data_SMR-bb00552acd89a153c960ac60a146953e_2 _entry.id SMR-bb00552acd89a153c960ac60a146953e_2 _struct.entry_id SMR-bb00552acd89a153c960ac60a146953e_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9WU78 (isoform 2)/ PDC6I_MOUSE, Programmed cell death 6-interacting protein Estimated model accuracy of this model is 0.014, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9WU78 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 112608.238 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PDC6I_MOUSE Q9WU78 1 ;MASFIWVQLKKTSEVDLAKPLVKFIQQTYPSGGEEQAQYCRAAEELSKLRRSALGRPLDKHEGALETLLR YYDQICSIEPKFPFSENQICLTFTWKDAFDKGSLFGGSVKLALASLGYEKSCVLFNCAALASQIAAEQNL DNDEGLKTAAKQYQFASGAFLHIKDTVLSALSREPTVDISPDTVGTLSLIMLAQAQEVFFLKATRDKMKD AIIAKLANQAADYFGDAFKQCQYKDTLPKYFYFQEVFPTLAAKQCIMQANAEYHQSILAKQQKKFGEEIA RLQHAAELIKNVASRYDEYVNVKDFSDKINRALTAAKKDNDFIYHDRVPDLKDLDPIGKATLVKPTPVNV PVSQKFTDLFEKMVPVSVQQSLAVFSQRKADLVNRSIAQMREATTLANGVLASLNLPAAIEDVSGDTVPQ SILTKSTSVVEQGGIQTVDQLIKELPELLQRNREILEESLRLLDEEEATDNDLRAKFKDRWQRTPSNDLY KPLRAEGAKFRAVLDKAVQADGQVKERYQSHRDTIALLCKPEPELNAAIPSANPAKTMQGSEVVSVLKSL LSNLDEIKKERESLENDLKSVNFDMTSKFLTALAQDGVINEEALSVTELDRIYGGLTSKVQESLKKQEGL LKNIQVSHQEFSKMKQSNNEANLREEVLKNLATAYDNFVELVANLKEGTKFYNELTEILVRFQNKCSDIV FARKTERDELLKDLQQSIAREPSAPSIPPPAYQSSPAAGHAAAPPTPAPRTMPPAKPQPPARPPPPVLPA NRVPPASAAAAPAGVGTASAAPPQTPGSAPPPQAQGPPYPTYPGYPGYCQMPMPMGYNPYAYGQYNMPYP PVYHQSPGQAPYPGPQQPTYPFPQPPQQSYYPQQ ; 'Programmed cell death 6-interacting protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 874 1 874 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . PDC6I_MOUSE Q9WU78 Q9WU78-2 1 874 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 4B3AA18F84E39723 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no F ;MASFIWVQLKKTSEVDLAKPLVKFIQQTYPSGGEEQAQYCRAAEELSKLRRSALGRPLDKHEGALETLLR YYDQICSIEPKFPFSENQICLTFTWKDAFDKGSLFGGSVKLALASLGYEKSCVLFNCAALASQIAAEQNL DNDEGLKTAAKQYQFASGAFLHIKDTVLSALSREPTVDISPDTVGTLSLIMLAQAQEVFFLKATRDKMKD AIIAKLANQAADYFGDAFKQCQYKDTLPKYFYFQEVFPTLAAKQCIMQANAEYHQSILAKQQKKFGEEIA RLQHAAELIKNVASRYDEYVNVKDFSDKINRALTAAKKDNDFIYHDRVPDLKDLDPIGKATLVKPTPVNV PVSQKFTDLFEKMVPVSVQQSLAVFSQRKADLVNRSIAQMREATTLANGVLASLNLPAAIEDVSGDTVPQ SILTKSTSVVEQGGIQTVDQLIKELPELLQRNREILEESLRLLDEEEATDNDLRAKFKDRWQRTPSNDLY KPLRAEGAKFRAVLDKAVQADGQVKERYQSHRDTIALLCKPEPELNAAIPSANPAKTMQGSEVVSVLKSL LSNLDEIKKERESLENDLKSVNFDMTSKFLTALAQDGVINEEALSVTELDRIYGGLTSKVQESLKKQEGL LKNIQVSHQEFSKMKQSNNEANLREEVLKNLATAYDNFVELVANLKEGTKFYNELTEILVRFQNKCSDIV FARKTERDELLKDLQQSIAREPSAPSIPPPAYQSSPAAGHAAAPPTPAPRTMPPAKPQPPARPPPPVLPA NRVPPASAAAAPAGVGTASAAPPQTPGSAPPPQAQGPPYPTYPGYPGYCQMPMPMGYNPYAYGQYNMPYP PVYHQSPGQAPYPGPQQPTYPFPQPPQQSYYPQQ ; ;MASFIWVQLKKTSEVDLAKPLVKFIQQTYPSGGEEQAQYCRAAEELSKLRRSALGRPLDKHEGALETLLR YYDQICSIEPKFPFSENQICLTFTWKDAFDKGSLFGGSVKLALASLGYEKSCVLFNCAALASQIAAEQNL DNDEGLKTAAKQYQFASGAFLHIKDTVLSALSREPTVDISPDTVGTLSLIMLAQAQEVFFLKATRDKMKD AIIAKLANQAADYFGDAFKQCQYKDTLPKYFYFQEVFPTLAAKQCIMQANAEYHQSILAKQQKKFGEEIA RLQHAAELIKNVASRYDEYVNVKDFSDKINRALTAAKKDNDFIYHDRVPDLKDLDPIGKATLVKPTPVNV PVSQKFTDLFEKMVPVSVQQSLAVFSQRKADLVNRSIAQMREATTLANGVLASLNLPAAIEDVSGDTVPQ SILTKSTSVVEQGGIQTVDQLIKELPELLQRNREILEESLRLLDEEEATDNDLRAKFKDRWQRTPSNDLY KPLRAEGAKFRAVLDKAVQADGQVKERYQSHRDTIALLCKPEPELNAAIPSANPAKTMQGSEVVSVLKSL LSNLDEIKKERESLENDLKSVNFDMTSKFLTALAQDGVINEEALSVTELDRIYGGLTSKVQESLKKQEGL LKNIQVSHQEFSKMKQSNNEANLREEVLKNLATAYDNFVELVANLKEGTKFYNELTEILVRFQNKCSDIV FARKTERDELLKDLQQSIAREPSAPSIPPPAYQSSPAAGHAAAPPTPAPRTMPPAKPQPPARPPPPVLPA NRVPPASAAAAPAGVGTASAAPPQTPGSAPPPQAQGPPYPTYPGYPGYCQMPMPMGYNPYAYGQYNMPYP PVYHQSPGQAPYPGPQQPTYPFPQPPQQSYYPQQ ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 SER . 1 4 PHE . 1 5 ILE . 1 6 TRP . 1 7 VAL . 1 8 GLN . 1 9 LEU . 1 10 LYS . 1 11 LYS . 1 12 THR . 1 13 SER . 1 14 GLU . 1 15 VAL . 1 16 ASP . 1 17 LEU . 1 18 ALA . 1 19 LYS . 1 20 PRO . 1 21 LEU . 1 22 VAL . 1 23 LYS . 1 24 PHE . 1 25 ILE . 1 26 GLN . 1 27 GLN . 1 28 THR . 1 29 TYR . 1 30 PRO . 1 31 SER . 1 32 GLY . 1 33 GLY . 1 34 GLU . 1 35 GLU . 1 36 GLN . 1 37 ALA . 1 38 GLN . 1 39 TYR . 1 40 CYS . 1 41 ARG . 1 42 ALA . 1 43 ALA . 1 44 GLU . 1 45 GLU . 1 46 LEU . 1 47 SER . 1 48 LYS . 1 49 LEU . 1 50 ARG . 1 51 ARG . 1 52 SER . 1 53 ALA . 1 54 LEU . 1 55 GLY . 1 56 ARG . 1 57 PRO . 1 58 LEU . 1 59 ASP . 1 60 LYS . 1 61 HIS . 1 62 GLU . 1 63 GLY . 1 64 ALA . 1 65 LEU . 1 66 GLU . 1 67 THR . 1 68 LEU . 1 69 LEU . 1 70 ARG . 1 71 TYR . 1 72 TYR . 1 73 ASP . 1 74 GLN . 1 75 ILE . 1 76 CYS . 1 77 SER . 1 78 ILE . 1 79 GLU . 1 80 PRO . 1 81 LYS . 1 82 PHE . 1 83 PRO . 1 84 PHE . 1 85 SER . 1 86 GLU . 1 87 ASN . 1 88 GLN . 1 89 ILE . 1 90 CYS . 1 91 LEU . 1 92 THR . 1 93 PHE . 1 94 THR . 1 95 TRP . 1 96 LYS . 1 97 ASP . 1 98 ALA . 1 99 PHE . 1 100 ASP . 1 101 LYS . 1 102 GLY . 1 103 SER . 1 104 LEU . 1 105 PHE . 1 106 GLY . 1 107 GLY . 1 108 SER . 1 109 VAL . 1 110 LYS . 1 111 LEU . 1 112 ALA . 1 113 LEU . 1 114 ALA . 1 115 SER . 1 116 LEU . 1 117 GLY . 1 118 TYR . 1 119 GLU . 1 120 LYS . 1 121 SER . 1 122 CYS . 1 123 VAL . 1 124 LEU . 1 125 PHE . 1 126 ASN . 1 127 CYS . 1 128 ALA . 1 129 ALA . 1 130 LEU . 1 131 ALA . 1 132 SER . 1 133 GLN . 1 134 ILE . 1 135 ALA . 1 136 ALA . 1 137 GLU . 1 138 GLN . 1 139 ASN . 1 140 LEU . 1 141 ASP . 1 142 ASN . 1 143 ASP . 1 144 GLU . 1 145 GLY . 1 146 LEU . 1 147 LYS . 1 148 THR . 1 149 ALA . 1 150 ALA . 1 151 LYS . 1 152 GLN . 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A 1 835 TYR 835 ? ? ? F . A 1 836 ASN 836 ? ? ? F . A 1 837 MET 837 ? ? ? F . A 1 838 PRO 838 ? ? ? F . A 1 839 TYR 839 ? ? ? F . A 1 840 PRO 840 ? ? ? F . A 1 841 PRO 841 ? ? ? F . A 1 842 VAL 842 ? ? ? F . A 1 843 TYR 843 ? ? ? F . A 1 844 HIS 844 ? ? ? F . A 1 845 GLN 845 ? ? ? F . A 1 846 SER 846 ? ? ? F . A 1 847 PRO 847 ? ? ? F . A 1 848 GLY 848 ? ? ? F . A 1 849 GLN 849 ? ? ? F . A 1 850 ALA 850 ? ? ? F . A 1 851 PRO 851 ? ? ? F . A 1 852 TYR 852 ? ? ? F . A 1 853 PRO 853 ? ? ? F . A 1 854 GLY 854 ? ? ? F . A 1 855 PRO 855 ? ? ? F . A 1 856 GLN 856 ? ? ? F . A 1 857 GLN 857 ? ? ? F . A 1 858 PRO 858 ? ? ? F . A 1 859 THR 859 ? ? ? F . A 1 860 TYR 860 ? ? ? F . A 1 861 PRO 861 ? ? ? F . A 1 862 PHE 862 ? ? ? F . A 1 863 PRO 863 ? ? ? F . A 1 864 GLN 864 ? ? ? F . A 1 865 PRO 865 ? ? ? F . A 1 866 PRO 866 ? ? ? F . A 1 867 GLN 867 ? ? ? F . A 1 868 GLN 868 ? ? ? F . A 1 869 SER 869 ? ? ? F . A 1 870 TYR 870 ? ? ? F . A 1 871 TYR 871 ? ? ? F . A 1 872 PRO 872 ? ? ? F . A 1 873 GLN 873 ? ? ? F . A 1 874 GLN 874 ? ? ? F . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 '14-3-3 protein sigma {PDB ID=9axa, label_asym_id=F, auth_asym_id=F, SMTL ID=9axa.1.F}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 9axa, label_asym_id=F' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-08-13 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-08-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A F 3 1 F # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MERASLIQKAKLAEQAERYEDMAAFMKGAVEKGEELSCEERNLLSVAYKNVVGGQRAAWRVLSSIEQKSN EEGSEEKGPEVREYREKVETELQGVCDTVLGLLDSHLIKEAGDAESRVFYLKMKGDYYRYLAEVATGDDK KRIIDSARSAYQEAMDISKKEMPPTNPIRLGLALNFSVFHYEIANSPEEAISLAKTTFDEAMADLHTLSE DSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTADNAGEEGGEAPQEPQS ; ;MERASLIQKAKLAEQAERYEDMAAFMKGAVEKGEELSCEERNLLSVAYKNVVGGQRAAWRVLSSIEQKSN EEGSEEKGPEVREYREKVETELQGVCDTVLGLLDSHLIKEAGDAESRVFYLKMKGDYYRYLAEVATGDDK KRIIDSARSAYQEAMDISKKEMPPTNPIRLGLALNFSVFHYEIANSPEEAISLAKTTFDEAMADLHTLSE DSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTADNAGEEGGEAPQEPQS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 186 240 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 9axa 2024-11-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 874 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 874 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 180.000 18.182 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MASFIWVQLKKTSEVDLAKPLVKFIQQTYPSGGEEQAQYCRAAEELSKLRRSALGRPLDKHEGALETLLRYYDQICSIEPKFPFSENQICLTFTWKDAFDKGSLFGGSVKLALASLGYEKSCVLFNCAALASQIAAEQNLDNDEGLKTAAKQYQFASGAFLHIKDTVLSALSREPTVDISPDTVGTLSLIMLAQAQEVFFLKATRDKMKDAIIAKLANQAADYFGDAFKQCQYKDTLPKYFYFQEVFPTLAAKQCIMQANAEYHQSILAKQQKKFGEEIARLQHAAELIKNVASRYDEYVNVKDFSDKINRALTAAKKDNDFIYHDRVPDLKDLDPIGKATLVKPTPVNVPVSQKFTDLFEKMVPVSVQQSLAVFSQRKADLVNRSIAQMREATTLANGVLASLNLPAAIEDVSGDTVPQSILTKSTSVVEQGGIQTVDQLIKELPELLQRNREILEESLRLLDEEEATDNDLRAKFKDRWQRTPSNDLYKPLRAEGAKFRAVLDKAVQADGQVKERYQSHRDTIALLCKPEPELNAAIPSANPAKTMQGSEVVSVLKSLLSNLDEIKKERESLENDLKSVNFDMTSKFLTALAQDGVINEEALSVTELDRIYGGLTSKVQESLKKQEGLLKNIQVSHQEFSKMKQSNNEANLREEVLKNLATAYDNFVELVANLKEGTKFYNELTEILVRFQNKCSDIVFARKTERDELLKDLQQSIAREPSAPSIPPPAYQSSPAAGHAAAPPTPAPRTMPPAKPQPPARPPPPVLPANRVPPASAAAAPAGVGTASAAPPQTPGSAPPPQAQGPPYPTYPGYPGYCQMPMPMGYNPYAYGQYNMPYPPVYHQSPGQAPYPGPQQPTYPFPQPPQQSYYPQQ 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SPEEAISLAKTTFDEAMADLHTLSED--SYKDSTLIMQLLRDNLTLWTADNAGEEGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 9axa.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 2' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 653 653 ? A 215.698 184.294 207.680 1 1 F LEU 0.520 1 ATOM 2 C CA . LEU 653 653 ? A 216.715 183.609 206.812 1 1 F LEU 0.520 1 ATOM 3 C C . LEU 653 653 ? A 216.225 183.277 205.414 1 1 F LEU 0.520 1 ATOM 4 O O . LEU 653 653 ? A 215.966 182.125 205.094 1 1 F LEU 0.520 1 ATOM 5 C CB . LEU 653 653 ? A 217.153 182.317 207.529 1 1 F LEU 0.520 1 ATOM 6 C CG . LEU 653 653 ? A 217.835 182.518 208.892 1 1 F LEU 0.520 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 653 653 ? A 218.134 181.149 209.513 1 1 F LEU 0.520 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 653 653 ? A 219.130 183.325 208.756 1 1 F LEU 0.520 1 ATOM 9 N N . ARG 654 654 ? A 216.064 184.287 204.539 1 1 F ARG 0.530 1 ATOM 10 C CA . ARG 654 654 ? A 215.470 184.098 203.221 1 1 F ARG 0.530 1 ATOM 11 C C . ARG 654 654 ? A 216.263 183.197 202.282 1 1 F ARG 0.530 1 ATOM 12 O O . ARG 654 654 ? A 215.687 182.336 201.621 1 1 F ARG 0.530 1 ATOM 13 C CB . ARG 654 654 ? A 215.230 185.477 202.575 1 1 F ARG 0.530 1 ATOM 14 C CG . ARG 654 654 ? A 214.153 186.311 203.299 1 1 F ARG 0.530 1 ATOM 15 C CD . ARG 654 654 ? A 214.066 187.726 202.730 1 1 F ARG 0.530 1 ATOM 16 N NE . ARG 654 654 ? A 213.012 188.464 203.499 1 1 F ARG 0.530 1 ATOM 17 C CZ . ARG 654 654 ? A 212.784 189.775 203.337 1 1 F ARG 0.530 1 ATOM 18 N NH1 . ARG 654 654 ? A 213.528 190.503 202.508 1 1 F ARG 0.530 1 ATOM 19 N NH2 . ARG 654 654 ? A 211.792 190.371 203.994 1 1 F ARG 0.530 1 ATOM 20 N N . GLU 655 655 ? A 217.601 183.348 202.237 1 1 F GLU 0.600 1 ATOM 21 C CA . GLU 655 655 ? A 218.497 182.535 201.434 1 1 F GLU 0.600 1 ATOM 22 C C . GLU 655 655 ? A 218.477 181.057 201.802 1 1 F GLU 0.600 1 ATOM 23 O O . GLU 655 655 ? A 218.315 180.194 200.942 1 1 F GLU 0.600 1 ATOM 24 C CB . GLU 655 655 ? A 219.929 183.078 201.617 1 1 F GLU 0.600 1 ATOM 25 C CG . GLU 655 655 ? A 220.114 184.521 201.089 1 1 F GLU 0.600 1 ATOM 26 C CD . GLU 655 655 ? A 221.456 185.127 201.508 1 1 F GLU 0.600 1 ATOM 27 O OE1 . GLU 655 655 ? A 221.894 184.838 202.652 1 1 F GLU 0.600 1 ATOM 28 O OE2 . GLU 655 655 ? A 222.006 185.919 200.707 1 1 F GLU 0.600 1 ATOM 29 N N . GLU 656 656 ? A 218.565 180.748 203.114 1 1 F GLU 0.640 1 ATOM 30 C CA . GLU 656 656 ? A 218.465 179.402 203.661 1 1 F GLU 0.640 1 ATOM 31 C C . GLU 656 656 ? A 217.112 178.755 203.397 1 1 F GLU 0.640 1 ATOM 32 O O . GLU 656 656 ? A 217.018 177.608 202.956 1 1 F GLU 0.640 1 ATOM 33 C CB . GLU 656 656 ? A 218.721 179.422 205.189 1 1 F GLU 0.640 1 ATOM 34 C CG . GLU 656 656 ? A 218.852 178.015 205.826 1 1 F GLU 0.640 1 ATOM 35 C CD . GLU 656 656 ? A 220.109 177.247 205.398 1 1 F GLU 0.640 1 ATOM 36 O OE1 . GLU 656 656 ? A 221.013 177.844 204.754 1 1 F GLU 0.640 1 ATOM 37 O OE2 . GLU 656 656 ? A 220.151 176.032 205.712 1 1 F GLU 0.640 1 ATOM 38 N N . VAL 657 657 ? A 216.006 179.514 203.606 1 1 F VAL 0.670 1 ATOM 39 C CA . VAL 657 657 ? A 214.647 179.074 203.290 1 1 F VAL 0.670 1 ATOM 40 C C . VAL 657 657 ? A 214.504 178.739 201.819 1 1 F VAL 0.670 1 ATOM 41 O O . VAL 657 657 ? A 214.104 177.631 201.466 1 1 F VAL 0.670 1 ATOM 42 C CB . VAL 657 657 ? A 213.602 180.118 203.711 1 1 F VAL 0.670 1 ATOM 43 C CG1 . VAL 657 657 ? A 212.205 179.883 203.095 1 1 F VAL 0.670 1 ATOM 44 C CG2 . VAL 657 657 ? A 213.471 180.085 205.243 1 1 F VAL 0.670 1 ATOM 45 N N . LEU 658 658 ? A 214.918 179.649 200.916 1 1 F LEU 0.670 1 ATOM 46 C CA . LEU 658 658 ? A 214.829 179.432 199.485 1 1 F LEU 0.670 1 ATOM 47 C C . LEU 658 658 ? A 215.665 178.255 199.007 1 1 F LEU 0.670 1 ATOM 48 O O . LEU 658 658 ? A 215.215 177.436 198.201 1 1 F LEU 0.670 1 ATOM 49 C CB . LEU 658 658 ? A 215.228 180.716 198.727 1 1 F LEU 0.670 1 ATOM 50 C CG . LEU 658 658 ? A 215.098 180.640 197.193 1 1 F LEU 0.670 1 ATOM 51 C CD1 . LEU 658 658 ? A 213.662 180.347 196.735 1 1 F LEU 0.670 1 ATOM 52 C CD2 . LEU 658 658 ? A 215.610 181.939 196.562 1 1 F LEU 0.670 1 ATOM 53 N N . LYS 659 659 ? 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A 214.490 159.693 194.727 1 1 F LEU 0.590 1 ATOM 158 N N . VAL 672 672 ? A 209.615 161.341 192.478 1 1 F VAL 0.620 1 ATOM 159 C CA . VAL 672 672 ? A 208.172 161.146 192.278 1 1 F VAL 0.620 1 ATOM 160 C C . VAL 672 672 ? A 207.790 160.026 191.341 1 1 F VAL 0.620 1 ATOM 161 O O . VAL 672 672 ? A 206.671 159.499 191.398 1 1 F VAL 0.620 1 ATOM 162 C CB . VAL 672 672 ? A 207.433 162.382 191.785 1 1 F VAL 0.620 1 ATOM 163 C CG1 . VAL 672 672 ? A 207.480 163.463 192.862 1 1 F VAL 0.620 1 ATOM 164 C CG2 . VAL 672 672 ? A 207.972 162.935 190.454 1 1 F VAL 0.620 1 ATOM 165 N N . ALA 673 673 ? A 208.720 159.597 190.482 1 1 F ALA 0.470 1 ATOM 166 C CA . ALA 673 673 ? A 208.469 158.656 189.412 1 1 F ALA 0.470 1 ATOM 167 C C . ALA 673 673 ? A 208.200 157.234 189.919 1 1 F ALA 0.470 1 ATOM 168 O O . ALA 673 673 ? A 207.613 156.412 189.207 1 1 F ALA 0.470 1 ATOM 169 C CB . ALA 673 673 ? A 209.642 158.717 188.408 1 1 F ALA 0.470 1 ATOM 170 N N . ASN 674 674 ? A 208.560 156.929 191.185 1 1 F ASN 0.390 1 ATOM 171 C CA . ASN 674 674 ? A 208.381 155.607 191.774 1 1 F ASN 0.390 1 ATOM 172 C C . ASN 674 674 ? A 207.161 155.517 192.675 1 1 F ASN 0.390 1 ATOM 173 O O . ASN 674 674 ? A 206.589 154.441 192.849 1 1 F ASN 0.390 1 ATOM 174 C CB . ASN 674 674 ? A 209.584 155.216 192.659 1 1 F ASN 0.390 1 ATOM 175 C CG . ASN 674 674 ? A 210.810 155.083 191.776 1 1 F ASN 0.390 1 ATOM 176 O OD1 . ASN 674 674 ? A 210.766 154.491 190.695 1 1 F ASN 0.390 1 ATOM 177 N ND2 . ASN 674 674 ? A 211.957 155.627 192.233 1 1 F ASN 0.390 1 ATOM 178 N N . LEU 675 675 ? A 206.699 156.648 193.254 1 1 F LEU 0.390 1 ATOM 179 C CA . LEU 675 675 ? A 205.505 156.674 194.113 1 1 F LEU 0.390 1 ATOM 180 C C . LEU 675 675 ? A 204.258 156.309 193.363 1 1 F LEU 0.390 1 ATOM 181 O O . LEU 675 675 ? A 203.311 155.751 193.942 1 1 F LEU 0.390 1 ATOM 182 C CB . LEU 675 675 ? A 205.185 158.067 194.678 1 1 F LEU 0.390 1 ATOM 183 C CG . LEU 675 675 ? A 206.050 158.486 195.861 1 1 F LEU 0.390 1 ATOM 184 C CD1 . LEU 675 675 ? A 205.744 159.952 196.187 1 1 F LEU 0.390 1 ATOM 185 C CD2 . LEU 675 675 ? A 205.783 157.582 197.074 1 1 F LEU 0.390 1 ATOM 186 N N . LYS 676 676 ? A 204.291 156.692 192.082 1 1 F LYS 0.450 1 ATOM 187 C CA . LYS 676 676 ? A 203.452 156.299 190.976 1 1 F LYS 0.450 1 ATOM 188 C C . LYS 676 676 ? A 202.794 157.523 190.351 1 1 F LYS 0.450 1 ATOM 189 O O . LYS 676 676 ? A 201.822 158.052 190.888 1 1 F LYS 0.450 1 ATOM 190 C CB . LYS 676 676 ? A 202.411 155.209 191.367 1 1 F LYS 0.450 1 ATOM 191 C CG . LYS 676 676 ? A 201.496 154.662 190.294 1 1 F LYS 0.450 1 ATOM 192 C CD . LYS 676 676 ? A 202.076 153.682 189.290 1 1 F LYS 0.450 1 ATOM 193 C CE . LYS 676 676 ? A 200.884 153.251 188.453 1 1 F LYS 0.450 1 ATOM 194 N NZ . LYS 676 676 ? A 201.338 152.330 187.415 1 1 F LYS 0.450 1 ATOM 195 N N . GLU 677 677 ? A 203.308 158.033 189.208 1 1 F GLU 0.430 1 ATOM 196 C CA . GLU 677 677 ? A 202.742 159.172 188.486 1 1 F GLU 0.430 1 ATOM 197 C C . GLU 677 677 ? A 201.259 159.036 188.114 1 1 F GLU 0.430 1 ATOM 198 O O . GLU 677 677 ? A 200.793 157.988 187.664 1 1 F GLU 0.430 1 ATOM 199 C CB . GLU 677 677 ? A 203.583 159.496 187.230 1 1 F GLU 0.430 1 ATOM 200 C CG . GLU 677 677 ? A 203.217 160.817 186.508 1 1 F GLU 0.430 1 ATOM 201 C CD . GLU 677 677 ? A 204.085 161.082 185.275 1 1 F GLU 0.430 1 ATOM 202 O OE1 . GLU 677 677 ? A 203.842 162.135 184.630 1 1 F GLU 0.430 1 ATOM 203 O OE2 . GLU 677 677 ? A 204.981 160.253 184.977 1 1 F GLU 0.430 1 ATOM 204 N N . GLY 678 678 ? A 200.475 160.118 188.342 1 1 F GLY 0.500 1 ATOM 205 C CA . GLY 678 678 ? A 199.039 160.198 188.071 1 1 F GLY 0.500 1 ATOM 206 C C . GLY 678 678 ? A 198.137 159.566 189.105 1 1 F GLY 0.500 1 ATOM 207 O O . GLY 678 678 ? A 196.917 159.584 188.959 1 1 F GLY 0.500 1 ATOM 208 N N . THR 679 679 ? A 198.689 159.006 190.199 1 1 F THR 0.650 1 ATOM 209 C CA . THR 679 679 ? A 197.883 158.433 191.276 1 1 F THR 0.650 1 ATOM 210 C C . THR 679 679 ? A 197.681 159.368 192.406 1 1 F THR 0.650 1 ATOM 211 O O . THR 679 679 ? A 198.113 160.513 192.390 1 1 F THR 0.650 1 ATOM 212 C CB . THR 679 679 ? A 198.379 157.118 191.877 1 1 F THR 0.650 1 ATOM 213 O OG1 . THR 679 679 ? A 199.620 157.223 192.575 1 1 F THR 0.650 1 ATOM 214 C CG2 . THR 679 679 ? A 198.538 156.203 190.667 1 1 F THR 0.650 1 ATOM 215 N N . LYS 680 680 ? A 197.016 158.874 193.464 1 1 F LYS 0.580 1 ATOM 216 C CA . LYS 680 680 ? A 196.861 159.610 194.689 1 1 F LYS 0.580 1 ATOM 217 C C . LYS 680 680 ? A 198.188 160.028 195.319 1 1 F LYS 0.580 1 ATOM 218 O O . LYS 680 680 ? A 198.359 161.197 195.654 1 1 F LYS 0.580 1 ATOM 219 C CB . LYS 680 680 ? A 196.054 158.774 195.699 1 1 F LYS 0.580 1 ATOM 220 C CG . LYS 680 680 ? A 195.798 159.579 196.972 1 1 F LYS 0.580 1 ATOM 221 C CD . LYS 680 680 ? A 195.007 158.817 198.026 1 1 F LYS 0.580 1 ATOM 222 C CE . LYS 680 680 ? A 194.827 159.671 199.279 1 1 F LYS 0.580 1 ATOM 223 N NZ . LYS 680 680 ? A 194.044 158.897 200.255 1 1 F LYS 0.580 1 ATOM 224 N N . PHE 681 681 ? A 199.202 159.159 195.452 1 1 F PHE 0.520 1 ATOM 225 C CA . PHE 681 681 ? A 200.468 159.533 196.073 1 1 F PHE 0.520 1 ATOM 226 C C . PHE 681 681 ? A 201.230 160.616 195.335 1 1 F PHE 0.520 1 ATOM 227 O O . PHE 681 681 ? A 201.796 161.531 195.933 1 1 F PHE 0.520 1 ATOM 228 C CB . PHE 681 681 ? A 201.399 158.311 196.188 1 1 F PHE 0.520 1 ATOM 229 C CG . PHE 681 681 ? A 200.945 157.280 197.181 1 1 F PHE 0.520 1 ATOM 230 C CD1 . PHE 681 681 ? A 200.203 157.576 198.340 1 1 F PHE 0.520 1 ATOM 231 C CD2 . PHE 681 681 ? A 201.376 155.962 196.978 1 1 F PHE 0.520 1 ATOM 232 C CE1 . PHE 681 681 ? A 199.886 156.566 199.260 1 1 F PHE 0.520 1 ATOM 233 C CE2 . PHE 681 681 ? A 201.069 154.955 197.896 1 1 F PHE 0.520 1 ATOM 234 C CZ . PHE 681 681 ? A 200.319 155.254 199.036 1 1 F PHE 0.520 1 ATOM 235 N N . TYR 682 682 ? 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