data_SMR-ea9c8fe1f7641599b23995f0fcb8bd93_17 _entry.id SMR-ea9c8fe1f7641599b23995f0fcb8bd93_17 _struct.entry_id SMR-ea9c8fe1f7641599b23995f0fcb8bd93_17 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - B9EKI3/ TMF1_MOUSE, TATA element modulatory factor Estimated model accuracy of this model is 0.027, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries B9EKI3' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-07.1 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 141594.552 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP TMF1_MOUSE B9EKI3 1 ;MSWFNASQLSSFAKQALSQAQKSIDRVLDIQEEEPSAWAEAIPYGEPGISPPVSGGWDTSTWGLNSTSSE PQSPPTASQAITKPVRRTVVDESENFFSAFLSPSDAHTIQKSPVVSKPPSKSQRPEEEVKSSLQESSSPG QSRVSETAEVRDSVCVSGETSAVGTPSPVPEDKHEETAGEESEVKVPTVRLKASENVVNVNTTEDVSTTS TQSLTAETKDMALEPKEQKHEDRQSNTPSPPVSSFSSGTSTTSDIEVLDHESVISESSASSRQETSDAKS SLHLMQTSFQLLSASACPEYSRLDDFQKLNESCCSSDAFERIDSFSVQSLDSRSVSEINSDDELPGKGYA LVPIIVSPSTPKTKVVESTEENAEEEEGNETLVAPSEEAELEESGRSATPVNCDQPDILASPTAGSGGHS ASGPATEQCEAVENQPKAPPEKEDVCKTVEFLNEKLEKRETQLLSLSKEKALLEEAYDNLKDEMFRVKEE SSSISSLKDEFTQRIAEAEKKVQLACKERDAAKKEMKTIKEELATRLNSSQTADLLKEKDEQIQGLMEEG EKLSKQQLHNSNIIKKLRAKDKDNENVIAKLNRKAKELEEELQHLRQVLDGKEEVEKQHRENIKKLNSVV ERQEKDLGRLQVDMDELEEKSRSTQAALDSAYRELTDLHKANAAKDSEVQEAALRREMKAKEELSGALEK AQEEARQQQEALVLQVGDLRLALQRAEQAAARKEDYLRHEISELQQRLQEAENRNQELSQSVSSTARPLL RQIENLQATLGSQTSSWETLEKSLSDRLGESQTLLAAAVERERAATEELLANKIQMSSVESQNTLLRQEN SRLQAQLESEKNKLRKLEDENSRYQVELENLKDEYVRTLEESRKEKTLLSSQLEMERMKVEQERKKTIFT QEALKEKDHKLFSVCSTPTMSRSSSISGVDAAGLQASFLSQDESHDHSFGPMSTSASGSNLYEAVRMGAG SSIIENLQSQLKLREGEISHLQLEISNLEKTRSIMSEELVKLTNQNDELEEKVKEIPKLRVQLRDLDQRY NTILQMYGEKAEEAEELRLDLEDVKNMYKTQIDELLRQRLS ; 'TATA element modulatory factor' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1091 1 1091 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . TMF1_MOUSE B9EKI3 . 1 1091 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 D208A815FF740CF1 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no D ;MSWFNASQLSSFAKQALSQAQKSIDRVLDIQEEEPSAWAEAIPYGEPGISPPVSGGWDTSTWGLNSTSSE PQSPPTASQAITKPVRRTVVDESENFFSAFLSPSDAHTIQKSPVVSKPPSKSQRPEEEVKSSLQESSSPG QSRVSETAEVRDSVCVSGETSAVGTPSPVPEDKHEETAGEESEVKVPTVRLKASENVVNVNTTEDVSTTS TQSLTAETKDMALEPKEQKHEDRQSNTPSPPVSSFSSGTSTTSDIEVLDHESVISESSASSRQETSDAKS SLHLMQTSFQLLSASACPEYSRLDDFQKLNESCCSSDAFERIDSFSVQSLDSRSVSEINSDDELPGKGYA LVPIIVSPSTPKTKVVESTEENAEEEEGNETLVAPSEEAELEESGRSATPVNCDQPDILASPTAGSGGHS ASGPATEQCEAVENQPKAPPEKEDVCKTVEFLNEKLEKRETQLLSLSKEKALLEEAYDNLKDEMFRVKEE SSSISSLKDEFTQRIAEAEKKVQLACKERDAAKKEMKTIKEELATRLNSSQTADLLKEKDEQIQGLMEEG EKLSKQQLHNSNIIKKLRAKDKDNENVIAKLNRKAKELEEELQHLRQVLDGKEEVEKQHRENIKKLNSVV ERQEKDLGRLQVDMDELEEKSRSTQAALDSAYRELTDLHKANAAKDSEVQEAALRREMKAKEELSGALEK AQEEARQQQEALVLQVGDLRLALQRAEQAAARKEDYLRHEISELQQRLQEAENRNQELSQSVSSTARPLL RQIENLQATLGSQTSSWETLEKSLSDRLGESQTLLAAAVERERAATEELLANKIQMSSVESQNTLLRQEN SRLQAQLESEKNKLRKLEDENSRYQVELENLKDEYVRTLEESRKEKTLLSSQLEMERMKVEQERKKTIFT QEALKEKDHKLFSVCSTPTMSRSSSISGVDAAGLQASFLSQDESHDHSFGPMSTSASGSNLYEAVRMGAG SSIIENLQSQLKLREGEISHLQLEISNLEKTRSIMSEELVKLTNQNDELEEKVKEIPKLRVQLRDLDQRY NTILQMYGEKAEEAEELRLDLEDVKNMYKTQIDELLRQRLS ; ;MSWFNASQLSSFAKQALSQAQKSIDRVLDIQEEEPSAWAEAIPYGEPGISPPVSGGWDTSTWGLNSTSSE PQSPPTASQAITKPVRRTVVDESENFFSAFLSPSDAHTIQKSPVVSKPPSKSQRPEEEVKSSLQESSSPG QSRVSETAEVRDSVCVSGETSAVGTPSPVPEDKHEETAGEESEVKVPTVRLKASENVVNVNTTEDVSTTS TQSLTAETKDMALEPKEQKHEDRQSNTPSPPVSSFSSGTSTTSDIEVLDHESVISESSASSRQETSDAKS SLHLMQTSFQLLSASACPEYSRLDDFQKLNESCCSSDAFERIDSFSVQSLDSRSVSEINSDDELPGKGYA LVPIIVSPSTPKTKVVESTEENAEEEEGNETLVAPSEEAELEESGRSATPVNCDQPDILASPTAGSGGHS ASGPATEQCEAVENQPKAPPEKEDVCKTVEFLNEKLEKRETQLLSLSKEKALLEEAYDNLKDEMFRVKEE SSSISSLKDEFTQRIAEAEKKVQLACKERDAAKKEMKTIKEELATRLNSSQTADLLKEKDEQIQGLMEEG EKLSKQQLHNSNIIKKLRAKDKDNENVIAKLNRKAKELEEELQHLRQVLDGKEEVEKQHRENIKKLNSVV ERQEKDLGRLQVDMDELEEKSRSTQAALDSAYRELTDLHKANAAKDSEVQEAALRREMKAKEELSGALEK AQEEARQQQEALVLQVGDLRLALQRAEQAAARKEDYLRHEISELQQRLQEAENRNQELSQSVSSTARPLL RQIENLQATLGSQTSSWETLEKSLSDRLGESQTLLAAAVERERAATEELLANKIQMSSVESQNTLLRQEN SRLQAQLESEKNKLRKLEDENSRYQVELENLKDEYVRTLEESRKEKTLLSSQLEMERMKVEQERKKTIFT QEALKEKDHKLFSVCSTPTMSRSSSISGVDAAGLQASFLSQDESHDHSFGPMSTSASGSNLYEAVRMGAG SSIIENLQSQLKLREGEISHLQLEISNLEKTRSIMSEELVKLTNQNDELEEKVKEIPKLRVQLRDLDQRY NTILQMYGEKAEEAEELRLDLEDVKNMYKTQIDELLRQRLS ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 SER . 1 3 TRP . 1 4 PHE . 1 5 ASN . 1 6 ALA . 1 7 SER . 1 8 GLN . 1 9 LEU . 1 10 SER . 1 11 SER . 1 12 PHE . 1 13 ALA . 1 14 LYS . 1 15 GLN . 1 16 ALA . 1 17 LEU . 1 18 SER . 1 19 GLN . 1 20 ALA . 1 21 GLN . 1 22 LYS . 1 23 SER . 1 24 ILE . 1 25 ASP . 1 26 ARG . 1 27 VAL . 1 28 LEU . 1 29 ASP . 1 30 ILE . 1 31 GLN . 1 32 GLU . 1 33 GLU . 1 34 GLU . 1 35 PRO . 1 36 SER . 1 37 ALA . 1 38 TRP . 1 39 ALA . 1 40 GLU . 1 41 ALA . 1 42 ILE . 1 43 PRO . 1 44 TYR . 1 45 GLY . 1 46 GLU . 1 47 PRO . 1 48 GLY . 1 49 ILE . 1 50 SER . 1 51 PRO . 1 52 PRO . 1 53 VAL . 1 54 SER . 1 55 GLY . 1 56 GLY . 1 57 TRP . 1 58 ASP . 1 59 THR . 1 60 SER . 1 61 THR . 1 62 TRP . 1 63 GLY . 1 64 LEU . 1 65 ASN . 1 66 SER . 1 67 THR . 1 68 SER . 1 69 SER . 1 70 GLU . 1 71 PRO . 1 72 GLN . 1 73 SER . 1 74 PRO . 1 75 PRO . 1 76 THR . 1 77 ALA . 1 78 SER . 1 79 GLN . 1 80 ALA . 1 81 ILE . 1 82 THR . 1 83 LYS . 1 84 PRO . 1 85 VAL . 1 86 ARG . 1 87 ARG . 1 88 THR . 1 89 VAL . 1 90 VAL . 1 91 ASP . 1 92 GLU . 1 93 SER . 1 94 GLU . 1 95 ASN . 1 96 PHE . 1 97 PHE . 1 98 SER . 1 99 ALA . 1 100 PHE . 1 101 LEU . 1 102 SER . 1 103 PRO . 1 104 SER . 1 105 ASP . 1 106 ALA . 1 107 HIS . 1 108 THR . 1 109 ILE . 1 110 GLN . 1 111 LYS . 1 112 SER . 1 113 PRO . 1 114 VAL . 1 115 VAL . 1 116 SER 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A 1 1090 LEU 1090 ? ? ? D . A 1 1091 SER 1091 ? ? ? D . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Chromosome partition protein MukB {PDB ID=9gm6, label_asym_id=D, auth_asym_id=A, SMTL ID=9gm6.1.D}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 9gm6, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 17' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-08-13 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-08-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 3 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MIERGKFRSLTLVNWNGFFARTFDLDELVTTLSGGNGAGKSTTMAAFVTALIPDLTLLHFRNTTEAGATS GSRDKGLHGKLRAGVCYSTLDVINSRHQRVVVGVRLQQVAGRDRKVDIKPFMIQGLPTAIQPTQLLTENV GERQARVLPLNELKDRLDEMEGVQFKQFNSITDYHAQMFDLGVIPKRLRSASDRSKFYRLIEASLYGGIS SAITRSLRDYLLPENSGVRKAFQDMEAALRENRITLEAIRVTQSDRDLFKHLITEATSYVSADYMRHANE RRTHLDEALALRGELFGSHKQLATEQYRHVEMARELAEQSGASSDLETDHQAASDHLNLVQTAMRQQEKI DRYQVDLEELSYRLEEQTDVVEEAGELQAEYEARTEATEQEVDELKSQLADYQQALDVQQTRAIQYQQAL QALERARELCRLPDLSVDNAEEWLETFQAKEQQATEALLALEQKLSVADAAHNQFEQAYQLVKNIVGETS RSEAWQSARELLRDWPSQRHLADRVQPLRMRLSELEQRLNNQQNAERLLSEFCKRQGRQYQAEDLEALQN ELEARQEALSLSVNEGGERRMEMRQELEQLKQKIQSLTARAPVWLAAQDTLNQLCEQSGETLASSNDVTE YMQQLLEREREATVERDEVAAQKRELEKQIERLSQPSGAEDSRMIALAERFGGVLLSEIYDDITIDDAPY FSALYGPARHGIVVPDLSLVRPHLETLEDCPEDLYLIEGDPQSFDDSVFNAEEQTNAVLVKSSDRQWRYS RYPELPLFGRAARENRLEALNLERDALAERYATLSFDVQKIQRAHQAFSQFVGKHLSVAFDTDPEAEIRE LRQRHTELEREVSRFEDQTQQQRQQYAQAKESLTTLNRLIPQVTLLLDETLIDRVEEVREEMDEAQEAAR FLQQHGSALTKLEPMVAVLQSDPQQHEQLQQDYETAKHSQHQAKQQAFALVEIVQRRVHFSYSDSAGMLS ENADLNDKLRQRLEHAESDRSRAREQLRQQQAQYSQFNQVLASLKSSYETKQDMLKELLQEMKDIGVQAD ANAEMRARERRDRLHEALSVNRSRVNQLEKQIAFCEAEMENVQKKLRKLERDYYQIREQVVSAKAGWCAV MRMVKDNGVERRLHRRELAYMEGGALRSMSDKALGALRLAVADNEHLRDALRLSEDPKRPERKVQFFIAV YQHLRERIRQDIIRTDDPVDAIEQMEIELARLTEELTAREQKLAISSKSVANIIRKTIQREQNRIRMLNQ GLQAVSFGQVRGVRLNVNVRESHAILLDVLSEQQEQHQDLFNSQRLTFSEAMAKLYQRLNPQVDMGQRLP QTIGEELLDYRNYLELDVEVNRGSDGWLKAESGALSTGEAIGTGMSILVMVVQSWEEESRRLRGKDISPC RLLFLDEAARLDAKSIATLFELCERLQMQLIIAAPENISPEKGTTYKLVRKVFKNHEHVHVVGLRGFGQD APATQLISDVTA ; ;MIERGKFRSLTLVNWNGFFARTFDLDELVTTLSGGNGAGKSTTMAAFVTALIPDLTLLHFRNTTEAGATS GSRDKGLHGKLRAGVCYSTLDVINSRHQRVVVGVRLQQVAGRDRKVDIKPFMIQGLPTAIQPTQLLTENV GERQARVLPLNELKDRLDEMEGVQFKQFNSITDYHAQMFDLGVIPKRLRSASDRSKFYRLIEASLYGGIS SAITRSLRDYLLPENSGVRKAFQDMEAALRENRITLEAIRVTQSDRDLFKHLITEATSYVSADYMRHANE RRTHLDEALALRGELFGSHKQLATEQYRHVEMARELAEQSGASSDLETDHQAASDHLNLVQTAMRQQEKI DRYQVDLEELSYRLEEQTDVVEEAGELQAEYEARTEATEQEVDELKSQLADYQQALDVQQTRAIQYQQAL QALERARELCRLPDLSVDNAEEWLETFQAKEQQATEALLALEQKLSVADAAHNQFEQAYQLVKNIVGETS RSEAWQSARELLRDWPSQRHLADRVQPLRMRLSELEQRLNNQQNAERLLSEFCKRQGRQYQAEDLEALQN ELEARQEALSLSVNEGGERRMEMRQELEQLKQKIQSLTARAPVWLAAQDTLNQLCEQSGETLASSNDVTE YMQQLLEREREATVERDEVAAQKRELEKQIERLSQPSGAEDSRMIALAERFGGVLLSEIYDDITIDDAPY FSALYGPARHGIVVPDLSLVRPHLETLEDCPEDLYLIEGDPQSFDDSVFNAEEQTNAVLVKSSDRQWRYS RYPELPLFGRAARENRLEALNLERDALAERYATLSFDVQKIQRAHQAFSQFVGKHLSVAFDTDPEAEIRE LRQRHTELEREVSRFEDQTQQQRQQYAQAKESLTTLNRLIPQVTLLLDETLIDRVEEVREEMDEAQEAAR FLQQHGSALTKLEPMVAVLQSDPQQHEQLQQDYETAKHSQHQAKQQAFALVEIVQRRVHFSYSDSAGMLS ENADLNDKLRQRLEHAESDRSRAREQLRQQQAQYSQFNQVLASLKSSYETKQDMLKELLQEMKDIGVQAD ANAEMRARERRDRLHEALSVNRSRVNQLEKQIAFCEAEMENVQKKLRKLERDYYQIREQVVSAKAGWCAV MRMVKDNGVERRLHRRELAYMEGGALRSMSDKALGALRLAVADNEHLRDALRLSEDPKRPERKVQFFIAV YQHLRERIRQDIIRTDDPVDAIEQMEIELARLTEELTAREQKLAISSKSVANIIRKTIQREQNRIRMLNQ GLQAVSFGQVRGVRLNVNVRESHAILLDVLSEQQEQHQDLFNSQRLTFSEAMAKLYQRLNPQVDMGQRLP QTIGEELLDYRNYLELDVEVNRGSDGWLKAESGALSTGEAIGTGMSILVMVVQSWEEESRRLRGKDISPC RLLFLDEAARLDAKSIATLFELCERLQMQLIIAAPENISPEKGTTYKLVRKVFKNHEHVHVVGLRGFGQD APATQLISDVTA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1005 1111 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 9gm6 2025-05-14 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1091 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1093 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.007 13.333 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSWFNASQLSSFAKQALSQAQKSIDRVLDIQEEEPSAWAEAIPYGEPGISPPVSGGWDTSTWGLNSTSSEPQSPPTASQAITKPVRRTVVDESENFFSAFLSPSDAHTIQKSPVVSKPPSKSQRPEEEVKSSLQESSSPGQSRVSETAEVRDSVCVSGETSAVGTPSPVPEDKHEETAGEESEVKVPTVRLKASENVVNVNTTEDVSTTSTQSLTAETKDMALEPKEQKHEDRQSNTPSPPVSSFSSGTSTTSDIEVLDHESVISESSASSRQETSDAKSSLHLMQTSFQLLSASACPEYSRLDDFQKLNESCCSSDAFERIDSFSVQSLDSRSVSEINSDDELPGKGYALVPIIVSPSTPKTKVVESTEENAEEEEGNETLVAPSEEAELEESGRSATPVNCDQPDILASPTAGSGGHSASGPATEQCEAVENQPKAPPEKEDVCKTVEFLNEKLEKRETQLLSLSKEKALLEEAYDNLKDEMFRVKEESSSISSLKDEFTQRIAEAEKKVQLACKERDAAKKEMKTIKEELATRLNSSQTADLLKEKDEQIQGLMEEGEKLSKQQLHNSNIIKKLRAKDKDNENVIAKLNRKAKELEEELQHLRQVLDGKEEVEKQHRENIKKLNSVVERQEKDLGRLQVDMDELEEKSRSTQAALDSAYRELTDLHKANAAKDSEVQEAALRREMKAKEELSGALEKAQEEARQQQEALVLQVGDLRLALQRAEQAAARKEDYLRHEISELQQRLQEAENRNQELSQSVSSTARPLLRQIENLQATLGSQTSSWETLEKSLSDRLGESQTLLAAAVERERAATEELLANKIQMSSVESQNTLLRQENSRLQAQLESEKNKLRKLEDENSRYQVELENLKDEYVRTLEESRKEKTLLSSQLEMERMKVEQERKKTIFTQEALKEKDHKLFSVCSTPTMSRSSSISGVDAAGLQASFLSQDESHDHSFGPMSTSASGSNLYEAVRMGAGSSIIENLQSQLKLREGEISHLQLEISNLEKTRSIMSEELVKLTNQNDEL--EEKVKEIPKLRVQLRDLDQRYNTILQMYGEKAEEAEELRLDLEDVKNMYKTQIDELLRQRLS 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EQLRQQQAQYSQFNQVLASLKSSYETKQDMLKELLQEMKDIGVQADANAEMRARERRDRLHEALSVNRSRVNQLEKQIAFCEAEMENVQKKLRKLERDYYQIREQVV----- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 9gm6.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 17' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LYS 1032 1032 ? A 214.246 270.593 184.664 1 1 D LYS 0.420 1 ATOM 2 C CA . LYS 1032 1032 ? A 215.355 269.761 185.260 1 1 D LYS 0.420 1 ATOM 3 C C . LYS 1032 1032 ? A 215.319 269.731 186.798 1 1 D LYS 0.420 1 ATOM 4 O O . LYS 1032 1032 ? A 215.377 268.660 187.405 1 1 D LYS 0.420 1 ATOM 5 C CB . LYS 1032 1032 ? A 216.737 270.287 184.787 1 1 D LYS 0.420 1 ATOM 6 C CG . LYS 1032 1032 ? A 217.916 269.402 185.243 1 1 D LYS 0.420 1 ATOM 7 C CD . LYS 1032 1032 ? A 219.277 269.903 184.725 1 1 D LYS 0.420 1 ATOM 8 C CE . LYS 1032 1032 ? A 220.451 269.027 185.186 1 1 D LYS 0.420 1 ATOM 9 N NZ . LYS 1032 1032 ? A 221.731 269.534 184.642 1 1 D LYS 0.420 1 ATOM 10 N N . VAL 1033 1033 ? A 215.188 270.903 187.449 1 1 D VAL 0.520 1 ATOM 11 C CA . VAL 1033 1033 ? A 215.014 271.036 188.893 1 1 D VAL 0.520 1 ATOM 12 C C . VAL 1033 1033 ? A 213.677 270.523 189.453 1 1 D VAL 0.520 1 ATOM 13 O O . VAL 1033 1033 ? A 213.498 270.389 190.586 1 1 D VAL 0.520 1 ATOM 14 C CB . VAL 1033 1033 ? A 215.267 272.465 189.447 1 1 D VAL 0.520 1 ATOM 15 C CG1 . VAL 1033 1033 ? A 215.313 272.565 190.993 1 1 D VAL 0.520 1 ATOM 16 C CG2 . VAL 1033 1033 ? A 216.628 273.013 188.963 1 1 D VAL 0.520 1 ATOM 17 N N . LYS 1034 1034 ? A 212.649 270.190 188.656 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 18 C CA . LYS 1034 1034 ? A 211.645 269.352 189.275 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 19 C C . LYS 1034 1034 ? A 212.050 267.875 189.478 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 20 O O . LYS 1034 1034 ? A 211.816 267.316 190.570 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 21 C CB . LYS 1034 1034 ? A 210.355 269.482 188.503 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 22 C CG . LYS 1034 1034 ? A 209.226 268.736 189.180 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 23 C CD . LYS 1034 1034 ? A 208.006 269.074 188.352 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 24 C CE . LYS 1034 1034 ? A 206.772 268.319 188.777 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 25 N NZ . LYS 1034 1034 ? A 205.625 268.670 187.918 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 26 N N . GLU 1035 1035 ? A 212.644 267.216 188.486 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 27 C CA . GLU 1035 1035 ? A 212.985 265.793 188.486 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 28 C C . GLU 1035 1035 ? A 214.098 265.411 189.462 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 29 O O . GLU 1035 1035 ? A 213.926 264.498 190.293 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 30 C CB . GLU 1035 1035 ? A 213.342 265.437 187.037 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 31 C CG . GLU 1035 1035 ? A 213.667 263.956 186.768 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 32 C CD . GLU 1035 1035 ? A 213.959 263.723 185.282 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 33 O OE1 . GLU 1035 1035 ? A 213.920 264.716 184.503 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 34 O OE2 . GLU 1035 1035 ? A 214.236 262.551 184.931 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 35 N N . ILE 1036 1036 ? A 215.232 266.128 189.462 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 36 C CA . ILE 1036 1036 ? A 216.361 265.893 190.367 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 37 C C . ILE 1036 1036 ? A 216.012 266.017 191.878 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 38 O O . ILE 1036 1036 ? A 216.383 265.127 192.616 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 39 C CB . ILE 1036 1036 ? A 217.612 266.687 189.950 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 40 C CG1 . ILE 1036 1036 ? A 218.122 266.270 188.544 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 41 C CG2 . ILE 1036 1036 ? A 218.743 266.519 190.995 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 42 C CD1 . ILE 1036 1036 ? A 219.218 267.206 188.013 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 43 N N . PRO 1037 1037 ? A 215.310 267.009 192.439 1 1 D PRO 0.650 1 ATOM 44 C CA . PRO 1037 1037 ? A 214.902 267.011 193.843 1 1 D PRO 0.650 1 ATOM 45 C C . PRO 1037 1037 ? A 213.892 265.978 194.225 1 1 D PRO 0.650 1 ATOM 46 O O . PRO 1037 1037 ? A 213.917 265.532 195.373 1 1 D PRO 0.650 1 ATOM 47 C CB . PRO 1037 1037 ? A 214.223 268.363 194.041 1 1 D PRO 0.650 1 ATOM 48 C CG . PRO 1037 1037 ? A 214.879 269.300 193.036 1 1 D PRO 0.650 1 ATOM 49 C CD . PRO 1037 1037 ? A 215.291 268.367 191.900 1 1 D PRO 0.650 1 ATOM 50 N N . LYS 1038 1038 ? A 212.950 265.615 193.329 1 1 D LYS 0.670 1 ATOM 51 C CA . LYS 1038 1038 ? A 212.071 264.493 193.600 1 1 D LYS 0.670 1 ATOM 52 C C . LYS 1038 1038 ? A 212.882 263.213 193.714 1 1 D LYS 0.670 1 ATOM 53 O O . LYS 1038 1038 ? 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A 219.129 231.091 224.063 1 1 D LEU 0.740 1 ATOM 301 C CB . LEU 1067 1067 ? A 217.476 233.566 222.970 1 1 D LEU 0.740 1 ATOM 302 C CG . LEU 1067 1067 ? A 216.477 234.658 223.397 1 1 D LEU 0.740 1 ATOM 303 C CD1 . LEU 1067 1067 ? A 215.341 234.753 222.366 1 1 D LEU 0.740 1 ATOM 304 C CD2 . LEU 1067 1067 ? A 215.902 234.399 224.798 1 1 D LEU 0.740 1 ATOM 305 N N . ARG 1068 1068 ? A 220.430 232.138 222.587 1 1 D ARG 0.700 1 ATOM 306 C CA . ARG 1068 1068 ? A 221.311 231.001 222.371 1 1 D ARG 0.700 1 ATOM 307 C C . ARG 1068 1068 ? A 222.178 230.652 223.568 1 1 D ARG 0.700 1 ATOM 308 O O . ARG 1068 1068 ? A 222.355 229.479 223.886 1 1 D ARG 0.700 1 ATOM 309 C CB . ARG 1068 1068 ? A 222.237 231.205 221.165 1 1 D ARG 0.700 1 ATOM 310 C CG . ARG 1068 1068 ? A 221.520 231.206 219.813 1 1 D ARG 0.700 1 ATOM 311 C CD . ARG 1068 1068 ? A 222.504 231.627 218.735 1 1 D ARG 0.700 1 ATOM 312 N NE . ARG 1068 1068 ? A 221.915 231.214 217.435 1 1 D ARG 0.700 1 ATOM 313 C CZ . ARG 1068 1068 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.677 2 1 3 0.027 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1032 LYS 1 0.420 2 1 A 1033 VAL 1 0.520 3 1 A 1034 LYS 1 0.600 4 1 A 1035 GLU 1 0.600 5 1 A 1036 ILE 1 0.620 6 1 A 1037 PRO 1 0.650 7 1 A 1038 LYS 1 0.670 8 1 A 1039 LEU 1 0.680 9 1 A 1040 ARG 1 0.650 10 1 A 1041 VAL 1 0.690 11 1 A 1042 GLN 1 0.680 12 1 A 1043 LEU 1 0.700 13 1 A 1044 ARG 1 0.670 14 1 A 1045 ASP 1 0.710 15 1 A 1046 LEU 1 0.700 16 1 A 1047 ASP 1 0.700 17 1 A 1048 GLN 1 0.700 18 1 A 1049 ARG 1 0.670 19 1 A 1050 TYR 1 0.660 20 1 A 1051 ASN 1 0.710 21 1 A 1052 THR 1 0.700 22 1 A 1053 ILE 1 0.660 23 1 A 1054 LEU 1 0.690 24 1 A 1055 GLN 1 0.670 25 1 A 1056 MET 1 0.650 26 1 A 1057 TYR 1 0.640 27 1 A 1058 GLY 1 0.710 28 1 A 1059 GLU 1 0.690 29 1 A 1060 LYS 1 0.710 30 1 A 1061 ALA 1 0.750 31 1 A 1062 GLU 1 0.720 32 1 A 1063 GLU 1 0.720 33 1 A 1064 ALA 1 0.770 34 1 A 1065 GLU 1 0.730 35 1 A 1066 GLU 1 0.730 36 1 A 1067 LEU 1 0.740 37 1 A 1068 ARG 1 0.700 38 1 A 1069 LEU 1 0.740 39 1 A 1070 ASP 1 0.720 40 1 A 1071 LEU 1 0.730 41 1 A 1072 GLU 1 0.720 42 1 A 1073 ASP 1 0.720 43 1 A 1074 VAL 1 0.730 44 1 A 1075 LYS 1 0.720 45 1 A 1076 ASN 1 0.710 46 1 A 1077 MET 1 0.680 47 1 A 1078 TYR 1 0.670 48 1 A 1079 LYS 1 0.690 49 1 A 1080 THR 1 0.680 50 1 A 1081 GLN 1 0.640 51 1 A 1082 ILE 1 0.620 52 1 A 1083 ASP 1 0.590 53 1 A 1084 GLU 1 0.580 54 1 A 1085 LEU 1 0.680 55 1 A 1086 LEU 1 0.650 #