data_SMR-7054dc0d9f2200768b2bdfe30cdd6031_2
_entry.id SMR-7054dc0d9f2200768b2bdfe30cdd6031_2
_struct.entry_id SMR-7054dc0d9f2200768b2bdfe30cdd6031_2
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q0VD83/ APOBR_HUMAN, Apolipoprotein B receptor

Estimated model accuracy of this model is 0.003, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q0VD83'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_version 1.4.7
#
loop_
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_citation.title
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_citation.page_last
_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.5
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
_pdbx_data_usage.name
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
endorses you or your use. When you publish, patent or distribute
results that were fully or partially based on the model, please cite
the corresponding papers mentioned under JRNL.
ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material,
you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
'Attribution-ShareAlike 4.0 International'
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer .
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 135501.458 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP APOBR_HUMAN Q0VD83 1
;MDFLRLYLPGLHQALRGALDSLGTFVSYLLGDAVPTVEREAQAAEELGVVAVGKTGKIVEEEAQEDLEGL
RGSQNEGAGRLRGPGDDRRHEVGSSAVEQTWGWGDGSSHGSQAERQDSGAGETAKAARCQEPSAHLEARK
KSKAGSGACQDRSGQAQERQESHEQEVNREERLRSWEQEEEEEEVRAREPGMARGAESEWTWHGETEGKA
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EEARTTPGREEARAILDGEEARTISGGEEAETASGGEEAETASGGEEAGTASGGEEAGIASGGEAGTASG
GEEAGTASGGEEAGTASGGDEAWTTSGKEEADLLGVRQTEYGAVPGERLLEATGKVWVLEEEGDEEREAE
VSPFPKQPQVLGTERTEEAAESQTAGREAVGGQEAGESFEGQVDLRGKEAEMRQDLGIRADRARMEELVQ
AEEAQEERGSSRDPVAELPSDGEAEGTADLEATPEARPEEELTGEESEAAQTSCGLLGVEWGGLTHSVTK
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;
'Apolipoprotein B receptor'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1097 1 1097
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
_ma_target_ref_db_details.is_primary
1 UNP . APOBR_HUMAN Q0VD83 . 1 1097 9606 'Homo sapiens (Human)' 2019-07-03
55BADDAD96EB16E1 .
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no W
;MDFLRLYLPGLHQALRGALDSLGTFVSYLLGDAVPTVEREAQAAEELGVVAVGKTGKIVEEEAQEDLEGL
RGSQNEGAGRLRGPGDDRRHEVGSSAVEQTWGWGDGSSHGSQAERQDSGAGETAKAARCQEPSAHLEARK
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NSWSEAPLPGSLLDVSVPRSRVHLSRSSSQRRSRPSFRRTPAWEQQEEPPAPNPPEEELSAPEQRPLQLE
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;

;MDFLRLYLPGLHQALRGALDSLGTFVSYLLGDAVPTVEREAQAAEELGVVAVGKTGKIVEEEAQEDLEGL
RGSQNEGAGRLRGPGDDRRHEVGSSAVEQTWGWGDGSSHGSQAERQDSGAGETAKAARCQEPSAHLEARK
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GAVGPKAAGDNREMEQGVREADAGETEEPGAEGAGKGEEVVVVEKACESTRAWGTWGPGAEPEDWGILGR
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;

#
#
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_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 ASP .
1 3 PHE .
1 4 LEU .
1 5 ARG .
1 6 LEU .
1 7 TYR .
1 8 LEU .
1 9 PRO .
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1 15 LEU .
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1 17 GLY .
1 18 ALA .
1 19 LEU .
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1 21 SER .
1 22 LEU .
1 23 GLY .
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1 25 PHE .
1 26 VAL .
1 27 SER .
1 28 TYR .
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1 30 LEU .
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1 33 ALA .
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1 35 PRO .
1 36 THR .
1 37 VAL .
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1 39 ARG .
1 40 GLU .
1 41 ALA .
1 42 GLN .
1 43 ALA .
1 44 ALA .
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1 46 GLU .
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1 48 GLY .
1 49 VAL .
1 50 VAL .
1 51 ALA .
1 52 VAL .
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1 57 LYS .
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1 61 GLU .
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1 64 GLN .
1 65 GLU .
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1 68 GLU .
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1 72 GLY .
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1 74 GLN .
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1 76 GLU .
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1 79 GLY .
1 80 ARG .
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1 82 ARG .
1 83 GLY .
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1 87 ASP .
1 88 ARG .
1 89 ARG .
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1 127 ALA .
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1 143 LYS .
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1 148 ALA .
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1 151 ASP .
1 152 ARG .
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1 159 ARG .
1 160 GLN .
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1 163 HIS .
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1 170 GLU .
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1 174 ARG .
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1 183 GLU .
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1 978 GLY .
1 979 ALA .
1 980 ALA .
1 981 ASN .
1 982 SER .
1 983 TRP .
1 984 SER .
1 985 GLU .
1 986 ALA .
1 987 PRO .
1 988 LEU .
1 989 PRO .
1 990 GLY .
1 991 SER .
1 992 LEU .
1 993 LEU .
1 994 ASP .
1 995 VAL .
1 996 SER .
1 997 VAL .
1 998 PRO .
1 999 ARG .
1 1000 SER .
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1 1061 ASP .
1 1062 GLY .
1 1063 THR .
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1 1065 VAL .
1 1066 PRO .
1 1067 ALA .
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1 1070 ARG .
1 1071 PRO .
1 1072 LEU .
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1 1074 HIS .
1 1075 GLY .
1 1076 PHE .
1 1077 GLY .
1 1078 LEU .
1 1079 ALA .
1 1080 HIS .
1 1081 PRO .
1 1082 GLY .
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1 1084 MET .
1 1085 GLN .
1 1086 GLU .
1 1087 LEU .
1 1088 GLN .
1 1089 ALA .
1 1090 ARG .
1 1091 LEU .
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#
#
loop_
_struct_asym.id
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.details
A 1 .
#
#
loop_
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_pdbx_poly_seq_scheme.entity_id
_pdbx_poly_seq_scheme.seq_id
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_pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id
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_pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code
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A 1 4 LEU 4 ? ? ? W .
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A 1 23 GLY 23 23 GLY GLY W .
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A 1 29 LEU 29 29 LEU LEU W .
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A 1 170 GLU 170 ? ? ? W .
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A 1 180 GLU 180 ? ? ? W .
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A 1 182 GLU 182 ? ? ? W .
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_ma_data.content_type_other_details
1 'UQCRTT2 {PDB ID=8b6j, label_asym_id=W, auth_asym_id=l, SMTL ID=8b6j.1.W}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 8b6j, label_asym_id=W'
'target-template alignment' .
4 'model 2' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
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#
loop_
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#
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_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-09-03
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-08-29
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#
loop_
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1 2 'reference database'
#
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A 1 .
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1 1 'reference database' polymer 1 1 A W 12 1 l
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MAPVFLKALRYVIYSYPLYVCYLIKQAQINAQGSEKEEEHH
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1 1 3 27
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_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 8b6j 2023-04-12
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loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1097
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1097 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 260.000 36.000
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MDFLRLYLPGLHQALRGALDSLGTFVSYLLGDAVPTVEREAQAAEELGVVAVGKTGKIVEEEAQEDLEGLRGSQNEGAGRLRGPGDDRRHEVGSSAVEQTWGWGDGSSHGSQAERQDSGAGETAKAARCQEPSAHLEARKKSKAGSGACQDRSGQAQERQESHEQEVNREERLRSWEQEEEEEEVRAREPGMARGAESEWTWHGETEGKAGAVGPKAAGDNREMEQGVREADAGETEEPGAEGAGKGEEVVVVEKACESTRAWGTWGPGAEPEDWGILGREEARTTPGREEARAILDGEEARTISGGEEAETASGGEEAETASGGEEAGTASGGEEAGIASGGEAGTASGGEEAGTASGGEEAGTASGGDEAWTTSGKEEADLLGVRQTEYGAVPGERLLEATGKVWVLEEEGDEEREAEVSPFPKQPQVLGTERTEEAAESQTAGREAVGGQEAGESFEGQVDLRGKEAEMRQDLGIRADRARMEELVQAEEAQEERGSSRDPVAELPSDGEAEGTADLEATPEARPEEELTGEESEAAQTSCGLLGVEWGGLTHSVTKGQGPELMGGAQTPTKQPEEREAGEVELMGVLALSKEEQERSLEAGPRHAGSVKPEASEAFPGAWENRTRKDMERGNTQEDAADGEQREEEETAGGQTLAAEAEGDRESELSEVPEAGGEGLTTQDAGCGTEEGEASVSENQELDGSTGADAGPCPSLGEAYARETEDEEAEADRTSRRGWRLQAVAVGLPDREDAQTGSVAAGIMGGDVVPHISAAGAGEALEGVLGQGWDSKEKEEAAAGEHAGGQEFGLEGSAEEEVTGRGSQVEAFESREGGPWGGRVEAEESAGAEDSCGLDPAGSQTARAEGMGAMVEAGGLLEKWTLLEEEAVGWQEREQREDSEGRCGDYHPEGEAPRLLDAEGLMVTGGRRAEAKETEPESLEHVRGQEEQPTHQAPAEAAPESVGEAETAEAMGSARGGAANSWSEAPLPGSLLDVSVPRSRVHLSRSSSQRRSRPSFRRTPAWEQQEEPPAPNPPEEELSAPEQRPLQLEEPLEPSPLRHDGTPVPARRRPLGHGFGLAHPGMMQELQARLGRPKPQ
2 1 2
--------PVFLKALRYVIYSYPLYVCYLIKQA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8b6j.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 'model 2' 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_ma_model_group.id
_ma_model_group.name
_ma_model_group.details
1 . .
#
#
loop_
_ma_model_group_link.group_id
_ma_model_group_link.model_id
1 1
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . PRO 9 9 ? A 370.918 328.396 150.781 1 1 W PRO 0.490 1
ATOM 2 C CA . PRO 9 9 ? A 372.277 328.938 151.174 1 1 W PRO 0.490 1
ATOM 3 C C . PRO 9 9 ? A 372.895 328.166 152.314 1 1 W PRO 0.490 1
ATOM 4 O O . PRO 9 9 ? A 372.164 327.886 153.277 1 1 W PRO 0.490 1
ATOM 5 C CB . PRO 9 9 ? A 372.012 330.406 151.566 1 1 W PRO 0.490 1
ATOM 6 C CG . PRO 9 9 ? A 370.647 330.758 150.967 1 1 W PRO 0.490 1
ATOM 7 C CD . PRO 9 9 ? A 369.869 329.453 151.098 1 1 W PRO 0.490 1
ATOM 8 N N . GLY 10 10 ? A 374.214 327.864 152.269 1 1 W GLY 0.460 1
ATOM 9 C CA . GLY 10 10 ? A 374.943 327.111 153.292 1 1 W GLY 0.460 1
ATOM 10 C C . GLY 10 10 ? A 375.080 327.806 154.624 1 1 W GLY 0.460 1
ATOM 11 O O . GLY 10 10 ? A 374.945 327.191 155.674 1 1 W GLY 0.460 1
ATOM 12 N N . LEU 11 11 ? A 375.322 329.132 154.619 1 1 W LEU 0.400 1
ATOM 13 C CA . LEU 11 11 ? A 375.412 329.934 155.831 1 1 W LEU 0.400 1
ATOM 14 C C . LEU 11 11 ? A 374.108 330.041 156.614 1 1 W LEU 0.400 1
ATOM 15 O O . LEU 11 11 ? A 374.093 329.931 157.831 1 1 W LEU 0.400 1
ATOM 16 C CB . LEU 11 11 ? A 375.969 331.344 155.527 1 1 W LEU 0.400 1
ATOM 17 C CG . LEU 11 11 ? A 377.432 331.342 155.034 1 1 W LEU 0.400 1
ATOM 18 C CD1 . LEU 11 11 ? A 377.844 332.765 154.630 1 1 W LEU 0.400 1
ATOM 19 C CD2 . LEU 11 11 ? A 378.400 330.797 156.102 1 1 W LEU 0.400 1
ATOM 20 N N . HIS 12 12 ? A 372.962 330.217 155.918 1 1 W HIS 0.480 1
ATOM 21 C CA . HIS 12 12 ? A 371.644 330.226 156.542 1 1 W HIS 0.480 1
ATOM 22 C C . HIS 12 12 ? A 371.280 328.881 157.174 1 1 W HIS 0.480 1
ATOM 23 O O . HIS 12 12 ? A 370.731 328.805 158.267 1 1 W HIS 0.480 1
ATOM 24 C CB . HIS 12 12 ? A 370.549 330.627 155.527 1 1 W HIS 0.480 1
ATOM 25 C CG . HIS 12 12 ? A 369.191 330.721 156.136 1 1 W HIS 0.480 1
ATOM 26 N ND1 . HIS 12 12 ? A 368.948 331.747 157.023 1 1 W HIS 0.480 1
ATOM 27 C CD2 . HIS 12 12 ? A 368.095 329.937 156.009 1 1 W HIS 0.480 1
ATOM 28 C CE1 . HIS 12 12 ? A 367.711 331.573 157.416 1 1 W HIS 0.480 1
ATOM 29 N NE2 . HIS 12 12 ? A 367.134 330.487 156.833 1 1 W HIS 0.480 1
ATOM 30 N N . GLN 13 13 ? A 371.610 327.759 156.493 1 1 W GLN 0.430 1
ATOM 31 C CA . GLN 13 13 ? A 371.465 326.422 157.050 1 1 W GLN 0.430 1
ATOM 32 C C . GLN 13 13 ? A 372.347 326.176 158.270 1 1 W GLN 0.430 1
ATOM 33 O O . GLN 13 13 ? A 371.898 325.620 159.267 1 1 W GLN 0.430 1
ATOM 34 C CB . GLN 13 13 ? A 371.750 325.348 155.978 1 1 W GLN 0.430 1
ATOM 35 C CG . GLN 13 13 ? A 370.670 325.325 154.873 1 1 W GLN 0.430 1
ATOM 36 C CD . GLN 13 13 ? A 371.024 324.335 153.765 1 1 W GLN 0.430 1
ATOM 37 O OE1 . GLN 13 13 ? A 372.191 324.085 153.460 1 1 W GLN 0.430 1
ATOM 38 N NE2 . GLN 13 13 ? A 369.990 323.784 153.092 1 1 W GLN 0.430 1
ATOM 39 N N . ALA 14 14 ? A 373.618 326.636 158.232 1 1 W ALA 0.430 1
ATOM 40 C CA . ALA 14 14 ? A 374.523 326.610 159.366 1 1 W ALA 0.430 1
ATOM 41 C C . ALA 14 14 ? A 374.028 327.433 160.551 1 1 W ALA 0.430 1
ATOM 42 O O . ALA 14 14 ? A 374.095 326.993 161.696 1 1 W ALA 0.430 1
ATOM 43 C CB . ALA 14 14 ? A 375.919 327.113 158.940 1 1 W ALA 0.430 1
ATOM 44 N N . LEU 15 15 ? A 373.467 328.637 160.290 1 1 W LEU 0.530 1
ATOM 45 C CA . LEU 15 15 ? A 372.816 329.461 161.293 1 1 W LEU 0.530 1
ATOM 46 C C . LEU 15 15 ? A 371.627 328.764 161.926 1 1 W LEU 0.530 1
ATOM 47 O O . LEU 15 15 ? A 371.501 328.730 163.145 1 1 W LEU 0.530 1
ATOM 48 C CB . LEU 15 15 ? A 372.356 330.814 160.693 1 1 W LEU 0.530 1
ATOM 49 C CG . LEU 15 15 ? A 371.590 331.741 161.667 1 1 W LEU 0.530 1
ATOM 50 C CD1 . LEU 15 15 ? A 372.376 332.025 162.961 1 1 W LEU 0.530 1
ATOM 51 C CD2 . LEU 15 15 ? A 371.210 333.051 160.960 1 1 W LEU 0.530 1
ATOM 52 N N . ARG 16 16 ? A 370.756 328.118 161.119 1 1 W ARG 0.440 1
ATOM 53 C CA . ARG 16 16 ? A 369.669 327.312 161.646 1 1 W ARG 0.440 1
ATOM 54 C C . ARG 16 16 ? A 370.165 326.171 162.523 1 1 W ARG 0.440 1
ATOM 55 O O . ARG 16 16 ? A 369.680 325.987 163.633 1 1 W ARG 0.440 1
ATOM 56 C CB . ARG 16 16 ? A 368.777 326.756 160.505 1 1 W ARG 0.440 1
ATOM 57 C CG . ARG 16 16 ? A 367.660 325.778 160.962 1 1 W ARG 0.440 1
ATOM 58 C CD . ARG 16 16 ? A 366.766 326.230 162.126 1 1 W ARG 0.440 1
ATOM 59 N NE . ARG 16 16 ? A 366.104 327.492 161.665 1 1 W ARG 0.440 1
ATOM 60 C CZ . ARG 16 16 ? A 365.301 328.212 162.456 1 1 W ARG 0.440 1
ATOM 61 N NH1 . ARG 16 16 ? A 365.047 327.815 163.698 1 1 W ARG 0.440 1
ATOM 62 N NH2 . ARG 16 16 ? A 364.752 329.336 161.992 1 1 W ARG 0.440 1
ATOM 63 N N . GLY 17 17 ? A 371.207 325.432 162.082 1 1 W GLY 0.550 1
ATOM 64 C CA . GLY 17 17 ? A 371.782 324.368 162.898 1 1 W GLY 0.550 1
ATOM 65 C C . GLY 17 17 ? A 372.381 324.833 164.205 1 1 W GLY 0.550 1
ATOM 66 O O . GLY 17 17 ? A 372.229 324.169 165.223 1 1 W GLY 0.550 1
ATOM 67 N N . ALA 18 18 ? A 373.044 326.008 164.215 1 1 W ALA 0.550 1
ATOM 68 C CA . ALA 18 18 ? A 373.541 326.665 165.412 1 1 W ALA 0.550 1
ATOM 69 C C . ALA 18 18 ? A 372.445 327.117 166.372 1 1 W ALA 0.550 1
ATOM 70 O O . ALA 18 18 ? A 372.567 326.953 167.586 1 1 W ALA 0.550 1
ATOM 71 C CB . ALA 18 18 ? A 374.406 327.887 165.029 1 1 W ALA 0.550 1
ATOM 72 N N . LEU 19 19 ? A 371.332 327.684 165.859 1 1 W LEU 0.580 1
ATOM 73 C CA . LEU 19 19 ? A 370.171 328.058 166.656 1 1 W LEU 0.580 1
ATOM 74 C C . LEU 19 19 ? A 369.511 326.882 167.358 1 1 W LEU 0.580 1
ATOM 75 O O . LEU 19 19 ? A 369.191 326.965 168.542 1 1 W LEU 0.580 1
ATOM 76 C CB . LEU 19 19 ? A 369.093 328.760 165.788 1 1 W LEU 0.580 1
ATOM 77 C CG . LEU 19 19 ? A 369.472 330.175 165.305 1 1 W LEU 0.580 1
ATOM 78 C CD1 . LEU 19 19 ? A 368.434 330.686 164.290 1 1 W LEU 0.580 1
ATOM 79 C CD2 . LEU 19 19 ? A 369.628 331.164 166.473 1 1 W LEU 0.580 1
ATOM 80 N N . ASP 20 20 ? A 369.324 325.754 166.645 1 1 W ASP 0.560 1
ATOM 81 C CA . ASP 20 20 ? A 368.800 324.525 167.200 1 1 W ASP 0.560 1
ATOM 82 C C . ASP 20 20 ? A 369.755 323.879 168.224 1 1 W ASP 0.560 1
ATOM 83 O O . ASP 20 20 ? A 369.343 323.389 169.274 1 1 W ASP 0.560 1
ATOM 84 C CB . ASP 20 20 ? A 368.481 323.534 166.043 1 1 W ASP 0.560 1
ATOM 85 C CG . ASP 20 20 ? A 367.368 324.013 165.104 1 1 W ASP 0.560 1
ATOM 86 O OD1 . ASP 20 20 ? A 366.663 325.020 165.389 1 1 W ASP 0.560 1
ATOM 87 O OD2 . ASP 20 20 ? A 367.221 323.365 164.036 1 1 W ASP 0.560 1
ATOM 88 N N . SER 21 21 ? A 371.083 323.858 167.954 1 1 W SER 0.530 1
ATOM 89 C CA . SER 21 21 ? A 372.023 323.066 168.744 1 1 W SER 0.530 1
ATOM 90 C C . SER 21 21 ? A 372.692 323.780 169.900 1 1 W SER 0.530 1
ATOM 91 O O . SER 21 21 ? A 373.219 323.134 170.808 1 1 W SER 0.530 1
ATOM 92 C CB . SER 21 21 ? A 373.163 322.470 167.866 1 1 W SER 0.530 1
ATOM 93 O OG . SER 21 21 ? A 374.085 323.453 167.383 1 1 W SER 0.530 1
ATOM 94 N N . LEU 22 22 ? A 372.685 325.129 169.931 1 1 W LEU 0.620 1
ATOM 95 C CA . LEU 22 22 ? A 373.399 325.881 170.948 1 1 W LEU 0.620 1
ATOM 96 C C . LEU 22 22 ? A 372.904 325.638 172.366 1 1 W LEU 0.620 1
ATOM 97 O O . LEU 22 22 ? A 373.691 325.429 173.279 1 1 W LEU 0.620 1
ATOM 98 C CB . LEU 22 22 ? A 373.420 327.396 170.642 1 1 W LEU 0.620 1
ATOM 99 C CG . LEU 22 22 ? A 374.212 328.251 171.659 1 1 W LEU 0.620 1
ATOM 100 C CD1 . LEU 22 22 ? A 375.693 327.836 171.765 1 1 W LEU 0.620 1
ATOM 101 C CD2 . LEU 22 22 ? A 374.090 329.738 171.299 1 1 W LEU 0.620 1
ATOM 102 N N . GLY 23 23 ? A 371.568 325.590 172.586 1 1 W GLY 0.620 1
ATOM 103 C CA . GLY 23 23 ? A 371.013 325.298 173.911 1 1 W GLY 0.620 1
ATOM 104 C C . GLY 23 23 ? A 371.383 323.930 174.445 1 1 W GLY 0.620 1
ATOM 105 O O . GLY 23 23 ? A 371.613 323.756 175.636 1 1 W GLY 0.620 1
ATOM 106 N N . THR 24 24 ? A 371.523 322.933 173.548 1 1 W THR 0.630 1
ATOM 107 C CA . THR 24 24 ? A 372.057 321.603 173.858 1 1 W THR 0.630 1
ATOM 108 C C . THR 24 24 ? A 373.509 321.638 174.291 1 1 W THR 0.630 1
ATOM 109 O O . THR 24 24 ? A 373.897 320.983 175.257 1 1 W THR 0.630 1
ATOM 110 C CB . THR 24 24 ? A 371.920 320.619 172.702 1 1 W THR 0.630 1
ATOM 111 O OG1 . THR 24 24 ? A 370.545 320.461 172.397 1 1 W THR 0.630 1
ATOM 112 C CG2 . THR 24 24 ? A 372.444 319.216 173.059 1 1 W THR 0.630 1
ATOM 113 N N . PHE 25 25 ? A 374.357 322.443 173.609 1 1 W PHE 0.610 1
ATOM 114 C CA . PHE 25 25 ? A 375.738 322.687 174.000 1 1 W PHE 0.610 1
ATOM 115 C C . PHE 25 25 ? A 375.824 323.340 175.381 1 1 W PHE 0.610 1
ATOM 116 O O . PHE 25 25 ? A 376.603 322.909 176.226 1 1 W PHE 0.610 1
ATOM 117 C CB . PHE 25 25 ? A 376.453 323.552 172.921 1 1 W PHE 0.610 1
ATOM 118 C CG . PHE 25 25 ? A 377.914 323.759 173.228 1 1 W PHE 0.610 1
ATOM 119 C CD1 . PHE 25 25 ? A 378.358 324.980 173.761 1 1 W PHE 0.610 1
ATOM 120 C CD2 . PHE 25 25 ? A 378.848 322.733 173.013 1 1 W PHE 0.610 1
ATOM 121 C CE1 . PHE 25 25 ? A 379.715 325.188 174.030 1 1 W PHE 0.610 1
ATOM 122 C CE2 . PHE 25 25 ? A 380.201 322.924 173.323 1 1 W PHE 0.610 1
ATOM 123 C CZ . PHE 25 25 ? A 380.636 324.155 173.827 1 1 W PHE 0.610 1
ATOM 124 N N . VAL 26 26 ? A 374.968 324.347 175.671 1 1 W VAL 0.650 1
ATOM 125 C CA . VAL 26 26 ? A 374.880 324.980 176.987 1 1 W VAL 0.650 1
ATOM 126 C C . VAL 26 26 ? A 374.520 323.970 178.070 1 1 W VAL 0.650 1
ATOM 127 O O . VAL 26 26 ? A 375.165 323.909 179.113 1 1 W VAL 0.650 1
ATOM 128 C CB . VAL 26 26 ? A 373.881 326.141 177.006 1 1 W VAL 0.650 1
ATOM 129 C CG1 . VAL 26 26 ? A 373.759 326.760 178.419 1 1 W VAL 0.650 1
ATOM 130 C CG2 . VAL 26 26 ? A 374.351 327.226 176.015 1 1 W VAL 0.650 1
ATOM 131 N N . SER 27 27 ? A 373.529 323.088 177.816 1 1 W SER 0.620 1
ATOM 132 C CA . SER 27 27 ? A 373.163 321.994 178.714 1 1 W SER 0.620 1
ATOM 133 C C . SER 27 27 ? A 374.276 320.994 178.975 1 1 W SER 0.620 1
ATOM 134 O O . SER 27 27 ? A 374.459 320.551 180.105 1 1 W SER 0.620 1
ATOM 135 C CB . SER 27 27 ? A 371.942 321.186 178.217 1 1 W SER 0.620 1
ATOM 136 O OG . SER 27 27 ? A 370.779 322.012 178.225 1 1 W SER 0.620 1
ATOM 137 N N . TYR 28 28 ? A 375.066 320.631 177.938 1 1 W TYR 0.600 1
ATOM 138 C CA . TYR 28 28 ? A 376.276 319.829 178.071 1 1 W TYR 0.600 1
ATOM 139 C C . TYR 28 28 ? A 377.309 320.518 178.969 1 1 W TYR 0.600 1
ATOM 140 O O . TYR 28 28 ? A 377.802 319.919 179.918 1 1 W TYR 0.600 1
ATOM 141 C CB . TYR 28 28 ? A 376.849 319.529 176.649 1 1 W TYR 0.600 1
ATOM 142 C CG . TYR 28 28 ? A 378.149 318.764 176.677 1 1 W TYR 0.600 1
ATOM 143 C CD1 . TYR 28 28 ? A 378.175 317.365 176.800 1 1 W TYR 0.600 1
ATOM 144 C CD2 . TYR 28 28 ? A 379.366 319.464 176.632 1 1 W TYR 0.600 1
ATOM 145 C CE1 . TYR 28 28 ? A 379.401 316.675 176.815 1 1 W TYR 0.600 1
ATOM 146 C CE2 . TYR 28 28 ? A 380.584 318.778 176.667 1 1 W TYR 0.600 1
ATOM 147 C CZ . TYR 28 28 ? A 380.602 317.386 176.715 1 1 W TYR 0.600 1
ATOM 148 O OH . TYR 28 28 ? A 381.859 316.752 176.718 1 1 W TYR 0.600 1
ATOM 149 N N . LEU 29 29 ? A 377.587 321.824 178.751 1 1 W LEU 0.600 1
ATOM 150 C CA . LEU 29 29 ? A 378.501 322.592 179.586 1 1 W LEU 0.600 1
ATOM 151 C C . LEU 29 29 ? A 378.076 322.696 181.040 1 1 W LEU 0.600 1
ATOM 152 O O . LEU 29 29 ? A 378.896 322.630 181.947 1 1 W LEU 0.600 1
ATOM 153 C CB . LEU 29 29 ? A 378.673 324.043 179.081 1 1 W LEU 0.600 1
ATOM 154 C CG . LEU 29 29 ? A 379.384 324.205 177.727 1 1 W LEU 0.600 1
ATOM 155 C CD1 . LEU 29 29 ? A 379.565 325.710 177.478 1 1 W LEU 0.600 1
ATOM 156 C CD2 . LEU 29 29 ? A 380.736 323.472 177.658 1 1 W LEU 0.600 1
ATOM 157 N N . LEU 30 30 ? A 376.766 322.875 181.286 1 1 W LEU 0.610 1
ATOM 158 C CA . LEU 30 30 ? A 376.192 322.834 182.620 1 1 W LEU 0.610 1
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ATOM 163 C CD1 . LEU 30 30 ? A 372.929 324.933 182.089 1 1 W LEU 0.610 1
ATOM 164 C CD2 . LEU 30 30 ? A 375.025 325.670 183.304 1 1 W LEU 0.610 1
ATOM 165 N N . GLY 31 31 ? A 376.142 320.372 182.564 1 1 W GLY 0.650 1
ATOM 166 C CA . GLY 31 31 ? A 376.332 319.025 183.104 1 1 W GLY 0.650 1
ATOM 167 C C . GLY 31 31 ? A 377.760 318.623 183.384 1 1 W GLY 0.650 1
ATOM 168 O O . GLY 31 31 ? A 377.985 317.804 184.293 1 1 W GLY 0.650 1
ATOM 169 N N . ASP 32 32 ? A 378.737 319.127 182.616 1 1 W ASP 0.400 1
ATOM 170 C CA . ASP 32 32 ? A 380.172 319.040 182.869 1 1 W ASP 0.400 1
ATOM 171 C C . ASP 32 32 ? A 380.646 319.878 184.066 1 1 W ASP 0.400 1
ATOM 172 O O . ASP 32 32 ? A 381.627 319.515 184.732 1 1 W ASP 0.400 1
ATOM 173 C CB . ASP 32 32 ? A 380.985 319.481 181.609 1 1 W ASP 0.400 1
ATOM 174 C CG . ASP 32 32 ? A 381.177 318.384 180.568 1 1 W ASP 0.400 1
ATOM 175 O OD1 . ASP 32 32 ? A 380.794 317.216 180.819 1 1 W ASP 0.400 1
ATOM 176 O OD2 . ASP 32 32 ? A 381.789 318.711 179.512 1 1 W ASP 0.400 1
ATOM 177 N N . ALA 33 33 ? A 380.014 321.039 184.317 1 1 W ALA 0.470 1
ATOM 178 C CA . ALA 33 33 ? A 380.245 321.891 185.471 1 1 W ALA 0.470 1
ATOM 179 C C . ALA 33 33 ? A 379.732 321.365 186.849 1 1 W ALA 0.470 1
ATOM 180 O O . ALA 33 33 ? A 379.060 320.306 186.927 1 1 W ALA 0.470 1
ATOM 181 C CB . ALA 33 33 ? A 379.591 323.271 185.224 1 1 W ALA 0.470 1
ATOM 182 O OXT . ALA 33 33 ? A 380.030 322.066 187.861 1 1 W ALA 0.470 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.540
2 1 3 0.003
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 9 PRO 1 0.490
2 1 A 10 GLY 1 0.460
3 1 A 11 LEU 1 0.400
4 1 A 12 HIS 1 0.480
5 1 A 13 GLN 1 0.430
6 1 A 14 ALA 1 0.430
7 1 A 15 LEU 1 0.530
8 1 A 16 ARG 1 0.440
9 1 A 17 GLY 1 0.550
10 1 A 18 ALA 1 0.550
11 1 A 19 LEU 1 0.580
12 1 A 20 ASP 1 0.560
13 1 A 21 SER 1 0.530
14 1 A 22 LEU 1 0.620
15 1 A 23 GLY 1 0.620
16 1 A 24 THR 1 0.630
17 1 A 25 PHE 1 0.610
18 1 A 26 VAL 1 0.650
19 1 A 27 SER 1 0.620
20 1 A 28 TYR 1 0.600
21 1 A 29 LEU 1 0.600
22 1 A 30 LEU 1 0.610
23 1 A 31 GLY 1 0.650
24 1 A 32 ASP 1 0.400
25 1 A 33 ALA 1 0.470
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