data_SMR-df5c5a970752927d272a31202387a714_1 _entry.id SMR-df5c5a970752927d272a31202387a714_1 _struct.entry_id SMR-df5c5a970752927d272a31202387a714_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q9WTN3 (isoform 2)/ SRBP1_MOUSE, Sterol regulatory element-binding protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.03, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9WTN3 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-10.11 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' DA 'DNA linking' "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" 'C10 H14 N5 O6 P' 331.225 'CCD Core' DC 'DNA linking' "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" 'C9 H14 N3 O7 P' 307.199 'CCD Core' DG 'DNA linking' "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" 'C10 H14 N5 O7 P' 347.224 'CCD Core' DT 'DNA linking' "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" 'C10 H15 N2 O8 P' 322.210 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 136059.308 2 . 2 polymer man "DNA (5'-D(*TP*CP*AP*CP*GP*CP*AP*T)-3')" 2575.691 1 . 3 polymer man "DNA (5'-D(*AP*TP*GP*CP*GP*TP*GP*A)-3')" 2655.741 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SRBP1_MOUSE Q9WTN3 1 ;MDELAFGEAALEQTLAEMCELDTAVLNDIEDMLQLINNQDSDFPGLFDAPYAGGETGDTGPSSPGANSPE SFSSASLASSLEAFLGGPKPAAPQPSPGTLLPPSFPAPPVQLSPAPVLGYSSLPSGFSGTLPGNTQQPPS SLPLAPAPGVLPTPALHTQVQSLASQQPLPASAAPRTNTVTSQVQQVPVVLQPHFIKADSLLLTAVKTDA GATVKTAGISTLAPGTAVQAGPLQTLVSGGTILATVPLVVDTDKLPIHRLAAGSKALGSAQSRGEKRTAH NAIEKRYRSSINDKIVELKDLVVGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLTLRSAHKSKSLKD LVSACGSGGGTDVSMEGMKPEVVETLTPPPSDAGSPSQSSPLSFGSRASSSGGSDSEPDSPAFEDSQVKA QRLPSHSRGMLDRSRLALCVLAFLCLTCNPLASLFGWGILTPSDATGTHRSSGRSMLEAESRDGSNWTQW LLPPLVWLANGLLVLACLALLFVYGEPVTRPHSGPAVHFWRHRKQADLDLARGDFPQAAQQLWLALQALG RPLPTSNLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGQAGGLLRDRGLRKDARASARDAAVVYHKLHQLHAMG KYTGGHLAASNLALSALNLAECAGDAISMATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQS GSVPLAMQWLCHPVGHRFFVDGDWAVHGAPPESLYSVAGNPVDPLAQVTRLFREHLLERALNCIAQPSPG AADGDREFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPACSFSVSSSMAATTGPDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAE RLYPLVEHIPQVLQDTERPLPRAALYSFKAARALLDHRKVESSPASLAICEKASGYLRDSLASTPTGSSI DKAMQLLLCDLLLVARTSLWQRQQSPASVQVAHGTSNGPQASALELRGFQHDLSSLRRLAQSFRPAMRRV FLHEATARLMAGASPARTHQLLDRSLRRRAGSSGKGGTTAELEPRPTWREHTEALLLASCYLPPAFLSAP GQRMSMLAEAARTVEKLGDHRLLLDCQQMLLRLGGGTTVTSS ; 'Sterol regulatory element-binding protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1092 1 1092 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . SRBP1_MOUSE Q9WTN3 Q9WTN3-2 1 1092 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-07-24 7AD020CB6E87C2E6 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MDELAFGEAALEQTLAEMCELDTAVLNDIEDMLQLINNQDSDFPGLFDAPYAGGETGDTGPSSPGANSPE SFSSASLASSLEAFLGGPKPAAPQPSPGTLLPPSFPAPPVQLSPAPVLGYSSLPSGFSGTLPGNTQQPPS SLPLAPAPGVLPTPALHTQVQSLASQQPLPASAAPRTNTVTSQVQQVPVVLQPHFIKADSLLLTAVKTDA GATVKTAGISTLAPGTAVQAGPLQTLVSGGTILATVPLVVDTDKLPIHRLAAGSKALGSAQSRGEKRTAH NAIEKRYRSSINDKIVELKDLVVGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLTLRSAHKSKSLKD LVSACGSGGGTDVSMEGMKPEVVETLTPPPSDAGSPSQSSPLSFGSRASSSGGSDSEPDSPAFEDSQVKA QRLPSHSRGMLDRSRLALCVLAFLCLTCNPLASLFGWGILTPSDATGTHRSSGRSMLEAESRDGSNWTQW LLPPLVWLANGLLVLACLALLFVYGEPVTRPHSGPAVHFWRHRKQADLDLARGDFPQAAQQLWLALQALG RPLPTSNLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGQAGGLLRDRGLRKDARASARDAAVVYHKLHQLHAMG KYTGGHLAASNLALSALNLAECAGDAISMATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQS GSVPLAMQWLCHPVGHRFFVDGDWAVHGAPPESLYSVAGNPVDPLAQVTRLFREHLLERALNCIAQPSPG AADGDREFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPACSFSVSSSMAATTGPDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAE RLYPLVEHIPQVLQDTERPLPRAALYSFKAARALLDHRKVESSPASLAICEKASGYLRDSLASTPTGSSI DKAMQLLLCDLLLVARTSLWQRQQSPASVQVAHGTSNGPQASALELRGFQHDLSSLRRLAQSFRPAMRRV FLHEATARLMAGASPARTHQLLDRSLRRRAGSSGKGGTTAELEPRPTWREHTEALLLASCYLPPAFLSAP GQRMSMLAEAARTVEKLGDHRLLLDCQQMLLRLGGGTTVTSS ; ;MDELAFGEAALEQTLAEMCELDTAVLNDIEDMLQLINNQDSDFPGLFDAPYAGGETGDTGPSSPGANSPE SFSSASLASSLEAFLGGPKPAAPQPSPGTLLPPSFPAPPVQLSPAPVLGYSSLPSGFSGTLPGNTQQPPS SLPLAPAPGVLPTPALHTQVQSLASQQPLPASAAPRTNTVTSQVQQVPVVLQPHFIKADSLLLTAVKTDA GATVKTAGISTLAPGTAVQAGPLQTLVSGGTILATVPLVVDTDKLPIHRLAAGSKALGSAQSRGEKRTAH NAIEKRYRSSINDKIVELKDLVVGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLTLRSAHKSKSLKD LVSACGSGGGTDVSMEGMKPEVVETLTPPPSDAGSPSQSSPLSFGSRASSSGGSDSEPDSPAFEDSQVKA QRLPSHSRGMLDRSRLALCVLAFLCLTCNPLASLFGWGILTPSDATGTHRSSGRSMLEAESRDGSNWTQW LLPPLVWLANGLLVLACLALLFVYGEPVTRPHSGPAVHFWRHRKQADLDLARGDFPQAAQQLWLALQALG RPLPTSNLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGQAGGLLRDRGLRKDARASARDAAVVYHKLHQLHAMG KYTGGHLAASNLALSALNLAECAGDAISMATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQS GSVPLAMQWLCHPVGHRFFVDGDWAVHGAPPESLYSVAGNPVDPLAQVTRLFREHLLERALNCIAQPSPG AADGDREFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPACSFSVSSSMAATTGPDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAE RLYPLVEHIPQVLQDTERPLPRAALYSFKAARALLDHRKVESSPASLAICEKASGYLRDSLASTPTGSSI DKAMQLLLCDLLLVARTSLWQRQQSPASVQVAHGTSNGPQASALELRGFQHDLSSLRRLAQSFRPAMRRV FLHEATARLMAGASPARTHQLLDRSLRRRAGSSGKGGTTAELEPRPTWREHTEALLLASCYLPPAFLSAP GQRMSMLAEAARTVEKLGDHRLLLDCQQMLLRLGGGTTVTSS ; 2 polydeoxyribonucleotide no no '_' (DT)(DC)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DT) TCACGCAT 3 polydeoxyribonucleotide no no '_' (DA)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DG)(DA) ATGCGTGA # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASP . 1 3 GLU . 1 4 LEU . 1 5 ALA . 1 6 PHE . 1 7 GLY . 1 8 GLU . 1 9 ALA . 1 10 ALA . 1 11 LEU . 1 12 GLU . 1 13 GLN . 1 14 THR . 1 15 LEU . 1 16 ALA . 1 17 GLU . 1 18 MET . 1 19 CYS . 1 20 GLU . 1 21 LEU . 1 22 ASP . 1 23 THR . 1 24 ALA . 1 25 VAL . 1 26 LEU . 1 27 ASN . 1 28 ASP . 1 29 ILE . 1 30 GLU . 1 31 ASP . 1 32 MET . 1 33 LEU . 1 34 GLN . 1 35 LEU . 1 36 ILE . 1 37 ASN . 1 38 ASN . 1 39 GLN . 1 40 ASP . 1 41 SER . 1 42 ASP . 1 43 PHE . 1 44 PRO . 1 45 GLY . 1 46 LEU . 1 47 PHE . 1 48 ASP . 1 49 ALA . 1 50 PRO . 1 51 TYR . 1 52 ALA . 1 53 GLY . 1 54 GLY . 1 55 GLU . 1 56 THR . 1 57 GLY . 1 58 ASP . 1 59 THR . 1 60 GLY . 1 61 PRO . 1 62 SER . 1 63 SER . 1 64 PRO . 1 65 GLY . 1 66 ALA . 1 67 ASN . 1 68 SER . 1 69 PRO . 1 70 GLU . 1 71 SER . 1 72 PHE . 1 73 SER . 1 74 SER . 1 75 ALA . 1 76 SER . 1 77 LEU . 1 78 ALA . 1 79 SER . 1 80 SER . 1 81 LEU . 1 82 GLU . 1 83 ALA . 1 84 PHE . 1 85 LEU . 1 86 GLY . 1 87 GLY . 1 88 PRO . 1 89 LYS . 1 90 PRO . 1 91 ALA . 1 92 ALA . 1 93 PRO . 1 94 GLN . 1 95 PRO . 1 96 SER . 1 97 PRO . 1 98 GLY . 1 99 THR . 1 100 LEU . 1 101 LEU . 1 102 PRO . 1 103 PRO 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B 1 1073 LEU 1073 ? ? ? B . B 1 1074 LEU 1074 ? ? ? B . B 1 1075 ASP 1075 ? ? ? B . B 1 1076 CYS 1076 ? ? ? B . B 1 1077 GLN 1077 ? ? ? B . B 1 1078 GLN 1078 ? ? ? B . B 1 1079 MET 1079 ? ? ? B . B 1 1080 LEU 1080 ? ? ? B . B 1 1081 LEU 1081 ? ? ? B . B 1 1082 ARG 1082 ? ? ? B . B 1 1083 LEU 1083 ? ? ? B . B 1 1084 GLY 1084 ? ? ? B . B 1 1085 GLY 1085 ? ? ? B . B 1 1086 GLY 1086 ? ? ? B . B 1 1087 THR 1087 ? ? ? B . B 1 1088 THR 1088 ? ? ? B . B 1 1089 VAL 1089 ? ? ? B . B 1 1090 THR 1090 ? ? ? B . B 1 1091 SER 1091 ? ? ? B . B 1 1092 SER 1092 ? ? ? B . C 2 1 DT 1 1 DT DT '_' A C 2 2 DC 1 1 DC DC '_' B C 2 3 DA 1 1 DA DA '_' C C 2 4 DC 1 1 DC DC '_' D C 2 5 DG 1 1 DG DG '_' E C 2 6 DC 1 1 DC DC '_' F C 2 7 DA 1 1 DA DA '_' G C 2 8 DT 1 1 DT DT '_' H D 3 1 DA 2 2 DA DA '_' A D 3 2 DT 2 2 DT DT '_' B D 3 3 DG 2 2 DG DG '_' C D 3 4 DC 2 2 DC DC '_' D D 3 5 DG 2 2 DG DG '_' E D 3 6 DT 2 2 DT DT '_' F D 3 7 DG 2 2 DG DG '_' G D 3 8 DA 2 2 DA DA '_' H # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Transcription factor HMS1 {PDB ID=8hov, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=8hov.1.A}' 'template structure' . 2 'Transcription factor HMS1 {PDB ID=8hov, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=8hov.1.B}' 'template structure' . 3 "DNA (5'-D(*TP*CP*AP*CP*GP*CP*AP*T)-3') {PDB ID=8hov, label_asym_id=G, auth_asym_id=G, SMTL ID=8hov.1._.1}" 'template structure' . 4 "DNA (5'-D(*AP*TP*GP*CP*GP*TP*GP*A)-3') {PDB ID=8hov, label_asym_id=J, auth_asym_id=J, SMTL ID=8hov.1._.2}" 'template structure' . 5 . target . 6 "DNA (5'-D(*TP*CP*AP*CP*GP*CP*AP*T)-3')" target . 7 "DNA (5'-D(*AP*TP*GP*CP*GP*TP*GP*A)-3')" target . 8 'Target-template alignment by BLAST to 8hov, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 9 'Target-template alignment by BLAST to 8hov, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 10 'model 1' 'model coordinates' . 11 SMTL 'reference database' . 12 PDB 'reference database' . 13 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 5 2 1 11 3 1 12 4 2 13 5 3 5 6 3 6 7 3 7 8 3 1 9 3 2 10 3 3 11 3 4 12 3 8 13 3 9 14 4 1 15 4 2 16 4 3 17 4 4 18 4 8 19 4 9 20 4 6 21 4 7 22 5 10 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 11 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-11-05 12 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-10-31 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 5 'reference database' 2 6 . 3 7 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . C 2 . D 3 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B C 1 1 C 3 3 'reference database' polymer 1 3 . G 2 1 G 4 4 'reference database' polymer 1 4 . J 3 1 J # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSHNIIEKKYRSNINDKIEQLRRTVPTLRVAYKKCNDLPITSRDLADLDGLEPATKLNKASILTKSIEYI CHLERKCLQLSLANQHLSNDTRDSFVHLTEPSHHHHHH ; ;MSHNIIEKKYRSNINDKIEQLRRTVPTLRVAYKKCNDLPITSRDLADLDGLEPATKLNKASILTKSIEYI CHLERKCLQLSLANQHLSNDTRDSFVHLTEPSHHHHHH ; 2 ;MSHNIIEKKYRSNINDKIEQLRRTVPTLRVAYKKCNDLPITSRDLADLDGLEPATKLNKASILTKSIEYI CHLERKCLQLSLANQHLSNDTRDSFVHLTEPSHHHHHH ; ;MSHNIIEKKYRSNINDKIEQLRRTVPTLRVAYKKCNDLPITSRDLADLDGLEPATKLNKASILTKSIEYI CHLERKCLQLSLANQHLSNDTRDSFVHLTEPSHHHHHH ; 3 (DT)(DC)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DT) TCACGCAT 4 (DA)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DG)(DA) ATGCGTGA # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 2 93 2 2 2 93 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8hov 2025-01-15 2 PDB . 8hov 2025-01-15 3 PDB . 8hov 2025-01-15 4 PDB . 8hov 2025-01-15 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1092 2 2 B 1 1092 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 8 1 1117 'target-template pairwise alignment' local 2 9 1 1117 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 9.55e-05 47.761 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'BLAST e-value' . 9.55e-05 47.761 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDELAFGEAALEQTLAEMCELDTAVLNDIEDMLQLINNQDSDFPGLFDAPYAGGETGDTGPSSPGANSPESFSSASLASSLEAFLGGPKPAAPQPSPGTLLPPSFPAPPVQLSPAPVLGYSSLPSGFSGTLPGNTQQPPSSLPLAPAPGVLPTPALHTQVQSLASQQPLPASAAPRTNTVTSQVQQVPVVLQPHFIKADSLLLTAVKTDAGATVKTAGISTLAPGTAVQAGPLQTLVSGGTILATVPLVVDTDKLPIHRLAAGSKALGSAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIVELK--------------DLVVGTE-----------AKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLTLRSAHKSKSLKDLVSACGSGGGTDVSMEGMKPEVVETLTPPPSDAGSPSQSSPLSFGSRASSSGGSDSEPDSPAFEDSQVKAQRLPSHSRGMLDRSRLALCVLAFLCLTCNPLASLFGWGILTPSDATGTHRSSGRSMLEAESRDGSNWTQWLLPPLVWLANGLLVLACLALLFVYGEPVTRPHSGPAVHFWRHRKQADLDLARGDFPQAAQQLWLALQALGRPLPTSNLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGQAGGLLRDRGLRKDARASARDAAVVYHKLHQLHAMGKYTGGHLAASNLALSALNLAECAGDAISMATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPLAMQWLCHPVGHRFFVDGDWAVHGAPPESLYSVAGNPVDPLAQVTRLFREHLLERALNCIAQPSPGAADGDREFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPACSFSVSSSMAATTGPDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLYPLVEHIPQVLQDTERPLPRAALYSFKAARALLDHRKVESSPASLAICEKASGYLRDSLASTPTGSSIDKAMQLLLCDLLLVARTSLWQRQQSPASVQVAHGTSNGPQASALELRGFQHDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPARTHQLLDRSLRRRAGSSGKGGTTAELEPRPTWREHTEALLLASCYLPPAFLSAPGQRMSMLAEAARTVEKLGDHRLLLDCQQMLLRLGGGTTVTSS 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SHNIIEKKYRSNINDKIEQLRRTVPTLRVAYKKCNDLPITSRDLADLDGLEPATKLNKASILTKSIEYICHLER-----KCLQLSLANQHLSNDTRD---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MDELAFGEAALEQTLAEMCELDTAVLNDIEDMLQLINNQDSDFPGLFDAPYAGGETGDTGPSSPGANSPESFSSASLASSLEAFLGGPKPAAPQPSPGTLLPPSFPAPPVQLSPAPVLGYSSLPSGFSGTLPGNTQQPPSSLPLAPAPGVLPTPALHTQVQSLASQQPLPASAAPRTNTVTSQVQQVPVVLQPHFIKADSLLLTAVKTDAGATVKTAGISTLAPGTAVQAGPLQTLVSGGTILATVPLVVDTDKLPIHRLAAGSKALGSAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIVELK--------------DLVVGTE-----------AKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLTLRSAHKSKSLKDLVSACGSGGGTDVSMEGMKPEVVETLTPPPSDAGSPSQSSPLSFGSRASSSGGSDSEPDSPAFEDSQVKAQRLPSHSRGMLDRSRLALCVLAFLCLTCNPLASLFGWGILTPSDATGTHRSSGRSMLEAESRDGSNWTQWLLPPLVWLANGLLVLACLALLFVYGEPVTRPHSGPAVHFWRHRKQADLDLARGDFPQAAQQLWLALQALGRPLPTSNLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGQAGGLLRDRGLRKDARASARDAAVVYHKLHQLHAMGKYTGGHLAASNLALSALNLAECAGDAISMATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPLAMQWLCHPVGHRFFVDGDWAVHGAPPESLYSVAGNPVDPLAQVTRLFREHLLERALNCIAQPSPGAADGDREFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPACSFSVSSSMAATTGPDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLYPLVEHIPQVLQDTERPLPRAALYSFKAARALLDHRKVESSPASLAICEKASGYLRDSLASTPTGSSIDKAMQLLLCDLLLVARTSLWQRQQSPASVQVAHGTSNGPQASALELRGFQHDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPARTHQLLDRSLRRRAGSSGKGGTTAELEPRPTWREHTEALLLASCYLPPAFLSAPGQRMSMLAEAARTVEKLGDHRLLLDCQQMLLRLGGGTTVTSS 4 2 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SHNIIEKKYRSNINDKIEQLRRTVPTLRVAYKKCNDLPITSRDLADLDGLEPATKLNKASILTKSIEYICHLER-----KCLQLSLANQHLSNDTRD---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.436}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8hov.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 10 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ALA 279 279 ? A -43.774 -3.559 1.962 1 1 A ALA 0.460 1 ATOM 2 C CA . ALA 279 279 ? A -43.992 -2.102 1.637 1 1 A ALA 0.460 1 ATOM 3 C C . ALA 279 279 ? A -44.166 -1.270 2.898 1 1 A ALA 0.460 1 ATOM 4 O O . ALA 279 279 ? A -44.408 -1.859 3.947 1 1 A ALA 0.460 1 ATOM 5 C CB . ALA 279 279 ? A -45.275 -1.967 0.777 1 1 A ALA 0.460 1 ATOM 6 N N . HIS 280 280 ? A -44.095 0.088 2.816 1 1 A HIS 0.500 1 ATOM 7 C CA . HIS 280 280 ? A -44.346 1.012 3.925 1 1 A HIS 0.500 1 ATOM 8 C C . HIS 280 280 ? A -45.769 0.863 4.463 1 1 A HIS 0.500 1 ATOM 9 O O . HIS 280 280 ? A -46.016 0.743 5.655 1 1 A HIS 0.500 1 ATOM 10 C CB . HIS 280 280 ? A -44.029 2.480 3.503 1 1 A HIS 0.500 1 ATOM 11 C CG . HIS 280 280 ? A -44.216 3.513 4.566 1 1 A HIS 0.500 1 ATOM 12 N ND1 . HIS 280 280 ? A -43.921 3.153 5.854 1 1 A HIS 0.500 1 ATOM 13 C CD2 . HIS 280 280 ? A -44.740 4.765 4.531 1 1 A HIS 0.500 1 ATOM 14 C CE1 . HIS 280 280 ? A -44.289 4.175 6.594 1 1 A HIS 0.500 1 ATOM 15 N NE2 . HIS 280 280 ? A -44.785 5.187 5.843 1 1 A HIS 0.500 1 ATOM 16 N N . ASN 281 281 ? A -46.764 0.727 3.567 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 17 C CA . ASN 281 281 ? A -48.135 0.486 3.991 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 18 C C . ASN 281 281 ? A -48.327 -0.826 4.754 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 19 O O . ASN 281 281 ? A -49.100 -0.903 5.702 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 20 C CB . ASN 281 281 ? A -49.101 0.484 2.784 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 21 C CG . ASN 281 281 ? A -49.063 1.836 2.086 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 22 O OD1 . ASN 281 281 ? A -48.654 2.850 2.643 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 23 N ND2 . ASN 281 281 ? A -49.489 1.858 0.803 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 24 N N . ALA 282 282 ? A -47.622 -1.901 4.337 1 1 A ALA 0.730 1 ATOM 25 C CA . ALA 282 282 ? A -47.673 -3.203 4.976 1 1 A ALA 0.730 1 ATOM 26 C C . ALA 282 282 ? A -47.042 -3.255 6.366 1 1 A ALA 0.730 1 ATOM 27 O O . ALA 282 282 ? A -47.607 -3.832 7.293 1 1 A ALA 0.730 1 ATOM 28 C CB . ALA 282 282 ? A -46.986 -4.259 4.085 1 1 A ALA 0.730 1 ATOM 29 N N . ILE 283 283 ? A -45.847 -2.647 6.544 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 30 C CA . ILE 283 283 ? A -45.186 -2.512 7.837 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 31 C C . ILE 283 283 ? A -45.964 -1.609 8.784 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 32 O O . ILE 283 283 ? A -46.127 -1.948 9.952 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 33 C CB . ILE 283 283 ? A -43.708 -2.122 7.733 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 34 C CG1 . ILE 283 283 ? A -43.463 -0.789 7.005 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 35 C CG2 . ILE 283 283 ? A -42.941 -3.264 7.029 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 36 C CD1 . ILE 283 283 ? A -43.305 0.423 7.931 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 37 N N . GLU 284 284 ? A -46.539 -0.485 8.287 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 38 C CA . GLU 284 284 ? A -47.427 0.391 9.034 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 39 C C . GLU 284 284 ? A -48.698 -0.327 9.459 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 40 O O . GLU 284 284 ? A -49.226 -0.168 10.559 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 41 C CB . GLU 284 284 ? A -47.793 1.644 8.201 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 42 C CG . GLU 284 284 ? A -48.698 2.665 8.940 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 43 C CD . GLU 284 284 ? 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A -54.375 -8.466 24.974 1 1 A GLU 0.810 1 ATOM 154 C CG . GLU 297 297 ? A -53.818 -9.482 26.016 1 1 A GLU 0.810 1 ATOM 155 C CD . GLU 297 297 ? A -52.336 -9.844 25.923 1 1 A GLU 0.810 1 ATOM 156 O OE1 . GLU 297 297 ? A -51.819 -10.464 26.900 1 1 A GLU 0.810 1 ATOM 157 O OE2 . GLU 297 297 ? A -51.669 -9.466 24.934 1 1 A GLU 0.810 1 ATOM 158 N N . LEU 298 298 ? A -56.212 -6.325 26.648 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 159 C CA . LEU 298 298 ? A -56.705 -5.637 27.835 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 160 C C . LEU 298 298 ? A -58.203 -5.757 28.069 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 161 O O . LEU 298 298 ? A -58.655 -5.810 29.209 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 162 C CB . LEU 298 298 ? A -56.372 -4.126 27.791 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 163 C CG . LEU 298 298 ? A -54.884 -3.793 27.973 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 164 C CD1 . LEU 298 298 ? A -54.625 -2.326 27.598 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 165 C CD2 . LEU 298 298 ? A -54.437 -4.070 29.418 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 166 N N . LYS 299 299 ? A -58.998 -5.735 26.982 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 167 C CA . LYS 299 299 ? A -60.428 -6.005 26.993 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 168 C C . LYS 299 299 ? A -60.763 -7.419 27.397 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 169 O O . LYS 299 299 ? A -59.969 -8.335 27.210 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 170 C CB . LYS 299 299 ? A -61.107 -5.782 25.618 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 171 C CG . LYS 299 299 ? A -60.696 -4.463 24.980 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 172 C CD . LYS 299 299 ? A -61.236 -4.220 23.564 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 173 C CE . LYS 299 299 ? A -62.721 -3.906 23.594 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 174 N NZ . LYS 299 299 ? A -63.231 -3.583 22.249 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 175 N N . ASP 300 300 ? A -61.973 -7.640 27.929 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 176 C CA . ASP 300 300 ? A -62.315 -8.944 28.417 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 177 C C . ASP 300 300 ? A -63.812 -9.104 28.261 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 178 O O . ASP 300 300 ? A -64.504 -8.236 27.725 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 179 C CB . ASP 300 300 ? A -61.821 -9.110 29.885 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 180 C CG . ASP 300 300 ? A -61.553 -10.556 30.273 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 181 O OD1 . ASP 300 300 ? A -62.109 -11.463 29.597 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 182 O OD2 . ASP 300 300 ? A -60.844 -10.770 31.287 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 183 N N . LEU 301 301 ? A -64.335 -10.260 28.695 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 184 C CA . LEU 301 301 ? A -65.753 -10.518 28.840 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 185 C C . LEU 301 301 ? A -66.408 -9.583 29.848 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 186 O O . LEU 301 301 ? A -67.466 -9.000 29.610 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 187 C CB . LEU 301 301 ? A -65.980 -11.972 29.322 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 188 C CG . LEU 301 301 ? A -67.462 -12.359 29.516 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 189 C CD1 . LEU 301 301 ? A -68.247 -12.244 28.199 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 190 C CD2 . LEU 301 301 ? A -67.584 -13.767 30.118 1 1 A LEU 0.280 1 ATOM 191 N N . VAL 302 302 ? A -65.760 -9.407 31.018 1 1 A VAL 0.270 1 ATOM 192 C CA . VAL 302 302 ? A -66.139 -8.409 31.999 1 1 A VAL 0.270 1 ATOM 193 C C . VAL 302 302 ? A -65.672 -7.052 31.522 1 1 A VAL 0.270 1 ATOM 194 O O . VAL 302 302 ? A -64.486 -6.823 31.311 1 1 A VAL 0.270 1 ATOM 195 C CB . VAL 302 302 ? A -65.571 -8.688 33.390 1 1 A VAL 0.270 1 ATOM 196 C CG1 . VAL 302 302 ? A -65.954 -7.571 34.390 1 1 A VAL 0.270 1 ATOM 197 C CG2 . VAL 302 302 ? A -66.098 -10.048 33.886 1 1 A VAL 0.270 1 ATOM 198 N N . VAL 303 303 ? A -66.622 -6.113 31.361 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 199 C CA . VAL 303 303 ? A -66.361 -4.782 30.874 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 200 C C . VAL 303 303 ? A -65.964 -3.869 32.033 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 201 O O . VAL 303 303 ? A -65.355 -2.819 31.918 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 202 C CB . VAL 303 303 ? A -67.611 -4.285 30.147 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 203 C CG1 . VAL 303 303 ? A -67.961 -5.262 29.000 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 204 C CG2 . VAL 303 303 ? A -68.800 -4.051 31.108 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 205 N N . GLY 304 304 ? A -66.266 -4.250 33.290 1 1 A GLY 0.460 1 ATOM 206 C CA . GLY 304 304 ? A -65.633 -3.559 34.407 1 1 A GLY 0.460 1 ATOM 207 C C . GLY 304 304 ? A -66.151 -2.176 34.741 1 1 A GLY 0.460 1 ATOM 208 O O . GLY 304 304 ? A -65.441 -1.420 35.399 1 1 A GLY 0.460 1 ATOM 209 N N . THR 305 305 ? A -67.353 -1.803 34.237 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 210 C CA . THR 305 305 ? A -68.095 -0.533 34.410 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 211 C C . THR 305 305 ? A -68.020 0.328 33.153 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 212 O O . THR 305 305 ? A -68.665 1.366 33.070 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 213 C CB . THR 305 305 ? A -67.758 0.274 35.702 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 214 O OG1 . THR 305 305 ? A -68.127 -0.421 36.877 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 215 C CG2 . THR 305 305 ? A -68.191 1.741 35.901 1 1 A THR 0.370 1 ATOM 216 N N . GLU 306 306 ? A -67.292 -0.062 32.077 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 217 C CA . GLU 306 306 ? A -67.363 0.677 30.819 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 218 C C . GLU 306 306 ? A -68.689 0.447 30.126 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 219 O O . GLU 306 306 ? A -69.108 -0.664 29.819 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 220 C CB . GLU 306 306 ? A -66.176 0.405 29.866 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 221 C CG . GLU 306 306 ? A -66.076 -1.059 29.408 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 222 C CD . GLU 306 306 ? A -64.667 -1.610 29.192 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 223 O OE1 . GLU 306 306 ? A -63.697 -0.813 29.178 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 224 O OE2 . GLU 306 306 ? A -64.565 -2.854 29.021 1 1 A GLU 0.340 1 ATOM 225 N N . ALA 307 307 ? A -69.438 1.540 29.925 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 226 C CA . ALA 307 307 ? A -70.630 1.514 29.121 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 227 C C . ALA 307 307 ? A -70.296 1.432 27.636 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 228 O O . ALA 307 307 ? A -70.951 0.753 26.851 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 229 C CB . ALA 307 307 ? A -71.452 2.768 29.462 1 1 A ALA 0.440 1 ATOM 230 N N . LYS 308 308 ? A -69.225 2.136 27.221 1 1 A LYS 0.390 1 ATOM 231 C CA . LYS 308 308 ? A -68.738 2.102 25.861 1 1 A LYS 0.390 1 ATOM 232 C C . LYS 308 308 ? A -67.462 1.295 25.785 1 1 A LYS 0.390 1 ATOM 233 O O . LYS 308 308 ? A -66.715 1.244 26.747 1 1 A LYS 0.390 1 ATOM 234 C CB . LYS 308 308 ? A -68.419 3.519 25.325 1 1 A LYS 0.390 1 ATOM 235 C CG . LYS 308 308 ? A -69.312 4.621 25.908 1 1 A LYS 0.390 1 ATOM 236 C CD . LYS 308 308 ? A -69.239 5.941 25.127 1 1 A LYS 0.390 1 ATOM 237 C CE . LYS 308 308 ? A -70.061 5.889 23.835 1 1 A LYS 0.390 1 ATOM 238 N NZ . LYS 308 308 ? A -70.163 7.230 23.222 1 1 A LYS 0.390 1 ATOM 239 N N . LEU 309 309 ? A -67.153 0.691 24.617 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 240 C CA . LEU 309 309 ? A -66.060 -0.263 24.501 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 241 C C . LEU 309 309 ? A -65.006 0.141 23.489 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 242 O O . LEU 309 309 ? A -64.318 -0.685 22.876 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 243 C CB . LEU 309 309 ? A -66.655 -1.645 24.161 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 244 C CG . LEU 309 309 ? A -65.955 -2.821 24.856 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 245 C CD1 . LEU 309 309 ? A -65.948 -2.677 26.370 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 246 C CD2 . LEU 309 309 ? A -66.630 -4.155 24.533 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 247 N N . ASN 310 310 ? A -64.881 1.466 23.283 1 1 A ASN 0.790 1 ATOM 248 C CA . ASN 310 310 ? A -63.887 2.074 22.416 1 1 A ASN 0.790 1 ATOM 249 C C . 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B -49.327 -8.871 44.423 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 975 C CG . LYS 333 333 ? B -47.891 -8.642 43.945 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 976 C CD . LYS 333 333 ? B -46.870 -8.911 45.061 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 977 C CE . LYS 333 333 ? B -45.464 -8.509 44.631 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 978 N NZ . LYS 333 333 ? B -44.472 -8.782 45.690 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 979 N N . GLN 334 334 ? B -52.055 -10.290 44.555 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 980 C CA . GLN 334 334 ? B -53.323 -10.364 45.221 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 981 C C . GLN 334 334 ? B -53.722 -11.761 45.679 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 982 O O . GLN 334 334 ? B -53.983 -11.965 46.864 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 983 C CB . GLN 334 334 ? B -54.386 -9.754 44.298 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 984 C CG . GLN 334 334 ? B -55.761 -9.607 44.976 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 985 C CD . GLN 334 334 ? B -56.531 -10.925 44.959 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 986 O OE1 . GLN 334 334 ? B -56.426 -11.716 44.037 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 987 N NE2 . GLN 334 334 ? B -57.368 -11.200 45.966 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 988 N N . GLU 335 335 ? B -53.721 -12.740 44.753 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 989 C CA . GLU 335 335 ? B -54.215 -14.079 45.000 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 990 C C . GLU 335 335 ? B -53.419 -14.819 46.057 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 991 O O . GLU 335 335 ? B -53.938 -15.374 47.015 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 992 C CB . GLU 335 335 ? B -54.199 -14.883 43.680 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 993 C CG . GLU 335 335 ? B -54.775 -16.318 43.786 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 994 C CD . GLU 335 335 ? B -56.282 -16.388 44.040 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 995 O OE1 . GLU 335 335 ? B -56.726 -17.489 44.463 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 996 O OE2 . GLU 335 335 ? B -56.995 -15.375 43.836 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 997 N N . ASN 336 336 ? B -52.080 -14.785 45.974 1 1 B ASN 0.520 1 ATOM 998 C CA . ASN 336 336 ? B -51.252 -15.403 46.983 1 1 B ASN 0.520 1 ATOM 999 C C . ASN 336 336 ? B -51.371 -14.742 48.353 1 1 B ASN 0.520 1 ATOM 1000 O O . ASN 336 336 ? B -51.334 -15.397 49.393 1 1 B ASN 0.520 1 ATOM 1001 C CB . ASN 336 336 ? B -49.794 -15.349 46.523 1 1 B ASN 0.520 1 ATOM 1002 C CG . ASN 336 336 ? B -48.918 -16.207 47.410 1 1 B ASN 0.520 1 ATOM 1003 O OD1 . ASN 336 336 ? B -49.107 -17.401 47.618 1 1 B ASN 0.520 1 ATOM 1004 N ND2 . ASN 336 336 ? B -47.929 -15.540 48.050 1 1 B ASN 0.520 1 ATOM 1005 N N . LEU 337 337 ? B -51.483 -13.403 48.399 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1006 C CA . LEU 337 337 ? B -51.668 -12.701 49.650 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1007 C C . LEU 337 337 ? B -52.978 -13.036 50.343 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1008 O O . LEU 337 337 ? B -52.999 -13.257 51.549 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1009 C CB . LEU 337 337 ? B -51.620 -11.179 49.457 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1010 C CG . LEU 337 337 ? B -50.232 -10.579 49.182 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1011 C CD1 . LEU 337 337 ? B -50.415 -9.104 48.782 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1012 C CD2 . LEU 337 337 ? B -49.258 -10.743 50.357 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 1013 N N . THR 338 338 ? B -54.103 -13.119 49.598 1 1 B THR 0.640 1 ATOM 1014 C CA . THR 338 338 ? 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DT 1 1 A C -43.469 4.269 17.034 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1081 O "O3'" . DT 1 1 A C -43.638 4.758 18.360 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1082 C "C2'" . DT 1 1 A C -43.206 5.414 16.045 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1083 C "C1'" . DT 1 1 A C -42.101 4.868 15.129 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1084 N N1 . DT 1 1 A C -42.504 4.744 13.697 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1085 C C2 . DT 1 1 A C -42.534 5.866 12.902 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1086 O O2 . DT 1 1 A C -42.256 6.980 13.307 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1087 N N3 . DT 1 1 A C -42.911 5.637 11.604 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1088 C C4 . DT 1 1 A C -43.249 4.423 11.034 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1089 O O4 . DT 1 1 A C -43.573 4.319 9.856 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1090 C C5 . DT 1 1 A C -43.193 3.287 11.922 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1091 C C7 . DT 1 1 A C -43.539 1.918 11.418 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1092 C C6 . DT 1 1 A C -42.826 3.500 13.194 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1093 P P . DC 2 1 B C -45.140 4.886 18.902 1 2 '_' DC . 1 ATOM 1094 O OP1 . DC 2 1 B C -45.155 5.065 20.395 1 2 '_' DC . 1 ATOM 1095 O OP2 . 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DT 8 1 H C -66.724 9.457 8.378 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1231 C C5 . DT 8 1 H C -66.613 8.129 6.425 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1232 C C7 . DT 8 1 H C -67.006 9.260 5.523 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1233 C C6 . DT 8 1 H C -66.350 6.898 5.971 1 2 '_' DT . 1 ATOM 1234 O "O5'" . DA 1 2 A D -64.852 8.202 19.072 1 3 '_' DA . 1 ATOM 1235 C "C5'" . DA 1 2 A D -65.551 7.067 19.568 1 3 '_' DA . 1 ATOM 1236 C "C4'" . DA 1 2 A D -65.231 5.827 18.749 1 3 '_' DA . 1 ATOM 1237 O "O4'" . DA 1 2 A D -65.655 6.029 17.377 1 3 '_' DA . 1 ATOM 1238 C "C3'" . DA 1 2 A D -63.753 5.450 18.685 1 3 '_' DA . 1 ATOM 1239 O "O3'" . DA 1 2 A D -63.615 4.036 18.687 1 3 '_' DA . 1 ATOM 1240 C "C2'" . DA 1 2 A D -63.299 6.054 17.360 1 3 '_' DA . 1 ATOM 1241 C "C1'" . DA 1 2 A D -64.552 5.925 16.502 1 3 '_' DA . 1 ATOM 1242 N N9 . DA 1 2 A D -64.667 6.977 15.498 1 3 '_' DA . 1 ATOM 1243 C C8 . DA 1 2 A D -64.717 8.324 15.722 1 3 '_' DA . 1 ATOM 1244 N N7 . DA 1 2 A D -64.819 9.040 14.627 1 3 '_' DA . 1 ATOM 1245 C C5 . 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DG 3 2 C D -58.526 -0.329 12.751 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1276 C "C5'" . DG 3 2 C D -59.548 -0.838 11.864 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1277 C "C4'" . DG 3 2 C D -59.237 -0.460 10.430 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1278 O "O4'" . DG 3 2 C D -59.543 0.938 10.220 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1279 C "C3'" . DG 3 2 C D -57.787 -0.666 9.990 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1280 O "O3'" . DG 3 2 C D -57.770 -1.196 8.664 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1281 C "C2'" . DG 3 2 C D -57.209 0.745 10.047 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1282 C "C1'" . DG 3 2 C D -58.406 1.598 9.673 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1283 N N9 . DG 3 2 C D -58.357 2.951 10.214 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1284 C C8 . DG 3 2 C D -58.116 3.306 11.516 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1285 N N7 . DG 3 2 C D -58.137 4.599 11.713 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1286 C C5 . DG 3 2 C D -58.411 5.129 10.459 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1287 C C6 . DG 3 2 C D -58.551 6.478 10.053 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1288 O O6 . DG 3 2 C D -58.461 7.500 10.744 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1289 N N1 . DG 3 2 C D -58.825 6.575 8.690 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1290 C C2 . DG 3 2 C D -58.948 5.513 7.831 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1291 N N2 . DG 3 2 C D -59.214 5.808 6.553 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1292 N N3 . DG 3 2 C D -58.819 4.241 8.205 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1293 C C4 . DG 3 2 C D -58.553 4.125 9.527 1 3 '_' DG . 1 ATOM 1294 P P . DC 4 2 D D -56.363 -1.662 8.052 1 3 '_' DC . 1 ATOM 1295 O OP1 . DC 4 2 D D -56.566 -2.889 7.235 1 3 '_' DC . 1 ATOM 1296 O OP2 . DC 4 2 D D -55.342 -1.746 9.134 1 3 '_' DC . 1 ATOM 1297 O "O5'" . DC 4 2 D D -55.949 -0.473 7.065 1 3 '_' DC . 1 ATOM 1298 C "C5'" . DC 4 2 D D -56.885 -0.081 6.047 1 3 '_' DC . 1 ATOM 1299 C "C4'" . DC 4 2 D D -56.433 1.209 5.404 1 3 '_' DC . 1 ATOM 1300 O "O4'" . DC 4 2 D D -56.629 2.303 6.325 1 3 '_' DC . 1 ATOM 1301 C "C3'" . DC 4 2 D D -54.960 1.256 4.990 1 3 '_' DC . 1 ATOM 1302 O "O3'" . DC 4 2 D D -54.883 1.298 3.566 1 3 '_' DC . 1 ATOM 1303 C "C2'" . DC 4 2 D D -54.421 2.537 5.631 1 3 '_' DC . 1 ATOM 1304 C "C1'" . DC 4 2 D D -55.667 3.294 6.055 1 3 '_' DC . 1 ATOM 1305 N N1 . 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