SMTL ID : 2q2r.1

Trypanosoma cruzi glucokinase in complex with beta-D-glucose and ADP

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 2.10 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

2 x BGC: beta-D-glucopyranose(Non-covalent)

BGC.1: 11 residues within 4Å: Chain A: P.98, G.99, P.100, N.111, N.136, D.137, G.192, L.193, G.194, E.213, E.242 14 PLIP interactions: 14 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:N.111, A:N.136, A:N.136, A:L.193, A:E.213, A:E.213 Water bridges: A:P.98, A:N.111, A:D.137, A:D.137, A:D.137, A:D.137, A:G.192, A:S.195 BGC.3: 10 residues within 4Å: Chain B: P.98, G.99, P.100, N.111, N.136, D.137, L.193, G.194, E.213, E.242 10 PLIP interactions: 10 interactions with chain B Hydrogen bonds: B:N.136, B:N.136, B:L.193, B:E.213, B:E.213 Water bridges: B:N.111, B:N.111, B:D.137, B:S.195, B:S.216

2 x ADP: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE(Non-covalent)

ADP.2: 8 residues within 4Å: Chain A: G.190, T.191, G.247, A.267, G.268, A.271, N.314, N.318 12 PLIP interactions: 12 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:T.191, A:T.191, A:N.314, A:N.318, A:N.318 Water bridges: A:G.38, A:T.39, A:T.39, A:R.42, A:G.190, A:A.248, A:N.314 ADP.4: 7 residues within 4Å: Chain B: G.190, T.191, A.267, G.268, A.271, N.314, N.318 13 PLIP interactions: 13 interactions with chain B Hydrogen bonds: B:T.191, B:T.191, B:T.191, B:N.314, B:N.318, B:N.318 Water bridges: B:G.38, B:G.38, B:G.38, B:T.39, B:T.39, B:Y.288, B:N.314

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Cordeiro, A.T. et al., The Crystal Structure of Trypanosoma cruzi Glucokinase Reveals Features Determining Oligomerization and Anomer Specificity of Hexose-phosphorylating Enzymes. J.Mol.Biol. (2007)

Release Date

2007-10-16

Peptides

Glucokinase 1, putative: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

Glucokinase 1, putative