SMTL ID : 1bxk.1

DTDP-GLUCOSE 4,6-DEHYDRATASE FROM E. COLI

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 1.90 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

2 x NAD: NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE(Non-covalent)

NAD.1: 27 residues within 4Å: Chain A: G.8, A.10, G.11, F.12, I.13, D.33, K.34, L.35, T.36, A.38, G.39, V.58, D.59, I.60, L.81, A.82, A.83, T.100, I.132, S.133, T.134, Y.160, K.164, C.187, S.188, N.189, N.190 20 PLIP interactions: 20 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:I.13 Hydrogen bonds: A:A.10, A:F.12, A:I.13, A:G.14, A:K.34, A:L.35, A:T.36, A:T.36, A:I.60, A:L.81, A:A.83, A:T.100, A:T.100, A:Y.160, A:K.164, A:N.190, A:N.190 Water bridges: A:G.11, A:A.38 NAD.2: 27 residues within 4Å: Chain B: G.8, A.10, G.11, F.12, I.13, D.33, K.34, L.35, T.36, A.38, G.39, V.58, D.59, I.60, L.81, A.82, A.83, T.100, I.132, S.133, T.134, Y.160, K.164, C.187, S.188, N.189, N.190 23 PLIP interactions: 23 interactions with chain B Hydrophobic interactions: B:I.13 Hydrogen bonds: B:A.10, B:F.12, B:I.13, B:G.14, B:K.34, B:L.35, B:T.36, B:T.36, B:D.59, B:I.60, B:L.81, B:A.83, B:T.100, B:Y.160, B:Y.160, B:K.164, B:N.190 Water bridges: B:G.11, B:A.38, B:S.85, B:S.85, B:N.189

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Thoden, J.B. et al., Molecular Structure of Dtdp-Glucose 4,6-Dehydratase from E. Coli. Protein Sci.

Release Date

1998-10-14

Peptides

PROTEIN (DTDP-GLUCOSE 4,6-DEHYDRATASE): AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

PROTEIN (DTDP-GLUCOSE 4,6-DEHYDRATASE)