SMTL ID : 1uf8.1

Crystal structure of C171A/V236A Mutant of N-carbamyl-D-amino acid amidohydrolase complexed with N-carbamyl-D-Phenylalanine

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 1.80 Å

Oligo State

homo-tetramer

Ligands

4 x ING: D-[(AMINO)CARBONYL]PHENYLALANINE(Non-covalent)

ING.1: 15 residues within 4Å: Chain A: E.46, F.52, K.126, P.130, G.131, H.143, E.145, A.171, N.172, R.174, R.175, N.196, T.197, N.201 Chain B: I.285 12 PLIP interactions: 10 interactions with chain A, 2 interactions with chain B Hydrophobic interactions: A:P.130, B:I.285, B:I.285 Hydrogen bonds: A:E.46, A:K.126, A:N.172, A:N.172, A:N.196, A:N.196 Salt bridges: A:R.174, A:R.175 pi-Stacking: A:H.143 ING.2: 15 residues within 4Å: Chain A: I.285 Chain B: E.46, F.52, K.126, P.130, G.131, H.143, E.145, A.171, N.172, R.174, R.175, N.196, T.197, N.201 12 PLIP interactions: 10 interactions with chain B, 2 interactions with chain A Hydrophobic interactions: B:P.130, A:I.285, A:I.285 Hydrogen bonds: B:E.46, B:K.126, B:N.172, B:N.172, B:N.196, B:N.196 Salt bridges: B:R.174, B:R.175 pi-Stacking: B:H.143 ING.3: 15 residues within 4Å: Chain C: E.46, F.52, K.126, P.130, G.131, H.143, E.145, A.171, N.172, R.174, R.175, N.196, T.197, N.201 Chain D: I.285 12 PLIP interactions: 10 interactions with chain C, 2 interactions with chain D Hydrophobic interactions: C:P.130, D:I.285, D:I.285 Hydrogen bonds: C:E.46, C:K.126, C:N.172, C:N.172, C:N.196, C:N.196 Salt bridges: C:R.174, C:R.175 pi-Stacking: C:H.143 ING.4: 15 residues within 4Å: Chain C: I.285 Chain D: E.46, F.52, K.126, P.130, G.131, H.143, E.145, A.171, N.172, R.174, R.175, N.196, T.197, N.201 12 PLIP interactions: 10 interactions with chain D, 2 interactions with chain C Hydrophobic interactions: D:P.130, C:I.285, C:I.285 Hydrogen bonds: D:E.46, D:K.126, D:N.172, D:N.172, D:N.196, D:N.196 Salt bridges: D:R.174, D:R.175 pi-Stacking: D:H.143

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Hashimoto, H. et al., Crystal structure of C171A/V236A Mutant of N-carbamyl-D-amino acid amidohydrolase. To be published

Release Date

2004-06-08

Peptides

N-carbamyl-D-amino acid amidohydrolase: ABCD

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

C
A

D
B

N-carbamyl-D-amino acid amidohydrolase

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