data_SMR-48418fc04c8ca6563c148093a8e58503_3 _entry.id SMR-48418fc04c8ca6563c148093a8e58503_3 _struct.entry_id SMR-48418fc04c8ca6563c148093a8e58503_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P46379 (isoform 2)/ BAG6_HUMAN, Large proline-rich protein BAG6 Estimated model accuracy of this model is 0.04, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P46379 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.5 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 132935.210 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP BAG6_HUMAN P46379 1 ;MEPNDSTSTAVEEPDSLEVLVKTLDSQTRTFIVGAQMNVKEFKEHIAASVSIPSEKQRLIYQGRVLQDDK KLQEYNVGGKVIHLVERAPPQTHLPSGASSGTGSASATHGGGSPPGTRGPGASVHDRNANSYVMVGTFNL PSDGSAVDVHINMEQAPIQSEPRVRLVMAQHMIRDIQTLLSRMECRGGPQPQHSQPPPQPPAVTPEPVAL SSQTSEPVESEAPPREPMEAEEVEERAPAQNPELTPGPAPAGPTPAPETNAPNHPSPAEYVEVLQELQRL ESRLQPFLQRYYEVLGAAATTDYNNNHEGREEDQRLINLVGESLRLLGNTFVALSDLRCNLACTPPRHLH VVRPMSHYTTPMVLQQAAIPIQINVGTTVTMTGNGTRPPPTPNAEAPPPGPGQASSVAPSSTNVESSAEG APPPGPAPPPATSHPRVIRISHQSVEPVVMMHMNIQDSGTQPGGVPSAPTGPLGPPGHGQTLGQQVPGFP TAPTRVVIARPTPPQARPSHPGGPPVSGTLQGAGLGTNASLAQMVSGLVGQLLMQPVLVAQGTPGMAPPP APATASASAGTTNTATTAGPAPGGPAQPPPTPQPSMADLQFSQLLGNLLGPAGPGAGGSGVASPTITVAM PGVPAFLQGMTDFLQATQTAPPPPPPPPPPPPAPEQQTMPPPGSPSGGAGSPGGLGLESLSPEFFTSVVQ GVLSSLLGSLGARAGSSESIAAFIQRLSGSSNIFEPGADGALGFFGALLSLLCQNFSMVDVVMLLHGHFQ PLQRLQPQLRSFFHQHYLGGQEPTPSNIRMATHTLITGLEEYVRESFSLVQVQPGVDIIRTNLEFLQEQF NSIAAHVLHCTDSGFGARLLELCNQGLFECLALNLHCLGGQQMELAAVINGRIRRMSRGVNPSLVSWLTT MMGLRLQVVLEHMPVGPDAILRYVRRVGDPPQPLPEEPMEVQGAERASPEPQRENASPAPGTTAEEAMSR GPPPAPEGGSRDEQDGASAETEPWAAAVPPEWVPIIQQDIQSQRKVKPQPPLSDAYLSGMPAKRRKLRSD IQKRLQEDPNYSPQRFPNAQRAFADDP ; 'Large proline-rich protein BAG6' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1077 1 1077 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . BAG6_HUMAN P46379 P46379-2 1 1077 9606 'Homo sapiens (Human)' 2005-09-27 CB94D1C58A1E3D21 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no D ;MEPNDSTSTAVEEPDSLEVLVKTLDSQTRTFIVGAQMNVKEFKEHIAASVSIPSEKQRLIYQGRVLQDDK KLQEYNVGGKVIHLVERAPPQTHLPSGASSGTGSASATHGGGSPPGTRGPGASVHDRNANSYVMVGTFNL PSDGSAVDVHINMEQAPIQSEPRVRLVMAQHMIRDIQTLLSRMECRGGPQPQHSQPPPQPPAVTPEPVAL SSQTSEPVESEAPPREPMEAEEVEERAPAQNPELTPGPAPAGPTPAPETNAPNHPSPAEYVEVLQELQRL ESRLQPFLQRYYEVLGAAATTDYNNNHEGREEDQRLINLVGESLRLLGNTFVALSDLRCNLACTPPRHLH VVRPMSHYTTPMVLQQAAIPIQINVGTTVTMTGNGTRPPPTPNAEAPPPGPGQASSVAPSSTNVESSAEG APPPGPAPPPATSHPRVIRISHQSVEPVVMMHMNIQDSGTQPGGVPSAPTGPLGPPGHGQTLGQQVPGFP TAPTRVVIARPTPPQARPSHPGGPPVSGTLQGAGLGTNASLAQMVSGLVGQLLMQPVLVAQGTPGMAPPP APATASASAGTTNTATTAGPAPGGPAQPPPTPQPSMADLQFSQLLGNLLGPAGPGAGGSGVASPTITVAM PGVPAFLQGMTDFLQATQTAPPPPPPPPPPPPAPEQQTMPPPGSPSGGAGSPGGLGLESLSPEFFTSVVQ GVLSSLLGSLGARAGSSESIAAFIQRLSGSSNIFEPGADGALGFFGALLSLLCQNFSMVDVVMLLHGHFQ PLQRLQPQLRSFFHQHYLGGQEPTPSNIRMATHTLITGLEEYVRESFSLVQVQPGVDIIRTNLEFLQEQF NSIAAHVLHCTDSGFGARLLELCNQGLFECLALNLHCLGGQQMELAAVINGRIRRMSRGVNPSLVSWLTT MMGLRLQVVLEHMPVGPDAILRYVRRVGDPPQPLPEEPMEVQGAERASPEPQRENASPAPGTTAEEAMSR GPPPAPEGGSRDEQDGASAETEPWAAAVPPEWVPIIQQDIQSQRKVKPQPPLSDAYLSGMPAKRRKLRSD IQKRLQEDPNYSPQRFPNAQRAFADDP ; ;MEPNDSTSTAVEEPDSLEVLVKTLDSQTRTFIVGAQMNVKEFKEHIAASVSIPSEKQRLIYQGRVLQDDK KLQEYNVGGKVIHLVERAPPQTHLPSGASSGTGSASATHGGGSPPGTRGPGASVHDRNANSYVMVGTFNL PSDGSAVDVHINMEQAPIQSEPRVRLVMAQHMIRDIQTLLSRMECRGGPQPQHSQPPPQPPAVTPEPVAL SSQTSEPVESEAPPREPMEAEEVEERAPAQNPELTPGPAPAGPTPAPETNAPNHPSPAEYVEVLQELQRL ESRLQPFLQRYYEVLGAAATTDYNNNHEGREEDQRLINLVGESLRLLGNTFVALSDLRCNLACTPPRHLH VVRPMSHYTTPMVLQQAAIPIQINVGTTVTMTGNGTRPPPTPNAEAPPPGPGQASSVAPSSTNVESSAEG APPPGPAPPPATSHPRVIRISHQSVEPVVMMHMNIQDSGTQPGGVPSAPTGPLGPPGHGQTLGQQVPGFP TAPTRVVIARPTPPQARPSHPGGPPVSGTLQGAGLGTNASLAQMVSGLVGQLLMQPVLVAQGTPGMAPPP APATASASAGTTNTATTAGPAPGGPAQPPPTPQPSMADLQFSQLLGNLLGPAGPGAGGSGVASPTITVAM PGVPAFLQGMTDFLQATQTAPPPPPPPPPPPPAPEQQTMPPPGSPSGGAGSPGGLGLESLSPEFFTSVVQ GVLSSLLGSLGARAGSSESIAAFIQRLSGSSNIFEPGADGALGFFGALLSLLCQNFSMVDVVMLLHGHFQ PLQRLQPQLRSFFHQHYLGGQEPTPSNIRMATHTLITGLEEYVRESFSLVQVQPGVDIIRTNLEFLQEQF NSIAAHVLHCTDSGFGARLLELCNQGLFECLALNLHCLGGQQMELAAVINGRIRRMSRGVNPSLVSWLTT MMGLRLQVVLEHMPVGPDAILRYVRRVGDPPQPLPEEPMEVQGAERASPEPQRENASPAPGTTAEEAMSR GPPPAPEGGSRDEQDGASAETEPWAAAVPPEWVPIIQQDIQSQRKVKPQPPLSDAYLSGMPAKRRKLRSD IQKRLQEDPNYSPQRFPNAQRAFADDP ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLU . 1 3 PRO . 1 4 ASN . 1 5 ASP . 1 6 SER . 1 7 THR . 1 8 SER . 1 9 THR . 1 10 ALA . 1 11 VAL . 1 12 GLU . 1 13 GLU . 1 14 PRO . 1 15 ASP . 1 16 SER . 1 17 LEU . 1 18 GLU . 1 19 VAL . 1 20 LEU . 1 21 VAL . 1 22 LYS . 1 23 THR . 1 24 LEU . 1 25 ASP . 1 26 SER . 1 27 GLN . 1 28 THR . 1 29 ARG . 1 30 THR . 1 31 PHE . 1 32 ILE . 1 33 VAL . 1 34 GLY . 1 35 ALA . 1 36 GLN . 1 37 MET . 1 38 ASN . 1 39 VAL . 1 40 LYS . 1 41 GLU . 1 42 PHE . 1 43 LYS . 1 44 GLU . 1 45 HIS . 1 46 ILE . 1 47 ALA . 1 48 ALA . 1 49 SER . 1 50 VAL . 1 51 SER . 1 52 ILE . 1 53 PRO . 1 54 SER . 1 55 GLU . 1 56 LYS . 1 57 GLN . 1 58 ARG . 1 59 LEU . 1 60 ILE . 1 61 TYR . 1 62 GLN . 1 63 GLY . 1 64 ARG . 1 65 VAL . 1 66 LEU . 1 67 GLN . 1 68 ASP . 1 69 ASP . 1 70 LYS . 1 71 LYS . 1 72 LEU . 1 73 GLN . 1 74 GLU . 1 75 TYR . 1 76 ASN . 1 77 VAL . 1 78 GLY . 1 79 GLY . 1 80 LYS . 1 81 VAL . 1 82 ILE . 1 83 HIS . 1 84 LEU . 1 85 VAL . 1 86 GLU . 1 87 ARG . 1 88 ALA . 1 89 PRO . 1 90 PRO . 1 91 GLN . 1 92 THR . 1 93 HIS . 1 94 LEU . 1 95 PRO . 1 96 SER . 1 97 GLY . 1 98 ALA . 1 99 SER . 1 100 SER . 1 101 GLY . 1 102 THR . 1 103 GLY . 1 104 SER . 1 105 ALA . 1 106 SER . 1 107 ALA . 1 108 THR . 1 109 HIS . 1 110 GLY . 1 111 GLY . 1 112 GLY . 1 113 SER . 1 114 PRO . 1 115 PRO . 1 116 GLY . 1 117 THR . 1 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D . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Large proline-rich protein BAG6 {PDB ID=7ru9, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=7ru9.1.D}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7ru9, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-08-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-08-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 3 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GPGSAETEPWAAAVPPEWVPIIQQDIQSQRKVKPQPPLSDAYLSGMPAKRRKTMQGEGPQLLLSEAVSRA AKAAGARPLTSPESLSRDLEAPEVQESYRQQLRSDIQKRLQEDPNYSPQRFPNAQRAFADDP ; ;GPGSAETEPWAAAVPPEWVPIIQQDIQSQRKVKPQPPLSDAYLSGMPAKRRKTMQGEGPQLLLSEAVSRA AKAAGARPLTSPESLSRDLEAPEVQESYRQQLRSDIQKRLQEDPNYSPQRFPNAQRAFADDP ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 4 132 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7ru9 2024-06-05 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1077 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1126 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.4e-27 97.500 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEPNDSTSTAVEEPDSLEVLVKTLDSQTRTFIVGAQMNVKEFKEHIAASVSIPSEKQRLIYQGRVLQDDKKLQEYNVGGKVIHLVERAPPQTHLPSGASSGTGSASATHGGGSPPGTRGPGASVHDRNANSYVMVGTFNLPSDGSAVDVHINMEQAPIQSEPRVRLVMAQHMIRDIQTLLSRMECRGGPQPQHSQPPPQPPAVTPEPVALSSQTSEPVESEAPPREPMEAEEVEERAPAQNPELTPGPAPAGPTPAPETNAPNHPSPAEYVEVLQELQRLESRLQPFLQRYYEVLGAAATTDYNNNHEGREEDQRLINLVGESLRLLGNTFVALSDLRCNLACTPPRHLHVVRPMSHYTTPMVLQQAAIPIQINVGTTVTMTGNGTRPPPTPNAEAPPPGPGQASSVAPSSTNVESSAEGAPPPGPAPPPATSHPRVIRISHQSVEPVVMMHMNIQDSGTQPGGVPSAPTGPLGPPGHGQTLGQQVPGFPTAPTRVVIARPTPPQARPSHPGGPPVSGTLQGAGLGTNASLAQMVSGLVGQLLMQPVLVAQGTPGMAPPPAPATASASAGTTNTATTAGPAPGGPAQPPPTPQPSMADLQFSQLLGNLLGPAGPGAGGSGVASPTITVAMPGVPAFLQGMTDFLQATQTAPPPPPPPPPPPPAPEQQTMPPPGSPSGGAGSPGGLGLESLSPEFFTSVVQGVLSSLLGSLGARAGSSESIAAFIQRLSGSSNIFEPGADGALGFFGALLSLLCQNFSMVDVVMLLHGHFQPLQRLQPQLRSFFHQHYLGGQEPTPSNIRMATHTLITGLEEYVRESFSLVQVQPGVDIIRTNLEFLQEQFNSIAAHVLHCTDSGFGARLLELCNQGLFECLALNLHCLGGQQMELAAVINGRIRRMSRGVNPSLVSWLTTMMGLRLQVVLEHMPVGPDAILRYVRRVGDPPQPLPEEPMEVQGAERASPEPQRENASPAPGTTAEEAMSRGPPPAPEGGSRDEQDGASAETEPWAAAVPPEWVPIIQQDIQSQRKVKPQPPLSDAYLSGMPAKRRKLR-------------------------------------------------SDIQKRLQEDPNYSPQRFPNAQRAFADDP 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SAETEPWAAAVPPEWVPIIQQDIQSQRKVKPQPPLSDAYLSGMPAKRRKTMQGEGPQLLLSEAVSRAAKAAGARPLTSPESLSRDLEAPEVQESYRQQLRSDIQKRLQEDPNYSPQRFPNAQRAFADDP # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7ru9.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 3' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 1002 1002 ? A 112.544 187.470 102.926 1 1 D GLU 0.490 1 ATOM 2 C CA . GLU 1002 1002 ? A 113.796 186.666 102.729 1 1 D GLU 0.490 1 ATOM 3 C C . GLU 1002 1002 ? A 113.536 185.162 102.732 1 1 D GLU 0.490 1 ATOM 4 O O . GLU 1002 1002 ? A 112.417 184.813 103.102 1 1 D GLU 0.490 1 ATOM 5 C CB . GLU 1002 1002 ? A 114.742 187.057 103.877 1 1 D GLU 0.490 1 ATOM 6 C CG . GLU 1002 1002 ? A 114.964 188.583 104.010 1 1 D GLU 0.490 1 ATOM 7 C CD . GLU 1002 1002 ? A 116.383 188.815 104.508 1 1 D GLU 0.490 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 1002 1002 ? A 117.299 188.318 103.811 1 1 D GLU 0.490 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 1002 1002 ? A 116.544 189.425 105.587 1 1 D GLU 0.490 1 ATOM 10 N N . PRO 1003 1003 ? A 114.429 184.235 102.358 1 1 D PRO 0.420 1 ATOM 11 C CA . PRO 1003 1003 ? A 114.130 182.800 102.288 1 1 D PRO 0.420 1 ATOM 12 C C . PRO 1003 1003 ? A 113.827 182.167 103.642 1 1 D PRO 0.420 1 ATOM 13 O O . PRO 1003 1003 ? A 112.951 181.320 103.731 1 1 D PRO 0.420 1 ATOM 14 C CB . PRO 1003 1003 ? A 115.391 182.161 101.666 1 1 D PRO 0.420 1 ATOM 15 C CG . PRO 1003 1003 ? A 116.106 183.313 100.948 1 1 D PRO 0.420 1 ATOM 16 C CD . PRO 1003 1003 ? A 115.735 184.545 101.776 1 1 D PRO 0.420 1 ATOM 17 N N . TRP 1004 1004 ? A 114.542 182.583 104.717 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 18 C CA . TRP 1004 1004 ? A 114.370 182.102 106.085 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 19 C C . TRP 1004 1004 ? A 113.002 182.457 106.670 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 20 O O . TRP 1004 1004 ? A 112.489 181.778 107.551 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 21 C CB . TRP 1004 1004 ? A 115.512 182.637 107.019 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 22 C CG . TRP 1004 1004 ? A 115.773 184.152 106.989 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 23 C CD1 . TRP 1004 1004 ? A 116.759 184.833 106.319 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 24 C CD2 . TRP 1004 1004 ? A 114.993 185.160 107.675 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 25 N NE1 . TRP 1004 1004 ? A 116.623 186.191 106.515 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 26 C CE2 . TRP 1004 1004 ? A 115.554 186.414 107.348 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 27 C CE3 . TRP 1004 1004 ? A 113.882 185.078 108.517 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 28 C CZ2 . TRP 1004 1004 ? A 115.013 187.594 107.845 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 29 C CZ3 . TRP 1004 1004 ? A 113.302 186.273 108.969 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 30 C CH2 . TRP 1004 1004 ? A 113.868 187.513 108.651 1 1 D TRP 0.580 1 ATOM 31 N N . ALA 1005 1005 ? A 112.369 183.532 106.135 1 1 D ALA 0.730 1 ATOM 32 C CA . ALA 1005 1005 ? A 111.071 184.027 106.541 1 1 D ALA 0.730 1 ATOM 33 C C . ALA 1005 1005 ? A 109.931 183.099 106.131 1 1 D ALA 0.730 1 ATOM 34 O O . ALA 1005 1005 ? A 108.831 183.216 106.641 1 1 D ALA 0.730 1 ATOM 35 C CB . ALA 1005 1005 ? A 110.788 185.422 105.932 1 1 D ALA 0.730 1 ATOM 36 N N . ALA 1006 1006 ? A 110.184 182.169 105.179 1 1 D ALA 0.670 1 ATOM 37 C CA . ALA 1006 1006 ? A 109.233 181.167 104.743 1 1 D ALA 0.670 1 ATOM 38 C C . ALA 1006 1006 ? A 108.835 180.139 105.809 1 1 D ALA 0.670 1 ATOM 39 O O . ALA 1006 1006 ? A 107.682 179.745 105.898 1 1 D ALA 0.670 1 ATOM 40 C CB . ALA 1006 1006 ? A 109.821 180.408 103.531 1 1 D ALA 0.670 1 ATOM 41 N N . ALA 1007 1007 ? A 109.813 179.648 106.611 1 1 D ALA 0.670 1 ATOM 42 C CA . ALA 1007 1007 ? A 109.570 178.648 107.637 1 1 D ALA 0.670 1 ATOM 43 C C . ALA 1007 1007 ? A 109.047 179.210 108.955 1 1 D ALA 0.670 1 ATOM 44 O O . ALA 1007 1007 ? A 108.174 178.632 109.593 1 1 D ALA 0.670 1 ATOM 45 C CB . ALA 1007 1007 ? A 110.881 177.893 107.947 1 1 D ALA 0.670 1 ATOM 46 N N . VAL 1008 1008 ? A 109.629 180.338 109.425 1 1 D VAL 0.700 1 ATOM 47 C CA . VAL 1008 1008 ? A 109.211 181.012 110.647 1 1 D VAL 0.700 1 ATOM 48 C C . VAL 1008 1008 ? A 107.807 181.609 110.520 1 1 D VAL 0.700 1 ATOM 49 O O . VAL 1008 1008 ? A 107.431 181.997 109.415 1 1 D VAL 0.700 1 ATOM 50 C CB . VAL 1008 1008 ? A 110.214 182.075 111.129 1 1 D VAL 0.700 1 ATOM 51 C CG1 . VAL 1008 1008 ? A 111.580 181.397 111.380 1 1 D VAL 0.700 1 ATOM 52 C CG2 . VAL 1008 1008 ? A 110.351 183.227 110.111 1 1 D VAL 0.700 1 ATOM 53 N N . PRO 1009 1009 ? A 106.969 181.710 111.557 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 54 C CA . PRO 1009 1009 ? A 105.744 182.509 111.517 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 55 C C . PRO 1009 1009 ? A 105.913 183.933 110.945 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 56 O O . PRO 1009 1009 ? A 106.931 184.550 111.281 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 57 C CB . PRO 1009 1009 ? A 105.232 182.517 112.969 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 58 C CG . PRO 1009 1009 ? A 105.883 181.290 113.621 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 59 C CD . PRO 1009 1009 ? A 107.224 181.180 112.892 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 60 N N . PRO 1010 1010 ? A 105.027 184.509 110.121 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 61 C CA . PRO 1010 1010 ? A 105.248 185.777 109.429 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 62 C C . PRO 1010 1010 ? A 105.474 186.957 110.357 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 63 O O . PRO 1010 1010 ? A 106.200 187.885 109.993 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 64 C CB . PRO 1010 1010 ? A 103.962 186.012 108.611 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 65 C CG . PRO 1010 1010 ? A 103.357 184.616 108.435 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 66 C CD . PRO 1010 1010 ? A 103.777 183.881 109.712 1 1 D PRO 0.710 1 ATOM 67 N N . GLU 1011 1011 ? A 104.851 186.964 111.553 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 68 C CA . GLU 1011 1011 ? A 104.924 188.024 112.533 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 69 C C . GLU 1011 1011 ? A 106.273 188.069 113.257 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 70 O O . GLU 1011 1011 ? A 106.623 189.065 113.877 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 71 C CB . GLU 1011 1011 ? A 103.749 187.929 113.559 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 72 C CG . GLU 1011 1011 ? A 103.753 186.707 114.530 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 73 C CD . GLU 1011 1011 ? A 103.273 185.361 113.984 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 74 O OE1 . GLU 1011 1011 ? A 103.039 185.244 112.755 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 75 O OE2 . GLU 1011 1011 ? A 103.179 184.424 114.817 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 76 N N . TRP 1012 1012 ? A 107.096 186.991 113.157 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 77 C CA . TRP 1012 1012 ? A 108.453 186.949 113.694 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 78 C C . TRP 1012 1012 ? A 109.428 187.678 112.799 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 79 O O . TRP 1012 1012 ? A 110.434 188.209 113.259 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 80 C CB . TRP 1012 1012 ? A 108.965 185.492 113.877 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 81 C CG . TRP 1012 1012 ? A 108.242 184.713 114.954 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 82 C CD1 . TRP 1012 1012 ? A 107.127 185.053 115.668 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 83 C CD2 . TRP 1012 1012 ? A 108.657 183.432 115.476 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 84 N NE1 . TRP 1012 1012 ? A 106.745 184.032 116.506 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 85 C CE2 . TRP 1012 1012 ? A 107.706 183.045 116.419 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 86 C CE3 . TRP 1012 1012 ? A 109.771 182.634 115.188 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 87 C CZ2 . TRP 1012 1012 ? A 107.820 181.840 117.111 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 88 C CZ3 . TRP 1012 1012 ? A 109.898 181.421 115.891 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 89 C CH2 . TRP 1012 1012 ? A 108.939 181.030 116.835 1 1 D TRP 0.670 1 ATOM 90 N N . VAL 1013 1013 ? A 109.125 187.763 111.487 1 1 D VAL 0.770 1 ATOM 91 C CA . VAL 1013 1013 ? A 110.001 188.369 110.494 1 1 D VAL 0.770 1 ATOM 92 C C . VAL 1013 1013 ? 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A 115.379 187.404 112.114 1 1 D ILE 0.800 1 ATOM 119 C CD1 . ILE 1016 1016 ? A 112.843 185.802 113.023 1 1 D ILE 0.800 1 ATOM 120 N N . GLN 1017 1017 ? A 114.428 190.904 111.373 1 1 D GLN 0.830 1 ATOM 121 C CA . GLN 1017 1017 ? A 115.062 191.853 110.471 1 1 D GLN 0.830 1 ATOM 122 C C . GLN 1017 1017 ? A 115.697 193.038 111.177 1 1 D GLN 0.830 1 ATOM 123 O O . GLN 1017 1017 ? A 116.808 193.428 110.847 1 1 D GLN 0.830 1 ATOM 124 C CB . GLN 1017 1017 ? A 114.069 192.423 109.437 1 1 D GLN 0.830 1 ATOM 125 C CG . GLN 1017 1017 ? A 113.591 191.375 108.420 1 1 D GLN 0.830 1 ATOM 126 C CD . GLN 1017 1017 ? A 112.561 192.002 107.487 1 1 D GLN 0.830 1 ATOM 127 O OE1 . GLN 1017 1017 ? A 112.101 193.122 107.634 1 1 D GLN 0.830 1 ATOM 128 N NE2 . GLN 1017 1017 ? A 112.146 191.198 106.478 1 1 D GLN 0.830 1 ATOM 129 N N . GLN 1018 1018 ? A 115.027 193.626 112.189 1 1 D GLN 0.820 1 ATOM 130 C CA . GLN 1018 1018 ? A 115.586 194.683 113.023 1 1 D GLN 0.820 1 ATOM 131 C C . GLN 1018 1018 ? 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A 137.200 174.886 135.066 1 1 D LYS 0.580 1 ATOM 327 C CD . LYS 1043 1043 ? A 135.861 175.542 135.482 1 1 D LYS 0.580 1 ATOM 328 C CE . LYS 1043 1043 ? A 134.893 174.571 136.184 1 1 D LYS 0.580 1 ATOM 329 N NZ . LYS 1043 1043 ? A 134.453 173.560 135.205 1 1 D LYS 0.580 1 ATOM 330 N N . ARG 1044 1044 ? A 139.066 177.256 130.922 1 1 D ARG 0.250 1 ATOM 331 C CA . ARG 1044 1044 ? A 140.263 177.711 130.198 1 1 D ARG 0.250 1 ATOM 332 C C . ARG 1044 1044 ? A 140.033 179.127 129.702 1 1 D ARG 0.250 1 ATOM 333 O O . ARG 1044 1044 ? A 140.342 179.475 128.566 1 1 D ARG 0.250 1 ATOM 334 C CB . ARG 1044 1044 ? A 140.699 176.862 128.964 1 1 D ARG 0.250 1 ATOM 335 C CG . ARG 1044 1044 ? A 140.849 175.345 129.196 1 1 D ARG 0.250 1 ATOM 336 C CD . ARG 1044 1044 ? A 140.678 174.528 127.906 1 1 D ARG 0.250 1 ATOM 337 N NE . ARG 1044 1044 ? A 139.264 174.755 127.406 1 1 D ARG 0.250 1 ATOM 338 C CZ . ARG 1044 1044 ? A 138.158 174.140 127.850 1 1 D ARG 0.250 1 ATOM 339 N NH1 . ARG 1044 1044 ? 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