data_SMR-c9b6a8cf7cf9955d2665e0ec1c1d6d86_4 _entry.id SMR-c9b6a8cf7cf9955d2665e0ec1c1d6d86_4 _struct.entry_id SMR-c9b6a8cf7cf9955d2665e0ec1c1d6d86_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - B2RY04/ DOCK5_MOUSE, Dedicator of cytokinesis protein 5 Estimated model accuracy of this model is 0.013, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries B2RY04' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 248349.151 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DOCK5_MOUSE B2RY04 1 ;MARWIPTKRQKYGVAIYNYNASQDVELSLQIGDTVHILEMYEGWYRGYALQNRSKKGIFPETYIHLKEAT VEDGGQHETVIPGELPLVQELTNTLREWAVIWRKLYVNNKVTLFRQLQQMTYSLIEWRSQILSGTLPKDE LAELKKKVTAKIDHGNRMLGLDLVVRDDNGNILDPDETSTVALFRAHEVASKRIEEKIQEEKSILQNLDL RGQAIFSTVHTYGLYVNFKNFVCNIGEDAELFIALYDPDQSTFISENYLIRWGSNGMPKEIEKLNNLQAV FTDLSSTDLIRPRISLVCQIVRVGRMELKEGKKHTCGLRRPFGVAVMDISDIVHGKVDDEEKQHFIPFQQ IAMETYIRQRQLIMSPLITSHVIGENEPLTSVLNKVIAAKEVNHKGQGLWVSLKLLPGDLTQVQKNFSHL VDRSTAIARKMGFPEIILPGDVRNDIYVTLIHGEFDKGKKKTPKNVEVTMSVFDEEGNLLEKAIHPGAGY EGVSEYKSVVYYQVKQPCWYETVKVFIAIEEVTRCHIRFTFRHRSSQESRDKSERAFGVAFVKLMNADGT TLQDGRHDLVVYKGDNKKMEDAKYYLTLPGTKAELEEKELQASKNPSVFTPSKDSTKDSFQIATLICSTK LTQNVDLLGLLNWRSNSQNIKHNLKKLMEVDGGEIVKFLQDTLDALFNIMMEMSDNETYDFLVFDALVFI ISLIGDIKFQHFNPVLETYIYKHFSATLAHVKLSKVLNFYVANAEDPSKTELLFAALKALKYLFRFIIQS RVLYLRFYGQSEDGDEFNDSIRQLFLAFNTLMDRPLEEAVKIKGAALKYLPSIINDVKLVFDPMELSVLF CKFIQSIPDNQLVRQKLNCMTKIVESSLFQQAECREVLLPLLTDQLSGQLDDHSTKPDHEASSQLLSNIL EVLDRTDVGPTSAHVQLIMERLLRRINRTVIGMSRQSPHIGSFVACMIAVLRQMEDSHYSHYISTFKTRQ DIIDFLMETFIMFKDLIGKNVYAKDWMVMNMTQNRVFLRAINQFAEVLTKSFMDQASFELQLWNNYFHLA VAFLTHESLQLETFSEAKRNKIVKKYGDMRKEIGFRIRDMWYNLGPHKIKFIPSMVGPILEVTLTPEVEL RKATIPIFFDMMQCEFNLSGNGNFHMFENELITKLDQEVEGGRGDEQYKVLLEKLLLEHCRKHKYLANSG EAFAFLVSSLLENLLDYRTIIIHDESKENRMSCTVNVLNFYKDKKREDIYIRYLYKLRDLHRDCENYTEA AYTLLLHAELLQWSDKPCVPHLLQRDSYYVYTQQELKEKLYQEIISYFDKGKMWEKAIKLSKELAETYES KVFDYEGLGSLLKKRALFYENIIKAMRPQPEYFAVGYYGQGFPSFLRNKIFIYRGKEYERREDFSLRLLT QFPNAEKMTSTTPPGEDIKSSPKQYLQCFTVKPVMSLPPSYKDKPVPEQILNYYRANEVQQFSYSRPFRK GEKDPENEFATMWIERTTYRTAYTFPGILKWFEAKEISVEEISPLENAIETMELTNERVSNCVQQHAWDH SLSVHPLSMLLSGIVDPAVMGGFSNYEKAFFTEKYLQEHPEDQEKVELLKRLIALQIPLLTEGIRIHGEK LTEQLKPLHARLSSCFRELKEKVEKLYGVITLPPSMTERKPSRAGSMVLPYILSSTLRRLSVTSVASSVI STSSNSSDNASSRPGSDGSILEPLFERRASSGARVEDLPPKEDSENRISKFKRKDWNLSKSQVIAEKAPE PDVMSPGKKTQRPKSLQLVDSRLTPFHSPSPLQSTALSPPPLTPKATRTLSSPSLQTDGLTASVPPPPPP KSKPYESSQRNSAEIAPPLPVRRDSKAPPPPPPKARKSGILSSEPGSQ ; 'Dedicator of cytokinesis protein 5' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1868 1 1868 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . DOCK5_MOUSE B2RY04 . 1 1868 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 D4AB0D8CD588F73D . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no D ;MARWIPTKRQKYGVAIYNYNASQDVELSLQIGDTVHILEMYEGWYRGYALQNRSKKGIFPETYIHLKEAT VEDGGQHETVIPGELPLVQELTNTLREWAVIWRKLYVNNKVTLFRQLQQMTYSLIEWRSQILSGTLPKDE LAELKKKVTAKIDHGNRMLGLDLVVRDDNGNILDPDETSTVALFRAHEVASKRIEEKIQEEKSILQNLDL RGQAIFSTVHTYGLYVNFKNFVCNIGEDAELFIALYDPDQSTFISENYLIRWGSNGMPKEIEKLNNLQAV FTDLSSTDLIRPRISLVCQIVRVGRMELKEGKKHTCGLRRPFGVAVMDISDIVHGKVDDEEKQHFIPFQQ IAMETYIRQRQLIMSPLITSHVIGENEPLTSVLNKVIAAKEVNHKGQGLWVSLKLLPGDLTQVQKNFSHL VDRSTAIARKMGFPEIILPGDVRNDIYVTLIHGEFDKGKKKTPKNVEVTMSVFDEEGNLLEKAIHPGAGY EGVSEYKSVVYYQVKQPCWYETVKVFIAIEEVTRCHIRFTFRHRSSQESRDKSERAFGVAFVKLMNADGT TLQDGRHDLVVYKGDNKKMEDAKYYLTLPGTKAELEEKELQASKNPSVFTPSKDSTKDSFQIATLICSTK LTQNVDLLGLLNWRSNSQNIKHNLKKLMEVDGGEIVKFLQDTLDALFNIMMEMSDNETYDFLVFDALVFI ISLIGDIKFQHFNPVLETYIYKHFSATLAHVKLSKVLNFYVANAEDPSKTELLFAALKALKYLFRFIIQS RVLYLRFYGQSEDGDEFNDSIRQLFLAFNTLMDRPLEEAVKIKGAALKYLPSIINDVKLVFDPMELSVLF CKFIQSIPDNQLVRQKLNCMTKIVESSLFQQAECREVLLPLLTDQLSGQLDDHSTKPDHEASSQLLSNIL EVLDRTDVGPTSAHVQLIMERLLRRINRTVIGMSRQSPHIGSFVACMIAVLRQMEDSHYSHYISTFKTRQ DIIDFLMETFIMFKDLIGKNVYAKDWMVMNMTQNRVFLRAINQFAEVLTKSFMDQASFELQLWNNYFHLA VAFLTHESLQLETFSEAKRNKIVKKYGDMRKEIGFRIRDMWYNLGPHKIKFIPSMVGPILEVTLTPEVEL RKATIPIFFDMMQCEFNLSGNGNFHMFENELITKLDQEVEGGRGDEQYKVLLEKLLLEHCRKHKYLANSG EAFAFLVSSLLENLLDYRTIIIHDESKENRMSCTVNVLNFYKDKKREDIYIRYLYKLRDLHRDCENYTEA AYTLLLHAELLQWSDKPCVPHLLQRDSYYVYTQQELKEKLYQEIISYFDKGKMWEKAIKLSKELAETYES KVFDYEGLGSLLKKRALFYENIIKAMRPQPEYFAVGYYGQGFPSFLRNKIFIYRGKEYERREDFSLRLLT QFPNAEKMTSTTPPGEDIKSSPKQYLQCFTVKPVMSLPPSYKDKPVPEQILNYYRANEVQQFSYSRPFRK GEKDPENEFATMWIERTTYRTAYTFPGILKWFEAKEISVEEISPLENAIETMELTNERVSNCVQQHAWDH SLSVHPLSMLLSGIVDPAVMGGFSNYEKAFFTEKYLQEHPEDQEKVELLKRLIALQIPLLTEGIRIHGEK LTEQLKPLHARLSSCFRELKEKVEKLYGVITLPPSMTERKPSRAGSMVLPYILSSTLRRLSVTSVASSVI STSSNSSDNASSRPGSDGSILEPLFERRASSGARVEDLPPKEDSENRISKFKRKDWNLSKSQVIAEKAPE PDVMSPGKKTQRPKSLQLVDSRLTPFHSPSPLQSTALSPPPLTPKATRTLSSPSLQTDGLTASVPPPPPP KSKPYESSQRNSAEIAPPLPVRRDSKAPPPPPPKARKSGILSSEPGSQ ; ;MARWIPTKRQKYGVAIYNYNASQDVELSLQIGDTVHILEMYEGWYRGYALQNRSKKGIFPETYIHLKEAT VEDGGQHETVIPGELPLVQELTNTLREWAVIWRKLYVNNKVTLFRQLQQMTYSLIEWRSQILSGTLPKDE LAELKKKVTAKIDHGNRMLGLDLVVRDDNGNILDPDETSTVALFRAHEVASKRIEEKIQEEKSILQNLDL RGQAIFSTVHTYGLYVNFKNFVCNIGEDAELFIALYDPDQSTFISENYLIRWGSNGMPKEIEKLNNLQAV FTDLSSTDLIRPRISLVCQIVRVGRMELKEGKKHTCGLRRPFGVAVMDISDIVHGKVDDEEKQHFIPFQQ IAMETYIRQRQLIMSPLITSHVIGENEPLTSVLNKVIAAKEVNHKGQGLWVSLKLLPGDLTQVQKNFSHL VDRSTAIARKMGFPEIILPGDVRNDIYVTLIHGEFDKGKKKTPKNVEVTMSVFDEEGNLLEKAIHPGAGY EGVSEYKSVVYYQVKQPCWYETVKVFIAIEEVTRCHIRFTFRHRSSQESRDKSERAFGVAFVKLMNADGT TLQDGRHDLVVYKGDNKKMEDAKYYLTLPGTKAELEEKELQASKNPSVFTPSKDSTKDSFQIATLICSTK LTQNVDLLGLLNWRSNSQNIKHNLKKLMEVDGGEIVKFLQDTLDALFNIMMEMSDNETYDFLVFDALVFI ISLIGDIKFQHFNPVLETYIYKHFSATLAHVKLSKVLNFYVANAEDPSKTELLFAALKALKYLFRFIIQS RVLYLRFYGQSEDGDEFNDSIRQLFLAFNTLMDRPLEEAVKIKGAALKYLPSIINDVKLVFDPMELSVLF CKFIQSIPDNQLVRQKLNCMTKIVESSLFQQAECREVLLPLLTDQLSGQLDDHSTKPDHEASSQLLSNIL EVLDRTDVGPTSAHVQLIMERLLRRINRTVIGMSRQSPHIGSFVACMIAVLRQMEDSHYSHYISTFKTRQ DIIDFLMETFIMFKDLIGKNVYAKDWMVMNMTQNRVFLRAINQFAEVLTKSFMDQASFELQLWNNYFHLA VAFLTHESLQLETFSEAKRNKIVKKYGDMRKEIGFRIRDMWYNLGPHKIKFIPSMVGPILEVTLTPEVEL RKATIPIFFDMMQCEFNLSGNGNFHMFENELITKLDQEVEGGRGDEQYKVLLEKLLLEHCRKHKYLANSG EAFAFLVSSLLENLLDYRTIIIHDESKENRMSCTVNVLNFYKDKKREDIYIRYLYKLRDLHRDCENYTEA AYTLLLHAELLQWSDKPCVPHLLQRDSYYVYTQQELKEKLYQEIISYFDKGKMWEKAIKLSKELAETYES KVFDYEGLGSLLKKRALFYENIIKAMRPQPEYFAVGYYGQGFPSFLRNKIFIYRGKEYERREDFSLRLLT QFPNAEKMTSTTPPGEDIKSSPKQYLQCFTVKPVMSLPPSYKDKPVPEQILNYYRANEVQQFSYSRPFRK GEKDPENEFATMWIERTTYRTAYTFPGILKWFEAKEISVEEISPLENAIETMELTNERVSNCVQQHAWDH SLSVHPLSMLLSGIVDPAVMGGFSNYEKAFFTEKYLQEHPEDQEKVELLKRLIALQIPLLTEGIRIHGEK LTEQLKPLHARLSSCFRELKEKVEKLYGVITLPPSMTERKPSRAGSMVLPYILSSTLRRLSVTSVASSVI 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D . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Outer membrane protein assembly factor BamD {PDB ID=6so8, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=6so8.1.D}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6so8, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-08-13 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-08-08 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 4 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;EVPDNPPNEIYATAQQKLQDGNWRQAITQLEALDNRYPFGPYSQQVQLDLIYAYYKNADLPLAQAAIDRF IRLNPTHPNIDYVMYMRGLTNMALDDSALQGFFGVDRSDRDPQHARAAFSDFSKLVRGYPNSQYTTDATK RLVFLKDRLAKYEYSVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQATRDALPLMENAYRQMQMNAQAEKVA KIIAANSS ; ;EVPDNPPNEIYATAQQKLQDGNWRQAITQLEALDNRYPFGPYSQQVQLDLIYAYYKNADLPLAQAAIDRF IRLNPTHPNIDYVMYMRGLTNMALDDSALQGFFGVDRSDRDPQHARAAFSDFSKLVRGYPNSQYTTDATK RLVFLKDRLAKYEYSVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQATRDALPLMENAYRQMQMNAQAEKVA KIIAANSS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 103 200 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6so8 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1868 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1868 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 230.000 12.245 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MARWIPTKRQKYGVAIYNYNASQDVELSLQIGDTVHILEMYEGWYRGYALQNRSKKGIFPETYIHLKEATVEDGGQHETVIPGELPLVQELTNTLREWAVIWRKLYVNNKVTLFRQLQQMTYSLIEWRSQILSGTLPKDELAELKKKVTAKIDHGNRMLGLDLVVRDDNGNILDPDETSTVALFRAHEVASKRIEEKIQEEKSILQNLDLRGQAIFSTVHTYGLYVNFKNFVCNIGEDAELFIALYDPDQSTFISENYLIRWGSNGMPKEIEKLNNLQAVFTDLSSTDLIRPRISLVCQIVRVGRMELKEGKKHTCGLRRPFGVAVMDISDIVHGKVDDEEKQHFIPFQQIAMETYIRQRQLIMSPLITSHVIGENEPLTSVLNKVIAAKEVNHKGQGLWVSLKLLPGDLTQVQKNFSHLVDRSTAIARKMGFPEIILPGDVRNDIYVTLIHGEFDKGKKKTPKNVEVTMSVFDEEGNLLEKAIHPGAGYEGVSEYKSVVYYQVKQPCWYETVKVFIAIEEVTRCHIRFTFRHRSSQESRDKSERAFGVAFVKLMNADGTTLQDGRHDLVVYKGDNKKMEDAKYYLTLPGTKAELEEKELQASKNPSVFTPSKDSTKDSFQIATLICSTKLTQNVDLLGLLNWRSNSQNIKHNLKKLMEVDGGEIVKFLQDTLDALFNIMMEMSDNETYDFLVFDALVFIISLIGDIKFQHFNPVLETYIYKHFSATLAHVKLSKVLNFYVANAEDPSKTELLFAALKALKYLFRFIIQSRVLYLRFYGQSEDGDEFNDSIRQLFLAFNTLMDRPLEEAVKIKGAALKYLPSIINDVKLVFDPMELSVLFCKFIQSIPDNQLVRQKLNCMTKIVESSLFQQAECREVLLPLLTDQLSGQLDDHSTKPDHEASSQLLSNILEVLDRTDVGPTSAHVQLIMERLLRRINRTVIGMSRQSPHIGSFVACMIAVLRQMEDSHYSHYISTFKTRQDIIDFLMETFIMFKDLIGKNVYAKDWMVMNMTQNRVFLRAINQFAEVLTKSFMDQASFELQLWNNYFHLAVAFLTHESLQLETFSEAKRNKIVKKYGDMRKEIGFRIRDMWYNLGPHKIKFIPSMVGPILEVTLTPEVELRKATIPIFFDMMQCEFNLSGNGNFHMFENELITKLDQEVEGGRGDEQYKVLLEKLLLEHCRKHKYLANSGEAFAFLVSSLLENLLDYRTIIIHDESKENRMSCTVNVLNFYKDKKREDIYIRYLYKLRDLHRDCENYTEAAYTLLLHAELLQWSDKPCVPHLLQRDSYYVYTQQELKEKLYQEIISYFDKGKMWEKAIKLSKELAETYESKVFDYEGLGSLLKKRALFYENIIKAMRPQPEYFAVGYYGQGFPSFLRNKIFIYRGKEYERREDFSLRLLTQFPNAEKMTSTTPPGEDIKSSPKQYLQCFTVKPVMSLPPSYKDKPVPEQILNYYRANEVQQFSYSRPFRKGEKDPENEFATMWIERTTYRTAYTFPGILKWFEAKEISVEEISPLENAIETMELTNERVSNCVQQHAWDHSLSVHPLSMLLSGIVDPAVMGGFSNYEKAFFTEKYLQEHPEDQEKVELLKRLIALQIPLLTEGIRIHGEKLTEQLKPLHARLSSCFRELKEKVEKLYGVITLPPSMTERKPSRAGSMVLPYILSSTLRRLSVTSVASSVISTSSNSSDNASSRPGSDGSILEPLFERRASSGARVEDLPPKEDSENRISKFKRKDWNLSKSQVIAEKAPEPDVMSPGKKTQRPKSLQLVDSRLTPFHSPSPLQSTALSPPPLTPKATRTLSSPSLQTDGLTASVPPPPPPKSKPYESSQRNSAEIAPPLPVRRDSKAPPPPPPKARKSGILSSEPGSQ 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGVDRSDRDPQHARAAFSDFSKLVRGYPNSQYT--TDAT--K-RLVFLKDRLAKYEY-SVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQ----ATRDALPLMENAYRQM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6so8.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 4' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . TYR 1245 1245 ? A 185.703 170.572 166.007 1 1 D TYR 0.010 1 ATOM 2 C CA . TYR 1245 1245 ? A 185.942 169.474 167.015 1 1 D TYR 0.010 1 ATOM 3 C C . TYR 1245 1245 ? A 186.704 168.220 166.566 1 1 D TYR 0.010 1 ATOM 4 O O . TYR 1245 1245 ? A 186.700 167.244 167.300 1 1 D TYR 0.010 1 ATOM 5 C CB . TYR 1245 1245 ? A 184.572 169.051 167.631 1 1 D TYR 0.010 1 ATOM 6 C CG . TYR 1245 1245 ? A 183.909 170.185 168.374 1 1 D TYR 0.010 1 ATOM 7 C CD1 . TYR 1245 1245 ? A 184.449 170.643 169.589 1 1 D TYR 0.010 1 ATOM 8 C CD2 . TYR 1245 1245 ? A 182.742 170.790 167.876 1 1 D TYR 0.010 1 ATOM 9 C CE1 . TYR 1245 1245 ? A 183.835 171.690 170.289 1 1 D TYR 0.010 1 ATOM 10 C CE2 . TYR 1245 1245 ? A 182.126 171.837 168.579 1 1 D TYR 0.010 1 ATOM 11 C CZ . TYR 1245 1245 ? A 182.675 172.284 169.786 1 1 D TYR 0.010 1 ATOM 12 O OH . TYR 1245 1245 ? A 182.063 173.323 170.512 1 1 D TYR 0.010 1 ATOM 13 N N . LYS 1246 1246 ? A 187.397 168.211 165.392 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 14 C CA . LYS 1246 1246 ? A 188.353 167.154 165.036 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 15 C C . LYS 1246 1246 ? A 187.736 165.867 164.475 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 16 O O . LYS 1246 1246 ? A 188.241 164.762 164.652 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 17 C CB . LYS 1246 1246 ? A 189.419 166.896 166.143 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 18 C CG . LYS 1246 1246 ? A 190.718 166.213 165.678 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 19 C CD . LYS 1246 1246 ? A 191.603 165.837 166.877 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 20 C CE . LYS 1246 1246 ? A 192.693 164.821 166.529 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 21 N NZ . LYS 1246 1246 ? A 193.456 164.466 167.747 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 22 N N . LEU 1247 1247 ? A 186.639 165.989 163.709 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 23 C CA . LEU 1247 1247 ? A 186.078 164.887 162.955 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 24 C C . LEU 1247 1247 ? A 186.108 165.318 161.499 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 25 O O . LEU 1247 1247 ? A 186.085 166.511 161.198 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 26 C CB . LEU 1247 1247 ? A 184.652 164.505 163.437 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 27 C CG . LEU 1247 1247 ? A 184.598 164.023 164.909 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 28 C CD1 . LEU 1247 1247 ? A 183.150 163.834 165.389 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 29 C CD2 . LEU 1247 1247 ? A 185.392 162.727 165.145 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 30 N N . ARG 1248 1248 ? A 186.238 164.356 160.567 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 31 C CA . ARG 1248 1248 ? A 186.380 164.612 159.147 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 32 C C . ARG 1248 1248 ? A 185.542 163.573 158.437 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 33 O O . ARG 1248 1248 ? A 185.487 162.433 158.894 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 34 C CB . ARG 1248 1248 ? A 187.828 164.385 158.617 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 35 C CG . ARG 1248 1248 ? A 188.949 165.193 159.303 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 36 C CD . ARG 1248 1248 ? A 190.326 165.028 158.629 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 37 N NE . ARG 1248 1248 ? A 190.679 163.572 158.658 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 38 C CZ . ARG 1248 1248 ? A 191.532 162.940 157.845 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 39 N NH1 . ARG 1248 1248 ? A 192.258 163.535 156.911 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 40 N NH2 . ARG 1248 1248 ? A 191.596 161.618 157.914 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 41 N N . ASP 1249 1249 ? A 184.918 163.924 157.295 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 42 C CA . ASP 1249 1249 ? A 184.029 163.034 156.573 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 43 C C . ASP 1249 1249 ? A 184.539 162.710 155.171 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 44 O O . ASP 1249 1249 ? A 183.783 162.559 154.216 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 45 C CB . ASP 1249 1249 ? A 182.588 163.591 156.558 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 46 C CG . ASP 1249 1249 ? A 181.973 163.433 157.942 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 47 O OD1 . ASP 1249 1249 ? A 181.950 162.283 158.466 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 48 O OD2 . ASP 1249 1249 ? A 181.507 164.456 158.491 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 49 N N . LEU 1250 1250 ? A 185.861 162.450 155.037 1 1 D LEU 0.370 1 ATOM 50 C CA . LEU 1250 1250 ? A 186.473 161.944 153.809 1 1 D LEU 0.370 1 ATOM 51 C C . LEU 1250 1250 ? A 186.291 160.428 153.698 1 1 D LEU 0.370 1 ATOM 52 O O . LEU 1250 1250 ? A 186.945 159.727 152.938 1 1 D LEU 0.370 1 ATOM 53 C CB . LEU 1250 1250 ? 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A 186.238 159.712 158.796 1 1 D HIS 0.290 1 ATOM 67 N N . ARG 1252 1252 ? A 182.754 159.079 153.965 1 1 D ARG 0.270 1 ATOM 68 C CA . ARG 1252 1252 ? A 181.300 159.041 153.962 1 1 D ARG 0.270 1 ATOM 69 C C . ARG 1252 1252 ? A 180.773 159.155 152.539 1 1 D ARG 0.270 1 ATOM 70 O O . ARG 1252 1252 ? A 180.242 158.205 151.971 1 1 D ARG 0.270 1 ATOM 71 C CB . ARG 1252 1252 ? A 180.686 160.226 154.757 1 1 D ARG 0.270 1 ATOM 72 C CG . ARG 1252 1252 ? A 180.967 160.235 156.266 1 1 D ARG 0.270 1 ATOM 73 C CD . ARG 1252 1252 ? A 180.400 159.063 157.066 1 1 D ARG 0.270 1 ATOM 74 N NE . ARG 1252 1252 ? A 180.733 159.397 158.483 1 1 D ARG 0.270 1 ATOM 75 C CZ . ARG 1252 1252 ? A 181.924 159.144 159.042 1 1 D ARG 0.270 1 ATOM 76 N NH1 . ARG 1252 1252 ? A 182.792 158.297 158.501 1 1 D ARG 0.270 1 ATOM 77 N NH2 . ARG 1252 1252 ? A 182.243 159.831 160.137 1 1 D ARG 0.270 1 ATOM 78 N N . ASP 1253 1253 ? A 180.918 160.338 151.903 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 79 C CA . ASP 1253 1253 ? 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A 185.469 171.685 136.110 1 1 D HIS 0.470 1 ATOM 197 C CD2 . HIS 1267 1267 ? A 184.650 170.937 134.154 1 1 D HIS 0.470 1 ATOM 198 C CE1 . HIS 1267 1267 ? A 184.169 171.505 136.224 1 1 D HIS 0.470 1 ATOM 199 N NE2 . HIS 1267 1267 ? A 183.620 171.071 135.065 1 1 D HIS 0.470 1 ATOM 200 N N . ALA 1268 1268 ? A 189.925 169.985 133.257 1 1 D ALA 0.490 1 ATOM 201 C CA . ALA 1268 1268 ? A 191.318 170.060 132.827 1 1 D ALA 0.490 1 ATOM 202 C C . ALA 1268 1268 ? A 191.624 169.404 131.480 1 1 D ALA 0.490 1 ATOM 203 O O . ALA 1268 1268 ? A 192.450 169.901 130.718 1 1 D ALA 0.490 1 ATOM 204 C CB . ALA 1268 1268 ? A 192.269 169.505 133.907 1 1 D ALA 0.490 1 ATOM 205 N N . GLU 1269 1269 ? A 190.996 168.261 131.141 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 206 C CA . GLU 1269 1269 ? A 191.161 167.642 129.833 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 207 C C . GLU 1269 1269 ? A 190.599 168.472 128.681 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 208 O O . GLU 1269 1269 ? A 191.263 168.686 127.669 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 209 C CB . GLU 1269 1269 ? A 190.495 166.245 129.805 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 210 C CG . GLU 1269 1269 ? A 191.221 165.199 130.686 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 211 C CD . GLU 1269 1269 ? A 190.535 163.832 130.685 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 212 O OE1 . GLU 1269 1269 ? A 189.421 163.709 130.114 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 213 O OE2 . GLU 1269 1269 ? A 191.141 162.897 131.271 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 214 N N . LEU 1270 1270 ? A 189.360 168.985 128.820 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 215 C CA . LEU 1270 1270 ? A 188.709 169.800 127.809 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 216 C C . LEU 1270 1270 ? A 189.226 171.233 127.761 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 217 O O . LEU 1270 1270 ? A 189.417 171.798 126.686 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 218 C CB . LEU 1270 1270 ? A 187.170 169.812 128.022 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 219 C CG . LEU 1270 1270 ? A 186.495 168.421 127.966 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 220 C CD1 . LEU 1270 1270 ? A 185.039 168.504 128.454 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 221 C CD2 . LEU 1270 1270 ? A 186.562 167.787 126.568 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 222 N N . LEU 1271 1271 ? A 189.458 171.866 128.929 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 223 C CA . LEU 1271 1271 ? A 189.863 173.256 129.010 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 224 C C . LEU 1271 1271 ? A 191.171 173.365 129.779 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 225 O O . LEU 1271 1271 ? A 191.231 173.252 130.998 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 226 C CB . LEU 1271 1271 ? A 188.783 174.111 129.729 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 227 C CG . LEU 1271 1271 ? A 187.397 174.100 129.047 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 228 C CD1 . LEU 1271 1271 ? A 186.329 174.716 129.964 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 229 C CD2 . LEU 1271 1271 ? A 187.424 174.845 127.706 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 230 N N . GLN 1272 1272 ? A 192.283 173.636 129.075 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 231 C CA . GLN 1272 1272 ? A 193.585 173.807 129.705 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 232 C C . GLN 1272 1272 ? A 193.930 175.284 129.827 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 233 O O . GLN 1272 1272 ? A 195.034 175.665 130.212 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 234 C CB . GLN 1272 1272 ? A 194.665 173.078 128.870 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 235 C CG . GLN 1272 1272 ? A 194.453 171.546 128.867 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 236 C CD . GLN 1272 1272 ? A 195.498 170.811 128.033 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 237 O OE1 . GLN 1272 1272 ? A 196.300 171.382 127.296 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 238 N NE2 . GLN 1272 1272 ? A 195.488 169.462 128.150 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 239 N N . TRP 1273 1273 ? A 192.964 176.149 129.482 1 1 D TRP 0.290 1 ATOM 240 C CA . TRP 1273 1273 ? A 193.124 177.577 129.352 1 1 D TRP 0.290 1 ATOM 241 C C . TRP 1273 1273 ? A 192.667 178.341 130.590 1 1 D TRP 0.290 1 ATOM 242 O O . TRP 1273 1273 ? A 192.296 177.786 131.621 1 1 D TRP 0.290 1 ATOM 243 C CB . TRP 1273 1273 ? A 192.374 178.063 128.086 1 1 D TRP 0.290 1 ATOM 244 C CG . TRP 1273 1273 ? A 192.845 177.396 126.803 1 1 D TRP 0.290 1 ATOM 245 C CD1 . TRP 1273 1273 ? A 192.224 176.429 126.059 1 1 D TRP 0.290 1 ATOM 246 C CD2 . TRP 1273 1273 ? A 194.084 177.698 126.158 1 1 D TRP 0.290 1 ATOM 247 N NE1 . TRP 1273 1273 ? A 193.019 176.092 124.989 1 1 D TRP 0.290 1 ATOM 248 C CE2 . TRP 1273 1273 ? 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A 187.497 133.562 160.688 1 1 D LYS 0.640 1 ATOM 587 N NZ . LYS 1312 1312 ? A 186.796 132.800 161.745 1 1 D LYS 0.640 1 ATOM 588 N N . MET 1313 1313 ? A 186.814 138.344 156.023 1 1 D MET 0.650 1 ATOM 589 C CA . MET 1313 1313 ? A 186.647 137.912 154.654 1 1 D MET 0.650 1 ATOM 590 C C . MET 1313 1313 ? A 187.829 138.371 153.835 1 1 D MET 0.650 1 ATOM 591 O O . MET 1313 1313 ? A 187.785 139.366 153.110 1 1 D MET 0.650 1 ATOM 592 C CB . MET 1313 1313 ? A 185.321 138.409 154.038 1 1 D MET 0.650 1 ATOM 593 C CG . MET 1313 1313 ? A 184.073 137.806 154.714 1 1 D MET 0.650 1 ATOM 594 S SD . MET 1313 1313 ? A 183.953 135.987 154.649 1 1 D MET 0.650 1 ATOM 595 C CE . MET 1313 1313 ? A 183.824 135.723 152.855 1 1 D MET 0.650 1 ATOM 596 N N . TRP 1314 1314 ? A 188.918 137.592 153.928 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 597 C CA . TRP 1314 1314 ? A 190.232 137.886 153.400 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 598 C C . TRP 1314 1314 ? A 190.252 138.129 151.890 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 599 O O . TRP 1314 1314 ? A 190.935 139.033 151.411 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 600 C CB . TRP 1314 1314 ? A 191.215 136.778 153.862 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 601 C CG . TRP 1314 1314 ? A 191.139 136.430 155.352 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 602 C CD1 . TRP 1314 1314 ? A 190.899 135.204 155.914 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 603 C CD2 . TRP 1314 1314 ? A 191.308 137.351 156.448 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 604 N NE1 . TRP 1314 1314 ? A 190.891 135.301 157.287 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 605 C CE2 . TRP 1314 1314 ? A 191.147 136.602 157.644 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 606 C CE3 . TRP 1314 1314 ? A 191.588 138.714 156.499 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 607 C CZ2 . TRP 1314 1314 ? A 191.284 137.206 158.885 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 608 C CZ3 . TRP 1314 1314 ? A 191.728 139.318 157.754 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 609 C CH2 . TRP 1314 1314 ? A 191.576 138.575 158.934 1 1 D TRP 0.640 1 ATOM 610 N N . GLU 1315 1315 ? A 189.418 137.399 151.106 1 1 D GLU 0.780 1 ATOM 611 C CA . GLU 1315 1315 ? A 189.192 137.689 149.693 1 1 D GLU 0.780 1 ATOM 612 C C . GLU 1315 1315 ? A 188.682 139.095 149.408 1 1 D GLU 0.780 1 ATOM 613 O O . GLU 1315 1315 ? A 189.106 139.743 148.455 1 1 D GLU 0.780 1 ATOM 614 C CB . GLU 1315 1315 ? A 188.102 136.802 149.045 1 1 D GLU 0.780 1 ATOM 615 C CG . GLU 1315 1315 ? A 188.527 135.382 148.626 1 1 D GLU 0.780 1 ATOM 616 C CD . GLU 1315 1315 ? A 187.539 134.803 147.607 1 1 D GLU 0.780 1 ATOM 617 O OE1 . GLU 1315 1315 ? A 186.601 135.542 147.182 1 1 D GLU 0.780 1 ATOM 618 O OE2 . GLU 1315 1315 ? A 187.751 133.646 147.191 1 1 D GLU 0.780 1 ATOM 619 N N . LYS 1316 1316 ? A 187.717 139.599 150.201 1 1 D LYS 0.680 1 ATOM 620 C CA . LYS 1316 1316 ? A 187.088 140.882 149.944 1 1 D LYS 0.680 1 ATOM 621 C C . LYS 1316 1316 ? A 188.093 142.011 150.081 1 1 D LYS 0.680 1 ATOM 622 O O . LYS 1316 1316 ? A 188.219 142.878 149.226 1 1 D LYS 0.680 1 ATOM 623 C CB . LYS 1316 1316 ? A 185.859 141.091 150.864 1 1 D LYS 0.680 1 ATOM 624 C CG . LYS 1316 1316 ? A 184.719 140.098 150.568 1 1 D LYS 0.680 1 ATOM 625 C CD . LYS 1316 1316 ? A 183.483 140.318 151.457 1 1 D LYS 0.680 1 ATOM 626 C CE . LYS 1316 1316 ? A 182.364 139.314 151.159 1 1 D LYS 0.680 1 ATOM 627 N NZ . LYS 1316 1316 ? A 181.246 139.463 152.119 1 1 D LYS 0.680 1 ATOM 628 N N . ALA 1317 1317 ? A 188.922 141.948 151.125 1 1 D ALA 0.750 1 ATOM 629 C CA . ALA 1317 1317 ? A 190.016 142.860 151.327 1 1 D ALA 0.750 1 ATOM 630 C C . ALA 1317 1317 ? A 191.104 142.851 150.248 1 1 D ALA 0.750 1 ATOM 631 O O . ALA 1317 1317 ? A 191.623 143.904 149.884 1 1 D ALA 0.750 1 ATOM 632 C CB . ALA 1317 1317 ? A 190.641 142.494 152.663 1 1 D ALA 0.750 1 ATOM 633 N N . ILE 1318 1318 ? A 191.498 141.678 149.700 1 1 D ILE 0.770 1 ATOM 634 C CA . ILE 1318 1318 ? A 192.474 141.633 148.610 1 1 D ILE 0.770 1 ATOM 635 C C . ILE 1318 1318 ? A 191.912 142.022 147.246 1 1 D ILE 0.770 1 ATOM 636 O O . ILE 1318 1318 ? A 192.652 142.447 146.362 1 1 D ILE 0.770 1 ATOM 637 C CB . ILE 1318 1318 ? A 193.217 140.307 148.472 1 1 D ILE 0.770 1 ATOM 638 C CG1 . ILE 1318 1318 ? A 192.259 139.152 148.114 1 1 D ILE 0.770 1 ATOM 639 C CG2 . ILE 1318 1318 ? A 193.984 140.038 149.784 1 1 D ILE 0.770 1 ATOM 640 C CD1 . ILE 1318 1318 ? A 192.946 137.840 147.741 1 1 D ILE 0.770 1 ATOM 641 N N . LYS 1319 1319 ? A 190.584 141.914 147.032 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 642 C CA . LYS 1319 1319 ? A 189.914 142.506 145.883 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 643 C C . LYS 1319 1319 ? A 189.909 144.018 145.998 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 644 O O . LYS 1319 1319 ? A 190.314 144.733 145.089 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 645 C CB . LYS 1319 1319 ? A 188.470 141.960 145.778 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 646 C CG . LYS 1319 1319 ? A 188.467 140.489 145.333 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 647 C CD . LYS 1319 1319 ? A 187.132 139.763 145.555 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 648 C CE . LYS 1319 1319 ? A 187.250 138.268 145.229 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 649 N NZ . LYS 1319 1319 ? A 186.029 137.552 145.632 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 650 N N . LEU 1320 1320 ? A 189.553 144.527 147.188 1 1 D LEU 0.640 1 ATOM 651 C CA . LEU 1320 1320 ? A 189.549 145.942 147.487 1 1 D LEU 0.640 1 ATOM 652 C C . LEU 1320 1320 ? A 190.950 146.569 147.531 1 1 D LEU 0.640 1 ATOM 653 O O . LEU 1320 1320 ? A 191.137 147.752 147.252 1 1 D LEU 0.640 1 ATOM 654 C CB . LEU 1320 1320 ? A 188.801 146.216 148.811 1 1 D LEU 0.640 1 ATOM 655 C CG . LEU 1320 1320 ? A 187.277 146.454 148.720 1 1 D LEU 0.640 1 ATOM 656 C CD1 . LEU 1320 1320 ? A 186.986 147.769 147.983 1 1 D LEU 0.640 1 ATOM 657 C CD2 . LEU 1320 1320 ? A 186.440 145.308 148.140 1 1 D LEU 0.640 1 ATOM 658 N N . SER 1321 1321 ? A 192.010 145.807 147.867 1 1 D SER 0.720 1 ATOM 659 C CA . SER 1321 1321 ? A 193.389 146.267 147.715 1 1 D SER 0.720 1 ATOM 660 C C . SER 1321 1321 ? A 193.804 146.494 146.287 1 1 D SER 0.720 1 ATOM 661 O O . SER 1321 1321 ? A 194.494 147.463 145.975 1 1 D SER 0.720 1 ATOM 662 C CB . SER 1321 1321 ? A 194.429 145.430 148.500 1 1 D SER 0.720 1 ATOM 663 O OG . SER 1321 1321 ? A 194.667 144.147 147.931 1 1 D SER 0.720 1 ATOM 664 N N . LYS 1322 1322 ? A 193.334 145.635 145.373 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 665 C CA . LYS 1322 1322 ? A 193.382 145.886 143.951 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 666 C C . LYS 1322 1322 ? A 192.524 147.069 143.540 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 667 O O . LYS 1322 1322 ? A 192.969 147.908 142.768 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 668 C CB . LYS 1322 1322 ? A 193.085 144.602 143.164 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 669 C CG . LYS 1322 1322 ? A 194.201 143.576 143.401 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 670 C CD . LYS 1322 1322 ? A 194.057 142.350 142.499 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 671 C CE . LYS 1322 1322 ? A 195.228 141.388 142.652 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 672 N NZ . LYS 1322 1322 ? A 195.077 140.291 141.680 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 673 N N . GLU 1323 1323 ? A 191.324 147.253 144.121 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 674 C CA . GLU 1323 1323 ? A 190.558 148.475 143.920 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 675 C C . GLU 1323 1323 ? A 191.274 149.758 144.354 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 676 O O . GLU 1323 1323 ? A 191.214 150.754 143.637 1 1 D GLU 0.600 1 ATOM 677 C CB . GLU 1323 1323 ? 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A 194.768 149.848 144.342 1 1 D ALA 0.640 1 ATOM 691 C CA . ALA 1325 1325 ? A 195.911 149.830 143.444 1 1 D ALA 0.640 1 ATOM 692 C C . ALA 1325 1325 ? A 195.619 150.239 142.008 1 1 D ALA 0.640 1 ATOM 693 O O . ALA 1325 1325 ? A 196.322 151.058 141.427 1 1 D ALA 0.640 1 ATOM 694 C CB . ALA 1325 1325 ? A 196.547 148.424 143.475 1 1 D ALA 0.640 1 ATOM 695 N N . GLU 1326 1326 ? A 194.531 149.711 141.431 1 1 D GLU 0.500 1 ATOM 696 C CA . GLU 1326 1326 ? A 194.218 149.840 140.025 1 1 D GLU 0.500 1 ATOM 697 C C . GLU 1326 1326 ? A 193.333 151.061 139.773 1 1 D GLU 0.500 1 ATOM 698 O O . GLU 1326 1326 ? A 193.107 151.466 138.635 1 1 D GLU 0.500 1 ATOM 699 C CB . GLU 1326 1326 ? A 193.541 148.516 139.557 1 1 D GLU 0.500 1 ATOM 700 C CG . GLU 1326 1326 ? A 194.433 147.256 139.807 1 1 D GLU 0.500 1 ATOM 701 C CD . GLU 1326 1326 ? A 193.770 145.893 139.573 1 1 D GLU 0.500 1 ATOM 702 O OE1 . GLU 1326 1326 ? A 192.641 145.836 139.030 1 1 D GLU 0.500 1 ATOM 703 O OE2 . GLU 1326 1326 ? 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A 194.886 129.623 153.970 1 1 D ILE 0.520 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.501 2 1 3 0.013 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1245 TYR 1 0.010 2 1 A 1246 LYS 1 0.080 3 1 A 1247 LEU 1 0.070 4 1 A 1248 ARG 1 0.220 5 1 A 1249 ASP 1 0.290 6 1 A 1250 LEU 1 0.370 7 1 A 1251 HIS 1 0.290 8 1 A 1252 ARG 1 0.270 9 1 A 1253 ASP 1 0.390 10 1 A 1254 CYS 1 0.490 11 1 A 1255 GLU 1 0.440 12 1 A 1256 ASN 1 0.520 13 1 A 1257 TYR 1 0.440 14 1 A 1258 THR 1 0.520 15 1 A 1259 GLU 1 0.540 16 1 A 1260 ALA 1 0.580 17 1 A 1261 ALA 1 0.570 18 1 A 1262 TYR 1 0.530 19 1 A 1263 THR 1 0.580 20 1 A 1264 LEU 1 0.490 21 1 A 1265 LEU 1 0.520 22 1 A 1266 LEU 1 0.550 23 1 A 1267 HIS 1 0.470 24 1 A 1268 ALA 1 0.490 25 1 A 1269 GLU 1 0.560 26 1 A 1270 LEU 1 0.510 27 1 A 1271 LEU 1 0.440 28 1 A 1272 GLN 1 0.400 29 1 A 1273 TRP 1 0.290 30 1 A 1274 SER 1 0.390 31 1 A 1275 ASP 1 0.400 32 1 A 1276 LYS 1 0.380 33 1 A 1277 PRO 1 0.380 34 1 A 1278 CYS 1 0.360 35 1 A 1279 VAL 1 0.350 36 1 A 1280 PRO 1 0.400 37 1 A 1281 HIS 1 0.350 38 1 A 1282 LEU 1 0.390 39 1 A 1283 LEU 1 0.410 40 1 A 1284 GLN 1 0.350 41 1 A 1285 ARG 1 0.360 42 1 A 1286 ASP 1 0.340 43 1 A 1287 SER 1 0.390 44 1 A 1288 TYR 1 0.370 45 1 A 1289 TYR 1 0.370 46 1 A 1290 VAL 1 0.370 47 1 A 1291 TYR 1 0.360 48 1 A 1292 THR 1 0.450 49 1 A 1293 GLN 1 0.430 50 1 A 1294 GLN 1 0.500 51 1 A 1295 GLU 1 0.510 52 1 A 1296 LEU 1 0.470 53 1 A 1297 LYS 1 0.510 54 1 A 1298 GLU 1 0.480 55 1 A 1299 LYS 1 0.550 56 1 A 1300 LEU 1 0.440 57 1 A 1301 TYR 1 0.560 58 1 A 1302 GLN 1 0.500 59 1 A 1303 GLU 1 0.580 60 1 A 1304 ILE 1 0.660 61 1 A 1305 ILE 1 0.630 62 1 A 1306 SER 1 0.590 63 1 A 1307 TYR 1 0.570 64 1 A 1308 PHE 1 0.620 65 1 A 1309 ASP 1 0.630 66 1 A 1310 LYS 1 0.650 67 1 A 1311 GLY 1 0.730 68 1 A 1312 LYS 1 0.640 69 1 A 1313 MET 1 0.650 70 1 A 1314 TRP 1 0.640 71 1 A 1315 GLU 1 0.780 72 1 A 1316 LYS 1 0.680 73 1 A 1317 ALA 1 0.750 74 1 A 1318 ILE 1 0.770 75 1 A 1319 LYS 1 0.710 76 1 A 1320 LEU 1 0.640 77 1 A 1321 SER 1 0.720 78 1 A 1322 LYS 1 0.700 79 1 A 1323 GLU 1 0.600 80 1 A 1324 LEU 1 0.650 81 1 A 1325 ALA 1 0.640 82 1 A 1326 GLU 1 0.500 83 1 A 1327 THR 1 0.470 84 1 A 1328 TYR 1 0.430 85 1 A 1329 GLU 1 0.450 86 1 A 1330 SER 1 0.370 87 1 A 1331 LYS 1 0.410 88 1 A 1332 VAL 1 0.400 89 1 A 1333 PHE 1 0.340 90 1 A 1334 ASP 1 0.370 91 1 A 1335 TYR 1 0.290 92 1 A 1336 GLU 1 0.420 93 1 A 1337 GLY 1 0.490 94 1 A 1338 LEU 1 0.450 95 1 A 1339 GLY 1 0.560 96 1 A 1340 SER 1 0.620 97 1 A 1341 LEU 1 0.580 98 1 A 1342 LEU 1 0.640 99 1 A 1343 LYS 1 0.670 100 1 A 1344 LYS 1 0.640 101 1 A 1345 ARG 1 0.680 102 1 A 1346 ALA 1 0.800 103 1 A 1347 LEU 1 0.770 104 1 A 1348 PHE 1 0.770 105 1 A 1349 TYR 1 0.780 106 1 A 1350 GLU 1 0.780 107 1 A 1351 ASN 1 0.670 108 1 A 1352 ILE 1 0.520 #