SMTL ID : 4z24.1

Mimivirus R135 (residues 51-702)

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 2.00 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

2 x FAD: FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE(Non-covalent)

FAD.1: 37 residues within 4Å: Chain A: G.13, G.15, A.16, A.17, L.36, E.37, A.38, S.68, W.75, A.93, H.94, G.95, M.96, G.97, G.100, S.101, T.102, I.104, N.105, R.106, L.107, N.108, A.261, V.262, V.263, T.297, S.298, G.299, Y.302, S.577, H.578, D.605, L.606, N.616, T.617, W.618, A.621 28 PLIP interactions: 28 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:I.104 Hydrogen bonds: A:A.14, A:A.16, A:A.17, A:A.38, A:G.95, A:G.97, A:S.101, A:S.101, A:T.102, A:N.105, A:R.106, A:N.108, A:N.108, A:V.263, A:V.263, A:L.606, A:N.616, A:T.617, A:T.617, A:T.617, A:W.618 Water bridges: A:G.15, A:S.101, A:A.300 Salt bridges: A:H.94 pi-Stacking: A:H.578 pi-Cation interactions: A:H.578 FAD.2: 36 residues within 4Å: Chain B: G.13, G.15, A.16, A.17, E.37, A.38, S.68, W.75, A.93, H.94, G.95, M.96, G.97, G.100, S.101, T.102, I.104, N.105, R.106, L.107, N.108, A.261, V.262, V.263, T.297, S.298, G.299, Y.302, S.577, H.578, D.605, L.606, N.616, T.617, W.618, A.621 30 PLIP interactions: 30 interactions with chain B Hydrophobic interactions: B:I.104, B:N.105 Hydrogen bonds: B:A.14, B:A.16, B:A.17, B:A.38, B:G.95, B:G.97, B:S.101, B:S.101, B:T.102, B:N.105, B:R.106, B:N.108, B:N.108, B:V.263, B:V.263, B:L.606, B:N.616, B:T.617, B:T.617, B:W.618 Water bridges: B:G.15, B:G.18, B:S.101, B:A.300, B:A.619 Salt bridges: B:H.94 pi-Stacking: B:H.578, B:H.578

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Klose, T. et al., A Mimivirus Enzyme that Participates in Viral Entry. Structure (2015)

Release Date

2015-04-15

Peptides

GMC-type oxidoreductase R135: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

GMC-type oxidoreductase R135

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