data_SMR-44cfb6690910ca67845d8205d5d79334_3 _entry.id SMR-44cfb6690910ca67845d8205d5d79334_3 _struct.entry_id SMR-44cfb6690910ca67845d8205d5d79334_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - P57075/ UBS3A_HUMAN, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A Estimated model accuracy of this model is 0.037, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P57075' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 86104.512 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP UBS3A_HUMAN P57075 1 ;MAAGETQLYAKVSNKLKSRSSPSLLEPLLAMGFPVHTALKALAATGRKTAEEALAWLHDHCNDPSLDDPI PQEYALFLCPTGPLLEKLQEFWRESKRQCAKNRAHEVFPHVTLCDFFTCEDQKVECLYEALKRAGDRLLG SFPTAVPLALHSSISYLGFFVSGSPADVIREFAMTFATEASLLAGTSVSRFWIFSQVPGHGPNLRLSNLT RASFVSHYILQKYCSVKPCTKQLHLTLAHKFYPHHQRTLEQLARAIPLGHSCQWTAALYSRDMRFVHYQT LRALFQYKPQNVDELTLSPGDYIFVDPTQQDEASEGWVIGISQRTGCRGFLPENYTDRASESDTWVKHRM YTFSLATDLNSRKDGEASSRCSGEFLPQTARSLSSLQALQATVARKSVLVVRHGERVDQIFGKAWLQQCS TPDGKYYRPDLNFPCSLPRRSRGIKDFENDPPLSSCGIFQSRIAGDALLDSGIRISSVFASPALRCVQTA KLILEELKLEKKIKIRVEPGIFEWTKWEAGKTTPTLMSLEELKEANFNIDTDYRPAFPLSALMPAESYQE YMDRCTASMVQIVNTCPQDTGVILIVSHGSTLDSCTRPLLGLPPRECGDFAQLVRKIPSLGMCFCEENKE EGKWELVNPPVKTLTHGANAAFNWRNWISGN ; 'Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 661 1 661 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . UBS3A_HUMAN P57075 . 1 661 9606 'Homo sapiens (Human)' 2000-12-01 60DA2E0B8CE4ABFC . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MAAGETQLYAKVSNKLKSRSSPSLLEPLLAMGFPVHTALKALAATGRKTAEEALAWLHDHCNDPSLDDPI PQEYALFLCPTGPLLEKLQEFWRESKRQCAKNRAHEVFPHVTLCDFFTCEDQKVECLYEALKRAGDRLLG SFPTAVPLALHSSISYLGFFVSGSPADVIREFAMTFATEASLLAGTSVSRFWIFSQVPGHGPNLRLSNLT RASFVSHYILQKYCSVKPCTKQLHLTLAHKFYPHHQRTLEQLARAIPLGHSCQWTAALYSRDMRFVHYQT LRALFQYKPQNVDELTLSPGDYIFVDPTQQDEASEGWVIGISQRTGCRGFLPENYTDRASESDTWVKHRM YTFSLATDLNSRKDGEASSRCSGEFLPQTARSLSSLQALQATVARKSVLVVRHGERVDQIFGKAWLQQCS TPDGKYYRPDLNFPCSLPRRSRGIKDFENDPPLSSCGIFQSRIAGDALLDSGIRISSVFASPALRCVQTA KLILEELKLEKKIKIRVEPGIFEWTKWEAGKTTPTLMSLEELKEANFNIDTDYRPAFPLSALMPAESYQE YMDRCTASMVQIVNTCPQDTGVILIVSHGSTLDSCTRPLLGLPPRECGDFAQLVRKIPSLGMCFCEENKE EGKWELVNPPVKTLTHGANAAFNWRNWISGN ; ;MAAGETQLYAKVSNKLKSRSSPSLLEPLLAMGFPVHTALKALAATGRKTAEEALAWLHDHCNDPSLDDPI PQEYALFLCPTGPLLEKLQEFWRESKRQCAKNRAHEVFPHVTLCDFFTCEDQKVECLYEALKRAGDRLLG SFPTAVPLALHSSISYLGFFVSGSPADVIREFAMTFATEASLLAGTSVSRFWIFSQVPGHGPNLRLSNLT RASFVSHYILQKYCSVKPCTKQLHLTLAHKFYPHHQRTLEQLARAIPLGHSCQWTAALYSRDMRFVHYQT LRALFQYKPQNVDELTLSPGDYIFVDPTQQDEASEGWVIGISQRTGCRGFLPENYTDRASESDTWVKHRM YTFSLATDLNSRKDGEASSRCSGEFLPQTARSLSSLQALQATVARKSVLVVRHGERVDQIFGKAWLQQCS TPDGKYYRPDLNFPCSLPRRSRGIKDFENDPPLSSCGIFQSRIAGDALLDSGIRISSVFASPALRCVQTA KLILEELKLEKKIKIRVEPGIFEWTKWEAGKTTPTLMSLEELKEANFNIDTDYRPAFPLSALMPAESYQE YMDRCTASMVQIVNTCPQDTGVILIVSHGSTLDSCTRPLLGLPPRECGDFAQLVRKIPSLGMCFCEENKE EGKWELVNPPVKTLTHGANAAFNWRNWISGN ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 ALA . 1 4 GLY . 1 5 GLU . 1 6 THR . 1 7 GLN . 1 8 LEU . 1 9 TYR . 1 10 ALA . 1 11 LYS . 1 12 VAL . 1 13 SER . 1 14 ASN . 1 15 LYS . 1 16 LEU . 1 17 LYS . 1 18 SER . 1 19 ARG . 1 20 SER . 1 21 SER . 1 22 PRO . 1 23 SER . 1 24 LEU . 1 25 LEU . 1 26 GLU . 1 27 PRO . 1 28 LEU . 1 29 LEU . 1 30 ALA . 1 31 MET . 1 32 GLY . 1 33 PHE . 1 34 PRO . 1 35 VAL . 1 36 HIS . 1 37 THR . 1 38 ALA . 1 39 LEU . 1 40 LYS . 1 41 ALA . 1 42 LEU . 1 43 ALA . 1 44 ALA . 1 45 THR . 1 46 GLY . 1 47 ARG . 1 48 LYS . 1 49 THR . 1 50 ALA . 1 51 GLU . 1 52 GLU . 1 53 ALA . 1 54 LEU . 1 55 ALA . 1 56 TRP . 1 57 LEU . 1 58 HIS . 1 59 ASP . 1 60 HIS . 1 61 CYS . 1 62 ASN . 1 63 ASP . 1 64 PRO . 1 65 SER . 1 66 LEU . 1 67 ASP . 1 68 ASP . 1 69 PRO . 1 70 ILE . 1 71 PRO . 1 72 GLN . 1 73 GLU . 1 74 TYR . 1 75 ALA . 1 76 LEU . 1 77 PHE . 1 78 LEU . 1 79 CYS . 1 80 PRO . 1 81 THR . 1 82 GLY . 1 83 PRO . 1 84 LEU . 1 85 LEU . 1 86 GLU . 1 87 LYS . 1 88 LEU . 1 89 GLN . 1 90 GLU . 1 91 PHE . 1 92 TRP . 1 93 ARG . 1 94 GLU . 1 95 SER . 1 96 LYS . 1 97 ARG . 1 98 GLN . 1 99 CYS . 1 100 ALA . 1 101 LYS . 1 102 ASN . 1 103 ARG . 1 104 ALA . 1 105 HIS . 1 106 GLU . 1 107 VAL . 1 108 PHE . 1 109 PRO . 1 110 HIS . 1 111 VAL . 1 112 THR . 1 113 LEU . 1 114 CYS . 1 115 ASP . 1 116 PHE . 1 117 PHE . 1 118 THR . 1 119 CYS . 1 120 GLU . 1 121 ASP . 1 122 GLN . 1 123 LYS . 1 124 VAL . 1 125 GLU . 1 126 CYS . 1 127 LEU . 1 128 TYR . 1 129 GLU . 1 130 ALA . 1 131 LEU . 1 132 LYS . 1 133 ARG . 1 134 ALA . 1 135 GLY . 1 136 ASP . 1 137 ARG . 1 138 LEU . 1 139 LEU . 1 140 GLY . 1 141 SER . 1 142 PHE . 1 143 PRO . 1 144 THR . 1 145 ALA . 1 146 VAL . 1 147 PRO . 1 148 LEU . 1 149 ALA . 1 150 LEU . 1 151 HIS . 1 152 SER . 1 153 SER . 1 154 ILE . 1 155 SER . 1 156 TYR . 1 157 LEU . 1 158 GLY . 1 159 PHE . 1 160 PHE . 1 161 VAL . 1 162 SER . 1 163 GLY . 1 164 SER . 1 165 PRO . 1 166 ALA . 1 167 ASP . 1 168 VAL . 1 169 ILE . 1 170 ARG . 1 171 GLU . 1 172 PHE . 1 173 ALA . 1 174 MET . 1 175 THR . 1 176 PHE . 1 177 ALA . 1 178 THR . 1 179 GLU . 1 180 ALA . 1 181 SER . 1 182 LEU . 1 183 LEU . 1 184 ALA . 1 185 GLY . 1 186 THR . 1 187 SER . 1 188 VAL . 1 189 SER . 1 190 ARG . 1 191 PHE . 1 192 TRP . 1 193 ILE . 1 194 PHE 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 11,Chimera protein of MLK3-SH3 and MIP {PDB ID=5k26, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5k26.1.A}' 'template structure' . 2 'Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 11,Chimera protein of MLK3-SH3 and MIP {PDB ID=5k26, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=5k26.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 5k26, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 5k26, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 3' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-08-20 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-08-15 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;HMYANPVWTALFDYEPSGQDELALRKGDRVEVLSRDAAISGDEGWWAGQVGGQVGIFPSNYVSRGGGAIR INPNGTWSRQAETVES ; ;HMYANPVWTALFDYEPSGQDELALRKGDRVEVLSRDAAISGDEGWWAGQVGGQVGIFPSNYVSRGGGAIR INPNGTWSRQAETVES ; 2 ;HMYANPVWTALFDYEPSGQDELALRKGDRVEVLSRDAAISGDEGWWAGQVGGQVGIFPSNYVSRGGGAIR INPNGTWSRQAETVES ; ;HMYANPVWTALFDYEPSGQDELALRKGDRVEVLSRDAAISGDEGWWAGQVGGQVGIFPSNYVSRGGGAIR INPNGTWSRQAETVES ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 7 69 2 2 7 69 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5k26 2023-09-27 2 PDB . 5k26 2023-09-27 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 661 2 2 B 1 661 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 662 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 662 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.150 35.484 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 0.150 35.484 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAAGETQLYAKVSNKLKSRSSPSLLEPLLAMGFPVHTALKALAATGRKTAEEALAWLHDHCNDPSLDDPIPQEYALFLCPTGPLLEKLQEFWRESKRQCAKNRAHEVFPHVTLCDFFTCEDQKVECLYEALKRAGDRLLGSFPTAVPLALHSSISYLGFFVSGSPADVIREFAMTFATEASLLAGTSVSRFWIFSQVPGHGPNLRLSNLTRASFVSHYILQKYCSVKPCTKQLHLTLAHKFYPHHQRTLEQLARAIPLGHSCQWTAALYSRDMRFVHYQTLRALFQYKPQNVDELTLSPGDYIFVDPTQQD-EASEGWVIGISQRTGCRGFLPENYTDRASESDTWVKHRMYTFSLATDLNSRKDGEASSRCSGEFLPQTARSLSSLQALQATVARKSVLVVRHGERVDQIFGKAWLQQCSTPDGKYYRPDLNFPCSLPRRSRGIKDFENDPPLSSCGIFQSRIAGDALLDSGIRISSVFASPALRCVQTAKLILEELKLEKKIKIRVEPGIFEWTKWEAGKTTPTLMSLEELKEANFNIDTDYRPAFPLSALMPAESYQEYMDRCTASMVQIVNTCPQDTGVILIVSHGSTLDSCTRPLLGLPPRECGDFAQLVRKIPSLGMCFCEENKEEGKWELVNPPVKTLTHGANAAFNWRNWISGN 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VWTALFDYEPSGQDELALRKGDRVEVLSRDAAISGDEGWWAGQV--GGQVGIFPSNYVSRGGGAI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 3 2 1 MAAGETQLYAKVSNKLKSRSSPSLLEPLLAMGFPVHTALKALAATGRKTAEEALAWLHDHCNDPSLDDPIPQEYALFLCPTGPLLEKLQEFWRESKRQCAKNRAHEVFPHVTLCDFFTCEDQKVECLYEALKRAGDRLLGSFPTAVPLALHSSISYLGFFVSGSPADVIREFAMTFATEASLLAGTSVSRFWIFSQVPGHGPNLRLSNLTRASFVSHYILQKYCSVKPCTKQLHLTLAHKFYPHHQRTLEQLARAIPLGHSCQWTAALYSRDMRFVHYQTLRALFQYKPQNVDELTLSPGDYIFVDPTQQD-EASEGWVIGISQRTGCRGFLPENYTDRASESDTWVKHRMYTFSLATDLNSRKDGEASSRCSGEFLPQTARSLSSLQALQATVARKSVLVVRHGERVDQIFGKAWLQQCSTPDGKYYRPDLNFPCSLPRRSRGIKDFENDPPLSSCGIFQSRIAGDALLDSGIRISSVFASPALRCVQTAKLILEELKLEKKIKIRVEPGIFEWTKWEAGKTTPTLMSLEELKEANFNIDTDYRPAFPLSALMPAESYQEYMDRCTASMVQIVNTCPQDTGVILIVSHGSTLDSCTRPLLGLPPRECGDFAQLVRKIPSLGMCFCEENKEEGKWELVNPPVKTLTHGANAAFNWRNWISGN 4 2 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VWTALFDYEPSGQDELALRKGDRVEVLSRDAAISGDEGWWAGQV--GGQVGIFPSNYVSRGGGAI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.223}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5k26.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 3' 6 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . THR 280 280 ? A 28.541 55.106 9.408 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 2 C CA . THR 280 280 ? A 27.616 54.981 10.601 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 3 C C . THR 280 280 ? A 26.168 55.053 10.178 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 4 O O . THR 280 280 ? A 25.760 56.018 9.542 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 5 C CB . THR 280 280 ? A 27.924 56.046 11.656 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 6 O OG1 . THR 280 280 ? A 29.291 55.942 12.035 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 7 C CG2 . THR 280 280 ? A 27.094 55.880 12.938 1 1 A THR 0.640 1 ATOM 8 N N . LEU 281 281 ? A 25.378 54.008 10.473 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 9 C CA . LEU 281 281 ? A 23.974 53.916 10.134 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 10 C C . LEU 281 281 ? A 23.202 54.090 11.421 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 11 O O . LEU 281 281 ? A 23.767 54.036 12.507 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 12 C CB . LEU 281 281 ? A 23.610 52.560 9.482 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 13 C CG . LEU 281 281 ? A 24.342 52.273 8.158 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 14 C CD1 . LEU 281 281 ? A 23.853 50.948 7.566 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 15 C CD2 . LEU 281 281 ? A 24.131 53.365 7.103 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 16 N N . ARG 282 282 ? A 21.894 54.342 11.328 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 17 C CA . ARG 282 282 ? A 21.059 54.564 12.486 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 18 C C . ARG 282 282 ? A 19.997 53.484 12.530 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 19 O O . ARG 282 282 ? A 19.376 53.184 11.516 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 20 C CB . ARG 282 282 ? A 20.401 55.955 12.377 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 21 C CG . ARG 282 282 ? A 19.451 56.323 13.529 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 22 C CD . ARG 282 282 ? A 18.950 57.757 13.392 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 23 N NE . ARG 282 282 ? A 17.993 58.000 14.526 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 24 C CZ . ARG 282 282 ? A 17.416 59.181 14.776 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 25 N NH1 . ARG 282 282 ? A 17.688 60.227 14.006 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 26 N NH2 . ARG 282 282 ? A 16.544 59.335 15.772 1 1 A ARG 0.610 1 ATOM 27 N N . ALA 283 283 ? A 19.768 52.847 13.696 1 1 A ALA 0.730 1 ATOM 28 C CA . ALA 283 283 ? A 18.681 51.905 13.884 1 1 A ALA 0.730 1 ATOM 29 C C . ALA 283 283 ? A 17.290 52.552 13.796 1 1 A ALA 0.730 1 ATOM 30 O O . ALA 283 283 ? A 16.983 53.531 14.481 1 1 A ALA 0.730 1 ATOM 31 C CB . ALA 283 283 ? A 18.849 51.159 15.219 1 1 A ALA 0.730 1 ATOM 32 N N . LEU 284 284 ? A 16.423 52.004 12.922 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 33 C CA . LEU 284 284 ? A 15.041 52.402 12.732 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 34 C C . LEU 284 284 ? A 14.136 51.829 13.806 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 35 O O . LEU 284 284 ? A 13.211 52.473 14.299 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 36 C CB . LEU 284 284 ? A 14.544 51.904 11.355 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 37 C CG . LEU 284 284 ? A 15.192 52.586 10.138 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 38 C CD1 . LEU 284 284 ? A 14.826 51.807 8.864 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 39 C CD2 . LEU 284 284 ? A 14.773 54.060 10.024 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 40 N N . PHE 285 285 ? A 14.407 50.575 14.201 1 1 A PHE 0.610 1 ATOM 41 C CA . PHE 285 285 ? A 13.528 49.805 15.045 1 1 A PHE 0.610 1 ATOM 42 C C . PHE 285 285 ? A 14.382 49.102 16.076 1 1 A PHE 0.610 1 ATOM 43 O O . PHE 285 285 ? A 15.590 48.935 15.911 1 1 A PHE 0.610 1 ATOM 44 C CB . PHE 285 285 ? A 12.734 48.705 14.274 1 1 A PHE 0.610 1 ATOM 45 C CG . PHE 285 285 ? A 12.266 49.152 12.915 1 1 A PHE 0.610 1 ATOM 46 C CD1 . PHE 285 285 ? A 11.264 50.125 12.772 1 1 A PHE 0.610 1 ATOM 47 C CD2 . PHE 285 285 ? A 12.856 48.624 11.754 1 1 A PHE 0.610 1 ATOM 48 C CE1 . PHE 285 285 ? A 10.881 50.574 11.501 1 1 A PHE 0.610 1 ATOM 49 C CE2 . PHE 285 285 ? A 12.468 49.069 10.486 1 1 A PHE 0.610 1 ATOM 50 C CZ . PHE 285 285 ? A 11.472 50.037 10.356 1 1 A PHE 0.610 1 ATOM 51 N N . GLN 286 286 ? A 13.756 48.655 17.178 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 52 C CA . GLN 286 286 ? A 14.381 47.737 18.105 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 53 C C . GLN 286 286 ? A 14.599 46.357 17.497 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 54 O O . GLN 286 286 ? A 13.725 45.810 16.836 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 55 C CB . GLN 286 286 ? A 13.572 47.593 19.414 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 56 C CG . GLN 286 286 ? A 14.321 46.789 20.500 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 57 C CD . GLN 286 286 ? A 13.532 46.717 21.801 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 58 O OE1 . GLN 286 286 ? A 12.556 47.430 22.021 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 59 N NE2 . GLN 286 286 ? A 13.987 45.826 22.714 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 60 N N . TYR 287 287 ? A 15.777 45.756 17.737 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 61 C CA . TYR 287 287 ? A 16.059 44.394 17.350 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 62 C C . TYR 287 287 ? A 16.564 43.699 18.604 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 63 O O . TYR 287 287 ? A 17.486 44.167 19.262 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 64 C CB . TYR 287 287 ? A 17.077 44.299 16.171 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 65 C CG . TYR 287 287 ? A 17.321 42.855 15.786 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 66 C CD1 . TYR 287 287 ? A 16.277 42.075 15.273 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 67 C CD2 . TYR 287 287 ? A 18.527 42.216 16.112 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 68 C CE1 . TYR 287 287 ? A 16.395 40.682 15.173 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 69 C CE2 . TYR 287 287 ? A 18.652 40.821 16.005 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 70 C CZ . TYR 287 287 ? A 17.574 40.049 15.565 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 71 O OH . TYR 287 287 ? 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