data_SMR-87dc2302b1dc1aec48202e1a6fdf1878_1 _entry.id SMR-87dc2302b1dc1aec48202e1a6fdf1878_1 _struct.entry_id SMR-87dc2302b1dc1aec48202e1a6fdf1878_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q5VT52 (isoform 2)/ RPRD2_HUMAN, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.102, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5VT52 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-08.6 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 178888.269 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RPRD2_HUMAN Q5VT52 1 ;MAAGGGGGSSKASSSSASSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSA YPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSVERIFKIWEDRNVYPEEMIVA LREALTSTNPKAALKSKIVAEFRSQALIEELLLYKRSEDQIELKEKQLSTMRVDVCSTETLKCLKDKTGG KKFSKEFEEASSKLEEFVNGLDKQVKNGPSLTEALENAGIFYEAQYKEVKVVANAYKTFANRVNNLKKKL DQLKSTLPDPEESPVPSPSMDAPSPTGSESPFQGMGGEESQSPTMESEKSATPEPVTDNRDVEDMELSDV EDDGSKIIVEDRKEKPAEKSAVSTSVPTKPTENISKASSCTPVPVTMTATPPLPKPVNTSLSPSPALALP NLANVDLAKISSILSSLTSVMKNTGVSPASRPSPGTPTSPSNLTSGLKTPAPATTTSHNPLANILSKVEI TPESILSALSKTQTQSAPALQGLSSLLQSVTGNPVPASEAASQSTSASPANTTVSTIKGRNLPSSAQPFI PKSFNYSPNSSTSEVSSTSASKASIGQSPGLPSTTFKLPSNSLGFTATHNTSPAAPPTEVTICQSSEVSK PKLESESTSPSLEMKIHNFLKGNPGFSGLNLNIPILSSLGSSAPSESHPSDFQRGPTSTSIDNIDGTPVR DERSGTPTQDEMMDKPTSSSVDTMSLLSKIISPGSSTPSSTRSPPPGRDESYPRELSNSVSTYRPFGLGS ESPYKQPSDGMERPSSLMDSSQEKFYPDTSFQEDEDYRDFEYSGPPPSAMMNLEKKPAKSILKSSKLSDT TEYQPILSSYSHRAQEFGVKSAFPPSVRALLDSSENCDRLSSSPGLFGAFSVRGNEPGSDRSPSPSKNDS FFTPDSNHNSLSQSTTGHLSLPQKQYPDSPHPVPHRSLFSPQNTLAAPTGHPPTSGVEKVLASTISTTST IEFKNMLKNASRKPSDDKHFGQAPSKGTPSDGVSLSNLTQPSLTATDQQQQEEHYRIETRVSSSCLDLPD STEEKGAPIETLGYHSASNRRMSGEPIQTVESIRVPGKGNRGHGREASRVGWFDLSTSGSSFDNGPSSAS ELASLGGGGSGGLTGFKTAPYKERAPQFQESVGSFRSNSFNSTFEHHLPPSPLEHGTPFQREPVGPSSAP PVPPKDHGGIFSRDAPTHLPSVDLSNPFTKEAALAHAAPPPPPGEHSGIPFPTPPPPPPPGEHSSSGGSG VPFSTPPPPPPPVDHSGVVPFPAPPLAEHGVAGAVAVFPKDHSSLLQGTLAEHFGVLPGPRDHGGPTQRD LNGPGLSRVRESLTLPSHSLEHLGPPHGGGGGGGSNSSSGPPLGPSHRDTISRSGIILRSPRPDFRPREP FLSRDPFHSLKRPRPPFARGPPFFAPKRPFFPPRY ; 'Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1435 1 1435 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . RPRD2_HUMAN Q5VT52 Q5VT52-2 1 1435 9606 'Homo sapiens (Human)' 2004-12-07 3425769AF329312E . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MAAGGGGGSSKASSSSASSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSA YPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSVERIFKIWEDRNVYPEEMIVA LREALTSTNPKAALKSKIVAEFRSQALIEELLLYKRSEDQIELKEKQLSTMRVDVCSTETLKCLKDKTGG KKFSKEFEEASSKLEEFVNGLDKQVKNGPSLTEALENAGIFYEAQYKEVKVVANAYKTFANRVNNLKKKL DQLKSTLPDPEESPVPSPSMDAPSPTGSESPFQGMGGEESQSPTMESEKSATPEPVTDNRDVEDMELSDV EDDGSKIIVEDRKEKPAEKSAVSTSVPTKPTENISKASSCTPVPVTMTATPPLPKPVNTSLSPSPALALP NLANVDLAKISSILSSLTSVMKNTGVSPASRPSPGTPTSPSNLTSGLKTPAPATTTSHNPLANILSKVEI TPESILSALSKTQTQSAPALQGLSSLLQSVTGNPVPASEAASQSTSASPANTTVSTIKGRNLPSSAQPFI PKSFNYSPNSSTSEVSSTSASKASIGQSPGLPSTTFKLPSNSLGFTATHNTSPAAPPTEVTICQSSEVSK PKLESESTSPSLEMKIHNFLKGNPGFSGLNLNIPILSSLGSSAPSESHPSDFQRGPTSTSIDNIDGTPVR DERSGTPTQDEMMDKPTSSSVDTMSLLSKIISPGSSTPSSTRSPPPGRDESYPRELSNSVSTYRPFGLGS ESPYKQPSDGMERPSSLMDSSQEKFYPDTSFQEDEDYRDFEYSGPPPSAMMNLEKKPAKSILKSSKLSDT TEYQPILSSYSHRAQEFGVKSAFPPSVRALLDSSENCDRLSSSPGLFGAFSVRGNEPGSDRSPSPSKNDS FFTPDSNHNSLSQSTTGHLSLPQKQYPDSPHPVPHRSLFSPQNTLAAPTGHPPTSGVEKVLASTISTTST IEFKNMLKNASRKPSDDKHFGQAPSKGTPSDGVSLSNLTQPSLTATDQQQQEEHYRIETRVSSSCLDLPD STEEKGAPIETLGYHSASNRRMSGEPIQTVESIRVPGKGNRGHGREASRVGWFDLSTSGSSFDNGPSSAS ELASLGGGGSGGLTGFKTAPYKERAPQFQESVGSFRSNSFNSTFEHHLPPSPLEHGTPFQREPVGPSSAP PVPPKDHGGIFSRDAPTHLPSVDLSNPFTKEAALAHAAPPPPPGEHSGIPFPTPPPPPPPGEHSSSGGSG VPFSTPPPPPPPVDHSGVVPFPAPPLAEHGVAGAVAVFPKDHSSLLQGTLAEHFGVLPGPRDHGGPTQRD LNGPGLSRVRESLTLPSHSLEHLGPPHGGGGGGGSNSSSGPPLGPSHRDTISRSGIILRSPRPDFRPREP FLSRDPFHSLKRPRPPFARGPPFFAPKRPFFPPRY ; ;MAAGGGGGSSKASSSSASSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSA YPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSVERIFKIWEDRNVYPEEMIVA LREALTSTNPKAALKSKIVAEFRSQALIEELLLYKRSEDQIELKEKQLSTMRVDVCSTETLKCLKDKTGG KKFSKEFEEASSKLEEFVNGLDKQVKNGPSLTEALENAGIFYEAQYKEVKVVANAYKTFANRVNNLKKKL DQLKSTLPDPEESPVPSPSMDAPSPTGSESPFQGMGGEESQSPTMESEKSATPEPVTDNRDVEDMELSDV EDDGSKIIVEDRKEKPAEKSAVSTSVPTKPTENISKASSCTPVPVTMTATPPLPKPVNTSLSPSPALALP NLANVDLAKISSILSSLTSVMKNTGVSPASRPSPGTPTSPSNLTSGLKTPAPATTTSHNPLANILSKVEI TPESILSALSKTQTQSAPALQGLSSLLQSVTGNPVPASEAASQSTSASPANTTVSTIKGRNLPSSAQPFI PKSFNYSPNSSTSEVSSTSASKASIGQSPGLPSTTFKLPSNSLGFTATHNTSPAAPPTEVTICQSSEVSK PKLESESTSPSLEMKIHNFLKGNPGFSGLNLNIPILSSLGSSAPSESHPSDFQRGPTSTSIDNIDGTPVR DERSGTPTQDEMMDKPTSSSVDTMSLLSKIISPGSSTPSSTRSPPPGRDESYPRELSNSVSTYRPFGLGS ESPYKQPSDGMERPSSLMDSSQEKFYPDTSFQEDEDYRDFEYSGPPPSAMMNLEKKPAKSILKSSKLSDT TEYQPILSSYSHRAQEFGVKSAFPPSVRALLDSSENCDRLSSSPGLFGAFSVRGNEPGSDRSPSPSKNDS FFTPDSNHNSLSQSTTGHLSLPQKQYPDSPHPVPHRSLFSPQNTLAAPTGHPPTSGVEKVLASTISTTST IEFKNMLKNASRKPSDDKHFGQAPSKGTPSDGVSLSNLTQPSLTATDQQQQEEHYRIETRVSSSCLDLPD STEEKGAPIETLGYHSASNRRMSGEPIQTVESIRVPGKGNRGHGREASRVGWFDLSTSGSSFDNGPSSAS ELASLGGGGSGGLTGFKTAPYKERAPQFQESVGSFRSNSFNSTFEHHLPPSPLEHGTPFQREPVGPSSAP PVPPKDHGGIFSRDAPTHLPSVDLSNPFTKEAALAHAAPPPPPGEHSGIPFPTPPPPPPPGEHSSSGGSG VPFSTPPPPPPPVDHSGVVPFPAPPLAEHGVAGAVAVFPKDHSSLLQGTLAEHFGVLPGPRDHGGPTQRD LNGPGLSRVRESLTLPSHSLEHLGPPHGGGGGGGSNSSSGPPLGPSHRDTISRSGIILRSPRPDFRPREP FLSRDPFHSLKRPRPPFARGPPFFAPKRPFFPPRY ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 ALA . 1 4 GLY . 1 5 GLY . 1 6 GLY . 1 7 GLY . 1 8 GLY . 1 9 SER . 1 10 SER . 1 11 LYS . 1 12 ALA . 1 13 SER . 1 14 SER . 1 15 SER . 1 16 SER . 1 17 ALA . 1 18 SER . 1 19 SER . 1 20 ALA . 1 21 GLY . 1 22 ALA . 1 23 LEU . 1 24 GLU . 1 25 SER . 1 26 SER . 1 27 LEU . 1 28 ASP . 1 29 ARG . 1 30 LYS . 1 31 PHE . 1 32 GLN . 1 33 SER . 1 34 VAL . 1 35 THR . 1 36 ASN . 1 37 THR . 1 38 MET . 1 39 GLU . 1 40 SER . 1 41 ILE . 1 42 GLN . 1 43 GLY . 1 44 LEU . 1 45 SER . 1 46 SER . 1 47 TRP . 1 48 CYS . 1 49 ILE . 1 50 GLU . 1 51 ASN . 1 52 LYS . 1 53 LYS 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B 1 1233 PRO 1233 ? ? ? B . B 1 1234 GLY 1234 ? ? ? B . B 1 1235 GLU 1235 ? ? ? B . B 1 1236 HIS 1236 ? ? ? B . B 1 1237 SER 1237 ? ? ? B . B 1 1238 GLY 1238 ? ? ? B . B 1 1239 ILE 1239 ? ? ? B . B 1 1240 PRO 1240 ? ? ? B . B 1 1241 PHE 1241 ? ? ? B . B 1 1242 PRO 1242 ? ? ? B . B 1 1243 THR 1243 ? ? ? B . B 1 1244 PRO 1244 ? ? ? B . B 1 1245 PRO 1245 ? ? ? B . B 1 1246 PRO 1246 ? ? ? B . B 1 1247 PRO 1247 ? ? ? B . B 1 1248 PRO 1248 ? ? ? B . B 1 1249 PRO 1249 ? ? ? B . B 1 1250 PRO 1250 ? ? ? B . B 1 1251 GLY 1251 ? ? ? B . B 1 1252 GLU 1252 ? ? ? B . B 1 1253 HIS 1253 ? ? ? B . B 1 1254 SER 1254 ? ? ? B . B 1 1255 SER 1255 ? ? ? B . B 1 1256 SER 1256 ? ? ? B . B 1 1257 GLY 1257 ? ? ? B . B 1 1258 GLY 1258 ? ? ? B . B 1 1259 SER 1259 ? ? ? B . B 1 1260 GLY 1260 ? ? ? B . B 1 1261 VAL 1261 ? ? ? B . B 1 1262 PRO 1262 ? ? ? B . B 1 1263 PHE 1263 ? ? ? B . B 1 1264 SER 1264 ? ? ? B . B 1 1265 THR 1265 ? ? ? B . B 1 1266 PRO 1266 ? ? ? B . B 1 1267 PRO 1267 ? ? ? B . B 1 1268 PRO 1268 ? ? ? B . B 1 1269 PRO 1269 ? ? ? B . B 1 1270 PRO 1270 ? ? ? B . B 1 1271 PRO 1271 ? ? ? B . B 1 1272 PRO 1272 ? ? ? B . B 1 1273 VAL 1273 ? ? ? B . B 1 1274 ASP 1274 ? ? ? B . B 1 1275 HIS 1275 ? ? ? B . B 1 1276 SER 1276 ? ? ? B . B 1 1277 GLY 1277 ? ? ? B . B 1 1278 VAL 1278 ? ? ? B . B 1 1279 VAL 1279 ? ? ? B . B 1 1280 PRO 1280 ? ? ? B . B 1 1281 PHE 1281 ? ? ? B . B 1 1282 PRO 1282 ? ? ? B . B 1 1283 ALA 1283 ? ? ? B . B 1 1284 PRO 1284 ? ? ? B . B 1 1285 PRO 1285 ? ? ? B . B 1 1286 LEU 1286 ? ? ? B . B 1 1287 ALA 1287 ? ? ? B . B 1 1288 GLU 1288 ? ? ? B . B 1 1289 HIS 1289 ? ? ? B . B 1 1290 GLY 1290 ? ? ? B . B 1 1291 VAL 1291 ? ? ? B . B 1 1292 ALA 1292 ? ? ? B . B 1 1293 GLY 1293 ? ? ? B . B 1 1294 ALA 1294 ? ? ? B . B 1 1295 VAL 1295 ? ? ? B . B 1 1296 ALA 1296 ? ? ? B . B 1 1297 VAL 1297 ? ? ? B . B 1 1298 PHE 1298 ? ? ? B . B 1 1299 PRO 1299 ? ? ? B . B 1 1300 LYS 1300 ? ? ? B . B 1 1301 ASP 1301 ? ? ? B . B 1 1302 HIS 1302 ? ? ? B . B 1 1303 SER 1303 ? ? ? B . B 1 1304 SER 1304 ? ? ? B . B 1 1305 LEU 1305 ? ? ? B . B 1 1306 LEU 1306 ? ? ? B . B 1 1307 GLN 1307 ? ? ? B . B 1 1308 GLY 1308 ? ? ? B . B 1 1309 THR 1309 ? ? ? B . B 1 1310 LEU 1310 ? ? ? B . B 1 1311 ALA 1311 ? ? ? B . B 1 1312 GLU 1312 ? ? ? B . B 1 1313 HIS 1313 ? ? ? B . B 1 1314 PHE 1314 ? ? ? B . B 1 1315 GLY 1315 ? ? ? B . B 1 1316 VAL 1316 ? ? ? B . B 1 1317 LEU 1317 ? ? ? B . B 1 1318 PRO 1318 ? ? ? B . B 1 1319 GLY 1319 ? ? ? B . B 1 1320 PRO 1320 ? ? ? B . B 1 1321 ARG 1321 ? ? ? B . B 1 1322 ASP 1322 ? ? ? B . B 1 1323 HIS 1323 ? ? ? B . B 1 1324 GLY 1324 ? ? ? B . B 1 1325 GLY 1325 ? ? ? B . B 1 1326 PRO 1326 ? ? ? B . B 1 1327 THR 1327 ? ? ? B . B 1 1328 GLN 1328 ? ? ? B . B 1 1329 ARG 1329 ? ? ? B . B 1 1330 ASP 1330 ? ? ? B . B 1 1331 LEU 1331 ? ? ? B . B 1 1332 ASN 1332 ? ? ? B . B 1 1333 GLY 1333 ? ? ? B . B 1 1334 PRO 1334 ? ? ? B . B 1 1335 GLY 1335 ? ? ? B . B 1 1336 LEU 1336 ? ? ? B . B 1 1337 SER 1337 ? ? ? B . B 1 1338 ARG 1338 ? ? ? B . B 1 1339 VAL 1339 ? ? ? B . B 1 1340 ARG 1340 ? ? ? B . B 1 1341 GLU 1341 ? ? ? B . B 1 1342 SER 1342 ? ? ? B . B 1 1343 LEU 1343 ? ? ? B . B 1 1344 THR 1344 ? ? ? B . B 1 1345 LEU 1345 ? ? ? B . B 1 1346 PRO 1346 ? ? ? B . B 1 1347 SER 1347 ? ? ? B . B 1 1348 HIS 1348 ? ? ? B . B 1 1349 SER 1349 ? ? ? B . B 1 1350 LEU 1350 ? ? ? B . B 1 1351 GLU 1351 ? ? ? B . B 1 1352 HIS 1352 ? ? ? B . B 1 1353 LEU 1353 ? ? ? B . B 1 1354 GLY 1354 ? ? ? B . B 1 1355 PRO 1355 ? ? ? B . B 1 1356 PRO 1356 ? ? ? B . B 1 1357 HIS 1357 ? ? ? B . B 1 1358 GLY 1358 ? ? ? B . B 1 1359 GLY 1359 ? ? ? B . B 1 1360 GLY 1360 ? ? ? B . B 1 1361 GLY 1361 ? ? ? B . B 1 1362 GLY 1362 ? ? ? B . B 1 1363 GLY 1363 ? ? ? B . B 1 1364 GLY 1364 ? ? ? B . B 1 1365 SER 1365 ? ? ? B . B 1 1366 ASN 1366 ? ? ? B . B 1 1367 SER 1367 ? ? ? B . B 1 1368 SER 1368 ? ? ? B . B 1 1369 SER 1369 ? ? ? B . B 1 1370 GLY 1370 ? ? ? B . B 1 1371 PRO 1371 ? ? ? B . B 1 1372 PRO 1372 ? ? ? B . B 1 1373 LEU 1373 ? ? ? B . B 1 1374 GLY 1374 ? ? ? B . B 1 1375 PRO 1375 ? ? ? B . B 1 1376 SER 1376 ? ? ? B . B 1 1377 HIS 1377 ? ? ? B . B 1 1378 ARG 1378 ? ? ? B . B 1 1379 ASP 1379 ? ? ? B . B 1 1380 THR 1380 ? ? ? B . B 1 1381 ILE 1381 ? ? ? B . B 1 1382 SER 1382 ? ? ? B . B 1 1383 ARG 1383 ? ? ? B . B 1 1384 SER 1384 ? ? ? B . B 1 1385 GLY 1385 ? ? ? B . B 1 1386 ILE 1386 ? ? ? B . B 1 1387 ILE 1387 ? ? ? B . B 1 1388 LEU 1388 ? ? ? B . B 1 1389 ARG 1389 ? ? ? B . B 1 1390 SER 1390 ? ? ? B . B 1 1391 PRO 1391 ? ? ? B . B 1 1392 ARG 1392 ? ? ? B . B 1 1393 PRO 1393 ? ? ? B . B 1 1394 ASP 1394 ? ? ? B . B 1 1395 PHE 1395 ? ? ? B . B 1 1396 ARG 1396 ? ? ? B . B 1 1397 PRO 1397 ? ? ? B . B 1 1398 ARG 1398 ? ? ? B . B 1 1399 GLU 1399 ? ? ? B . B 1 1400 PRO 1400 ? ? ? B . B 1 1401 PHE 1401 ? ? ? B . B 1 1402 LEU 1402 ? ? ? B . B 1 1403 SER 1403 ? ? ? B . B 1 1404 ARG 1404 ? ? ? B . B 1 1405 ASP 1405 ? ? ? B . B 1 1406 PRO 1406 ? ? ? B . B 1 1407 PHE 1407 ? ? ? B . B 1 1408 HIS 1408 ? ? ? B . B 1 1409 SER 1409 ? ? ? B . B 1 1410 LEU 1410 ? ? ? B . B 1 1411 LYS 1411 ? ? ? B . B 1 1412 ARG 1412 ? ? ? B . B 1 1413 PRO 1413 ? ? ? B . B 1 1414 ARG 1414 ? ? ? B . B 1 1415 PRO 1415 ? ? ? B . B 1 1416 PRO 1416 ? ? ? B . B 1 1417 PHE 1417 ? ? ? B . B 1 1418 ALA 1418 ? ? ? B . B 1 1419 ARG 1419 ? ? ? B . B 1 1420 GLY 1420 ? ? ? B . B 1 1421 PRO 1421 ? ? ? B . B 1 1422 PRO 1422 ? ? ? B . B 1 1423 PHE 1423 ? ? ? B . B 1 1424 PHE 1424 ? ? ? B . B 1 1425 ALA 1425 ? ? ? B . B 1 1426 PRO 1426 ? ? ? B . B 1 1427 LYS 1427 ? ? ? B . B 1 1428 ARG 1428 ? ? ? B . B 1 1429 PRO 1429 ? ? ? B . B 1 1430 PHE 1430 ? ? ? B . B 1 1431 PHE 1431 ? ? ? B . B 1 1432 PRO 1432 ? ? ? B . B 1 1433 PRO 1433 ? ? ? B . B 1 1434 ARG 1434 ? ? ? B . B 1 1435 TYR 1435 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2 {PDB ID=4flb, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=4flb.1.B}' 'template structure' . 2 'Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2 {PDB ID=4flb, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=4flb.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 4flb, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 4flb, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-09-24 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-09-19 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSAYPHRLNLFYLANDVIQN CKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSVERIFKIWEDRNVYPEEMIVALREALSTTFKTQKQLKE NLNK ; ;GSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSAYPHRLNLFYLANDVIQN CKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSVERIFKIWEDRNVYPEEMIVALREALSTTFKTQKQLKE NLNK ; 2 ;GSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSAYPHRLNLFYLANDVIQN CKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSVERIFKIWEDRNVYPEEMIVALREALSTTFKTQKQLKE NLNK ; ;GSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSAYPHRLNLFYLANDVIQN CKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSVERIFKIWEDRNVYPEEMIVALREALSTTFKTQKQLKE NLNK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 3 132 2 2 3 132 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4flb 2024-02-28 2 PDB . 4flb 2024-02-28 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1435 2 2 B 1 1435 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 1435 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 1435 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 7.4e-24 97.692 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 7.4e-24 97.692 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAAGGGGGSSKASSSSASSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSAYPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSVERIFKIWEDRNVYPEEMIVALREALTSTNPKAALKSKIVAEFRSQALIEELLLYKRSEDQIELKEKQLSTMRVDVCSTETLKCLKDKTGGKKFSKEFEEASSKLEEFVNGLDKQVKNGPSLTEALENAGIFYEAQYKEVKVVANAYKTFANRVNNLKKKLDQLKSTLPDPEESPVPSPSMDAPSPTGSESPFQGMGGEESQSPTMESEKSATPEPVTDNRDVEDMELSDVEDDGSKIIVEDRKEKPAEKSAVSTSVPTKPTENISKASSCTPVPVTMTATPPLPKPVNTSLSPSPALALPNLANVDLAKISSILSSLTSVMKNTGVSPASRPSPGTPTSPSNLTSGLKTPAPATTTSHNPLANILSKVEITPESILSALSKTQTQSAPALQGLSSLLQSVTGNPVPASEAASQSTSASPANTTVSTIKGRNLPSSAQPFIPKSFNYSPNSSTSEVSSTSASKASIGQSPGLPSTTFKLPSNSLGFTATHNTSPAAPPTEVTICQSSEVSKPKLESESTSPSLEMKIHNFLKGNPGFSGLNLNIPILSSLGSSAPSESHPSDFQRGPTSTSIDNIDGTPVRDERSGTPTQDEMMDKPTSSSVDTMSLLSKIISPGSSTPSSTRSPPPGRDESYPRELSNSVSTYRPFGLGSESPYKQPSDGMERPSSLMDSSQEKFYPDTSFQEDEDYRDFEYSGPPPSAMMNLEKKPAKSILKSSKLSDTTEYQPILSSYSHRAQEFGVKSAFPPSVRALLDSSENCDRLSSSPGLFGAFSVRGNEPGSDRSPSPSKNDSFFTPDSNHNSLSQSTTGHLSLPQKQYPDSPHPVPHRSLFSPQNTLAAPTGHPPTSGVEKVLASTISTTSTIEFKNMLKNASRKPSDDKHFGQAPSKGTPSDGVSLSNLTQPSLTATDQQQQEEHYRIETRVSSSCLDLPDSTEEKGAPIETLGYHSASNRRMSGEPIQTVESIRVPGKGNRGHGREASRVGWFDLSTSGSSFDNGPSSASELASLGGGGSGGLTGFKTAPYKERAPQFQESVGSFRSNSFNSTFEHHLPPSPLEHGTPFQREPVGPSSAPPVPPKDHGGIFSRDAPTHLPSVDLSNPFTKEAALAHAAPPPPPGEHSGIPFPTPPPPPPPGEHSSSGGSGVPFSTPPPPPPPVDHSGVVPFPAPPLAEHGVAGAVAVFPKDHSSLLQGTLAEHFGVLPGPRDHGGPTQRDLNGPGLSRVRESLTLPSHSLEHLGPPHGGGGGGGSNSSSGPPLGPSHRDTISRSGIILRSPRPDFRPREPFLSRDPFHSLKRPRPPFARGPPFFAPKRPFFPPRY 2 1 2 -------------------AGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSAYPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSVERIFKIWEDRNVYPEEMIVALREALSTTF-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MAAGGGGGSSKASSSSASSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSAYPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSVERIFKIWEDRNVYPEEMIVALREALTSTNPKAALKSKIVAEFRSQALIEELLLYKRSEDQIELKEKQLSTMRVDVCSTETLKCLKDKTGGKKFSKEFEEASSKLEEFVNGLDKQVKNGPSLTEALENAGIFYEAQYKEVKVVANAYKTFANRVNNLKKKLDQLKSTLPDPEESPVPSPSMDAPSPTGSESPFQGMGGEESQSPTMESEKSATPEPVTDNRDVEDMELSDVEDDGSKIIVEDRKEKPAEKSAVSTSVPTKPTENISKASSCTPVPVTMTATPPLPKPVNTSLSPSPALALPNLANVDLAKISSILSSLTSVMKNTGVSPASRPSPGTPTSPSNLTSGLKTPAPATTTSHNPLANILSKVEITPESILSALSKTQTQSAPALQGLSSLLQSVTGNPVPASEAASQSTSASPANTTVSTIKGRNLPSSAQPFIPKSFNYSPNSSTSEVSSTSASKASIGQSPGLPSTTFKLPSNSLGFTATHNTSPAAPPTEVTICQSSEVSKPKLESESTSPSLEMKIHNFLKGNPGFSGLNLNIPILSSLGSSAPSESHPSDFQRGPTSTSIDNIDGTPVRDERSGTPTQDEMMDKPTSSSVDTMSLLSKIISPGSSTPSSTRSPPPGRDESYPRELSNSVSTYRPFGLGSESPYKQPSDGMERPSSLMDSSQEKFYPDTSFQEDEDYRDFEYSGPPPSAMMNLEKKPAKSILKSSKLSDTTEYQPILSSYSHRAQEFGVKSAFPPSVRALLDSSENCDRLSSSPGLFGAFSVRGNEPGSDRSPSPSKNDSFFTPDSNHNSLSQSTTGHLSLPQKQYPDSPHPVPHRSLFSPQNTLAAPTGHPPTSGVEKVLASTISTTSTIEFKNMLKNASRKPSDDKHFGQAPSKGTPSDGVSLSNLTQPSLTATDQQQQEEHYRIETRVSSSCLDLPDSTEEKGAPIETLGYHSASNRRMSGEPIQTVESIRVPGKGNRGHGREASRVGWFDLSTSGSSFDNGPSSASELASLGGGGSGGLTGFKTAPYKERAPQFQESVGSFRSNSFNSTFEHHLPPSPLEHGTPFQREPVGPSSAPPVPPKDHGGIFSRDAPTHLPSVDLSNPFTKEAALAHAAPPPPPGEHSGIPFPTPPPPPPPGEHSSSGGSGVPFSTPPPPPPPVDHSGVVPFPAPPLAEHGVAGAVAVFPKDHSSLLQGTLAEHFGVLPGPRDHGGPTQRDLNGPGLSRVRESLTLPSHSLEHLGPPHGGGGGGGSNSSSGPPLGPSHRDTISRSGIILRSPRPDFRPREPFLSRDPFHSLKRPRPPFARGPPFFAPKRPFFPPRY 4 2 2 -------------------AGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSAYPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSVERIFKIWEDRNVYPEEMIVALREALSTTF-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.237}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4flb.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 6 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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LEU 23 23 ? A 10.135 16.211 65.949 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 17 C C . LEU 23 23 ? A 9.019 16.439 64.938 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 18 O O . LEU 23 23 ? A 8.069 17.153 65.240 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 19 C CB . LEU 23 23 ? A 11.395 17.012 65.588 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 20 C CG . LEU 23 23 ? A 11.259 18.534 65.697 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 21 C CD1 . LEU 23 23 ? A 10.883 19.023 67.108 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 22 C CD2 . LEU 23 23 ? A 12.596 19.136 65.275 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 23 N N . GLU 24 24 ? A 9.076 15.789 63.746 1 1 A GLU 0.820 1 ATOM 24 C CA . GLU 24 24 ? A 8.015 15.833 62.748 1 1 A GLU 0.820 1 ATOM 25 C C . GLU 24 24 ? A 6.695 15.315 63.299 1 1 A GLU 0.820 1 ATOM 26 O O . GLU 24 24 ? A 5.690 16.015 63.283 1 1 A GLU 0.820 1 ATOM 27 C CB . GLU 24 24 ? A 8.415 15.020 61.489 1 1 A GLU 0.820 1 ATOM 28 C CG . GLU 24 24 ? A 7.555 15.348 60.240 1 1 A GLU 0.820 1 ATOM 29 C CD . GLU 24 24 ? A 6.512 14.309 59.820 1 1 A GLU 0.820 1 ATOM 30 O OE1 . GLU 24 24 ? A 6.284 13.327 60.561 1 1 A GLU 0.820 1 ATOM 31 O OE2 . GLU 24 24 ? A 6.006 14.518 58.679 1 1 A GLU 0.820 1 ATOM 32 N N . SER 25 25 ? A 6.731 14.134 63.960 1 1 A SER 0.900 1 ATOM 33 C CA . SER 25 25 ? A 5.563 13.512 64.569 1 1 A SER 0.900 1 ATOM 34 C C . SER 25 25 ? A 4.911 14.358 65.652 1 1 A SER 0.900 1 ATOM 35 O O . SER 25 25 ? A 3.690 14.436 65.776 1 1 A SER 0.900 1 ATOM 36 C CB . SER 25 25 ? A 5.903 12.145 65.223 1 1 A SER 0.900 1 ATOM 37 O OG . SER 25 25 ? A 6.113 11.146 64.230 1 1 A SER 0.900 1 ATOM 38 N N . SER 26 26 ? A 5.722 15.023 66.508 1 1 A SER 0.940 1 ATOM 39 C CA . SER 26 26 ? A 5.210 15.994 67.471 1 1 A SER 0.940 1 ATOM 40 C C . SER 26 26 ? A 4.597 17.223 66.836 1 1 A SER 0.940 1 ATOM 41 O O . SER 26 26 ? A 3.545 17.674 67.278 1 1 A SER 0.940 1 ATOM 42 C CB . SER 26 26 ? A 6.272 16.545 68.457 1 1 A SER 0.940 1 ATOM 43 O OG . SER 26 26 ? A 6.618 15.595 69.471 1 1 A SER 0.940 1 ATOM 44 N N . LEU 27 27 ? A 5.246 17.807 65.810 1 1 A LEU 0.930 1 ATOM 45 C CA . LEU 27 27 ? A 4.764 18.978 65.098 1 1 A LEU 0.930 1 ATOM 46 C C . LEU 27 27 ? A 3.494 18.738 64.321 1 1 A LEU 0.930 1 ATOM 47 O O . LEU 27 27 ? A 2.583 19.561 64.381 1 1 A LEU 0.930 1 ATOM 48 C CB . LEU 27 27 ? A 5.851 19.538 64.158 1 1 A LEU 0.930 1 ATOM 49 C CG . LEU 27 27 ? A 7.019 20.169 64.932 1 1 A LEU 0.930 1 ATOM 50 C CD1 . LEU 27 27 ? A 8.244 20.370 64.033 1 1 A LEU 0.930 1 ATOM 51 C CD2 . LEU 27 27 ? A 6.608 21.502 65.561 1 1 A LEU 0.930 1 ATOM 52 N N . ASP 28 28 ? A 3.365 17.592 63.624 1 1 A ASP 0.920 1 ATOM 53 C CA . ASP 28 28 ? A 2.145 17.223 62.934 1 1 A ASP 0.920 1 ATOM 54 C C . ASP 28 28 ? A 0.959 17.092 63.863 1 1 A ASP 0.920 1 ATOM 55 O O . ASP 28 28 ? A -0.103 17.652 63.627 1 1 A ASP 0.920 1 ATOM 56 C CB . ASP 28 28 ? A 2.342 15.901 62.147 1 1 A ASP 0.920 1 ATOM 57 C CG . ASP 28 28 ? A 2.907 16.200 60.768 1 1 A ASP 0.920 1 ATOM 58 O OD1 . ASP 28 28 ? A 3.226 17.393 60.490 1 1 A ASP 0.920 1 ATOM 59 O OD2 . ASP 28 28 ? A 2.933 15.306 59.897 1 1 A ASP 0.920 1 ATOM 60 N N . 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A -1.113 21.545 66.881 1 1 A LYS 0.910 1 ATOM 75 C CB . LYS 30 30 ? A 1.659 20.366 68.148 1 1 A LYS 0.910 1 ATOM 76 C CG . LYS 30 30 ? A 2.140 19.579 69.378 1 1 A LYS 0.910 1 ATOM 77 C CD . LYS 30 30 ? A 3.554 19.994 69.812 1 1 A LYS 0.910 1 ATOM 78 C CE . LYS 30 30 ? A 4.208 19.011 70.775 1 1 A LYS 0.910 1 ATOM 79 N NZ . LYS 30 30 ? A 3.551 19.087 72.093 1 1 A LYS 0.910 1 ATOM 80 N N . PHE 31 31 ? A 0.301 20.864 65.295 1 1 A PHE 0.920 1 ATOM 81 C CA . PHE 31 31 ? A -0.195 21.833 64.330 1 1 A PHE 0.920 1 ATOM 82 C C . PHE 31 31 ? A -1.487 21.415 63.670 1 1 A PHE 0.920 1 ATOM 83 O O . PHE 31 31 ? A -2.226 22.266 63.189 1 1 A PHE 0.920 1 ATOM 84 C CB . PHE 31 31 ? A 0.829 22.122 63.204 1 1 A PHE 0.920 1 ATOM 85 C CG . PHE 31 31 ? A 2.025 22.912 63.659 1 1 A PHE 0.920 1 ATOM 86 C CD1 . PHE 31 31 ? A 1.947 23.942 64.616 1 1 A PHE 0.920 1 ATOM 87 C CD2 . PHE 31 31 ? A 3.261 22.659 63.043 1 1 A PHE 0.920 1 ATOM 88 C CE1 . PHE 31 31 ? A 3.094 24.662 64.971 1 1 A PHE 0.920 1 ATOM 89 C CE2 . 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B -18.607 34.526 77.522 1 1 B SER 0.930 1 ATOM 1168 C CB . SER 33 33 ? B -21.147 35.890 77.922 1 1 B SER 0.930 1 ATOM 1169 O OG . SER 33 33 ? B -20.804 37.133 77.298 1 1 B SER 0.930 1 ATOM 1170 N N . VAL 34 34 ? B -17.814 36.235 78.758 1 1 B VAL 0.930 1 ATOM 1171 C CA . VAL 34 34 ? B -16.472 36.144 78.201 1 1 B VAL 0.930 1 ATOM 1172 C C . VAL 34 34 ? B -15.840 34.783 78.458 1 1 B VAL 0.930 1 ATOM 1173 O O . VAL 34 34 ? B -15.938 34.198 79.532 1 1 B VAL 0.930 1 ATOM 1174 C CB . VAL 34 34 ? B -15.532 37.281 78.615 1 1 B VAL 0.930 1 ATOM 1175 C CG1 . VAL 34 34 ? B -15.197 37.215 80.120 1 1 B VAL 0.930 1 ATOM 1176 C CG2 . VAL 34 34 ? B -14.249 37.280 77.746 1 1 B VAL 0.930 1 ATOM 1177 N N . THR 35 35 ? B -15.190 34.222 77.433 1 1 B THR 0.920 1 ATOM 1178 C CA . THR 35 35 ? B -14.692 32.860 77.440 1 1 B THR 0.920 1 ATOM 1179 C C . THR 35 35 ? B -13.244 32.959 77.044 1 1 B THR 0.920 1 ATOM 1180 O O . THR 35 35 ? B -12.691 34.055 76.946 1 1 B THR 0.920 1 ATOM 1181 C CB . THR 35 35 ? B -15.508 31.856 76.604 1 1 B THR 0.920 1 ATOM 1182 O OG1 . THR 35 35 ? B -15.138 30.511 76.873 1 1 B THR 0.920 1 ATOM 1183 C CG2 . THR 35 35 ? B -15.372 32.055 75.090 1 1 B THR 0.920 1 ATOM 1184 N N . ASN 36 36 ? B -12.571 31.826 76.830 1 1 B ASN 0.900 1 ATOM 1185 C CA . ASN 36 36 ? B -11.145 31.729 76.626 1 1 B ASN 0.900 1 ATOM 1186 C C . ASN 36 36 ? B -10.742 31.707 75.154 1 1 B ASN 0.900 1 ATOM 1187 O O . ASN 36 36 ? B -9.604 31.424 74.815 1 1 B ASN 0.900 1 ATOM 1188 C CB . ASN 36 36 ? B -10.602 30.460 77.341 1 1 B ASN 0.900 1 ATOM 1189 C CG . ASN 36 36 ? B -11.157 29.151 76.778 1 1 B ASN 0.900 1 ATOM 1190 O OD1 . ASN 36 36 ? B -12.185 29.075 76.109 1 1 B ASN 0.900 1 ATOM 1191 N ND2 . ASN 36 36 ? B -10.420 28.052 77.054 1 1 B ASN 0.900 1 ATOM 1192 N N . THR 37 37 ? B -11.688 31.990 74.233 1 1 B THR 0.880 1 ATOM 1193 C CA . THR 37 37 ? B -11.427 31.986 72.802 1 1 B THR 0.880 1 ATOM 1194 C C . THR 37 37 ? B -10.890 33.324 72.374 1 1 B THR 0.880 1 ATOM 1195 O O . THR 37 37 ? B -11.275 34.364 72.912 1 1 B THR 0.880 1 ATOM 1196 C CB . THR 37 37 ? B -12.635 31.650 71.919 1 1 B THR 0.880 1 ATOM 1197 O OG1 . THR 37 37 ? B -13.720 32.560 72.053 1 1 B THR 0.880 1 ATOM 1198 C CG2 . THR 37 37 ? B -13.184 30.277 72.320 1 1 B THR 0.880 1 ATOM 1199 N N . MET 38 38 ? B -10.007 33.348 71.355 1 1 B MET 0.840 1 ATOM 1200 C CA . MET 38 38 ? B -9.490 34.578 70.784 1 1 B MET 0.840 1 ATOM 1201 C C . MET 38 38 ? B -10.604 35.473 70.265 1 1 B MET 0.840 1 ATOM 1202 O O . MET 38 38 ? B -10.626 36.671 70.518 1 1 B MET 0.840 1 ATOM 1203 C CB . MET 38 38 ? B -8.500 34.287 69.630 1 1 B MET 0.840 1 ATOM 1204 C CG . MET 38 38 ? B -7.183 33.626 70.082 1 1 B MET 0.840 1 ATOM 1205 S SD . MET 38 38 ? B -6.164 34.638 71.193 1 1 B MET 0.840 1 ATOM 1206 C CE . MET 38 38 ? B -5.621 35.912 70.025 1 1 B MET 0.840 1 ATOM 1207 N N . GLU 39 39 ? B -11.618 34.907 69.586 1 1 B GLU 0.880 1 ATOM 1208 C CA . GLU 39 39 ? B -12.776 35.645 69.127 1 1 B GLU 0.880 1 ATOM 1209 C C . GLU 39 39 ? B -13.598 36.322 70.220 1 1 B GLU 0.880 1 ATOM 1210 O O . GLU 39 39 ? B -13.976 37.479 70.083 1 1 B GLU 0.880 1 ATOM 1211 C CB . GLU 39 39 ? B -13.691 34.731 68.278 1 1 B GLU 0.880 1 ATOM 1212 C CG . GLU 39 39 ? B -13.036 34.324 66.932 1 1 B GLU 0.880 1 ATOM 1213 C CD . GLU 39 39 ? B -11.912 33.294 67.058 1 1 B GLU 0.880 1 ATOM 1214 O OE1 . GLU 39 39 ? B -11.895 32.541 68.073 1 1 B GLU 0.880 1 ATOM 1215 O OE2 . GLU 39 39 ? B -11.018 33.302 66.178 1 1 B GLU 0.880 1 ATOM 1216 N N . SER 40 40 ? B -13.866 35.636 71.356 1 1 B SER 0.940 1 ATOM 1217 C CA . SER 40 40 ? B -14.583 36.230 72.484 1 1 B SER 0.940 1 ATOM 1218 C C . SER 40 40 ? B -13.819 37.364 73.126 1 1 B SER 0.940 1 ATOM 1219 O O . SER 40 40 ? B -14.343 38.458 73.340 1 1 B SER 0.940 1 ATOM 1220 C CB . SER 40 40 ? B -14.831 35.151 73.566 1 1 B SER 0.940 1 ATOM 1221 O OG . SER 40 40 ? B -15.511 35.629 74.736 1 1 B SER 0.940 1 ATOM 1222 N N . ILE 41 41 ? B -12.518 37.135 73.394 1 1 B ILE 0.910 1 ATOM 1223 C CA . ILE 41 41 ? 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B -12.776 43.096 73.828 1 1 B SER 0.950 1 ATOM 1252 C CA . SER 45 45 ? B -11.705 44.089 73.900 1 1 B SER 0.950 1 ATOM 1253 C C . SER 45 45 ? B -11.933 45.258 72.957 1 1 B SER 0.950 1 ATOM 1254 O O . SER 45 45 ? B -11.872 46.418 73.351 1 1 B SER 0.950 1 ATOM 1255 C CB . SER 45 45 ? B -10.349 43.434 73.538 1 1 B SER 0.950 1 ATOM 1256 O OG . SER 45 45 ? B -9.231 44.315 73.620 1 1 B SER 0.950 1 ATOM 1257 N N . SER 46 46 ? B -12.310 44.957 71.690 1 1 B SER 0.940 1 ATOM 1258 C CA . SER 46 46 ? B -12.668 45.967 70.699 1 1 B SER 0.940 1 ATOM 1259 C C . SER 46 46 ? B -13.849 46.816 71.129 1 1 B SER 0.940 1 ATOM 1260 O O . SER 46 46 ? B -13.780 48.036 71.046 1 1 B SER 0.940 1 ATOM 1261 C CB . SER 46 46 ? B -13.010 45.364 69.309 1 1 B SER 0.940 1 ATOM 1262 O OG . SER 46 46 ? B -11.835 44.945 68.606 1 1 B SER 0.940 1 ATOM 1263 N N . TRP 47 47 ? B -14.927 46.199 71.675 1 1 B TRP 0.910 1 ATOM 1264 C CA . TRP 47 47 ? B -16.082 46.914 72.201 1 1 B TRP 0.910 1 ATOM 1265 C C . TRP 47 47 ? 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B -13.549 49.411 74.905 1 1 B CYS 0.910 1 ATOM 1280 O O . CYS 48 48 ? B -13.731 50.525 75.380 1 1 B CYS 0.910 1 ATOM 1281 C CB . CYS 48 48 ? B -13.505 47.399 76.387 1 1 B CYS 0.910 1 ATOM 1282 S SG . CYS 48 48 ? B -14.497 46.201 77.343 1 1 B CYS 0.910 1 ATOM 1283 N N . ILE 49 49 ? B -12.655 49.213 73.922 1 1 B ILE 0.880 1 ATOM 1284 C CA . ILE 49 49 ? B -11.878 50.276 73.305 1 1 B ILE 0.880 1 ATOM 1285 C C . ILE 49 49 ? B -12.719 51.276 72.500 1 1 B ILE 0.880 1 ATOM 1286 O O . ILE 49 49 ? B -12.487 52.481 72.572 1 1 B ILE 0.880 1 ATOM 1287 C CB . ILE 49 49 ? B -10.702 49.694 72.540 1 1 B ILE 0.880 1 ATOM 1288 C CG1 . ILE 49 49 ? B -9.721 49.037 73.549 1 1 B ILE 0.880 1 ATOM 1289 C CG2 . ILE 49 49 ? B -9.987 50.798 71.740 1 1 B ILE 0.880 1 ATOM 1290 C CD1 . ILE 49 49 ? B -8.641 48.153 72.912 1 1 B ILE 0.880 1 ATOM 1291 N N . GLU 50 50 ? B -13.766 50.820 71.766 1 1 B GLU 0.870 1 ATOM 1292 C CA . GLU 50 50 ? B -14.768 51.679 71.132 1 1 B GLU 0.870 1 ATOM 1293 C C . GLU 50 50 ? B -15.460 52.591 72.141 1 1 B GLU 0.870 1 ATOM 1294 O O . GLU 50 50 ? B -15.707 53.771 71.904 1 1 B GLU 0.870 1 ATOM 1295 C CB . GLU 50 50 ? B -15.864 50.825 70.443 1 1 B GLU 0.870 1 ATOM 1296 C CG . GLU 50 50 ? B -15.437 50.201 69.093 1 1 B GLU 0.870 1 ATOM 1297 C CD . GLU 50 50 ? B -16.515 49.287 68.504 1 1 B GLU 0.870 1 ATOM 1298 O OE1 . GLU 50 50 ? B -17.388 48.796 69.268 1 1 B GLU 0.870 1 ATOM 1299 O OE2 . GLU 50 50 ? B -16.439 49.059 67.269 1 1 B GLU 0.870 1 ATOM 1300 N N . ASN 51 51 ? B -15.722 52.048 73.343 1 1 B ASN 0.890 1 ATOM 1301 C CA . ASN 51 51 ? B -16.421 52.699 74.427 1 1 B ASN 0.890 1 ATOM 1302 C C . ASN 51 51 ? B -15.462 53.288 75.445 1 1 B ASN 0.890 1 ATOM 1303 O O . ASN 51 51 ? B -15.791 53.418 76.626 1 1 B ASN 0.890 1 ATOM 1304 C CB . ASN 51 51 ? B -17.378 51.700 75.116 1 1 B ASN 0.890 1 ATOM 1305 C CG . ASN 51 51 ? B -18.585 51.531 74.209 1 1 B ASN 0.890 1 ATOM 1306 O OD1 . ASN 51 51 ? B -19.477 52.380 74.210 1 1 B ASN 0.890 1 ATOM 1307 N ND2 . ASN 51 51 ? 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B -20.191 47.556 85.637 1 1 B HIS 0.920 1 ATOM 1392 N ND1 . HIS 61 61 ? B -21.173 47.125 86.520 1 1 B HIS 0.920 1 ATOM 1393 C CD2 . HIS 61 61 ? B -20.406 48.840 85.290 1 1 B HIS 0.920 1 ATOM 1394 C CE1 . HIS 61 61 ? B -21.964 48.167 86.672 1 1 B HIS 0.920 1 ATOM 1395 N NE2 . HIS 61 61 ? B -21.548 49.239 85.953 1 1 B HIS 0.920 1 ATOM 1396 N N . TRP 62 62 ? B -15.990 45.393 85.427 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1397 C CA . TRP 62 62 ? B -15.028 44.307 85.282 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1398 C C . TRP 62 62 ? B -14.607 43.762 86.633 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1399 O O . TRP 62 62 ? B -14.619 42.561 86.883 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1400 C CB . TRP 62 62 ? B -13.751 44.805 84.537 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1401 C CG . TRP 62 62 ? B -12.682 43.746 84.287 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1402 C CD1 . TRP 62 62 ? B -12.591 42.884 83.233 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1403 C CD2 . TRP 62 62 ? B -11.582 43.425 85.168 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1404 N NE1 . TRP 62 62 ? B -11.504 42.054 83.388 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1405 C CE2 . TRP 62 62 ? B -10.883 42.355 84.575 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1406 C CE3 . TRP 62 62 ? B -11.161 43.967 86.384 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1407 C CZ2 . TRP 62 62 ? B -9.767 41.799 85.186 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1408 C CZ3 . TRP 62 62 ? B -10.034 43.402 87.001 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1409 C CH2 . TRP 62 62 ? B -9.345 42.335 86.410 1 1 B TRP 0.930 1 ATOM 1410 N N . MET 63 63 ? B -14.280 44.675 87.566 1 1 B MET 0.900 1 ATOM 1411 C CA . MET 63 63 ? B -13.881 44.311 88.902 1 1 B MET 0.900 1 ATOM 1412 C C . MET 63 63 ? B -14.998 43.686 89.720 1 1 B MET 0.900 1 ATOM 1413 O O . MET 63 63 ? B -14.800 42.713 90.443 1 1 B MET 0.900 1 ATOM 1414 C CB . MET 63 63 ? B -13.265 45.524 89.628 1 1 B MET 0.900 1 ATOM 1415 C CG . MET 63 63 ? B -12.491 45.114 90.893 1 1 B MET 0.900 1 ATOM 1416 S SD . MET 63 63 ? B -11.211 43.863 90.577 1 1 B MET 0.900 1 ATOM 1417 C CE . MET 63 63 ? B -10.793 43.651 92.318 1 1 B MET 0.900 1 ATOM 1418 N N . LYS 64 64 ? B -16.237 44.201 89.583 1 1 B LYS 0.910 1 ATOM 1419 C CA . LYS 64 64 ? 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