SMTL ID : 2axz.3 (2 other biounits)

Crystal structure of PrgX/cCF10 complex

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 3.00 Å

Oligo State

homo-tetramer

Ligands

3 x LEU- VAL- THR- LEU- VAL- PHE- VAL: LVTLVFV peptide(Non-covalent)

LEU-VAL-THR-LEU-VAL-PHE-VAL.1: 31 residues within 4Å: Chain A: T.69, K.70, K.79, I.82, F.86, S.111, G.115, S.118, E.154, S.157, N.158, N.161, D.185, L.188, T.189, T.192, K.195, N.196, T.199, I.200, E.235, S.275, L.276, E.279, F.289, T.296, M.297, Y.298, Y.299, Y.302 Chain B: N.57 36 PLIP interactions: 36 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:K.79, A:K.79, A:I.82, A:F.86, A:N.158, A:D.185, A:L.188, A:T.189, A:T.192, A:I.200, A:L.276, A:E.279, A:F.289, A:F.289, A:T.296, A:Y.298, A:Y.299, A:Y.302 Hydrogen bonds: A:K.70, A:K.79, A:E.154, A:E.154, A:N.158, A:N.158, A:K.195, A:K.195, A:N.196, A:T.199, A:T.296, A:T.296, A:Y.298, A:Y.298, A:Y.302, A:Y.302 Salt bridges: A:K.70, A:K.79 LEU-VAL-THR-LEU-VAL-PHE-VAL.2: 30 residues within 4Å: Chain A: N.57 Chain B: K.70, K.79, I.82, F.86, S.111, G.115, S.118, E.154, S.157, N.158, N.161, D.185, L.188, T.189, T.192, K.195, N.196, T.199, I.200, E.235, S.275, L.276, E.279, F.289, T.296, M.297, Y.298, Y.299, Y.302 36 PLIP interactions: 36 interactions with chain B Hydrophobic interactions: B:I.82, B:F.86, B:N.158, B:D.185, B:L.188, B:T.189, B:T.192, B:I.200, B:L.276, B:E.279, B:F.289, B:F.289, B:T.296, B:Y.298, B:Y.299, B:Y.302 Hydrogen bonds: B:K.70, B:K.79, B:E.154, B:E.154, B:N.158, B:N.158, B:N.161, B:K.195, B:K.195, B:N.196, B:T.199, B:E.235, B:T.296, B:T.296, B:Y.298, B:Y.298, B:Y.302, B:Y.302 Salt bridges: B:K.70, B:K.79 LEU-VAL-THR-LEU-VAL-PHE-VAL.3: 29 residues within 4Å: Chain C: N.57 Chain D: K.70, K.79, I.82, F.86, S.111, S.118, E.154, S.157, N.158, N.161, D.185, L.188, T.189, T.192, K.195, N.196, T.199, I.200, E.235, S.275, L.276, E.279, F.289, T.296, M.297, Y.298, Y.299, Y.302 32 PLIP interactions: 1 interactions with chain C, 31 interactions with chain D Hydrogen bonds: C:N.57, D:K.79, D:E.154, D:N.158, D:N.158, D:N.161, D:K.195, D:K.195, D:K.195, D:N.196, D:T.199, D:E.235, D:T.296, D:Y.298, D:Y.298, D:Y.302 Hydrophobic interactions: D:K.70, D:K.70, D:I.82, D:I.82, D:F.86, D:L.188, D:T.189, D:T.192, D:N.196, D:I.200, D:L.276, D:E.279, D:F.289, D:Y.298, D:Y.299, D:Y.302

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Shi, K. et al., Structure of peptide sex pheromone receptor PrgX and PrgX/pheromone complexes and regulation of conjugation in Enterococcus faecalis. Proc.Natl.Acad.Sci.Usa (2005)

Release Date

2005-12-06

Peptides

PrgX: ABCD

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

C
C

D
D

PrgX

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