- Coordinates
- PDB Format
- Method
- X-RAY DIFFRACTION 2.10 Å
- Oligo State
- homo-dimer
- Ligands
- 2 x MG: MAGNESIUM ION(Non-covalent)
- 2 x FMN: FLAVIN MONONUCLEOTIDE(Non-covalent)
FMN.2: 23 residues within 4Å:- Chain A: A.18, S.19, G.20, K.43, S.44, Y.58, N.67, M.69, L.71, N.127, K.164, V.192, N.193, S.194, G.220, G.221, I.224, T.248, G.249, G.250, G.271, T.272
- Ligands: ORO.3
25 PLIP interactions:25 interactions with chain A- Hydrophobic interactions: A:Y.58, A:Y.58
- Hydrogen bonds: A:S.19, A:S.44, A:S.44, A:S.44, A:N.127, A:K.164, A:K.164, A:K.164, A:N.193, A:G.221, A:G.250, A:G.271, A:T.272, A:T.272
- Water bridges: A:S.19, A:K.43, A:S.99, A:S.99, A:N.190, A:G.249, A:I.251, A:I.251, A:I.251
FMN.7: 23 residues within 4Å:- Chain B: A.18, S.19, G.20, K.43, S.44, Y.58, N.67, M.69, L.71, N.127, K.164, V.192, N.193, S.194, G.220, G.221, I.224, T.248, G.249, G.250, G.271, T.272
- Ligands: ORO.8
23 PLIP interactions:23 interactions with chain B- Hydrophobic interactions: B:Y.58, B:Y.58
- Hydrogen bonds: B:S.19, B:S.44, B:S.44, B:S.44, B:N.127, B:K.164, B:K.164, B:K.164, B:N.193, B:G.221, B:G.250, B:G.271, B:T.272
- Water bridges: B:S.19, B:K.43, B:S.99, B:N.190, B:G.249, B:G.249, B:I.251, B:I.251
- 2 x ORO: OROTIC ACID(Non-covalent)
ORO.3: 12 residues within 4Å:- Chain A: K.43, N.67, S.68, M.69, G.70, L.71, P.72, N.127, N.193, S.194
- Ligands: FMN.2, ACY.5
12 PLIP interactions:12 interactions with chain A- Hydrophobic interactions: A:L.71
- Hydrogen bonds: A:N.67, A:N.67, A:M.69, A:G.70, A:L.71, A:N.127, A:N.193, A:N.193, A:S.194
- Water bridges: A:G.218
- Salt bridges: A:K.43
ORO.8: 12 residues within 4Å:- Chain B: K.43, N.67, S.68, M.69, G.70, L.71, P.72, N.127, N.193, S.194
- Ligands: FMN.7, ACY.9
13 PLIP interactions:13 interactions with chain B- Hydrophobic interactions: B:L.71
- Hydrogen bonds: B:N.67, B:N.67, B:N.67, B:M.69, B:G.70, B:L.71, B:N.127, B:N.193, B:N.193, B:S.194
- Water bridges: B:G.218
- Salt bridges: B:K.43
- 4 x ACY: ACETIC ACID(Non-functional Binders)
ACY.4: 4 residues within 4Å:- Chain A: E.213, F.216
- Chain B: L.171, R.238
5 PLIP interactions:1 interactions with chain A, 4 interactions with chain B- Hydrophobic interactions: A:F.216, B:L.171
- Water bridges: B:R.238, B:R.238
- Salt bridges: B:R.238
ACY.5: 6 residues within 4Å:- Chain A: S.129, N.193, S.194, G.196, G.218
- Ligands: ORO.3
3 PLIP interactions:3 interactions with chain A- Water bridges: A:S.129, A:N.197, A:G.218
ACY.9: 6 residues within 4Å:- Chain B: S.129, N.193, S.194, G.196, G.218
- Ligands: ORO.8
4 PLIP interactions:4 interactions with chain B- Water bridges: B:S.129, B:G.196, B:N.197, B:G.218
ACY.10: 4 residues within 4Å:- Chain A: L.171, R.238
- Chain B: E.213, F.216
3 PLIP interactions:1 interactions with chain B, 2 interactions with chain A- Hydrophobic interactions: B:F.216
- Water bridges: A:T.237
- Salt bridges: A:R.238
- Links
- RCSB PDBe PDBe-KB PDBj PDBsum CATH PLIP
- Citation
- Norager, S. et al., Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A mutants reveal important facets of the enzymatic function. J.Biol.Chem. (2003)
- Release Date
- 2003-09-09
- Peptides
- Dihydroorotate dehydrogenase A: AB
- SMTL:PDB
- SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:A
AB
B
- Coordinates
- PDB Format
- Method
- X-RAY DIFFRACTION 2.10 Å
- Oligo State
- homo-dimer
- Ligands
- 2 x MG: MAGNESIUM ION(Non-covalent)
- 2 x FMN: FLAVIN MONONUCLEOTIDE(Non-covalent)
- 2 x ORO: OROTIC ACID(Non-covalent)
- 4 x ACY: ACETIC ACID(Non-functional Binders)
- Links
- RCSB PDBe PDBe-KB PDBj PDBsum CATH PLIP
- Citation
- Norager, S. et al., Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A mutants reveal important facets of the enzymatic function. J.Biol.Chem. (2003)
- Release Date
- 2003-09-09
- Peptides
- Dihydroorotate dehydrogenase A: AB
- SMTL:PDB
- SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:A
AB
B