data_SMR-3f18698e318f628a018715e40756ace2_1 _entry.id SMR-3f18698e318f628a018715e40756ace2_1 _struct.entry_id SMR-3f18698e318f628a018715e40756ace2_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-tetramer covers following UniProtKB entries: - A4V038/ A4V038_DROME, Male-specific lethal 2 - P50534/ MSL2_DROME, E3 ubiquitin-protein ligase msl-2 Estimated model accuracy of this model is 0.036, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A4V038, P50534' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.5 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 98857.548 4 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 12 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MSL2_DROME P50534 1 ;MAQTAYLKVTRIAMRSASNLSKRRVEELNSGLGELRQLLSCVVCCQLLVDPYSPKGKRCQHNVCRLCLRG KKHLFPSCTQCEGCSDFKTYEENRMMAAQLLCYKTLCVHLLHSALFGELAGMRPQVARELVPRIKLPPKT TQEFIREGSNISDTFDIFLPQPDLPFLKDMPTSLPAETPPTSAVTTPELPYDHHLNISDIEAEAAATAEQ GHFSPLPLLPTGSRMGMLSHAGQIVIATESSESGFMDQAWTDQVDLSGTVSVSKYTNSGNNFAVSYVMPT SATTKFDPQELQIGQVVQMADSTQLAVLAAVEETVETSTQLTVLSTTVEETVETSTQLEVLTSAEEPNEI SDQLANLQVEESDEALVEETVEEAEGTSIPSEVVAEHMEEDQHLDVHTSQSPTQTEMEEAVEEHVATKTQ LGHVQTELQDAESLQKDFEDAKAAAEEAKEKEKDLHAISAELQKEDSDEPTLKRKRTRTLKASQAAKIEP VPSEVKTKVQSGKGALRRIRGKDKEEKVKPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVC CKNPHKEDYVESDEDDDLEDFEMPKDVPEPMTQSEEPVVAEPRQEENSMAPPDSSAPISLVPLNNLQQSQ HPLVLVQNEKGEYQGFNIFQGSKPLDPVTVGFTIRVQLQHTDGFGSLPQYAYIMPTIDPPNPPAPSLSPP PPPAPDREVIEPPAKKFRTSRTRRGRANFSALDTVDELVSGGSRSNSAAGDRSSATDNAHSLFEEIMSGS DDL ; 'E3 ubiquitin-protein ligase msl-2' 2 1 UNP A4V038_DROME A4V038 1 ;MAQTAYLKVTRIAMRSASNLSKRRVEELNSGLGELRQLLSCVVCCQLLVDPYSPKGKRCQHNVCRLCLRG KKHLFPSCTQCEGCSDFKTYEENRMMAAQLLCYKTLCVHLLHSALFGELAGMRPQVARELVPRIKLPPKT TQEFIREGSNISDTFDIFLPQPDLPFLKDMPTSLPAETPPTSAVTTPELPYDHHLNISDIEAEAAATAEQ GHFSPLPLLPTGSRMGMLSHAGQIVIATESSESGFMDQAWTDQVDLSGTVSVSKYTNSGNNFAVSYVMPT SATTKFDPQELQIGQVVQMADSTQLAVLAAVEETVETSTQLTVLSTTVEETVETSTQLEVLTSAEEPNEI SDQLANLQVEESDEALVEETVEEAEGTSIPSEVVAEHMEEDQHLDVHTSQSPTQTEMEEAVEEHVATKTQ LGHVQTELQDAESLQKDFEDAKAAAEEAKEKEKDLHAISAELQKEDSDEPTLKRKRTRTLKASQAAKIEP VPSEVKTKVQSGKGALRRIRGKDKEEKVKPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVC CKNPHKEDYVESDEDDDLEDFEMPKDVPEPMTQSEEPVVAEPRQEENSMAPPDSSAPISLVPLNNLQQSQ HPLVLVQNEKGEYQGFNIFQGSKPLDPVTVGFTIRVQLQHTDGFGSLPQYAYIMPTIDPPNPPAPSLSPP PPPAPDREVIEPPAKKFRTSRTRRGRANFSALDTVDELVSGGSRSNSAAGDRSSATDNAHSLFEEIMSGS DDL ; 'Male-specific lethal 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 773 1 773 2 2 1 773 1 773 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . MSL2_DROME P50534 . 1 773 7227 'Drosophila melanogaster (Fruit fly)' 2005-09-27 31830142AD64F4D7 . 1 UNP . A4V038_DROME A4V038 . 1 773 7227 'Drosophila melanogaster (Fruit fly)' 2007-05-29 31830142AD64F4D7 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B,C,D ;MAQTAYLKVTRIAMRSASNLSKRRVEELNSGLGELRQLLSCVVCCQLLVDPYSPKGKRCQHNVCRLCLRG KKHLFPSCTQCEGCSDFKTYEENRMMAAQLLCYKTLCVHLLHSALFGELAGMRPQVARELVPRIKLPPKT TQEFIREGSNISDTFDIFLPQPDLPFLKDMPTSLPAETPPTSAVTTPELPYDHHLNISDIEAEAAATAEQ GHFSPLPLLPTGSRMGMLSHAGQIVIATESSESGFMDQAWTDQVDLSGTVSVSKYTNSGNNFAVSYVMPT SATTKFDPQELQIGQVVQMADSTQLAVLAAVEETVETSTQLTVLSTTVEETVETSTQLEVLTSAEEPNEI SDQLANLQVEESDEALVEETVEEAEGTSIPSEVVAEHMEEDQHLDVHTSQSPTQTEMEEAVEEHVATKTQ LGHVQTELQDAESLQKDFEDAKAAAEEAKEKEKDLHAISAELQKEDSDEPTLKRKRTRTLKASQAAKIEP VPSEVKTKVQSGKGALRRIRGKDKEEKVKPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVC CKNPHKEDYVESDEDDDLEDFEMPKDVPEPMTQSEEPVVAEPRQEENSMAPPDSSAPISLVPLNNLQQSQ 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_pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id _pdbx_entity_nonpoly.ma_model_mode 2 'ZINC ION' ZN implicit # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 GLN . 1 4 THR . 1 5 ALA . 1 6 TYR . 1 7 LEU . 1 8 LYS . 1 9 VAL . 1 10 THR . 1 11 ARG . 1 12 ILE . 1 13 ALA . 1 14 MET . 1 15 ARG . 1 16 SER . 1 17 ALA . 1 18 SER . 1 19 ASN . 1 20 LEU . 1 21 SER . 1 22 LYS . 1 23 ARG . 1 24 ARG . 1 25 VAL . 1 26 GLU . 1 27 GLU . 1 28 LEU . 1 29 ASN . 1 30 SER . 1 31 GLY . 1 32 LEU . 1 33 GLY . 1 34 GLU . 1 35 LEU . 1 36 ARG . 1 37 GLN . 1 38 LEU . 1 39 LEU . 1 40 SER . 1 41 CYS . 1 42 VAL . 1 43 VAL . 1 44 CYS . 1 45 CYS . 1 46 GLN . 1 47 LEU . 1 48 LEU . 1 49 VAL . 1 50 ASP . 1 51 PRO . 1 52 TYR . 1 53 SER . 1 54 PRO . 1 55 LYS . 1 56 GLY . 1 57 LYS . 1 58 ARG . 1 59 CYS . 1 60 GLN . 1 61 HIS . 1 62 ASN . 1 63 VAL . 1 64 CYS . 1 65 ARG . 1 66 LEU . 1 67 CYS . 1 68 LEU . 1 69 ARG . 1 70 GLY . 1 71 LYS . 1 72 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P 2 ZN 1 12 12 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'E3 ubiquitin-protein ligase msl-2 {PDB ID=4rkh, label_asym_id=A, auth_asym_id=C, SMTL ID=4rkh.1.A}' 'template structure' . 2 'E3 ubiquitin-protein ligase msl-2 {PDB ID=4rkh, label_asym_id=B, auth_asym_id=D, SMTL ID=4rkh.1.B}' 'template structure' . 3 'E3 ubiquitin-protein ligase msl-2 {PDB ID=4rkh, label_asym_id=C, auth_asym_id=E, SMTL ID=4rkh.1.C}' 'template structure' . 4 'E3 ubiquitin-protein ligase msl-2 {PDB ID=4rkh, label_asym_id=D, auth_asym_id=F, SMTL ID=4rkh.1.D}' 'template structure' . 5 'ZINC ION {PDB ID=4rkh, label_asym_id=G, auth_asym_id=C, SMTL ID=4rkh.1._.1}' 'template structure' . 6 'ZINC ION {PDB ID=4rkh, label_asym_id=H, auth_asym_id=C, SMTL ID=4rkh.1._.2}' 'template structure' . 7 'ZINC ION {PDB ID=4rkh, label_asym_id=I, auth_asym_id=C, SMTL ID=4rkh.1._.3}' 'template structure' . 8 'ZINC ION {PDB ID=4rkh, label_asym_id=J, auth_asym_id=D, SMTL ID=4rkh.1._.4}' 'template structure' . 9 'ZINC ION {PDB ID=4rkh, label_asym_id=K, auth_asym_id=D, SMTL ID=4rkh.1._.5}' 'template structure' . 10 'ZINC ION {PDB ID=4rkh, label_asym_id=L, auth_asym_id=D, SMTL ID=4rkh.1._.6}' 'template structure' . 11 'ZINC ION {PDB ID=4rkh, label_asym_id=M, auth_asym_id=E, SMTL ID=4rkh.1._.7}' 'template structure' . 12 'ZINC ION {PDB ID=4rkh, label_asym_id=N, auth_asym_id=E, SMTL ID=4rkh.1._.8}' 'template structure' . 13 'ZINC ION {PDB ID=4rkh, label_asym_id=O, auth_asym_id=E, SMTL ID=4rkh.1._.9}' 'template structure' . 14 'ZINC ION {PDB ID=4rkh, label_asym_id=P, auth_asym_id=F, SMTL ID=4rkh.1._.10}' 'template structure' . 15 'ZINC ION {PDB ID=4rkh, label_asym_id=Q, auth_asym_id=F, SMTL ID=4rkh.1._.11}' 'template structure' . 16 'ZINC ION {PDB ID=4rkh, label_asym_id=R, auth_asym_id=F, SMTL ID=4rkh.1._.12}' 'template structure' . 17 . target . 18 'ZINC ION' target . 19 'Target-template alignment by HHblits to 4rkh, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 20 'Target-template alignment by HHblits to 4rkh, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 21 'Target-template alignment by HHblits to 4rkh, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 22 'Target-template alignment by HHblits to 4rkh, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 23 'model 1' 'model coordinates' . 24 SMTL 'reference database' . 25 PDB 'reference database' . 26 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 17 2 1 24 3 1 25 4 2 26 5 3 17 6 3 18 7 3 1 8 3 2 9 3 3 10 3 4 11 3 5 12 3 6 13 3 7 14 3 8 15 3 9 16 3 10 17 3 11 18 3 12 19 3 13 20 3 14 21 3 15 22 3 16 23 3 19 24 3 20 25 3 21 26 3 22 27 4 1 28 4 2 29 4 3 30 4 4 31 4 5 32 4 6 33 4 7 34 4 8 35 4 9 36 4 10 37 4 11 38 4 12 39 4 13 40 4 14 41 4 15 42 4 16 43 4 19 44 4 20 45 4 21 46 4 22 47 4 18 48 5 23 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 24 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-09-10 25 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-09-05 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 17 'reference database' 2 18 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . C 1 . D 1 . E 2 . F 2 . G 2 . H 2 . I 2 . J 2 . K 2 . L 2 . M 2 . N 2 . O 2 . P 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 C 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 D 3 3 'reference database' polymer 1 3 C C 1 1 E 4 4 'reference database' polymer 1 4 D D 1 1 F 5 5 'reference database' non-polymer 1 5 E G 4 1 C 6 6 'reference database' non-polymer 1 6 F H 4 1 C 7 7 'reference database' non-polymer 1 7 G I 4 1 C 8 8 'reference database' non-polymer 1 8 H J 4 1 D 9 9 'reference database' non-polymer 1 9 I K 4 1 D 10 10 'reference database' non-polymer 1 10 J L 4 1 D 11 11 'reference database' non-polymer 1 11 K M 4 1 E 12 12 'reference database' non-polymer 1 12 L N 4 1 E 13 13 'reference database' non-polymer 1 13 M O 4 1 E 14 14 'reference database' non-polymer 1 14 N P 4 1 F 15 15 'reference database' non-polymer 1 15 O Q 4 1 F 16 16 'reference database' non-polymer 1 16 P R 4 1 F # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 SPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVGCKNPHKEDYV SPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVGCKNPHKEDYV 2 SPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVGCKNPHKEDYV SPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVGCKNPHKEDYV 3 SPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVGCKNPHKEDYV SPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVGCKNPHKEDYV 4 SPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVGCKNPHKEDYV SPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVGCKNPHKEDYV # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 2 52 2 2 2 52 3 3 2 52 4 4 2 52 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 5 ZN 'ZINC ION' 6 ZN 'ZINC ION' 7 ZN 'ZINC ION' 8 ZN 'ZINC ION' 9 ZN 'ZINC ION' 10 ZN 'ZINC ION' 11 ZN 'ZINC ION' 12 ZN 'ZINC ION' 13 ZN 'ZINC ION' 14 ZN 'ZINC ION' 15 ZN 'ZINC ION' 16 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4rkh 2024-03-20 2 PDB . 4rkh 2024-03-20 3 PDB . 4rkh 2024-03-20 4 PDB . 4rkh 2024-03-20 5 PDB . 4rkh 2024-03-20 6 PDB . 4rkh 2024-03-20 7 PDB . 4rkh 2024-03-20 8 PDB . 4rkh 2024-03-20 9 PDB . 4rkh 2024-03-20 10 PDB . 4rkh 2024-03-20 11 PDB . 4rkh 2024-03-20 12 PDB . 4rkh 2024-03-20 13 PDB . 4rkh 2024-03-20 14 PDB . 4rkh 2024-03-20 15 PDB . 4rkh 2024-03-20 16 PDB . 4rkh 2024-03-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 773 2 2 B 1 773 3 3 C 1 773 4 4 D 1 773 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 19 1 773 'target-template pairwise alignment' local 2 20 1 773 'target-template pairwise alignment' local 3 21 1 773 'target-template pairwise alignment' local 4 22 1 773 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.2e-20 98.039 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 2.2e-20 98.039 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 3 3 3 C 'HHblits e-value' . 2.2e-20 98.039 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 4 4 4 D 'HHblits e-value' . 2.2e-20 98.039 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAQTAYLKVTRIAMRSASNLSKRRVEELNSGLGELRQLLSCVVCCQLLVDPYSPKGKRCQHNVCRLCLRGKKHLFPSCTQCEGCSDFKTYEENRMMAAQLLCYKTLCVHLLHSALFGELAGMRPQVARELVPRIKLPPKTTQEFIREGSNISDTFDIFLPQPDLPFLKDMPTSLPAETPPTSAVTTPELPYDHHLNISDIEAEAAATAEQGHFSPLPLLPTGSRMGMLSHAGQIVIATESSESGFMDQAWTDQVDLSGTVSVSKYTNSGNNFAVSYVMPTSATTKFDPQELQIGQVVQMADSTQLAVLAAVEETVETSTQLTVLSTTVEETVETSTQLEVLTSAEEPNEISDQLANLQVEESDEALVEETVEEAEGTSIPSEVVAEHMEEDQHLDVHTSQSPTQTEMEEAVEEHVATKTQLGHVQTELQDAESLQKDFEDAKAAAEEAKEKEKDLHAISAELQKEDSDEPTLKRKRTRTLKASQAAKIEPVPSEVKTKVQSGKGALRRIRGKDKEEKVKPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVCCKNPHKEDYVESDEDDDLEDFEMPKDVPEPMTQSEEPVVAEPRQEENSMAPPDSSAPISLVPLNNLQQSQHPLVLVQNEKGEYQGFNIFQGSKPLDPVTVGFTIRVQLQHTDGFGSLPQYAYIMPTIDPPNPPAPSLSPPPPPAPDREVIEPPAKKFRTSRTRRGRANFSALDTVDELVSGGSRSNSAAGDRSSATDNAHSLFEEIMSGSDDL 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVGCKNPHKEDYV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MAQTAYLKVTRIAMRSASNLSKRRVEELNSGLGELRQLLSCVVCCQLLVDPYSPKGKRCQHNVCRLCLRGKKHLFPSCTQCEGCSDFKTYEENRMMAAQLLCYKTLCVHLLHSALFGELAGMRPQVARELVPRIKLPPKTTQEFIREGSNISDTFDIFLPQPDLPFLKDMPTSLPAETPPTSAVTTPELPYDHHLNISDIEAEAAATAEQGHFSPLPLLPTGSRMGMLSHAGQIVIATESSESGFMDQAWTDQVDLSGTVSVSKYTNSGNNFAVSYVMPTSATTKFDPQELQIGQVVQMADSTQLAVLAAVEETVETSTQLTVLSTTVEETVETSTQLEVLTSAEEPNEISDQLANLQVEESDEALVEETVEEAEGTSIPSEVVAEHMEEDQHLDVHTSQSPTQTEMEEAVEEHVATKTQLGHVQTELQDAESLQKDFEDAKAAAEEAKEKEKDLHAISAELQKEDSDEPTLKRKRTRTLKASQAAKIEPVPSEVKTKVQSGKGALRRIRGKDKEEKVKPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVCCKNPHKEDYVESDEDDDLEDFEMPKDVPEPMTQSEEPVVAEPRQEENSMAPPDSSAPISLVPLNNLQQSQHPLVLVQNEKGEYQGFNIFQGSKPLDPVTVGFTIRVQLQHTDGFGSLPQYAYIMPTIDPPNPPAPSLSPPPPPAPDREVIEPPAKKFRTSRTRRGRANFSALDTVDELVSGGSRSNSAAGDRSSATDNAHSLFEEIMSGSDDL 4 2 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVGCKNPHKEDYV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 5 3 1 MAQTAYLKVTRIAMRSASNLSKRRVEELNSGLGELRQLLSCVVCCQLLVDPYSPKGKRCQHNVCRLCLRGKKHLFPSCTQCEGCSDFKTYEENRMMAAQLLCYKTLCVHLLHSALFGELAGMRPQVARELVPRIKLPPKTTQEFIREGSNISDTFDIFLPQPDLPFLKDMPTSLPAETPPTSAVTTPELPYDHHLNISDIEAEAAATAEQGHFSPLPLLPTGSRMGMLSHAGQIVIATESSESGFMDQAWTDQVDLSGTVSVSKYTNSGNNFAVSYVMPTSATTKFDPQELQIGQVVQMADSTQLAVLAAVEETVETSTQLTVLSTTVEETVETSTQLEVLTSAEEPNEISDQLANLQVEESDEALVEETVEEAEGTSIPSEVVAEHMEEDQHLDVHTSQSPTQTEMEEAVEEHVATKTQLGHVQTELQDAESLQKDFEDAKAAAEEAKEKEKDLHAISAELQKEDSDEPTLKRKRTRTLKASQAAKIEPVPSEVKTKVQSGKGALRRIRGKDKEEKVKPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVCCKNPHKEDYVESDEDDDLEDFEMPKDVPEPMTQSEEPVVAEPRQEENSMAPPDSSAPISLVPLNNLQQSQHPLVLVQNEKGEYQGFNIFQGSKPLDPVTVGFTIRVQLQHTDGFGSLPQYAYIMPTIDPPNPPAPSLSPPPPPAPDREVIEPPAKKFRTSRTRRGRANFSALDTVDELVSGGSRSNSAAGDRSSATDNAHSLFEEIMSGSDDL 6 3 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVGCKNPHKEDYV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 7 4 1 MAQTAYLKVTRIAMRSASNLSKRRVEELNSGLGELRQLLSCVVCCQLLVDPYSPKGKRCQHNVCRLCLRGKKHLFPSCTQCEGCSDFKTYEENRMMAAQLLCYKTLCVHLLHSALFGELAGMRPQVARELVPRIKLPPKTTQEFIREGSNISDTFDIFLPQPDLPFLKDMPTSLPAETPPTSAVTTPELPYDHHLNISDIEAEAAATAEQGHFSPLPLLPTGSRMGMLSHAGQIVIATESSESGFMDQAWTDQVDLSGTVSVSKYTNSGNNFAVSYVMPTSATTKFDPQELQIGQVVQMADSTQLAVLAAVEETVETSTQLTVLSTTVEETVETSTQLEVLTSAEEPNEISDQLANLQVEESDEALVEETVEEAEGTSIPSEVVAEHMEEDQHLDVHTSQSPTQTEMEEAVEEHVATKTQLGHVQTELQDAESLQKDFEDAKAAAEEAKEKEKDLHAISAELQKEDSDEPTLKRKRTRTLKASQAAKIEPVPSEVKTKVQSGKGALRRIRGKDKEEKVKPPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVCCKNPHKEDYVESDEDDDLEDFEMPKDVPEPMTQSEEPVVAEPRQEENSMAPPDSSAPISLVPLNNLQQSQHPLVLVQNEKGEYQGFNIFQGSKPLDPVTVGFTIRVQLQHTDGFGSLPQYAYIMPTIDPPNPPAPSLSPPPPPAPDREVIEPPAKKFRTSRTRRGRANFSALDTVDELVSGGSRSNSAAGDRSSATDNAHSLFEEIMSGSDDL 8 4 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PPKPKCRCGISGSSNTLTTCRNSRCPCYKSYNSCAGCHCVGCKNPHKEDYV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4rkh.1, oligomeric state (homo-tetramer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 23 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A -1.104 1.893 5.872 1 1 A PRO 0.720 1 ATOM 16 C CD . PRO 523 523 ? A -1.774 1.392 4.595 1 1 A PRO 0.720 1 ATOM 17 N N . LYS 524 524 ? A -0.825 -1.918 7.733 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 18 C CA . LYS 524 524 ? A -1.293 -2.452 8.990 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 19 C C . LYS 524 524 ? A -0.412 -1.854 10.056 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 20 O O . LYS 524 524 ? A 0.773 -2.174 10.168 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 21 C CB . LYS 524 524 ? A -1.174 -3.989 9.039 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 22 C CG . LYS 524 524 ? A -2.288 -4.688 8.255 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 23 C CD . LYS 524 524 ? A -1.938 -6.147 7.933 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 24 C CE . LYS 524 524 ? A -2.916 -7.150 8.539 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 25 N NZ . LYS 524 524 ? A -2.579 -8.508 8.063 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 26 N N . CYS 525 525 ? A -0.970 -0.927 10.846 1 1 A CYS 0.750 1 ATOM 27 C CA . CYS 525 525 ? A -0.266 -0.274 11.922 1 1 A CYS 0.750 1 ATOM 28 C C . CYS 525 525 ? A -0.263 -1.112 13.194 1 1 A CYS 0.750 1 ATOM 29 O O . CYS 525 525 ? A -1.037 -2.054 13.349 1 1 A CYS 0.750 1 ATOM 30 C CB . CYS 525 525 ? A -0.796 1.164 12.161 1 1 A CYS 0.750 1 ATOM 31 S SG . CYS 525 525 ? A -2.493 1.247 12.782 1 1 A CYS 0.750 1 ATOM 32 N N . ARG 526 526 ? A 0.643 -0.770 14.132 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 33 C CA . ARG 526 526 ? A 0.826 -1.462 15.396 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 34 C C . ARG 526 526 ? A 0.878 -0.434 16.508 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 35 O O . ARG 526 526 ? A 1.614 -0.550 17.486 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 36 C CB . ARG 526 526 ? A 2.161 -2.234 15.412 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 37 C CG . ARG 526 526 ? A 2.266 -3.332 14.347 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 38 C CD . ARG 526 526 ? A 3.694 -3.849 14.206 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 39 N NE . ARG 526 526 ? A 3.661 -4.908 13.155 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 40 C CZ . ARG 526 526 ? A 3.399 -6.199 13.391 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 41 N NH1 . ARG 526 526 ? A 3.176 -6.657 14.620 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 42 N NH2 . ARG 526 526 ? A 3.355 -7.051 12.369 1 1 A ARG 0.690 1 ATOM 43 N N . CYS 527 527 ? 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A 1.833 2.106 24.870 1 1 A SER 0.450 1 ATOM 72 C CA . SER 532 532 ? A 2.450 3.381 24.464 1 1 A SER 0.450 1 ATOM 73 C C . SER 532 532 ? A 1.730 4.571 25.084 1 1 A SER 0.450 1 ATOM 74 O O . SER 532 532 ? A 0.505 4.651 25.016 1 1 A SER 0.450 1 ATOM 75 C CB . SER 532 532 ? A 2.525 3.604 22.923 1 1 A SER 0.450 1 ATOM 76 O OG . SER 532 532 ? A 3.306 4.746 22.571 1 1 A SER 0.450 1 ATOM 77 N N . SER 533 533 ? A 2.487 5.471 25.753 1 1 A SER 0.500 1 ATOM 78 C CA . SER 533 533 ? A 1.966 6.633 26.471 1 1 A SER 0.500 1 ATOM 79 C C . SER 533 533 ? A 1.002 7.474 25.643 1 1 A SER 0.500 1 ATOM 80 O O . SER 533 533 ? A 1.066 7.491 24.417 1 1 A SER 0.500 1 ATOM 81 C CB . SER 533 533 ? A 3.097 7.547 27.042 1 1 A SER 0.500 1 ATOM 82 O OG . SER 533 533 ? A 3.886 8.165 26.023 1 1 A SER 0.500 1 ATOM 83 N N . ASN 534 534 ? A 0.057 8.191 26.295 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 84 C CA . ASN 534 534 ? A -0.878 9.063 25.599 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 85 C C . ASN 534 534 ? A -1.917 8.344 24.719 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 86 O O . ASN 534 534 ? A -1.982 8.545 23.511 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 87 C CB . ASN 534 534 ? A -0.147 10.171 24.786 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 88 C CG . ASN 534 534 ? A 0.828 10.913 25.699 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 89 O OD1 . ASN 534 534 ? A 0.556 11.169 26.859 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 90 N ND2 . ASN 534 534 ? A 2.015 11.279 25.142 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 91 N N . THR 535 535 ? A -2.833 7.509 25.278 1 1 A THR 0.480 1 ATOM 92 C CA . THR 535 535 ? A -3.694 6.693 24.409 1 1 A THR 0.480 1 ATOM 93 C C . THR 535 535 ? A -4.939 7.408 23.891 1 1 A THR 0.480 1 ATOM 94 O O . THR 535 535 ? A -5.815 6.835 23.230 1 1 A THR 0.480 1 ATOM 95 C CB . THR 535 535 ? A -4.150 5.355 24.980 1 1 A THR 0.480 1 ATOM 96 O OG1 . THR 535 535 ? A -4.958 5.514 26.141 1 1 A THR 0.480 1 ATOM 97 C CG2 . THR 535 535 ? A -2.932 4.514 25.368 1 1 A THR 0.480 1 ATOM 98 N N . LEU 536 536 ? A -5.058 8.715 24.140 1 1 A LEU 0.410 1 ATOM 99 C CA . LEU 536 536 ? A -6.010 9.600 23.494 1 1 A LEU 0.410 1 ATOM 100 C C . LEU 536 536 ? 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C 22.128 7.753 1.195 1 1 C CYS 0.560 1 ATOM 1053 O O . CYS 561 561 ? C 23.053 8.009 0.433 1 1 C CYS 0.560 1 ATOM 1054 C CB . CYS 561 561 ? C 20.942 9.945 1.637 1 1 C CYS 0.560 1 ATOM 1055 S SG . CYS 561 561 ? C 19.380 9.567 0.787 1 1 C CYS 0.560 1 ATOM 1056 N N . LYS 562 562 ? C 21.461 6.586 1.130 1 1 C LYS 0.640 1 ATOM 1057 C CA . LYS 562 562 ? C 21.746 5.536 0.175 1 1 C LYS 0.640 1 ATOM 1058 C C . LYS 562 562 ? C 20.525 5.302 -0.702 1 1 C LYS 0.640 1 ATOM 1059 O O . LYS 562 562 ? C 20.372 4.235 -1.293 1 1 C LYS 0.640 1 ATOM 1060 C CB . LYS 562 562 ? C 22.070 4.189 0.877 1 1 C LYS 0.640 1 ATOM 1061 C CG . LYS 562 562 ? C 23.081 4.252 2.026 1 1 C LYS 0.640 1 ATOM 1062 C CD . LYS 562 562 ? C 24.513 4.555 1.568 1 1 C LYS 0.640 1 ATOM 1063 C CE . LYS 562 562 ? C 25.561 4.309 2.649 1 1 C LYS 0.640 1 ATOM 1064 N NZ . LYS 562 562 ? C 25.103 4.950 3.888 1 1 C LYS 0.640 1 ATOM 1065 N N . ASN 563 563 ? C 19.597 6.286 -0.775 1 1 C ASN 0.710 1 ATOM 1066 C CA . ASN 563 563 ? 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C 18.319 9.713 -9.636 1 1 C LYS 0.560 1 ATOM 1095 C CG . LYS 566 566 ? C 19.570 8.864 -9.344 1 1 C LYS 0.560 1 ATOM 1096 C CD . LYS 566 566 ? C 20.709 9.139 -10.343 1 1 C LYS 0.560 1 ATOM 1097 C CE . LYS 566 566 ? C 22.011 8.385 -10.058 1 1 C LYS 0.560 1 ATOM 1098 N NZ . LYS 566 566 ? C 21.845 6.956 -10.396 1 1 C LYS 0.560 1 ATOM 1099 N N . GLU 567 567 ? C 15.070 10.434 -8.956 1 1 C GLU 0.520 1 ATOM 1100 C CA . GLU 567 567 ? C 13.956 11.268 -9.337 1 1 C GLU 0.520 1 ATOM 1101 C C . GLU 567 567 ? C 12.750 10.762 -8.562 1 1 C GLU 0.520 1 ATOM 1102 O O . GLU 567 567 ? C 12.783 9.662 -8.013 1 1 C GLU 0.520 1 ATOM 1103 C CB . GLU 567 567 ? C 13.729 11.234 -10.872 1 1 C GLU 0.520 1 ATOM 1104 C CG . GLU 567 567 ? C 14.910 11.853 -11.667 1 1 C GLU 0.520 1 ATOM 1105 C CD . GLU 567 567 ? C 14.774 11.767 -13.188 1 1 C GLU 0.520 1 ATOM 1106 O OE1 . GLU 567 567 ? C 13.643 11.547 -13.687 1 1 C GLU 0.520 1 ATOM 1107 O OE2 . GLU 567 567 ? C 15.827 11.926 -13.860 1 1 C GLU 0.520 1 ATOM 1108 N N . 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TYR 569 569 ? C 7.752 8.300 -10.913 1 1 C TYR 0.170 1 ATOM 1123 C CD2 . TYR 569 569 ? C 5.868 9.471 -11.864 1 1 C TYR 0.170 1 ATOM 1124 C CE1 . TYR 569 569 ? C 7.818 7.485 -12.050 1 1 C TYR 0.170 1 ATOM 1125 C CE2 . TYR 569 569 ? C 5.940 8.666 -13.007 1 1 C TYR 0.170 1 ATOM 1126 C CZ . TYR 569 569 ? C 6.916 7.668 -13.097 1 1 C TYR 0.170 1 ATOM 1127 O OH . TYR 569 569 ? C 6.981 6.847 -14.240 1 1 C TYR 0.170 1 ATOM 1128 O OXT . TYR 569 569 ? C 5.445 7.828 -8.129 1 1 C TYR 0.170 1 ATOM 1129 N N . LYS 522 522 ? D 31.830 -18.482 17.068 1 1 D LYS 0.560 1 ATOM 1130 C CA . LYS 522 522 ? D 30.979 -19.215 18.067 1 1 D LYS 0.560 1 ATOM 1131 C C . LYS 522 522 ? D 29.461 -19.053 18.023 1 1 D LYS 0.560 1 ATOM 1132 O O . LYS 522 522 ? D 28.828 -20.090 18.208 1 1 D LYS 0.560 1 ATOM 1133 C CB . LYS 522 522 ? D 31.469 -19.048 19.542 1 1 D LYS 0.560 1 ATOM 1134 C CG . LYS 522 522 ? D 31.658 -17.617 20.058 1 1 D LYS 0.560 1 ATOM 1135 C CD . LYS 522 522 ? 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D 22.775 -19.213 15.809 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 1149 C CB . LYS 524 524 ? D 24.749 -21.320 15.403 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 1150 C CG . LYS 524 524 ? D 26.030 -22.157 15.456 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 1151 C CD . LYS 524 524 ? D 25.721 -23.651 15.294 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 1152 C CE . LYS 524 524 ? D 26.930 -24.572 15.418 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 1153 N NZ . LYS 524 524 ? D 27.416 -24.515 16.810 1 1 D LYS 0.700 1 ATOM 1154 N N . CYS 525 525 ? D 23.755 -18.179 14.064 1 1 D CYS 0.720 1 ATOM 1155 C CA . CYS 525 525 ? D 22.656 -17.282 13.793 1 1 D CYS 0.720 1 ATOM 1156 C C . CYS 525 525 ? D 21.531 -17.946 13.010 1 1 D CYS 0.720 1 ATOM 1157 O O . CYS 525 525 ? D 21.698 -19.004 12.407 1 1 D CYS 0.720 1 ATOM 1158 C CB . CYS 525 525 ? D 23.142 -15.950 13.151 1 1 D CYS 0.720 1 ATOM 1159 S SG . CYS 525 525 ? D 23.707 -16.073 11.429 1 1 D CYS 0.720 1 ATOM 1160 N N . ARG 526 526 ? D 20.332 -17.331 13.040 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 1161 C CA . ARG 526 526 ? D 19.143 -17.783 12.335 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 1162 C C . ARG 526 526 ? D 18.586 -16.685 11.443 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 1163 O O . ARG 526 526 ? D 17.402 -16.638 11.118 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 1164 C CB . ARG 526 526 ? D 18.071 -18.210 13.358 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 1165 C CG . ARG 526 526 ? D 18.368 -19.589 13.966 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 1166 C CD . ARG 526 526 ? D 17.415 -19.949 15.105 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 1167 N NE . ARG 526 526 ? D 17.507 -21.422 15.356 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 1168 C CZ . ARG 526 526 ? D 18.523 -22.044 15.969 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 1169 N NH1 . ARG 526 526 ? D 19.602 -21.392 16.391 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 1170 N NH2 . ARG 526 526 ? D 18.448 -23.361 16.159 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 1171 N N . CYS 527 527 ? D 19.429 -15.717 11.053 1 1 D CYS 0.650 1 ATOM 1172 C CA . CYS 527 527 ? D 18.997 -14.579 10.264 1 1 D CYS 0.650 1 ATOM 1173 C C . CYS 527 527 ? D 18.478 -14.938 8.877 1 1 D CYS 0.650 1 ATOM 1174 O O . CYS 527 527 ? 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ILE 529 529 ? D 16.692 -20.404 10.347 1 1 D ILE 0.490 1 ATOM 1189 N N . SER 530 530 ? D 12.953 -16.180 8.948 1 1 D SER 0.540 1 ATOM 1190 C CA . SER 530 530 ? D 11.569 -15.779 9.105 1 1 D SER 0.540 1 ATOM 1191 C C . SER 530 530 ? D 11.141 -14.794 8.036 1 1 D SER 0.540 1 ATOM 1192 O O . SER 530 530 ? D 10.035 -14.255 8.071 1 1 D SER 0.540 1 ATOM 1193 C CB . SER 530 530 ? D 11.324 -15.161 10.515 1 1 D SER 0.540 1 ATOM 1194 O OG . SER 530 530 ? D 12.338 -14.221 10.873 1 1 D SER 0.540 1 ATOM 1195 N N . GLY 531 531 ? D 12.009 -14.545 7.029 1 1 D GLY 0.470 1 ATOM 1196 C CA . GLY 531 531 ? D 11.908 -13.407 6.126 1 1 D GLY 0.470 1 ATOM 1197 C C . GLY 531 531 ? D 12.270 -12.133 6.837 1 1 D GLY 0.470 1 ATOM 1198 O O . GLY 531 531 ? D 12.342 -12.061 8.065 1 1 D GLY 0.470 1 ATOM 1199 N N . SER 532 532 ? D 12.526 -11.055 6.099 1 1 D SER 0.480 1 ATOM 1200 C CA . SER 532 532 ? D 12.781 -9.787 6.735 1 1 D SER 0.480 1 ATOM 1201 C C . SER 532 532 ? D 12.501 -8.737 5.698 1 1 D SER 0.480 1 ATOM 1202 O O . SER 532 532 ? D 12.537 -9.006 4.498 1 1 D SER 0.480 1 ATOM 1203 C CB . SER 532 532 ? D 14.219 -9.676 7.308 1 1 D SER 0.480 1 ATOM 1204 O OG . SER 532 532 ? D 14.443 -8.447 8.000 1 1 D SER 0.480 1 ATOM 1205 N N . SER 533 533 ? D 12.178 -7.512 6.136 1 1 D SER 0.520 1 ATOM 1206 C CA . SER 533 533 ? D 11.842 -6.366 5.305 1 1 D SER 0.520 1 ATOM 1207 C C . SER 533 533 ? D 12.995 -5.827 4.472 1 1 D SER 0.520 1 ATOM 1208 O O . SER 533 533 ? D 12.847 -4.838 3.751 1 1 D SER 0.520 1 ATOM 1209 C CB . SER 533 533 ? D 11.288 -5.203 6.171 1 1 D SER 0.520 1 ATOM 1210 O OG . SER 533 533 ? D 12.235 -4.777 7.156 1 1 D SER 0.520 1 ATOM 1211 N N . ASN 534 534 ? D 14.175 -6.466 4.554 1 1 D ASN 0.580 1 ATOM 1212 C CA . ASN 534 534 ? D 15.375 -6.023 3.904 1 1 D ASN 0.580 1 ATOM 1213 C C . ASN 534 534 ? D 16.322 -7.213 3.711 1 1 D ASN 0.580 1 ATOM 1214 O O . ASN 534 534 ? D 16.876 -7.761 4.659 1 1 D ASN 0.580 1 ATOM 1215 C CB . ASN 534 534 ? D 15.981 -4.900 4.782 1 1 D ASN 0.580 1 ATOM 1216 C CG . 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ARG 543 543 ? D 17.441 -6.404 15.235 1 1 D ARG 0.680 1 ATOM 1286 N NE . ARG 543 543 ? D 16.850 -7.735 15.593 1 1 D ARG 0.680 1 ATOM 1287 C CZ . ARG 543 543 ? D 15.570 -8.074 15.385 1 1 D ARG 0.680 1 ATOM 1288 N NH1 . ARG 543 543 ? D 15.155 -9.310 15.657 1 1 D ARG 0.680 1 ATOM 1289 N NH2 . ARG 543 543 ? D 14.702 -7.192 14.904 1 1 D ARG 0.680 1 ATOM 1290 N N . CYS 544 544 ? D 22.570 -9.285 13.800 1 1 D CYS 0.730 1 ATOM 1291 C CA . CYS 544 544 ? D 23.178 -10.580 13.589 1 1 D CYS 0.730 1 ATOM 1292 C C . CYS 544 544 ? D 24.289 -10.760 14.616 1 1 D CYS 0.730 1 ATOM 1293 O O . CYS 544 544 ? D 25.208 -9.939 14.631 1 1 D CYS 0.730 1 ATOM 1294 C CB . CYS 544 544 ? D 23.754 -10.739 12.163 1 1 D CYS 0.730 1 ATOM 1295 S SG . CYS 544 544 ? D 24.587 -12.344 11.855 1 1 D CYS 0.730 1 ATOM 1296 N N . PRO 545 545 ? D 24.293 -11.794 15.462 1 1 D PRO 0.690 1 ATOM 1297 C CA . PRO 545 545 ? D 25.300 -11.970 16.502 1 1 D PRO 0.690 1 ATOM 1298 C C . PRO 545 545 ? 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TYR 547 547 ? D 29.802 -8.048 13.240 1 1 D TYR 0.650 1 ATOM 1313 C CB . TYR 547 547 ? D 27.198 -9.007 11.372 1 1 D TYR 0.650 1 ATOM 1314 C CG . TYR 547 547 ? D 27.604 -7.734 10.681 1 1 D TYR 0.650 1 ATOM 1315 C CD1 . TYR 547 547 ? D 28.424 -7.764 9.546 1 1 D TYR 0.650 1 ATOM 1316 C CD2 . TYR 547 547 ? D 27.143 -6.495 11.150 1 1 D TYR 0.650 1 ATOM 1317 C CE1 . TYR 547 547 ? D 28.710 -6.582 8.848 1 1 D TYR 0.650 1 ATOM 1318 C CE2 . TYR 547 547 ? D 27.400 -5.317 10.434 1 1 D TYR 0.650 1 ATOM 1319 C CZ . TYR 547 547 ? D 28.167 -5.367 9.267 1 1 D TYR 0.650 1 ATOM 1320 O OH . TYR 547 547 ? D 28.386 -4.208 8.499 1 1 D TYR 0.650 1 ATOM 1321 N N . LYS 548 548 ? D 27.944 -8.636 14.371 1 1 D LYS 0.610 1 ATOM 1322 C CA . LYS 548 548 ? D 28.179 -7.832 15.555 1 1 D LYS 0.610 1 ATOM 1323 C C . LYS 548 548 ? D 29.468 -8.170 16.291 1 1 D LYS 0.610 1 ATOM 1324 O O . LYS 548 548 ? D 30.116 -7.296 16.867 1 1 D LYS 0.610 1 ATOM 1325 C CB . LYS 548 548 ? 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TYR 550 550 ? D 34.759 -11.447 13.195 1 1 D TYR 0.480 1 ATOM 1340 C CB . TYR 550 550 ? D 34.533 -8.949 14.316 1 1 D TYR 0.480 1 ATOM 1341 C CG . TYR 550 550 ? D 34.240 -7.602 14.907 1 1 D TYR 0.480 1 ATOM 1342 C CD1 . TYR 550 550 ? D 33.943 -6.495 14.099 1 1 D TYR 0.480 1 ATOM 1343 C CD2 . TYR 550 550 ? D 34.268 -7.438 16.299 1 1 D TYR 0.480 1 ATOM 1344 C CE1 . TYR 550 550 ? D 33.679 -5.245 14.678 1 1 D TYR 0.480 1 ATOM 1345 C CE2 . TYR 550 550 ? D 33.993 -6.194 16.879 1 1 D TYR 0.480 1 ATOM 1346 C CZ . TYR 550 550 ? D 33.704 -5.095 16.065 1 1 D TYR 0.480 1 ATOM 1347 O OH . TYR 550 550 ? D 33.442 -3.840 16.643 1 1 D TYR 0.480 1 ATOM 1348 N N . ASN 551 551 ? D 32.579 -11.963 13.279 1 1 D ASN 0.630 1 ATOM 1349 C CA . ASN 551 551 ? D 32.719 -13.363 12.975 1 1 D ASN 0.630 1 ATOM 1350 C C . ASN 551 551 ? D 32.049 -13.674 11.658 1 1 D ASN 0.630 1 ATOM 1351 O O . ASN 551 551 ? D 31.134 -12.993 11.193 1 1 D ASN 0.630 1 ATOM 1352 C CB . ASN 551 551 ? 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D 41.414 -22.546 -0.167 1 1 D TYR 0.280 1 ATOM 1488 C CZ . TYR 569 569 ? D 40.235 -22.412 -0.907 1 1 D TYR 0.280 1 ATOM 1489 O OH . TYR 569 569 ? D 40.069 -23.131 -2.107 1 1 D TYR 0.280 1 ATOM 1490 O OXT . TYR 569 569 ? D 40.972 -23.080 3.757 1 1 D TYR 0.280 1 HETATM 1491 ZN ZN . ZN . 1 ? E -2.131 3.412 13.931 1 2 '_' ZN . 1 HETATM 1492 ZN ZN . ZN . 2 ? F -5.538 2.110 14.726 1 2 '_' ZN . 1 HETATM 1493 ZN ZN . ZN . 3 ? G -3.925 1.300 11.368 1 2 '_' ZN . 1 HETATM 1494 ZN ZN . ZN . 4 ? H 12.352 25.419 33.387 1 2 '_' ZN . 1 HETATM 1495 ZN ZN . ZN . 5 ? I 10.220 27.097 35.973 1 2 '_' ZN . 1 HETATM 1496 ZN ZN . ZN . 6 ? J 14.003 27.620 35.932 1 2 '_' ZN . 1 HETATM 1497 ZN ZN . ZN . 7 ? K 15.263 8.647 4.479 1 2 '_' ZN . 1 HETATM 1498 ZN ZN . ZN . 8 ? L 17.897 10.217 2.226 1 2 '_' ZN . 1 HETATM 1499 ZN ZN . ZN . 9 ? M 14.250 11.412 2.253 1 2 '_' ZN . 1 HETATM 1500 ZN ZN . ZN . 10 ? N 23.258 -13.696 10.907 1 2 '_' ZN . 1 HETATM 1501 ZN ZN . ZN . 11 ? O 24.808 -15.426 7.980 1 2 '_' ZN . 1 HETATM 1502 ZN ZN . ZN . 12 ? P 25.895 -16.332 11.515 1 2 '_' ZN . 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S ZN # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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