data_SMR-c3d87c8afcf4e9163f924ee2e3a152fa_1 _entry.id SMR-c3d87c8afcf4e9163f924ee2e3a152fa_1 _struct.entry_id SMR-c3d87c8afcf4e9163f924ee2e3a152fa_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q5VV67 (isoform 2)/ PPRC1_HUMAN, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.019, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5VV67 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 192924.683 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PPRC1_HUMAN Q5VV67 1 ;MRHCWGPCRATWMPPLSPSLRILGALESIPDSELLVSPREGSSLHKLLTLSRTPPERDLITPVDPLGPST GSSRGSGVEMSLPDPSWDFSPPSFLETSSPKLPSWRPPRSRPRWGQSPPPQQRSDGEEEEEVASFSGQIL AGELDNCVSSIPDFPMHLACPEEEDKATAAEMAVPAAGDESISSLSELVRAMHPYCLPNLTHLASLEDEL QEQPDDLTLPEGCVVLEIVGQAATAGDDLEIPVVVRQVSPGPRPVLLDDSLETSSALQLLMPTLESETEA AVPKVTLCSEKEGLSLNSEEKLDSACLLKPREVVEPVVPKEPQNPPANAAPGSQRARKGRKKKSKEQPAA CVEGYARRLRSSSRGQSTVGTEVTSQVDNLQKQPQEELQKESGPLQGKGKPRAWARAWAAALENSSPKNL ERSAGQSSPAKEGPLDLYPKLADTIQTNPIPTHLSLVDSAQASPMPVDSVEADPTAVGPVLAGPVPVDPG LVDLASTSSELVEPLPAEPVLINPVLADSAAVDPAVVPISDNLPPVDAVPSGPAPVDLALVDPVPNDLTP VDPVLVKSRPTDPRRGAVSSALGGSAPQLLVESESLDPPKTIIPEVKEVVDSLKIESGTSATTHEARPRP LSLSEYRRRRQQRQAETEERSPQPPTGKWPSLPETPTGLADIPCLVIPPAPAKKTALQRSPETPLEICLV PVGPSPASPSPEPPVSKPVASSPTEQVPSQEMPLLARPSPPVQSVSPAVPTPPSMSAALPFPAGGLGMPP SLPPPPLQPPSLPLSMGPVLPDPFTHYAPLPSWPCYPHVSPSGYPCLPPPPTVPLVSGTPGAYAVPPTCS VPWAPPPAPVSPYSSTCTYGPLGWGPGPQHAPFWSTVPPPPLPPASIGRAVPQPKMESRGTPAGPPENVL PLSMAPPLSLGLPGHGAPQTEPTKVEVKPVPASPHPKHKVSALVQSPQMKALACVSAEGVTVEEPASERL KPETQETRPREKPPLPATKAVPTPRQSTVPKLPAVHPARLRKLSFLPTPRTQGSEDVVQAFISEIGIEAS DLSSLLEQFEKSEAKKECPPPAPADSLAVGNSGGVDIPQEKRPLDRLQAPELANVAGLTPPATPPHQLWK PLAAVSLLAKAKSPKSTAQEGTLKPEGVTEAKHPAAVRLQEGVHGPSRVHVGSGDHDYCVRSRTPPKKMP ALVIPEVGSRWNVKRHQDITIKPVLSLGPAAPPPPCIAASREPLDHRTSSEQADPSAPCLAPSSLLSPEA SPCRNDMNTRTPPEPSAKQRSMRCYRKACRSASPSSQGWQGRRGRNSRSVSSGSNRTSEASSSSSSSSSS SRSRSRSLSPPHKRWRRSSCSSSGRSRRCSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSRSRSRSPSPRRRSDRRRRSYR SHDHYQRQRVLQKERAIEERRVVFIGKIPGRMTRSELKQRFSVFGEIEECTIHFRVQGDNYGFVTYRYAE EAFAAIESGHKLRQADEQPFDLCFGGRRQFCKRSYSDLDSNREDFDPAPVKSKFDSLDFDTLLKQAQKNL RR ; 'Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1542 1 1542 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . PPRC1_HUMAN Q5VV67 Q5VV67-2 1 1542 9606 'Homo sapiens (Human)' 2004-12-07 9B120057AA1A0CA4 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no H ;MRHCWGPCRATWMPPLSPSLRILGALESIPDSELLVSPREGSSLHKLLTLSRTPPERDLITPVDPLGPST GSSRGSGVEMSLPDPSWDFSPPSFLETSSPKLPSWRPPRSRPRWGQSPPPQQRSDGEEEEEVASFSGQIL AGELDNCVSSIPDFPMHLACPEEEDKATAAEMAVPAAGDESISSLSELVRAMHPYCLPNLTHLASLEDEL QEQPDDLTLPEGCVVLEIVGQAATAGDDLEIPVVVRQVSPGPRPVLLDDSLETSSALQLLMPTLESETEA AVPKVTLCSEKEGLSLNSEEKLDSACLLKPREVVEPVVPKEPQNPPANAAPGSQRARKGRKKKSKEQPAA CVEGYARRLRSSSRGQSTVGTEVTSQVDNLQKQPQEELQKESGPLQGKGKPRAWARAWAAALENSSPKNL ERSAGQSSPAKEGPLDLYPKLADTIQTNPIPTHLSLVDSAQASPMPVDSVEADPTAVGPVLAGPVPVDPG LVDLASTSSELVEPLPAEPVLINPVLADSAAVDPAVVPISDNLPPVDAVPSGPAPVDLALVDPVPNDLTP VDPVLVKSRPTDPRRGAVSSALGGSAPQLLVESESLDPPKTIIPEVKEVVDSLKIESGTSATTHEARPRP LSLSEYRRRRQQRQAETEERSPQPPTGKWPSLPETPTGLADIPCLVIPPAPAKKTALQRSPETPLEICLV PVGPSPASPSPEPPVSKPVASSPTEQVPSQEMPLLARPSPPVQSVSPAVPTPPSMSAALPFPAGGLGMPP SLPPPPLQPPSLPLSMGPVLPDPFTHYAPLPSWPCYPHVSPSGYPCLPPPPTVPLVSGTPGAYAVPPTCS VPWAPPPAPVSPYSSTCTYGPLGWGPGPQHAPFWSTVPPPPLPPASIGRAVPQPKMESRGTPAGPPENVL PLSMAPPLSLGLPGHGAPQTEPTKVEVKPVPASPHPKHKVSALVQSPQMKALACVSAEGVTVEEPASERL KPETQETRPREKPPLPATKAVPTPRQSTVPKLPAVHPARLRKLSFLPTPRTQGSEDVVQAFISEIGIEAS DLSSLLEQFEKSEAKKECPPPAPADSLAVGNSGGVDIPQEKRPLDRLQAPELANVAGLTPPATPPHQLWK PLAAVSLLAKAKSPKSTAQEGTLKPEGVTEAKHPAAVRLQEGVHGPSRVHVGSGDHDYCVRSRTPPKKMP ALVIPEVGSRWNVKRHQDITIKPVLSLGPAAPPPPCIAASREPLDHRTSSEQADPSAPCLAPSSLLSPEA SPCRNDMNTRTPPEPSAKQRSMRCYRKACRSASPSSQGWQGRRGRNSRSVSSGSNRTSEASSSSSSSSSS SRSRSRSLSPPHKRWRRSSCSSSGRSRRCSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSRSRSRSPSPRRRSDRRRRSYR SHDHYQRQRVLQKERAIEERRVVFIGKIPGRMTRSELKQRFSVFGEIEECTIHFRVQGDNYGFVTYRYAE EAFAAIESGHKLRQADEQPFDLCFGGRRQFCKRSYSDLDSNREDFDPAPVKSKFDSLDFDTLLKQAQKNL RR ; ;MRHCWGPCRATWMPPLSPSLRILGALESIPDSELLVSPREGSSLHKLLTLSRTPPERDLITPVDPLGPST GSSRGSGVEMSLPDPSWDFSPPSFLETSSPKLPSWRPPRSRPRWGQSPPPQQRSDGEEEEEVASFSGQIL AGELDNCVSSIPDFPMHLACPEEEDKATAAEMAVPAAGDESISSLSELVRAMHPYCLPNLTHLASLEDEL QEQPDDLTLPEGCVVLEIVGQAATAGDDLEIPVVVRQVSPGPRPVLLDDSLETSSALQLLMPTLESETEA AVPKVTLCSEKEGLSLNSEEKLDSACLLKPREVVEPVVPKEPQNPPANAAPGSQRARKGRKKKSKEQPAA CVEGYARRLRSSSRGQSTVGTEVTSQVDNLQKQPQEELQKESGPLQGKGKPRAWARAWAAALENSSPKNL ERSAGQSSPAKEGPLDLYPKLADTIQTNPIPTHLSLVDSAQASPMPVDSVEADPTAVGPVLAGPVPVDPG LVDLASTSSELVEPLPAEPVLINPVLADSAAVDPAVVPISDNLPPVDAVPSGPAPVDLALVDPVPNDLTP VDPVLVKSRPTDPRRGAVSSALGGSAPQLLVESESLDPPKTIIPEVKEVVDSLKIESGTSATTHEARPRP LSLSEYRRRRQQRQAETEERSPQPPTGKWPSLPETPTGLADIPCLVIPPAPAKKTALQRSPETPLEICLV PVGPSPASPSPEPPVSKPVASSPTEQVPSQEMPLLARPSPPVQSVSPAVPTPPSMSAALPFPAGGLGMPP SLPPPPLQPPSLPLSMGPVLPDPFTHYAPLPSWPCYPHVSPSGYPCLPPPPTVPLVSGTPGAYAVPPTCS VPWAPPPAPVSPYSSTCTYGPLGWGPGPQHAPFWSTVPPPPLPPASIGRAVPQPKMESRGTPAGPPENVL PLSMAPPLSLGLPGHGAPQTEPTKVEVKPVPASPHPKHKVSALVQSPQMKALACVSAEGVTVEEPASERL KPETQETRPREKPPLPATKAVPTPRQSTVPKLPAVHPARLRKLSFLPTPRTQGSEDVVQAFISEIGIEAS DLSSLLEQFEKSEAKKECPPPAPADSLAVGNSGGVDIPQEKRPLDRLQAPELANVAGLTPPATPPHQLWK PLAAVSLLAKAKSPKSTAQEGTLKPEGVTEAKHPAAVRLQEGVHGPSRVHVGSGDHDYCVRSRTPPKKMP ALVIPEVGSRWNVKRHQDITIKPVLSLGPAAPPPPCIAASREPLDHRTSSEQADPSAPCLAPSSLLSPEA SPCRNDMNTRTPPEPSAKQRSMRCYRKACRSASPSSQGWQGRRGRNSRSVSSGSNRTSEASSSSSSSSSS SRSRSRSLSPPHKRWRRSSCSSSGRSRRCSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSRSRSRSPSPRRRSDRRRRSYR SHDHYQRQRVLQKERAIEERRVVFIGKIPGRMTRSELKQRFSVFGEIEECTIHFRVQGDNYGFVTYRYAE EAFAAIESGHKLRQADEQPFDLCFGGRRQFCKRSYSDLDSNREDFDPAPVKSKFDSLDFDTLLKQAQKNL RR ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ARG . 1 3 HIS . 1 4 CYS . 1 5 TRP . 1 6 GLY . 1 7 PRO . 1 8 CYS . 1 9 ARG . 1 10 ALA . 1 11 THR . 1 12 TRP . 1 13 MET . 1 14 PRO . 1 15 PRO . 1 16 LEU . 1 17 SER . 1 18 PRO . 1 19 SER . 1 20 LEU . 1 21 ARG . 1 22 ILE . 1 23 LEU . 1 24 GLY . 1 25 ALA . 1 26 LEU . 1 27 GLU . 1 28 SER . 1 29 ILE . 1 30 PRO . 1 31 ASP . 1 32 SER . 1 33 GLU . 1 34 LEU . 1 35 LEU . 1 36 VAL . 1 37 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A 1 1475 ALA 1475 1475 ALA ALA H . A 1 1476 ILE 1476 1476 ILE ILE H . A 1 1477 GLU 1477 1477 GLU GLU H . A 1 1478 SER 1478 1478 SER SER H . A 1 1479 GLY 1479 1479 GLY GLY H . A 1 1480 HIS 1480 1480 HIS HIS H . A 1 1481 LYS 1481 1481 LYS LYS H . A 1 1482 LEU 1482 1482 LEU LEU H . A 1 1483 ARG 1483 1483 ARG ARG H . A 1 1484 GLN 1484 1484 GLN GLN H . A 1 1485 ALA 1485 1485 ALA ALA H . A 1 1486 ASP 1486 1486 ASP ASP H . A 1 1487 GLU 1487 1487 GLU GLU H . A 1 1488 GLN 1488 1488 GLN GLN H . A 1 1489 PRO 1489 1489 PRO PRO H . A 1 1490 PHE 1490 1490 PHE PHE H . A 1 1491 ASP 1491 1491 ASP ASP H . A 1 1492 LEU 1492 1492 LEU LEU H . A 1 1493 CYS 1493 1493 CYS CYS H . A 1 1494 PHE 1494 1494 PHE PHE H . A 1 1495 GLY 1495 1495 GLY GLY H . A 1 1496 GLY 1496 1496 GLY GLY H . A 1 1497 ARG 1497 1497 ARG ARG H . A 1 1498 ARG 1498 1498 ARG ARG H . A 1 1499 GLN 1499 1499 GLN GLN H . A 1 1500 PHE 1500 1500 PHE PHE H . A 1 1501 CYS 1501 ? ? ? H . A 1 1502 LYS 1502 ? ? ? H . A 1 1503 ARG 1503 ? ? ? H . A 1 1504 SER 1504 ? ? ? H . A 1 1505 TYR 1505 ? ? ? H . A 1 1506 SER 1506 ? ? ? H . A 1 1507 ASP 1507 ? ? ? H . A 1 1508 LEU 1508 ? ? ? H . A 1 1509 ASP 1509 ? ? ? H . A 1 1510 SER 1510 ? ? ? H . A 1 1511 ASN 1511 ? ? ? H . A 1 1512 ARG 1512 ? ? ? H . A 1 1513 GLU 1513 ? ? ? H . A 1 1514 ASP 1514 ? ? ? H . A 1 1515 PHE 1515 ? ? ? H . A 1 1516 ASP 1516 ? ? ? H . A 1 1517 PRO 1517 ? ? ? H . A 1 1518 ALA 1518 ? ? ? H . A 1 1519 PRO 1519 ? ? ? H . A 1 1520 VAL 1520 ? ? ? H . A 1 1521 LYS 1521 ? ? ? H . A 1 1522 SER 1522 ? ? ? H . A 1 1523 LYS 1523 ? ? ? H . A 1 1524 PHE 1524 ? ? ? H . A 1 1525 ASP 1525 ? ? ? H . A 1 1526 SER 1526 ? ? ? H . A 1 1527 LEU 1527 ? ? ? H . A 1 1528 ASP 1528 ? ? ? H . A 1 1529 PHE 1529 ? ? ? H . A 1 1530 ASP 1530 ? ? ? H . A 1 1531 THR 1531 ? ? ? H . A 1 1532 LEU 1532 ? ? ? H . A 1 1533 LEU 1533 ? ? ? H . A 1 1534 LYS 1534 ? ? ? H . A 1 1535 GLN 1535 ? ? ? H . A 1 1536 ALA 1536 ? ? ? H . A 1 1537 GLN 1537 ? ? ? H . A 1 1538 LYS 1538 ? ? ? H . A 1 1539 ASN 1539 ? ? ? H . A 1 1540 LEU 1540 ? ? ? H . A 1 1541 ARG 1541 ? ? ? H . A 1 1542 ARG 1542 ? ? ? H . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Protein NAM8 {PDB ID=6g90, label_asym_id=H, auth_asym_id=F, SMTL ID=6g90.1.H}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6g90, label_asym_id=H' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-08-13 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-08-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A H 8 1 F # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSYKQTTYYPSRGNLVRNDSSPYTNTISSETNNSSTSVLSLQGASNVSLGTTGNQLYMGDLDPTWDKNTV RQIWASLGEANINVRMMWNNTLNNGSRSSMGPKNNQGYCFVDFPSSTHAANALLKNGMLIPNFPNKKLKL NWATSSYSNSNNSLNNVKSGNNCSIFVGDLAPNVTESQLFELFINRYASTSHAKIVHDQVTGMSKGYGFV KFTNSDEQQLALSEMQGVFLNGRAIKVGPTSGQQQHVSGNNDYNRSSSSLNNENVDSRFLSKGQSFLSNG NNNMGFKRNHMSQFIYPVQQQPSLNHFTDPNNTTVFIGGLSSLVTEDELRAYFQPFGTIVYVKIPVGKCC GFVQYVDRLSAEAAIAGMQGFPIANSRVRLSWGRSAKQTALLQQAMLSNSLQVQQQQPGLQQPNYGYIPS STCEAPVLPDNNVSSTMLPGCQILNYSNPYANANGLGSNNFSFYSNNNATNTQATSLLADTSSMDLSGTG GQQVIMQGSEAVVNSTNAMLNRLEQGSNGFMFA ; ;MSYKQTTYYPSRGNLVRNDSSPYTNTISSETNNSSTSVLSLQGASNVSLGTTGNQLYMGDLDPTWDKNTV RQIWASLGEANINVRMMWNNTLNNGSRSSMGPKNNQGYCFVDFPSSTHAANALLKNGMLIPNFPNKKLKL NWATSSYSNSNNSLNNVKSGNNCSIFVGDLAPNVTESQLFELFINRYASTSHAKIVHDQVTGMSKGYGFV KFTNSDEQQLALSEMQGVFLNGRAIKVGPTSGQQQHVSGNNDYNRSSSSLNNENVDSRFLSKGQSFLSNG NNNMGFKRNHMSQFIYPVQQQPSLNHFTDPNNTTVFIGGLSSLVTEDELRAYFQPFGTIVYVKIPVGKCC GFVQYVDRLSAEAAIAGMQGFPIANSRVRLSWGRSAKQTALLQQAMLSNSLQVQQQQPGLQQPNYGYIPS STCEAPVLPDNNVSSTMLPGCQILNYSNPYANANGLGSNNFSFYSNNNATNTQATSLLADTSSMDLSGTG GQQVIMQGSEAVVNSTNAMLNRLEQGSNGFMFA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 310 388 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6g90 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1542 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1542 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.2e-08 29.114 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRHCWGPCRATWMPPLSPSLRILGALESIPDSELLVSPREGSSLHKLLTLSRTPPERDLITPVDPLGPSTGSSRGSGVEMSLPDPSWDFSPPSFLETSSPKLPSWRPPRSRPRWGQSPPPQQRSDGEEEEEVASFSGQILAGELDNCVSSIPDFPMHLACPEEEDKATAAEMAVPAAGDESISSLSELVRAMHPYCLPNLTHLASLEDELQEQPDDLTLPEGCVVLEIVGQAATAGDDLEIPVVVRQVSPGPRPVLLDDSLETSSALQLLMPTLESETEAAVPKVTLCSEKEGLSLNSEEKLDSACLLKPREVVEPVVPKEPQNPPANAAPGSQRARKGRKKKSKEQPAACVEGYARRLRSSSRGQSTVGTEVTSQVDNLQKQPQEELQKESGPLQGKGKPRAWARAWAAALENSSPKNLERSAGQSSPAKEGPLDLYPKLADTIQTNPIPTHLSLVDSAQASPMPVDSVEADPTAVGPVLAGPVPVDPGLVDLASTSSELVEPLPAEPVLINPVLADSAAVDPAVVPISDNLPPVDAVPSGPAPVDLALVDPVPNDLTPVDPVLVKSRPTDPRRGAVSSALGGSAPQLLVESESLDPPKTIIPEVKEVVDSLKIESGTSATTHEARPRPLSLSEYRRRRQQRQAETEERSPQPPTGKWPSLPETPTGLADIPCLVIPPAPAKKTALQRSPETPLEICLVPVGPSPASPSPEPPVSKPVASSPTEQVPSQEMPLLARPSPPVQSVSPAVPTPPSMSAALPFPAGGLGMPPSLPPPPLQPPSLPLSMGPVLPDPFTHYAPLPSWPCYPHVSPSGYPCLPPPPTVPLVSGTPGAYAVPPTCSVPWAPPPAPVSPYSSTCTYGPLGWGPGPQHAPFWSTVPPPPLPPASIGRAVPQPKMESRGTPAGPPENVLPLSMAPPLSLGLPGHGAPQTEPTKVEVKPVPASPHPKHKVSALVQSPQMKALACVSAEGVTVEEPASERLKPETQETRPREKPPLPATKAVPTPRQSTVPKLPAVHPARLRKLSFLPTPRTQGSEDVVQAFISEIGIEASDLSSLLEQFEKSEAKKECPPPAPADSLAVGNSGGVDIPQEKRPLDRLQAPELANVAGLTPPATPPHQLWKPLAAVSLLAKAKSPKSTAQEGTLKPEGVTEAKHPAAVRLQEGVHGPSRVHVGSGDHDYCVRSRTPPKKMPALVIPEVGSRWNVKRHQDITIKPVLSLGPAAPPPPCIAASREPLDHRTSSEQADPSAPCLAPSSLLSPEASPCRNDMNTRTPPEPSAKQRSMRCYRKACRSASPSSQGWQGRRGRNSRSVSSGSNRTSEASSSSSSSSSSSRSRSRSLSPPHKRWRRSSCSSSGRSRRCSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSRSRSRSPSPRRRSDRRRRSYRSHDHYQRQRVLQKERAIEERRVVFIGKIPGRMTRSELKQRFSVFGEIEECTIHFRVQGDNYGFVTYRYAEEAFAAIESGHKLRQADEQPFDLCFGGRRQFCKRSYSDLDSNREDFDPAPVKSKFDSLDFDTLLKQAQKNLRR 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PNNTTVFIGGLSSLVTEDELRAYFQPFGTIVYVKIPV---GKCCGFVQYVDRLSAEAAIAGMQG-FPIANSRVRLSWGRSAKQ------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6g90.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 1418 1418 ? A 283.245 281.747 316.238 1 1 H GLU 0.370 1 ATOM 2 C CA . GLU 1418 1418 ? A 282.483 281.024 315.165 1 1 H GLU 0.370 1 ATOM 3 C C . GLU 1418 1418 ? A 281.012 280.748 315.440 1 1 H GLU 0.370 1 ATOM 4 O O . GLU 1418 1418 ? A 280.298 280.160 314.634 1 1 H GLU 0.370 1 ATOM 5 C CB . GLU 1418 1418 ? A 283.181 279.653 314.915 1 1 H GLU 0.370 1 ATOM 6 C CG . GLU 1418 1418 ? A 283.207 278.682 316.133 1 1 H GLU 0.370 1 ATOM 7 C CD . GLU 1418 1418 ? A 284.283 279.002 317.174 1 1 H GLU 0.370 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 1418 1418 ? A 284.318 278.287 318.196 1 1 H GLU 0.370 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 1418 1418 ? A 285.020 280.000 316.969 1 1 H GLU 0.370 1 ATOM 10 N N . GLU 1419 1419 ? A 280.516 281.157 316.611 1 1 H GLU 0.470 1 ATOM 11 C CA . GLU 1419 1419 ? A 279.293 280.731 317.215 1 1 H GLU 0.470 1 ATOM 12 C C . GLU 1419 1419 ? A 278.029 281.346 316.656 1 1 H GLU 0.470 1 ATOM 13 O O . GLU 1419 1419 ? A 276.932 280.828 316.874 1 1 H GLU 0.470 1 ATOM 14 C CB . GLU 1419 1419 ? A 279.393 281.008 318.736 1 1 H GLU 0.470 1 ATOM 15 C CG . GLU 1419 1419 ? A 279.533 282.501 319.166 1 1 H GLU 0.470 1 ATOM 16 C CD . GLU 1419 1419 ? A 280.863 283.224 318.891 1 1 H GLU 0.470 1 ATOM 17 O OE1 . GLU 1419 1419 ? A 280.917 284.439 319.184 1 1 H GLU 0.470 1 ATOM 18 O OE2 . GLU 1419 1419 ? A 281.806 282.616 318.319 1 1 H GLU 0.470 1 ATOM 19 N N . ARG 1420 1420 ? A 278.129 282.446 315.893 1 1 H ARG 0.490 1 ATOM 20 C CA . ARG 1420 1420 ? A 276.978 282.993 315.211 1 1 H ARG 0.490 1 ATOM 21 C C . ARG 1420 1420 ? A 276.521 282.097 314.071 1 1 H ARG 0.490 1 ATOM 22 O O . ARG 1420 1420 ? A 277.210 281.886 313.083 1 1 H ARG 0.490 1 ATOM 23 C CB . ARG 1420 1420 ? A 277.244 284.416 314.683 1 1 H ARG 0.490 1 ATOM 24 C CG . ARG 1420 1420 ? A 277.516 285.432 315.807 1 1 H ARG 0.490 1 ATOM 25 C CD . ARG 1420 1420 ? A 277.682 286.849 315.259 1 1 H ARG 0.490 1 ATOM 26 N NE . ARG 1420 1420 ? A 277.957 287.744 316.422 1 1 H ARG 0.490 1 ATOM 27 C CZ . ARG 1420 1420 ? A 278.184 289.058 316.303 1 1 H ARG 0.490 1 ATOM 28 N NH1 . ARG 1420 1420 ? A 278.232 289.647 315.111 1 1 H ARG 0.490 1 ATOM 29 N NH2 . ARG 1420 1420 ? A 278.384 289.786 317.397 1 1 H ARG 0.490 1 ATOM 30 N N . ARG 1421 1421 ? A 275.310 281.539 314.207 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 31 C CA . ARG 1421 1421 ? A 274.763 280.554 313.292 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 32 C C . ARG 1421 1421 ? A 273.636 281.198 312.524 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 33 O O . ARG 1421 1421 ? A 272.787 280.562 311.898 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 34 C CB . ARG 1421 1421 ? A 274.260 279.369 314.126 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 35 C CG . ARG 1421 1421 ? A 275.437 278.606 314.753 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 36 C CD . ARG 1421 1421 ? A 275.044 277.753 315.950 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 37 N NE . ARG 1421 1421 ? A 276.228 276.882 316.235 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 38 C CZ . ARG 1421 1421 ? A 277.191 277.147 317.122 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 39 N NH1 . ARG 1421 1421 ? A 277.210 278.253 317.851 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 40 N NH2 . ARG 1421 1421 ? 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