SMTL ID : 2i99.1

Crystal structure of human Mu_crystallin at 2.6 Angstrom

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 2.60 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

2 x NDP: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE(Non-covalent)

NDP.1: 25 residues within 4Å: Chain A: D.81, S.90, H.91, T.115, R.118, T.119, G.142, A.143, G.144, V.145, Q.146, N.167, R.168, T.169, N.172, V.203, T.204, L.205, A.206, V.225, G.226, A.227, S.291, L.292, G.293 29 PLIP interactions: 29 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:T.115, A:T.119, A:V.225 Hydrogen bonds: A:D.81, A:S.90, A:H.91, A:R.118, A:A.143, A:V.145, A:Q.146, A:N.167, A:R.168, A:T.169, A:T.169, A:N.172, A:T.204, A:T.204, A:L.205, A:V.225, A:A.227, A:S.228 Water bridges: A:Q.146, A:A.147, A:R.168, A:T.207, A:S.291 Salt bridges: A:H.91, A:R.168 pi-Cation interactions: A:R.168 NDP.2: 23 residues within 4Å: Chain B: D.81, H.91, R.118, T.119, G.142, A.143, G.144, V.145, Q.146, N.167, R.168, T.169, N.172, V.203, T.204, L.205, A.206, V.225, G.226, S.228, S.291, L.292, G.293 31 PLIP interactions: 31 interactions with chain B Hydrophobic interactions: B:T.119, B:V.225 Hydrogen bonds: B:D.81, B:D.81, B:R.118, B:A.143, B:G.144, B:V.145, B:Q.146, B:N.167, B:N.167, B:R.168, B:T.169, B:T.169, B:N.172, B:T.204, B:L.205, B:S.291 Water bridges: B:H.91, B:H.91, B:H.91, B:H.91, B:A.147, B:R.168, B:A.227, B:S.228, B:S.291 Salt bridges: B:H.91, B:H.91, B:R.168 pi-Cation interactions: B:R.168

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Cheng, Z. et al., Crystal structure of human {micro}-crystallin complexed with NADPH. Protein Sci. (2007)

Release Date

2007-02-27

Peptides

Mu-crystallin homolog: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

Mu-crystallin homolog