SMTL ID : 6da0.1

Crystal structure of glucokinase (NfHK) from Naegleria fowleri

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 2.20 Å

Oligo State

monomer

Ligands

1 x BGC: beta-D-glucopyranose(Non-covalent)

BGC.1: 13 residues within 4Å: Chain A: A.124, G.125, P.126, T.135, N.136, N.163, D.164, G.216, L.217, G.218, E.236, H.239, E.276 14 PLIP interactions: 14 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:T.135, A:T.135, A:N.136, A:N.163, A:N.163, A:E.236, A:E.236 Water bridges: A:D.164, A:D.164, A:D.164, A:G.216, A:G.216, A:G.218 Salt bridges: A:H.239

1 x ANP: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER(Non-covalent)

ANP.2: 15 residues within 4Å: Chain A: G.64, A.65, T.66, N.67, G.214, T.215, G.281, L.284, A.303, S.304, A.307, H.323, N.350, F.353, N.354 19 PLIP interactions: 19 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:A.65, A:T.66, A:T.66, A:T.66, A:N.67, A:N.67, A:T.215, A:T.215, A:T.215, A:G.216, A:G.281, A:N.350, A:N.354, A:N.354 Water bridges: A:N.67, A:R.69, A:G.214, A:G.214, A:R.282

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Milanes, J.E. et al., Enzymatic and Structural Characterization of theNaegleria fowleriGlucokinase. Antimicrob.Agents Chemother. (2019)

Release Date

2018-05-09

Peptides

Glucokinase: A

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

Glucokinase