data_SMR-b1614cae7bd64bf3f2d61458a13f2603_2 _entry.id SMR-b1614cae7bd64bf3f2d61458a13f2603_2 _struct.entry_id SMR-b1614cae7bd64bf3f2d61458a13f2603_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9D415 (isoform 2)/ DLGP1_MOUSE, Disks large-associated protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.017, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9D415 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.6 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 121013.288 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DLGP1_MOUSE Q9D415 1 ;MKGLSGSRSHHHGITCEAACDSLSHHSDHKPYLLSPVDHHPADHPYYTQRNSFQAECVGPFSDPLASSTF PRRHYTSQQELKDESALVPRTLATKANRLPTNLLDQFERQLPLSRDGYHTLQYKRTAVEHRSDSPGRIRH LVHSVQKLFTKSHSLEGPSKGSVNGGKASPDESQTLRYGKRSKSKERRSESKARSNASNASPTSPSWWSS DDNLDGDMCLYHTPSGVMTMGRCPDRSASQYFMEAYNTISEQAVKASRSNNDIKCSTCANLPVTLDAPLL KKSAWSSTLTVSRAREVYQKASVNMDQAMVKSEACQQERSCQYLQVPQDEWSGYTPRGKDDEIPCRRMRS GSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYLRAVSEV SINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPLP GCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPF ISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDMISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGSNAAA VTTTTTIATVTTEDRKKDFKKNRCLSIGIQVDDAEEPEKMAESKTSNKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNS VTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTSTVSIQGSGNHYHACAADDDFDTDFDPSI LPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDRMEGWCKLMEREERENNLPEDILGKIRTAV GSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPL DKKVEQCRFCMVHLKPCTNAGQSK ; 'Disks large-associated protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 934 1 934 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . DLGP1_MOUSE Q9D415 Q9D415-2 1 934 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2005-07-19 224A365837BCE785 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no G ;MKGLSGSRSHHHGITCEAACDSLSHHSDHKPYLLSPVDHHPADHPYYTQRNSFQAECVGPFSDPLASSTF PRRHYTSQQELKDESALVPRTLATKANRLPTNLLDQFERQLPLSRDGYHTLQYKRTAVEHRSDSPGRIRH LVHSVQKLFTKSHSLEGPSKGSVNGGKASPDESQTLRYGKRSKSKERRSESKARSNASNASPTSPSWWSS DDNLDGDMCLYHTPSGVMTMGRCPDRSASQYFMEAYNTISEQAVKASRSNNDIKCSTCANLPVTLDAPLL KKSAWSSTLTVSRAREVYQKASVNMDQAMVKSEACQQERSCQYLQVPQDEWSGYTPRGKDDEIPCRRMRS GSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYLRAVSEV SINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPLP GCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPF ISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDMISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGSNAAA VTTTTTIATVTTEDRKKDFKKNRCLSIGIQVDDAEEPEKMAESKTSNKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNS VTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTSTVSIQGSGNHYHACAADDDFDTDFDPSI LPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDRMEGWCKLMEREERENNLPEDILGKIRTAV GSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPL DKKVEQCRFCMVHLKPCTNAGQSK ; ;MKGLSGSRSHHHGITCEAACDSLSHHSDHKPYLLSPVDHHPADHPYYTQRNSFQAECVGPFSDPLASSTF PRRHYTSQQELKDESALVPRTLATKANRLPTNLLDQFERQLPLSRDGYHTLQYKRTAVEHRSDSPGRIRH LVHSVQKLFTKSHSLEGPSKGSVNGGKASPDESQTLRYGKRSKSKERRSESKARSNASNASPTSPSWWSS DDNLDGDMCLYHTPSGVMTMGRCPDRSASQYFMEAYNTISEQAVKASRSNNDIKCSTCANLPVTLDAPLL KKSAWSSTLTVSRAREVYQKASVNMDQAMVKSEACQQERSCQYLQVPQDEWSGYTPRGKDDEIPCRRMRS GSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYLRAVSEV SINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPLP GCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPF ISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDMISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGSNAAA VTTTTTIATVTTEDRKKDFKKNRCLSIGIQVDDAEEPEKMAESKTSNKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNS VTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTSTVSIQGSGNHYHACAADDDFDTDFDPSI LPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDRMEGWCKLMEREERENNLPEDILGKIRTAV GSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPL DKKVEQCRFCMVHLKPCTNAGQSK ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 LYS . 1 3 GLY . 1 4 LEU . 1 5 SER . 1 6 GLY . 1 7 SER . 1 8 ARG . 1 9 SER . 1 10 HIS . 1 11 HIS . 1 12 HIS . 1 13 GLY . 1 14 ILE . 1 15 THR . 1 16 CYS . 1 17 GLU . 1 18 ALA . 1 19 ALA . 1 20 CYS . 1 21 ASP . 1 22 SER . 1 23 LEU . 1 24 SER . 1 25 HIS . 1 26 HIS . 1 27 SER . 1 28 ASP . 1 29 HIS . 1 30 LYS . 1 31 PRO . 1 32 TYR . 1 33 LEU . 1 34 LEU . 1 35 SER . 1 36 PRO . 1 37 VAL . 1 38 ASP . 1 39 HIS . 1 40 HIS . 1 41 PRO . 1 42 ALA . 1 43 ASP . 1 44 HIS . 1 45 PRO . 1 46 TYR . 1 47 TYR . 1 48 THR . 1 49 GLN . 1 50 ARG . 1 51 ASN . 1 52 SER . 1 53 PHE . 1 54 GLN . 1 55 ALA . 1 56 GLU . 1 57 CYS . 1 58 VAL . 1 59 GLY . 1 60 PRO . 1 61 PHE . 1 62 SER . 1 63 ASP . 1 64 PRO . 1 65 LEU . 1 66 ALA . 1 67 SER . 1 68 SER . 1 69 THR . 1 70 PHE . 1 71 PRO . 1 72 ARG . 1 73 ARG . 1 74 HIS . 1 75 TYR . 1 76 THR . 1 77 SER . 1 78 GLN . 1 79 GLN . 1 80 GLU . 1 81 LEU . 1 82 LYS . 1 83 ASP . 1 84 GLU . 1 85 SER . 1 86 ALA . 1 87 LEU . 1 88 VAL . 1 89 PRO . 1 90 ARG . 1 91 THR . 1 92 LEU . 1 93 ALA . 1 94 THR . 1 95 LYS . 1 96 ALA . 1 97 ASN . 1 98 ARG . 1 99 LEU . 1 100 PRO . 1 101 THR . 1 102 ASN . 1 103 LEU . 1 104 LEU . 1 105 ASP . 1 106 GLN . 1 107 PHE . 1 108 GLU . 1 109 ARG . 1 110 GLN . 1 111 LEU . 1 112 PRO . 1 113 LEU . 1 114 SER . 1 115 ARG . 1 116 ASP . 1 117 GLY . 1 118 TYR . 1 119 HIS . 1 120 THR . 1 121 LEU . 1 122 GLN . 1 123 TYR . 1 124 LYS . 1 125 ARG . 1 126 THR . 1 127 ALA . 1 128 VAL . 1 129 GLU . 1 130 HIS . 1 131 ARG . 1 132 SER . 1 133 ASP . 1 134 SER . 1 135 PRO . 1 136 GLY . 1 137 ARG . 1 138 ILE . 1 139 ARG . 1 140 HIS . 1 141 LEU . 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A 1 837 ARG 837 837 ARG ARG G . A 1 838 THR 838 838 THR THR G . A 1 839 ALA 839 839 ALA ALA G . A 1 840 VAL 840 840 VAL VAL G . A 1 841 GLY 841 841 GLY GLY G . A 1 842 SER 842 842 SER SER G . A 1 843 ALA 843 843 ALA ALA G . A 1 844 GLN 844 844 GLN GLN G . A 1 845 LEU 845 845 LEU LEU G . A 1 846 LEU 846 846 LEU LEU G . A 1 847 MET 847 847 MET MET G . A 1 848 ALA 848 848 ALA ALA G . A 1 849 GLN 849 849 GLN GLN G . A 1 850 LYS 850 850 LYS LYS G . A 1 851 PHE 851 851 PHE PHE G . A 1 852 TYR 852 852 TYR TYR G . A 1 853 GLN 853 853 GLN GLN G . A 1 854 PHE 854 854 PHE PHE G . A 1 855 ARG 855 855 ARG ARG G . A 1 856 GLU 856 856 GLU GLU G . A 1 857 LEU 857 857 LEU LEU G . A 1 858 CYS 858 858 CYS CYS G . A 1 859 GLU 859 859 GLU GLU G . A 1 860 GLU 860 860 GLU GLU G . A 1 861 ASN 861 861 ASN ASN G . A 1 862 LEU 862 ? ? ? G . A 1 863 ASN 863 ? ? ? G . A 1 864 PRO 864 ? ? ? G . A 1 865 ASN 865 ? ? ? G . A 1 866 ALA 866 ? ? ? G . A 1 867 HIS 867 ? ? ? G . A 1 868 PRO 868 ? ? ? G . A 1 869 ARG 869 ? ? ? G . A 1 870 PRO 870 ? ? ? G . A 1 871 THR 871 ? ? ? G . A 1 872 SER 872 ? ? ? G . A 1 873 GLN 873 ? ? ? G . A 1 874 ASP 874 ? ? ? G . A 1 875 LEU 875 ? ? ? G . A 1 876 ALA 876 ? ? ? G . A 1 877 GLY 877 ? ? ? G . A 1 878 PHE 878 ? ? ? G . A 1 879 TRP 879 ? ? ? G . A 1 880 ASP 880 ? ? ? G . A 1 881 MET 881 ? ? ? G . A 1 882 LEU 882 ? ? ? G . A 1 883 GLN 883 ? ? ? G . A 1 884 LEU 884 ? ? ? G . A 1 885 SER 885 ? ? ? G . A 1 886 ILE 886 ? ? ? G . A 1 887 GLU 887 ? ? ? G . A 1 888 ASN 888 ? ? ? G . A 1 889 ILE 889 ? ? ? G . A 1 890 SER 890 ? ? ? G . A 1 891 MET 891 ? ? ? G . A 1 892 LYS 892 ? ? ? G . A 1 893 PHE 893 ? ? ? G . A 1 894 ASP 894 ? ? ? G . A 1 895 GLU 895 ? ? ? G . A 1 896 LEU 896 ? ? ? G . A 1 897 HIS 897 ? ? ? G . A 1 898 GLN 898 ? ? ? G . A 1 899 LEU 899 ? ? ? G . A 1 900 LYS 900 ? ? ? G . A 1 901 ALA 901 ? ? ? G . A 1 902 ASN 902 ? ? ? G . A 1 903 ASN 903 ? ? ? G . A 1 904 TRP 904 ? ? ? G . A 1 905 LYS 905 ? ? ? G . A 1 906 GLN 906 ? ? ? G . 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G . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Nucleoporin NUP49/NSP49 {PDB ID=7n85, label_asym_id=G, auth_asym_id=C, SMTL ID=7n85.1.G}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7n85, label_asym_id=G' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-09-24 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-09-19 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A G 6 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MFGLNKASSTPAGGLFGQASGASTGNANTGFSFGGTQTGQNTGPSTGGLFGAKPAGSTGGLGASFGQQQQ QSQTNAFGGSATTGGGLFGNKPNNTANTGGGLFGANSNSNSGSLFGSNNAQTSRGLFGNNNTNNINNSSS GMNNASAGLFGSKPAGGTSLFGNTSTSSAPAQNQGMFGAKPAGTSLFGNNAGNTTTGGGLFGSKPTGATS LFGSSNNNNNNNNSNNIMSASGGLFGNQQQQLQQQPQMQCALQNLSQLPITPMTRISELPPQIRQEIEQL DQYIQKQVQISHHLKADTIDHDELIDSIPRDVAYLLKSESATSQYLKQDLKKISSFKSLIDEDLLDTQTF SVLLQQLLTPGSKISSNDLDKFFQKKIHLYEKKLEDYCRILSDIETAVNGIDTDLFGAPNNPNSTAITAD LGSSEAENLLQLKTGLAAIVSTVIEEFTLFMDIAERIAVLHQKTKTLASLSI ; ;MFGLNKASSTPAGGLFGQASGASTGNANTGFSFGGTQTGQNTGPSTGGLFGAKPAGSTGGLGASFGQQQQ QSQTNAFGGSATTGGGLFGNKPNNTANTGGGLFGANSNSNSGSLFGSNNAQTSRGLFGNNNTNNINNSSS GMNNASAGLFGSKPAGGTSLFGNTSTSSAPAQNQGMFGAKPAGTSLFGNNAGNTTTGGGLFGSKPTGATS LFGSSNNNNNNNNSNNIMSASGGLFGNQQQQLQQQPQMQCALQNLSQLPITPMTRISELPPQIRQEIEQL DQYIQKQVQISHHLKADTIDHDELIDSIPRDVAYLLKSESATSQYLKQDLKKISSFKSLIDEDLLDTQTF SVLLQQLLTPGSKISSNDLDKFFQKKIHLYEKKLEDYCRILSDIETAVNGIDTDLFGAPNNPNSTAITAD LGSSEAENLLQLKTGLAAIVSTVIEEFTLFMDIAERIAVLHQKTKTLASLSI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 272 343 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7n85 2024-06-05 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 934 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 941 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 17.000 13.846 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKGLSGSRSHHHGITCEAACDSLSHHSDHKPYLLSPVDHHPADHPYYTQRNSFQAECVGPFSDPLASSTFPRRHYTSQQELKDESALVPRTLATKANRLPTNLLDQFERQLPLSRDGYHTLQYKRTAVEHRSDSPGRIRHLVHSVQKLFTKSHSLEGPSKGSVNGGKASPDESQTLRYGKRSKSKERRSESKARSNASNASPTSPSWWSSDDNLDGDMCLYHTPSGVMTMGRCPDRSASQYFMEAYNTISEQAVKASRSNNDIKCSTCANLPVTLDAPLLKKSAWSSTLTVSRAREVYQKASVNMDQAMVKSEACQQERSCQYLQVPQDEWSGYTPRGKDDEIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYLRAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPLPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDMISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGSNAAAVTTTTTIATVTTEDRKKDFKKNRCLSIGIQVDDAEEPEKMAESKTSNKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTSTVSIQGSGNHYHACAADDDFDTDFDPSILPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDRMEGWCKLMEREERE-----NNLPEDILGKIRTAVGSAQLL--MAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKKVEQCRFCMVHLKPCTNAGQSK 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QIRQEIEQLDQYIQKQVQISHHLKADTIDHDELIDSIPRDVAYLLKSESATSQYLKQDLKKISSFKSLIDED------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7n85.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 2' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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