data_SMR-6174065351d8f1dc970c4a4d832f418b_1 _entry.id SMR-6174065351d8f1dc970c4a4d832f418b_1 _struct.entry_id SMR-6174065351d8f1dc970c4a4d832f418b_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - G1T8J0/ G1T8J0_RABIT, Collagen type III alpha 1 chain Estimated model accuracy of this model is 0.032, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries G1T8J0' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 164860.167 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP G1T8J0_RABIT G1T8J0 1 ;MMSFVQKVTWLLLALLHPTVILAQQAPAGGCTHLGQSYADRDVWKPEPCQICICDGGYVLCDDVICDEEN LDCPNPEIPFGECCAVCPAPETTTPRTVDGLGPQGPKGDPGPPGIPGRNGDPGIPGQPGSPGSPGPPGIC ESCPTGTQNYSPQFDSYDVKSGIGGIGGGYPGPAGPPGPPGPPGTSGHPGSPGSPGYQGPPGEPGQAGPA GPPGPPGAIGPSGPAGKDGESGRPGRPGERGLPGPPGIKGPAGMPGFPGMKGHRGFDGRNGEKGETGAPG LKGENGLPGENGAPGPMGPRGAPGERGRPGLPGAAGARGNDGARGSDGQPGPPGPPGTAGFPGSPGAKGE VGPAGSPGSNGSPGQRGEPGPQGHAGAQGPPGPPGNNGSPGGKGEMGPAGIPGAPGLMGARGPPGPPGTN GIPGQRGAAGEPGKNGAKGEPGPRGERGEAGSPGIPGAKGEDGKDGSPGEPGANGLPGAAGERGAPGFRG PAGPSGTPGEKGPAGERGGPGPAGPRGATGEPGRDGAPGSPGMRGMPGSPGGPGSDGKPGPPGSQGDSGR PGPPGPSGPRGQPGVMGFPGPKGNDGAPGKNGERGGPGGPGLPGPPGKNGETGPQGPPGPTGPSGDKGDT GPPGPQGLQGLPGTSGPPGENGKPGEAGPKGDAGAPGAPGGKGDAGAPGERGPPGLAGTPGLRGGAGPPG PEGGKGPAGPPGPPGASGTPGLQGMPGERGGPGSPGPKGDKGEPGGAGADGAPGKDGPRGPAGPIGPPGP AGQPGDKGEGGAPGLPGIAGPRGGPGERGEHGPPGPAGFPGAPGQNGEPGAKGERGAPGEKGEGGPPGIA GPPGGSGPAGPPGPQGVKGERGSPGGPGAAGFPGARGLPGPPGNNGNPGPPGPSGGPGKDGPPGPPGSNG APGNPGVAGPKGDAGQPGEKGSPGAQGPPGAPGPLGLAGITGARGLAGPPGMPGPRGSPGPQGVKGESGK PGVNGQNGERGPPGPQGLPGLAGTAGEPGRDGNPGSDGQPGRDGAPGGKGDRGENGSPGAPGAPGHPGPP GPVGPAGKSGDRGETGPAGPSGAPGPAGARGAPGPQGPRGDKGETGERGANGIKGHRGFPGNPGPPGSPG PSGHQGAVGSPGPAGPRGPVGPSGPPGKDGTSGHPGPIGPPGPRGNRGERGSEGSPGHPGQPGPPGPPGA PGPCCGGAAAIAGVGGEKSGGFAPYYGDDPMDFKTNTEEIMSSLKSVNGQIESLISPDGSRKNPARNCRD LKFCHPELKSGEYWVDPNQGCKLDAIKVFCNMETGETCVNANPLSIPRKKWWTDSGAEKKHVWFGESMDG GFQFSYGDPELPEDVLDVQLAFLRLLSSRASQNITYHCKNSIAYMDQASGNVKKALKLMGSNEGEFKAEG NSKFTYTVLEDGCSKHTGEWSKTVFEYRTRKAVRLPIIDIAPYDIGGPDQEFGADVGPVCFL ; 'Collagen type III alpha 1 chain' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1462 1 1462 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . G1T8J0_RABIT G1T8J0 . 1 1462 9986 'Oryctolagus cuniculus (Rabbit)' 2019-12-11 0C6E5E4D5A147431 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MMSFVQKVTWLLLALLHPTVILAQQAPAGGCTHLGQSYADRDVWKPEPCQICICDGGYVLCDDVICDEEN LDCPNPEIPFGECCAVCPAPETTTPRTVDGLGPQGPKGDPGPPGIPGRNGDPGIPGQPGSPGSPGPPGIC ESCPTGTQNYSPQFDSYDVKSGIGGIGGGYPGPAGPPGPPGPPGTSGHPGSPGSPGYQGPPGEPGQAGPA GPPGPPGAIGPSGPAGKDGESGRPGRPGERGLPGPPGIKGPAGMPGFPGMKGHRGFDGRNGEKGETGAPG LKGENGLPGENGAPGPMGPRGAPGERGRPGLPGAAGARGNDGARGSDGQPGPPGPPGTAGFPGSPGAKGE VGPAGSPGSNGSPGQRGEPGPQGHAGAQGPPGPPGNNGSPGGKGEMGPAGIPGAPGLMGARGPPGPPGTN GIPGQRGAAGEPGKNGAKGEPGPRGERGEAGSPGIPGAKGEDGKDGSPGEPGANGLPGAAGERGAPGFRG PAGPSGTPGEKGPAGERGGPGPAGPRGATGEPGRDGAPGSPGMRGMPGSPGGPGSDGKPGPPGSQGDSGR PGPPGPSGPRGQPGVMGFPGPKGNDGAPGKNGERGGPGGPGLPGPPGKNGETGPQGPPGPTGPSGDKGDT GPPGPQGLQGLPGTSGPPGENGKPGEAGPKGDAGAPGAPGGKGDAGAPGERGPPGLAGTPGLRGGAGPPG PEGGKGPAGPPGPPGASGTPGLQGMPGERGGPGSPGPKGDKGEPGGAGADGAPGKDGPRGPAGPIGPPGP AGQPGDKGEGGAPGLPGIAGPRGGPGERGEHGPPGPAGFPGAPGQNGEPGAKGERGAPGEKGEGGPPGIA GPPGGSGPAGPPGPQGVKGERGSPGGPGAAGFPGARGLPGPPGNNGNPGPPGPSGGPGKDGPPGPPGSNG APGNPGVAGPKGDAGQPGEKGSPGAQGPPGAPGPLGLAGITGARGLAGPPGMPGPRGSPGPQGVKGESGK PGVNGQNGERGPPGPQGLPGLAGTAGEPGRDGNPGSDGQPGRDGAPGGKGDRGENGSPGAPGAPGHPGPP GPVGPAGKSGDRGETGPAGPSGAPGPAGARGAPGPQGPRGDKGETGERGANGIKGHRGFPGNPGPPGSPG PSGHQGAVGSPGPAGPRGPVGPSGPPGKDGTSGHPGPIGPPGPRGNRGERGSEGSPGHPGQPGPPGPPGA PGPCCGGAAAIAGVGGEKSGGFAPYYGDDPMDFKTNTEEIMSSLKSVNGQIESLISPDGSRKNPARNCRD LKFCHPELKSGEYWVDPNQGCKLDAIKVFCNMETGETCVNANPLSIPRKKWWTDSGAEKKHVWFGESMDG GFQFSYGDPELPEDVLDVQLAFLRLLSSRASQNITYHCKNSIAYMDQASGNVKKALKLMGSNEGEFKAEG NSKFTYTVLEDGCSKHTGEWSKTVFEYRTRKAVRLPIIDIAPYDIGGPDQEFGADVGPVCFL ; ;MMSFVQKVTWLLLALLHPTVILAQQAPAGGCTHLGQSYADRDVWKPEPCQICICDGGYVLCDDVICDEEN LDCPNPEIPFGECCAVCPAPETTTPRTVDGLGPQGPKGDPGPPGIPGRNGDPGIPGQPGSPGSPGPPGIC ESCPTGTQNYSPQFDSYDVKSGIGGIGGGYPGPAGPPGPPGPPGTSGHPGSPGSPGYQGPPGEPGQAGPA GPPGPPGAIGPSGPAGKDGESGRPGRPGERGLPGPPGIKGPAGMPGFPGMKGHRGFDGRNGEKGETGAPG LKGENGLPGENGAPGPMGPRGAPGERGRPGLPGAAGARGNDGARGSDGQPGPPGPPGTAGFPGSPGAKGE VGPAGSPGSNGSPGQRGEPGPQGHAGAQGPPGPPGNNGSPGGKGEMGPAGIPGAPGLMGARGPPGPPGTN GIPGQRGAAGEPGKNGAKGEPGPRGERGEAGSPGIPGAKGEDGKDGSPGEPGANGLPGAAGERGAPGFRG PAGPSGTPGEKGPAGERGGPGPAGPRGATGEPGRDGAPGSPGMRGMPGSPGGPGSDGKPGPPGSQGDSGR PGPPGPSGPRGQPGVMGFPGPKGNDGAPGKNGERGGPGGPGLPGPPGKNGETGPQGPPGPTGPSGDKGDT GPPGPQGLQGLPGTSGPPGENGKPGEAGPKGDAGAPGAPGGKGDAGAPGERGPPGLAGTPGLRGGAGPPG PEGGKGPAGPPGPPGASGTPGLQGMPGERGGPGSPGPKGDKGEPGGAGADGAPGKDGPRGPAGPIGPPGP AGQPGDKGEGGAPGLPGIAGPRGGPGERGEHGPPGPAGFPGAPGQNGEPGAKGERGAPGEKGEGGPPGIA GPPGGSGPAGPPGPQGVKGERGSPGGPGAAGFPGARGLPGPPGNNGNPGPPGPSGGPGKDGPPGPPGSNG APGNPGVAGPKGDAGQPGEKGSPGAQGPPGAPGPLGLAGITGARGLAGPPGMPGPRGSPGPQGVKGESGK PGVNGQNGERGPPGPQGLPGLAGTAGEPGRDGNPGSDGQPGRDGAPGGKGDRGENGSPGAPGAPGHPGPP GPVGPAGKSGDRGETGPAGPSGAPGPAGARGAPGPQGPRGDKGETGERGANGIKGHRGFPGNPGPPGSPG 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# loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # 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# loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1e-09 61.194 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMSFVQKVTWLLLALLHPTVILAQQAPAGGCTHLGQSYADRDVWKPEPCQICICDGGYVLCDDVICDEENLDCPNPEIPFGECCAVCPAPETTTPRTVDGLGPQGPKGDPGPPGIPGRNGDPGIPGQPGSPGSPGPPGICESCPTGTQNYSPQFDSYDVKSGIGGIGGGYPGPAGPPGPPGPPGTSGHPGSPGSPGYQGPPGEPGQAGPAGPPGPPGAIGPSGPAGKDGESGRPGRPGERGLPGPPGIKGPAGMPGFPGMKGHRGFDGRNGEKGETGAPGLKGENGLPGENGAPGPMGPRGAPGERGRPGLPGAAGARGNDGARGSDGQPGPPGPPGTAGFPGSPGAKGEVGPAGSPGSNGSPGQRGEPGPQGHAGAQGPPGPPGNNGSPGGKGEMGPAGIPGAPGLMGARGPPGPPGTNGIPGQRGAAGEPGKNGAKGEPGPRGERGEAGSPGIPGAKGEDGKDGSPGEPGANGLPGAAGERGAPGFRGPAGPSGTPGEKGPAGERGGPGPAGPRGATGEPGRDGAPGSPGMRGMPGSPGGPGSDGKPGPPGSQGDSGRPGPPGPSGPRGQPGVMGFPGPKGNDGAPGKNGERGGPGGPGLPGPPGKNGETGPQGPPGPTGPSGDKGDTGPPGPQGLQGLPGTSGPPGENGKPGEAGPKGDAGAPGAPGGKGDAGAPGERGPPGLAGTPGLRGGAGPPGPEGGKGPAGPPGPPGASGTPGLQGMPGERGGPGSPGPKGDKGEPGGAGADGAPGKDGPRGPAGPIGPPGPAGQPGDKGEGGAPGLPGIAGPRGGPGERGEHGPPGPAGFPGAPGQNGEPGAKGERGAPGEKGEGGPPGIAGPPGGSGPAGPPGPQGVKGERGSPGGPGAAGFPGARGLPGPPGNNGNPGPPGPSGGPGKDGPPGPPGSNGAPGNPGVAGPKGDAGQPGEKGSPGAQGPPGAPGPLGLAGITGARGLAGPPGMPGPRGSPGPQGVKGESGKPGVNGQNGERGPPGPQGLPGLAGTAGEPGRDGNPGSDGQPGRDGAPGGKGDRGENGSPGAPGAPGHPGPPGPVGPAGKSGDRGETGPAGPSGAPGPAGARGAPGPQGPRGDKGETGERGANGIKGHRGFPGNPGPPGSPGPSGHQGAVGSPGPAGPRGPVGPSGPPGKDGTSGHPGPIGPPGPRGNRGERGSEGSPGHPGQPGPPGPPGAPGPCCGGAAAIAGVGGEKSGGFAPYYGDDPMDFKTNTEEIMSSLKSVNGQIESLISPDGSRKNPARNCRDLKFCHPELKSGEYWVDPNQGCKLDAIKVFCNMETGETCVNANPLSIPRKKWWTDSGAEKKHVWFGESMDGGFQFSYGDPELPEDVLDVQLAFLRLLSSRASQNITYHCKNSIAYMDQASGNVKKALKLMGSNEGEFKAEGNSKFTYTVLEDGCSKHTGEWSKTVFEYRTRKAVRLPIIDIAPYDIGGPDQEFGADVGPVCFL 2 1 2 --------------------------EAGSCVQDGQRYNDKDVWKPEPCRICVCDTGTVLCDDIICED-VKDCLSPEIPFGECCPICPADLAAA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1u5m.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 27 27 ? A -4.534 20.656 1.365 1 1 A PRO 0.350 1 ATOM 2 C CA . PRO 27 27 ? A -3.571 21.815 1.105 1 1 A PRO 0.350 1 ATOM 3 C C . PRO 27 27 ? A -2.353 21.343 0.372 1 1 A PRO 0.350 1 ATOM 4 O O . PRO 27 27 ? A -1.708 20.438 0.882 1 1 A PRO 0.350 1 ATOM 5 C CB . PRO 27 27 ? A -3.206 22.319 2.468 1 1 A PRO 0.350 1 ATOM 6 C CG . PRO 27 27 ? A -4.257 21.783 3.465 1 1 A PRO 0.350 1 ATOM 7 C CD . PRO 27 27 ? A -4.836 20.542 2.876 1 1 A PRO 0.350 1 ATOM 8 N N . ALA 28 28 ? A -1.994 22.048 -0.730 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 9 C CA . ALA 28 28 ? A -0.826 21.796 -1.558 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 10 C C . ALA 28 28 ? A -0.924 20.466 -2.320 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 11 O O . ALA 28 28 ? A -1.621 19.551 -1.900 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 12 C CB . ALA 28 28 ? A 0.503 22.042 -0.796 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 13 N N . GLY 29 29 ? A -0.307 20.351 -3.521 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 14 C CA . GLY 29 29 ? A -0.340 19.082 -4.258 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 15 C C . GLY 29 29 ? A 0.914 18.286 -4.062 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 16 O O . GLY 29 29 ? A 0.878 17.074 -3.907 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 17 N N . GLY 30 30 ? A 2.078 18.971 -4.054 1 1 A GLY 0.630 1 ATOM 18 C CA . GLY 30 30 ? A 3.370 18.375 -3.737 1 1 A GLY 0.630 1 ATOM 19 C C . GLY 30 30 ? A 3.448 17.705 -2.394 1 1 A GLY 0.630 1 ATOM 20 O O . GLY 30 30 ? A 3.012 18.240 -1.381 1 1 A GLY 0.630 1 ATOM 21 N N . CYS 31 31 ? A 4.097 16.532 -2.356 1 1 A CYS 0.640 1 ATOM 22 C CA . CYS 31 31 ? A 4.168 15.733 -1.157 1 1 A CYS 0.640 1 ATOM 23 C C . CYS 31 31 ? A 5.597 15.681 -0.728 1 1 A CYS 0.640 1 ATOM 24 O O . CYS 31 31 ? A 6.493 15.442 -1.533 1 1 A CYS 0.640 1 ATOM 25 C CB . CYS 31 31 ? A 3.696 14.278 -1.383 1 1 A CYS 0.640 1 ATOM 26 S SG . CYS 31 31 ? A 1.892 14.128 -1.285 1 1 A CYS 0.640 1 ATOM 27 N N . THR 32 32 ? A 5.824 15.900 0.578 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 28 C CA . THR 32 32 ? A 7.154 15.946 1.157 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 29 C C . THR 32 32 ? A 7.429 14.611 1.789 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 30 O O . THR 32 32 ? A 6.904 14.292 2.850 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 31 C CB . THR 32 32 ? A 7.296 17.021 2.229 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 32 O OG1 . THR 32 32 ? A 7.139 18.289 1.619 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 33 C CG2 . THR 32 32 ? A 8.696 17.043 2.863 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 34 N N . HIS 33 33 ? A 8.280 13.786 1.156 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 35 C CA . HIS 33 33 ? A 8.607 12.466 1.661 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 36 C C . HIS 33 33 ? A 10.087 12.487 1.948 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 37 O O . HIS 33 33 ? A 10.880 12.527 1.020 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 38 C CB . HIS 33 33 ? A 8.327 11.395 0.577 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 39 C CG . HIS 33 33 ? A 8.632 9.998 1.013 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 40 N ND1 . HIS 33 33 ? A 7.816 9.410 1.956 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 41 C CD2 . HIS 33 33 ? A 9.645 9.158 0.672 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 42 C CE1 . HIS 33 33 ? A 8.342 8.223 2.175 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 43 N NE2 . HIS 33 33 ? A 9.450 8.018 1.423 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 44 N N . LEU 34 34 ? A 10.498 12.547 3.235 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 45 C CA . LEU 34 34 ? A 11.900 12.581 3.669 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 46 C C . LEU 34 34 ? A 12.628 13.880 3.329 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 47 O O . LEU 34 34 ? A 13.834 14.014 3.518 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 48 C CB . LEU 34 34 ? A 12.731 11.356 3.192 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 49 C CG . LEU 34 34 ? A 12.092 9.985 3.500 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 50 C CD1 . LEU 34 34 ? A 12.910 8.885 2.805 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 51 C CD2 . LEU 34 34 ? A 11.971 9.726 5.014 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 52 N N . GLY 35 35 ? A 11.875 14.894 2.853 1 1 A GLY 0.560 1 ATOM 53 C CA . GLY 35 35 ? A 12.425 16.121 2.292 1 1 A GLY 0.560 1 ATOM 54 C C . GLY 35 35 ? A 12.499 16.107 0.790 1 1 A GLY 0.560 1 ATOM 55 O O . GLY 35 35 ? A 13.176 16.935 0.194 1 1 A GLY 0.560 1 ATOM 56 N N . GLN 36 36 ? A 11.795 15.182 0.113 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 57 C CA . GLN 36 36 ? A 11.774 15.134 -1.330 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 58 C C . GLN 36 36 ? A 10.397 15.513 -1.816 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 59 O O . GLN 36 36 ? A 9.395 14.974 -1.353 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 60 C CB . GLN 36 36 ? A 12.130 13.715 -1.812 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 61 C CG . GLN 36 36 ? A 13.645 13.435 -1.732 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 62 C CD . GLN 36 36 ? A 13.931 11.944 -1.896 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 63 O OE1 . GLN 36 36 ? A 13.467 11.092 -1.141 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 64 N NE2 . GLN 36 36 ? A 14.696 11.576 -2.947 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 65 N N . SER 37 37 ? A 10.355 16.483 -2.757 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 66 C CA . SER 37 37 ? A 9.150 16.987 -3.397 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 67 C C . SER 37 37 ? A 8.808 16.086 -4.563 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 68 O O . SER 37 37 ? A 9.543 16.007 -5.544 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 69 C CB . SER 37 37 ? A 9.329 18.450 -3.908 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 70 O OG . SER 37 37 ? A 8.129 18.986 -4.474 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 71 N N . TYR 38 38 ? A 7.681 15.368 -4.439 1 1 A TYR 0.590 1 ATOM 72 C CA . TYR 38 38 ? A 7.180 14.437 -5.429 1 1 A TYR 0.590 1 ATOM 73 C C . TYR 38 38 ? A 5.822 14.919 -5.899 1 1 A TYR 0.590 1 ATOM 74 O O . TYR 38 38 ? A 5.126 15.639 -5.180 1 1 A TYR 0.590 1 ATOM 75 C CB . TYR 38 38 ? 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