data_SMR-61abf5cc9fa83b8b230c304abfba3e95_7 _entry.id SMR-61abf5cc9fa83b8b230c304abfba3e95_7 _struct.entry_id SMR-61abf5cc9fa83b8b230c304abfba3e95_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8VI56 (isoform 2)/ LRP4_MOUSE, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4 Estimated model accuracy of this model is 0.123, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8VI56 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.5 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 238888.504 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP LRP4_MOUSE Q8VI56 1 ;MRRWWGALLLGALLCAHGIASSLECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCDGDNDCGDHSDEDGCTLPT CSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNSD EQCDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEESCPSAVPSPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHC DGDDDCGDWSDESDCSSHQPCRSGEFMCDSGLCINSGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCRSG RCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCENTGSPQCASDQFLCWNGRCIGQRKLCNGINDCGDSSDESPQQNCR PRTGEENCNVNNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGRTCQDVNECAEEGYCSQGCTNTEGAFQCWC EAGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLD RILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVLLWQSLEKPRAIA LHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGS HRKAVISQGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKN RCGDNNGGCTHLCLPSGQNYTCACPTGFRKINSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLA DVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRI EVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDASSRQVIISSNLTWPNGLAI DYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGQRIYWTDWQTKSIQSADRLTGLDRE TLQENLENLMDIHVFHRQRPPVTTLCAVENGGCSHLCLRSPNPSGFSCTCPTGINLLRDGKTCSPGMNSF LIFARRIDVRMVSLDIPYFADVVVPINMTMKNTIAIGVDPLEGKVYWSDSTLHRISRASLDGSQHEDIIT TGLQTTDGLAVDAIGRKVYWTDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGENA KLERSGMDGSDRTVLINNNLGWPNGLTVDKTSSQLLWADAHTERIEVADLNGANRHTLVSPVQHPYGLTL LDSYIYWTDWQTRSIHRADKSTGSNVILVRSNLPGLMDIQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGCSHLCLPRPSG FSCACPTGIQLKGDRKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTDDHTDVHVPVPGLNNVISLDYDSVHGKVY YTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGHGLKTTDGLAVDWVARNLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSL DEPRAIAVFPRKGYLFWTDWGHIAKIERANLDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIE SADLNGKLRQVLVSHVSHPFALTNGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDGHPCSLVPGLVPPAPRATSMNEK SPVLPNTLPTTLHSSTTKTRTSLEGAGGRCSERDAQLGLCAHSNEAVPAAPGEGLHVSYAIGGLLSILLI LLVIAALMLYRHRKSKFTDPGMGNLTYSNPSYRTSTQEVKLEAAPKPAVYNQLCYKKEGGPDHSYTKEKI KIVEGIRLLAGDDAEWGDLKQLRSSRGGLLRDHVCMKTDTVSIQASSGSLDDTETEQLLQEEQSECSSVH TAATPERRGSLPDTGWKHERKLSSESQV ; 'Low-density lipoprotein receptor-related protein 4' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1848 1 1848 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . LRP4_MOUSE Q8VI56 Q8VI56-2 1 1848 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2009-06-16 D494D4B76036B93F . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no F ;MRRWWGALLLGALLCAHGIASSLECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCDGDNDCGDHSDEDGCTLPT CSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNSD EQCDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEESCPSAVPSPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHC DGDDDCGDWSDESDCSSHQPCRSGEFMCDSGLCINSGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCRSG RCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCENTGSPQCASDQFLCWNGRCIGQRKLCNGINDCGDSSDESPQQNCR PRTGEENCNVNNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGRTCQDVNECAEEGYCSQGCTNTEGAFQCWC EAGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLD RILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVLLWQSLEKPRAIA LHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGS 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SPVLPNTLPTTLHSSTTKTRTSLEGAGGRCSERDAQLGLCAHSNEAVPAAPGEGLHVSYAIGGLLSILLI LLVIAALMLYRHRKSKFTDPGMGNLTYSNPSYRTSTQEVKLEAAPKPAVYNQLCYKKEGGPDHSYTKEKI KIVEGIRLLAGDDAEWGDLKQLRSSRGGLLRDHVCMKTDTVSIQASSGSLDDTETEQLLQEEQSECSSVH TAATPERRGSLPDTGWKHERKLSSESQV ; ;MRRWWGALLLGALLCAHGIASSLECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCDGDNDCGDHSDEDGCTLPT CSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNSD EQCDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEESCPSAVPSPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHC DGDDDCGDWSDESDCSSHQPCRSGEFMCDSGLCINSGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCRSG RCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCENTGSPQCASDQFLCWNGRCIGQRKLCNGINDCGDSSDESPQQNCR PRTGEENCNVNNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGRTCQDVNECAEEGYCSQGCTNTEGAFQCWC EAGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLD RILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVLLWQSLEKPRAIA LHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGS HRKAVISQGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKN RCGDNNGGCTHLCLPSGQNYTCACPTGFRKINSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLA DVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRI EVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDASSRQVIISSNLTWPNGLAI DYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGQRIYWTDWQTKSIQSADRLTGLDRE TLQENLENLMDIHVFHRQRPPVTTLCAVENGGCSHLCLRSPNPSGFSCTCPTGINLLRDGKTCSPGMNSF LIFARRIDVRMVSLDIPYFADVVVPINMTMKNTIAIGVDPLEGKVYWSDSTLHRISRASLDGSQHEDIIT TGLQTTDGLAVDAIGRKVYWTDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGENA KLERSGMDGSDRTVLINNNLGWPNGLTVDKTSSQLLWADAHTERIEVADLNGANRHTLVSPVQHPYGLTL LDSYIYWTDWQTRSIHRADKSTGSNVILVRSNLPGLMDIQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGCSHLCLPRPSG FSCACPTGIQLKGDRKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTDDHTDVHVPVPGLNNVISLDYDSVHGKVY YTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGHGLKTTDGLAVDWVARNLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSL DEPRAIAVFPRKGYLFWTDWGHIAKIERANLDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIE SADLNGKLRQVLVSHVSHPFALTNGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDGHPCSLVPGLVPPAPRATSMNEK SPVLPNTLPTTLHSSTTKTRTSLEGAGGRCSERDAQLGLCAHSNEAVPAAPGEGLHVSYAIGGLLSILLI 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A 1 1676 SER 1676 ? ? ? F . A 1 1677 ILE 1677 ? ? ? F . A 1 1678 LEU 1678 ? ? ? F . A 1 1679 LEU 1679 ? ? ? F . A 1 1680 ILE 1680 ? ? ? F . A 1 1681 LEU 1681 ? ? ? F . A 1 1682 LEU 1682 ? ? ? F . A 1 1683 VAL 1683 ? ? ? F . A 1 1684 ILE 1684 ? ? ? F . A 1 1685 ALA 1685 ? ? ? F . A 1 1686 ALA 1686 ? ? ? F . A 1 1687 LEU 1687 ? ? ? F . A 1 1688 MET 1688 ? ? ? F . A 1 1689 LEU 1689 ? ? ? F . A 1 1690 TYR 1690 ? ? ? F . A 1 1691 ARG 1691 ? ? ? F . A 1 1692 HIS 1692 ? ? ? F . A 1 1693 ARG 1693 ? ? ? F . A 1 1694 LYS 1694 ? ? ? F . A 1 1695 SER 1695 ? ? ? F . A 1 1696 LYS 1696 ? ? ? F . A 1 1697 PHE 1697 ? ? ? F . A 1 1698 THR 1698 ? ? ? F . A 1 1699 ASP 1699 ? ? ? F . A 1 1700 PRO 1700 ? ? ? F . A 1 1701 GLY 1701 ? ? ? F . A 1 1702 MET 1702 ? ? ? F . A 1 1703 GLY 1703 ? ? ? F . A 1 1704 ASN 1704 ? ? ? F . A 1 1705 LEU 1705 ? ? ? F . A 1 1706 THR 1706 ? ? ? F . A 1 1707 TYR 1707 ? ? ? F . A 1 1708 SER 1708 ? ? ? F . A 1 1709 ASN 1709 ? ? ? F . A 1 1710 PRO 1710 ? ? ? F . A 1 1711 SER 1711 ? ? ? F . A 1 1712 TYR 1712 ? ? ? F . A 1 1713 ARG 1713 ? ? ? F . A 1 1714 THR 1714 ? ? ? F . A 1 1715 SER 1715 ? ? ? F . A 1 1716 THR 1716 ? ? ? F . A 1 1717 GLN 1717 ? ? ? F . A 1 1718 GLU 1718 ? ? ? F . A 1 1719 VAL 1719 ? ? ? F . A 1 1720 LYS 1720 ? ? ? F . A 1 1721 LEU 1721 ? ? ? F . A 1 1722 GLU 1722 ? ? ? F . A 1 1723 ALA 1723 ? ? ? F . A 1 1724 ALA 1724 ? ? ? F . A 1 1725 PRO 1725 ? ? ? F . A 1 1726 LYS 1726 ? ? ? F . A 1 1727 PRO 1727 ? ? ? F . A 1 1728 ALA 1728 ? ? ? F . A 1 1729 VAL 1729 ? ? ? F . A 1 1730 TYR 1730 ? ? ? F . A 1 1731 ASN 1731 ? ? ? F . A 1 1732 GLN 1732 ? ? ? F . A 1 1733 LEU 1733 ? ? ? F . A 1 1734 CYS 1734 ? ? ? F . A 1 1735 TYR 1735 ? ? ? F . A 1 1736 LYS 1736 ? ? ? F . A 1 1737 LYS 1737 ? ? ? F . A 1 1738 GLU 1738 ? ? ? F . A 1 1739 GLY 1739 ? ? ? F . A 1 1740 GLY 1740 ? ? ? F . A 1 1741 PRO 1741 ? ? ? F . A 1 1742 ASP 1742 ? ? ? F . A 1 1743 HIS 1743 ? ? ? F . A 1 1744 SER 1744 ? ? ? F . A 1 1745 TYR 1745 ? ? ? F . A 1 1746 THR 1746 ? ? ? F . A 1 1747 LYS 1747 ? ? ? F . A 1 1748 GLU 1748 ? ? ? F . A 1 1749 LYS 1749 ? ? ? F . A 1 1750 ILE 1750 ? ? ? F . A 1 1751 LYS 1751 ? ? ? F . A 1 1752 ILE 1752 ? ? ? F . A 1 1753 VAL 1753 ? ? ? F . A 1 1754 GLU 1754 ? ? ? F . A 1 1755 GLY 1755 ? ? ? F . A 1 1756 ILE 1756 ? ? ? F . A 1 1757 ARG 1757 ? ? ? F . A 1 1758 LEU 1758 ? ? ? F . A 1 1759 LEU 1759 ? ? ? F . A 1 1760 ALA 1760 ? ? ? F . A 1 1761 GLY 1761 ? ? ? F . A 1 1762 ASP 1762 ? ? ? F . A 1 1763 ASP 1763 ? ? ? F . A 1 1764 ALA 1764 ? ? ? F . A 1 1765 GLU 1765 ? ? ? F . A 1 1766 TRP 1766 ? ? ? F . A 1 1767 GLY 1767 ? ? ? F . A 1 1768 ASP 1768 ? ? ? F . A 1 1769 LEU 1769 ? ? ? F . A 1 1770 LYS 1770 ? ? ? F . A 1 1771 GLN 1771 ? ? ? F . A 1 1772 LEU 1772 ? ? ? F . A 1 1773 ARG 1773 ? ? ? F . A 1 1774 SER 1774 ? ? ? F . A 1 1775 SER 1775 ? ? ? F . A 1 1776 ARG 1776 ? ? ? F . A 1 1777 GLY 1777 ? ? ? F . A 1 1778 GLY 1778 ? ? ? F . A 1 1779 LEU 1779 ? ? ? F . A 1 1780 LEU 1780 ? ? ? F . A 1 1781 ARG 1781 ? ? ? F . A 1 1782 ASP 1782 ? ? ? F . A 1 1783 HIS 1783 ? ? ? F . A 1 1784 VAL 1784 ? ? ? F . A 1 1785 CYS 1785 ? ? ? F . A 1 1786 MET 1786 ? ? ? F . A 1 1787 LYS 1787 ? ? ? F . A 1 1788 THR 1788 ? ? ? F . A 1 1789 ASP 1789 ? ? ? F . A 1 1790 THR 1790 ? ? ? F . A 1 1791 VAL 1791 ? ? ? F . A 1 1792 SER 1792 ? ? ? F . A 1 1793 ILE 1793 ? ? ? F . A 1 1794 GLN 1794 ? ? ? F . A 1 1795 ALA 1795 ? ? ? F . A 1 1796 SER 1796 ? ? ? F . A 1 1797 SER 1797 ? ? ? F . A 1 1798 GLY 1798 ? ? ? F . A 1 1799 SER 1799 ? ? ? F . A 1 1800 LEU 1800 ? ? ? F . A 1 1801 ASP 1801 ? ? ? F . A 1 1802 ASP 1802 ? ? ? F . A 1 1803 THR 1803 ? ? ? F . A 1 1804 GLU 1804 ? ? ? F . A 1 1805 THR 1805 ? ? ? F . A 1 1806 GLU 1806 ? ? ? F . A 1 1807 GLN 1807 ? ? ? F . A 1 1808 LEU 1808 ? ? ? F . A 1 1809 LEU 1809 ? ? ? F . A 1 1810 GLN 1810 ? ? ? F . A 1 1811 GLU 1811 ? ? ? F . A 1 1812 GLU 1812 ? ? ? F . A 1 1813 GLN 1813 ? ? ? F . A 1 1814 SER 1814 ? ? ? F . A 1 1815 GLU 1815 ? ? ? F . A 1 1816 CYS 1816 ? ? ? F . A 1 1817 SER 1817 ? ? ? F . A 1 1818 SER 1818 ? ? ? F . A 1 1819 VAL 1819 ? ? ? F . A 1 1820 HIS 1820 ? ? ? F . A 1 1821 THR 1821 ? ? ? F . A 1 1822 ALA 1822 ? ? ? F . A 1 1823 ALA 1823 ? ? ? F . A 1 1824 THR 1824 ? ? ? F . A 1 1825 PRO 1825 ? ? ? F . A 1 1826 GLU 1826 ? ? ? F . A 1 1827 ARG 1827 ? ? ? F . A 1 1828 ARG 1828 ? ? ? F . A 1 1829 GLY 1829 ? ? ? F . A 1 1830 SER 1830 ? ? ? F . A 1 1831 LEU 1831 ? ? ? F . A 1 1832 PRO 1832 ? ? ? F . A 1 1833 ASP 1833 ? ? ? F . A 1 1834 THR 1834 ? ? ? F . A 1 1835 GLY 1835 ? ? ? F . A 1 1836 TRP 1836 ? ? ? F . A 1 1837 LYS 1837 ? ? ? F . A 1 1838 HIS 1838 ? ? ? F . A 1 1839 GLU 1839 ? ? ? F . A 1 1840 ARG 1840 ? ? ? F . A 1 1841 LYS 1841 ? ? ? F . A 1 1842 LEU 1842 ? ? ? F . A 1 1843 SER 1843 ? ? ? F . A 1 1844 SER 1844 ? ? ? F . A 1 1845 GLU 1845 ? ? ? F . A 1 1846 SER 1846 ? ? ? F . A 1 1847 GLN 1847 ? ? ? F . A 1 1848 VAL 1848 ? ? ? F . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Low-density lipoprotein receptor {PDB ID=9coo, label_asym_id=F, auth_asym_id=R, SMTL ID=9coo.1.F}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 9coo, label_asym_id=F' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-09-03 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-08-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A F 6 1 R # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;VTCKSGDFSCGGRVNRCIPQFWRCDGQVDCDNGSDEQGCPPKTCSQDEFRCHDGKCISRQFVCDSDRDCL DGSDEASCPVLTCGPASFQCNSSTCIPQLWACDNDPDCEDGSDEWPQRCRGLYVFQGDSSPCSAFEFHCL SGECIHSSWRCDGGPDCKDKSDEENCAVATCRPDEFQCSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNVTL CEGPNKFKCHSGECITLDKVCNMARDCRDWSDEPIKECGTNECLDNNGGCSHVCNDLKIGYECLCPDGFQ LVAQRRCEDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAVGSIAYLFFTNRHEVRKMTLD RSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQLDRAHGVSSYDTVISRDIQAPDGLAVDWIH SNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRENGSKPRAIVVDPVHGFMYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSL VTENIQWPNGITLDLLSGRLYWVDSKLHSISSIDVNGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIIN EAIFSANRLTGSDVNLLAENLLSPEDMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPKFT CACPDGMLLARDMRSCLTEAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRPVPDTSRLPGATPGLTTVEIV TMSHQALGDVAGRGNEKKPSSVRALSIVLPIVLLVFLCLGVFLLWKNWRLKNINSINFDNPVYQKTTEDE VHICHNQDGYSYPSRQMVSLEDDVA ; ;VTCKSGDFSCGGRVNRCIPQFWRCDGQVDCDNGSDEQGCPPKTCSQDEFRCHDGKCISRQFVCDSDRDCL DGSDEASCPVLTCGPASFQCNSSTCIPQLWACDNDPDCEDGSDEWPQRCRGLYVFQGDSSPCSAFEFHCL SGECIHSSWRCDGGPDCKDKSDEENCAVATCRPDEFQCSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNVTL CEGPNKFKCHSGECITLDKVCNMARDCRDWSDEPIKECGTNECLDNNGGCSHVCNDLKIGYECLCPDGFQ LVAQRRCEDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAVGSIAYLFFTNRHEVRKMTLD RSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQLDRAHGVSSYDTVISRDIQAPDGLAVDWIH SNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRENGSKPRAIVVDPVHGFMYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSL VTENIQWPNGITLDLLSGRLYWVDSKLHSISSIDVNGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIIN EAIFSANRLTGSDVNLLAENLLSPEDMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPKFT CACPDGMLLARDMRSCLTEAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRPVPDTSRLPGATPGLTTVEIV TMSHQALGDVAGRGNEKKPSSVRALSIVLPIVLLVFLCLGVFLLWKNWRLKNINSINFDNPVYQKTTEDE VHICHNQDGYSYPSRQMVSLEDDVA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 2 657 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 9coo 2025-03-05 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1848 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1875 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.4e-91 41.176 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRRWWGALLLGALLCAHGIASSLECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCDGDNDCGDHSDEDGCTLPTCSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQC---D--------MRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEESCPSAVPSPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHCDGDDDCGDWSDESDCSSHQPCRSGEFMCDSGLCINSGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCRSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCENTGSPQCASDQFLCWNGRCIGQRKLCNGINDCGDSSDESPQQNCRPRTGEENCNVNNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGRTCQDVNECAEEGYCSQGCTNTEGAFQCWCEAGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLDRILRANLNGSN----VEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVLLWQSLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQ--GLPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCG---DNNGGCTHLCLPSGQ------NYTCACPTGFRKINS-HACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRIEVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDASSRQVIISSNLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGQRIYWTDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRQRPPVTTLCAVENGGCSHLCLRSPNPSGFSCTCPTGINLLRDGKTCSPGMNSFLIFARRIDVRMVSLDIPYFADVVVPINMTMKNTIAIGVDPLEGKVYWSDSTLHRISRASLDGSQHEDIITTGLQTTDGLAVDAIGRKVYWTDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGENAKLERSGMDGSDRTVLINNNLGWPNGLTVDKTSSQLLWADAHTERIEVADLNGANRHTLVSPVQHPYGLTLLDSYIYWTDWQTRSIHRADKSTGSNVILVRSNLPGLMDIQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGCSHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDRKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTDDHTDVHVPVPGLNNVISLDYDSVHGKVYYTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGHGLKTTDGLAVDWVARNLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSLDEPRAIAVFPRKGYLFWTDWGHIAKIERANLDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLVSHVSHPFALTNGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDGHPCSLVPGLVPPAPRATSMNEKSPVLPNTLPTTLHSSTTKTRTSLEGAGGRCSERDAQLGLCAHSNEAVPAAPGEGLHVSYAIGGLLSILLILLVIAALMLYRHRKSKFTDPGMGNLTYSNPSYRTSTQEVKLEAAPKPAVYNQLCYKKEGGPDHSYTKEKIKIVEGIRLLAGDDAEWGDLKQLRSSRGGLLRDHVCMKTDTVSIQASSGSLDDTETEQLLQEEQSECSSVHTAATPERRGSLPDTGWKHERKLSSESQV 2 1 2 -------------------------TCKSGDFSCGG---RVNRCIPQFWRCDGQVDCDNGSDEQGCPPKTCSQDEFRCHDGKCISRQFVCDSDRDCLDGSDEASCPVLTCGPASFQCNSSTCIPQLWACDNDPDCEDGSDEWPQRCRGLYVFQGDSSPCSAFEFHCLSGECIHSSWRCDGGPDCKDKSDEENCAV----ATCRPDEFQCSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNVTLC--------------------------------------EGPNKFKCHSGECITLDKVCNMARDCRDWSDEPIKE------C-------GT----------------------------------NECLDNNGGCSHVCNDLKIGYECLCPDGFQLVA-QRRCEDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAVGSIAYLFFTNRHEVRKMTLDRSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQLDRAHGVSSYDTVISRDIQAPDGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRENGSKPRAIVVDPVHGFMYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSGRLYWVDSKLHSISSIDVNGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANRLTGSDVNLLAENLLSPEDMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPKFTCACPDGMLLARDMRSCLTE-AEAAVATQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 9coo.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 7' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ALA 26 26 ? A 415.519 259.150 298.802 1 1 F ALA 0.420 1 ATOM 2 C CA . ALA 26 26 ? A 415.395 258.122 297.722 1 1 F ALA 0.420 1 ATOM 3 C C . ALA 26 26 ? A 414.068 258.297 297.016 1 1 F ALA 0.420 1 ATOM 4 O O . ALA 26 26 ? A 413.849 259.332 296.401 1 1 F ALA 0.420 1 ATOM 5 C CB . ALA 26 26 ? A 415.601 256.703 298.311 1 1 F ALA 0.420 1 ATOM 6 N N . CYS 27 27 ? A 413.150 257.327 297.139 1 1 F CYS 0.550 1 ATOM 7 C CA . CYS 27 27 ? A 411.818 257.398 296.597 1 1 F CYS 0.550 1 ATOM 8 C C . CYS 27 27 ? A 410.863 257.932 297.633 1 1 F CYS 0.550 1 ATOM 9 O O . CYS 27 27 ? A 411.108 257.814 298.832 1 1 F CYS 0.550 1 ATOM 10 C CB . CYS 27 27 ? A 411.354 255.983 296.204 1 1 F CYS 0.550 1 ATOM 11 S SG . CYS 27 27 ? A 412.219 255.374 294.729 1 1 F CYS 0.550 1 ATOM 12 N N . GLY 28 28 ? A 409.745 258.542 297.182 1 1 F GLY 0.560 1 ATOM 13 C CA . GLY 28 28 ? A 408.573 258.754 298.022 1 1 F GLY 0.560 1 ATOM 14 C C . GLY 28 28 ? A 407.784 257.469 298.136 1 1 F GLY 0.560 1 ATOM 15 O O . GLY 28 28 ? A 408.109 256.473 297.505 1 1 F GLY 0.560 1 ATOM 16 N N . ARG 29 29 ? A 406.672 257.467 298.896 1 1 F ARG 0.440 1 ATOM 17 C CA . ARG 29 29 ? A 405.831 256.289 299.097 1 1 F ARG 0.440 1 ATOM 18 C C . ARG 29 29 ? A 405.155 255.728 297.849 1 1 F ARG 0.440 1 ATOM 19 O O . ARG 29 29 ? A 404.958 254.526 297.721 1 1 F ARG 0.440 1 ATOM 20 C CB . ARG 29 29 ? A 404.724 256.571 300.139 1 1 F ARG 0.440 1 ATOM 21 C CG . ARG 29 29 ? A 405.258 256.777 301.569 1 1 F ARG 0.440 1 ATOM 22 C CD . ARG 29 29 ? A 404.170 256.750 302.654 1 1 F ARG 0.440 1 ATOM 23 N NE . ARG 29 29 ? A 403.252 257.924 302.441 1 1 F ARG 0.440 1 ATOM 24 C CZ . ARG 29 29 ? A 403.436 259.157 302.939 1 1 F ARG 0.440 1 ATOM 25 N NH1 . ARG 29 29 ? A 404.483 259.454 303.700 1 1 F ARG 0.440 1 ATOM 26 N NH2 . ARG 29 29 ? A 402.556 260.120 302.663 1 1 F ARG 0.440 1 ATOM 27 N N . SER 30 30 ? A 404.767 256.613 296.909 1 1 F SER 0.550 1 ATOM 28 C CA . SER 30 30 ? A 404.089 256.279 295.671 1 1 F SER 0.550 1 ATOM 29 C C . SER 30 30 ? A 405.083 256.082 294.543 1 1 F SER 0.550 1 ATOM 30 O O . SER 30 30 ? A 404.710 255.801 293.403 1 1 F SER 0.550 1 ATOM 31 C CB . SER 30 30 ? A 403.123 257.427 295.257 1 1 F SER 0.550 1 ATOM 32 O OG . SER 30 30 ? A 403.788 258.694 295.249 1 1 F SER 0.550 1 ATOM 33 N N . HIS 31 31 ? A 406.390 256.195 294.844 1 1 F HIS 0.600 1 ATOM 34 C CA . HIS 31 31 ? A 407.433 256.037 293.867 1 1 F HIS 0.600 1 ATOM 35 C C . HIS 31 31 ? A 408.080 254.724 294.131 1 1 F HIS 0.600 1 ATOM 36 O O . HIS 31 31 ? A 408.686 254.468 295.165 1 1 F HIS 0.600 1 ATOM 37 C CB . HIS 31 31 ? A 408.491 257.143 293.911 1 1 F HIS 0.600 1 ATOM 38 C CG . HIS 31 31 ? A 407.920 258.481 293.602 1 1 F HIS 0.600 1 ATOM 39 N ND1 . HIS 31 31 ? A 407.894 258.896 292.290 1 1 F HIS 0.600 1 ATOM 40 C CD2 . HIS 31 31 ? A 407.407 259.442 294.413 1 1 F HIS 0.600 1 ATOM 41 C CE1 . HIS 31 31 ? A 407.373 260.102 292.323 1 1 F HIS 0.600 1 ATOM 42 N NE2 . HIS 31 31 ? A 407.059 260.484 293.583 1 1 F HIS 0.600 1 ATOM 43 N N . PHE 32 32 ? A 407.909 253.822 293.175 1 1 F PHE 0.600 1 ATOM 44 C CA . PHE 32 32 ? A 408.565 252.564 293.157 1 1 F PHE 0.600 1 ATOM 45 C C . PHE 32 32 ? A 410.071 252.760 292.926 1 1 F PHE 0.600 1 ATOM 46 O O . PHE 32 32 ? A 410.516 253.638 292.189 1 1 F PHE 0.600 1 ATOM 47 C CB . PHE 32 32 ? A 407.792 251.744 292.107 1 1 F PHE 0.600 1 ATOM 48 C CG . PHE 32 32 ? A 408.313 250.361 292.061 1 1 F PHE 0.600 1 ATOM 49 C CD1 . PHE 32 32 ? A 409.411 250.146 291.237 1 1 F PHE 0.600 1 ATOM 50 C CD2 . PHE 32 32 ? A 407.867 249.329 292.894 1 1 F PHE 0.600 1 ATOM 51 C CE1 . PHE 32 32 ? A 410.064 248.915 291.247 1 1 F PHE 0.600 1 ATOM 52 C CE2 . PHE 32 32 ? A 408.517 248.095 292.892 1 1 F PHE 0.600 1 ATOM 53 C CZ . PHE 32 32 ? A 409.609 247.882 292.070 1 1 F PHE 0.600 1 ATOM 54 N N . THR 33 33 ? A 410.892 251.934 293.598 1 1 F THR 0.590 1 ATOM 55 C CA . THR 33 33 ? A 412.333 252.045 293.611 1 1 F THR 0.590 1 ATOM 56 C C . THR 33 33 ? A 412.789 250.932 292.808 1 1 F THR 0.590 1 ATOM 57 O O . THR 33 33 ? A 412.310 249.808 292.951 1 1 F THR 0.590 1 ATOM 58 C CB . THR 33 33 ? A 413.036 251.926 294.967 1 1 F THR 0.590 1 ATOM 59 O OG1 . THR 33 33 ? A 414.452 251.995 294.866 1 1 F THR 0.590 1 ATOM 60 C CG2 . THR 33 33 ? A 412.716 250.634 295.728 1 1 F THR 0.590 1 ATOM 61 N N . CYS 34 34 ? A 413.763 251.206 291.950 1 1 F CYS 0.560 1 ATOM 62 C CA . CYS 34 34 ? A 414.509 250.136 291.408 1 1 F CYS 0.560 1 ATOM 63 C C . CYS 34 34 ? A 415.812 249.979 292.231 1 1 F CYS 0.560 1 ATOM 64 O O . CYS 34 34 ? A 416.475 250.980 292.466 1 1 F CYS 0.560 1 ATOM 65 C CB . CYS 34 34 ? A 414.536 250.352 289.898 1 1 F CYS 0.560 1 ATOM 66 S SG . CYS 34 34 ? A 414.585 248.757 289.194 1 1 F CYS 0.560 1 ATOM 67 N N . ALA 35 35 ? A 416.151 248.755 292.771 1 1 F ALA 0.520 1 ATOM 68 C CA . ALA 35 35 ? A 416.923 248.541 294.023 1 1 F ALA 0.520 1 ATOM 69 C C . ALA 35 35 ? A 418.451 248.704 293.975 1 1 F ALA 0.520 1 ATOM 70 O O . ALA 35 35 ? A 419.092 247.863 293.382 1 1 F ALA 0.520 1 ATOM 71 C CB . ALA 35 35 ? A 416.808 247.061 294.504 1 1 F ALA 0.520 1 ATOM 72 N N . VAL 36 36 ? A 419.124 249.666 294.668 1 1 F VAL 0.420 1 ATOM 73 C CA . VAL 36 36 ? A 420.526 250.019 294.463 1 1 F VAL 0.420 1 ATOM 74 C C . VAL 36 36 ? A 421.548 248.880 294.490 1 1 F VAL 0.420 1 ATOM 75 O O . VAL 36 36 ? A 422.409 248.786 293.627 1 1 F VAL 0.420 1 ATOM 76 C CB . VAL 36 36 ? A 420.961 251.151 295.414 1 1 F VAL 0.420 1 ATOM 77 C CG1 . VAL 36 36 ? A 421.016 250.709 296.897 1 1 F VAL 0.420 1 ATOM 78 C CG2 . VAL 36 36 ? A 422.242 251.858 294.902 1 1 F VAL 0.420 1 ATOM 79 N N . SER 37 37 ? A 421.432 247.947 295.453 1 1 F SER 0.270 1 ATOM 80 C CA . SER 37 37 ? A 422.325 246.813 295.652 1 1 F SER 0.270 1 ATOM 81 C C . SER 37 37 ? A 422.331 245.806 294.514 1 1 F SER 0.270 1 ATOM 82 O O . SER 37 37 ? A 423.365 245.244 294.168 1 1 F SER 0.270 1 ATOM 83 C CB . SER 37 37 ? A 421.976 246.087 296.976 1 1 F SER 0.270 1 ATOM 84 O OG . SER 37 37 ? A 421.984 247.017 298.062 1 1 F SER 0.270 1 ATOM 85 N N . ALA 38 38 ? 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A 406.219 250.343 276.240 1 1 F ASP 0.530 1 ATOM 208 N N . ASN 55 55 ? A 409.753 247.254 279.495 1 1 F ASN 0.520 1 ATOM 209 C CA . ASN 55 55 ? A 410.760 247.184 280.555 1 1 F ASN 0.520 1 ATOM 210 C C . ASN 55 55 ? A 411.552 248.507 280.706 1 1 F ASN 0.520 1 ATOM 211 O O . ASN 55 55 ? A 412.340 248.844 279.816 1 1 F ASN 0.520 1 ATOM 212 C CB . ASN 55 55 ? A 411.675 245.970 280.217 1 1 F ASN 0.520 1 ATOM 213 C CG . ASN 55 55 ? A 412.612 245.577 281.355 1 1 F ASN 0.520 1 ATOM 214 O OD1 . ASN 55 55 ? A 412.164 245.315 282.458 1 1 F ASN 0.520 1 ATOM 215 N ND2 . ASN 55 55 ? A 413.930 245.407 281.075 1 1 F ASN 0.520 1 ATOM 216 N N . ASP 56 56 ? A 411.354 249.277 281.811 1 1 F ASP 0.590 1 ATOM 217 C CA . ASP 56 56 ? A 411.936 250.594 282.021 1 1 F ASP 0.590 1 ATOM 218 C C . ASP 56 56 ? A 413.201 250.466 282.845 1 1 F ASP 0.590 1 ATOM 219 O O . ASP 56 56 ? A 414.301 250.860 282.445 1 1 F ASP 0.590 1 ATOM 220 C CB . ASP 56 56 ? A 410.923 251.613 282.658 1 1 F ASP 0.590 1 ATOM 221 C CG . ASP 56 56 ? A 410.214 251.163 283.930 1 1 F ASP 0.590 1 ATOM 222 O OD1 . ASP 56 56 ? A 410.933 251.051 284.945 1 1 F ASP 0.590 1 ATOM 223 O OD2 . ASP 56 56 ? A 408.976 251.021 283.948 1 1 F ASP 0.590 1 ATOM 224 N N . CYS 57 57 ? A 413.056 249.865 284.032 1 1 F CYS 0.580 1 ATOM 225 C CA . CYS 57 57 ? A 414.108 249.468 284.909 1 1 F CYS 0.580 1 ATOM 226 C C . CYS 57 57 ? A 414.874 248.344 284.245 1 1 F CYS 0.580 1 ATOM 227 O O . CYS 57 57 ? A 414.333 247.552 283.500 1 1 F CYS 0.580 1 ATOM 228 C CB . CYS 57 57 ? A 413.688 249.210 286.363 1 1 F CYS 0.580 1 ATOM 229 S SG . CYS 57 57 ? A 415.177 248.928 287.334 1 1 F CYS 0.580 1 ATOM 230 N N . GLY 58 58 ? A 416.215 248.302 284.426 1 1 F GLY 0.550 1 ATOM 231 C CA . GLY 58 58 ? A 417.007 247.246 283.803 1 1 F GLY 0.550 1 ATOM 232 C C . GLY 58 58 ? A 416.856 245.860 284.386 1 1 F GLY 0.550 1 ATOM 233 O O . GLY 58 58 ? A 416.964 244.893 283.643 1 1 F GLY 0.550 1 ATOM 234 N N . ASP 59 59 ? A 416.629 245.731 285.710 1 1 F ASP 0.550 1 ATOM 235 C CA . ASP 59 59 ? A 416.414 244.433 286.337 1 1 F ASP 0.550 1 ATOM 236 C C . ASP 59 59 ? A 415.630 244.649 287.603 1 1 F ASP 0.550 1 ATOM 237 O O . ASP 59 59 ? A 416.259 245.086 288.572 1 1 F ASP 0.550 1 ATOM 238 C CB . ASP 59 59 ? A 417.778 243.757 286.704 1 1 F ASP 0.550 1 ATOM 239 C CG . ASP 59 59 ? A 417.672 242.348 287.292 1 1 F ASP 0.550 1 ATOM 240 O OD1 . ASP 59 59 ? A 416.544 241.895 287.602 1 1 F ASP 0.550 1 ATOM 241 O OD2 . ASP 59 59 ? A 418.749 241.713 287.441 1 1 F ASP 0.550 1 ATOM 242 N N . HIS 60 60 ? A 414.274 244.385 287.601 1 1 F HIS 0.450 1 ATOM 243 C CA . HIS 60 60 ? A 413.433 244.448 288.785 1 1 F HIS 0.450 1 ATOM 244 C C . HIS 60 60 ? A 411.926 244.120 288.594 1 1 F HIS 0.450 1 ATOM 245 O O . HIS 60 60 ? A 411.512 243.403 287.699 1 1 F HIS 0.450 1 ATOM 246 C CB . HIS 60 60 ? A 413.572 245.860 289.325 1 1 F HIS 0.450 1 ATOM 247 C CG . HIS 60 60 ? A 413.488 246.046 290.786 1 1 F HIS 0.450 1 ATOM 248 N ND1 . HIS 60 60 ? A 414.532 246.028 291.679 1 1 F HIS 0.450 1 ATOM 249 C CD2 . HIS 60 60 ? A 412.396 246.544 291.369 1 1 F HIS 0.450 1 ATOM 250 C CE1 . HIS 60 60 ? A 414.017 246.535 292.781 1 1 F HIS 0.450 1 ATOM 251 N NE2 . HIS 60 60 ? A 412.723 246.883 292.644 1 1 F HIS 0.450 1 ATOM 252 N N . SER 61 61 ? A 411.044 244.634 289.488 1 1 F SER 0.480 1 ATOM 253 C CA . SER 61 61 ? A 409.605 244.382 289.555 1 1 F SER 0.480 1 ATOM 254 C C . SER 61 61 ? A 408.808 245.542 288.955 1 1 F SER 0.480 1 ATOM 255 O O . SER 61 61 ? A 407.711 245.819 289.409 1 1 F SER 0.480 1 ATOM 256 C CB . SER 61 61 ? A 409.221 244.099 291.058 1 1 F SER 0.480 1 ATOM 257 O OG . SER 61 61 ? A 407.891 243.651 291.313 1 1 F SER 0.480 1 ATOM 258 N N . ASP 62 62 ? A 409.336 246.281 287.933 1 1 F ASP 0.580 1 ATOM 259 C CA . ASP 62 62 ? A 408.577 247.139 287.025 1 1 F ASP 0.580 1 ATOM 260 C C . ASP 62 62 ? A 407.569 246.260 286.282 1 1 F ASP 0.580 1 ATOM 261 O O . ASP 62 62 ? A 406.383 246.274 286.594 1 1 F ASP 0.580 1 ATOM 262 C CB . ASP 62 62 ? A 409.478 248.011 286.065 1 1 F ASP 0.580 1 ATOM 263 C CG . ASP 62 62 ? A 410.609 247.274 285.364 1 1 F ASP 0.580 1 ATOM 264 O OD1 . ASP 62 62 ? A 411.162 246.337 286.001 1 1 F ASP 0.580 1 ATOM 265 O OD2 . ASP 62 62 ? A 410.981 247.686 284.241 1 1 F ASP 0.580 1 ATOM 266 N N . GLU 63 63 ? A 408.058 245.347 285.417 1 1 F GLU 0.560 1 ATOM 267 C CA . GLU 63 63 ? A 407.176 244.526 284.612 1 1 F GLU 0.560 1 ATOM 268 C C . GLU 63 63 ? A 407.068 243.092 285.057 1 1 F GLU 0.560 1 ATOM 269 O O . GLU 63 63 ? A 406.086 242.398 284.775 1 1 F GLU 0.560 1 ATOM 270 C CB . GLU 63 63 ? A 407.618 244.570 283.126 1 1 F GLU 0.560 1 ATOM 271 C CG . GLU 63 63 ? A 407.518 245.989 282.535 1 1 F GLU 0.560 1 ATOM 272 C CD . GLU 63 63 ? A 406.100 246.465 282.791 1 1 F GLU 0.560 1 ATOM 273 O OE1 . GLU 63 63 ? A 405.157 245.900 282.170 1 1 F GLU 0.560 1 ATOM 274 O OE2 . GLU 63 63 ? A 405.918 247.279 283.727 1 1 F GLU 0.560 1 ATOM 275 N N . 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A 402.389 241.521 286.946 1 1 F CYS 0.450 1 ATOM 289 C C . CYS 66 66 ? A 401.345 240.488 286.559 1 1 F CYS 0.450 1 ATOM 290 O O . CYS 66 66 ? A 401.587 239.562 285.786 1 1 F CYS 0.450 1 ATOM 291 C CB . CYS 66 66 ? A 402.380 242.654 285.897 1 1 F CYS 0.450 1 ATOM 292 S SG . CYS 66 66 ? A 403.574 243.951 286.315 1 1 F CYS 0.450 1 ATOM 293 N N . THR 67 67 ? A 400.129 240.652 287.108 1 1 F THR 0.340 1 ATOM 294 C CA . THR 67 67 ? A 398.978 239.786 286.840 1 1 F THR 0.340 1 ATOM 295 C C . THR 67 67 ? A 398.381 240.029 285.458 1 1 F THR 0.340 1 ATOM 296 O O . THR 67 67 ? A 398.095 241.161 285.079 1 1 F THR 0.340 1 ATOM 297 C CB . THR 67 67 ? A 397.885 239.911 287.899 1 1 F THR 0.340 1 ATOM 298 O OG1 . THR 67 67 ? A 398.436 239.653 289.182 1 1 F THR 0.340 1 ATOM 299 C CG2 . THR 67 67 ? A 396.735 238.904 287.723 1 1 F THR 0.340 1 ATOM 300 N N . LEU 68 68 ? A 398.205 238.944 284.665 1 1 F LEU 0.330 1 ATOM 301 C CA . LEU 68 68 ? A 397.619 238.901 283.325 1 1 F LEU 0.330 1 ATOM 302 C C . 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A 386.205 240.342 271.605 1 1 F ILE 0.560 1 ATOM 424 C CG1 . ILE 84 84 ? A 387.202 241.503 271.383 1 1 F ILE 0.560 1 ATOM 425 C CG2 . ILE 84 84 ? A 384.890 240.639 270.841 1 1 F ILE 0.560 1 ATOM 426 C CD1 . ILE 84 84 ? A 386.831 242.808 272.098 1 1 F ILE 0.560 1 ATOM 427 N N . ARG 85 85 ? A 383.780 239.157 273.259 1 1 F ARG 0.480 1 ATOM 428 C CA . ARG 85 85 ? A 382.746 238.175 273.419 1 1 F ARG 0.480 1 ATOM 429 C C . ARG 85 85 ? A 382.845 237.000 272.444 1 1 F ARG 0.480 1 ATOM 430 O O . ARG 85 85 ? A 382.813 237.157 271.232 1 1 F ARG 0.480 1 ATOM 431 C CB . ARG 85 85 ? A 381.370 238.859 273.276 1 1 F ARG 0.480 1 ATOM 432 C CG . ARG 85 85 ? A 380.198 237.961 273.701 1 1 F ARG 0.480 1 ATOM 433 C CD . ARG 85 85 ? A 378.818 238.571 273.435 1 1 F ARG 0.480 1 ATOM 434 N NE . ARG 85 85 ? A 378.601 239.705 274.372 1 1 F ARG 0.480 1 ATOM 435 C CZ . ARG 85 85 ? A 378.132 239.590 275.621 1 1 F ARG 0.480 1 ATOM 436 N NH1 . ARG 85 85 ? A 377.806 238.412 276.144 1 1 F ARG 0.480 1 ATOM 437 N NH2 . ARG 85 85 ? A 378.018 240.688 276.363 1 1 F ARG 0.480 1 ATOM 438 N N . ARG 86 86 ? A 382.906 235.764 272.981 1 1 F ARG 0.460 1 ATOM 439 C CA . ARG 86 86 ? A 383.147 234.535 272.245 1 1 F ARG 0.460 1 ATOM 440 C C . ARG 86 86 ? A 381.967 234.029 271.444 1 1 F ARG 0.460 1 ATOM 441 O O . ARG 86 86 ? A 382.015 232.962 270.844 1 1 F ARG 0.460 1 ATOM 442 C CB . ARG 86 86 ? A 383.488 233.387 273.227 1 1 F ARG 0.460 1 ATOM 443 C CG . ARG 86 86 ? A 382.320 232.874 274.101 1 1 F ARG 0.460 1 ATOM 444 C CD . ARG 86 86 ? A 382.766 231.706 274.973 1 1 F ARG 0.460 1 ATOM 445 N NE . ARG 86 86 ? A 381.551 231.248 275.724 1 1 F ARG 0.460 1 ATOM 446 C CZ . ARG 86 86 ? A 381.582 230.366 276.731 1 1 F ARG 0.460 1 ATOM 447 N NH1 . ARG 86 86 ? A 382.686 229.684 277.010 1 1 F ARG 0.460 1 ATOM 448 N NH2 . ARG 86 86 ? A 380.493 230.165 277.474 1 1 F ARG 0.460 1 ATOM 449 N N . SER 87 87 ? A 380.852 234.779 271.492 1 1 F SER 0.530 1 ATOM 450 C CA . SER 87 87 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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