SMTL ID : 1f76.3 (3 other biounits)

ESCHERICHIA COLI DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 2.50 Å

Oligo State

monomer

Ligands

1 x FMN: FLAVIN MONONUCLEOTIDE(Non-covalent)

FMN.1: 24 residues within 4Å: Chain A: A.61, A.62, G.63, K.66, T.86, L.100, N.111, N.139, N.172, K.217, T.245, N.246, T.247, S.267, G.268, L.271, V.295, G.296, G.297, I.317, Y.318, S.319 Ligands: FMT.3, FMT.4 21 PLIP interactions: 21 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:L.100 Hydrogen bonds: A:A.62, A:K.66, A:T.86, A:T.86, A:T.86, A:N.139, A:N.172, A:K.217, A:K.217, A:N.246, A:S.267, A:G.268, A:G.297, A:Y.318, A:S.319 Water bridges: A:A.62, A:G.296, A:G.296, A:G.320 pi-Stacking: A:Y.318

1 x ORO: OROTIC ACID(Non-covalent)

ORO.2: 5 residues within 4Å: Chain A: M.1, L.37, V.38, Q.40, P.326 1 PLIP interactions: 1 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:Q.40

2 x FMT: FORMIC ACID(Non-functional Binders)

FMT.3: 8 residues within 4Å: Chain A: F.115, N.172, S.175, P.176, N.246, T.247 Ligands: FMN.1, FMT.4 4 PLIP interactions: 4 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:N.172, A:N.177, A:N.246, A:T.247 FMT.4: 9 residues within 4Å: Chain A: K.66, N.111, M.113, G.114, F.115, S.175, N.177 Ligands: FMN.1, FMT.3 6 PLIP interactions: 6 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:K.66, A:K.66, A:G.114, A:F.115, A:S.175, A:N.177

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Norager, S. et al., E. coli Dihydroorotate Dehydrogenase Reveals Structural and Functional Distinction between different classes of dihydroorotate dehydrogenases. Structure (2002)

Release Date

2002-10-16

Peptides

Dihydroorotate dehydrogenase (quinone): A

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
D

Dihydroorotate dehydrogenase (quinone)

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