SMTL ID : 4rk0.2 (1 other biounit)

Crystal structure of LacI family transcriptional regulator from Enterococcus faecalis V583, Target EFI-512923, with bound ribose

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 1.80 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

2 x RIB: alpha-D-ribofuranose(Non-covalent)

RIB.1: 12 residues within 4Å: Chain A: N.19, F.21, F.22, D.94, Q.95, N.139, I.140, R.143, L.162, N.186, D.214, Q.231 14 PLIP interactions: 14 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:N.19, A:N.19, A:Q.95, A:N.139, A:R.143, A:R.143, A:N.186, A:D.214, A:Q.231, A:Q.231 Water bridges: A:D.94, A:D.94, A:D.187 Salt bridges: A:R.143 RIB.2: 12 residues within 4Å: Chain B: N.19, F.21, F.22, D.94, Q.95, N.139, I.140, R.143, L.162, N.186, D.214, Q.231 14 PLIP interactions: 14 interactions with chain B Hydrogen bonds: B:N.19, B:N.19, B:Q.95, B:N.139, B:R.143, B:R.143, B:N.186, B:D.214, B:Q.231, B:Q.231 Water bridges: B:E.188 Salt bridges: B:R.143 pi-Stacking: B:F.22 pi-Cation interactions: B:R.143

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Patskovsky, Y. et al., Crystal Structure of LacI Transcriptional Regulator Ef_2962 from Enterococcus faecalis V583, Target EFI-512923. To be Published

Release Date

2014-10-29

Peptides

LacI family sugar-binding transcriptional regulator: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
C

B
D

LacI family sugar-binding transcriptional regulator

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