data_SMR-fa73be65843cb2305a5b225e970ac48d_1 _entry.id SMR-fa73be65843cb2305a5b225e970ac48d_1 _struct.entry_id SMR-fa73be65843cb2305a5b225e970ac48d_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P11531/ DMD_MOUSE, Dystrophin Estimated model accuracy of this model is 0.037, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P11531' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-10.11 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.6.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.11.1 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url _pdbx_data_usage.name 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 'Attribution-ShareAlike 4.0 International' 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer . # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 492664.425 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DMD_MOUSE P11531 1 ;MLWWEEVEDCYEREDVQKKTFTKWINAQFSKFGKQHIDNLFSDLQDGKRLLDLLEGLTGQKLPKEKGSTR VHALNNVNKALRVLQKNNVDLVNIGSTDIVDGNHKLTLGLIWNIILHWQVKNVMKTIMAGLQQTNSEKIL LSWVRQSTRNYPQVNVINFTSSWSDGLALNALIHSHRPDLFDWNSVVSQHSATQRLEHAFNIAKCQLGIE KLLDPEDVATTYPDKKSILMYITSLFQVLPQQVSIEAIQEVEMLPRTSSKVTREEHFQLHHQMHYSQQIT VSLAQGYEQTSSSPKPRFKSYAFTQAAYVATSDSTQSPYPSQHLEAPRDKSLDSSLMETEVNLDSYQTAL EEVLSWLLSAEDTLRAQGEISNDVEEVKEQFHAHEGFMMDLTSHQGLVGNVLQLGSQLVGKGKLSEDEEA EVQEQMNLLNSRWECLRVASMEKQSKLHKVLMDLQNQKLKELDDWLTKTEERTKKMEEEPFGPDLEDLKC QVQQHKVLQEDLEQEQVRVNSLTHMVVVVDESSGDHATAALEEQLKVLGDRWANICRWTEDRWIVLQDIL LKWQHFTEEQCLFSTWLSEKEDAMKNIQTSGFKDQNEMMSSLHKISTLKIDLEKKKPTMEKLSSLNQDLL SALKNKSVTQKMEIWMENFAQRWDNLTQKLEKSSAQISQAVTTTQPSLTQTTVMETVTMVTTREQIMVKH AQEELPPPPPQKKRQITVDSELRKRLDVDITELHSWITRSEAVLQSSEFAVYRKEGNISDLQEKVNAIAR EKAEKFRKLQDASRSAQALVEQMANEGVNAESIRQASEQLNSRWTEFCQLLSERVNWLEYQTNIITFYNQ LQQLEQMTTTAENLLKTQSTTLSEPTAIKSQLKICKDEVNRLSALQPQIEQLKIQSLQLKEKGQGPMFLD ADFVAFTNHFNHIFDGVRAKEKELQTIFDTLPPMRYQETMSSIRTWIQQSESKLSVPYLSVTEYEIMEER LGKLQALQSSLKEQQNGFNYLSDTVKEMAKKAPSEICQKYLSEFEEIEGHWKKLSSQLVESCQKLEEHMN KLRKFQNHIKTLQKWMAEVDVFLKEEWPALGDAEILKKQLKQCRLLVGDIQTIQPSLNSVNEGGQKIKSE AELEFASRLETELRELNTQWDHICRQVYTRKEALKAGLDKTVSLQKDLSEMHEWMTQAEEEYLERDFEYK TPDELQTAVEEMKRAKEEALQKETKVKLLTETVNSVIAHAPPSAQEALKKELETLTTNYQWLCTRLNGKC KTLEEVWACWHELLSYLEKANKWLNEVELKLKTMENVPAGPEEITEVLESLENLMHHSEENPNQIRLLAQ TLTDGGVMDELINEELETFNSRWRELHEEAVRKQKLLEQSIQSAQEIEKSLHLIQESLEFIDKQLAAYIT DKVDAAQMPQEAQKIQSDLTSHEISLEEMKKHNQGKDANQRVLSQIDVAQKKLQDVSMKFRLFQKPANFE QRLEESKMILDEVKMHLPALETKSVEQEVIQSQLSHCVNLYKSLSEVKSEVEMVIKTGRQIVQKKQTENP KELDERVTALKLHYNELGAKVTERKQQLEKCLKLSRKMRKEMNVLTEWLAATDTELTKRSAVEGMPSNLD SEVAWGKATQKEIEKQKAHLKSVTELGESLKMVLGKKETLVEDKLSLLNSNWIAVTSRVEEWLNLLLEYQ KHMETFDQNIEQITKWIIHADELLDESEKKKPQQKEDILKRLKAEMNDMRPKVDSTRDQAAKLMANRGDH CRKVVEPQISELNRRFAAISHRIKTGKASIPLKELEQFNSDIQKLLEPLEAEIQQGVNLKEEDFNKDMSE DNEGTVNELLQRGDNLQQRITDERKREEIKIKQQLLQTKHNALKDLRSQRRKKALEISHQWYQYKRQADD LLKCLDEIEKKLASLPEPRDERKLKEIDRELQKKKEELNAVRRQAEGLSENGAAMAVEPTQIQLSKRWRQ IESNFAQFRRLNFAQIHTLHEETMVVTTEDMPLDVSYVPSTYLTEISHILQALSEVDHLLNTPELCAKDF EDLFKQEESLKNIKDNLQQISGRIDIIHKKKTAALQSATSMEKVKVQEAVAQMDFQGEKLHRMYKERQGR FDRSVEKWRHFHYDMKVFNQWLNEVEQFFKKTQNPENWEHAKYKWYLKELQDGIGQRQAVVRTLNATGEE IIQQSSKTDVNILQEKLGSLSLRWHDICKELAERRKRIEEQKNVLSEFQRDLNEFVLWLEEADNIAITPL GDEQQLKEQLEQVKLLAEELPLRQGILKQLNETGGAVLVSAPIRPEEQDKLEKKLKQTNLQWIKVSRALP EKQGELEVHLKDFRQLEEQLDHLLLWLSPIRNQLEIYNQPSQAGPFDIKEIEVTVHGKQADVERLLSKGQ HLYKEKPSTQPVKRKLEDLRSEWEAVNHLLRELRTKQPDRAPGLSTTGASASQTVTLVTQSVVTKETVIS KLEMPSSLLLEVPALADFNRAWTELTDWLSLLDRVIKSQRVMVGDLEDINEMIIKQKATLQDLEQRRPQL EELITAAQNLKNKTSNQEARTIITDRIERIQIQWDEVQEQLQNRRQQLNEMLKDSTQWLEAKEEAEQVIG QVRGKLDSWKEGPHTVDAIQKKITETKQLAKDLRQRQISVDVANDLALKLLRDYSADDTRKVHMITENIN TSWGNIHKRVSEQEAALEETHRLLQQFPLDLEKFLSWITEAETTANVLQDASRKEKLLEDSRGVRELMKP WQDLQGEIETHTDIYHNLDENGQKILRSLEGSDEAPLLQRRLDNMNFKWSELQKKSLNIRSHLEASSDQW KRLHLSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQKQNDIHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRIFLTEQP LEGLEKLYQEPRELPPEERAQNVTRLLRKQAEEVNAEWDKLNLRSADWQRKIDEALERLQELQEAADELD LKLRQAEVIKGSWQPVGDLLIDSLQDHLEKVKALRGEIAPLKENVNRVNDLAHQLTTLGIQLSPYNLSTL EDLNTRWRLLQVAVEDRVRQLHEAHRDFGPASQHFLSTSVQGPWERAISPNKVPYYINHETQTTCWDHPK MTELYQSLADLNNVRFSAYRTAMKLRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQIINCLTTI YDRLEQEHNNLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTG FCDQRRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWMRLEPQSMVWLPV LHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHKMHYPMVEYCTPTTSGE DVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDNMETPVTLINFWPVDSAPASSPQLSHDDTHSRI EHYASRLAEMENSNGSYLNDSISPNESIDDEHLLIQHYCQSLNQDSPLSQPRSPAQILISLESEERGELE RILADLEEENRNLQAEYDRLKQQHEHKGLSPLPSPPEMMPTSPQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEARMQ ILEDHNKQLESQLHRLRQLLEQPQAEAKVNGTTVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSESMGEEDLLS PPQDTSTGLEEVMEQLNNSFPSSRGRNAPGKPMREDTM ; Dystrophin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3678 1 3678 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . DMD_MOUSE P11531 . 1 3678 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 53487B1E27104228 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no Z ;MLWWEEVEDCYEREDVQKKTFTKWINAQFSKFGKQHIDNLFSDLQDGKRLLDLLEGLTGQKLPKEKGSTR VHALNNVNKALRVLQKNNVDLVNIGSTDIVDGNHKLTLGLIWNIILHWQVKNVMKTIMAGLQQTNSEKIL LSWVRQSTRNYPQVNVINFTSSWSDGLALNALIHSHRPDLFDWNSVVSQHSATQRLEHAFNIAKCQLGIE KLLDPEDVATTYPDKKSILMYITSLFQVLPQQVSIEAIQEVEMLPRTSSKVTREEHFQLHHQMHYSQQIT VSLAQGYEQTSSSPKPRFKSYAFTQAAYVATSDSTQSPYPSQHLEAPRDKSLDSSLMETEVNLDSYQTAL EEVLSWLLSAEDTLRAQGEISNDVEEVKEQFHAHEGFMMDLTSHQGLVGNVLQLGSQLVGKGKLSEDEEA EVQEQMNLLNSRWECLRVASMEKQSKLHKVLMDLQNQKLKELDDWLTKTEERTKKMEEEPFGPDLEDLKC QVQQHKVLQEDLEQEQVRVNSLTHMVVVVDESSGDHATAALEEQLKVLGDRWANICRWTEDRWIVLQDIL LKWQHFTEEQCLFSTWLSEKEDAMKNIQTSGFKDQNEMMSSLHKISTLKIDLEKKKPTMEKLSSLNQDLL 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A 1 3533 PRO 3533 ? ? ? Z . A 1 3534 SER 3534 ? ? ? Z . A 1 3535 PRO 3535 ? ? ? Z . A 1 3536 PRO 3536 ? ? ? Z . A 1 3537 GLU 3537 ? ? ? Z . A 1 3538 MET 3538 ? ? ? Z . A 1 3539 MET 3539 ? ? ? Z . A 1 3540 PRO 3540 ? ? ? Z . A 1 3541 THR 3541 ? ? ? Z . A 1 3542 SER 3542 ? ? ? Z . A 1 3543 PRO 3543 ? ? ? Z . A 1 3544 GLN 3544 ? ? ? Z . A 1 3545 SER 3545 ? ? ? Z . A 1 3546 PRO 3546 ? ? ? Z . A 1 3547 ARG 3547 ? ? ? Z . A 1 3548 ASP 3548 ? ? ? Z . A 1 3549 ALA 3549 ? ? ? Z . A 1 3550 GLU 3550 ? ? ? Z . A 1 3551 LEU 3551 ? ? ? Z . A 1 3552 ILE 3552 ? ? ? Z . A 1 3553 ALA 3553 ? ? ? Z . A 1 3554 GLU 3554 ? ? ? Z . A 1 3555 ALA 3555 ? ? ? Z . A 1 3556 LYS 3556 ? ? ? Z . A 1 3557 LEU 3557 ? ? ? Z . A 1 3558 LEU 3558 ? ? ? Z . A 1 3559 ARG 3559 ? ? ? Z . A 1 3560 GLN 3560 ? ? ? Z . A 1 3561 HIS 3561 ? ? ? Z . A 1 3562 LYS 3562 ? ? ? Z . A 1 3563 GLY 3563 ? ? ? Z . A 1 3564 ARG 3564 ? ? ? Z . A 1 3565 LEU 3565 ? ? ? Z . A 1 3566 GLU 3566 ? ? ? Z . A 1 3567 ALA 3567 ? ? ? Z . 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A 1 3603 THR 3603 ? ? ? Z . A 1 3604 VAL 3604 ? ? ? Z . A 1 3605 SER 3605 ? ? ? Z . A 1 3606 SER 3606 ? ? ? Z . A 1 3607 PRO 3607 ? ? ? Z . A 1 3608 SER 3608 ? ? ? Z . A 1 3609 THR 3609 ? ? ? Z . A 1 3610 SER 3610 ? ? ? Z . A 1 3611 LEU 3611 ? ? ? Z . A 1 3612 GLN 3612 ? ? ? Z . A 1 3613 ARG 3613 ? ? ? Z . A 1 3614 SER 3614 ? ? ? Z . A 1 3615 ASP 3615 ? ? ? Z . A 1 3616 SER 3616 ? ? ? Z . A 1 3617 SER 3617 ? ? ? Z . A 1 3618 GLN 3618 ? ? ? Z . A 1 3619 PRO 3619 ? ? ? Z . A 1 3620 MET 3620 ? ? ? Z . A 1 3621 LEU 3621 ? ? ? Z . A 1 3622 LEU 3622 ? ? ? Z . A 1 3623 ARG 3623 ? ? ? Z . A 1 3624 VAL 3624 ? ? ? Z . A 1 3625 VAL 3625 ? ? ? Z . A 1 3626 GLY 3626 ? ? ? Z . A 1 3627 SER 3627 ? ? ? Z . A 1 3628 GLN 3628 ? ? ? Z . A 1 3629 THR 3629 ? ? ? Z . A 1 3630 SER 3630 ? ? ? Z . A 1 3631 GLU 3631 ? ? ? Z . A 1 3632 SER 3632 ? ? ? Z . A 1 3633 MET 3633 ? ? ? Z . A 1 3634 GLY 3634 ? ? ? Z . A 1 3635 GLU 3635 ? ? ? Z . A 1 3636 GLU 3636 ? ? ? Z . A 1 3637 ASP 3637 ? ? ? Z . A 1 3638 LEU 3638 ? ? ? Z . A 1 3639 LEU 3639 ? ? ? Z . A 1 3640 SER 3640 ? ? ? Z . A 1 3641 PRO 3641 ? ? ? Z . A 1 3642 PRO 3642 ? ? ? Z . A 1 3643 GLN 3643 ? ? ? Z . A 1 3644 ASP 3644 ? ? ? Z . A 1 3645 THR 3645 ? ? ? Z . A 1 3646 SER 3646 ? ? ? Z . A 1 3647 THR 3647 ? ? ? Z . A 1 3648 GLY 3648 ? ? ? Z . A 1 3649 LEU 3649 ? ? ? Z . A 1 3650 GLU 3650 ? ? ? Z . A 1 3651 GLU 3651 ? ? ? Z . A 1 3652 VAL 3652 ? ? ? Z . A 1 3653 MET 3653 ? ? ? Z . A 1 3654 GLU 3654 ? ? ? Z . A 1 3655 GLN 3655 ? ? ? Z . A 1 3656 LEU 3656 ? ? ? Z . A 1 3657 ASN 3657 ? ? ? Z . A 1 3658 ASN 3658 ? ? ? Z . A 1 3659 SER 3659 ? ? ? Z . A 1 3660 PHE 3660 ? ? ? Z . A 1 3661 PRO 3661 ? ? ? Z . A 1 3662 SER 3662 ? ? ? Z . A 1 3663 SER 3663 ? ? ? Z . A 1 3664 ARG 3664 ? ? ? Z . A 1 3665 GLY 3665 ? ? ? Z . A 1 3666 ARG 3666 ? ? ? Z . A 1 3667 ASN 3667 ? ? ? Z . A 1 3668 ALA 3668 ? ? ? Z . A 1 3669 PRO 3669 ? ? ? Z . A 1 3670 GLY 3670 ? ? ? Z . A 1 3671 LYS 3671 ? ? ? Z . A 1 3672 PRO 3672 ? ? ? Z . A 1 3673 MET 3673 ? ? ? Z . A 1 3674 ARG 3674 ? ? ? Z . A 1 3675 GLU 3675 ? ? ? Z . A 1 3676 ASP 3676 ? ? ? Z . A 1 3677 THR 3677 ? ? ? Z . A 1 3678 MET 3678 ? ? ? Z . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Spectrin beta chain {PDB ID=8iai, label_asym_id=Z, auth_asym_id=S, SMTL ID=8iai.1.Z}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8iai, label_asym_id=Z' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-11-05 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-10-31 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A Z 5 1 S # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MTSATEFENVGNQPPYSRINARWDAPDDELDNDNSSARLFERSRIKALADEREVVQKKTFTKWVNSHLAR VSCRITDLYKDLRDGRMLIKLLEVLSGEMLPKPTKGKMRIHCLENVDKALQFLKEQRVHLENMGSHDIVD GNHRLVLGLIWTIILRFQIQDIVVQTQEGRETRSAKDALLLWCQMKTAGYPNVNVTNFTSSWKDGLAFNA LIHKHRPDLIDFDKLKDSNARHNLEHAFDVAERQLGIIQLLDPEDVFTENPDEKSIITYVVAFYHYFSKM KVLAVEGKRVGKVIDHAIETEKMIEKYSGLASDLLTWIEQTITVLNSRKFANSLAGVQQQLQAFSTYRTV EKPPKFQEKGNLEVLLFTIQSRMRANNQKVYTPHDGKLVSDINRAWESLEEAEYRRELALRSELIRQEKL EQLARRFDRKAAMRETWLNENQRLVAQDNFGYDLAAVEAAKKKHEAIETDTAAYEERVRALEDLARELEL ENYHDQKRITARKDNILRLWNYLQELLQSRRQRLETTLALQQLFQDMLHSIDWMDEIKAHLLSAEFGKHL LEAEDLLQKHKLMEADIAIQGDKVKAITAATLQFTEETGYQPCDPQVIRDRVSHLEQCFAELSNTAAGRK AQLEQSKRLWKLFWEMDEAKSWIKEKEQIYSSLGYGKDLTSVLILQRKHKAFEDELRRLDPHLDQIFQEA EDMVALKQFGYPKNEAWVKEVSAQWDQLKEVPAQWNQLKELAASRKKNLQDTENFFQFQGDVDDLKAWLQ DAHKLLSGEDVGQDEGATRALGKKHKDFLEELEESRGVMEHLEQQAQDFPERFRDSPDVTNRLQVLRDLY QQVVAQADLRRQRLQDALDLYTVFGETDACELWMGEKEKWLAQMDIPDTLEDLEVVQHRFDILDQEMKTL IAQIDGVNVAANSLVESNHPRSTEVKQYQDHLNTRWREFQTMVLARREAVDSALRVHNYCVDCEETSKWI IDKTKVVESTKDLGQDLAGVMAIQRKLSGLERDVAAIQVRVGALEQESHRLMESHREQEKDIGERQAYVE ELWQGLQQALKGQEALLGKSSQLQAFLQDLDAFEAWLSTAQKEVASKDMPESLPEAEQLLQQHAALKDDI DRHQENYQHVKASGEKVIHGQTDPEYLLLGQRLEGLDKGWDALCRMWESRGHTLAQCLGFQEFQKDAKQA EAILSNQEYTLAHLEPPDSLEAAEAGIRKFQDFFTTMENNRDKVLSPVDSGNKLVAEGNLYSDKIKEKVQ QIEDRHKRNNEKAQEASVLLQDNLALQNFLQNCQELTLWINDKLLTSQDVSYDDARNLHNKWLKHTAFEA ELASQQGWLENIDAEGKQLMEEKPQFEALVSQRLEALHRLWDELQATTKEIGQRLSAARSSDLRSQTHAD LNKWIRAMEDQLRSDDLGKDLTSVNRMLAKLKRVEDQVNVRKEELGELFAHMPSPGEEAEDEDLSIEKRF LDLLEPLGRRKKQLESSKAKLQISRDLEDETLWVEERLPLAQSTDYGANLQTVQLFMKKNQTLQNEILGH 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ELASQQGWLENIDAEGKQLMEEKPQFEALVSQRLEALHRLWDELQATTKEIGQRLSAARSSDLRSQTHAD LNKWIRAMEDQLRSDDLGKDLTSVNRMLAKLKRVEDQVNVRKEELGELFAHMPSPGEEAEDEDLSIEKRF LDLLEPLGRRKKQLESSKAKLQISRDLEDETLWVEERLPLAQSTDYGANLQTVQLFMKKNQTLQNEILGH APRVEDVLYRGHQLVEAAEIDCQDIEERLGHLQNSWDTLQEAAAGRLQRLWDASEAQQYYLDAGEAEAWI SEQELYVISDEMPQDEEGAIVMLKRHLRQQRMVEEYERNIKQLAGRAQSLLAAGHPEGEQIIRLQGQVDK HYAGLKDMAEDRKRKLENKYRQFQMEREADDLEQWILEKDLVASSPEMGQDFDHVTLLRDKFRDFARETG AIGQERVDNMNALIEHLIDAGHEEAASIAERKDGLNEMWADVLELIDTRMQLLAASYDRHRYFYTGNEIL GLIDEKHRELPEDVGLDASTAESFHRVHTAFERELHQLGVQVQQFQDVATRLQAAYAGEEADSIQNKEQE VSAAWQALLDACAGRRTQLVDTADKFRFFSMVRDLLSWMETIIRQIETQERPRDVSSVELLMKYHQGIWA EMDTRSKNFSACLELGESLLQRQHQASDEIREKLQQVVSKKKEIDEKWKARSDRLSMLLEVCQFSRDASV AEAWLIAQEPYLSSRDFGHTVDSVEKLIKRHEAFEKSTASWEPRFAALEKPTTLELKERQTPERPKEDAG PQEEEGETAGEAPRGPHRAATERTSPVSSLSHLSSSWESLLPEPAHPY ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 48 2142 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8iai 2025-06-18 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3678 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 3714 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1e-121 19.524 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 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2 1 2 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# # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8iai.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 1' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 339.261 361.352 284.295 1 1 Z TYR 0.520 1 ATOM 16 C CA . TYR 11 11 ? A 339.790 362.329 285.246 1 1 Z TYR 0.520 1 ATOM 17 C C . TYR 11 11 ? A 339.625 363.768 284.767 1 1 Z TYR 0.520 1 ATOM 18 O O . TYR 11 11 ? A 339.068 364.599 285.480 1 1 Z TYR 0.520 1 ATOM 19 C CB . TYR 11 11 ? A 341.274 362.028 285.609 1 1 Z TYR 0.520 1 ATOM 20 C CG . TYR 11 11 ? A 341.377 360.729 286.366 1 1 Z TYR 0.520 1 ATOM 21 C CD1 . TYR 11 11 ? A 340.919 360.666 287.691 1 1 Z TYR 0.520 1 ATOM 22 C CD2 . TYR 11 11 ? A 341.955 359.579 285.800 1 1 Z TYR 0.520 1 ATOM 23 C CE1 . TYR 11 11 ? A 341.037 359.485 288.436 1 1 Z TYR 0.520 1 ATOM 24 C CE2 . TYR 11 11 ? A 342.069 358.394 286.545 1 1 Z TYR 0.520 1 ATOM 25 C CZ . TYR 11 11 ? A 341.605 358.346 287.864 1 1 Z TYR 0.520 1 ATOM 26 O OH . TYR 11 11 ? A 341.725 357.165 288.624 1 1 Z TYR 0.520 1 ATOM 27 N N . GLU 12 12 ? A 339.967 364.100 283.505 1 1 Z GLU 0.440 1 ATOM 28 C CA . GLU 12 12 ? A 339.731 365.436 282.974 1 1 Z GLU 0.440 1 ATOM 29 C C . GLU 12 12 ? A 338.263 365.836 282.970 1 1 Z GLU 0.440 1 ATOM 30 O O . GLU 12 12 ? A 337.871 366.934 283.370 1 1 Z GLU 0.440 1 ATOM 31 C CB . GLU 12 12 ? A 340.248 365.540 281.515 1 1 Z GLU 0.440 1 ATOM 32 C CG . GLU 12 12 ? A 341.766 365.815 281.393 1 1 Z GLU 0.440 1 ATOM 33 C CD . GLU 12 12 ? A 342.152 367.146 282.041 1 1 Z GLU 0.440 1 ATOM 34 O OE1 . GLU 12 12 ? A 341.348 368.107 281.948 1 1 Z GLU 0.440 1 ATOM 35 O OE2 . GLU 12 12 ? A 343.281 367.198 282.588 1 1 Z GLU 0.440 1 ATOM 36 N N . ARG 13 13 ? A 337.370 364.928 282.547 1 1 Z ARG 0.600 1 ATOM 37 C CA . ARG 13 13 ? A 335.950 365.196 282.578 1 1 Z ARG 0.600 1 ATOM 38 C C . ARG 13 13 ? A 335.363 365.403 283.971 1 1 Z ARG 0.600 1 ATOM 39 O O . ARG 13 13 ? A 334.564 366.321 284.166 1 1 Z ARG 0.600 1 ATOM 40 C CB . ARG 13 13 ? A 335.179 364.070 281.857 1 1 Z ARG 0.600 1 ATOM 41 C CG . ARG 13 13 ? A 333.650 364.272 281.862 1 1 Z ARG 0.600 1 ATOM 42 C CD . ARG 13 13 ? A 332.915 363.429 280.819 1 1 Z ARG 0.600 1 ATOM 43 N NE . ARG 13 13 ? 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GLY 47 47 ? A 324.156 367.323 305.511 1 1 Z GLY 0.830 1 ATOM 330 O O . GLY 47 47 ? A 323.074 367.550 304.973 1 1 Z GLY 0.830 1 ATOM 331 N N . LYS 48 48 ? A 324.759 368.226 306.309 1 1 Z LYS 0.750 1 ATOM 332 C CA . LYS 48 48 ? A 324.154 369.495 306.670 1 1 Z LYS 0.750 1 ATOM 333 C C . LYS 48 48 ? A 324.028 370.408 305.470 1 1 Z LYS 0.750 1 ATOM 334 O O . LYS 48 48 ? A 322.967 370.949 305.152 1 1 Z LYS 0.750 1 ATOM 335 C CB . LYS 48 48 ? A 324.987 370.217 307.759 1 1 Z LYS 0.750 1 ATOM 336 C CG . LYS 48 48 ? A 324.492 371.645 308.031 1 1 Z LYS 0.750 1 ATOM 337 C CD . LYS 48 48 ? A 325.201 372.314 309.209 1 1 Z LYS 0.750 1 ATOM 338 C CE . LYS 48 48 ? A 324.634 373.707 309.484 1 1 Z LYS 0.750 1 ATOM 339 N NZ . LYS 48 48 ? A 324.825 374.580 308.302 1 1 Z LYS 0.750 1 ATOM 340 N N . ARG 49 49 ? A 325.111 370.563 304.694 1 1 Z ARG 0.760 1 ATOM 341 C CA . ARG 49 49 ? A 325.110 371.458 303.551 1 1 Z ARG 0.760 1 ATOM 342 C C . ARG 49 49 ? 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