SMTL ID : 2grm.2 (1 other biounit)

Crystal structure of PrgX/iCF10 complex

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 3.00 Å

Oligo State

homo-tetramer

Ligands

2 x ALA- ILE- THR- LEU- ILE- PHE- ILE: peptide(Non-covalent)

ALA-ILE-THR-LEU-ILE-PHE-ILE.1: 27 residues within 4Å: Chain A: K.70, K.79, F.86, S.111, G.115, S.118, E.154, S.157, N.158, N.161, D.185, L.188, T.189, T.192, K.195, N.196, T.199, I.200, Y.232, E.235, S.275, E.279, P.311, E.312, I.313, K.314, E.315 26 PLIP interactions: 26 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:F.86, A:E.154, A:D.185, A:L.188, A:T.192, A:N.196, A:I.200, A:P.311, A:I.313, A:I.313, A:K.314 Hydrogen bonds: A:E.154, A:E.154, A:N.158, A:K.195, A:K.195, A:K.195, A:N.196, A:T.199, A:Y.232, A:E.235, A:E.312, A:E.312, A:K.314, A:K.314 Salt bridges: A:K.79 ALA-ILE-THR-LEU-ILE-PHE-ILE.2: 27 residues within 4Å: Chain C: K.70, K.79, F.86, S.111, G.115, S.118, E.154, S.157, N.158, N.161, D.185, L.188, T.189, T.192, K.195, N.196, T.199, I.200, Y.232, E.235, S.275, E.279, P.311, E.312, I.313, K.314, E.315 26 PLIP interactions: 26 interactions with chain C Hydrophobic interactions: C:F.86, C:E.154, C:D.185, C:L.188, C:T.192, C:N.196, C:I.200, C:P.311, C:I.313, C:I.313, C:K.314 Hydrogen bonds: C:E.154, C:E.154, C:N.158, C:K.195, C:K.195, C:K.195, C:N.196, C:T.199, C:Y.232, C:E.235, C:E.312, C:E.312, C:K.314, C:K.314 Salt bridges: C:K.79

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Kozlowicz, B.K. et al., Molecular basis for control of conjugation by bacterial pheromone and inhibitor peptides. Mol.Microbiol. (2006)

Release Date

2007-04-03

Peptides

PrgX: ABCD

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
B

B
C

C
B

D
C

PrgX

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