SMTL ID : 2hhj.1

Human bisphosphoglycerate mutase complexed with 2,3-bisphosphoglycerate (15 days)

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 1.50 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

1 x HAI: CYCLOHEXYLAMMONIUM ION(Non-covalent)

HAI.1: 5 residues within 4Å: Chain A: A.94, L.95, H.107, W.115, P.124 4 PLIP interactions: 4 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:A.94, A:L.95, A:W.115, A:P.124

2 x DG2: (2R)-2,3-diphosphoglyceric acid(Covalent)

DG2.2: 16 residues within 4Å: Chain A: R.10, H.11, N.17, F.22, C.23, S.24, R.62, E.89, Y.92, R.100, R.116, R.117, H.188, G.189, N.190 Ligands: 3PG.3 22 PLIP interactions: 22 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:N.17, A:C.23, A:S.24, A:E.89, A:Y.92, A:G.189, A:N.190 Water bridges: A:R.10, A:Q.28, A:R.62, A:R.100, A:R.116, A:R.117, A:R.117 Salt bridges: A:R.10, A:R.10, A:R.62, A:R.100, A:R.100, A:R.116, A:R.117, A:H.188 DG2.4: 16 residues within 4Å: Chain B: R.10, H.11, N.17, F.22, C.23, S.24, R.62, E.89, Y.92, R.100, R.116, R.117, H.188, G.189, N.190 Ligands: 3PG.5 22 PLIP interactions: 22 interactions with chain B Hydrogen bonds: B:R.10, B:N.17, B:C.23, B:S.24, B:E.89, B:Y.92, B:G.189, B:N.190 Water bridges: B:R.10, B:N.17, B:R.21, B:R.100, B:R.116, B:R.117, B:R.117 Salt bridges: B:R.10, B:R.62, B:R.100, B:R.100, B:R.116, B:R.117, B:H.188

2 x 3PG: 3-PHOSPHOGLYCERIC ACID(Non-covalent)

3PG.3: 12 residues within 4Å: Chain A: R.10, H.11, F.22, C.23, S.24, E.89, Y.92, R.100, R.116, R.117, N.190 Ligands: DG2.2 17 PLIP interactions: 17 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:R.10, A:C.23, A:S.24, A:E.89, A:Y.92, A:N.190 Water bridges: A:R.10, A:N.17, A:R.62, A:R.100, A:R.116, A:R.117, A:R.117 Salt bridges: A:R.100, A:R.100, A:R.116, A:R.117 3PG.5: 12 residues within 4Å: Chain B: R.10, H.11, F.22, C.23, S.24, E.89, Y.92, R.100, R.116, R.117, N.190 Ligands: DG2.4 17 PLIP interactions: 17 interactions with chain B Hydrogen bonds: B:R.10, B:C.23, B:S.24, B:E.89, B:E.89, B:Y.92, B:N.190 Water bridges: B:R.10, B:N.17, B:R.100, B:R.116, B:R.117, B:R.117 Salt bridges: B:R.100, B:R.100, B:R.116, B:R.117

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Wang, Y. et al., Seeing the process of histidine phosphorylation in human bisphosphoglycerate mutase. J.Biol.Chem. (2006)

Release Date

2006-10-24

Peptides

Bisphosphoglycerate mutase: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

Bisphosphoglycerate mutase

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