data_SMR-b99d5f454e627e40999dca6504b8c938_10 _entry.id SMR-b99d5f454e627e40999dca6504b8c938_10 _struct.entry_id SMR-b99d5f454e627e40999dca6504b8c938_10 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O15078/ CE290_HUMAN, Centrosomal protein of 290 kDa Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O15078' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.5 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 335516.654 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CE290_HUMAN O15078 1 ;MPPNINWKEIMKVDPDDLPRQEELADNLLISLSKVEVNELKSEKQENVIHLFRITQSLMKMKAQEVELAL EEVEKAGEEQAKFENQLKTKVMKLENELEMAQQSAGGRDTRFLRNEICQLEKQLEQKDRELEDMEKELEK EKKVNEQLALRNEEAENENSKLRRENKRLKKKNEQLCQDIIDYQKQIDSQKETLLSRRGEDSDYRSQLSK KNYELIQYLDEIQTLTEANEKIEVQNQEMRKNLEESVQEMEKMTDEYNRMKAIVHQTDNVIDQLKKENDH YQLQVQELTDLLKSKNEEDDPIMVAVNAKVEEWKLILSSKDDEIIEYQQMLHNLREKLKNAQLDADKSNV MALQQGIQERDSQIKMLTEQVEQYTKEMEKNTCIIEDLKNELQRNKGASTLSQQTHMKIQSTLDILKEKT KEAERTAELAEADAREKDKELVEALKRLKDYESGVYGLEDAVVEIKNCKNQIKIRDREIEILTKEINKLE LKISDFLDENEALRERVGLEPKTMIDLTEFRNSKHLKQQQYRAENQILLKEIESLEEERLDLKKKIRQMA QERGKRSATSGLTTEDLNLTENISQGDRISERKLDLLSLKNMSEAQSKNEFLSRELIEKERDLERSRTVI AKFQNKLKELVEENKQLEEGMKEILQAIKEMQKDPDVKGGETSLIIPSLERLVNAIESKNAEGIFDASLH LKAQVDQLTGRNEELRQELRESRKEAINYSQQLAKANLKIDHLEKETSLLRQSEGSNVVFKGIDLPDGIA PSSASIINSQNEYLIHLLQELENKEKKLKNLEDSLEDYNRKFAVIRHQQSLLYKEYLSEKETWKTESKTI KEEKRKLEDQVQQDAIKVKEYNNLLNALQMDSDEMKKILAENSRKITVLQVNEKSLIRQYTTLVELERQL RKENEKQKNELLSMEAEVCEKIGCLQRFKEMAIFKIAALQKVVDNSVSLSELELANKQYNELTAKYRDIL QKDNMLVQRTSNLEHLECENISLKEQVESINKELEITKEKLHTIEQAWEQETKLGNESSMDKAKKSITNS DIVSISKKITMLEMKELNERQRAEHCQKMYEHLRTSLKQMEERNFELETKFAELTKINLDAQKVEQMLRD ELADSVSKAVSDADRQRILELEKNEMELKVEVSKLREISDIARRQVEILNAQQQSRDKEVESLRMQLLDY QAQSDEKSLIAKLHQHNVSLQLSEATALGKLESITSKLQKMEAYNLRLEQKLDEKEQALYYARLEGRNRA KHLRQTIQSLRRQFSGALPLAQQEKFSKTMIQLQNDKLKIMQEMKNSQQEHRNMENKTLEMELKLKGLEE LISTLKDTKGAQKVINWHMKIEELRLQELKLNRELVKDKEEIKYLNNIISEYERTISSLEEEIVQQNKFH EERQMAWDQREVDLERQLDIFDRQQNEILNAAQKFEEATGSIPDPSLPLPNQLEIALRKIKENIRIILET RATCKSLEEKLKEKESALRLAEQNILSRDKVINELRLRLPATAEREKLIAELGRKEMEPKSHHTLKIAHQ TIANMQARLNQKEEVLKKYQRLLEKAREEQREIVKKHEEDLHILHHRLELQADSSLNKFKQTAWDLMKQS PTPVPTNKHFIRLAEMEQTVAEQDDSLSSLLVKLKKVSQDLERQREITELKVKEFENIKLQLQENHEDEV KKVKAEVEDLKYLLDQSQKESQCLKSELQAQKEANSRAPTTTMRNLVERLKSQLALKEKQQKALSRALLE LRAEMTAAAEERIISATSQKEAHLNVQQIVDRHTRELKTQVEDLNENLLKLKEALKTSKNRENSLTDNLN DLNNELQKKQKAYNKILREKEEIDQENDELKRQIKRLTSGLQGKPLTDNKQSLIEELQRKVKKLENQLEG KVEEVDLKPMKEKNAKEELIRWEEGKKWQAKIEGIRNKLKEKEGEVFTLTKQLNTLKDLFAKADKEKLTL QRKLKTTGMTVDQVLGIRALESEKELEELKKRNLDLENDILYMRAHQALPRDSVVEDLHLQNRYLQEKLH ALEKQFSKDTYSKPSISGIESDDHCQREQELQKENLKLSSENIELKFQLEQANKDLPRLKNQVRDLKEMC EFLKKEKAEVQRKLGHVRGSGRSGKTIPELEKTIGLMKKVVEKVQRENEQLKKASGILTSEKMANIEQEN EKLKAELEKLKAHLGHQLSMHYESKTKGTEKIIAENERLRKELKKETDAAEKLRIAKNNLEILNEKMTVQ LEETGKRLQFAESRGPQLEGADSKSWKSIVVTRMYETKLKELETDIAKKNQSITDLKQLVKEATEREQKV NKYNEDLEQQIKILKHVPEGAETEQGLKRELQVLRLANHQLDKEKAELIHQIEANKDQSGAESTIPDADQ LKEKIKDLETQLKMSDLEKQHLKEEIKKLKKELENFDPSFFEEIEDLKYNYKEEVKKNILLEEKVKKLSE QLGVELTSPVAASEEFEDEEESPVNFPIY ; 'Centrosomal protein of 290 kDa' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2479 1 2479 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . CE290_HUMAN O15078 . 1 2479 9606 'Homo sapiens (Human)' 2006-10-17 7CA87D53FAF036FC . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no J ;MPPNINWKEIMKVDPDDLPRQEELADNLLISLSKVEVNELKSEKQENVIHLFRITQSLMKMKAQEVELAL EEVEKAGEEQAKFENQLKTKVMKLENELEMAQQSAGGRDTRFLRNEICQLEKQLEQKDRELEDMEKELEK EKKVNEQLALRNEEAENENSKLRRENKRLKKKNEQLCQDIIDYQKQIDSQKETLLSRRGEDSDYRSQLSK KNYELIQYLDEIQTLTEANEKIEVQNQEMRKNLEESVQEMEKMTDEYNRMKAIVHQTDNVIDQLKKENDH YQLQVQELTDLLKSKNEEDDPIMVAVNAKVEEWKLILSSKDDEIIEYQQMLHNLREKLKNAQLDADKSNV MALQQGIQERDSQIKMLTEQVEQYTKEMEKNTCIIEDLKNELQRNKGASTLSQQTHMKIQSTLDILKEKT KEAERTAELAEADAREKDKELVEALKRLKDYESGVYGLEDAVVEIKNCKNQIKIRDREIEILTKEINKLE LKISDFLDENEALRERVGLEPKTMIDLTEFRNSKHLKQQQYRAENQILLKEIESLEEERLDLKKKIRQMA QERGKRSATSGLTTEDLNLTENISQGDRISERKLDLLSLKNMSEAQSKNEFLSRELIEKERDLERSRTVI AKFQNKLKELVEENKQLEEGMKEILQAIKEMQKDPDVKGGETSLIIPSLERLVNAIESKNAEGIFDASLH LKAQVDQLTGRNEELRQELRESRKEAINYSQQLAKANLKIDHLEKETSLLRQSEGSNVVFKGIDLPDGIA PSSASIINSQNEYLIHLLQELENKEKKLKNLEDSLEDYNRKFAVIRHQQSLLYKEYLSEKETWKTESKTI KEEKRKLEDQVQQDAIKVKEYNNLLNALQMDSDEMKKILAENSRKITVLQVNEKSLIRQYTTLVELERQL RKENEKQKNELLSMEAEVCEKIGCLQRFKEMAIFKIAALQKVVDNSVSLSELELANKQYNELTAKYRDIL QKDNMLVQRTSNLEHLECENISLKEQVESINKELEITKEKLHTIEQAWEQETKLGNESSMDKAKKSITNS DIVSISKKITMLEMKELNERQRAEHCQKMYEHLRTSLKQMEERNFELETKFAELTKINLDAQKVEQMLRD ELADSVSKAVSDADRQRILELEKNEMELKVEVSKLREISDIARRQVEILNAQQQSRDKEVESLRMQLLDY QAQSDEKSLIAKLHQHNVSLQLSEATALGKLESITSKLQKMEAYNLRLEQKLDEKEQALYYARLEGRNRA KHLRQTIQSLRRQFSGALPLAQQEKFSKTMIQLQNDKLKIMQEMKNSQQEHRNMENKTLEMELKLKGLEE LISTLKDTKGAQKVINWHMKIEELRLQELKLNRELVKDKEEIKYLNNIISEYERTISSLEEEIVQQNKFH EERQMAWDQREVDLERQLDIFDRQQNEILNAAQKFEEATGSIPDPSLPLPNQLEIALRKIKENIRIILET RATCKSLEEKLKEKESALRLAEQNILSRDKVINELRLRLPATAEREKLIAELGRKEMEPKSHHTLKIAHQ TIANMQARLNQKEEVLKKYQRLLEKAREEQREIVKKHEEDLHILHHRLELQADSSLNKFKQTAWDLMKQS 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EEVEKAGEEQAKFENQLKTKVMKLENELEMAQQSAGGRDTRFLRNEICQLEKQLEQKDRELEDMEKELEK EKKVNEQLALRNEEAENENSKLRRENKRLKKKNEQLCQDIIDYQKQIDSQKETLLSRRGEDSDYRSQLSK KNYELIQYLDEIQTLTEANEKIEVQNQEMRKNLEESVQEMEKMTDEYNRMKAIVHQTDNVIDQLKKENDH YQLQVQELTDLLKSKNEEDDPIMVAVNAKVEEWKLILSSKDDEIIEYQQMLHNLREKLKNAQLDADKSNV MALQQGIQERDSQIKMLTEQVEQYTKEMEKNTCIIEDLKNELQRNKGASTLSQQTHMKIQSTLDILKEKT KEAERTAELAEADAREKDKELVEALKRLKDYESGVYGLEDAVVEIKNCKNQIKIRDREIEILTKEINKLE LKISDFLDENEALRERVGLEPKTMIDLTEFRNSKHLKQQQYRAENQILLKEIESLEEERLDLKKKIRQMA QERGKRSATSGLTTEDLNLTENISQGDRISERKLDLLSLKNMSEAQSKNEFLSRELIEKERDLERSRTVI AKFQNKLKELVEENKQLEEGMKEILQAIKEMQKDPDVKGGETSLIIPSLERLVNAIESKNAEGIFDASLH LKAQVDQLTGRNEELRQELRESRKEAINYSQQLAKANLKIDHLEKETSLLRQSEGSNVVFKGIDLPDGIA PSSASIINSQNEYLIHLLQELENKEKKLKNLEDSLEDYNRKFAVIRHQQSLLYKEYLSEKETWKTESKTI KEEKRKLEDQVQQDAIKVKEYNNLLNALQMDSDEMKKILAENSRKITVLQVNEKSLIRQYTTLVELERQL RKENEKQKNELLSMEAEVCEKIGCLQRFKEMAIFKIAALQKVVDNSVSLSELELANKQYNELTAKYRDIL QKDNMLVQRTSNLEHLECENISLKEQVESINKELEITKEKLHTIEQAWEQETKLGNESSMDKAKKSITNS 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A 1 2221 GLU 2221 ? ? ? J . A 1 2222 LYS 2222 ? ? ? J . A 1 2223 LEU 2223 ? ? ? J . A 1 2224 ARG 2224 ? ? ? J . A 1 2225 ILE 2225 ? ? ? J . A 1 2226 ALA 2226 ? ? ? J . A 1 2227 LYS 2227 ? ? ? J . A 1 2228 ASN 2228 ? ? ? J . A 1 2229 ASN 2229 ? ? ? J . A 1 2230 LEU 2230 ? ? ? J . A 1 2231 GLU 2231 ? ? ? J . A 1 2232 ILE 2232 ? ? ? J . A 1 2233 LEU 2233 ? ? ? J . A 1 2234 ASN 2234 ? ? ? J . A 1 2235 GLU 2235 ? ? ? J . A 1 2236 LYS 2236 ? ? ? J . A 1 2237 MET 2237 ? ? ? J . A 1 2238 THR 2238 ? ? ? J . A 1 2239 VAL 2239 ? ? ? J . A 1 2240 GLN 2240 ? ? ? J . A 1 2241 LEU 2241 ? ? ? J . A 1 2242 GLU 2242 ? ? ? J . A 1 2243 GLU 2243 ? ? ? J . A 1 2244 THR 2244 ? ? ? J . A 1 2245 GLY 2245 ? ? ? J . A 1 2246 LYS 2246 ? ? ? J . A 1 2247 ARG 2247 ? ? ? J . A 1 2248 LEU 2248 ? ? ? J . A 1 2249 GLN 2249 ? ? ? J . A 1 2250 PHE 2250 ? ? ? J . A 1 2251 ALA 2251 ? ? ? J . A 1 2252 GLU 2252 ? ? ? J . A 1 2253 SER 2253 ? ? ? J . A 1 2254 ARG 2254 ? ? ? J . A 1 2255 GLY 2255 ? ? ? J . A 1 2256 PRO 2256 ? ? ? J . A 1 2257 GLN 2257 ? ? ? J . A 1 2258 LEU 2258 ? ? ? J . A 1 2259 GLU 2259 ? ? ? J . A 1 2260 GLY 2260 ? ? ? J . A 1 2261 ALA 2261 ? ? ? J . A 1 2262 ASP 2262 ? ? ? J . A 1 2263 SER 2263 ? ? ? J . A 1 2264 LYS 2264 ? ? ? J . A 1 2265 SER 2265 ? ? ? J . A 1 2266 TRP 2266 ? ? ? J . A 1 2267 LYS 2267 ? ? ? J . A 1 2268 SER 2268 ? ? ? J . A 1 2269 ILE 2269 ? ? ? J . A 1 2270 VAL 2270 ? ? ? J . A 1 2271 VAL 2271 ? ? ? J . A 1 2272 THR 2272 ? ? ? J . A 1 2273 ARG 2273 ? ? ? J . A 1 2274 MET 2274 ? ? ? J . A 1 2275 TYR 2275 ? ? ? J . A 1 2276 GLU 2276 ? ? ? J . A 1 2277 THR 2277 ? ? ? J . A 1 2278 LYS 2278 ? ? ? J . A 1 2279 LEU 2279 ? ? ? J . A 1 2280 LYS 2280 ? ? ? J . A 1 2281 GLU 2281 ? ? ? J . A 1 2282 LEU 2282 ? ? ? J . A 1 2283 GLU 2283 ? ? ? J . A 1 2284 THR 2284 ? ? ? J . A 1 2285 ASP 2285 ? ? ? J . A 1 2286 ILE 2286 ? ? ? J . A 1 2287 ALA 2287 ? ? ? J . A 1 2288 LYS 2288 ? ? ? J . A 1 2289 LYS 2289 ? ? ? J . A 1 2290 ASN 2290 ? ? ? J . A 1 2291 GLN 2291 ? ? ? J . A 1 2292 SER 2292 ? ? ? J . A 1 2293 ILE 2293 ? ? ? J . A 1 2294 THR 2294 ? ? ? J . A 1 2295 ASP 2295 ? ? ? J . A 1 2296 LEU 2296 ? ? ? J . A 1 2297 LYS 2297 ? ? ? J . A 1 2298 GLN 2298 ? ? ? J . A 1 2299 LEU 2299 ? ? ? J . A 1 2300 VAL 2300 ? ? ? J . A 1 2301 LYS 2301 ? ? ? J . A 1 2302 GLU 2302 ? ? ? J . A 1 2303 ALA 2303 ? ? ? J . A 1 2304 THR 2304 ? ? ? J . A 1 2305 GLU 2305 ? ? ? J . A 1 2306 ARG 2306 ? ? ? J . A 1 2307 GLU 2307 ? ? ? J . A 1 2308 GLN 2308 ? ? ? J . A 1 2309 LYS 2309 ? ? ? J . A 1 2310 VAL 2310 ? ? ? J . A 1 2311 ASN 2311 ? ? ? J . A 1 2312 LYS 2312 ? ? ? J . A 1 2313 TYR 2313 ? ? ? J . A 1 2314 ASN 2314 ? ? ? J . A 1 2315 GLU 2315 ? ? ? J . A 1 2316 ASP 2316 ? ? ? J . A 1 2317 LEU 2317 ? ? ? J . A 1 2318 GLU 2318 ? ? ? J . A 1 2319 GLN 2319 ? ? ? J . A 1 2320 GLN 2320 ? ? ? J . A 1 2321 ILE 2321 ? ? ? J . A 1 2322 LYS 2322 ? ? ? J . A 1 2323 ILE 2323 ? ? ? J . A 1 2324 LEU 2324 ? ? ? J . A 1 2325 LYS 2325 ? ? ? J . A 1 2326 HIS 2326 ? ? ? J . A 1 2327 VAL 2327 ? ? ? J . A 1 2328 PRO 2328 ? ? ? J . A 1 2329 GLU 2329 ? ? ? J . A 1 2330 GLY 2330 ? ? ? J . A 1 2331 ALA 2331 ? ? ? J . A 1 2332 GLU 2332 ? ? ? J . A 1 2333 THR 2333 ? ? ? J . A 1 2334 GLU 2334 ? ? ? J . A 1 2335 GLN 2335 ? ? ? J . A 1 2336 GLY 2336 ? ? ? J . A 1 2337 LEU 2337 ? ? ? J . A 1 2338 LYS 2338 ? ? ? J . A 1 2339 ARG 2339 ? ? ? J . A 1 2340 GLU 2340 ? ? ? J . A 1 2341 LEU 2341 ? ? ? J . A 1 2342 GLN 2342 ? ? ? J . A 1 2343 VAL 2343 ? ? ? J . A 1 2344 LEU 2344 ? ? ? J . A 1 2345 ARG 2345 ? ? ? J . A 1 2346 LEU 2346 ? ? ? J . A 1 2347 ALA 2347 ? ? ? J . A 1 2348 ASN 2348 ? ? ? J . A 1 2349 HIS 2349 ? ? ? J . A 1 2350 GLN 2350 ? ? ? J . A 1 2351 LEU 2351 ? ? ? J . A 1 2352 ASP 2352 ? ? ? J . A 1 2353 LYS 2353 ? ? ? J . A 1 2354 GLU 2354 ? ? ? J . A 1 2355 LYS 2355 ? ? ? J . A 1 2356 ALA 2356 ? ? ? J . A 1 2357 GLU 2357 ? ? ? J . A 1 2358 LEU 2358 ? ? ? J . A 1 2359 ILE 2359 ? ? ? J . A 1 2360 HIS 2360 ? ? ? J . 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A 1 2431 TYR 2431 ? ? ? J . A 1 2432 LYS 2432 ? ? ? J . A 1 2433 GLU 2433 ? ? ? J . A 1 2434 GLU 2434 ? ? ? J . A 1 2435 VAL 2435 ? ? ? J . A 1 2436 LYS 2436 ? ? ? J . A 1 2437 LYS 2437 ? ? ? J . A 1 2438 ASN 2438 ? ? ? J . A 1 2439 ILE 2439 ? ? ? J . A 1 2440 LEU 2440 ? ? ? J . A 1 2441 LEU 2441 ? ? ? J . A 1 2442 GLU 2442 ? ? ? J . A 1 2443 GLU 2443 ? ? ? J . A 1 2444 LYS 2444 ? ? ? J . A 1 2445 VAL 2445 ? ? ? J . A 1 2446 LYS 2446 ? ? ? J . A 1 2447 LYS 2447 ? ? ? J . A 1 2448 LEU 2448 ? ? ? J . A 1 2449 SER 2449 ? ? ? J . A 1 2450 GLU 2450 ? ? ? J . A 1 2451 GLN 2451 ? ? ? J . A 1 2452 LEU 2452 ? ? ? J . A 1 2453 GLY 2453 ? ? ? J . A 1 2454 VAL 2454 ? ? ? J . A 1 2455 GLU 2455 ? ? ? J . A 1 2456 LEU 2456 ? ? ? J . A 1 2457 THR 2457 ? ? ? J . A 1 2458 SER 2458 ? ? ? J . A 1 2459 PRO 2459 ? ? ? J . A 1 2460 VAL 2460 ? ? ? J . A 1 2461 ALA 2461 ? ? ? J . A 1 2462 ALA 2462 ? ? ? J . A 1 2463 SER 2463 ? ? ? J . A 1 2464 GLU 2464 ? ? ? J . A 1 2465 GLU 2465 ? ? ? J . A 1 2466 PHE 2466 ? ? ? J . A 1 2467 GLU 2467 ? ? ? J . A 1 2468 ASP 2468 ? ? ? J . A 1 2469 GLU 2469 ? ? ? J . A 1 2470 GLU 2470 ? ? ? J . A 1 2471 GLU 2471 ? ? ? J . A 1 2472 SER 2472 ? ? ? J . A 1 2473 PRO 2473 ? ? ? J . A 1 2474 VAL 2474 ? ? ? J . A 1 2475 ASN 2475 ? ? ? J . A 1 2476 PHE 2476 ? ? ? J . A 1 2477 PRO 2477 ? ? ? J . A 1 2478 ILE 2478 ? ? ? J . A 1 2479 TYR 2479 ? ? ? J . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=8zbk, label_asym_id=J, auth_asym_id=S, SMTL ID=8zbk.1.J}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8zbk, label_asym_id=J' 'target-template alignment' . 4 'model 10' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-09-10 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-09-05 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A J 3 1 S # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;QLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKY EEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKL KEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAI ; ;QLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKY EEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKL KEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 7 174 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8zbk 2025-01-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2479 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2485 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.700 24.074 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 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2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEE---------------------VARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.190}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8zbk.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 10' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 206.764 168.109 306.532 1 1 J ILE 0.530 1 ATOM 15 C CG2 . ILE 325 325 ? A 207.051 169.562 304.445 1 1 J ILE 0.530 1 ATOM 16 C CD1 . ILE 325 325 ? A 207.124 169.167 307.583 1 1 J ILE 0.530 1 ATOM 17 N N . GLU 326 326 ? A 209.168 167.225 302.677 1 1 J GLU 0.520 1 ATOM 18 C CA . GLU 326 326 ? A 209.786 167.302 301.362 1 1 J GLU 0.520 1 ATOM 19 C C . GLU 326 326 ? A 209.360 166.201 300.394 1 1 J GLU 0.520 1 ATOM 20 O O . GLU 326 326 ? A 209.095 166.435 299.219 1 1 J GLU 0.520 1 ATOM 21 C CB . GLU 326 326 ? A 211.315 167.265 301.525 1 1 J GLU 0.520 1 ATOM 22 C CG . GLU 326 326 ? A 211.901 168.518 302.218 1 1 J GLU 0.520 1 ATOM 23 C CD . GLU 326 326 ? A 213.410 168.373 302.424 1 1 J GLU 0.520 1 ATOM 24 O OE1 . GLU 326 326 ? A 213.927 167.241 302.239 1 1 J GLU 0.520 1 ATOM 25 O OE2 . GLU 326 326 ? A 214.033 169.386 302.824 1 1 J GLU 0.520 1 ATOM 26 N N . TYR 327 327 ? A 209.224 164.954 300.894 1 1 J TYR 0.520 1 ATOM 27 C CA . TYR 327 327 ? 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A 204.865 166.073 299.266 1 1 J GLN 0.590 1 ATOM 41 O O . GLN 328 328 ? A 203.971 166.081 298.417 1 1 J GLN 0.590 1 ATOM 42 C CB . GLN 328 328 ? A 204.141 165.208 301.536 1 1 J GLN 0.590 1 ATOM 43 C CG . GLN 328 328 ? A 203.982 164.018 302.522 1 1 J GLN 0.590 1 ATOM 44 C CD . GLN 328 328 ? A 203.347 162.771 301.894 1 1 J GLN 0.590 1 ATOM 45 O OE1 . GLN 328 328 ? A 202.825 162.765 300.780 1 1 J GLN 0.590 1 ATOM 46 N NE2 . GLN 328 328 ? A 203.379 161.658 302.667 1 1 J GLN 0.590 1 ATOM 47 N N . GLN 329 329 ? A 205.780 167.066 299.321 1 1 J GLN 0.610 1 ATOM 48 C CA . GLN 329 329 ? A 205.918 168.110 298.315 1 1 J GLN 0.610 1 ATOM 49 C C . GLN 329 329 ? A 206.275 167.573 296.941 1 1 J GLN 0.610 1 ATOM 50 O O . GLN 329 329 ? A 205.666 167.938 295.934 1 1 J GLN 0.610 1 ATOM 51 C CB . GLN 329 329 ? A 207.002 169.128 298.728 1 1 J GLN 0.610 1 ATOM 52 C CG . GLN 329 329 ? A 206.590 169.981 299.944 1 1 J GLN 0.610 1 ATOM 53 C CD . GLN 329 329 ? 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