data_SMR-df20e0247c439db1185cb599ee5e31de_1 _entry.id SMR-df20e0247c439db1185cb599ee5e31de_1 _struct.entry_id SMR-df20e0247c439db1185cb599ee5e31de_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O97592/ DMD_CANLF, Dystrophin Estimated model accuracy of this model is 0.038, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O97592' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-10.7 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 492513.142 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DMD_CANLF O97592 1 ;MLWWEEVEDCYEREDVQKKTFTKWVNAQFSKFGKQHIENLFSDLQDGRRLLDLLEGLTGQKLPKEKGSTR VHALNNVNKALRVLQKNNVDLVNIGSTDIVDGNHKLTLGLIWNIILHWQVKNVMKNIMAGLQQTNSEKIL LSWVRQSTRNYPQVNVINFTTSWSDGLALNALIHSHRPDLFDWNSVVCQQSATQRLEHAFNIAKYQLGIE KLLDPEDVATTYPDKKSILMYITSLFQVLPQQVSIEAIQEVEMLPRPSQVTREEHFQIHHQMHYSQQITV SLAQGYERAPSFPKPRFKSYAYTQAAYVTTSDPTRSPLPSQHLETPEDKSFGRSLTETEANLDSYQTALE EVLSWLLSAEDALQAQGEISNDVEEVKEQFHTHEGYMMDLTSHQGRVGNVLQLGSQLIGTGKLSEDEETE VQEQMNLLNSRWECLRVASMEKQSNLHKVLMDLQNQQLKELNDWLTKTEERTRKMEKEPLGPDIEDLKRQ VQQHKVLQEDLEQEQVRVNSLTHMVVVVDESSGDHATAALEEQLKVLGDRWANICRWTEDRWVLLQDILL KWQRFTEEQCLFSAWLSEKEDAVNKIHTTGFKDQSEVLSNLQKLAVLKTDLEKKKQTMDKLCSLNQDLLS ALKNTVVAHKMEAWLDNFAQRWDNLVQKLEKSSAQISQAVTTTQPSLTQTTVMETVTMVTTREHILVKHA QEELPPPPPQKKRQIIVDSEIRKRLDVDITELHSWITRSEAVLQSPEFAIYRKEGNFSDLKEKVNAIERE KAEKFRKLQDASRSAQALVEQMVNEGVNADSIKQASEQLNSRWIEFCQLLSERLNWLEYQNNIITFYNQL QQLEQMTTTAENWLKTQPTTTSEPTAIKSQLKICKDEINRLSALQPQIERLKIQSIALKEKGQGPMFLDA DFVAFTNHFNQVFADVQAREKELQTIFDSLPPMRYQETMSTILTWIQQSETKLSIPQVTVTEYDIMEQRL GELQALQSSLQEQQNGLNYLSTTVKEMSKKAPLSDISRKYQSEFEEIEGRWKKLSSQLVEHCQKLEEQMA KLRKIQNHIKTLKKWITEVDVFLKEEWPALGDSEILKRQLKQCRLLVNDIQTIQPSLNSVNEGAQKMKNE AEPEFAGRLETELRELNTQWDYMCRQVYARKEALKGGLDKTVSLQKDLSEMHEWMTQAEEEYLERDFEYK TPDELQTAVEEMKRAKEEAQQKEAKVKLLTESVNSVIAQAPPAAQEALKKELDTLTTNYQWLCTRLNGKC KTLEEVWACWHELLSYLEKANKWLSEVEVKLKTTENISGGAEEIAEVLDSLENLMQHSEDNPNQIRILAQ TLTDGGVMDELINEELETFNSRWRELHEEAVRRQKLLEQSIQSAQEIEKSLHLIQESLSSIDKQLAAYIA DKVDAAQMPQEAQKIQSDLTSHEISLEEMKKHNQGKETAQRVLSQIDVAQKKLQDVSMKFRLFQKPANFE QRLQESKMILDEVKMHLPALETKSVEQEVVQSQLNHCVNLYKSLSEVKSEVEMVIKTGRQIVQKKQTENP KELDERVTALKLHYNELGAKVTERKQQLEKCLKLSRKMRKEMNALTEWLAATDMELTKRSAVEGMPSNLD SEVAWGKATQKEIEKQKVHLKSVTEVGEALKTVLGKKEMLVEDKLSLLNSNWIAVTSRAEEWLNLLLEYQ KHMETFDQNVDYITNWIIQADALLDESEKKKPQQKEDILKRLKAEMNDIRPKVDSTRDQAANLMANRGDH CRKVVEPKISELNHRFAAISHRIKTGKASIPLKELEQFNSDIQKLLEPLEAEIQQGVNLKEEDFNKDMSE DNEGTVKELLQRGDNLQQRITDERKREEIKIKQQLLQTKHNALKDLRSQRRKKALEISHQWYQYKRQADD LLKCLDDIEKKLASLPEPRDERKIKEIDRELQKKKEELNAVRRQAEGLSEDGAAMAVEPTQIQLSKRWRE IESKFAQFRRLNFAQIHTVHEESVVAMTEDMPLEISYVPSTYLTEITHVSQALSEVEELLNAPDLCAQDF EDLFKQEESLKNIKDSLQQISGRIDIIHNKKTAALHSATPAERAKLQEALSRLDFQWERVNNMYKDRQGR FDRSVEKWRRFHYDMKILNQWLTEAEQFLKKTQIPENWEHAKYKWYLKELQDGIGQRQSVVRVLNATGEE IIQQSSKTDASILQEKLGSLNLRWQEVCKQLAERKKRLEEQKNILSEFQRDVNEFVLWLEEADNVANIPL EPGNEQQLKEKLEQVKLLAEELPLRQGILKQLNETGGTVLVSAPLSPEEQDKLENKLKQTNLQWIKVSRN LPEKQEEIEAHVKDLGQLEEQLNHLLLWLSPIRNQLEIYNQPNQTGPFDIKEIEVAVQAKQPDVEGILSK GQHLYKEKPATQPAKRKLEDLSSDWKVVTQLLQELRAKQPGPAPGLTTVRAPPSQTVTLVTQPAVTKETA ISKLEMPSSLLLEVPALADFNRAWTELTDWLSLLDRVIKSQRVMVGDLEDINEMIIKQKATLQDLEQRRP QLEELITAAQNLKNKTSNQEARTIITDRIERIQSQWDEVQEHLQNRRLQLTEMLKDSTQWLEAKEEAEQV LGQARAKLESWKEAPYTVDAIQKKITETKQLAKDLRQWQINVDVANDLALKLLRDYSADDTRKVHMITEN INASWASIHKRLSEREAALEETHRLLQQFPLDLEKFLAWLTEAETTANVLQDATHKERLLEDSKGVRELM KQWQDLQGEIEAHTDIYHNLDENGQKVLRSLEGSDDAALLQRRLDNMNFKWSELRKKSLNIRSHLEASSD QWKRLHLSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQKQNDVHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRIFLTE QPLEGLEKLYQEPRELPPEERAQNVTRLLRKQAEEVNTQWEKLNVHSADWQRKIDEALERLQELQEATDE LDLKLRQAEVIKGSWQPVGDLLIDSLQDHLEKVKALRGEITPLKENVSYVNDLARQLTTLGIQLSPYNLN TLEDLNTRWKLLQVAIEDRIRQLHEAHRDFGPASQHFLSTSVQGPWERAISPNKVPYYINHETQTTCWDH PKMTELYQSLADLNNVRFSAYRTAMKLRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQVINCLT TIYDRLEQEHNNLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASS TGFCDQRRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWMRLEPQSMVWL PVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHKMHYPMVEYCTPTTS GEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDNMETPVTLINFWPVDSAPASSPQLSHDDTHS RIEHYASRLKKMENSNGSYLNDSISPNESIDDEHLLIQHYWRSLNQESPLSQPRSPAQILISLESEERGE LERILADLEGRNRNLQAEYDRLKQQHEHKGLSPLPSPPEMMPTSPQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEAR MQILEDHNKQLESQLHRLRQLLEQPQAEAKVNGTTVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSESMGEEDL LSPPQDTSTGLEEVMEQLNHSFPSSRGRNTPGKPMREDTM ; Dystrophin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3680 1 3680 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . DMD_CANLF O97592 . 1 3680 9615 'Canis lupus familiaris (Dog) (Canis familiaris)' 1999-05-01 539F1C9D72377872 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no Z ;MLWWEEVEDCYEREDVQKKTFTKWVNAQFSKFGKQHIENLFSDLQDGRRLLDLLEGLTGQKLPKEKGSTR VHALNNVNKALRVLQKNNVDLVNIGSTDIVDGNHKLTLGLIWNIILHWQVKNVMKNIMAGLQQTNSEKIL LSWVRQSTRNYPQVNVINFTTSWSDGLALNALIHSHRPDLFDWNSVVCQQSATQRLEHAFNIAKYQLGIE KLLDPEDVATTYPDKKSILMYITSLFQVLPQQVSIEAIQEVEMLPRPSQVTREEHFQIHHQMHYSQQITV SLAQGYERAPSFPKPRFKSYAYTQAAYVTTSDPTRSPLPSQHLETPEDKSFGRSLTETEANLDSYQTALE EVLSWLLSAEDALQAQGEISNDVEEVKEQFHTHEGYMMDLTSHQGRVGNVLQLGSQLIGTGKLSEDEETE VQEQMNLLNSRWECLRVASMEKQSNLHKVLMDLQNQQLKELNDWLTKTEERTRKMEKEPLGPDIEDLKRQ VQQHKVLQEDLEQEQVRVNSLTHMVVVVDESSGDHATAALEEQLKVLGDRWANICRWTEDRWVLLQDILL KWQRFTEEQCLFSAWLSEKEDAVNKIHTTGFKDQSEVLSNLQKLAVLKTDLEKKKQTMDKLCSLNQDLLS 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A 1 3533 PRO 3533 ? ? ? Z . A 1 3534 LEU 3534 ? ? ? Z . A 1 3535 PRO 3535 ? ? ? Z . A 1 3536 SER 3536 ? ? ? Z . A 1 3537 PRO 3537 ? ? ? Z . A 1 3538 PRO 3538 ? ? ? Z . A 1 3539 GLU 3539 ? ? ? Z . A 1 3540 MET 3540 ? ? ? Z . A 1 3541 MET 3541 ? ? ? Z . A 1 3542 PRO 3542 ? ? ? Z . A 1 3543 THR 3543 ? ? ? Z . A 1 3544 SER 3544 ? ? ? Z . A 1 3545 PRO 3545 ? ? ? Z . A 1 3546 GLN 3546 ? ? ? Z . A 1 3547 SER 3547 ? ? ? Z . A 1 3548 PRO 3548 ? ? ? Z . A 1 3549 ARG 3549 ? ? ? Z . A 1 3550 ASP 3550 ? ? ? Z . A 1 3551 ALA 3551 ? ? ? Z . A 1 3552 GLU 3552 ? ? ? Z . A 1 3553 LEU 3553 ? ? ? Z . A 1 3554 ILE 3554 ? ? ? Z . A 1 3555 ALA 3555 ? ? ? Z . A 1 3556 GLU 3556 ? ? ? Z . A 1 3557 ALA 3557 ? ? ? Z . A 1 3558 LYS 3558 ? ? ? Z . A 1 3559 LEU 3559 ? ? ? Z . A 1 3560 LEU 3560 ? ? ? Z . A 1 3561 ARG 3561 ? ? ? Z . A 1 3562 GLN 3562 ? ? ? Z . A 1 3563 HIS 3563 ? ? ? Z . A 1 3564 LYS 3564 ? ? ? Z . A 1 3565 GLY 3565 ? ? ? Z . A 1 3566 ARG 3566 ? ? ? Z . A 1 3567 LEU 3567 ? ? ? Z . 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A 1 3638 GLU 3638 ? ? ? Z . A 1 3639 ASP 3639 ? ? ? Z . A 1 3640 LEU 3640 ? ? ? Z . A 1 3641 LEU 3641 ? ? ? Z . A 1 3642 SER 3642 ? ? ? Z . A 1 3643 PRO 3643 ? ? ? Z . A 1 3644 PRO 3644 ? ? ? Z . A 1 3645 GLN 3645 ? ? ? Z . A 1 3646 ASP 3646 ? ? ? Z . A 1 3647 THR 3647 ? ? ? Z . A 1 3648 SER 3648 ? ? ? Z . A 1 3649 THR 3649 ? ? ? Z . A 1 3650 GLY 3650 ? ? ? Z . A 1 3651 LEU 3651 ? ? ? Z . A 1 3652 GLU 3652 ? ? ? Z . A 1 3653 GLU 3653 ? ? ? Z . A 1 3654 VAL 3654 ? ? ? Z . A 1 3655 MET 3655 ? ? ? Z . A 1 3656 GLU 3656 ? ? ? Z . A 1 3657 GLN 3657 ? ? ? Z . A 1 3658 LEU 3658 ? ? ? Z . A 1 3659 ASN 3659 ? ? ? Z . A 1 3660 HIS 3660 ? ? ? Z . A 1 3661 SER 3661 ? ? ? Z . A 1 3662 PHE 3662 ? ? ? Z . A 1 3663 PRO 3663 ? ? ? Z . A 1 3664 SER 3664 ? ? ? Z . A 1 3665 SER 3665 ? ? ? Z . A 1 3666 ARG 3666 ? ? ? Z . A 1 3667 GLY 3667 ? ? ? Z . A 1 3668 ARG 3668 ? ? ? Z . A 1 3669 ASN 3669 ? ? ? Z . A 1 3670 THR 3670 ? ? ? Z . A 1 3671 PRO 3671 ? ? ? Z . A 1 3672 GLY 3672 ? ? ? Z . 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Z . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Spectrin beta chain {PDB ID=8iai, label_asym_id=Z, auth_asym_id=S, SMTL ID=8iai.1.Z}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8iai, label_asym_id=Z' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-10-22 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-10-17 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A Z 5 1 S # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MTSATEFENVGNQPPYSRINARWDAPDDELDNDNSSARLFERSRIKALADEREVVQKKTFTKWVNSHLAR VSCRITDLYKDLRDGRMLIKLLEVLSGEMLPKPTKGKMRIHCLENVDKALQFLKEQRVHLENMGSHDIVD GNHRLVLGLIWTIILRFQIQDIVVQTQEGRETRSAKDALLLWCQMKTAGYPNVNVTNFTSSWKDGLAFNA LIHKHRPDLIDFDKLKDSNARHNLEHAFDVAERQLGIIQLLDPEDVFTENPDEKSIITYVVAFYHYFSKM KVLAVEGKRVGKVIDHAIETEKMIEKYSGLASDLLTWIEQTITVLNSRKFANSLAGVQQQLQAFSTYRTV EKPPKFQEKGNLEVLLFTIQSRMRANNQKVYTPHDGKLVSDINRAWESLEEAEYRRELALRSELIRQEKL EQLARRFDRKAAMRETWLNENQRLVAQDNFGYDLAAVEAAKKKHEAIETDTAAYEERVRALEDLARELEL ENYHDQKRITARKDNILRLWNYLQELLQSRRQRLETTLALQQLFQDMLHSIDWMDEIKAHLLSAEFGKHL 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ELASQQGWLENIDAEGKQLMEEKPQFEALVSQRLEALHRLWDELQATTKEIGQRLSAARSSDLRSQTHAD LNKWIRAMEDQLRSDDLGKDLTSVNRMLAKLKRVEDQVNVRKEELGELFAHMPSPGEEAEDEDLSIEKRF LDLLEPLGRRKKQLESSKAKLQISRDLEDETLWVEERLPLAQSTDYGANLQTVQLFMKKNQTLQNEILGH APRVEDVLYRGHQLVEAAEIDCQDIEERLGHLQNSWDTLQEAAAGRLQRLWDASEAQQYYLDAGEAEAWI SEQELYVISDEMPQDEEGAIVMLKRHLRQQRMVEEYERNIKQLAGRAQSLLAAGHPEGEQIIRLQGQVDK HYAGLKDMAEDRKRKLENKYRQFQMEREADDLEQWILEKDLVASSPEMGQDFDHVTLLRDKFRDFARETG AIGQERVDNMNALIEHLIDAGHEEAASIAERKDGLNEMWADVLELIDTRMQLLAASYDRHRYFYTGNEIL GLIDEKHRELPEDVGLDASTAESFHRVHTAFERELHQLGVQVQQFQDVATRLQAAYAGEEADSIQNKEQE VSAAWQALLDACAGRRTQLVDTADKFRFFSMVRDLLSWMETIIRQIETQERPRDVSSVELLMKYHQGIWA EMDTRSKNFSACLELGESLLQRQHQASDEIREKLQQVVSKKKEIDEKWKARSDRLSMLLEVCQFSRDASV AEAWLIAQEPYLSSRDFGHTVDSVEKLIKRHEAFEKSTASWEPRFAALEKPTTLELKERQTPERPKEDAG PQEEEGETAGEAPRGPHRAATERTSPVSSLSHLSSSWESLLPEPAHPY ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 48 2088 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8iai 2025-06-18 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3680 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 3705 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5e-120 19.494 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 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2 1 2 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# # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8iai.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 339.265 361.350 284.290 1 1 Z TYR 0.550 1 ATOM 16 C CA . TYR 11 11 ? A 339.790 362.327 285.242 1 1 Z TYR 0.550 1 ATOM 17 C C . TYR 11 11 ? A 339.621 363.773 284.773 1 1 Z TYR 0.550 1 ATOM 18 O O . TYR 11 11 ? A 339.084 364.598 285.484 1 1 Z TYR 0.550 1 ATOM 19 C CB . TYR 11 11 ? A 341.268 362.026 285.610 1 1 Z TYR 0.550 1 ATOM 20 C CG . TYR 11 11 ? A 341.376 360.729 286.367 1 1 Z TYR 0.550 1 ATOM 21 C CD1 . TYR 11 11 ? A 340.922 360.665 287.691 1 1 Z TYR 0.550 1 ATOM 22 C CD2 . TYR 11 11 ? A 341.956 359.581 285.802 1 1 Z TYR 0.550 1 ATOM 23 C CE1 . TYR 11 11 ? A 341.038 359.484 288.435 1 1 Z TYR 0.550 1 ATOM 24 C CE2 . TYR 11 11 ? A 342.069 358.395 286.546 1 1 Z TYR 0.550 1 ATOM 25 C CZ . TYR 11 11 ? A 341.605 358.346 287.864 1 1 Z TYR 0.550 1 ATOM 26 O OH . TYR 11 11 ? A 341.727 357.166 288.625 1 1 Z TYR 0.550 1 ATOM 27 N N . GLU 12 12 ? A 339.964 364.095 283.500 1 1 Z GLU 0.470 1 ATOM 28 C CA . GLU 12 12 ? A 339.729 365.433 282.973 1 1 Z GLU 0.470 1 ATOM 29 C C . GLU 12 12 ? A 338.261 365.840 282.973 1 1 Z GLU 0.470 1 ATOM 30 O O . GLU 12 12 ? A 337.874 366.930 283.373 1 1 Z GLU 0.470 1 ATOM 31 C CB . GLU 12 12 ? A 340.249 365.541 281.517 1 1 Z GLU 0.470 1 ATOM 32 C CG . GLU 12 12 ? A 341.765 365.818 281.394 1 1 Z GLU 0.470 1 ATOM 33 C CD . GLU 12 12 ? A 342.151 367.147 282.043 1 1 Z GLU 0.470 1 ATOM 34 O OE1 . GLU 12 12 ? A 341.346 368.107 281.951 1 1 Z GLU 0.470 1 ATOM 35 O OE2 . GLU 12 12 ? A 343.280 367.199 282.590 1 1 Z GLU 0.470 1 ATOM 36 N N . ARG 13 13 ? A 337.369 364.924 282.547 1 1 Z ARG 0.640 1 ATOM 37 C CA . ARG 13 13 ? A 335.951 365.195 282.580 1 1 Z ARG 0.640 1 ATOM 38 C C . ARG 13 13 ? A 335.363 365.406 283.972 1 1 Z ARG 0.640 1 ATOM 39 O O . ARG 13 13 ? A 334.568 366.322 284.169 1 1 Z ARG 0.640 1 ATOM 40 C CB . ARG 13 13 ? A 335.179 364.071 281.857 1 1 Z ARG 0.640 1 ATOM 41 C CG . ARG 13 13 ? A 333.650 364.273 281.863 1 1 Z ARG 0.640 1 ATOM 42 C CD . ARG 13 13 ? A 332.915 363.430 280.821 1 1 Z ARG 0.640 1 ATOM 43 N NE . ARG 13 13 ? 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A 325.342 376.567 298.981 1 1 Z PHE 0.690 1 ATOM 181 C CD1 . PHE 29 29 ? A 324.043 376.154 298.748 1 1 Z PHE 0.690 1 ATOM 182 C CD2 . PHE 29 29 ? A 326.260 375.604 299.447 1 1 Z PHE 0.690 1 ATOM 183 C CE1 . PHE 29 29 ? A 323.640 374.927 299.169 1 1 Z PHE 0.690 1 ATOM 184 C CE2 . PHE 29 29 ? A 325.843 374.327 299.850 1 1 Z PHE 0.690 1 ATOM 185 C CZ . PHE 29 29 ? A 324.495 374.014 299.755 1 1 Z PHE 0.690 1 ATOM 186 N N . SER 30 30 ? A 325.100 381.163 298.261 1 1 Z SER 0.660 1 ATOM 187 C CA . SER 30 30 ? A 325.566 382.448 298.689 1 1 Z SER 0.660 1 ATOM 188 C C . SER 30 30 ? A 324.447 383.299 299.267 1 1 Z SER 0.660 1 ATOM 189 O O . SER 30 30 ? A 324.719 384.240 300.007 1 1 Z SER 0.660 1 ATOM 190 C CB . SER 30 30 ? A 326.308 383.180 297.555 1 1 Z SER 0.660 1 ATOM 191 O OG . SER 30 30 ? A 325.421 383.524 296.493 1 1 Z SER 0.660 1 ATOM 192 N N . LYS 31 31 ? A 323.161 382.913 299.037 1 1 Z LYS 0.550 1 ATOM 193 C CA . LYS 31 31 ? A 321.977 383.572 299.571 1 1 Z LYS 0.550 1 ATOM 194 C C . 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LYS 34 34 ? A 326.762 382.689 307.569 1 1 Z LYS 0.430 1 ATOM 222 C CD . LYS 34 34 ? A 326.228 382.759 309.004 1 1 Z LYS 0.430 1 ATOM 223 C CE . LYS 34 34 ? A 326.436 384.143 309.619 1 1 Z LYS 0.430 1 ATOM 224 N NZ . LYS 34 34 ? A 325.912 384.163 311.000 1 1 Z LYS 0.430 1 ATOM 225 N N . GLN 35 35 ? A 327.157 379.453 303.810 1 1 Z GLN 0.490 1 ATOM 226 C CA . GLN 35 35 ? A 327.065 378.102 303.301 1 1 Z GLN 0.490 1 ATOM 227 C C . GLN 35 35 ? A 328.047 377.935 302.166 1 1 Z GLN 0.490 1 ATOM 228 O O . GLN 35 35 ? A 327.764 377.359 301.139 1 1 Z GLN 0.490 1 ATOM 229 C CB . GLN 35 35 ? A 325.604 377.731 302.890 1 1 Z GLN 0.490 1 ATOM 230 C CG . GLN 35 35 ? A 324.648 377.664 304.103 1 1 Z GLN 0.490 1 ATOM 231 C CD . GLN 35 35 ? A 325.121 376.564 305.059 1 1 Z GLN 0.490 1 ATOM 232 O OE1 . GLN 35 35 ? A 325.871 375.668 304.689 1 1 Z GLN 0.490 1 ATOM 233 N NE2 . GLN 35 35 ? A 324.646 376.638 306.327 1 1 Z GLN 0.490 1 ATOM 234 N N . HIS 36 36 ? 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A 334.325 366.712 300.181 1 1 Z SER 0.790 1 ATOM 289 C CA . SER 42 42 ? A 334.596 366.688 301.605 1 1 Z SER 0.790 1 ATOM 290 C C . SER 42 42 ? A 333.521 367.384 302.408 1 1 Z SER 0.790 1 ATOM 291 O O . SER 42 42 ? A 333.049 366.828 303.396 1 1 Z SER 0.790 1 ATOM 292 C CB . SER 42 42 ? A 335.986 367.235 302.028 1 1 Z SER 0.790 1 ATOM 293 O OG . SER 42 42 ? A 336.259 368.529 301.505 1 1 Z SER 0.790 1 ATOM 294 N N . ASP 43 43 ? A 333.065 368.586 301.987 1 1 Z ASP 0.790 1 ATOM 295 C CA . ASP 43 43 ? A 332.057 369.348 302.686 1 1 Z ASP 0.790 1 ATOM 296 C C . ASP 43 43 ? A 330.653 368.729 302.615 1 1 Z ASP 0.790 1 ATOM 297 O O . ASP 43 43 ? A 329.809 368.974 303.463 1 1 Z ASP 0.790 1 ATOM 298 C CB . ASP 43 43 ? A 332.025 370.797 302.138 1 1 Z ASP 0.790 1 ATOM 299 C CG . ASP 43 43 ? A 333.282 371.597 302.460 1 1 Z ASP 0.790 1 ATOM 300 O OD1 . ASP 43 43 ? A 334.320 371.411 301.775 1 1 Z ASP 0.790 1 ATOM 301 O OD2 . ASP 43 43 ? A 333.166 372.464 303.365 1 1 Z ASP 0.790 1 ATOM 302 N N . 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A 314.962 375.798 300.368 1 1 Z GLU 0.690 1 ATOM 397 C CB . GLU 55 55 ? A 316.496 374.429 303.008 1 1 Z GLU 0.690 1 ATOM 398 C CG . GLU 55 55 ? A 316.045 373.382 304.056 1 1 Z GLU 0.690 1 ATOM 399 C CD . GLU 55 55 ? A 315.584 373.954 305.401 1 1 Z GLU 0.690 1 ATOM 400 O OE1 . GLU 55 55 ? A 316.376 374.619 306.105 1 1 Z GLU 0.690 1 ATOM 401 O OE2 . GLU 55 55 ? A 314.391 373.704 305.729 1 1 Z GLU 0.690 1 ATOM 402 N N . GLY 56 56 ? A 317.203 375.725 300.201 1 1 Z GLY 0.710 1 ATOM 403 C CA . GLY 56 56 ? A 317.286 376.898 299.335 1 1 Z GLY 0.710 1 ATOM 404 C C . GLY 56 56 ? A 316.712 376.745 297.948 1 1 Z GLY 0.710 1 ATOM 405 O O . GLY 56 56 ? A 316.127 377.682 297.412 1 1 Z GLY 0.710 1 ATOM 406 N N . LEU 57 57 ? A 316.893 375.566 297.324 1 1 Z LEU 0.690 1 ATOM 407 C CA . LEU 57 57 ? A 316.294 375.225 296.046 1 1 Z LEU 0.690 1 ATOM 408 C C . LEU 57 57 ? A 314.803 374.953 296.093 1 1 Z LEU 0.690 1 ATOM 409 O O . LEU 57 57 ? A 314.050 375.472 295.276 1 1 Z LEU 0.690 1 ATOM 410 C CB . 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LYS 61 61 ? A 310.396 371.247 305.720 1 1 Z LYS 0.570 1 ATOM 438 C CB . LYS 61 61 ? A 310.411 374.040 306.689 1 1 Z LYS 0.570 1 ATOM 439 C CG . LYS 61 61 ? A 311.216 373.837 307.977 1 1 Z LYS 0.570 1 ATOM 440 C CD . LYS 61 61 ? A 310.498 374.434 309.191 1 1 Z LYS 0.570 1 ATOM 441 C CE . LYS 61 61 ? A 311.266 374.220 310.488 1 1 Z LYS 0.570 1 ATOM 442 N NZ . LYS 61 61 ? A 310.474 374.788 311.600 1 1 Z LYS 0.570 1 ATOM 443 N N . LEU 62 62 ? A 312.599 371.585 305.399 1 1 Z LEU 0.570 1 ATOM 444 C CA . LEU 62 62 ? A 312.998 370.215 305.641 1 1 Z LEU 0.570 1 ATOM 445 C C . LEU 62 62 ? A 313.069 369.971 307.160 1 1 Z LEU 0.570 1 ATOM 446 O O . LEU 62 62 ? A 313.193 370.916 307.940 1 1 Z LEU 0.570 1 ATOM 447 C CB . LEU 62 62 ? A 314.339 369.849 304.943 1 1 Z LEU 0.570 1 ATOM 448 C CG . LEU 62 62 ? A 314.256 369.471 303.443 1 1 Z LEU 0.570 1 ATOM 449 C CD1 . LEU 62 62 ? A 313.938 370.609 302.458 1 1 Z LEU 0.570 1 ATOM 450 C CD2 . LEU 62 62 ? 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