data_SMR-cede0bebc47a9a3cb041cedc894232dc_3 _entry.id SMR-cede0bebc47a9a3cb041cedc894232dc_3 _struct.entry_id SMR-cede0bebc47a9a3cb041cedc894232dc_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - P0C6F5/ R1A_BC279, Replicase polyprotein 1a Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P0C6F5' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.5 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 567235.816 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP R1A_BC279 P0C6F5 1 ;MESLALGVSEKTHVQLSLPVLQVRDVLVRGFGDSVEEALAEAREHLKNGTCGLVELEKGVLPQLEQPYVF IKRSDAQGTNHGYKVVELVAELDGIQYGRSGTTLGVLVPHVGETPVAYRNVLLRKNGNKGAGGHSYGIDL KSYDLGVELGTDPIEDYEQNWNTKHGGGVLRELIRELNGGAFTRYVDNNFCGPDGYPLECIKDLLARAGK SMCTLSEQLDYIESKRGVYCCREHEHEIVWFTERSEKSYERQTPFEIKSAKKFDTFKGECPKFVFPLNSK VKVIQPRVEKKKTEGFMGRIRSVYPVATPQECNDMHLSTLMKCNHCDEVSWQTCDFLKATCEQCGTENLV CEGPTTCGYLPANAVVKMPCPACQDPEVGPEHSVADYHNHSNIETRLRKGGRTKCFGGCVFAYVGCYNKR AYWVPRASANIGASHTGITGDNVETLNEDLMEILNRDRVNINIVGDFHLNEEVAIILASFSASTCAFVDT VKGLDYKTFKDIVESCGNFKVTRGRAKKGAWNIGQEKSILTPLYGFPSQAAGVIRSIFTRALDTANHSIP DLQRAAITILDGISEQSLRLIDAMVYTSDLLTNSVIVMAYVTGGLVQQITQWLSNMLGTTVDKLKPVFTW VEAKLSAGIEFLRDAWEILKFLVTGVFDIVKGQIQVASDNLKECVKAFLDVLNKALEMCIDQVIIAGAKL RTLNLGEVFIAQSKGLYRQCIRGKEQLQLLMPLRAPKEVTFFEGDSHDTVFTSEEVVLKNGELEALETPV DSFTNGAVIGTPVCVNGLMLLELKDKEQYCALSPGLLATNNVFSLKGGAPVKGVTFGEDTVLEVQGYKNV KITFELDERVDKVLNEKCSVYTVESGTEVTEFACVVAEAVVKTLQPVSDLLTNMGIDLDEWSVATFYLFD DAGEEKLSSRMYCSFYPPDEEEDCEEYEDEEEIPEETCEHEYGTEDDYKGLPLEFGASTEIQQVDEEEEE DWLEEAIAAKPEPEPLPEEPVNQFTGYLKLTDNVAIKCVDIVKEAQHAKPTVIVNAANVHLKHGGGVAGA LNKATNGAMQQESDDYIKKNGPLTVGGSCLLSGHNLAKKCMHVVGPNLNAGEDVQLLKAAYANFNSQDVL LAPLLSAGIFGAKPLQSLKMCVETVRTQVYFAVNDQDLYDHVVLGYLDSLKPKVETPTQENLELKEQPAV ETLTQENLELEELPVIEKPVDVKFKARIEEVNTSLEETKFLTSRLLLFADINGKLYQDSQNMLRGEDMFF LEKDAPYIVGDVISSGDITCVIIPAKKAGGTTEMLAKALKKVPVSEYITTYPGQGCAGYTLEEAKTALRK CKSVFYVLPSKTPNDKEEILGTVSWNLREMLAHAEETRKLMLICMDVKALMSTIHRRYKGIKVQEGIVDY GVRFFFYTSKEPVASIITKLNLLNEPLVTMPIGYVTHGLNLEEAARCMRSLKAPAVVSVSSPDAVTTYNG YLTSSSKTSEEHFIETVSLAGMYRDWSYSGQRTELGVEFLKRGDKVVYHTVGSPIQFHLDGEVLLLDKLK SLLSLREVRTIKVFTTVDNTNLHTQIVDMSMTYGQQFGPTYLDGADVTKIKPHAKHEGKTFFVLPSDDTL RSEAFEYYHTLDESFLGRYMSALNHTKKWKFPQIGGLTSIKWADNNCYLSSVLLALQQIEVKFNAPALQE AYYRARAGDAANFCALILAYSNRTVGELGDVRETMTHLLQHANLESAKRVLNVVCKTCGQKSTTLTGVEA VMYMGTLSYEELKTGVTIPCICGRDATQYLVQQESSFVMMSAPPSEYTLQQGAFLCANEYTGSYQCGHYT HVTVKETLYRIDGAYLTKMSEYKGPVTDVFYKEISYTTTIKPVSYKLDGVIYTEIQPKLDEYYKKDNAYY TEQPIDLVPTQPLPNASFDNFKLTCSNTKFADDLNQMTGFKKPASRELSVTFFPDLNGDVVAIDYRHYSA SFKKGAKLLHKPIIWHINQTTNKTTYKPNTWCLRCLWSTKPVETSNSFEVLEVEDTQGMDNLACESQTPT SEEVVENPTIQKEVIECDVKTIEVVGNVILKPSEEGVKVTQELGHEDLMAAYVEETSITIKKPNELSLAL GLRTLATHGAAAINSVPWSKILAYVKPFLGQAAVTTTNCIKRCVQRVFNNYMPYVITLLFQLCTFTRSTN SRIRASLPTTIAKNSVKSVAKLCLDVCINYVKSPKFSKLFTIAMWLLLLSICLGSLIYVTAAFGVLLSNL GIPSYCDGVRESYVNSSNVTTMDFCEGSFLCSVCLNGLDSLDSYPALETIQVTISSYKLDLTSLGLAAEW FLAYMLFTKFFYLLGLSAIMQVFFGYFASHFISNSWLMWFIISIVQMAPVSAMVRMYIFFAFCYYVWKSY VHIMDGCTSSTCMMCYKRNRATRVECTTIVNGMKRSFYVYANGGRGFCKAHNWNCLNCDTFCAGSTFISD EVARDLSLQFKRPINPTDQSSYVVDSVAVKNGALHLYFDKAGQKTYERHPLSHFVNLDNLRANNTKGSLP INVIVFDGKSKCDESAAKSASVYYSQLMCQPILLLDQALVSDVGDSTEVSVKMFDAYVDTFSATFSVPME KLKALVATAHSELAKGVALDGVLSTFVSAARQGVVDTDVDTKDVIECLKLSHHSDLEVTGDSCNNFMLTY NKVENMTPRDLGACIDCNARHINAQVAKSHNVSLIWNVKDYMSLSEQLRKQIRSAAKKNNIPFRLTCATT RQVVNAITTKISLKGGKIVSTWFKLMLKATLLCVLAALFCYIIMPVHSLSVHDGYTNEIIGYKAIQDGVT RDIMATDDCFANKHAGFDSWFSQRGGSYRNDKSCPVVAAIITREIGFIVPGLPGTVLRAINGDFLHFLPR VFSAVGNICYTPSKLIEYSDFATSACVLAAECTIFKDAMGKPVPYCYDTNLLEGSISYSELRPDTRYVLM DGSIIQFPNTYLEGSVRVVTTFDAEYCRHGTCERSEAGVCLSTSGRWVLNNEHYRALPGVFCGVDAMNLI ANIFTPLVQPVGALDVSASVVAGGIIAILVTCAAYYFMKFRRAFGEYNHVVAANALLFLMSFTILCLAPA YSFLPGVYSIFYLYLTFYFTNDVSFLAHLQWFAMFSPIVPFWITAIYVFCISLKHCHWFFNNYLRKRVMF NGVTFSTFEEAALCTFLLNKEMYLKLRSETLLPLTQYNRYLALYNKYKYFSGALDTTSYREAACCHLAKA LNDFSNSGADVLYQPPQTSITSAVLQSGFRKMAFPSGKVEGCMVQVTCGTTTLNGLWLDDTVYCPRHVIC TAEDMLNPNYEDLLIRKSNHSFLVQAGNVQLRVIGHSMQNCLLRLKVDTSNPKTPKYKFVRIQPGQTFSV LACYNGSPSGVYQCAMRPNYTIKGSFLNGSCGSVGFNIDYDCVSFCYMHHMELPTGVHAGTDLEGKFYGP FVDRQTAQAAGTDTTITLNVLAWLYAAVINGDRWFLNRFTTTLNDFNLVAMKYNYEPLTQDHVDILGPLS AQTGIAVLDMCAALKELLQNGMNGRTILGSTILEDEFTPFDVVRQCSGVTFQGKFKKIVKGTHHWMLLTF LTSLLILVQSTQWSLFFFVYENAFLPFTLGIMAIAACAMLLVKHKHAFLCLFLLPSLATVAYFNMVYMPA SWVMRIMTWLELADTSLSGYRLKDCVMYASALVLLVLMTARTVYDDAARRVWTLMNVITLVYKVYYGNSL DQAISMWALVISVTSNYSGVVTTIMFLARAIVFVCVEYYPLLFITGNTLQCIMLVYCFLGYCCCCYFGLF CLLNRYFRLTLGVYDYLVSTQEFRYMNSQGLLPPKSSIDAFKLNIKLLGIGGKPCIKVATVQSKMSDVKC TSVVLLSVLQQLRVESSSKLWAQCVQLHNDILLAKDTTEAFEKMVSLLSVLLSMQGAVDINKLCEEMLDN RATLQAIASEFSSLPSYAAYATAQEAYEQAVANGDSEVVLKKLKKSLNVAKSEFDRDAAMQRKLEKMADQ AMTQMYKQARSEDKRAKVTSAMQTMLFTMLRKLDNDALNNIINNARDGCVPLNIIPLTTAAKLMVVVPDY GTYKNTCDGNTFTYASALWEIQQVVDADSKIVQLSEINMDNSQNLAWPLIVTALRANSAVKLQNNELSPV ALRQMSCAAGTTQTACTDDNALAYYNNSKGGRFVLALLSDHQDLKWARFPKSDGTGTIYTELEPPCRFVT DTPRGPKVKYLYFIKGLNNLNRGMVLGSLAATVRLQAGNATEVPANSAVLSFCAFAVDPAKAYKDYLASG GQPITNCVKMLCTHTGTGQAITVTPEANMDQESFGGASCCLYCRCHIDHPNPKGFCDLKGKYVQIPATCA NDPVGFTLKNTVCTVCGTWKGYGCSCDQLREPMMQSADASTFLNGFAV ; 'Replicase polyprotein 1a' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 4388 1 4388 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . R1A_BC279 P0C6F5 . 1 4388 389167 'Bat coronavirus 279/2005 (BtCoV) (BtCoV/279/2005)' 2008-06-10 1D91B831273D6F2A . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MESLALGVSEKTHVQLSLPVLQVRDVLVRGFGDSVEEALAEAREHLKNGTCGLVELEKGVLPQLEQPYVF IKRSDAQGTNHGYKVVELVAELDGIQYGRSGTTLGVLVPHVGETPVAYRNVLLRKNGNKGAGGHSYGIDL KSYDLGVELGTDPIEDYEQNWNTKHGGGVLRELIRELNGGAFTRYVDNNFCGPDGYPLECIKDLLARAGK SMCTLSEQLDYIESKRGVYCCREHEHEIVWFTERSEKSYERQTPFEIKSAKKFDTFKGECPKFVFPLNSK VKVIQPRVEKKKTEGFMGRIRSVYPVATPQECNDMHLSTLMKCNHCDEVSWQTCDFLKATCEQCGTENLV CEGPTTCGYLPANAVVKMPCPACQDPEVGPEHSVADYHNHSNIETRLRKGGRTKCFGGCVFAYVGCYNKR AYWVPRASANIGASHTGITGDNVETLNEDLMEILNRDRVNINIVGDFHLNEEVAIILASFSASTCAFVDT VKGLDYKTFKDIVESCGNFKVTRGRAKKGAWNIGQEKSILTPLYGFPSQAAGVIRSIFTRALDTANHSIP DLQRAAITILDGISEQSLRLIDAMVYTSDLLTNSVIVMAYVTGGLVQQITQWLSNMLGTTVDKLKPVFTW VEAKLSAGIEFLRDAWEILKFLVTGVFDIVKGQIQVASDNLKECVKAFLDVLNKALEMCIDQVIIAGAKL RTLNLGEVFIAQSKGLYRQCIRGKEQLQLLMPLRAPKEVTFFEGDSHDTVFTSEEVVLKNGELEALETPV DSFTNGAVIGTPVCVNGLMLLELKDKEQYCALSPGLLATNNVFSLKGGAPVKGVTFGEDTVLEVQGYKNV KITFELDERVDKVLNEKCSVYTVESGTEVTEFACVVAEAVVKTLQPVSDLLTNMGIDLDEWSVATFYLFD DAGEEKLSSRMYCSFYPPDEEEDCEEYEDEEEIPEETCEHEYGTEDDYKGLPLEFGASTEIQQVDEEEEE DWLEEAIAAKPEPEPLPEEPVNQFTGYLKLTDNVAIKCVDIVKEAQHAKPTVIVNAANVHLKHGGGVAGA LNKATNGAMQQESDDYIKKNGPLTVGGSCLLSGHNLAKKCMHVVGPNLNAGEDVQLLKAAYANFNSQDVL LAPLLSAGIFGAKPLQSLKMCVETVRTQVYFAVNDQDLYDHVVLGYLDSLKPKVETPTQENLELKEQPAV ETLTQENLELEELPVIEKPVDVKFKARIEEVNTSLEETKFLTSRLLLFADINGKLYQDSQNMLRGEDMFF LEKDAPYIVGDVISSGDITCVIIPAKKAGGTTEMLAKALKKVPVSEYITTYPGQGCAGYTLEEAKTALRK CKSVFYVLPSKTPNDKEEILGTVSWNLREMLAHAEETRKLMLICMDVKALMSTIHRRYKGIKVQEGIVDY GVRFFFYTSKEPVASIITKLNLLNEPLVTMPIGYVTHGLNLEEAARCMRSLKAPAVVSVSSPDAVTTYNG YLTSSSKTSEEHFIETVSLAGMYRDWSYSGQRTELGVEFLKRGDKVVYHTVGSPIQFHLDGEVLLLDKLK SLLSLREVRTIKVFTTVDNTNLHTQIVDMSMTYGQQFGPTYLDGADVTKIKPHAKHEGKTFFVLPSDDTL 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B 1 4234 ARG 4234 ? ? ? B . B 1 4235 LEU 4235 ? ? ? B . B 1 4236 GLN 4236 ? ? ? B . B 1 4237 ALA 4237 ? ? ? B . B 1 4238 GLY 4238 ? ? ? B . B 1 4239 ASN 4239 ? ? ? B . B 1 4240 ALA 4240 ? ? ? B . B 1 4241 THR 4241 ? ? ? B . B 1 4242 GLU 4242 ? ? ? B . B 1 4243 VAL 4243 ? ? ? B . B 1 4244 PRO 4244 ? ? ? B . B 1 4245 ALA 4245 ? ? ? B . B 1 4246 ASN 4246 ? ? ? B . B 1 4247 SER 4247 ? ? ? B . B 1 4248 ALA 4248 ? ? ? B . B 1 4249 VAL 4249 ? ? ? B . B 1 4250 LEU 4250 ? ? ? B . B 1 4251 SER 4251 ? ? ? B . B 1 4252 PHE 4252 ? ? ? B . B 1 4253 CYS 4253 ? ? ? B . B 1 4254 ALA 4254 ? ? ? B . B 1 4255 PHE 4255 ? ? ? B . B 1 4256 ALA 4256 ? ? ? B . B 1 4257 VAL 4257 ? ? ? B . B 1 4258 ASP 4258 ? ? ? B . B 1 4259 PRO 4259 ? ? ? B . B 1 4260 ALA 4260 ? ? ? B . B 1 4261 LYS 4261 ? ? ? B . B 1 4262 ALA 4262 ? ? ? B . B 1 4263 TYR 4263 ? ? ? B . B 1 4264 LYS 4264 ? ? ? B . B 1 4265 ASP 4265 ? ? ? B . B 1 4266 TYR 4266 ? ? ? B . B 1 4267 LEU 4267 ? ? ? B . B 1 4268 ALA 4268 ? ? ? B . B 1 4269 SER 4269 ? ? ? B . B 1 4270 GLY 4270 ? ? ? B . B 1 4271 GLY 4271 ? ? ? B . B 1 4272 GLN 4272 ? ? ? B . B 1 4273 PRO 4273 ? ? ? B . B 1 4274 ILE 4274 ? ? ? B . B 1 4275 THR 4275 ? ? ? B . B 1 4276 ASN 4276 ? ? ? B . B 1 4277 CYS 4277 ? ? ? B . B 1 4278 VAL 4278 ? ? ? B . B 1 4279 LYS 4279 ? ? ? B . B 1 4280 MET 4280 ? ? ? B . B 1 4281 LEU 4281 ? ? ? B . B 1 4282 CYS 4282 ? ? ? B . B 1 4283 THR 4283 ? ? ? B . B 1 4284 HIS 4284 ? ? ? B . B 1 4285 THR 4285 ? ? ? B . B 1 4286 GLY 4286 ? ? ? B . B 1 4287 THR 4287 ? ? ? B . B 1 4288 GLY 4288 ? ? ? B . B 1 4289 GLN 4289 ? ? ? B . B 1 4290 ALA 4290 ? ? ? B . B 1 4291 ILE 4291 ? ? ? B . B 1 4292 THR 4292 ? ? ? B . B 1 4293 VAL 4293 ? ? ? B . B 1 4294 THR 4294 ? ? ? B . B 1 4295 PRO 4295 ? ? ? B . B 1 4296 GLU 4296 ? ? ? B . B 1 4297 ALA 4297 ? ? ? B . B 1 4298 ASN 4298 ? ? ? B . B 1 4299 MET 4299 ? ? ? B . B 1 4300 ASP 4300 ? ? ? B . B 1 4301 GLN 4301 ? ? ? B . B 1 4302 GLU 4302 ? ? ? B . B 1 4303 SER 4303 ? ? ? B . B 1 4304 PHE 4304 ? ? ? B . B 1 4305 GLY 4305 ? ? ? B . B 1 4306 GLY 4306 ? ? ? B . B 1 4307 ALA 4307 ? ? ? B . B 1 4308 SER 4308 ? ? ? B . B 1 4309 CYS 4309 ? ? ? B . B 1 4310 CYS 4310 ? ? ? B . B 1 4311 LEU 4311 ? ? ? B . B 1 4312 TYR 4312 ? ? ? B . B 1 4313 CYS 4313 ? ? ? B . B 1 4314 ARG 4314 ? ? ? B . B 1 4315 CYS 4315 ? ? ? B . B 1 4316 HIS 4316 ? ? ? B . B 1 4317 ILE 4317 ? ? ? B . B 1 4318 ASP 4318 ? ? ? B . B 1 4319 HIS 4319 ? ? ? B . B 1 4320 PRO 4320 ? ? ? B . B 1 4321 ASN 4321 ? ? ? B . B 1 4322 PRO 4322 ? ? ? B . B 1 4323 LYS 4323 ? ? ? B . B 1 4324 GLY 4324 ? ? ? B . B 1 4325 PHE 4325 ? ? ? B . B 1 4326 CYS 4326 ? ? ? B . B 1 4327 ASP 4327 ? ? ? B . B 1 4328 LEU 4328 ? ? ? B . B 1 4329 LYS 4329 ? ? ? B . B 1 4330 GLY 4330 ? ? ? B . B 1 4331 LYS 4331 ? ? ? B . B 1 4332 TYR 4332 ? ? ? B . B 1 4333 VAL 4333 ? ? ? B . B 1 4334 GLN 4334 ? ? ? B . B 1 4335 ILE 4335 ? ? ? B . B 1 4336 PRO 4336 ? ? ? B . B 1 4337 ALA 4337 ? ? ? B . B 1 4338 THR 4338 ? ? ? B . B 1 4339 CYS 4339 ? ? ? B . B 1 4340 ALA 4340 ? ? ? B . B 1 4341 ASN 4341 ? ? ? B . B 1 4342 ASP 4342 ? ? ? B . B 1 4343 PRO 4343 ? ? ? B . B 1 4344 VAL 4344 ? ? ? B . B 1 4345 GLY 4345 ? ? ? B . B 1 4346 PHE 4346 ? ? ? B . B 1 4347 THR 4347 ? ? ? B . B 1 4348 LEU 4348 ? ? ? B . B 1 4349 LYS 4349 ? ? ? B . B 1 4350 ASN 4350 ? ? ? B . B 1 4351 THR 4351 ? ? ? B . B 1 4352 VAL 4352 ? ? ? B . B 1 4353 CYS 4353 ? ? ? B . B 1 4354 THR 4354 ? ? ? B . B 1 4355 VAL 4355 ? ? ? B . B 1 4356 CYS 4356 ? ? ? B . B 1 4357 GLY 4357 ? ? ? B . B 1 4358 THR 4358 ? ? ? B . B 1 4359 TRP 4359 ? ? ? B . B 1 4360 LYS 4360 ? ? ? B . B 1 4361 GLY 4361 ? ? ? B . B 1 4362 TYR 4362 ? ? ? B . B 1 4363 GLY 4363 ? ? ? B . B 1 4364 CYS 4364 ? ? ? B . B 1 4365 SER 4365 ? ? ? B . B 1 4366 CYS 4366 ? ? ? B . B 1 4367 ASP 4367 ? ? ? B . B 1 4368 GLN 4368 ? ? ? B . B 1 4369 LEU 4369 ? ? ? B . B 1 4370 ARG 4370 ? ? ? B . B 1 4371 GLU 4371 ? ? ? B . B 1 4372 PRO 4372 ? ? ? B . B 1 4373 MET 4373 ? ? ? B . B 1 4374 MET 4374 ? ? ? B . B 1 4375 GLN 4375 ? ? ? B . B 1 4376 SER 4376 ? ? ? B . B 1 4377 ALA 4377 ? ? ? B . B 1 4378 ASP 4378 ? ? ? B . B 1 4379 ALA 4379 ? ? ? B . B 1 4380 SER 4380 ? ? ? B . B 1 4381 THR 4381 ? ? ? B . B 1 4382 PHE 4382 ? ? ? B . B 1 4383 LEU 4383 ? ? ? B . B 1 4384 ASN 4384 ? ? ? B . B 1 4385 GLY 4385 ? ? ? B . B 1 4386 PHE 4386 ? ? ? B . B 1 4387 ALA 4387 ? ? ? B . B 1 4388 VAL 4388 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 '3C-like proteinase {PDB ID=9n3m, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=9n3m.1.B}' 'template structure' . 2 '3C-like proteinase {PDB ID=9n3m, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=9n3m.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 9n3m, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 9n3m, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 6 'model 3' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-09-10 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-09-05 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SGFRKMAFPSGKVEGCMVQVTCGTTTLNGLWLDDVVYCPRHVICTSEDMFNPNYEDLLIRKSNHNFLVQA GNVQLRVIGHSMQNCVLKLKVDTANPKTPKYKFVRIQPGQTFSVLACYNGSPSGVYQCAMRPNFTIKGSF LNGSCGSVGFNIDYDCVSFCYMHHMAFPTGVHAGTDLEGNFYGPFVDRQTAQAAGTDTTITVNVLAWLYA AVINGDRWFLNRFTTTLNDFNLVAMKYNYEPLTQDHVDILGPLSAQTGIAVLDMCASLKELLQNGMNGRT ILGSALLEDEFTPFDVVRQCSGVTFQ ; ;SGFRKMAFPSGKVEGCMVQVTCGTTTLNGLWLDDVVYCPRHVICTSEDMFNPNYEDLLIRKSNHNFLVQA GNVQLRVIGHSMQNCVLKLKVDTANPKTPKYKFVRIQPGQTFSVLACYNGSPSGVYQCAMRPNFTIKGSF LNGSCGSVGFNIDYDCVSFCYMHHMAFPTGVHAGTDLEGNFYGPFVDRQTAQAAGTDTTITVNVLAWLYA AVINGDRWFLNRFTTTLNDFNLVAMKYNYEPLTQDHVDILGPLSAQTGIAVLDMCASLKELLQNGMNGRT ILGSALLEDEFTPFDVVRQCSGVTFQ ; 2 ;SGFRKMAFPSGKVEGCMVQVTCGTTTLNGLWLDDVVYCPRHVICTSEDMFNPNYEDLLIRKSNHNFLVQA GNVQLRVIGHSMQNCVLKLKVDTANPKTPKYKFVRIQPGQTFSVLACYNGSPSGVYQCAMRPNFTIKGSF LNGSCGSVGFNIDYDCVSFCYMHHMAFPTGVHAGTDLEGNFYGPFVDRQTAQAAGTDTTITVNVLAWLYA AVINGDRWFLNRFTTTLNDFNLVAMKYNYEPLTQDHVDILGPLSAQTGIAVLDMCASLKELLQNGMNGRT ILGSALLEDEFTPFDVVRQCSGVTFQ ; ;SGFRKMAFPSGKVEGCMVQVTCGTTTLNGLWLDDVVYCPRHVICTSEDMFNPNYEDLLIRKSNHNFLVQA GNVQLRVIGHSMQNCVLKLKVDTANPKTPKYKFVRIQPGQTFSVLACYNGSPSGVYQCAMRPNFTIKGSF LNGSCGSVGFNIDYDCVSFCYMHHMAFPTGVHAGTDLEGNFYGPFVDRQTAQAAGTDTTITVNVLAWLYA AVINGDRWFLNRFTTTLNDFNLVAMKYNYEPLTQDHVDILGPLSAQTGIAVLDMCASLKELLQNGMNGRT ILGSALLEDEFTPFDVVRQCSGVTFQ ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 306 2 2 1 306 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 9n3m 2025-09-03 2 PDB . 9n3m 2025-09-03 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 4388 2 2 B 1 4388 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 4388 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 4388 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5e-126 95.098 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 5e-126 95.098 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MESLALGVSEKTHVQLSLPVLQVRDVLVRGFGDSVEEALAEAREHLKNGTCGLVELEKGVLPQLEQPYVFIKRSDAQGTNHGYKVVELVAELDGIQYGRSGTTLGVLVPHVGETPVAYRNVLLRKNGNKGAGGHSYGIDLKSYDLGVELGTDPIEDYEQNWNTKHGGGVLRELIRELNGGAFTRYVDNNFCGPDGYPLECIKDLLARAGKSMCTLSEQLDYIESKRGVYCCREHEHEIVWFTERSEKSYERQTPFEIKSAKKFDTFKGECPKFVFPLNSKVKVIQPRVEKKKTEGFMGRIRSVYPVATPQECNDMHLSTLMKCNHCDEVSWQTCDFLKATCEQCGTENLVCEGPTTCGYLPANAVVKMPCPACQDPEVGPEHSVADYHNHSNIETRLRKGGRTKCFGGCVFAYVGCYNKRAYWVPRASANIGASHTGITGDNVETLNEDLMEILNRDRVNINIVGDFHLNEEVAIILASFSASTCAFVDTVKGLDYKTFKDIVESCGNFKVTRGRAKKGAWNIGQEKSILTPLYGFPSQAAGVIRSIFTRALDTANHSIPDLQRAAITILDGISEQSLRLIDAMVYTSDLLTNSVIVMAYVTGGLVQQITQWLSNMLGTTVDKLKPVFTWVEAKLSAGIEFLRDAWEILKFLVTGVFDIVKGQIQVASDNLKECVKAFLDVLNKALEMCIDQVIIAGAKLRTLNLGEVFIAQSKGLYRQCIRGKEQLQLLMPLRAPKEVTFFEGDSHDTVFTSEEVVLKNGELEALETPVDSFTNGAVIGTPVCVNGLMLLELKDKEQYCALSPGLLATNNVFSLKGGAPVKGVTFGEDTVLEVQGYKNVKITFELDERVDKVLNEKCSVYTVESGTEVTEFACVVAEAVVKTLQPVSDLLTNMGIDLDEWSVATFYLFDDAGEEKLSSRMYCSFYPPDEEEDCEEYEDEEEIPEETCEHEYGTEDDYKGLPLEFGASTEIQQVDEEEEEDWLEEAIAAKPEPEPLPEEPVNQFTGYLKLTDNVAIKCVDIVKEAQHAKPTVIVNAANVHLKHGGGVAGALNKATNGAMQQESDDYIKKNGPLTVGGSCLLSGHNLAKKCMHVVGPNLNAGEDVQLLKAAYANFNSQDVLLAPLLSAGIFGAKPLQSLKMCVETVRTQVYFAVNDQDLYDHVVLGYLDSLKPKVETPTQENLELKEQPAVETLTQENLELEELPVIEKPVDVKFKARIEEVNTSLEETKFLTSRLLLFADINGKLYQDSQNMLRGEDMFFLEKDAPYIVGDVISSGDITCVIIPAKKAGGTTEMLAKALKKVPVSEYITTYPGQGCAGYTLEEAKTALRKCKSVFYVLPSKTPNDKEEILGTVSWNLREMLAHAEETRKLMLICMDVKALMSTIHRRYKGIKVQEGIVDYGVRFFFYTSKEPVASIITKLNLLNEPLVTMPIGYVTHGLNLEEAARCMRSLKAPAVVSVSSPDAVTTYNGYLTSSSKTSEEHFIETVSLAGMYRDWSYSGQRTELGVEFLKRGDKVVYHTVGSPIQFHLDGEVLLLDKLKSLLSLREVRTIKVFTTVDNTNLHTQIVDMSMTYGQQFGPTYLDGADVTKIKPHAKHEGKTFFVLPSDDTLRSEAFEYYHTLDESFLGRYMSALNHTKKWKFPQIGGLTSIKWADNNCYLSSVLLALQQIEVKFNAPALQEAYYRARAGDAANFCALILAYSNRTVGELGDVRETMTHLLQHANLESAKRVLNVVCKTCGQKSTTLTGVEAVMYMGTLSYEELKTGVTIPCICGRDATQYLVQQESSFVMMSAPPSEYTLQQGAFLCANEYTGSYQCGHYTHVTVKETLYRIDGAYLTKMSEYKGPVTDVFYKEISYTTTIKPVSYKLDGVIYTEIQPKLDEYYKKDNAYYTEQPIDLVPTQPLPNASFDNFKLTCSNTKFADDLNQMTGFKKPASRELSVTFFPDLNGDVVAIDYRHYSASFKKGAKLLHKPIIWHINQTTNKTTYKPNTWCLRCLWSTKPVETSNSFEVLEVEDTQGMDNLACESQTPTSEEVVENPTIQKEVIECDVKTIEVVGNVILKPSEEGVKVTQELGHEDLMAAYVEETSITIKKPNELSLALGLRTLATHGAAAINSVPWSKILAYVKPFLGQAAVTTTNCIKRCVQRVFNNYMPYVITLLFQLCTFTRSTNSRIRASLPTTIAKNSVKSVAKLCLDVCINYVKSPKFSKLFTIAMWLLLLSICLGSLIYVTAAFGVLLSNLGIPSYCDGVRESYVNSSNVTTMDFCEGSFLCSVCLNGLDSLDSYPALETIQVTISSYKLDLTSLGLAAEWFLAYMLFTKFFYLLGLSAIMQVFFGYFASHFISNSWLMWFIISIVQMAPVSAMVRMYIFFAFCYYVWKSYVHIMDGCTSSTCMMCYKRNRATRVECTTIVNGMKRSFYVYANGGRGFCKAHNWNCLNCDTFCAGSTFISDEVARDLSLQFKRPINPTDQSSYVVDSVAVKNGALHLYFDKAGQKTYERHPLSHFVNLDNLRANNTKGSLPINVIVFDGKSKCDESAAKSASVYYSQLMCQPILLLDQALVSDVGDSTEVSVKMFDAYVDTFSATFSVPMEKLKALVATAHSELAKGVALDGVLSTFVSAARQGVVDTDVDTKDVIECLKLSHHSDLEVTGDSCNNFMLTYNKVENMTPRDLGACIDCNARHINAQVAKSHNVSLIWNVKDYMSLSEQLRKQIRSAAKKNNIPFRLTCATTRQVVNAITTKISLKGGKIVSTWFKLMLKATLLCVLAALFCYIIMPVHSLSVHDGYTNEIIGYKAIQDGVTRDIMATDDCFANKHAGFDSWFSQRGGSYRNDKSCPVVAAIITREIGFIVPGLPGTVLRAINGDFLHFLPRVFSAVGNICYTPSKLIEYSDFATSACVLAAECTIFKDAMGKPVPYCYDTNLLEGSISYSELRPDTRYVLMDGSIIQFPNTYLEGSVRVVTTFDAEYCRHGTCERSEAGVCLSTSGRWVLNNEHYRALPGVFCGVDAMNLIANIFTPLVQPVGALDVSASVVAGGIIAILVTCAAYYFMKFRRAFGEYNHVVAANALLFLMSFTILCLAPAYSFLPGVYSIFYLYLTFYFTNDVSFLAHLQWFAMFSPIVPFWITAIYVFCISLKHCHWFFNNYLRKRVMFNGVTFSTFEEAALCTFLLNKEMYLKLRSETLLPLTQYNRYLALYNKYKYFSGALDTTSYREAACCHLAKALNDFSNSGADVLYQPPQTSITSAVLQSGFRKMAFPSGKVEGCMVQVTCGTTTLNGLWLDDTVYCPRHVICTAEDMLNPNYEDLLIRKSNHSFLVQAGNVQLRVIGHSMQNCLLRLKVDTSNPKTPKYKFVRIQPGQTFSVLACYNGSPSGVYQCAMRPNYTIKGSFLNGSCGSVGFNIDYDCVSFCYMHHMELPTGVHAGTDLEGKFYGPFVDRQTAQAAGTDTTITLNVLAWLYAAVINGDRWFLNRFTTTLNDFNLVAMKYNYEPLTQDHVDILGPLSAQTGIAVLDMCAALKELLQNGMNGRTILGSTILEDEFTPFDVVRQCSGVTFQGKFKKIVKGTHHWMLLTFLTSLLILVQSTQWSLFFFVYENAFLPFTLGIMAIAACAMLLVKHKHAFLCLFLLPSLATVAYFNMVYMPASWVMRIMTWLELADTSLSGYRLKDCVMYASALVLLVLMTARTVYDDAARRVWTLMNVITLVYKVYYGNSLDQAISMWALVISVTSNYSGVVTTIMFLARAIVFVCVEYYPLLFITGNTLQCIMLVYCFLGYCCCCYFGLFCLLNRYFRLTLGVYDYLVSTQEFRYMNSQGLLPPKSSIDAFKLNIKLLGIGGKPCIKVATVQSKMSDVKCTSVVLLSVLQQLRVESSSKLWAQCVQLHNDILLAKDTTEAFEKMVSLLSVLLSMQGAVDINKLCEEMLDNRATLQAIASEFSSLPSYAAYATAQEAYEQAVANGDSEVVLKKLKKSLNVAKSEFDRDAAMQRKLEKMADQAMTQMYKQARSEDKRAKVTSAMQTMLFTMLRKLDNDALNNIINNARDGCVPLNIIPLTTAAKLMVVVPDYGTYKNTCDGNTFTYASALWEIQQVVDADSKIVQLSEINMDNSQNLAWPLIVTALRANSAVKLQNNELSPVALRQMSCAAGTTQTACTDDNALAYYNNSKGGRFVLALLSDHQDLKWARFPKSDGTGTIYTELEPPCRFVTDTPRGPKVKYLYFIKGLNNLNRGMVLGSLAATVRLQAGNATEVPANSAVLSFCAFAVDPAKAYKDYLASGGQPITNCVKMLCTHTGTGQAITVTPEANMDQESFGGASCCLYCRCHIDHPNPKGFCDLKGKYVQIPATCANDPVGFTLKNTVCTVCGTWKGYGCSCDQLREPMMQSADASTFLNGFAV 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SGFRKMAFPSGKVEGCMVQVTCGTTTLNGLWLDDVVYCPRHVICTSEDMFNPNYEDLLIRKSNHNFLVQAGNVQLRVIGHSMQNCVLKLKVDTANPKTPKYKFVRIQPGQTFSVLACYNGSPSGVYQCAMRPNFTIKGSFLNGSCGSVGFNIDYDCVSFCYMHHMAFPTGVHAGTDLEGNFYGPFVDRQTAQAAGTDTTITVNVLAWLYAAVINGDRWFLNRFTTTLNDFNLVAMKYNYEPLTQDHVDILGPLSAQTGIAVLDMCASLKELLQNGMNGRTILGSALLEDEFTPFDVVRQCSGVTFQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 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4 2 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SGFRKMAFPSGKVEGCMVQVTCGTTTLNGLWLDDVVYCPRHVICTSEDMFNPNYEDLLIRKSNHNFLVQAGNVQLRVIGHSMQNCVLKLKVDTANPKTPKYKFVRIQPGQTFSVLACYNGSPSGVYQCAMRPNFTIKGSFLNGSCGSVGFNIDYDCVSFCYMHHMAFPTGVHAGTDLEGNFYGPFVDRQTAQAAGTDTTITVNVLAWLYAAVINGDRWFLNRFTTTLNDFNLVAMKYNYEPLTQDHVDILGPLSAQTGIAVLDMCASLKELLQNGMNGRTILGSALLEDEFTPFDVVRQCSGVTFQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.441}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 9n3m.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 3' 6 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A -7.761 34.709 18.676 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 15 C CB . PHE 3249 3249 ? A -10.421 33.153 18.385 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 16 C CG . PHE 3249 3249 ? A -10.403 31.735 18.874 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 17 C CD1 . PHE 3249 3249 ? A -11.437 31.275 19.701 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 18 C CD2 . PHE 3249 3249 ? A -9.363 30.857 18.535 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 19 C CE1 . PHE 3249 3249 ? A -11.444 29.958 20.174 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 20 C CE2 . PHE 3249 3249 ? A -9.376 29.537 18.995 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 21 C CZ . PHE 3249 3249 ? A -10.412 29.086 19.818 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 22 N N . ARG 3250 3250 ? A -7.834 33.556 20.597 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 23 C CA . ARG 3250 3250 ? A -6.424 33.619 20.872 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 24 C C . ARG 3250 3250 ? A -5.928 32.293 21.386 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 25 O O . ARG 3250 3250 ? A -6.637 31.513 22.012 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 26 C CB . ARG 3250 3250 ? A -6.148 34.660 21.983 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 27 C CG . ARG 3250 3250 ? A -6.463 36.122 21.600 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 28 C CD . 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ARG 3306 3306 ? A 26.811 8.576 46.088 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 459 C CB . ARG 3306 3306 ? A 27.418 7.611 43.217 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 460 C CG . ARG 3306 3306 ? A 27.947 6.767 42.038 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 461 C CD . ARG 3306 3306 ? A 29.400 6.269 42.122 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 462 N NE . ARG 3306 3306 ? A 29.472 4.948 42.834 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 463 C CZ . ARG 3306 3306 ? A 29.038 3.782 42.328 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 464 N NH1 . ARG 3306 3306 ? A 28.432 3.683 41.154 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 465 N NH2 . ARG 3306 3306 ? A 29.228 2.657 43.016 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 466 N N . LYS 3307 3307 ? A 24.868 8.397 44.971 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 467 C CA . LYS 3307 3307 ? A 24.226 9.537 45.578 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 468 C C . LYS 3307 3307 ? A 23.535 9.247 46.903 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 469 O O . LYS 3307 3307 ? A 22.808 8.277 47.091 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 470 C CB . LYS 3307 3307 ? A 23.235 10.205 44.593 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 471 C CG . LYS 3307 3307 ? 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B -15.681 43.897 22.793 1 1 B GLU 0.720 1 ATOM 3652 C CG . GLU 3412 3412 ? B -17.207 43.672 22.977 1 1 B GLU 0.720 1 ATOM 3653 C CD . GLU 3412 3412 ? B -17.529 42.185 23.141 1 1 B GLU 0.720 1 ATOM 3654 O OE1 . GLU 3412 3412 ? B -18.578 41.734 22.623 1 1 B GLU 0.720 1 ATOM 3655 O OE2 . GLU 3412 3412 ? B -16.692 41.461 23.746 1 1 B GLU 0.720 1 ATOM 3656 N N . LEU 3413 3413 ? B -15.477 45.878 20.325 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 3657 C CA . LEU 3413 3413 ? B -16.050 46.489 19.151 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 3658 C C . LEU 3413 3413 ? B -16.119 45.408 18.078 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 3659 O O . LEU 3413 3413 ? B -15.453 44.378 18.231 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 3660 C CB . LEU 3413 3413 ? B -15.156 47.683 18.705 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 3661 C CG . LEU 3413 3413 ? B -15.059 48.831 19.740 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 3662 C CD1 . LEU 3413 3413 ? B -13.997 49.872 19.350 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 3663 C CD2 . LEU 3413 3413 ? B -16.414 49.520 19.970 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 3664 N N . PRO 3414 3414 ? 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B 19.586 47.025 6.602 1 1 B LEU 0.760 1 ATOM 4396 O O . LEU 3508 3508 ? B 18.782 46.985 5.669 1 1 B LEU 0.760 1 ATOM 4397 C CB . LEU 3508 3508 ? B 20.403 49.406 7.156 1 1 B LEU 0.760 1 ATOM 4398 C CG . LEU 3508 3508 ? B 19.956 50.774 7.754 1 1 B LEU 0.760 1 ATOM 4399 C CD1 . LEU 3508 3508 ? B 18.446 51.038 7.593 1 1 B LEU 0.760 1 ATOM 4400 C CD2 . LEU 3508 3508 ? B 20.403 51.018 9.209 1 1 B LEU 0.760 1 ATOM 4401 N N . ASP 3509 3509 ? B 20.444 46.010 6.808 1 1 B ASP 0.770 1 ATOM 4402 C CA . ASP 3509 3509 ? B 20.452 44.794 6.019 1 1 B ASP 0.770 1 ATOM 4403 C C . ASP 3509 3509 ? B 19.162 43.985 6.263 1 1 B ASP 0.770 1 ATOM 4404 O O . ASP 3509 3509 ? B 18.508 43.487 5.344 1 1 B ASP 0.770 1 ATOM 4405 C CB . ASP 3509 3509 ? B 21.717 43.941 6.315 1 1 B ASP 0.770 1 ATOM 4406 C CG . ASP 3509 3509 ? B 23.062 44.645 6.112 1 1 B ASP 0.770 1 ATOM 4407 O OD1 . ASP 3509 3509 ? B 23.116 45.878 5.858 1 1 B ASP 0.770 1 ATOM 4408 O OD2 . ASP 3509 3509 ? 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LEU 3514 3514 ? B 11.370 43.532 3.840 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 4436 O O . LEU 3514 3514 ? B 10.253 43.174 3.471 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 4437 C CB . LEU 3514 3514 ? B 11.898 43.721 6.284 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 4438 C CG . LEU 3514 3514 ? B 10.438 44.088 6.635 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 4439 C CD1 . LEU 3514 3514 ? B 9.475 42.889 6.642 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 4440 C CD2 . LEU 3514 3514 ? B 10.385 44.807 7.988 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 4441 N N . LYS 3515 3515 ? B 12.029 44.502 3.183 1 1 B LYS 0.800 1 ATOM 4442 C CA . LYS 3515 3515 ? B 11.511 45.172 2.002 1 1 B LYS 0.800 1 ATOM 4443 C C . LYS 3515 3515 ? B 11.176 44.226 0.859 1 1 B LYS 0.800 1 ATOM 4444 O O . LYS 3515 3515 ? B 10.116 44.342 0.242 1 1 B LYS 0.800 1 ATOM 4445 C CB . LYS 3515 3515 ? B 12.546 46.220 1.529 1 1 B LYS 0.800 1 ATOM 4446 C CG . LYS 3515 3515 ? B 12.210 46.917 0.201 1 1 B LYS 0.800 1 ATOM 4447 C CD . LYS 3515 3515 ? B 13.313 47.857 -0.321 1 1 B LYS 0.800 1 ATOM 4448 C CE . LYS 3515 3515 ? 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