data_SMR-2e71fe1d05bb3cc5753141370c1aa85a_3 _entry.id SMR-2e71fe1d05bb3cc5753141370c1aa85a_3 _struct.entry_id SMR-2e71fe1d05bb3cc5753141370c1aa85a_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - P58107/ EPIPL_HUMAN, Epiplakin Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P58107' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.5 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 647953.083 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP EPIPL_HUMAN P58107 1 ;MSGHTLPPLPVPGTNSTEQASVPRAMAATLGAGTPPRPQARSIAGVYVEASGQAQSVYAAMEQGLLPAGL GQALLEAQAATGGLVDLARGQLLPVSKALQQGLVGLELKEKLLAAERATTGYPDPYGGEKLALFQAIGKE VVDRALGQSWLEVQLATGGLVDPAQGVLVAPEPACHQGLLDRETWHKLSELEPGTGDLRFLDPNTLERLT YHQLLERCVRAPGSGLALLPLKITFRSMGGAVSAAELLEVGILDEQAVQGLREGRLAAVDVSARAEVRRY LEGTGSVAGVVLLPEGHKKSFFQAATEHLLPMGTALPLLEAQAATHTLVDPITGQRLWVDEAVRAGLVSP ELHEQLLVAEQAVTGHHDPFSGSQIPLFQAMKKGLVDRPLALRLLDAQLATGGLVCPARRLRLPLEAALR CGCLDEDTQRQLSQAGSFSDGTHGGLRYEQLLALCVTDPETGLAFLPLSGGPRGGEPQGPPFIKYSTRQA LSTATATVSVGKFRGRPVSLWELLFSEAISSEQRAMLAQQYQEGTLSVEKLAAKLSATLEQAAATARVTF SGLRDTVTPGELLKAEIIDQDLYERLEHGQATAKDVGSLASVQRYLQGTGCIAGLLLPGSQERLSIYEAR CKGLLRPGTALILLEAQAATGFIIDPKANKGHSVEEALRAAVIGPDVFAKLLSAERAVTGYTDPYTGQQI SLFQAMQKGLIVREHGIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAYRRGYFDQMLNLILLDPSDDTKGFFDP NTHENLTYLQLLERCVRDPETGLYLLPLSSTQSPLVDSATQQAFQNLLLSVKYGRFQGQRVSAWELINSE YFSEGRRRQLLRRYRQREVTLGQVAKLLEAETQRQADIMLPALRSRVTVHQLLEAGIIDQQLLDQVLAGT ISPEALLLMDGVRRYLCGLGAVGGVRLLPSGQRLSLYQAMRQKLLGPRVALALLEAQAATGTIMDPHSPE SLSVDEAVRRGVVGPELYGRLKRAEGAIAGFRDPFSGKQVSVFQAMKKGLIPWEQAARLLEAQVATGGII DPTSHHHLPMPVAIQRGYVDQEMETALSSSSETFPTPDGQGRTSYAQLLEECPRDETSGLHLLPLPESAP ALPTEEQVQRSLQAVPGAKDGTSLWDLLSSCHFTEEQRRGLLEDVQEGRTTVPQLLASVQRWVQETKLLA QARVMVPGPRGEVPAVWLLDAGIITQETLEALAQGTQSPAQVAEQPAVKACLWGTGCVAGVLLQPSGAKA SIAQAVRDGLLPTGLGQRLLEAQVASGFLVDPLNNQRLSVEDAVKVGLVGRELSEQLGQAERAAAGYPDP YSRASLSLWQAMEKGLVPQNEGLPLLQVQLATGGVVDPVHGVHLPQAAACRLGLLDTQTSQVLTAVDKDN KFFFDPSARDQVTYQQLRERCVCDSETGLLLLPLPSDTVLEVDDHTAVALRAMKVPVSTGRFKGCSVSLW DLLLSEYVGADKRRELVALCRSGRAAALRQVVSAVTTLVEAAERQPLQATFRGLRKQVSARDLFRAQLIS RKTLDELSQGTTTVKEVAEMDSVKRSLEGGNFIAGVLIQGTQERMSIPEALRRHILRPGTALVLLEAQAA TGFIIDPVENRKLTVEEAFKAGMFGKETYVKLLSAERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKDLIVREHGIRL LEAQIATGGIIDPVHSHRVPVDVAYRCGYFDEEMNRILADPSDDTKGFFDPNTHENLTYLQLLERCVEDP ETGLYLLQIIKKGENYVYINEATRHVLQSRTAKMRVGRFADQVVSFWDLLSSPYFTEDRKRELIQEYGAQ SGGLEKLLEIITTTIEETETQNQGIKVAAIRGEVTAADLFNSRVIDQKTLHTLRVGRTGGQALSTLECVK PYLEGSGCIAGVTVPSTREVMSLHEASRKELIPAAFATWLLEAQAATGFLLDPCTRQKLSVDEAVDVGLV NEELRERLLKAERAATGYRDPATGDTIPLFQAMQKQLIEKAEALRLLEVQVATGGVIDPQHHHRLPLETA YRRGCLHKDIYALISDQKHMRKRFVDPNTQEKVSYRELQERCRPQEDTGWLLFPVNKAARDSEHIDDETR RALEAEQVEITVGRFRGQKPTLWALLNSEYVTEEKKLQLVRMYRTHTRRALQTVAQLILELIEKQETSNK HLWFQGIRRQITASELLSSAIITEEMLQDLETGRSTTQELMEDDRVKRYLEGTSCIAGVLVPAKDQPGRQ EKMSIYQAMWKGVLRPGTALVLLEAQAATGFVIDPVRNLRLSVEEAVAAGVVGGEIQEKLLSAERAVTGY TDPYTGQQISLFQAMQKDLIVREHGIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAYRRGYFDEEMNRVLADPS DDTKGFFDPNTHENLTYVQLLRRCVPDPDTGLYMLQLAGRGSAVHQLSEELRCALRDARVTPGSGALQGQ SVSVWELLFYREVSEDRRQDLLSRYRAGTLTVEELGATLTSLLAQAQAQARAEAEAGSPRPDPREALRAA TMEVKVGRLRGRAVPVWDVLASGYVSRAAREELLAEFGSGTLDLPALTRRLTAIIEEAEEAPGARPQLQD AWRGPREPGPAGRGDGDSGRSQREGQGEGETQEAAAAAAAAAARRQEQTLRDATMEVQRGQFQGRPVSVW DVLFSSYLSEARRDELLAQHAAGALGLPDLVAVLTRVIEETEERLSKVSFRGLRRQVSASELHTSGILGP ETLRDLAQGTKTLQEVTEMDSVKRYLEGTSCIAGVLVPAKDQPGRQEKMSIYQAMWKGVLRPGTALVLLE AQAATGFVIDPVRNLRLSVEEAVAAGVVGGEIQEKLLSAERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKDLIVREH GIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAYQRGYFDEEMNRVLADPSDDTKGFFDPNTHENLTYVQLLRRC VPDPDTGLYMLQLAGRGSAVHQLSEELRCALRDARVTPGSGALQGQSVSVWELLFYREVSEDRRQDLLSR YRAGTLTVEELGATLTSLLAQAQAQARAEAEAGSPRPDPREALRAATMEVKVGRLRGRAVPVWDVLASGY VSRAAREELLAEFGSGTLDLPALTRRLTAIIEEAEEAPGARPQLQDAWRGPREPGPAGRGDGDSGRSQRE GQGEGETQEAAAAARRQEQTLRDATMEVQRGQFQGRPVSVWDVLFSSYLSEARRDELLAQHAAGALGLPD LVAVLTRVIEETEERLSKVSFRGLRCQVSASELHTSGILGPETLRDLAQGTKTLQEVTEMDSVKRYLEGT SCIAGVLVPAKDQPGRQEKMSIYQAMWKGVLRPGTALVLLEAQAATGFVIDPVRNLRLSVEEAVAAGVVG GEIQEKLLSAERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKDLIVREHGIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAY RRGYFDEEMNRVLADPSDDTKGFFDPNTHENLTYVQLLRRCVPDPDTGLYMLQLAGRGSAVHQLSEELRC ALRDARVTPGSGALQGQSVSVWELLFYREVSEDRRQDLLSRYRAGTLTVEELGATLTSLLAQAQAQARAE AEAGSPRPDPREALRAATMEVKVGRLRGRAVPVWDVLASGYVSRAAREELLAEFGSGTLDLPALTRRLTA IIEEAEEAPGARPQLQDAWRGPREPGPAGRGDGDSGRSQREGQGEGETQEAAAATAAARRQEQTLRDATM EVQRGQFQGRPVSVWDVLFSSYLSEARRDELLAQHAAGALGLPDLVAVLTRVIEETEERLSKVSFRGLRR QVSASELHTSGILGPETLRDLAQGTKTLQEVTEMDSVKRYLEGTSCIAGVLVPAKDQPGRQEKMSIYQAM WKGVLRPGTALVLLEAQAATGFVIDPVRNLRLSVEEAVAAGVVGGEIQEKLLSAERAVTGYTDPYTGQQI SLFQAMQKDLIVREHGIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAYRRGYFDEEMNRVLADPSDDTKGFFDP NTHENLTYVQLLRRCVPDPDTGLYMLQLAGRGSAVHQLSEELRCALRDARVTPGSGALQGQSVSVWELLF YREVSEDRRQDLLSRYRAGTLTVEELGATLTSLLAQAQAQARAEAEAGSPRPDPREALRAATMEVKVGRL RGRAVPVWDVLASGYVSRAAREELLAEFGSGTLDLPALTRRLTAIIEEAEEAPGARPQLQDAWRGPREPG PAGRGDGDSGRSQREGQGEGETQEAAAATAAARRQEQTLRDATMEVQRGQFQGRPVSVWDVLFSSYLSEA RRDELLAQHAAGALGLPDLVAVLTRVIEETEERLSKVSFRGLRRQVSASELHTSGILGPETLRDLAQGTK TLQEVTEMDSVKRYLEGTSCIAGVLVPAKDQPGHQEKMSIYQAMWKGVLRPGTALVLLEAQAATGFVIDP VRNLRLSVEEAVAAGVVGGEIQEKLLSAERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKDLIVREHGIRLLEAQIAT GGVIDPVHSHRVPVDVAYRRGYFDEEMNRVLAHPSDDTKGFFDPNTHENLTYVQLLRRCVPDPDTGLYML QLAGRGSAVHQLSEELRCALRDARVMPGSGALQGQSVSVWELLFYREVSEDRRQDLLSRYRAGTLTVEEL GATLTSLLAQAQAQARAEAEAEAGSPRPDPREALRAATMEVKVGRLRGRAVPVWDVLASGYVSGAAREEL LAEFGSGTLDLPALTRRLTAIIEEAEEAPGARPQLQDAWRGPREPGPAGRGDGDSGRSQREGQGEGETQE AAAAARRQEQTLRDATMEVQRGQFQGRPVSVWDVLFSSYLSEAHRDELLAQHAAGALGLPDLVAVLTRVI EETEERLSKVSFRGLRRQVSASELHTSGILGPETLRDLAQGTKTLQEVTEMDSVKRYLEGTSCIAGVLVP AKDQPGRQEKMSIYQAMWKGVLRPGTALVLLEAQAATGFVIDPVRNLRLSVEEAVAAGVVGGEIQEKLLS AERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKDLIVREHGIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAYRRGYFDEEM NRVLADPSDDTKGFFDPNTHENLTYLQLLQRATLDPETGLLFLSLSLQ ; Epiplakin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 5088 1 5088 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . EPIPL_HUMAN P58107 . 1 5088 9606 'Homo sapiens (Human)' 2018-03-28 ED7799C641FA8FC5 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MSGHTLPPLPVPGTNSTEQASVPRAMAATLGAGTPPRPQARSIAGVYVEASGQAQSVYAAMEQGLLPAGL GQALLEAQAATGGLVDLARGQLLPVSKALQQGLVGLELKEKLLAAERATTGYPDPYGGEKLALFQAIGKE VVDRALGQSWLEVQLATGGLVDPAQGVLVAPEPACHQGLLDRETWHKLSELEPGTGDLRFLDPNTLERLT YHQLLERCVRAPGSGLALLPLKITFRSMGGAVSAAELLEVGILDEQAVQGLREGRLAAVDVSARAEVRRY LEGTGSVAGVVLLPEGHKKSFFQAATEHLLPMGTALPLLEAQAATHTLVDPITGQRLWVDEAVRAGLVSP ELHEQLLVAEQAVTGHHDPFSGSQIPLFQAMKKGLVDRPLALRLLDAQLATGGLVCPARRLRLPLEAALR CGCLDEDTQRQLSQAGSFSDGTHGGLRYEQLLALCVTDPETGLAFLPLSGGPRGGEPQGPPFIKYSTRQA LSTATATVSVGKFRGRPVSLWELLFSEAISSEQRAMLAQQYQEGTLSVEKLAAKLSATLEQAAATARVTF SGLRDTVTPGELLKAEIIDQDLYERLEHGQATAKDVGSLASVQRYLQGTGCIAGLLLPGSQERLSIYEAR 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B 1 4998 ILE 4998 ? ? ? B . B 1 4999 VAL 4999 ? ? ? B . B 1 5000 ARG 5000 ? ? ? B . B 1 5001 GLU 5001 ? ? ? B . B 1 5002 HIS 5002 ? ? ? B . B 1 5003 GLY 5003 ? ? ? B . B 1 5004 ILE 5004 ? ? ? B . B 1 5005 ARG 5005 ? ? ? B . B 1 5006 LEU 5006 ? ? ? B . B 1 5007 LEU 5007 ? ? ? B . B 1 5008 GLU 5008 ? ? ? B . B 1 5009 ALA 5009 ? ? ? B . B 1 5010 GLN 5010 ? ? ? B . B 1 5011 ILE 5011 ? ? ? B . B 1 5012 ALA 5012 ? ? ? B . B 1 5013 THR 5013 ? ? ? B . B 1 5014 GLY 5014 ? ? ? B . B 1 5015 GLY 5015 ? ? ? B . B 1 5016 VAL 5016 ? ? ? B . B 1 5017 ILE 5017 ? ? ? B . B 1 5018 ASP 5018 ? ? ? B . B 1 5019 PRO 5019 ? ? ? B . B 1 5020 VAL 5020 ? ? ? B . B 1 5021 HIS 5021 ? ? ? B . B 1 5022 SER 5022 ? ? ? B . B 1 5023 HIS 5023 ? ? ? B . B 1 5024 ARG 5024 ? ? ? B . B 1 5025 VAL 5025 ? ? ? B . B 1 5026 PRO 5026 ? ? ? B . B 1 5027 VAL 5027 ? ? ? B . B 1 5028 ASP 5028 ? ? ? B . B 1 5029 VAL 5029 ? ? ? B . B 1 5030 ALA 5030 ? ? ? B . B 1 5031 TYR 5031 ? ? ? B . B 1 5032 ARG 5032 ? ? ? B . B 1 5033 ARG 5033 ? ? ? B . B 1 5034 GLY 5034 ? ? ? B . B 1 5035 TYR 5035 ? ? ? B . B 1 5036 PHE 5036 ? ? ? B . B 1 5037 ASP 5037 ? ? ? B . B 1 5038 GLU 5038 ? ? ? B . B 1 5039 GLU 5039 ? ? ? B . B 1 5040 MET 5040 ? ? ? B . B 1 5041 ASN 5041 ? ? ? B . B 1 5042 ARG 5042 ? ? ? B . B 1 5043 VAL 5043 ? ? ? B . B 1 5044 LEU 5044 ? ? ? B . B 1 5045 ALA 5045 ? ? ? B . B 1 5046 ASP 5046 ? ? ? B . B 1 5047 PRO 5047 ? ? ? B . B 1 5048 SER 5048 ? ? ? B . B 1 5049 ASP 5049 ? ? ? B . B 1 5050 ASP 5050 ? ? ? B . B 1 5051 THR 5051 ? ? ? B . B 1 5052 LYS 5052 ? ? ? B . B 1 5053 GLY 5053 ? ? ? B . B 1 5054 PHE 5054 ? ? ? B . B 1 5055 PHE 5055 ? ? ? B . B 1 5056 ASP 5056 ? ? ? B . B 1 5057 PRO 5057 ? ? ? B . B 1 5058 ASN 5058 ? ? ? B . B 1 5059 THR 5059 ? ? ? B . B 1 5060 HIS 5060 ? ? ? B . B 1 5061 GLU 5061 ? ? ? B . B 1 5062 ASN 5062 ? ? ? B . B 1 5063 LEU 5063 ? ? ? B . B 1 5064 THR 5064 ? ? ? B . B 1 5065 TYR 5065 ? ? ? B . B 1 5066 LEU 5066 ? ? ? B . B 1 5067 GLN 5067 ? ? ? B . B 1 5068 LEU 5068 ? ? ? B . B 1 5069 LEU 5069 ? ? ? B . B 1 5070 GLN 5070 ? ? ? B . B 1 5071 ARG 5071 ? ? ? B . B 1 5072 ALA 5072 ? ? ? B . B 1 5073 THR 5073 ? ? ? B . B 1 5074 LEU 5074 ? ? ? B . B 1 5075 ASP 5075 ? ? ? B . B 1 5076 PRO 5076 ? ? ? B . B 1 5077 GLU 5077 ? ? ? B . B 1 5078 THR 5078 ? ? ? B . B 1 5079 GLY 5079 ? ? ? B . B 1 5080 LEU 5080 ? ? ? B . B 1 5081 LEU 5081 ? ? ? B . B 1 5082 PHE 5082 ? ? ? B . B 1 5083 LEU 5083 ? ? ? B . B 1 5084 SER 5084 ? ? ? B . B 1 5085 LEU 5085 ? ? ? B . B 1 5086 SER 5086 ? ? ? B . B 1 5087 LEU 5087 ? ? ? B . B 1 5088 GLN 5088 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'subdomain of Desmoplakin Carboxy-Terminal domain (DPCT) {PDB ID=1lm7, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1lm7.1.A}' 'template structure' . 2 'subdomain of Desmoplakin Carboxy-Terminal domain (DPCT) {PDB ID=1lm7, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=1lm7.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by BLAST to 1lm7, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by BLAST to 1lm7, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 3' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-09-03 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-08-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SFQGIRQPVTVTELVDSGILRPSTVNELESGQISYDEVGERIKDFLQGSSCIAGIYNETTKQKLGIYEAM KIGLVRPGTALELLEAQAATGFIVDPVSNLRLPVEEAYKRGLVGIEFKEKLLSAERAVTGYNDPETGNII SLFQAMNKELIEKGHGIRLLEAQIATGGIIDPKESHRLPVDIAYKRGYFNEELSEILSDPSDDTKGFFDP NTEENLTYLQLKERCIKDEETGLCLLPLKEKKKQVQTS ; ;SFQGIRQPVTVTELVDSGILRPSTVNELESGQISYDEVGERIKDFLQGSSCIAGIYNETTKQKLGIYEAM KIGLVRPGTALELLEAQAATGFIVDPVSNLRLPVEEAYKRGLVGIEFKEKLLSAERAVTGYNDPETGNII SLFQAMNKELIEKGHGIRLLEAQIATGGIIDPKESHRLPVDIAYKRGYFNEELSEILSDPSDDTKGFFDP NTEENLTYLQLKERCIKDEETGLCLLPLKEKKKQVQTS ; 2 ;SFQGIRQPVTVTELVDSGILRPSTVNELESGQISYDEVGERIKDFLQGSSCIAGIYNETTKQKLGIYEAM KIGLVRPGTALELLEAQAATGFIVDPVSNLRLPVEEAYKRGLVGIEFKEKLLSAERAVTGYNDPETGNII SLFQAMNKELIEKGHGIRLLEAQIATGGIIDPKESHRLPVDIAYKRGYFNEELSEILSDPSDDTKGFFDP NTEENLTYLQLKERCIKDEETGLCLLPLKEKKKQVQTS ; ;SFQGIRQPVTVTELVDSGILRPSTVNELESGQISYDEVGERIKDFLQGSSCIAGIYNETTKQKLGIYEAM KIGLVRPGTALELLEAQAATGFIVDPVSNLRLPVEEAYKRGLVGIEFKEKLLSAERAVTGYNDPETGNII SLFQAMNKELIEKGHGIRLLEAQIATGGIIDPKESHRLPVDIAYKRGYFNEELSEILSDPSDDTKGFFDP NTEENLTYLQLKERCIKDEETGLCLLPLKEKKKQVQTS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 246 2 2 1 246 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1lm7 2024-02-14 2 PDB . 1lm7 2024-02-14 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 5088 2 2 B 1 5088 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 5088 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 5088 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 1.24e-84 62.195 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'BLAST e-value' . 1.24e-84 62.195 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSGHTLPPLPVPGTNSTEQASVPRAMAATLGAGTPPRPQARSIAGVYVEASGQAQSVYAAMEQGLLPAGLGQALLEAQAATGGLVDLARGQLLPVSKALQQGLVGLELKEKLLAAERATTGYPDPYGGEKLALFQAIGKEVVDRALGQSWLEVQLATGGLVDPAQGVLVAPEPACHQGLLDRETWHKLSELEPGTGDLRFLDPNTLERLTYHQLLERCVRAPGSGLALLPLKITFRSMGGAVSAAELLEVGILDEQAVQGLREGRLAAVDVSARAEVRRYLEGTGSVAGVVLLPEGHKKSFFQAATEHLLPMGTALPLLEAQAATHTLVDPITGQRLWVDEAVRAGLVSPELHEQLLVAEQAVTGHHDPFSGSQIPLFQAMKKGLVDRPLALRLLDAQLATGGLVCPARRLRLPLEAALRCGCLDEDTQRQLSQAGSFSDGTHGGLRYEQLLALCVTDPETGLAFLPLSGGPRGGEPQGPPFIKYSTRQALSTATATVSVGKFRGRPVSLWELLFSEAISSEQRAMLAQQYQEGTLSVEKLAAKLSATLEQAAATARVTFSGLRDTVTPGELLKAEIIDQDLYERLEHGQATAKDVGSLASVQRYLQGTGCIAGLLLPGSQERLSIYEARCKGLLRPGTALILLEAQAATGFIIDPKANKGHSVEEALRAAVIGPDVFAKLLSAERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKGLIVREHGIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAYRRGYFDQMLNLILLDPSDDTKGFFDPNTHENLTYLQLLERCVRDPETGLYLLPLSSTQSPLVDSATQQAFQNLLLSVKYGRFQGQRVSAWELINSEYFSEGRRRQLLRRYRQREVTLGQVAKLLEAETQRQADIMLPALRSRVTVHQLLEAGIIDQQLLDQVLAGTISPEALLLMDGVRRYLCGLGAVGGVRLLPSGQRLSLYQAMRQKLLGPRVALALLEAQAATGTIMDPHSPESLSVDEAVRRGVVGPELYGRLKRAEGAIAGFRDPFSGKQVSVFQAMKKGLIPWEQAARLLEAQVATGGIIDPTSHHHLPMPVAIQRGYVDQEMETALSSSSETFPTPDGQGRTSYAQLLEECPRDETSGLHLLPLPESAPALPTEEQVQRSLQAVPGAKDGTSLWDLLSSCHFTEEQRRGLLEDVQEGRTTVPQLLASVQRWVQETKLLAQARVMVPGPRGEVPAVWLLDAGIITQETLEALAQGTQSPAQVAEQPAVKACLWGTGCVAGVLLQPSGAKASIAQAVRDGLLPTGLGQRLLEAQVASGFLVDPLNNQRLSVEDAVKVGLVGRELSEQLGQAERAAAGYPDPYSRASLSLWQAMEKGLVPQNEGLPLLQVQLATGGVVDPVHGVHLPQAAACRLGLLDTQTSQVLTAVDKDNKFFFDPSARDQVTYQQLRERCVCDSETGLLLLPLPSDTVLEVDDHTAVALRAMKVPVSTGRFKGCSVSLWDLLLSEYVGADKRRELVALCRSGRAAALRQVVSAVTTLVEAAERQPLQATFRGLRKQVSARDLFRAQLISRKTLDELSQGTTTVKEVAEMDSVKRSLEGGNFIAGVLIQGTQERMSIPEALRRHILRPGTALVLLEAQAATGFIIDPVENRKLTVEEAFKAGMFGKETYVKLLSAERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKDLIVREHGIRLLEAQIATGGIIDPVHSHRVPVDVAYRCGYFDEEMNRILADPSDDTKGFFDPNTHENLTYLQLLERCVEDPETGLYLLQIIKKGENYVYINEATRHVLQSRTAKMRVGRFADQVVSFWDLLSSPYFTEDRKRELIQEYGAQSGGLEKLLEIITTTIEETETQNQGIKVAAIRGEVTAADLFNSRVIDQKTLHTLRVGRTGGQALSTLECVKPYLEGSGCIAGVTVPSTREVMSLHEASRKELIPAAFATWLLEAQAATGFLLDPCTRQKLSVDEAVDVGLVNEELRERLLKAERAATGYRDPATGDTIPLFQAMQKQLIEKAEALRLLEVQVATGGVIDPQHHHRLPLETAYRRGCLHKDIYALISDQKHMRKRFVDPNTQEKVSYRELQERCRPQEDTGWLLFPVNKAARDSEHIDDETRRALEAEQVEITVGRFRGQKPTLWALLNSEYVTEEKKLQLVRMYRTHTRRALQTVAQLILELIEKQETSNKHLWFQGIRRQITASELLSSAIITEEMLQDLETGRSTTQELMEDDRVKRYLEGTSCIAGVLVPAKDQPGRQEKMSIYQAMWKGVLRPGTALVLLEAQAATGFVIDPVRNLRLSVEEAVAAGVVGGEIQEKLLSAERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKDLIVREHGIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAYRRGYFDEEMNRVLADPSDDTKGFFDPNTHENLTYVQLLRRCVPDPDTGLYMLQLAGRGSAVHQLSEELRCALRDARVTPGSGALQGQSVSVWELLFYREVSEDRRQDLLSRYRAGTLTVEELGATLTSLLAQAQAQARAEAEAGSPRPDPREALRAATMEVKVGRLRGRAVPVWDVLASGYVSRAAREELLAEFGSGTLDLPALTRRLTAIIEEAEEAPGARPQLQDAWRGPREPGPAGRGDGDSGRSQREGQGEGETQEAAAAAAAAAARRQEQTLRDATMEVQRGQFQGRPVSVWDVLFSSYLSEARRDELLAQHAAGALGLPDLVAVLTRVIEETEERLSKVSFRGLRRQVSASELHTSGILGPETLRDLAQGTKTLQEVTEMDSVKRYLEGTSCIAGVLVPAKDQPGRQEKMSIYQAMWKGVLRPGTALVLLEAQAATGFVIDPVRNLRLSVEEAVAAGVVGGEIQEKLLSAERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKDLIVREHGIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAYQRGYFDEEMNRVLADPSDDTKGFFDPNTHENLTYVQLLRRCVPDPDTGLYMLQLAGRGSAVHQLSEELRCALRDARVTPGSGALQGQSVSVWELLFYREVSEDRRQDLLSRYRAGTLTVEELGATLTSLLAQAQAQARAEAEAGSPRPDPREALRAATMEVKVGRLRGRAVPVWDVLASGYVSRAAREELLAEFGSGTLDLPALTRRLTAIIEEAEEAPGARPQLQDAWRGPREPGPAGRGDGDSGRSQREGQGEGETQEAAAAARRQEQTLRDATMEVQRGQFQGRPVSVWDVLFSSYLSEARRDELLAQHAAGALGLPDLVAVLTRVIEETEERLSKVSFRGLRCQVSASELHTSGILGPETLRDLAQGTKTLQEVTEMDSVKRYLEGTSCIAGVLVPAKDQPGRQEKMSIYQAMWKGVLRPGTALVLLEAQAATGFVIDPVRNLRLSVEEAVAAGVVGGEIQEKLLSAERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKDLIVREHGIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAYRRGYFDEEMNRVLADPSDDTKGFFDPNTHENLTYVQLLRRCVPDPDTGLYMLQLAGRGSAVHQLSEELRCALRDARVTPGSGALQGQSVSVWELLFYREVSEDRRQDLLSRYRAGTLTVEELGATLTSLLAQAQAQARAEAEAGSPRPDPREALRAATMEVKVGRLRGRAVPVWDVLASGYVSRAAREELLAEFGSGTLDLPALTRRLTAIIEEAEEAPGARPQLQDAWRGPREPGPAGRGDGDSGRSQREGQGEGETQEAAAATAAARRQEQTLRDATMEVQRGQFQGRPVSVWDVLFSSYLSEARRDELLAQHAAGALGLPDLVAVLTRVIEETEERLSKVSFRGLRRQVSASELHTSGILGPETLRDLAQGTKTLQEVTEMDSVKRYLEGTSCIAGVLVPAKDQPGRQEKMSIYQAMWKGVLRPGTALVLLEAQAATGFVIDPVRNLRLSVEEAVAAGVVGGEIQEKLLSAERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKDLIVREHGIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAYRRGYFDEEMNRVLADPSDDTKGFFDPNTHENLTYVQLLRRCVPDPDTGLYMLQLAGRGSAVHQLSEELRCALRDARVTPGSGALQGQSVSVWELLFYREVSEDRRQDLLSRYRAGTLTVEELGATLTSLLAQAQAQARAEAEAGSPRPDPREALRAATMEVKVGRLRGRAVPVWDVLASGYVSRAAREELLAEFGSGTLDLPALTRRLTAIIEEAEEAPGARPQLQDAWRGPREPGPAGRGDGDSGRSQREGQGEGETQEAAAATAAARRQEQTLRDATMEVQRGQFQGRPVSVWDVLFSSYLSEARRDELLAQHAAGALGLPDLVAVLTRVIEETEERLSKVSFRGLRRQVSASELHTSGILGPETLRDLAQGTKTLQEVTEMDSVKRYLEGTSCIAGVLVPAKDQPGHQEKMSIYQAMWKGVLRPGTALVLLEAQAATGFVIDPVRNLRLSVEEAVAAGVVGGEIQEKLLSAERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKDLIVREHGIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAYRRGYFDEEMNRVLAHPSDDTKGFFDPNTHENLTYVQLLRRCVPDPDTGLYMLQLAGRGSAVHQLSEELRCALRDARVMPGSGALQGQSVSVWELLFYREVSEDRRQDLLSRYRAGTLTVEELGATLTSLLAQAQAQARAEAEAEAGSPRPDPREALRAATMEVKVGRLRGRAVPVWDVLASGYVSGAAREELLAEFGSGTLDLPALTRRLTAIIEEAEEAPGARPQLQDAWRGPREPGPAGRGDGDSGRSQREGQGEGETQEAAAAARRQEQTLRDATMEVQRGQFQGRPVSVWDVLFSSYLSEAHRDELLAQHAAGALGLPDLVAVLTRVIEETEERLSKVSFRGLRRQVSASELHTSGILGPETLRDLAQGTKTLQEVTEMDSVKRYLEGTSCIAGVLVPAKDQPGRQEKMSIYQAMWKGVLRPGTALVLLEAQAATGFVIDPVRNLRLSVEEAVAAGVVGGEIQEKLLSAERAVTGYTDPYTGQQISLFQAMQKDLIVR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2 1 2 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3 2 1 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EHGIRLLEAQIATGGVIDPVHSHRVPVDVAYRRGYFDEEMNRVLADPSDDTKGFFDPNTHENLTYLQLLQRATLDPETGLLFLSLSLQ 4 2 2 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---------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.110}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1lm7.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 3' 6 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 6.148 4.342 31.612 1 1 A PHE 0.640 1 ATOM 16 C CE2 . PHE 3775 3775 ? A 5.835 6.737 31.816 1 1 A PHE 0.640 1 ATOM 17 C CZ . PHE 3775 3775 ? A 5.337 5.435 31.942 1 1 A PHE 0.640 1 ATOM 18 N N . ARG 3776 3776 ? A 11.262 7.954 28.787 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 19 C CA . ARG 3776 3776 ? A 12.621 8.310 28.421 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 20 C C . ARG 3776 3776 ? A 13.566 8.119 29.593 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 21 O O . ARG 3776 3776 ? A 13.344 8.669 30.665 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 22 C CB . ARG 3776 3776 ? A 12.684 9.778 27.933 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 23 C CG . ARG 3776 3776 ? A 14.067 10.204 27.404 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 24 C CD . ARG 3776 3776 ? A 14.090 11.606 26.792 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 25 N NE . ARG 3776 3776 ? A 14.213 12.587 27.909 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 26 C CZ . ARG 3776 3776 ? A 14.175 13.915 27.752 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 27 N NH1 . ARG 3776 3776 ? A 13.872 14.491 26.596 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 28 N NH2 . ARG 3776 3776 ? A 14.439 14.679 28.800 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 29 N N . GLY 3777 3777 ? 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A 36.497 33.793 35.467 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 610 C CG . LYS 3852 3852 ? A 35.947 33.896 34.037 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 611 C CD . LYS 3852 3852 ? A 34.593 34.611 33.982 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 612 C CE . LYS 3852 3852 ? A 34.042 34.704 32.562 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 613 N NZ . LYS 3852 3852 ? A 32.718 35.357 32.596 1 1 A LYS 0.590 1 ATOM 614 N N . GLY 3853 3853 ? A 38.902 32.108 37.509 1 1 A GLY 0.640 1 ATOM 615 C CA . GLY 3853 3853 ? A 39.558 32.128 38.817 1 1 A GLY 0.640 1 ATOM 616 C C . GLY 3853 3853 ? A 38.674 32.229 40.022 1 1 A GLY 0.640 1 ATOM 617 O O . GLY 3853 3853 ? A 38.894 33.067 40.892 1 1 A GLY 0.640 1 ATOM 618 N N . VAL 3854 3854 ? A 37.664 31.366 40.143 1 1 A VAL 0.650 1 ATOM 619 C CA . VAL 3854 3854 ? A 36.792 31.291 41.314 1 1 A VAL 0.650 1 ATOM 620 C C . VAL 3854 3854 ? A 36.853 29.902 41.923 1 1 A VAL 0.650 1 ATOM 621 O O . VAL 3854 3854 ? A 36.514 29.638 43.080 1 1 A VAL 0.650 1 ATOM 622 C CB . VAL 3854 3854 ? 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A 42.575 23.221 37.463 1 1 A PRO 0.680 1 ATOM 649 C CG . PRO 3857 3857 ? A 42.996 24.688 37.456 1 1 A PRO 0.680 1 ATOM 650 C CD . PRO 3857 3857 ? A 42.674 25.143 38.880 1 1 A PRO 0.680 1 ATOM 651 N N . GLY 3858 3858 ? A 41.764 21.567 40.099 1 1 A GLY 0.680 1 ATOM 652 C CA . GLY 3858 3858 ? A 41.608 20.340 40.869 1 1 A GLY 0.680 1 ATOM 653 C C . GLY 3858 3858 ? A 40.203 19.976 41.270 1 1 A GLY 0.680 1 ATOM 654 O O . GLY 3858 3858 ? A 39.763 18.847 41.078 1 1 A GLY 0.680 1 ATOM 655 N N . THR 3859 3859 ? A 39.434 20.922 41.847 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 656 C CA . THR 3859 3859 ? A 38.066 20.610 42.260 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 657 C C . THR 3859 3859 ? A 37.103 20.738 41.115 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 658 O O . THR 3859 3859 ? A 36.037 20.139 41.140 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 659 C CB . THR 3859 3859 ? A 37.525 21.347 43.491 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 660 O OG1 . THR 3859 3859 ? A 37.368 22.758 43.350 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 661 C CG2 . THR 3859 3859 ? 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A 33.208 -3.555 37.280 1 1 A ALA 0.750 1 ATOM 1147 C CA . ALA 3925 3925 ? A 34.503 -2.998 36.934 1 1 A ALA 0.750 1 ATOM 1148 C C . ALA 3925 3925 ? A 35.446 -2.851 38.132 1 1 A ALA 0.750 1 ATOM 1149 O O . ALA 3925 3925 ? A 36.640 -3.146 38.044 1 1 A ALA 0.750 1 ATOM 1150 C CB . ALA 3925 3925 ? A 34.296 -1.669 36.186 1 1 A ALA 0.750 1 ATOM 1151 N N . MET 3926 3926 ? A 34.932 -2.449 39.305 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 1152 C CA . MET 3926 3926 ? A 35.641 -2.481 40.578 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 1153 C C . MET 3926 3926 ? A 35.990 -3.891 41.055 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 1154 O O . MET 3926 3926 ? A 37.048 -4.124 41.637 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 1155 C CB . MET 3926 3926 ? A 34.821 -1.769 41.679 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 1156 C CG . MET 3926 3926 ? A 34.595 -0.272 41.390 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 1157 S SD . MET 3926 3926 ? A 33.309 0.498 42.414 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 1158 C CE . MET 3926 3926 ? A 34.237 0.602 43.967 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 1159 N N . GLN 3927 3927 ? 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A 36.897 -7.224 36.738 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 1173 C CG . LYS 3928 3928 ? A 35.782 -8.281 36.730 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 1174 C CD . LYS 3928 3928 ? A 35.351 -8.692 35.314 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 1175 C CE . LYS 3928 3928 ? A 34.334 -9.836 35.326 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 1176 N NZ . LYS 3928 3928 ? A 34.142 -10.360 33.971 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 1177 N N . ASP 3929 3929 ? A 39.022 -5.237 38.903 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 1178 C CA . ASP 3929 3929 ? A 40.212 -4.396 38.978 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 1179 C C . ASP 3929 3929 ? A 40.509 -3.584 37.711 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 1180 O O . ASP 3929 3929 ? A 41.610 -3.563 37.165 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 1181 C CB . ASP 3929 3929 ? A 41.429 -5.209 39.503 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 1182 C CG . ASP 3929 3929 ? A 42.505 -4.331 40.128 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 1183 O OD1 . ASP 3929 3929 ? A 43.686 -4.762 40.124 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 1184 O OD2 . ASP 3929 3929 ? A 42.143 -3.253 40.670 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 1185 N N . LEU 3930 3930 ? 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B -4.222 3.893 57.738 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 3115 C CB . VAL 3932 3932 ? B -7.336 4.212 57.830 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 3116 C CG1 . VAL 3932 3932 ? B -7.538 4.462 56.323 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 3117 C CG2 . VAL 3932 3932 ? B -8.710 3.958 58.473 1 1 B VAL 0.580 1 ATOM 3118 N N . ARG 3933 3933 ? B -5.011 2.457 56.188 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 3119 C CA . ARG 3933 3933 ? B -3.816 2.466 55.367 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 3120 C C . ARG 3933 3933 ? B -3.452 3.863 54.927 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 3121 O O . ARG 3933 3933 ? B -2.289 4.238 55.033 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 3122 C CB . ARG 3933 3933 ? B -3.918 1.515 54.151 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 3123 C CG . ARG 3933 3933 ? B -3.847 0.028 54.559 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 3124 C CD . ARG 3933 3933 ? B -3.971 -0.924 53.364 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 3125 N NE . ARG 3933 3933 ? B -3.895 -2.333 53.868 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 3126 C CZ . ARG 3933 3933 ? B -4.058 -3.408 53.083 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 3127 N NH1 . ARG 3933 3933 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 4 QSQE 'Global Quaternary Structure Quality Estimate predicts the expected accuracy of the modelled interfaces.' 'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.677 2 1 3 0 3 1 4 0.110 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 3774 SER 1 0.580 2 1 A 3775 PHE 1 0.640 3 1 A 3776 ARG 1 0.650 4 1 A 3777 GLY 1 0.790 5 1 A 3778 LEU 1 0.780 6 1 A 3779 ARG 1 0.650 7 1 A 3780 ARG 1 0.640 8 1 A 3781 GLN 1 0.650 9 1 A 3782 VAL 1 0.710 10 1 A 3783 SER 1 0.690 11 1 A 3784 ALA 1 0.700 12 1 A 3785 SER 1 0.670 13 1 A 3786 GLU 1 0.690 14 1 A 3787 LEU 1 0.730 15 1 A 3788 HIS 1 0.680 16 1 A 3789 THR 1 0.670 17 1 A 3790 SER 1 0.760 18 1 A 3791 GLY 1 0.710 19 1 A 3792 ILE 1 0.740 20 1 A 3793 LEU 1 0.680 21 1 A 3794 GLY 1 0.660 22 1 A 3795 PRO 1 0.600 23 1 A 3796 GLU 1 0.560 24 1 A 3797 THR 1 0.590 25 1 A 3798 LEU 1 0.550 26 1 A 3799 ARG 1 0.440 27 1 A 3800 ASP 1 0.530 28 1 A 3801 LEU 1 0.560 29 1 A 3802 ALA 1 0.450 30 1 A 3803 GLN 1 0.480 31 1 A 3804 GLY 1 0.510 32 1 A 3805 THR 1 0.340 33 1 A 3806 LYS 1 0.370 34 1 A 3807 THR 1 0.540 35 1 A 3808 LEU 1 0.550 36 1 A 3809 GLN 1 0.570 37 1 A 3810 GLU 1 0.530 38 1 A 3811 VAL 1 0.640 39 1 A 3812 THR 1 0.670 40 1 A 3813 GLU 1 0.580 41 1 A 3814 MET 1 0.280 42 1 A 3815 ASP 1 0.380 43 1 A 3816 SER 1 0.420 44 1 A 3817 VAL 1 0.750 45 1 A 3818 LYS 1 0.750 46 1 A 3819 ARG 1 0.750 47 1 A 3820 TYR 1 0.760 48 1 A 3821 LEU 1 0.790 49 1 A 3822 GLU 1 0.790 50 1 A 3823 GLY 1 0.830 51 1 A 3824 THR 1 0.790 52 1 A 3825 SER 1 0.790 53 1 A 3826 CYS 1 0.820 54 1 A 3827 ILE 1 0.820 55 1 A 3828 ALA 1 0.840 56 1 A 3829 GLY 1 0.810 57 1 A 3830 VAL 1 0.800 58 1 A 3831 LEU 1 0.690 59 1 A 3832 VAL 1 0.610 60 1 A 3833 PRO 1 0.530 61 1 A 3834 ALA 1 0.410 62 1 A 3835 LYS 1 0.510 63 1 A 3836 ASP 1 0.500 64 1 A 3837 GLN 1 0.460 65 1 A 3838 PRO 1 0.420 66 1 A 3839 GLY 1 0.470 67 1 A 3840 ARG 1 0.320 68 1 A 3841 GLN 1 0.450 69 1 A 3842 GLU 1 0.560 70 1 A 3843 LYS 1 0.690 71 1 A 3844 MET 1 0.740 72 1 A 3845 SER 1 0.820 73 1 A 3846 ILE 1 0.820 74 1 A 3847 TYR 1 0.790 75 1 A 3848 GLN 1 0.750 76 1 A 3849 ALA 1 0.760 77 1 A 3850 MET 1 0.670 78 1 A 3851 TRP 1 0.530 79 1 A 3852 LYS 1 0.590 80 1 A 3853 GLY 1 0.640 81 1 A 3854 VAL 1 0.650 82 1 A 3855 LEU 1 0.680 83 1 A 3856 ARG 1 0.620 84 1 A 3857 PRO 1 0.680 85 1 A 3858 GLY 1 0.680 86 1 A 3859 THR 1 0.750 87 1 A 3860 ALA 1 0.820 88 1 A 3861 LEU 1 0.790 89 1 A 3862 VAL 1 0.790 90 1 A 3863 LEU 1 0.810 91 1 A 3864 LEU 1 0.830 92 1 A 3865 GLU 1 0.810 93 1 A 3866 ALA 1 0.840 94 1 A 3867 GLN 1 0.810 95 1 A 3868 ALA 1 0.830 96 1 A 3869 ALA 1 0.840 97 1 A 3870 THR 1 0.830 98 1 A 3871 GLY 1 0.800 99 1 A 3872 PHE 1 0.800 100 1 A 3873 VAL 1 0.830 101 1 A 3874 ILE 1 0.810 102 1 A 3875 ASP 1 0.770 103 1 A 3876 PRO 1 0.750 104 1 A 3877 VAL 1 0.690 105 1 A 3878 ARG 1 0.590 106 1 A 3879 ASN 1 0.660 107 1 A 3880 LEU 1 0.660 108 1 A 3881 ARG 1 0.730 109 1 A 3882 LEU 1 0.740 110 1 A 3883 SER 1 0.790 111 1 A 3884 VAL 1 0.780 112 1 A 3885 GLU 1 0.670 113 1 A 3886 GLU 1 0.650 114 1 A 3887 ALA 1 0.780 115 1 A 3888 VAL 1 0.690 116 1 A 3889 ALA 1 0.640 117 1 A 3890 ALA 1 0.660 118 1 A 3891 GLY 1 0.700 119 1 A 3892 VAL 1 0.780 120 1 A 3893 VAL 1 0.780 121 1 A 3894 GLY 1 0.720 122 1 A 3895 GLY 1 0.640 123 1 A 3896 GLU 1 0.590 124 1 A 3897 ILE 1 0.680 125 1 A 3898 GLN 1 0.690 126 1 A 3899 GLU 1 0.650 127 1 A 3900 LYS 1 0.720 128 1 A 3901 LEU 1 0.760 129 1 A 3902 LEU 1 0.710 130 1 A 3903 SER 1 0.760 131 1 A 3904 ALA 1 0.810 132 1 A 3905 GLU 1 0.800 133 1 A 3906 ARG 1 0.770 134 1 A 3907 ALA 1 0.830 135 1 A 3908 VAL 1 0.820 136 1 A 3909 THR 1 0.810 137 1 A 3910 GLY 1 0.810 138 1 A 3911 TYR 1 0.710 139 1 A 3912 THR 1 0.660 140 1 A 3913 ASP 1 0.590 141 1 A 3914 PRO 1 0.520 142 1 A 3915 TYR 1 0.480 143 1 A 3916 THR 1 0.440 144 1 A 3917 GLY 1 0.580 145 1 A 3918 GLN 1 0.610 146 1 A 3919 GLN 1 0.670 147 1 A 3920 ILE 1 0.700 148 1 A 3921 SER 1 0.800 149 1 A 3922 LEU 1 0.800 150 1 A 3923 PHE 1 0.780 151 1 A 3924 GLN 1 0.740 152 1 A 3925 ALA 1 0.750 153 1 A 3926 MET 1 0.660 154 1 A 3927 GLN 1 0.630 155 1 A 3928 LYS 1 0.610 156 1 A 3929 ASP 1 0.560 157 1 A 3930 LEU 1 0.580 158 1 A 3931 ILE 1 0.570 159 1 A 3932 VAL 1 0.580 160 1 A 3933 ARG 1 0.570 161 1 A 3934 GLU 1 0.620 162 1 A 3935 HIS 1 0.650 163 1 A 3936 GLY 1 0.760 164 1 A 3937 ILE 1 0.740 165 1 A 3938 ARG 1 0.740 166 1 A 3939 LEU 1 0.810 167 1 A 3940 LEU 1 0.810 168 1 A 3941 GLU 1 0.790 169 1 A 3942 ALA 1 0.840 170 1 A 3943 GLN 1 0.820 171 1 A 3944 ILE 1 0.810 172 1 A 3945 ALA 1 0.820 173 1 A 3946 THR 1 0.820 174 1 A 3947 GLY 1 0.810 175 1 A 3948 GLY 1 0.830 176 1 A 3949 VAL 1 0.830 177 1 A 3950 ILE 1 0.830 178 1 A 3951 ASP 1 0.820 179 1 A 3952 PRO 1 0.810 180 1 A 3953 VAL 1 0.770 181 1 A 3954 HIS 1 0.750 182 1 A 3955 SER 1 0.820 183 1 A 3956 HIS 1 0.810 184 1 A 3957 ARG 1 0.800 185 1 A 3958 VAL 1 0.820 186 1 A 3959 PRO 1 0.700 187 1 A 3960 VAL 1 0.730 188 1 A 3961 ASP 1 0.660 189 1 A 3962 VAL 1 0.700 190 1 A 3963 ALA 1 0.800 191 1 A 3964 TYR 1 0.660 192 1 A 3965 ARG 1 0.610 193 1 A 3966 ARG 1 0.630 194 1 A 3967 GLY 1 0.740 195 1 A 3968 TYR 1 0.770 196 1 A 3969 PHE 1 0.750 197 1 A 3970 ASP 1 0.670 198 1 A 3971 GLU 1 0.590 199 1 A 3972 GLU 1 0.610 200 1 A 3973 MET 1 0.680 201 1 A 3974 ASN 1 0.680 202 1 A 3975 ARG 1 0.580 203 1 A 3976 VAL 1 0.650 204 1 A 3977 LEU 1 0.630 205 1 A 3978 ALA 1 0.570 206 1 A 3979 ASP 1 0.550 207 1 A 3980 PRO 1 0.560 208 1 A 3981 SER 1 0.550 209 1 A 3982 ASP 1 0.490 210 1 A 3983 ASP 1 0.520 211 1 A 3984 THR 1 0.610 212 1 A 3985 LYS 1 0.630 213 1 A 3986 GLY 1 0.680 214 1 A 3987 PHE 1 0.710 215 1 A 3988 PHE 1 0.650 216 1 A 3989 ASP 1 0.680 217 1 A 3990 PRO 1 0.630 218 1 A 3991 ASN 1 0.560 219 1 A 3992 THR 1 0.570 220 1 A 3993 HIS 1 0.540 221 1 A 3994 GLU 1 0.550 222 1 A 3995 ASN 1 0.620 223 1 A 3996 LEU 1 0.630 224 1 A 3997 THR 1 0.740 225 1 A 3998 TYR 1 0.780 226 1 A 3999 VAL 1 0.750 227 1 A 4000 GLN 1 0.720 228 1 A 4001 LEU 1 0.740 229 1 A 4002 LEU 1 0.760 230 1 A 4003 ARG 1 0.670 231 1 A 4004 ARG 1 0.640 232 1 A 4005 CYS 1 0.740 233 1 A 4006 VAL 1 0.640 234 1 A 4007 PRO 1 0.660 235 1 A 4008 ASP 1 0.640 236 1 A 4009 PRO 1 0.530 237 1 A 4010 ASP 1 0.540 238 1 A 4011 THR 1 0.640 239 1 A 4012 GLY 1 0.670 240 1 A 4013 LEU 1 0.740 241 1 A 4014 TYR 1 0.750 242 1 A 4015 MET 1 0.770 243 1 A 4016 LEU 1 0.760 244 1 A 4017 GLN 1 0.680 245 1 A 4018 LEU 1 0.590 246 1 A 4019 ALA 1 0.580 247 1 A 4020 GLY 1 0.460 248 1 B 3774 SER 1 0.590 249 1 B 3775 PHE 1 0.640 250 1 B 3776 ARG 1 0.640 251 1 B 3777 GLY 1 0.790 252 1 B 3778 LEU 1 0.780 253 1 B 3779 ARG 1 0.650 254 1 B 3780 ARG 1 0.640 255 1 B 3781 GLN 1 0.660 256 1 B 3782 VAL 1 0.710 257 1 B 3783 SER 1 0.690 258 1 B 3784 ALA 1 0.700 259 1 B 3785 SER 1 0.670 260 1 B 3786 GLU 1 0.680 261 1 B 3787 LEU 1 0.720 262 1 B 3788 HIS 1 0.670 263 1 B 3789 THR 1 0.660 264 1 B 3790 SER 1 0.750 265 1 B 3791 GLY 1 0.710 266 1 B 3792 ILE 1 0.730 267 1 B 3793 LEU 1 0.670 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