data_SMR-a95e2b74756ad1f0d32d6ed4ff624f86_1 _entry.id SMR-a95e2b74756ad1f0d32d6ed4ff624f86_1 _struct.entry_id SMR-a95e2b74756ad1f0d32d6ed4ff624f86_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - P0C6U4/ R1A_CVHN2, Replicase polyprotein 1a Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P0C6U4' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.5 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance 010 non-polymer phenylmethanol 'C7 H8 O' 108.140 'CCD Core' 02J 'peptide linking' '5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxylic acid' 'C5 H5 N O3' 127.099 'CCD Core' ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PJE 'peptide linking' '(E,4S)-4-azanyl-5-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pent-2-enoic acid' 'C9 H14 N2 O3' 198.222 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 579856.780 2 . 2 polymer man 02J-ALA-VAL-LEU-PJE-010 770.878 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP R1A_CVHN2 P0C6U4 1 ;MIKTSKYGLGFKWAPEFRWLLPDAAEELASPMKSDEGGLCPSTGQAMESVGFVYDNHVKIDCRCILGQEW HVQSNLIRDIFVHEDLHVVEVLTKTAVKSGTAILIKSPLHSLGGFPKGYVMGLFRSYKTKRYVVHHLSMT TSTTNFGEDFLGWIVPFGFMPSYVHKWFQFCRLYIEESDLIISNFKFDDYDFSVEDAYAEVHAEPKGKYS QKAYALLRQYRGIKPVLFVDQYGCDYSGKLADCLQAYGHYSLQDMRQKQSVWLANCDFDIVVAWHVVRDS RFVMRLQTIATICGIKYVAQPTEDVVDGAVVIREPVHLLSADAIVLKLPSLMKVMTHMDDFSIKSIYNVD LCDCGFVMQYGYVDCFNDNCDFYGWVSGNMMDGFSCPLCCTVYDSSEVKAQSSGVIPENPVLFTNSTDTV NPDSFNLYGYSVTPFGSCIYWSPRPGLWIPIIKSSVKSYDDLVYSGVVGCKSIVKETALITHALYLDYVQ CKCGNLEQNHILGVNNSWCRQLLLNRGDYNMLLKNIDLFVKRRADFACKFAVCGDGFVPFLLDGLIPRSY YLIQSGIFFTSLMSQFSQEVSDMCLKMCILFMDRVSVATFYIEHYVNRLVTQFKLLGTTLVNKMVNWFNT MLDASAPATGWLLYQLLNGLFVVSQANFNFVALIPDYAKILVNKFYTFFKLLLECVTVDVLKDMPVLKTI NGLVCIVGNKFYNVSTGLIPGFVLPCNAQEQQIYFFEGVAESVIVEDDVIENVKSSLSSYEYCQPPKSVE KICIIDNMYMGKCGDKFFPIVMNDKNICLLDQAWRFPCAGRKVNFNEKPVVMEIPSLMTVKVMFDLDSTF DDILGKVCSEFEVEKGVTVDDFVAVVCDAIENALNSCKDHPVVGYQVRAFLNKLNENVVYLFDEAGDEAM ASRMYCTFAIEDVEDVISSEAVEDTIDGVVEDTINDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDV VTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDV VTGDNDDEEIVTGDNDDQIVVTGDDVDDIESVYDFDTYKALLVFNDVYNDALFVSYGSSVETETYFKVNG LWSPTITHTNCWLRSVLLVMQKLPFKFKDLAIENMWLSYKVGYNQSFVDYLLTTIPKAIVLPQGGYVADF AYWFLNQFDINAYANWCCLKCGFSFDLNGLDAVFFYGDIVSHVCKCGHNMTLIAADLPCTLHFSLFDDNF CAFCTPKKIFIAACAVDVNVCHSVAVIGDEQIDGKFVTKFSGDKFDFIVGYGMSFSMSSFELAQLYGLCI TPNVCFVKGDIINVARLVKADVIVNPANGHMLHGGGVAKAIAVAAGKKFSKETAAMVKSKGVCQVGDCYV STGGKLCKTILNIVGPDARQDGRQSYVLLARAYKHLNNYDCCLSTLISAGIFSVPADVSLTYLLGVVDKQ VILVSNNKEDFDIIQKCQITSVVGTKALAVRLTANVGRVIKFETDAYKLFLSGDDCFVSNSSVIQEVLLL RHDIQLNNDVRDYLLSKMTSLPKDWRLINKFDVINGVKTVKYFECPNSIYICSQGKDFGYVCDGSFYKAT VNQVCVLLAKKIDVLLTVDGVNFKSISLTVGEVFGKILGNVFCDGIDVTKLKCSDFYADKILYQYENLSL ADISAVQSSFGFDQQQLLAYYNFLTVCKWSVVVNGPFFSFEQSHNNCYVNVACLMLQHINLKFNKWQWQE AWYEFRAGRPHRLVALVLAKGHFKFDEPSDATDFIRVVLKQADLSGAICELELICDCGIKQESRVGVDAV MHFGTLAKTDLFNGYKIGCNCAGRIVHCTKLNVPFLICSNTPLSKDLPDDVVAANMFMGVGVGHYTHLKC GSPYQHYDACSVKKYTGVSGCLTDCLYLKNLTQTFTSMLTNYFLDDVEMVAYNPDLSQYYCDNGKYYTKP IIKAQFKPFAKVDGVYTNFKLVGHDICAQLNDKLGFNVDLPFVEYKVTVWPVATGDVVLASDDLYVKRYF KGCETFGKPVIWLCHDEASLNSLTYFNKPSFKSENRYSVLSVDSVSEESQGNVVTSVMESQISTKEVKLK GVRKTVKIEDAIIVNDENSSIKVVKSLSLVDVWDMYLTGCDYVVWVANELSRLVKSPTVREYIRYGIKPI TIPIDLLCLRDDNQTLLVPKIFKARAIEFYGFLKWLFIYVFSLLHFTNDKTIFYTTEIASKFTFNLFCLA LKNAFQTFRWSIFIKGFLVVATVFLFWFNFLYINVIFSDFYLPNISVFPIFVGRIVMWIKATFGLVTICD FYSKLGVGFTSHFCNGSFICELCYSGFDMLDTYAAIDFVQYEVDRRVLFDYVSLVKLIVELVIGYSLYTV WFYPLFCLIGLQLFTTWLPDLFMLETMHWLIRFIVFVANMLPAFVLLRFYIVVTAMYKVVGFIRHIVYGC NKAGCLFCYKRNCSVRVKCSTIVGGVIRYYDITANGGTGFCVKHQWNCFNCHSFKPGNTFITVEAAIELS KELKRPVNPTDASHYVVTDIKQVGCMMRLFYDRDGQRVYDDVDASLFVDINNLLHSKVKVVPNLYVVVVE SDADRANFLNAVVFYAQSLYRPILLVDKKLITTACNGISVTQTMFDVYVDTFMSHFDVDRKSFNNFVNIA HASLREGVQLEKVLDTFVGCVRKCCSIDSDVETRFITKSMISAVAAGLEFTDENYNNLVPTYLKSDNIVA ADLGVLIQNGAKHVQGNVAKAANISCIWFIDTFNQLTADLQHKLKKACVKTGLKLKLTFNKQEASVPILT TPFSLKGGVVLSNLLYILFFISLICFILLWALLPTYSVYKSDIHLPAYASFKVIDNGVVRDISVNDLCFA NKFFQFDQWYESTFGSFYYHNSMDCPIVVAVMDEDIGSTMFNVPTKVLRHGFHVLHFLTYAFASDSVQCY TPHIQISYNDFYASGCVLSSLCTMFKRGDGTPHPYCYSDGVMKNASLYTSLVPHTRYSLANSNGFIRFPD VISEGIVRIVRTRSMTYCRVGACEYAEEGICFNFNSSWVLNNDYYRSMPGTFCGRDLFDLFYQFFSSLIR PIDFFSLTASSIFGAILAIVVVLVFYYLIKLKRAFGDYTSVVVINVIVWCINFLMLFVFQVYPICACVYA CFYFYVTLYFPSEISVIMHLQWIVMYGAIMPFWFCVTYVAMVIANHVLWLFSYCRKIGVNVCNDSTFEET SLTTFMITKDSYCRLKNSVSDVAYNRYLSLYNKYRYYSGKMDTAAYREAACSQLAKAMETFNHNNGNDVL YQPPTASVSTSFLQSGIVKMVSPTSKIEPCIVSVTYGSMTLNGLWLDDKVYCPRHVICLSSNMNEPDYSA LLCRVTLGDFTIMSGRMSLTVVSYQMQGCQLVLTVSLQNPYTPKYTFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAF HVTMRSSYTIKGSFLCGSCGSVGYVLTGDSVKFVYMHQLELSTGCHTGTDFTGNFYGPYRDAQVVQLPVK DYVQTVNVIAWLYAAILNNCAWFVQNDVCSIEDFNVWAMTNGFSQVKADLVLDALASMTGVSIETLLAAI KRLYMGFQGRQILGSCTFEDELAPSDVYQQLAGVKLQSKTKRFIKETIYWILISTFLFSCIISAFVKWTI FMYINTHMIGVTLCVLCFVSFMMLLVKHKHFYLTMYIIPVLCTLFYVNYLVVYKEGFRGLTYVWLSYFVP AVNFTYVYEVFYGCILCVFAIFITMHSINHDIFSLMFLVGRIVTLISMWYFGSNLEEDVLLFITAFLGTY TWTTILSLAIAKIVANWLSVNIFYFTDVPYIKLILLSYLFIGYILSCYWGFFSLLNSVFRMPMGVYNYKI SVQELRYMNANGLRPPRNSFEAILLNLKLLGIGGVPVIEVSQIQSKLTDVKCANVVLLNCLQHLHVASNS RLWQYCSILHNEILSTSDLSVAFDKLAQLLIVLFANPAAVDTKCLASIDEVSDDYVQDSTVLQALQSEFV NMASFVEYEVAKKNLADAKNSGSVNQQQIKQLEKACNIAKSVYERDKAVARKLERMADLALTNMYKEARI NDKKSKVVSALQTMLFSMVRKLDNQALNSILDNAVKGCVPLNAIPALAANTLTIIIPDKQVFDKVVDNVY VAYAGSVWHIQTVQDADGINKQLTDISVDSNWPLVIIANRYNEVANAVMQNNELMPHKLKIQVVNSGSDM NCNIPTQCYYNNGSSGRIVYAVLSDVDGLKYTKIIKDDGNCVVLELDPPCKFSIQDVKGLKIKYLYFIKG CNTLARGWVVGTLSSTIRLQAGVATEYAANSSILSLCAFSVDPKKTYLDYIQQGGVPIINCVKMLCDHAG TGMAITIKPEATINQDSYGGASVCIYCRARVEHPDVDGLCKLRGKFVQVPLGIKDPILYVLTHDVCQVCG FWRDGSCSCVGSGVAVQSKDLNFLNGFGVLV ; 'Replicase polyprotein 1a' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 4441 1 4441 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . R1A_CVHN2 P0C6U4 . 1 4441 443240 'Human coronavirus HKU1 (isolate N2) (HCoV-HKU1)' 2008-06-10 9BED41AF10453162 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MIKTSKYGLGFKWAPEFRWLLPDAAEELASPMKSDEGGLCPSTGQAMESVGFVYDNHVKIDCRCILGQEW HVQSNLIRDIFVHEDLHVVEVLTKTAVKSGTAILIKSPLHSLGGFPKGYVMGLFRSYKTKRYVVHHLSMT TSTTNFGEDFLGWIVPFGFMPSYVHKWFQFCRLYIEESDLIISNFKFDDYDFSVEDAYAEVHAEPKGKYS QKAYALLRQYRGIKPVLFVDQYGCDYSGKLADCLQAYGHYSLQDMRQKQSVWLANCDFDIVVAWHVVRDS RFVMRLQTIATICGIKYVAQPTEDVVDGAVVIREPVHLLSADAIVLKLPSLMKVMTHMDDFSIKSIYNVD LCDCGFVMQYGYVDCFNDNCDFYGWVSGNMMDGFSCPLCCTVYDSSEVKAQSSGVIPENPVLFTNSTDTV NPDSFNLYGYSVTPFGSCIYWSPRPGLWIPIIKSSVKSYDDLVYSGVVGCKSIVKETALITHALYLDYVQ CKCGNLEQNHILGVNNSWCRQLLLNRGDYNMLLKNIDLFVKRRADFACKFAVCGDGFVPFLLDGLIPRSY YLIQSGIFFTSLMSQFSQEVSDMCLKMCILFMDRVSVATFYIEHYVNRLVTQFKLLGTTLVNKMVNWFNT 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B 1 4394 LYS 4394 ? ? ? B . B 1 4395 ASP 4395 ? ? ? B . B 1 4396 PRO 4396 ? ? ? B . B 1 4397 ILE 4397 ? ? ? B . B 1 4398 LEU 4398 ? ? ? B . B 1 4399 TYR 4399 ? ? ? B . B 1 4400 VAL 4400 ? ? ? B . B 1 4401 LEU 4401 ? ? ? B . B 1 4402 THR 4402 ? ? ? B . B 1 4403 HIS 4403 ? ? ? B . B 1 4404 ASP 4404 ? ? ? B . B 1 4405 VAL 4405 ? ? ? B . B 1 4406 CYS 4406 ? ? ? B . B 1 4407 GLN 4407 ? ? ? B . B 1 4408 VAL 4408 ? ? ? B . B 1 4409 CYS 4409 ? ? ? B . B 1 4410 GLY 4410 ? ? ? B . B 1 4411 PHE 4411 ? ? ? B . B 1 4412 TRP 4412 ? ? ? B . B 1 4413 ARG 4413 ? ? ? B . B 1 4414 ASP 4414 ? ? ? B . B 1 4415 GLY 4415 ? ? ? B . B 1 4416 SER 4416 ? ? ? B . B 1 4417 CYS 4417 ? ? ? B . B 1 4418 SER 4418 ? ? ? B . B 1 4419 CYS 4419 ? ? ? B . B 1 4420 VAL 4420 ? ? ? B . B 1 4421 GLY 4421 ? ? ? B . B 1 4422 SER 4422 ? ? ? B . B 1 4423 GLY 4423 ? ? ? B . B 1 4424 VAL 4424 ? ? ? B . B 1 4425 ALA 4425 ? ? ? B . B 1 4426 VAL 4426 ? ? ? B . B 1 4427 GLN 4427 ? ? ? B . B 1 4428 SER 4428 ? ? ? B . B 1 4429 LYS 4429 ? ? ? B . B 1 4430 ASP 4430 ? ? ? B . B 1 4431 LEU 4431 ? ? ? B . B 1 4432 ASN 4432 ? ? ? B . B 1 4433 PHE 4433 ? ? ? B . B 1 4434 LEU 4434 ? ? ? B . B 1 4435 ASN 4435 ? ? ? B . B 1 4436 GLY 4436 ? ? ? B . B 1 4437 PHE 4437 ? ? ? B . B 1 4438 GLY 4438 ? ? ? B . B 1 4439 VAL 4439 ? ? ? B . B 1 4440 LEU 4440 ? ? ? B . B 1 4441 VAL 4441 ? ? ? B . C 2 1 02J 1 1 02J 02J '_' A C 2 2 ALA 1 1 ALA ALA '_' B C 2 3 VAL 1 1 VAL VAL '_' C C 2 4 LEU 1 1 LEU LEU '_' D C 2 5 PJE 1 1 PJE PJE '_' E C 2 6 010 1 1 010 010 '_' F D 2 1 02J 2 2 02J 02J '_' A D 2 2 ALA 2 2 ALA ALA '_' B D 2 3 VAL 2 2 VAL VAL '_' C D 2 4 LEU 2 2 LEU LEU '_' D D 2 5 PJE 2 2 PJE PJE '_' E D 2 6 010 2 2 010 010 '_' F # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Replicative polyprotein 1ab {PDB ID=6jij, label_asym_id=A, auth_asym_id=B, SMTL ID=6jij.1.A}' 'template structure' . 2 'Replicative polyprotein 1ab {PDB ID=6jij, label_asym_id=C, auth_asym_id=A, SMTL ID=6jij.1.B}' 'template structure' . 3 '02J-ALA-VAL-LEU-PJE-010 {PDB ID=6jij, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=6jij.1._.1}' 'template structure' . 4 '02J-ALA-VAL-LEU-PJE-010 {PDB ID=6jij, label_asym_id=F, auth_asym_id=F, SMTL ID=6jij.1._.2}' 'template structure' . 5 . target . 6 02J-ALA-VAL-LEU-PJE-010 target . 7 'Target-template alignment by BLAST to 6jij, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 8 'Target-template alignment by BLAST to 6jij, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 9 'model 1' 'model coordinates' . 10 SMTL 'reference database' . 11 PDB 'reference database' . 12 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 5 2 1 10 3 1 11 4 2 12 5 3 5 6 3 6 7 3 1 8 3 2 9 3 3 10 3 4 11 3 7 12 3 8 13 4 1 14 4 2 15 4 3 16 4 4 17 4 7 18 4 8 19 4 6 20 5 9 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 10 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-09-10 11 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-09-05 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 5 'reference database' 2 6 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . C 2 . D 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 B 2 2 'reference database' polymer 1 2 B C 1 1 A 3 3 'reference database' polymer 1 3 . D 2 1 D 4 4 'reference database' polymer 1 4 . F 2 1 F # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SGIVKMVSPTSKVEPCIVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVICSDMTDPDYPNLLCRVTSSDFCVMSGR MSLTVMSYQMQGCQLVLTVTLQNPNTPKYSFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAFHVTLRSSHTIKGSFLC GSCGSVGYVLTGDSVRFVYMHQLELSTGCHTGTDFSGNFYGPYRDAQVVQLPVQDYTQTVNVVAWLYAAI FNRCNWFVQSDSCSLEEFNVWAMTNGFSSIKADLVLDALASMTGVTVEQVLAAIKRLHSGFQGKQILGSC VFEDELTPSDVYQQLAGVKLQ ; ;SGIVKMVSPTSKVEPCIVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVICSDMTDPDYPNLLCRVTSSDFCVMSGR MSLTVMSYQMQGCQLVLTVTLQNPNTPKYSFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAFHVTLRSSHTIKGSFLC GSCGSVGYVLTGDSVRFVYMHQLELSTGCHTGTDFSGNFYGPYRDAQVVQLPVQDYTQTVNVVAWLYAAI FNRCNWFVQSDSCSLEEFNVWAMTNGFSSIKADLVLDALASMTGVTVEQVLAAIKRLHSGFQGKQILGSC VFEDELTPSDVYQQLAGVKLQ ; 2 ;SGIVKMVSPTSKVEPCIVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVICSDMTDPDYPNLLCRVTSSDFCVMSGR MSLTVMSYQMQGCQLVLTVTLQNPNTPKYSFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAFHVTLRSSHTIKGSFLC GSCGSVGYVLTGDSVRFVYMHQLELSTGCHTGTDFSGNFYGPYRDAQVVQLPVQDYTQTVNVVAWLYAAI FNRCNWFVQSDSCSLEEFNVWAMTNGFSSIKADLVLDALASMTGVTVEQVLAAIKRLHSGFQGKQILGSC VFEDELTPSDVYQQLAGVKLQ ; ;SGIVKMVSPTSKVEPCIVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVICSDMTDPDYPNLLCRVTSSDFCVMSGR MSLTVMSYQMQGCQLVLTVTLQNPNTPKYSFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAFHVTLRSSHTIKGSFLC GSCGSVGYVLTGDSVRFVYMHQLELSTGCHTGTDFSGNFYGPYRDAQVVQLPVQDYTQTVNVVAWLYAAI FNRCNWFVQSDSCSLEEFNVWAMTNGFSSIKADLVLDALASMTGVTVEQVLAAIKRLHSGFQGKQILGSC VFEDELTPSDVYQQLAGVKLQ ; 3 ?AVL?(010) ?AVL?X 4 ?AVL?(010) ?AVL?X # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 301 2 2 1 301 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6jij 2024-10-23 2 PDB . 6jij 2024-10-23 3 PDB . 6jij 2024-10-23 4 PDB . 6jij 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 4441 2 2 B 1 4441 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 7 1 4441 'target-template pairwise alignment' local 2 8 1 4441 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 8.75e-180 86.711 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'BLAST e-value' . 8.75e-180 86.711 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MIKTSKYGLGFKWAPEFRWLLPDAAEELASPMKSDEGGLCPSTGQAMESVGFVYDNHVKIDCRCILGQEWHVQSNLIRDIFVHEDLHVVEVLTKTAVKSGTAILIKSPLHSLGGFPKGYVMGLFRSYKTKRYVVHHLSMTTSTTNFGEDFLGWIVPFGFMPSYVHKWFQFCRLYIEESDLIISNFKFDDYDFSVEDAYAEVHAEPKGKYSQKAYALLRQYRGIKPVLFVDQYGCDYSGKLADCLQAYGHYSLQDMRQKQSVWLANCDFDIVVAWHVVRDSRFVMRLQTIATICGIKYVAQPTEDVVDGAVVIREPVHLLSADAIVLKLPSLMKVMTHMDDFSIKSIYNVDLCDCGFVMQYGYVDCFNDNCDFYGWVSGNMMDGFSCPLCCTVYDSSEVKAQSSGVIPENPVLFTNSTDTVNPDSFNLYGYSVTPFGSCIYWSPRPGLWIPIIKSSVKSYDDLVYSGVVGCKSIVKETALITHALYLDYVQCKCGNLEQNHILGVNNSWCRQLLLNRGDYNMLLKNIDLFVKRRADFACKFAVCGDGFVPFLLDGLIPRSYYLIQSGIFFTSLMSQFSQEVSDMCLKMCILFMDRVSVATFYIEHYVNRLVTQFKLLGTTLVNKMVNWFNTMLDASAPATGWLLYQLLNGLFVVSQANFNFVALIPDYAKILVNKFYTFFKLLLECVTVDVLKDMPVLKTINGLVCIVGNKFYNVSTGLIPGFVLPCNAQEQQIYFFEGVAESVIVEDDVIENVKSSLSSYEYCQPPKSVEKICIIDNMYMGKCGDKFFPIVMNDKNICLLDQAWRFPCAGRKVNFNEKPVVMEIPSLMTVKVMFDLDSTFDDILGKVCSEFEVEKGVTVDDFVAVVCDAIENALNSCKDHPVVGYQVRAFLNKLNENVVYLFDEAGDEAMASRMYCTFAIEDVEDVISSEAVEDTIDGVVEDTINDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEDVVTGDNDDEEIVTGDNDDQIVVTGDDVDDIESVYDFDTYKALLVFNDVYNDALFVSYGSSVETETYFKVNGLWSPTITHTNCWLRSVLLVMQKLPFKFKDLAIENMWLSYKVGYNQSFVDYLLTTIPKAIVLPQGGYVADFAYWFLNQFDINAYANWCCLKCGFSFDLNGLDAVFFYGDIVSHVCKCGHNMTLIAADLPCTLHFSLFDDNFCAFCTPKKIFIAACAVDVNVCHSVAVIGDEQIDGKFVTKFSGDKFDFIVGYGMSFSMSSFELAQLYGLCITPNVCFVKGDIINVARLVKADVIVNPANGHMLHGGGVAKAIAVAAGKKFSKETAAMVKSKGVCQVGDCYVSTGGKLCKTILNIVGPDARQDGRQSYVLLARAYKHLNNYDCCLSTLISAGIFSVPADVSLTYLLGVVDKQVILVSNNKEDFDIIQKCQITSVVGTKALAVRLTANVGRVIKFETDAYKLFLSGDDCFVSNSSVIQEVLLLRHDIQLNNDVRDYLLSKMTSLPKDWRLINKFDVINGVKTVKYFECPNSIYICSQGKDFGYVCDGSFYKATVNQVCVLLAKKIDVLLTVDGVNFKSISLTVGEVFGKILGNVFCDGIDVTKLKCSDFYADKILYQYENLSLADISAVQSSFGFDQQQLLAYYNFLTVCKWSVVVNGPFFSFEQSHNNCYVNVACLMLQHINLKFNKWQWQEAWYEFRAGRPHRLVALVLAKGHFKFDEPSDATDFIRVVLKQADLSGAICELELICDCGIKQESRVGVDAVMHFGTLAKTDLFNGYKIGCNCAGRIVHCTKLNVPFLICSNTPLSKDLPDDVVAANMFMGVGVGHYTHLKCGSPYQHYDACSVKKYTGVSGCLTDCLYLKNLTQTFTSMLTNYFLDDVEMVAYNPDLSQYYCDNGKYYTKPIIKAQFKPFAKVDGVYTNFKLVGHDICAQLNDKLGFNVDLPFVEYKVTVWPVATGDVVLASDDLYVKRYFKGCETFGKPVIWLCHDEASLNSLTYFNKPSFKSENRYSVLSVDSVSEESQGNVVTSVMESQISTKEVKLKGVRKTVKIEDAIIVNDENSSIKVVKSLSLVDVWDMYLTGCDYVVWVANELSRLVKSPTVREYIRYGIKPITIPIDLLCLRDDNQTLLVPKIFKARAIEFYGFLKWLFIYVFSLLHFTNDKTIFYTTEIASKFTFNLFCLALKNAFQTFRWSIFIKGFLVVATVFLFWFNFLYINVIFSDFYLPNISVFPIFVGRIVMWIKATFGLVTICDFYSKLGVGFTSHFCNGSFICELCYSGFDMLDTYAAIDFVQYEVDRRVLFDYVSLVKLIVELVIGYSLYTVWFYPLFCLIGLQLFTTWLPDLFMLETMHWLIRFIVFVANMLPAFVLLRFYIVVTAMYKVVGFIRHIVYGCNKAGCLFCYKRNCSVRVKCSTIVGGVIRYYDITANGGTGFCVKHQWNCFNCHSFKPGNTFITVEAAIELSKELKRPVNPTDASHYVVTDIKQVGCMMRLFYDRDGQRVYDDVDASLFVDINNLLHSKVKVVPNLYVVVVESDADRANFLNAVVFYAQSLYRPILLVDKKLITTACNGISVTQTMFDVYVDTFMSHFDVDRKSFNNFVNIAHASLREGVQLEKVLDTFVGCVRKCCSIDSDVETRFITKSMISAVAAGLEFTDENYNNLVPTYLKSDNIVAADLGVLIQNGAKHVQGNVAKAANISCIWFIDTFNQLTADLQHKLKKACVKTGLKLKLTFNKQEASVPILTTPFSLKGGVVLSNLLYILFFISLICFILLWALLPTYSVYKSDIHLPAYASFKVIDNGVVRDISVNDLCFANKFFQFDQWYESTFGSFYYHNSMDCPIVVAVMDEDIGSTMFNVPTKVLRHGFHVLHFLTYAFASDSVQCYTPHIQISYNDFYASGCVLSSLCTMFKRGDGTPHPYCYSDGVMKNASLYTSLVPHTRYSLANSNGFIRFPDVISEGIVRIVRTRSMTYCRVGACEYAEEGICFNFNSSWVLNNDYYRSMPGTFCGRDLFDLFYQFFSSLIRPIDFFSLTASSIFGAILAIVVVLVFYYLIKLKRAFGDYTSVVVINVIVWCINFLMLFVFQVYPICACVYACFYFYVTLYFPSEISVIMHLQWIVMYGAIMPFWFCVTYVAMVIANHVLWLFSYCRKIGVNVCNDSTFEETSLTTFMITKDSYCRLKNSVSDVAYNRYLSLYNKYRYYSGKMDTAAYREAACSQLAKAMETFNHNNGNDVLYQPPTASVSTSFLQSGIVKMVSPTSKIEPCIVSVTYGSMTLNGLWLDDKVYCPRHVICLSSNMNEPDYSALLCRVTLGDFTIMSGRMSLTVVSYQMQGCQLVLTVSLQNPYTPKYTFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAFHVTMRSSYTIKGSFLCGSCGSVGYVLTGDSVKFVYMHQLELSTGCHTGTDFTGNFYGPYRDAQVVQLPVKDYVQTVNVIAWLYAAILNNCAWFVQNDVCSIEDFNVWAMTNGFSQVKADLVLDALASMTGVSIETLLAAIKRLYMGFQGRQILGSCTFEDELAPSDVYQQLAGVKLQSKTKRFIKETIYWILISTFLFSCIISAFVKWTIFMYINTHMIGVTLCVLCFVSFMMLLVKHKHFYLTMYIIPVLCTLFYVNYLVVYKEGFRGLTYVWLSYFVPAVNFTYVYEVFYGCILCVFAIFITMHSINHDIFSLMFLVGRIVTLISMWYFGSNLEEDVLLFITAFLGTYTWTTILSLAIAKIVANWLSVNIFYFTDVPYIKLILLSYLFIGYILSCYWGFFSLLNSVFRMPMGVYNYKISVQELRYMNANGLRPPRNSFEAILLNLKLLGIGGVPVIEVSQIQSKLTDVKCANVVLLNCLQHLHVASNSRLWQYCSILHNEILSTSDLSVAFDKLAQLLIVLFANPAAVDTKCLASIDEVSDDYVQDSTVLQALQSEFVNMASFVEYEVAKKNLADAKNSGSVNQQQIKQLEKACNIAKSVYERDKAVARKLERMADLALTNMYKEARINDKKSKVVSALQTMLFSMVRKLDNQALNSILDNAVKGCVPLNAIPALAANTLTIIIPDKQVFDKVVDNVYVAYAGSVWHIQTVQDADGINKQLTDISVDSNWPLVIIANRYNEVANAVMQNNELMPHKLKIQVVNSGSDMNCNIPTQCYYNNGSSGRIVYAVLSDVDGLKYTKIIKDDGNCVVLELDPPCKFSIQDVKGLKIKYLYFIKGCNTLARGWVVGTLSSTIRLQAGVATEYAANSSILSLCAFSVDPKKTYLDYIQQGGVPIINCVKMLCDHAGTGMAITIKPEATINQDSYGGASVCIYCRARVEHPDVDGLCKLRGKFVQVPLGIKDPILYVLTHDVCQVCGFWRDGSCSCVGSGVAVQSKDLNFLNGFGVLV 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SGIVKMVSPTSKVEPCIVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVIC--SDMTDPDYPNLLCRVTSSDFCVMSGRMSLTVMSYQMQGCQLVLTVTLQNPNTPKYSFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAFHVTLRSSHTIKGSFLCGSCGSVGYVLTGDSVRFVYMHQLELSTGCHTGTDFSGNFYGPYRDAQVVQLPVQDYTQTVNVVAWLYAAIFNRCNWFVQSDSCSLEEFNVWAMTNGFSSIKADLVLDALASMTGVTVEQVLAAIKRLHSGFQGKQILGSCVFEDELTPSDVYQQLAGVKLQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 3 2 1 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4 2 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SGIVKMVSPTSKVEPCIVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVIC--SDMTDPDYPNLLCRVTSSDFCVMSGRMSLTVMSYQMQGCQLVLTVTLQNPNTPKYSFGVVKPGETFTVLAAYNGRPQGAFHVTLRSSHTIKGSFLCGSCGSVGYVLTGDSVRFVYMHQLELSTGCHTGTDFSGNFYGPYRDAQVVQLPVQDYTQTVNVVAWLYAAIFNRCNWFVQSDSCSLEEFNVWAMTNGFSSIKADLVLDALASMTGVTVEQVLAAIKRLHSGFQGKQILGSCVFEDELTPSDVYQQLAGVKLQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.516}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6jij.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 9 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 10.592 32.793 10.783 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 16 C CG1 . ILE 3307 3307 ? A 9.702 33.212 9.592 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 17 C CG2 . ILE 3307 3307 ? A 12.001 32.389 10.290 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 18 C CD1 . ILE 3307 3307 ? A 9.495 32.116 8.536 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 19 N N . VAL 3308 3308 ? A 11.288 29.780 12.230 1 1 A VAL 0.800 1 ATOM 20 C CA . VAL 3308 3308 ? A 12.230 29.036 13.042 1 1 A VAL 0.800 1 ATOM 21 C C . VAL 3308 3308 ? A 13.171 28.315 12.106 1 1 A VAL 0.800 1 ATOM 22 O O . VAL 3308 3308 ? A 12.921 28.167 10.910 1 1 A VAL 0.800 1 ATOM 23 C CB . VAL 3308 3308 ? A 11.582 28.024 13.995 1 1 A VAL 0.800 1 ATOM 24 C CG1 . VAL 3308 3308 ? A 10.719 28.748 15.043 1 1 A VAL 0.800 1 ATOM 25 C CG2 . VAL 3308 3308 ? A 10.727 27.022 13.206 1 1 A VAL 0.800 1 ATOM 26 N N . LYS 3309 3309 ? A 14.303 27.812 12.624 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 27 C CA . LYS 3309 3309 ? A 15.070 26.822 11.899 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 28 C C . LYS 3309 3309 ? A 14.402 25.471 12.072 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 29 O O . LYS 3309 3309 ? A 14.218 24.988 13.190 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 30 C CB . LYS 3309 3309 ? A 16.535 26.731 12.371 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 31 C CG . LYS 3309 3309 ? A 17.296 28.061 12.329 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 32 C CD . LYS 3309 3309 ? A 18.745 27.893 12.820 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 33 C CE . LYS 3309 3309 ? A 19.420 29.243 13.069 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 34 N NZ . LYS 3309 3309 ? A 20.813 29.083 13.495 1 1 A LYS 0.810 1 ATOM 35 N N . MET 3310 3310 ? A 13.990 24.848 10.963 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 36 C CA . MET 3310 3310 ? A 13.330 23.565 10.995 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 37 C C . MET 3310 3310 ? A 14.312 22.485 10.645 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 38 O O . MET 3310 3310 ? A 15.362 22.731 10.074 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 39 C CB . MET 3310 3310 ? A 12.146 23.516 10.002 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 40 C CG . MET 3310 3310 ? A 10.826 23.914 10.681 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 41 S SD . MET 3310 3310 ? A 9.417 24.251 9.594 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 42 C CE . MET 3310 3310 ? A 9.434 22.676 8.706 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 43 N N . VAL 3311 3311 ? A 13.988 21.238 10.987 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 44 C CA . VAL 3311 3311 ? A 14.787 20.102 10.581 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 45 C C . VAL 3311 3311 ? A 13.937 19.154 9.772 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 46 O O . VAL 3311 3311 ? A 12.724 19.022 9.964 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 47 C CB . VAL 3311 3311 ? A 15.447 19.349 11.727 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 48 C CG1 . VAL 3311 3311 ? A 16.318 20.323 12.539 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 49 C CG2 . VAL 3311 3311 ? A 14.408 18.674 12.626 1 1 A VAL 0.870 1 ATOM 50 N N . SER 3312 3312 ? A 14.568 18.443 8.827 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 51 C CA . SER 3312 3312 ? A 13.967 17.305 8.157 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 52 C C . SER 3312 3312 ? A 13.613 16.191 9.140 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 53 O O . SER 3312 3312 ? A 14.418 15.922 10.032 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 54 C CB . SER 3312 3312 ? A 14.926 16.653 7.130 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 55 O OG . SER 3312 3312 ? A 15.383 17.600 6.171 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 56 N N . PRO 3313 3313 ? A 12.476 15.515 9.042 1 1 A PRO 0.870 1 ATOM 57 C CA . PRO 3313 3313 ? A 12.199 14.265 9.756 1 1 A PRO 0.870 1 ATOM 58 C C . PRO 3313 3313 ? A 13.291 13.192 9.663 1 1 A PRO 0.870 1 ATOM 59 O O . PRO 3313 3313 ? A 13.979 13.096 8.640 1 1 A PRO 0.870 1 ATOM 60 C CB . PRO 3313 3313 ? A 10.831 13.844 9.208 1 1 A PRO 0.870 1 ATOM 61 C CG . PRO 3313 3313 ? A 10.166 15.149 8.773 1 1 A PRO 0.870 1 ATOM 62 C CD . PRO 3313 3313 ? A 11.337 15.941 8.225 1 1 A PRO 0.870 1 ATOM 63 N N . THR 3314 3314 ? A 13.514 12.416 10.740 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 64 C CA . THR 3314 3314 ? A 14.682 11.538 10.892 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 65 C C . THR 3314 3314 ? A 14.402 10.064 10.675 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 66 O O . THR 3314 3314 ? A 15.326 9.246 10.674 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 67 C CB . THR 3314 3314 ? A 15.374 11.688 12.237 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 68 O OG1 . THR 3314 3314 ? A 14.472 11.469 13.301 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 69 C CG2 . THR 3314 3314 ? A 15.834 13.138 12.396 1 1 A THR 0.870 1 ATOM 70 N N . SER 3315 3315 ? A 13.141 9.680 10.398 1 1 A SER 0.850 1 ATOM 71 C CA . 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B 18.662 21.978 19.428 1 1 B MET 0.820 1 ATOM 2332 C CA . MET 3310 3310 ? B 18.513 20.607 18.984 1 1 B MET 0.820 1 ATOM 2333 C C . MET 3310 3310 ? B 17.080 20.155 19.086 1 1 B MET 0.820 1 ATOM 2334 O O . MET 3310 3310 ? B 16.309 20.656 19.890 1 1 B MET 0.820 1 ATOM 2335 C CB . MET 3310 3310 ? B 19.377 19.633 19.823 1 1 B MET 0.820 1 ATOM 2336 C CG . MET 3310 3310 ? B 20.779 19.424 19.233 1 1 B MET 0.820 1 ATOM 2337 S SD . MET 3310 3310 ? B 21.908 18.421 20.240 1 1 B MET 0.820 1 ATOM 2338 C CE . MET 3310 3310 ? B 20.849 16.955 20.327 1 1 B MET 0.820 1 ATOM 2339 N N . VAL 3311 3311 ? B 16.697 19.160 18.276 1 1 B VAL 0.870 1 ATOM 2340 C CA . VAL 3311 3311 ? B 15.403 18.522 18.411 1 1 B VAL 0.870 1 ATOM 2341 C C . VAL 3311 3311 ? B 15.580 17.037 18.632 1 1 B VAL 0.870 1 ATOM 2342 O O . VAL 3311 3311 ? B 16.539 16.404 18.180 1 1 B VAL 0.870 1 ATOM 2343 C CB . VAL 3311 3311 ? B 14.451 18.758 17.248 1 1 B VAL 0.870 1 ATOM 2344 C CG1 . VAL 3311 3311 ? 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B -16.013 24.335 14.042 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 2633 C CA . LEU 3349 3349 ? B -15.567 25.565 13.407 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 2634 C C . LEU 3349 3349 ? B -15.672 25.453 11.898 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 2635 O O . LEU 3349 3349 ? B -15.679 26.465 11.208 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 2636 C CB . LEU 3349 3349 ? B -14.109 25.950 13.808 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 2637 C CG . LEU 3349 3349 ? B -13.948 26.661 15.175 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 2638 C CD1 . LEU 3349 3349 ? B -12.477 26.908 15.543 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 2639 C CD2 . LEU 3349 3349 ? B -14.664 28.012 15.211 1 1 B LEU 0.500 1 ATOM 2640 N N . SER 3350 3350 ? B -15.857 24.234 11.352 1 1 B SER 0.520 1 ATOM 2641 C CA . SER 3350 3350 ? B -15.908 23.966 9.917 1 1 B SER 0.520 1 ATOM 2642 C C . SER 3350 3350 ? B -16.983 24.722 9.176 1 1 B SER 0.520 1 ATOM 2643 O O . SER 3350 3350 ? B -16.795 25.139 8.033 1 1 B SER 0.520 1 ATOM 2644 C CB . SER 3350 3350 ? B -16.053 22.451 9.641 1 1 B SER 0.520 1 ATOM 2645 O OG . SER 3350 3350 ? 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