIPKRELLCHLHGGDSHSVLYSLHHLTNLPALREEEVLKLLQKVPTKDLQGEHDTHDASVPEHLSQCQSLTLYQGFCAMKYAVYALCVNSHQHSQCPDCRDSASSEELALVEPGRDSLPSPGASHLFPTYLARCRQYLQRIPDSLCLEILENIFSLLLITSADLHPEPHLPEDYAEDDDIEGKGPWGLWSPSESPQHIAATERRSERASMGPRDLAPTGPGCPKGEPKDNSPGPHTHSFLDLKHFTSSLSGFLADEFAIGAFLSLIQEQLNELSSHRTPEETELLEDQSCWAARDGLQGRLHRFSKVLSEAQWRYKVVTSNQSSEEQPSRRYRPTAKRHSSLRRGRRTRRTRADGRERGSNPSLEGTSSELSTSTSEGSLSAVSGQVEADNRFQPQPQSSIIPMMFSPPESLLASCILRGNFAEAHQVVLMFNLKSSPSAGELMFVERYQEVIQELARVEHKIENQNSDGGNNTVRRTGSGRSTLQAIGSAAAAGMVFYSISDVTDKLLSPSEDPIPTLQEDFWINAALTETNTPLRGVLEDLSPPAMAAFDLACCQCQLWKTCKQLLETAERRLSSSLEGRGRRLDQVVLNPDGMRGFPFVLQQISKILSYPLTVTGLTKSETLEERGGGAPRCSISELLQMCWPSLTEDCIASHTSLSQQLDQALQSLREALTLSEPKSTPLTCLVEQAAQKAPEAEAHPVHIQSQLLQKTLGKQTLAGPRQTDYVGAFFSYCSSLAKVLLRSLSSDPDNVEVKVGNPFVLLQQSSSQLVSHLLLERQVPPDRLAALLAQEHLNLSVPQVIVSCCCEPLTLCLSRQSQQASSLTAHLGMLAQGHASHLLDGLPLSVLGSPRPSENPSAERKSDSSPKDSLPAFTASALAFLKSRSKILAMVACLRASRGTKVSRPSLSWKELRGRREAPLTAEKVAQECEHLLEQFPVFEAALLANWEPLQQASESRPSLAASLCGQARLSTVLLGLHSTLAQDVVTEAFEEALVARDWPRALQLIDVYGQDSDDLSSVRDSVLTCATVCDKEGWQYLFPVKDASLRSQLALRFVDKWPLESCLEILAYCVSDMAVPEELKSELQRKLTELRVYQKILGLQDPPVWCDWQTLRSCCAEDPSTVMDMMLGSQEYELCEEWGCLYPIPREHLVSLHHKHLLYLLERREYEKALQLLQRIPDPTMCLEVTERSLDQHPSLATSHFLANYLTSHFYGELTTDRHHEIQALYMGSKVLLTLPEQHRASYAHLSSSPLLMLEQLLMNMKVDWATTAVQTLQQLLAGQDIGFTLDEVDSLLSRYAGKALDLPYPLREKRSDSMIHLQEPVHQASDPETLSRSSSAEFSAAAAAPAPAAPGSALVCSPSPKERAFPQTQPPLEFVPPETPPARDQWVPDETESMCMVCCREHFTMFNRRHHCRRCGRLVCGSCSTKKMVVEGCRENPTRVCDQCYSYYNKDAPEESPCQSEVPDSAKNESPSYSAVVRIPKATEVEWILSLNEEENELVRSEFYYEQAPSASLCIAILNLHRDSIACGHQLIEHCCRLSRGLTNPEVDAGLLIDIMKQLLFSAKMMFVKAGQSQDLALCDSYISKVDVLHILVAAAYRHMPSLDQILQPASVTRLRNQLLEAEYYQLGVEVSTKTGLDSTGAWHAWGMACLKAGNLTAAREKFSRCLKPPLDLNQLSHGSRLVQDVVEYLESTVRPLVSLQDDDYFATLRELEATLRTQSLFLEAIPDGKIMNNTYYQECLFYLHNYSTNLAIISFYMRHNCLREALLHLLNKESPAEVFIEGIFQPSYKSGKLHTLENLLESIDPTLESWGAYLIAACQHLQKKNYYHILYELQQFMKDQVRAAMTCIRFFSHKAKSYTELGEKLSWLLKAKDHLKIYLQENSRSSGRKKTTFFRKKMAAADVSRHMNTLQLQMEVTRFLHRCESARTSQITTLPLPTLFGNNHMKMEVACQVMLGGKNVEDGFGIAFRVLQDFQLDAAVTYCRAARQLVEKEKYGEIRQLLKCVSESGMAA-----KSDGDTILLNCLEAFKRIP-PQELEGLIQAIHSDDNKVRAYLTCCKLRSAYLIAVKQEHTQAAALVQQVQQAAKSSGDSVVQDICAQWLLTSHSRGAHGSGSRK 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLDAALDEAKK--LNDSITWERLIQEALAQGNASLAEMIYQTQHSFDKLSFLYLVTGDVNKLS-KMQNIAQTREDFGSMLLNTFYNNSTKERSSIFAEGGSLPLAYAVAKANGDEAA---ASAFLEQA------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3mkq.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 5' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 2390 2390 ? A -27.311 158.604 174.557 1 1 B GLY 0.550 1 ATOM 2 C CA . GLY 2390 2390 ? A -27.635 158.843 176.016 1 1 B GLY 0.550 1 ATOM 3 C C . GLY 2390 2390 ? A -26.924 157.886 176.930 1 1 B GLY 0.550 1 ATOM 4 O O . GLY 2390 2390 ? A -27.294 156.729 177.036 1 1 B GLY 0.550 1 ATOM 5 N N . PHE 2391 2391 ? A -25.830 158.338 177.563 1 1 B PHE 0.450 1 ATOM 6 C CA . PHE 2391 2391 ? A -24.836 157.484 178.193 1 1 B PHE 0.450 1 ATOM 7 C C . PHE 2391 2391 ? A -25.296 156.935 179.518 1 1 B PHE 0.450 1 ATOM 8 O O . PHE 2391 2391 ? A -25.150 155.750 179.777 1 1 B PHE 0.450 1 ATOM 9 C CB . PHE 2391 2391 ? A -23.506 158.247 178.410 1 1 B PHE 0.450 1 ATOM 10 C CG . PHE 2391 2391 ? A -22.849 158.557 177.090 1 1 B PHE 0.450 1 ATOM 11 C CD1 . PHE 2391 2391 ? A -23.494 159.188 175.999 1 1 B PHE 0.450 1 ATOM 12 C CD2 . PHE 2391 2391 ? A -21.522 158.154 176.924 1 1 B PHE 0.450 1 ATOM 13 C CE1 . PHE 2391 2391 ? A -22.899 159.240 174.743 1 1 B PHE 0.450 1 ATOM 14 C CE2 . PHE 2391 2391 ? A -20.900 158.264 175.681 1 1 B PHE 0.450 1 ATOM 15 C CZ . PHE 2391 2391 ? A -21.618 158.735 174.590 1 1 B PHE 0.450 1 ATOM 16 N N . GLY 2392 2392 ? A -25.927 157.782 180.362 1 1 B GLY 0.630 1 ATOM 17 C CA . GLY 2392 2392 ? A -26.511 157.344 181.633 1 1 B GLY 0.630 1 ATOM 18 C C . GLY 2392 2392 ? A -27.578 156.291 181.466 1 1 B GLY 0.630 1 ATOM 19 O O . GLY 2392 2392 ? A -27.684 155.338 182.230 1 1 B GLY 0.630 1 ATOM 20 N N . ILE 2393 2393 ? A -28.377 156.421 180.393 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 21 C CA . ILE 2393 2393 ? A -29.327 155.413 179.956 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 22 C C . ILE 2393 2393 ? A -28.639 154.143 179.469 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 23 O O . ILE 2393 2393 ? A -29.040 153.034 179.819 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 24 C CB . ILE 2393 2393 ? A -30.243 155.987 178.875 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 25 C CG1 . ILE 2393 2393 ? A -31.098 157.140 179.461 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 26 C CG2 . ILE 2393 2393 ? A -31.126 154.876 178.266 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 27 C CD1 . ILE 2393 2393 ? A -31.889 157.923 178.406 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 28 N N . ALA 2394 2394 ? A -27.564 154.276 178.668 1 1 B ALA 0.600 1 ATOM 29 C CA . ALA 2394 2394 ? A -26.777 153.157 178.195 1 1 B ALA 0.600 1 ATOM 30 C C . ALA 2394 2394 ? A -26.103 152.353 179.298 1 1 B ALA 0.600 1 ATOM 31 O O . ALA 2394 2394 ? A -26.214 151.133 179.310 1 1 B ALA 0.600 1 ATOM 32 C CB . ALA 2394 2394 ? A -25.720 153.649 177.189 1 1 B ALA 0.600 1 ATOM 33 N N . PHE 2395 2395 ? A -25.456 153.010 180.286 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 34 C CA . PHE 2395 2395 ? A -24.865 152.371 181.454 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 35 C C . PHE 2395 2395 ? A -25.908 151.648 182.308 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 36 O O . PHE 2395 2395 ? A -25.703 150.531 182.780 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 37 C CB . PHE 2395 2395 ? A -24.072 153.406 182.299 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 38 C CG . PHE 2395 2395 ? A -23.341 152.747 183.444 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 39 C CD1 . PHE 2395 2395 ? A -23.901 152.738 184.733 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 40 C CD2 . PHE 2395 2395 ? A -22.120 152.088 183.229 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 41 C CE1 . PHE 2395 2395 ? A -23.271 152.055 185.781 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 42 C CE2 . PHE 2395 2395 ? A -21.487 151.400 184.273 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 43 C CZ . PHE 2395 2395 ? A -22.067 151.378 185.548 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 44 N N . ARG 2396 2396 ? A -27.094 152.259 182.490 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 45 C CA . ARG 2396 2396 ? A -28.196 151.644 183.205 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 46 C C . ARG 2396 2396 ? A -28.668 150.331 182.585 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 47 O O . ARG 2396 2396 ? A -28.861 149.334 183.275 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 48 C CB . ARG 2396 2396 ? A -29.374 152.646 183.233 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 49 C CG . ARG 2396 2396 ? A -30.617 152.176 184.011 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 50 C CD . ARG 2396 2396 ? A -31.778 153.173 183.950 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 51 N NE . ARG 2396 2396 ? A -32.269 153.203 182.534 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 52 C CZ . ARG 2396 2396 ? A -33.112 154.124 182.052 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 53 N NH1 . ARG 2396 2396 ? 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A -24.367 148.829 180.155 1 1 B LEU 0.570 1 ATOM 67 C CG . LEU 2398 2398 ? A -22.947 148.292 180.347 1 1 B LEU 0.570 1 ATOM 68 C CD1 . LEU 2398 2398 ? A -22.665 147.185 179.347 1 1 B LEU 0.570 1 ATOM 69 C CD2 . LEU 2398 2398 ? A -21.929 149.437 180.271 1 1 B LEU 0.570 1 ATOM 70 N N . GLN 2399 2399 ? A -25.533 147.579 182.765 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 71 C CA . GLN 2399 2399 ? A -25.451 146.891 184.033 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 72 C C . GLN 2399 2399 ? A -26.429 145.736 184.157 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 73 O O . GLN 2399 2399 ? A -26.102 144.684 184.712 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 74 C CB . GLN 2399 2399 ? A -25.706 147.901 185.176 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 75 C CG . GLN 2399 2399 ? A -25.539 147.312 186.595 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 76 C CD . GLN 2399 2399 ? A -24.093 146.894 186.854 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 77 O OE1 . GLN 2399 2399 ? A -23.179 147.716 186.904 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 78 N NE2 . GLN 2399 2399 ? A -23.868 145.574 187.043 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 79 N N . ASP 2400 2400 ? 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A 26.146 132.715 185.350 1 1 B ALA 0.380 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.505 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2390 GLY 1 0.550 2 1 A 2391 PHE 1 0.450 3 1 A 2392 GLY 1 0.630 4 1 A 2393 ILE 1 0.650 5 1 A 2394 ALA 1 0.600 6 1 A 2395 PHE 1 0.510 7 1 A 2396 ARG 1 0.520 8 1 A 2397 VAL 1 0.660 9 1 A 2398 LEU 1 0.570 10 1 A 2399 GLN 1 0.540 11 1 A 2400 ASP 1 0.600 12 1 A 2401 PHE 1 0.450 13 1 A 2402 GLN 1 0.500 14 1 A 2403 LEU 1 0.570 15 1 A 2404 ASP 1 0.580 16 1 A 2405 ALA 1 0.590 17 1 A 2406 ALA 1 0.680 18 1 A 2407 VAL 1 0.680 19 1 A 2408 THR 1 0.630 20 1 A 2409 TYR 1 0.580 21 1 A 2410 CYS 1 0.700 22 1 A 2411 ARG 1 0.570 23 1 A 2412 ALA 1 0.600 24 1 A 2413 ALA 1 0.670 25 1 A 2414 ARG 1 0.610 26 1 A 2415 GLN 1 0.630 27 1 A 2416 LEU 1 0.610 28 1 A 2417 VAL 1 0.690 29 1 A 2418 GLU 1 0.680 30 1 A 2419 LYS 1 0.620 31 1 A 2420 GLU 1 0.640 32 1 A 2421 LYS 1 0.640 33 1 A 2422 TYR 1 0.550 34 1 A 2423 GLY 1 0.630 35 1 A 2424 GLU 1 0.580 36 1 A 2425 ILE 1 0.580 37 1 A 2426 ARG 1 0.490 38 1 A 2427 GLN 1 0.610 39 1 A 2428 LEU 1 0.680 40 1 A 2429 LEU 1 0.560 41 1 A 2430 LYS 1 0.550 42 1 A 2431 CYS 1 0.510 43 1 A 2432 VAL 1 0.490 44 1 A 2433 SER 1 0.470 45 1 A 2434 GLU 1 0.460 46 1 A 2435 SER 1 0.510 47 1 A 2436 GLY 1 0.460 48 1 A 2437 MET 1 0.420 49 1 A 2438 ALA 1 0.450 50 1 A 2439 ALA 1 0.460 51 1 A 2440 LYS 1 0.440 52 1 A 2441 SER 1 0.480 53 1 A 2442 ASP 1 0.450 54 1 A 2443 GLY 1 0.430 55 1 A 2444 ASP 1 0.460 56 1 A 2445 THR 1 0.470 57 1 A 2446 ILE 1 0.450 58 1 A 2447 LEU 1 0.450 59 1 A 2448 LEU 1 0.470 60 1 A 2449 ASN 1 0.440 61 1 A 2450 CYS 1 0.460 62 1 A 2451 LEU 1 0.520 63 1 A 2452 GLU 1 0.480 64 1 A 2453 ALA 1 0.440 65 1 A 2454 PHE 1 0.360 66 1 A 2455 LYS 1 0.400 67 1 A 2456 ARG 1 0.310 68 1 A 2457 ILE 1 0.290 69 1 A 2458 PRO 1 0.320 70 1 A 2459 PRO 1 0.370 71 1 A 2460 GLN 1 0.380 72 1 A 2461 GLU 1 0.400 73 1 A 2462 LEU 1 0.420 74 1 A 2463 GLU 1 0.510 75 1 A 2464 GLY 1 0.490 76 1 A 2465 LEU 1 0.470 77 1 A 2466 ILE 1 0.530 78 1 A 2467 GLN 1 0.510 79 1 A 2468 ALA 1 0.510 80 1 A 2469 ILE 1 0.510 81 1 A 2470 HIS 1 0.440 82 1 A 2471 SER 1 0.510 83 1 A 2472 ASP 1 0.530 84 1 A 2473 ASP 1 0.500 85 1 A 2474 ASN 1 0.520 86 1 A 2475 LYS 1 0.560 87 1 A 2476 VAL 1 0.590 88 1 A 2477 ARG 1 0.520 89 1 A 2478 ALA 1 0.510 90 1 A 2479 TYR 1 0.480 91 1 A 2480 LEU 1 0.440 92 1 A 2481 THR 1 0.420 93 1 A 2482 CYS 1 0.410 94 1 A 2483 CYS 1 0.340 95 1 A 2484 LYS 1 0.450 96 1 A 2485 LEU 1 0.410 97 1 A 2486 ARG 1 0.440 98 1 A 2487 SER 1 0.550 99 1 A 2488 ALA 1 0.570 100 1 A 2489 TYR 1 0.520 101 1 A 2490 LEU 1 0.510 102 1 A 2491 ILE 1 0.540 103 1 A 2492 ALA 1 0.570 104 1 A 2493 VAL 1 0.570 105 1 A 2494 LYS 1 0.500 106 1 A 2495 GLN 1 0.490 107 1 A 2496 GLU 1 0.470 108 1 A 2497 HIS 1 0.350 109 1 A 2498 THR 1 0.360 110 1 A 2499 GLN 1 0.360 111 1 A 2500 ALA 1 0.430 112 1 A 2501 ALA 1 0.350 113 1 A 2502 ALA 1 0.430 114 1 A 2503 LEU 1 0.430 115 1 A 2504 VAL 1 0.530 116 1 A 2505 GLN 1 0.460 117 1 A 2506 GLN 1 0.470 118 1 A 2507 VAL 1 0.510 119 1 A 2508 GLN 1 0.440 120 1 A 2509 GLN 1 0.390 121 1 A 2510 ALA 1 0.430 122 1 A 2511 ALA 1 0.380 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #