SMTL ID : 6r9r.1

Crystal structure of Csx1 in complex with cyclic oligoadenylate cOA4 conformation 2

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 2.70 Å

Oligo State

homo-hexamer

Ligands

4 x A- A- A- A: circular RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*A)-3')(Non-covalent)

A-A-A-A.1: 38 residues within 4Å: Chain A: G.10, D.11, N.14, Y.15, S.16, Y.20, F.30, S.52, A.98, S.99, T.155, H.156, G.157, T.158, N.159, A.179, P.180, V.181, M.182 Chain B: G.10, D.11, N.14, Y.15, S.16, Y.20, F.30, S.52, L.53, A.98, S.99, T.155, H.156, G.157, T.158, N.159, A.179, V.181, M.182 Protein-ligand interaction information (PLIP) not available A-A-A-A.2: 38 residues within 4Å: Chain C: G.10, D.11, N.14, Y.15, S.16, Y.20, F.30, S.52, A.98, S.99, T.155, H.156, G.157, T.158, N.159, A.179, P.180, V.181, M.182 Chain D: G.10, D.11, N.14, Y.15, S.16, Y.20, F.30, S.52, L.53, A.98, S.99, T.155, H.156, G.157, T.158, N.159, A.179, V.181, M.182 Protein-ligand interaction information (PLIP) not available A-A-A-A.3: 24 residues within 4Å: Chain E: G.10, D.11, N.14, Y.15, S.16, Y.20, F.30, S.52, L.53, A.98, S.99, T.155, H.156, G.157, T.158, N.159, A.179, P.180, V.181 Chain F: N.159, P.180, M.182 Ligands: A-A.4, A-A.4 Protein-ligand interaction information (PLIP) not available A-A-A-A.4: 24 residues within 4Å: Chain E: N.159, P.180, M.182 Chain F: G.10, D.11, N.14, Y.15, S.16, Y.20, F.30, S.52, L.53, A.98, S.99, T.155, H.156, G.157, T.158, N.159, A.179, P.180, V.181 Ligands: A-A.3, A-A.3 Protein-ligand interaction information (PLIP) not available

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Molina, R. et al., Structure of Csx1-cOA4complex reveals the basis of RNA decay in Type III-B CRISPR-Cas. Nat Commun (2019)

Release Date

2019-10-02

Peptides

CRISPR-associated (Cas) DxTHG family: ABCDEF

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
B

B
A

C
B

D
A

E
C

F
C

CRISPR-associated (Cas) DxTHG family