SMTL ID : 1ff5.1

STRUCTURE OF E-CADHERIN DOUBLE DOMAIN

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 2.93 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

6 x CA: CALCIUM ION(Non-covalent)

CA.1: 6 residues within 4Å: Chain B: N.103, N.105, D.135, D.137, N.144, D.196 5 PLIP interactions: 5 interactions with chain B Metal complexes: B:N.105, B:D.135, B:D.137, B:N.144, B:D.196 CA.2: 6 residues within 4Å: Chain B: E.12, E.70, D.101, Q.102, D.104, D.137 5 PLIP interactions: 5 interactions with chain B Metal complexes: B:E.12, B:D.101, B:Q.102, B:D.104, B:D.137 CA.3: 5 residues within 4Å: Chain B: E.12, N.13, D.68, E.70, D.104 5 PLIP interactions: 3 interactions with chain B, 2 Ligand-Water interactions Metal complexes: B:E.12, B:D.68, B:D.104, H2O.8, H2O.10 CA.4: 6 residues within 4Å: Chain A: N.103, N.105, D.135, D.137, N.144, D.196 5 PLIP interactions: 5 interactions with chain A Metal complexes: A:N.105, A:D.135, A:D.137, A:N.144, A:D.196 CA.5: 7 residues within 4Å: Chain A: E.12, E.70, D.101, Q.102, D.104, N.105, D.137 5 PLIP interactions: 5 interactions with chain A Metal complexes: A:E.12, A:D.101, A:Q.102, A:D.104, A:D.137 CA.6: 5 residues within 4Å: Chain A: E.12, N.13, D.68, E.70, D.104 3 PLIP interactions: 3 interactions with chain A Metal complexes: A:E.12, A:D.68, A:D.104

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Pertz, O. et al., A new crystal structure, Ca2+ dependence and mutational analysis reveal molecular details of E-cadherin homoassociation. EMBO J. (1999)

Release Date

2000-08-23

Peptides

EPITHELIAL CADHERIN: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

EPITHELIAL CADHERIN