data_SMR-074d3f97db063efeb4bb8785603ad0c0_4 _entry.id SMR-074d3f97db063efeb4bb8785603ad0c0_4 _struct.entry_id SMR-074d3f97db063efeb4bb8785603ad0c0_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q6NXI6/ RPRD2_MOUSE, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.033, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q6NXI6' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.5 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 183216.635 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RPRD2_MOUSE Q6NXI6 1 ;MAAGGGGGSSKASSSSASSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRST YPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSIERIFKIWEDRNVYPEDMIVA LREALMDRAASHNARLQKLQCFPGTTFKTQKQLKENLNKQPNKQWKKSQTSTNPKAALKSKIVAEFRSQA LIEELLMYKRSEDQIELKEKQLSTMRVDVCSTETLKCLKDKTGGKKFSKEFEEASSKLEEFVNGLDKQVK NGPSLTEALENAGIFYEAQYKEVKVVANAYKTFANRVNNLKKKLDQLKSTLPDPEESPVPSPSMDAPSPT GSESPFQGMGGEEPQSPAMESDKSATPEPVTDNRDVEDMELSDVEDDGSKIIVEDRKEKPVEKPAVSTGV PTKSTESVSKASPCAPPSVPTTAAPPLPKPLSTALLSPSPTLVLPNLANVDLAKISSILSSLTSVMKNTG VSSASRPSPGIPTSPSNLSSGLKTPAPATTPSHNPLANILSKVEITPESILSALSKTQTQSAPALQGLSS LLQSVTANPVPASEVTSQSTTASPASTTGSAVKGRNLLSSTQSFIPKSFNYSPSSSTSEVSSTSASKASV GQSPVLPSTTFKLPSSSLGFTGTHNPSPAAPPTEVAVCQSSEVSKPKPESESTSPSLEMKIHNFLKGNPG FSGLNLNIPILSSLGSSAPSEGHASDFQRGPTSTSVDSIDGTPVRDERSGTPTQDEMMDKPTSSSVDTMS LLSKIISPGSSTPSSTRSPPPGRDESYPQELPNSVSTYRPFGLGSDSPYKQPSGGVERPSSLMDSSQEKL FPDTSFQEDEDYRDFEYSGPPPSAMMNLEKKPAKSILKSSKLSDATEYQPILSSYNHRAQEFGVKSAFPP SVRALLDSSENCDRLSSPPGLFGAFNIRGNEPGSERSPSPSKNDAFFTPDSNHSGLSQSTAGHLTLPQTQ YPDSPHSVPHRSIFSSQSTLAAPAGHPPTSGVEKVLASTISTTSTIEFKNMLKNASRKPSDDKHFGQTPN KGTSSDGVSLSNLTQPSLPTTDQQQEEHYRIETRVSSSCLDLPDSTEEKGAPIETLGYHNAANRRMSGEP IKTVESIRVPGKGNRGHGREVSRVGWFDLSTPGSSFDNGPSSASELASLGGGGSGGLTGFKTTPYKERAP QFQESVTSFRSNSFNSTFEHHLPPSPLEHGAPFQREPVGPSSAPPAPPKDHGGIFSREAPTHLPSVDLSN PFTKEASLAHAGPPPPPGEHSGVPFPPPPPPPPPGELSSGGTGVPFATPAPPPPPVDHSGVVPFPTPPLP EHGVTGAVSVFPKDHSSLLQGTMAEHFGVLTGPRDLNGPGLNRSRESLSLPSHPLEHLGPALGGGGGGNT SSSGLPLSPAHRDAIGRSGMILRSPRPDFRPREAFLGRDPFHSLKRPRPPFVRGPPFFAPKRPFFPPRY ; 'Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1469 1 1469 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . RPRD2_MOUSE Q6NXI6 . 1 1469 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2004-07-05 1EF4A65F32873748 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MAAGGGGGSSKASSSSASSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRST YPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSIERIFKIWEDRNVYPEDMIVA LREALMDRAASHNARLQKLQCFPGTTFKTQKQLKENLNKQPNKQWKKSQTSTNPKAALKSKIVAEFRSQA LIEELLMYKRSEDQIELKEKQLSTMRVDVCSTETLKCLKDKTGGKKFSKEFEEASSKLEEFVNGLDKQVK NGPSLTEALENAGIFYEAQYKEVKVVANAYKTFANRVNNLKKKLDQLKSTLPDPEESPVPSPSMDAPSPT GSESPFQGMGGEEPQSPAMESDKSATPEPVTDNRDVEDMELSDVEDDGSKIIVEDRKEKPVEKPAVSTGV PTKSTESVSKASPCAPPSVPTTAAPPLPKPLSTALLSPSPTLVLPNLANVDLAKISSILSSLTSVMKNTG VSSASRPSPGIPTSPSNLSSGLKTPAPATTPSHNPLANILSKVEITPESILSALSKTQTQSAPALQGLSS LLQSVTANPVPASEVTSQSTTASPASTTGSAVKGRNLLSSTQSFIPKSFNYSPSSSTSEVSSTSASKASV GQSPVLPSTTFKLPSSSLGFTGTHNPSPAAPPTEVAVCQSSEVSKPKPESESTSPSLEMKIHNFLKGNPG FSGLNLNIPILSSLGSSAPSEGHASDFQRGPTSTSVDSIDGTPVRDERSGTPTQDEMMDKPTSSSVDTMS LLSKIISPGSSTPSSTRSPPPGRDESYPQELPNSVSTYRPFGLGSDSPYKQPSGGVERPSSLMDSSQEKL FPDTSFQEDEDYRDFEYSGPPPSAMMNLEKKPAKSILKSSKLSDATEYQPILSSYNHRAQEFGVKSAFPP SVRALLDSSENCDRLSSPPGLFGAFNIRGNEPGSERSPSPSKNDAFFTPDSNHSGLSQSTAGHLTLPQTQ YPDSPHSVPHRSIFSSQSTLAAPAGHPPTSGVEKVLASTISTTSTIEFKNMLKNASRKPSDDKHFGQTPN KGTSSDGVSLSNLTQPSLPTTDQQQEEHYRIETRVSSSCLDLPDSTEEKGAPIETLGYHNAANRRMSGEP IKTVESIRVPGKGNRGHGREVSRVGWFDLSTPGSSFDNGPSSASELASLGGGGSGGLTGFKTTPYKERAP QFQESVTSFRSNSFNSTFEHHLPPSPLEHGAPFQREPVGPSSAPPAPPKDHGGIFSREAPTHLPSVDLSN PFTKEASLAHAGPPPPPGEHSGVPFPPPPPPPPPGELSSGGTGVPFATPAPPPPPVDHSGVVPFPTPPLP EHGVTGAVSVFPKDHSSLLQGTMAEHFGVLTGPRDLNGPGLNRSRESLSLPSHPLEHLGPALGGGGGGNT SSSGLPLSPAHRDAIGRSGMILRSPRPDFRPREAFLGRDPFHSLKRPRPPFVRGPPFFAPKRPFFPPRY ; ;MAAGGGGGSSKASSSSASSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRST YPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSIERIFKIWEDRNVYPEDMIVA LREALMDRAASHNARLQKLQCFPGTTFKTQKQLKENLNKQPNKQWKKSQTSTNPKAALKSKIVAEFRSQA LIEELLMYKRSEDQIELKEKQLSTMRVDVCSTETLKCLKDKTGGKKFSKEFEEASSKLEEFVNGLDKQVK NGPSLTEALENAGIFYEAQYKEVKVVANAYKTFANRVNNLKKKLDQLKSTLPDPEESPVPSPSMDAPSPT GSESPFQGMGGEEPQSPAMESDKSATPEPVTDNRDVEDMELSDVEDDGSKIIVEDRKEKPVEKPAVSTGV PTKSTESVSKASPCAPPSVPTTAAPPLPKPLSTALLSPSPTLVLPNLANVDLAKISSILSSLTSVMKNTG VSSASRPSPGIPTSPSNLSSGLKTPAPATTPSHNPLANILSKVEITPESILSALSKTQTQSAPALQGLSS LLQSVTANPVPASEVTSQSTTASPASTTGSAVKGRNLLSSTQSFIPKSFNYSPSSSTSEVSSTSASKASV GQSPVLPSTTFKLPSSSLGFTGTHNPSPAAPPTEVAVCQSSEVSKPKPESESTSPSLEMKIHNFLKGNPG FSGLNLNIPILSSLGSSAPSEGHASDFQRGPTSTSVDSIDGTPVRDERSGTPTQDEMMDKPTSSSVDTMS LLSKIISPGSSTPSSTRSPPPGRDESYPQELPNSVSTYRPFGLGSDSPYKQPSGGVERPSSLMDSSQEKL FPDTSFQEDEDYRDFEYSGPPPSAMMNLEKKPAKSILKSSKLSDATEYQPILSSYNHRAQEFGVKSAFPP SVRALLDSSENCDRLSSPPGLFGAFNIRGNEPGSERSPSPSKNDAFFTPDSNHSGLSQSTAGHLTLPQTQ YPDSPHSVPHRSIFSSQSTLAAPAGHPPTSGVEKVLASTISTTSTIEFKNMLKNASRKPSDDKHFGQTPN KGTSSDGVSLSNLTQPSLPTTDQQQEEHYRIETRVSSSCLDLPDSTEEKGAPIETLGYHNAANRRMSGEP IKTVESIRVPGKGNRGHGREVSRVGWFDLSTPGSSFDNGPSSASELASLGGGGSGGLTGFKTTPYKERAP QFQESVTSFRSNSFNSTFEHHLPPSPLEHGAPFQREPVGPSSAPPAPPKDHGGIFSREAPTHLPSVDLSN PFTKEASLAHAGPPPPPGEHSGVPFPPPPPPPPPGELSSGGTGVPFATPAPPPPPVDHSGVVPFPTPPLP EHGVTGAVSVFPKDHSSLLQGTMAEHFGVLTGPRDLNGPGLNRSRESLSLPSHPLEHLGPALGGGGGGNT SSSGLPLSPAHRDAIGRSGMILRSPRPDFRPREAFLGRDPFHSLKRPRPPFVRGPPFFAPKRPFFPPRY ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 ALA . 1 4 GLY . 1 5 GLY . 1 6 GLY . 1 7 GLY . 1 8 GLY . 1 9 SER . 1 10 SER . 1 11 LYS . 1 12 ALA . 1 13 SER . 1 14 SER . 1 15 SER . 1 16 SER . 1 17 ALA . 1 18 SER . 1 19 SER . 1 20 ALA . 1 21 GLY . 1 22 ALA . 1 23 LEU . 1 24 GLU . 1 25 SER . 1 26 SER . 1 27 LEU . 1 28 ASP . 1 29 ARG . 1 30 LYS . 1 31 PHE . 1 32 GLN . 1 33 SER . 1 34 VAL . 1 35 THR . 1 36 ASN . 1 37 THR . 1 38 MET . 1 39 GLU . 1 40 SER . 1 41 ILE . 1 42 GLN . 1 43 GLY . 1 44 LEU . 1 45 SER . 1 46 SER . 1 47 TRP . 1 48 CYS . 1 49 ILE . 1 50 GLU 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B 1 1193 GLN 1193 ? ? ? B . B 1 1194 GLU 1194 ? ? ? B . B 1 1195 SER 1195 ? ? ? B . B 1 1196 VAL 1196 ? ? ? B . B 1 1197 THR 1197 ? ? ? B . B 1 1198 SER 1198 ? ? ? B . B 1 1199 PHE 1199 ? ? ? B . B 1 1200 ARG 1200 ? ? ? B . B 1 1201 SER 1201 ? ? ? B . B 1 1202 ASN 1202 ? ? ? B . B 1 1203 SER 1203 ? ? ? B . B 1 1204 PHE 1204 ? ? ? B . B 1 1205 ASN 1205 ? ? ? B . B 1 1206 SER 1206 ? ? ? B . B 1 1207 THR 1207 ? ? ? B . B 1 1208 PHE 1208 ? ? ? B . B 1 1209 GLU 1209 ? ? ? B . B 1 1210 HIS 1210 ? ? ? B . B 1 1211 HIS 1211 ? ? ? B . B 1 1212 LEU 1212 ? ? ? B . B 1 1213 PRO 1213 ? ? ? B . B 1 1214 PRO 1214 ? ? ? B . B 1 1215 SER 1215 ? ? ? B . B 1 1216 PRO 1216 ? ? ? B . B 1 1217 LEU 1217 ? ? ? B . B 1 1218 GLU 1218 ? ? ? B . B 1 1219 HIS 1219 ? ? ? B . B 1 1220 GLY 1220 ? ? ? B . B 1 1221 ALA 1221 ? ? ? B . B 1 1222 PRO 1222 ? ? ? B . B 1 1223 PHE 1223 ? ? ? B . B 1 1224 GLN 1224 ? ? ? B . B 1 1225 ARG 1225 ? ? ? B . B 1 1226 GLU 1226 ? ? ? B . B 1 1227 PRO 1227 ? ? ? B . B 1 1228 VAL 1228 ? ? ? B . B 1 1229 GLY 1229 ? ? ? B . B 1 1230 PRO 1230 ? ? ? B . B 1 1231 SER 1231 ? ? ? B . B 1 1232 SER 1232 ? ? ? B . B 1 1233 ALA 1233 ? ? ? B . B 1 1234 PRO 1234 ? ? ? B . B 1 1235 PRO 1235 ? ? ? B . B 1 1236 ALA 1236 ? ? ? B . B 1 1237 PRO 1237 ? ? ? B . B 1 1238 PRO 1238 ? ? ? B . B 1 1239 LYS 1239 ? ? ? B . B 1 1240 ASP 1240 ? ? ? B . B 1 1241 HIS 1241 ? ? ? B . B 1 1242 GLY 1242 ? ? ? B . B 1 1243 GLY 1243 ? ? ? B . B 1 1244 ILE 1244 ? ? ? B . B 1 1245 PHE 1245 ? ? ? B . B 1 1246 SER 1246 ? ? ? B . B 1 1247 ARG 1247 ? ? ? B . B 1 1248 GLU 1248 ? ? ? B . B 1 1249 ALA 1249 ? ? ? B . B 1 1250 PRO 1250 ? ? ? B . B 1 1251 THR 1251 ? ? ? B . B 1 1252 HIS 1252 ? ? ? B . B 1 1253 LEU 1253 ? ? ? B . B 1 1254 PRO 1254 ? ? ? B . B 1 1255 SER 1255 ? ? ? B . B 1 1256 VAL 1256 ? ? ? B . B 1 1257 ASP 1257 ? ? ? B . B 1 1258 LEU 1258 ? ? ? B . B 1 1259 SER 1259 ? ? ? B . B 1 1260 ASN 1260 ? ? ? B . B 1 1261 PRO 1261 ? ? ? B . B 1 1262 PHE 1262 ? ? ? B . 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B 1 1333 GLY 1333 ? ? ? B . B 1 1334 VAL 1334 ? ? ? B . B 1 1335 THR 1335 ? ? ? B . B 1 1336 GLY 1336 ? ? ? B . B 1 1337 ALA 1337 ? ? ? B . B 1 1338 VAL 1338 ? ? ? B . B 1 1339 SER 1339 ? ? ? B . B 1 1340 VAL 1340 ? ? ? B . B 1 1341 PHE 1341 ? ? ? B . B 1 1342 PRO 1342 ? ? ? B . B 1 1343 LYS 1343 ? ? ? B . B 1 1344 ASP 1344 ? ? ? B . B 1 1345 HIS 1345 ? ? ? B . B 1 1346 SER 1346 ? ? ? B . B 1 1347 SER 1347 ? ? ? B . B 1 1348 LEU 1348 ? ? ? B . B 1 1349 LEU 1349 ? ? ? B . B 1 1350 GLN 1350 ? ? ? B . B 1 1351 GLY 1351 ? ? ? B . B 1 1352 THR 1352 ? ? ? B . B 1 1353 MET 1353 ? ? ? B . B 1 1354 ALA 1354 ? ? ? B . B 1 1355 GLU 1355 ? ? ? B . B 1 1356 HIS 1356 ? ? ? B . B 1 1357 PHE 1357 ? ? ? B . B 1 1358 GLY 1358 ? ? ? B . B 1 1359 VAL 1359 ? ? ? B . B 1 1360 LEU 1360 ? ? ? B . B 1 1361 THR 1361 ? ? ? B . B 1 1362 GLY 1362 ? ? ? B . B 1 1363 PRO 1363 ? ? ? B . B 1 1364 ARG 1364 ? ? ? B . B 1 1365 ASP 1365 ? ? ? B . B 1 1366 LEU 1366 ? ? ? B . B 1 1367 ASN 1367 ? ? ? B . B 1 1368 GLY 1368 ? ? ? B . B 1 1369 PRO 1369 ? ? ? B . B 1 1370 GLY 1370 ? ? ? B . B 1 1371 LEU 1371 ? ? ? B . B 1 1372 ASN 1372 ? ? ? B . B 1 1373 ARG 1373 ? ? ? B . B 1 1374 SER 1374 ? ? ? B . B 1 1375 ARG 1375 ? ? ? B . B 1 1376 GLU 1376 ? ? ? B . B 1 1377 SER 1377 ? ? ? B . B 1 1378 LEU 1378 ? ? ? B . B 1 1379 SER 1379 ? ? ? B . B 1 1380 LEU 1380 ? ? ? B . B 1 1381 PRO 1381 ? ? ? B . B 1 1382 SER 1382 ? ? ? B . B 1 1383 HIS 1383 ? ? ? B . B 1 1384 PRO 1384 ? ? ? B . B 1 1385 LEU 1385 ? ? ? B . B 1 1386 GLU 1386 ? ? ? B . B 1 1387 HIS 1387 ? ? ? B . B 1 1388 LEU 1388 ? ? ? B . B 1 1389 GLY 1389 ? ? ? B . B 1 1390 PRO 1390 ? ? ? B . B 1 1391 ALA 1391 ? ? ? B . B 1 1392 LEU 1392 ? ? ? B . B 1 1393 GLY 1393 ? ? ? B . B 1 1394 GLY 1394 ? ? ? B . B 1 1395 GLY 1395 ? ? ? B . B 1 1396 GLY 1396 ? ? ? B . B 1 1397 GLY 1397 ? ? ? B . B 1 1398 GLY 1398 ? ? ? B . B 1 1399 ASN 1399 ? ? ? B . B 1 1400 THR 1400 ? ? ? B . B 1 1401 SER 1401 ? ? ? B . B 1 1402 SER 1402 ? ? ? B . B 1 1403 SER 1403 ? ? ? B . B 1 1404 GLY 1404 ? ? ? B . B 1 1405 LEU 1405 ? ? ? B . B 1 1406 PRO 1406 ? ? ? B . B 1 1407 LEU 1407 ? ? ? B . B 1 1408 SER 1408 ? ? ? B . B 1 1409 PRO 1409 ? ? ? B . B 1 1410 ALA 1410 ? ? ? B . B 1 1411 HIS 1411 ? ? ? B . B 1 1412 ARG 1412 ? ? ? B . B 1 1413 ASP 1413 ? ? ? B . B 1 1414 ALA 1414 ? ? ? B . B 1 1415 ILE 1415 ? ? ? B . B 1 1416 GLY 1416 ? ? ? B . B 1 1417 ARG 1417 ? ? ? B . B 1 1418 SER 1418 ? ? ? B . B 1 1419 GLY 1419 ? ? ? B . B 1 1420 MET 1420 ? ? ? B . B 1 1421 ILE 1421 ? ? ? B . B 1 1422 LEU 1422 ? ? ? B . B 1 1423 ARG 1423 ? ? ? B . B 1 1424 SER 1424 ? ? ? B . B 1 1425 PRO 1425 ? ? ? B . B 1 1426 ARG 1426 ? ? ? B . B 1 1427 PRO 1427 ? ? ? B . B 1 1428 ASP 1428 ? ? ? B . B 1 1429 PHE 1429 ? ? ? B . B 1 1430 ARG 1430 ? ? ? B . B 1 1431 PRO 1431 ? ? ? B . B 1 1432 ARG 1432 ? ? ? B . B 1 1433 GLU 1433 ? ? ? B . B 1 1434 ALA 1434 ? ? ? B . B 1 1435 PHE 1435 ? ? ? B . B 1 1436 LEU 1436 ? ? ? B . B 1 1437 GLY 1437 ? ? ? B . B 1 1438 ARG 1438 ? ? ? B . B 1 1439 ASP 1439 ? ? ? B . B 1 1440 PRO 1440 ? ? ? B . B 1 1441 PHE 1441 ? ? ? B . B 1 1442 HIS 1442 ? ? ? B . B 1 1443 SER 1443 ? ? ? B . B 1 1444 LEU 1444 ? ? ? B . B 1 1445 LYS 1445 ? ? ? B . B 1 1446 ARG 1446 ? ? ? B . B 1 1447 PRO 1447 ? ? ? B . B 1 1448 ARG 1448 ? ? ? B . B 1 1449 PRO 1449 ? ? ? B . B 1 1450 PRO 1450 ? ? ? B . B 1 1451 PHE 1451 ? ? ? B . B 1 1452 VAL 1452 ? ? ? B . B 1 1453 ARG 1453 ? ? ? B . B 1 1454 GLY 1454 ? ? ? B . B 1 1455 PRO 1455 ? ? ? B . B 1 1456 PRO 1456 ? ? ? B . B 1 1457 PHE 1457 ? ? ? B . B 1 1458 PHE 1458 ? ? ? B . B 1 1459 ALA 1459 ? ? ? B . B 1 1460 PRO 1460 ? ? ? B . B 1 1461 LYS 1461 ? ? ? B . B 1 1462 ARG 1462 ? ? ? B . B 1 1463 PRO 1463 ? ? ? B . B 1 1464 PHE 1464 ? ? ? B . B 1 1465 PHE 1465 ? ? ? B . B 1 1466 PRO 1466 ? ? ? B . B 1 1467 PRO 1467 ? ? ? B . B 1 1468 ARG 1468 ? ? ? B . B 1 1469 TYR 1469 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B {PDB ID=4nad, label_asym_id=A, auth_asym_id=B, SMTL ID=4nad.1.A}' 'template structure' . 2 'Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B {PDB ID=4nad, label_asym_id=B, auth_asym_id=A, SMTL ID=4nad.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 4nad, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 4nad, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 4' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-09-10 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-09-05 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 B 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;AMGSTEELIKALQDLENAASGDATVRQKIASLPQEVQDVSLLEKITDKEAAERLSKTVDEACLLLAEYNG RLAAELEDRRQLARMLVEYTQNQKDVLSEKEKKLEEYKQKLARVTQVRKELKSHIQSLPDLSLLPNVTGG LAPLPSAGDLFSTD ; ;AMGSTEELIKALQDLENAASGDATVRQKIASLPQEVQDVSLLEKITDKEAAERLSKTVDEACLLLAEYNG RLAAELEDRRQLARMLVEYTQNQKDVLSEKEKKLEEYKQKLARVTQVRKELKSHIQSLPDLSLLPNVTGG LAPLPSAGDLFSTD ; 2 ;AMGSTEELIKALQDLENAASGDATVRQKIASLPQEVQDVSLLEKITDKEAAERLSKTVDEACLLLAEYNG RLAAELEDRRQLARMLVEYTQNQKDVLSEKEKKLEEYKQKLARVTQVRKELKSHIQSLPDLSLLPNVTGG LAPLPSAGDLFSTD ; ;AMGSTEELIKALQDLENAASGDATVRQKIASLPQEVQDVSLLEKITDKEAAERLSKTVDEACLLLAEYNG RLAAELEDRRQLARMLVEYTQNQKDVLSEKEKKLEEYKQKLARVTQVRKELKSHIQSLPDLSLLPNVTGG LAPLPSAGDLFSTD ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 149 2 2 5 149 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4nad 2024-03-20 2 PDB . 4nad 2024-03-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1469 2 2 B 1 1469 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 1470 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 1470 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 4.1e-28 20.833 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 4.1e-28 20.833 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAAGGGGGSSKASSSSASSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSTYPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSIERIFKIWEDRNVYPEDMIVALREALMDRAASHNARLQKLQCFPGTTFKTQKQLKENLNKQPNKQWKKSQTSTNPKAALKSKIVAEFRSQALIEELLMYKRSEDQIELKEKQLSTMRVDVCSTETLKCLKDKTGGKKFSKEFEEASSKLEEFVNGLDKQVKNGPSLTEALENAGIFYEAQYKEVKVVANAYKTFANRVNNLKKKLDQLKSTLPDPEESPVPSP-SMDAPSPTGSESPFQGMGGEEPQSPAMESDKSATPEPVTDNRDVEDMELSDVEDDGSKIIVEDRKEKPVEKPAVSTGVPTKSTESVSKASPCAPPSVPTTAAPPLPKPLSTALLSPSPTLVLPNLANVDLAKISSILSSLTSVMKNTGVSSASRPSPGIPTSPSNLSSGLKTPAPATTPSHNPLANILSKVEITPESILSALSKTQTQSAPALQGLSSLLQSVTANPVPASEVTSQSTTASPASTTGSAVKGRNLLSSTQSFIPKSFNYSPSSSTSEVSSTSASKASVGQSPVLPSTTFKLPSSSLGFTGTHNPSPAAPPTEVAVCQSSEVSKPKPESESTSPSLEMKIHNFLKGNPGFSGLNLNIPILSSLGSSAPSEGHASDFQRGPTSTSVDSIDGTPVRDERSGTPTQDEMMDKPTSSSVDTMSLLSKIISPGSSTPSSTRSPPPGRDESYPQELPNSVSTYRPFGLGSDSPYKQPSGGVERPSSLMDSSQEKLFPDTSFQEDEDYRDFEYSGPPPSAMMNLEKKPAKSILKSSKLSDATEYQPILSSYNHRAQEFGVKSAFPPSVRALLDSSENCDRLSSPPGLFGAFNIRGNEPGSERSPSPSKNDAFFTPDSNHSGLSQSTAGHLTLPQTQYPDSPHSVPHRSIFSSQSTLAAPAGHPPTSGVEKVLASTISTTSTIEFKNMLKNASRKPSDDKHFGQTPNKGTSSDGVSLSNLTQPSLPTTDQQQEEHYRIETRVSSSCLDLPDSTEEKGAPIETLGYHNAANRRMSGEPIKTVESIRVPGKGNRGHGREVSRVGWFDLSTPGSSFDNGPSSASELASLGGGGSGGLTGFKTTPYKERAPQFQESVTSFRSNSFNSTFEHHLPPSPLEHGAPFQREPVGPSSAPPAPPKDHGGIFSREAPTHLPSVDLSNPFTKEASLAHAGPPPPPGEHSGVPFPPPPPPPPPGELSSGGTGVPFATPAPPPPPVDHSGVVPFPTPPLPEHGVTGAVSVFPKDHSSLLQGTMAEHFGVLTGPRDLNGPGLNRSRESLSLPSHPLEHLGPALGGGGGGNTSSSGLPLSPAHRDAIGRSGMILRSPRPDFRPREAFLGRDPFHSLKRPRPPFVRGPPFFAPKRPFFPPRY 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TEELIKALQDLENAASGDATVRQKIASLPQEVQDVSLLEKITDKEAAERLSKTVDEACLLLAEYNGRLAAELEDRRQLARMLVEYTQNQKDVLSEKEKKLEEYKQKLARVTQVRKELKSHIQSLPDLS--LLPNVTGGLAPLPSAGD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 3 2 1 MAAGGGGGSSKASSSSASSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSTYPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSIERIFKIWEDRNVYPEDMIVALREALMDRAASHNARLQKLQCFPGTTFKTQKQLKENLNKQPNKQWKKSQTSTNPKAALKSKIVAEFRSQALIEELLMYKRSEDQIELKEKQLSTMRVDVCSTETLKCLKDKTGGKKFSKEFEEASSKLEEFVNGLDKQVKNGPSLTEALENAGIFYEAQYKEVKVVANAYKTFANRVNNLKKKLDQLKSTLPDPEESPVPSP-SMDAPSPTGSESPFQGMGGEEPQSPAMESDKSATPEPVTDNRDVEDMELSDVEDDGSKIIVEDRKEKPVEKPAVSTGVPTKSTESVSKASPCAPPSVPTTAAPPLPKPLSTALLSPSPTLVLPNLANVDLAKISSILSSLTSVMKNTGVSSASRPSPGIPTSPSNLSSGLKTPAPATTPSHNPLANILSKVEITPESILSALSKTQTQSAPALQGLSSLLQSVTANPVPASEVTSQSTTASPASTTGSAVKGRNLLSSTQSFIPKSFNYSPSSSTSEVSSTSASKASVGQSPVLPSTTFKLPSSSLGFTGTHNPSPAAPPTEVAVCQSSEVSKPKPESESTSPSLEMKIHNFLKGNPGFSGLNLNIPILSSLGSSAPSEGHASDFQRGPTSTSVDSIDGTPVRDERSGTPTQDEMMDKPTSSSVDTMSLLSKIISPGSSTPSSTRSPPPGRDESYPQELPNSVSTYRPFGLGSDSPYKQPSGGVERPSSLMDSSQEKLFPDTSFQEDEDYRDFEYSGPPPSAMMNLEKKPAKSILKSSKLSDATEYQPILSSYNHRAQEFGVKSAFPPSVRALLDSSENCDRLSSPPGLFGAFNIRGNEPGSERSPSPSKNDAFFTPDSNHSGLSQSTAGHLTLPQTQYPDSPHSVPHRSIFSSQSTLAAPAGHPPTSGVEKVLASTISTTSTIEFKNMLKNASRKPSDDKHFGQTPNKGTSSDGVSLSNLTQPSLPTTDQQQEEHYRIETRVSSSCLDLPDSTEEKGAPIETLGYHNAANRRMSGEPIKTVESIRVPGKGNRGHGREVSRVGWFDLSTPGSSFDNGPSSASELASLGGGGSGGLTGFKTTPYKERAPQFQESVTSFRSNSFNSTFEHHLPPSPLEHGAPFQREPVGPSSAPPAPPKDHGGIFSREAPTHLPSVDLSNPFTKEASLAHAGPPPPPGEHSGVPFPPPPPPPPPGELSSGGTGVPFATPAPPPPPVDHSGVVPFPTPPLPEHGVTGAVSVFPKDHSSLLQGTMAEHFGVLTGPRDLNGPGLNRSRESLSLPSHPLEHLGPALGGGGGGNTSSSGLPLSPAHRDAIGRSGMILRSPRPDFRPREAFLGRDPFHSLKRPRPPFVRGPPFFAPKRPFFPPRY 4 2 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TEELIKALQDLENAASGDATVRQKIASLPQEVQDVSLLEKITDKEAAERLSKTVDEACLLLAEYNGRLAAELEDRRQLARMLVEYTQNQKDVLSEKEKKLEEYKQKLARVTQVRKELKSHIQSLPDLS--LLPNVTGGLAPLPSAGD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.152}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4nad.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 4' 6 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 208 208 ? A -4.810 -16.240 99.638 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 2 C CA . SER 208 208 ? A -3.673 -15.323 100.008 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 3 C C . SER 208 208 ? A -3.038 -14.492 98.918 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 4 O O . SER 208 208 ? A -2.977 -13.282 99.082 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 5 C CB . SER 208 208 ? A -2.611 -16.109 100.790 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 6 O OG . SER 208 208 ? A -3.227 -16.838 101.848 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 7 N N . GLN 209 209 ? A -2.605 -15.062 97.768 1 1 A GLN 0.440 1 ATOM 8 C CA . GLN 209 209 ? A -1.989 -14.307 96.670 1 1 A GLN 0.440 1 ATOM 9 C C . GLN 209 209 ? A -2.800 -13.110 96.173 1 1 A GLN 0.440 1 ATOM 10 O O . GLN 209 209 ? A -2.296 -11.993 96.107 1 1 A GLN 0.440 1 ATOM 11 C CB . GLN 209 209 ? A -1.755 -15.289 95.497 1 1 A GLN 0.440 1 ATOM 12 C CG . GLN 209 209 ? A -1.027 -14.697 94.268 1 1 A GLN 0.440 1 ATOM 13 C CD . GLN 209 209 ? A 0.393 -14.229 94.596 1 1 A GLN 0.440 1 ATOM 14 O OE1 . GLN 209 209 ? A 1.114 -14.849 95.382 1 1 A GLN 0.440 1 ATOM 15 N NE2 . GLN 209 209 ? A 0.806 -13.111 93.968 1 1 A GLN 0.440 1 ATOM 16 N N . ALA 210 210 ? A -4.118 -13.314 95.959 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 17 C CA . ALA 210 210 ? A -5.086 -12.279 95.624 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 18 C C . ALA 210 210 ? A -5.067 -11.099 96.595 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 19 O O . ALA 210 210 ? A -4.983 -9.934 96.219 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 20 C CB . ALA 210 210 ? A -6.490 -12.928 95.679 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 21 N N . LEU 211 211 ? A -5.059 -11.417 97.903 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 22 C CA . LEU 211 211 ? A -5.034 -10.451 98.978 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 23 C C . LEU 211 211 ? A -3.768 -9.616 99.006 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 24 O O . LEU 211 211 ? A -3.817 -8.410 99.221 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 25 C CB . LEU 211 211 ? A -5.240 -11.170 100.337 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 26 C CG . LEU 211 211 ? A -5.465 -10.241 101.542 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 27 C CD1 . LEU 211 211 ? A -6.713 -9.382 101.337 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 28 C CD2 . LEU 211 211 ? A -5.604 -11.047 102.843 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 29 N N . ILE 212 212 ? A -2.588 -10.227 98.754 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 30 C CA . ILE 212 212 ? A -1.331 -9.494 98.647 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 31 C C . ILE 212 212 ? A -1.351 -8.487 97.507 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 32 O O . ILE 212 212 ? A -0.961 -7.332 97.681 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 33 C CB . ILE 212 212 ? A -0.132 -10.440 98.511 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 34 C CG1 . ILE 212 212 ? A 0.001 -11.278 99.806 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 35 C CG2 . ILE 212 212 ? A 1.171 -9.661 98.209 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 36 C CD1 . ILE 212 212 ? A 1.317 -12.053 99.934 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 37 N N . GLU 213 213 ? A -1.863 -8.879 96.326 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 38 C CA . GLU 213 213 ? A -1.997 -7.995 95.182 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 39 C C . GLU 213 213 ? A -2.922 -6.810 95.446 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 40 O O . GLU 213 213 ? A -2.547 -5.660 95.220 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 41 C CB . GLU 213 213 ? A -2.426 -8.818 93.941 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 42 C CG . GLU 213 213 ? A -1.326 -9.839 93.544 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 43 C CD . GLU 213 213 ? A -1.717 -10.844 92.464 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 44 O OE1 . GLU 213 213 ? A -2.623 -10.561 91.647 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 45 O OE2 . GLU 213 213 ? A -1.071 -11.925 92.452 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 46 N N . GLU 214 214 ? A -4.111 -7.033 96.039 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 47 C CA . GLU 214 214 ? A -5.008 -5.961 96.452 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 48 C C . GLU 214 214 ? A -4.405 -5.008 97.495 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 49 O O . GLU 214 214 ? A -4.521 -3.787 97.386 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 50 C CB . GLU 214 214 ? A -6.339 -6.563 96.958 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 51 C CG . GLU 214 214 ? A -7.181 -7.220 95.832 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 52 C CD . GLU 214 214 ? A -8.450 -7.897 96.350 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 53 O OE1 . GLU 214 214 ? A -8.606 -8.022 97.592 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 54 O OE2 . GLU 214 214 ? A -9.268 -8.311 95.487 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 55 N N . LEU 215 215 ? A -3.676 -5.537 98.500 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 56 C CA . LEU 215 215 ? A -2.929 -4.769 99.493 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 57 C C . LEU 215 215 ? A -1.842 -3.868 98.896 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 58 O O . LEU 215 215 ? A -1.681 -2.710 99.285 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 59 C CB . LEU 215 215 ? A -2.290 -5.760 100.514 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 60 C CG . LEU 215 215 ? A -2.842 -5.769 101.958 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 61 C CD1 . LEU 215 215 ? A -4.364 -5.630 102.045 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 62 C CD2 . LEU 215 215 ? A -2.436 -7.078 102.650 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 63 N N . LEU 216 216 ? A -1.069 -4.365 97.910 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 64 C CA . LEU 216 216 ? A -0.062 -3.592 97.193 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 65 C C . LEU 216 216 ? A -0.649 -2.448 96.383 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 66 O O . LEU 216 216 ? A -0.108 -1.340 96.351 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 67 C CB . LEU 216 216 ? A 0.794 -4.502 96.282 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 68 C CG . LEU 216 216 ? A 1.691 -5.488 97.062 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 69 C CD1 . LEU 216 216 ? A 2.215 -6.610 96.157 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 70 C CD2 . LEU 216 216 ? A 2.869 -4.790 97.757 1 1 A LEU 0.620 1 ATOM 71 N N . MET 217 217 ? 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LYS 259 259 ? A -5.481 29.982 82.968 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 417 N N . GLU 260 260 ? A -10.051 30.448 84.435 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 418 C CA . GLU 260 260 ? A -9.558 29.908 85.701 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 419 C C . GLU 260 260 ? A -10.559 28.949 86.305 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 420 O O . GLU 260 260 ? A -10.226 27.863 86.806 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 421 C CB . GLU 260 260 ? A -9.284 31.036 86.734 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 422 C CG . GLU 260 260 ? A -8.092 31.954 86.372 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 423 C CD . GLU 260 260 ? A -7.832 32.984 87.460 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 424 O OE1 . GLU 260 260 ? A -7.556 32.567 88.618 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 425 O OE2 . GLU 260 260 ? A -7.890 34.212 87.188 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 426 N N . PHE 261 261 ? A -11.838 29.314 86.230 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 427 C CA . PHE 261 261 ? A -12.963 28.542 86.693 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 428 C C . PHE 261 261 ? A -13.095 27.246 85.911 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 429 O O . PHE 261 261 ? A -13.288 26.179 86.483 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 430 C CB . PHE 261 261 ? A -14.276 29.366 86.608 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 431 C CG . PHE 261 261 ? A -14.232 30.711 87.310 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 432 C CD1 . PHE 261 261 ? A -13.173 31.191 88.117 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 433 C CD2 . PHE 261 261 ? A -15.340 31.549 87.134 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 434 C CE1 . PHE 261 261 ? A -13.233 32.443 88.737 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 435 C CE2 . PHE 261 261 ? A -15.386 32.802 87.751 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 436 C CZ . PHE 261 261 ? A -14.366 33.229 88.592 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 437 N N . GLU 262 262 ? A -12.931 27.288 84.576 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 438 C CA . GLU 262 262 ? A -12.985 26.113 83.730 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 439 C C . GLU 262 262 ? A -11.925 25.069 84.053 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 440 O O . GLU 262 262 ? A -12.227 23.887 84.231 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 441 C CB . GLU 262 262 ? A -12.852 26.573 82.263 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 442 C CG . GLU 262 262 ? A -13.013 25.452 81.212 1 1 A GLU 0.770 1 ATOM 443 C CD . GLU 262 262 ? 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A -12.058 15.310 87.585 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 499 C CA . GLU 270 270 ? A -11.104 14.215 87.491 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 500 C C . GLU 270 270 ? A -10.641 13.690 88.841 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 501 O O . GLU 270 270 ? A -10.543 12.476 89.047 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 502 C CB . GLU 270 270 ? A -9.884 14.616 86.637 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 503 C CG . GLU 270 270 ? A -10.218 14.814 85.139 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 504 C CD . GLU 270 270 ? A -8.977 15.119 84.304 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 505 O OE1 . GLU 270 270 ? A -7.912 15.447 84.892 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 506 O OE2 . GLU 270 270 ? A -9.084 14.994 83.059 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 507 N N . PHE 271 271 ? A -10.372 14.573 89.826 1 1 A PHE 0.750 1 ATOM 508 C CA . PHE 271 271 ? A -10.033 14.138 91.171 1 1 A PHE 0.750 1 ATOM 509 C C . PHE 271 271 ? A -11.170 13.375 91.854 1 1 A PHE 0.750 1 ATOM 510 O O . PHE 271 271 ? A -10.949 12.313 92.415 1 1 A PHE 0.750 1 ATOM 511 C CB . PHE 271 271 ? A -9.539 15.332 92.032 1 1 A PHE 0.750 1 ATOM 512 C CG . PHE 271 271 ? A -9.069 14.897 93.398 1 1 A PHE 0.750 1 ATOM 513 C CD1 . PHE 271 271 ? A -9.906 15.078 94.510 1 1 A PHE 0.750 1 ATOM 514 C CD2 . PHE 271 271 ? A -7.823 14.271 93.577 1 1 A PHE 0.750 1 ATOM 515 C CE1 . PHE 271 271 ? A -9.525 14.603 95.768 1 1 A PHE 0.750 1 ATOM 516 C CE2 . PHE 271 271 ? A -7.436 13.802 94.841 1 1 A PHE 0.750 1 ATOM 517 C CZ . PHE 271 271 ? A -8.295 13.958 95.936 1 1 A PHE 0.750 1 ATOM 518 N N . VAL 272 272 ? A -12.429 13.863 91.756 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 519 C CA . VAL 272 272 ? A -13.571 13.133 92.310 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 520 C C . VAL 272 272 ? A -13.761 11.778 91.649 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 521 O O . VAL 272 272 ? A -13.992 10.760 92.337 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 522 C CB . VAL 272 272 ? A -14.859 13.944 92.189 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 523 C CG1 . VAL 272 272 ? A -16.090 13.111 92.601 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 524 C CG2 . VAL 272 272 ? A -14.780 15.199 93.081 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 525 N N . ASN 273 273 ? A -13.595 11.657 90.330 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 526 C CA . ASN 273 273 ? A -13.609 10.382 89.635 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 527 C C . ASN 273 273 ? A -12.543 9.392 90.104 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 528 O O . ASN 273 273 ? A -12.788 8.196 90.182 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 529 C CB . ASN 273 273 ? A -13.367 10.553 88.121 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 530 C CG . ASN 273 273 ? A -14.529 11.261 87.445 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 531 O OD1 . ASN 273 273 ? A -15.684 11.162 87.851 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 532 N ND2 . ASN 273 273 ? A -14.229 11.929 86.309 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 533 N N . GLY 274 274 ? A -11.304 9.849 90.397 1 1 A GLY 0.780 1 ATOM 534 C CA . GLY 274 274 ? A -10.288 8.958 90.959 1 1 A GLY 0.780 1 ATOM 535 C C . GLY 274 274 ? A -10.568 8.564 92.387 1 1 A GLY 0.780 1 ATOM 536 O O . GLY 274 274 ? A -10.344 7.418 92.777 1 1 A GLY 0.780 1 ATOM 537 N N . LEU 275 275 ? A -11.090 9.498 93.197 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 538 C CA . LEU 275 275 ? A -11.442 9.266 94.582 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 539 C C . LEU 275 275 ? A -12.612 8.308 94.759 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 540 O O . 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ASN 319 319 ? A 3.643 -45.589 126.478 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 887 C C . ASN 319 319 ? A 4.251 -46.897 126.012 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 888 O O . ASN 319 319 ? A 4.601 -47.762 126.815 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 889 C CB . ASN 319 319 ? A 2.104 -45.681 126.373 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 890 C CG . ASN 319 319 ? A 1.472 -44.568 127.200 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 891 O OD1 . ASN 319 319 ? A 2.028 -44.100 128.193 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 892 N ND2 . ASN 319 319 ? A 0.243 -44.164 126.810 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 893 N N . LEU 320 320 ? A 4.407 -47.063 124.689 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 894 C CA . LEU 320 320 ? A 5.054 -48.218 124.124 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 895 C C . LEU 320 320 ? A 6.511 -48.340 124.498 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 896 O O . LEU 320 320 ? A 6.947 -49.412 124.911 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 897 C CB . LEU 320 320 ? A 4.896 -48.189 122.599 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 898 C CG . LEU 320 320 ? A 5.361 -49.470 121.917 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 899 C CD1 . LEU 320 320 ? 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LYS 322 322 ? A 8.575 -49.923 129.523 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 914 C CB . LYS 322 322 ? A 7.281 -46.924 129.542 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 915 C CG . LYS 322 322 ? A 7.778 -45.495 129.764 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 916 C CD . LYS 322 322 ? A 6.995 -44.829 130.899 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 917 C CE . LYS 322 322 ? A 7.468 -43.412 131.206 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 918 N NZ . LYS 322 322 ? A 7.189 -42.535 130.047 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 919 N N . LYS 323 323 ? A 6.820 -49.712 128.152 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 920 C CA . LYS 323 323 ? A 6.473 -51.116 128.264 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 921 C C . LYS 323 323 ? A 7.481 -52.000 127.537 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 922 O O . LYS 323 323 ? A 7.728 -53.136 127.927 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 923 C CB . LYS 323 323 ? A 5.023 -51.373 127.792 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 924 C CG . LYS 323 323 ? A 3.985 -50.635 128.657 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 925 C CD . LYS 323 323 ? A 2.545 -50.936 128.217 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 926 C CE . LYS 323 323 ? 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A 10.114 -60.374 129.599 1 1 A THR 0.480 1 ATOM 981 O OG1 . THR 330 330 ? A 9.866 -59.355 130.556 1 1 A THR 0.480 1 ATOM 982 C CG2 . THR 330 330 ? A 9.026 -61.435 129.801 1 1 A THR 0.480 1 ATOM 983 N N . LEU 331 331 ? A 12.916 -61.656 127.974 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 984 C CA . LEU 331 331 ? A 13.316 -62.435 126.825 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 985 C C . LEU 331 331 ? A 14.720 -62.961 127.015 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 986 O O . LEU 331 331 ? A 15.575 -62.189 127.469 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 987 C CB . LEU 331 331 ? A 13.291 -61.571 125.541 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 988 C CG . LEU 331 331 ? A 11.874 -61.314 124.998 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 989 C CD1 . LEU 331 331 ? A 11.840 -60.090 124.074 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 990 C CD2 . LEU 331 331 ? A 11.348 -62.550 124.260 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 991 N N . PRO 332 332 ? A 15.040 -64.229 126.693 1 1 A PRO 0.430 1 ATOM 992 C CA . PRO 332 332 ? A 16.420 -64.677 126.755 1 1 A PRO 0.430 1 ATOM 993 C C . PRO 332 332 ? A 17.302 -63.901 125.811 1 1 A PRO 0.430 1 ATOM 994 O O . PRO 332 332 ? A 16.839 -63.416 124.782 1 1 A PRO 0.430 1 ATOM 995 C CB . PRO 332 332 ? A 16.328 -66.166 126.425 1 1 A PRO 0.430 1 ATOM 996 C CG . PRO 332 332 ? A 15.183 -66.274 125.414 1 1 A PRO 0.430 1 ATOM 997 C CD . PRO 332 332 ? A 14.273 -65.076 125.753 1 1 A PRO 0.430 1 ATOM 998 N N . ASP 333 333 ? A 18.575 -63.725 126.148 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 999 C CA . ASP 333 333 ? A 19.459 -62.916 125.361 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 1000 C C . ASP 333 333 ? A 20.001 -63.679 124.132 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 1001 O O . ASP 333 333 ? A 20.313 -64.861 124.246 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 1002 C CB . ASP 333 333 ? A 20.532 -62.337 126.301 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 1003 C CG . ASP 333 333 ? A 21.234 -61.143 125.696 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 1004 O OD1 . ASP 333 333 ? A 22.066 -61.360 124.787 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 1005 O OD2 . ASP 333 333 ? A 20.861 -60.006 126.094 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 1006 N N . PRO 334 334 ? 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B -2.990 -6.842 106.502 1 1 B LEU 0.670 1 ATOM 1073 N N . ILE 212 212 ? B 1.855 -7.436 104.968 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 1074 C CA . ILE 212 212 ? B 2.408 -8.159 103.836 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 1075 C C . ILE 212 212 ? B 3.555 -9.086 104.223 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 1076 O O . ILE 212 212 ? B 3.600 -10.215 103.800 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 1077 C CB . ILE 212 212 ? B 2.798 -7.228 102.687 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 1078 C CG1 . ILE 212 212 ? B 1.520 -6.560 102.130 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 1079 C CG2 . ILE 212 212 ? B 3.540 -7.995 101.569 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 1080 C CD1 . ILE 212 212 ? B 1.733 -5.801 100.818 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 1081 N N . GLU 213 213 ? B 4.491 -8.631 105.093 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 1082 C CA . GLU 213 213 ? B 5.570 -9.488 105.570 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 1083 C C . GLU 213 213 ? B 5.063 -10.675 106.363 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 1084 O O . GLU 213 213 ? B 5.407 -11.827 106.055 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 1085 C CB . GLU 213 213 ? B 6.607 -8.646 106.347 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 1086 C CG . GLU 213 213 ? B 7.287 -7.641 105.387 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 1087 C CD . GLU 213 213 ? B 8.222 -6.638 106.048 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 1088 O OE1 . GLU 213 213 ? B 8.691 -6.876 107.184 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 1089 O OE2 . GLU 213 213 ? B 8.471 -5.602 105.373 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 1090 N N . GLU 214 214 ? B 4.130 -10.481 107.305 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 1091 C CA . GLU 214 214 ? B 3.461 -11.569 107.995 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 1092 C C . GLU 214 214 ? B 2.702 -12.515 107.040 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 1093 O O . GLU 214 214 ? B 2.781 -13.734 107.150 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 1094 C CB . GLU 214 214 ? B 2.564 -11.006 109.122 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 1095 C CG . GLU 214 214 ? B 3.369 -10.324 110.266 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 1096 C CD . GLU 214 214 ? B 2.485 -9.677 111.333 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 1097 O OE1 . GLU 214 214 ? B 1.250 -9.598 111.122 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 1098 O OE2 . GLU 214 214 ? B 3.058 -9.245 112.367 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 1099 N N . LEU 215 215 ? B 2.034 -11.968 106.002 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1100 C CA . LEU 215 215 ? B 1.396 -12.729 104.930 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1101 C C . LEU 215 215 ? B 2.401 -13.423 104.015 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1102 O O . LEU 215 215 ? B 2.077 -14.368 103.281 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1103 C CB . LEU 215 215 ? B 0.522 -11.776 104.065 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1104 C CG . LEU 215 215 ? B -1.005 -11.983 104.147 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1105 C CD1 . LEU 215 215 ? B -1.510 -12.241 105.566 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1106 C CD2 . LEU 215 215 ? B -1.736 -10.751 103.595 1 1 B LEU 0.640 1 ATOM 1107 N N . LEU 216 216 ? B 3.661 -13.085 103.927 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1108 C CA . LEU 216 216 ? B 4.614 -13.808 103.094 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1109 C C . LEU 216 216 ? B 5.273 -14.932 103.883 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1110 O O . LEU 216 216 ? B 5.770 -15.909 103.340 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1111 C CB . LEU 216 216 ? B 5.699 -12.850 102.533 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1112 C CG . LEU 216 216 ? B 5.198 -11.856 101.452 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1113 C CD1 . LEU 216 216 ? B 6.135 -10.658 101.189 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1114 C CD2 . LEU 216 216 ? B 4.895 -12.580 100.135 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1115 N N . MET 217 217 ? B 5.186 -14.858 105.224 1 1 B MET 0.620 1 ATOM 1116 C CA . MET 217 217 ? B 5.686 -15.901 106.094 1 1 B MET 0.620 1 ATOM 1117 C C . MET 217 217 ? B 4.648 -16.976 106.431 1 1 B MET 0.620 1 ATOM 1118 O O . MET 217 217 ? B 4.886 -17.847 107.266 1 1 B MET 0.620 1 ATOM 1119 C CB . MET 217 217 ? B 6.333 -15.284 107.357 1 1 B MET 0.620 1 ATOM 1120 C CG . MET 217 217 ? B 7.550 -14.378 107.044 1 1 B MET 0.620 1 ATOM 1121 S SD . MET 217 217 ? B 8.915 -15.145 106.107 1 1 B MET 0.620 1 ATOM 1122 C CE . MET 217 217 ? B 9.546 -16.205 107.439 1 1 B MET 0.620 1 ATOM 1123 N N . TYR 218 218 ? B 3.492 -17.037 105.727 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 1124 C CA . TYR 218 218 ? B 2.703 -18.267 105.755 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 1125 C C . TYR 218 218 ? B 3.231 -19.267 104.712 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 1126 O O . TYR 218 218 ? B 3.114 -20.479 104.872 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 1127 C CB . TYR 218 218 ? B 1.165 -18.039 105.658 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 1128 C CG . TYR 218 218 ? B 0.702 -17.843 104.261 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 1129 C CD1 . TYR 218 218 ? B 0.574 -16.586 103.711 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 1130 C CD2 . TYR 218 218 ? B 0.481 -18.960 103.464 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 1131 C CE1 . TYR 218 218 ? B 0.313 -16.420 102.336 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 1132 C CE2 . TYR 218 218 ? B 0.290 -18.826 102.094 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 1133 C CZ . TYR 218 218 ? B 0.235 -17.564 101.524 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 1134 O OH . TYR 218 218 ? B 0.175 -17.506 100.127 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 1135 N N . LYS 219 219 ? B 3.841 -18.781 103.604 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 1136 C CA . LYS 219 219 ? B 4.269 -19.598 102.470 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 1137 C C . LYS 219 219 ? B 5.327 -20.618 102.842 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 1138 O O . LYS 219 219 ? B 5.291 -21.779 102.451 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 1139 C CB . LYS 219 219 ? B 4.833 -18.699 101.338 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 1140 C CG . LYS 219 219 ? B 5.254 -19.456 100.064 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 1141 C CD . LYS 219 219 ? B 5.818 -18.508 98.994 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 1142 C CE . LYS 219 219 ? B 6.221 -19.253 97.720 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 1143 N NZ . LYS 219 219 ? B 6.690 -18.300 96.689 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 1144 N N . ARG 220 220 ? B 6.300 -20.197 103.664 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 1145 C CA . ARG 220 220 ? B 7.334 -21.072 104.172 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 1146 C C . ARG 220 220 ? B 6.956 -21.563 105.569 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 1147 O O . ARG 220 220 ? B 7.795 -22.039 106.326 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 1148 C CB . ARG 220 220 ? B 8.713 -20.366 104.143 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 1149 C CG . ARG 220 220 ? B 9.196 -20.006 102.715 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 1150 C CD . ARG 220 220 ? B 10.587 -19.357 102.715 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 1151 N NE . ARG 220 220 ? B 10.976 -19.039 101.299 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 1152 C CZ . ARG 220 220 ? B 12.114 -18.407 100.976 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 1153 N NH1 . ARG 220 220 ? B 12.980 -18.013 101.904 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 1154 N NH2 . ARG 220 220 ? B 12.391 -18.160 99.698 1 1 B ARG 0.470 1 ATOM 1155 N N . SER 221 221 ? B 5.654 -21.488 105.933 1 1 B SER 0.580 1 ATOM 1156 C CA . SER 221 221 ? B 5.099 -22.272 107.036 1 1 B SER 0.580 1 ATOM 1157 C C . SER 221 221 ? B 4.538 -23.585 106.493 1 1 B SER 0.580 1 ATOM 1158 O O . SER 221 221 ? B 4.301 -24.518 107.255 1 1 B SER 0.580 1 ATOM 1159 C CB . SER 221 221 ? B 3.943 -21.582 107.825 1 1 B SER 0.580 1 ATOM 1160 O OG . SER 221 221 ? B 4.398 -20.495 108.634 1 1 B SER 0.580 1 ATOM 1161 N N . GLU 222 222 ? B 4.377 -23.718 105.153 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 1162 C CA . GLU 222 222 ? B 4.115 -24.984 104.489 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 1163 C C . GLU 222 222 ? B 5.440 -25.716 104.277 1 1 B GLU 0.500 1 ATOM 1164 O O . GLU 222 222 ? 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B 9.871 -26.459 101.725 1 1 B ASP 0.470 1 ATOM 1178 N N . GLN 224 224 ? B 8.105 -27.888 104.446 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 1179 C CA . GLN 224 224 ? B 8.457 -29.117 105.112 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 1180 C C . GLN 224 224 ? B 7.296 -30.006 105.553 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 1181 O O . GLN 224 224 ? B 7.501 -31.189 105.831 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 1182 C CB . GLN 224 224 ? B 9.316 -28.758 106.347 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 1183 C CG . GLN 224 224 ? B 8.550 -28.021 107.474 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 1184 C CD . GLN 224 224 ? B 9.495 -27.678 108.624 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 1185 O OE1 . GLN 224 224 ? B 10.191 -28.553 109.165 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 1186 N NE2 . GLN 224 224 ? B 9.514 -26.381 109.007 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 1187 N N . ILE 225 225 ? B 6.068 -29.442 105.645 1 1 B ILE 0.580 1 ATOM 1188 C CA . ILE 225 225 ? B 4.824 -30.081 106.067 1 1 B ILE 0.580 1 ATOM 1189 C C . ILE 225 225 ? B 4.586 -31.493 105.533 1 1 B ILE 0.580 1 ATOM 1190 O O . ILE 225 225 ? 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B 5.875 -41.639 109.127 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 1243 C CB . GLN 231 231 ? B 7.948 -39.427 107.878 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 1244 C CG . GLN 231 231 ? B 8.929 -39.189 106.704 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 1245 C CD . GLN 231 231 ? B 10.200 -38.491 107.190 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 1246 O OE1 . GLN 231 231 ? B 10.260 -37.904 108.269 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 1247 N NE2 . GLN 231 231 ? B 11.283 -38.588 106.388 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 1248 N N . LEU 232 232 ? B 5.098 -39.525 109.335 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1249 C CA . LEU 232 232 ? B 4.161 -39.748 110.421 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1250 C C . LEU 232 232 ? B 2.876 -40.491 110.033 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1251 O O . LEU 232 232 ? B 2.412 -41.360 110.757 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1252 C CB . LEU 232 232 ? B 3.797 -38.401 111.082 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1253 C CG . LEU 232 232 ? B 4.988 -37.638 111.700 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1254 C CD1 . LEU 232 232 ? B 4.505 -36.316 112.301 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 1255 C CD2 . LEU 232 232 ? 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B -17.153 51.907 70.011 1 1 B PRO 0.330 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 4 QSQE 'Global Quaternary Structure Quality Estimate predicts the expected accuracy of the modelled interfaces.' 'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.635 2 1 3 0.033 3 1 4 0.152 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 208 SER 1 0.460 2 1 A 209 GLN 1 0.440 3 1 A 210 ALA 1 0.770 4 1 A 211 LEU 1 0.670 5 1 A 212 ILE 1 0.680 6 1 A 213 GLU 1 0.680 7 1 A 214 GLU 1 0.670 8 1 A 215 LEU 1 0.650 9 1 A 216 LEU 1 0.620 10 1 A 217 MET 1 0.600 11 1 A 218 TYR 1 0.540 12 1 A 219 LYS 1 0.500 13 1 A 220 ARG 1 0.460 14 1 A 221 SER 1 0.590 15 1 A 222 GLU 1 0.500 16 1 A 223 ASP 1 0.470 17 1 A 224 GLN 1 0.550 18 1 A 225 ILE 1 0.570 19 1 A 226 GLU 1 0.600 20 1 A 227 LEU 1 0.620 21 1 A 228 LYS 1 0.640 22 1 A 229 GLU 1 0.670 23 1 A 230 LYS 1 0.630 24 1 A 231 GLN 1 0.670 25 1 A 232 LEU 1 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