SMTL ID : 3is2.1

2.3 Angstrom Crystal Structure of a Cys71 Sulfenic Acid form of Vivid

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 2.30 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

2 x FAD: FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE(Non-covalent)

FAD.1: 25 residues within 4Å: Chain A: I.42, C.44, N.75, C.76, R.77, L.79, Q.80, P.88, K.89, S.90, T.91, R.92, S.97, I.100, N.101, R.104, I.107, N.119, N.129, L.131, M.133, S.146, M.147, G.148, Q.150 21 PLIP interactions: 21 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:I.42 Hydrogen bonds: A:N.75, A:C.76, A:R.77, A:Q.80, A:K.89, A:S.90, A:R.92, A:R.92, A:N.101, A:N.119, A:N.119, A:N.129, A:Q.150 Water bridges: A:S.90, A:R.92 Salt bridges: A:R.77, A:K.89, A:K.89, A:R.92, A:R.92 FAD.2: 27 residues within 4Å: Chain B: I.42, C.44, T.51, N.75, C.76, R.77, L.79, Q.80, P.88, K.89, S.90, T.91, R.92, S.97, I.100, N.101, R.104, I.107, V.117, N.119, N.129, L.131, M.133, S.146, M.147, G.148, Q.150 19 PLIP interactions: 19 interactions with chain B Hydrophobic interactions: B:I.42 Hydrogen bonds: B:N.75, B:C.76, B:Q.80, B:K.89, B:S.90, B:R.92, B:N.101, B:N.119, B:N.119, B:N.129 Water bridges: B:K.89, B:S.90, B:R.92 Salt bridges: B:R.77, B:K.89, B:K.89, B:R.92, B:R.92

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Lamb, J.S. et al., Illuminating solution responses of a LOV domain protein with photocoupled small-angle X-ray scattering. J.Mol.Biol. (2009)

Release Date

2009-11-03

Peptides

Vivid PAS protein VVD: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

Vivid PAS protein VVD